The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
51
|
structure length |
51
|
Chain Sequence |
EPTYCLCNQVSYGEMIGCDNDECPIEWFHFSCVGLNHKPKGKWYCPKCRGE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Antitumor protein, apoptosis
|
| molecule keywords |
Inhibitor of growth protein 1
|
| publication title |
Histone H3K4me3 binding is required for the DNA repair and apoptotic activities of ING1 tumor suppressor.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
8
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| structure length |
51
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| sequence length |
51
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-07-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Herpes Virus-1 | Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4A0C D; 2VPE A; 2JRJ A; 4GNF A; 2CKL B; 2HDP A; 4AYC A; 1V87 A; 2RI7 A; 2YHN A; 4XI1 A; 2ECN A; 2Y1M A; 1DVP A; 4GB0 A; 3IHP A; 2CSZ A; 4V3L C; 5C11 A; 3N9M A; 4YAB A; 3O37 A; 4LKA A; 5B77 A; 4O64 A; 2C2V S; 2H0D A; 2ZET C; 1HYI A; 3T6R A; 2MA5 A; 3VK6 A; 5TRB A; 1FP0 A; 4YAX A; 2PUY A; 1N87 A; 2VPD A; 4YAT A; 1IYM A; 1MM2 A; 2C2L A; 2KYU A; 4PTB A; 2L43 A; 2F42 A; 4YBM A; 3U5N A; 5TAB A; 1X4I A; 2LQ6 A; 2LN0 A; 3ZNI A; 3N9P A; 2LGL A; 5B78 A; 2E6S A; 2VPG A; 3O35 A; 2ECJ A; 1WFK A; 4YAD A; 2JMI A; 3ASL A; 2MNY A; 2CKL A; 2MIQ A; 2QIC A; 2KIZ A; 4B86 C; 4MSX A; 4NN2 A; 2AN6 A; 1WEO A; 2MA6 A; 1WEV A; 2I50 A; 1HYJ A; 4YBS A; 2KRE A; 3EB5 A; 2MT5 A; 4A4C A; 3KQI A; 1CHC A; 5FB1 A; 4S3O B; 4R8P K; 2KGI A; 5JG6 A; 5LKT A; 3V43 A; 5DKA A; 3O70 A; 4W4U A; 2DX8 A; 1WEW A; 4UP0 A; 2CSY A; 2EOD A; 4AYC B; 4L58 A; 4CA1 A; 5G0F A; 5C13 A; 4FJC A; 2L0B A; 3EB6 A; 3RPG C; 2H0D B; 4ZUX U; 4L7X A; 3SOW A; 2JMJ A; 2YYR A; 3C5K A; 1X4J A; 1G25 A; 5TBN A; 4P5O B; 3ZVZ B; 3SOX A; 2D8S A; 2FSA A; 1U6G B; 4LAD B; 3U5P A; 5H9M A; 1Z2Q A; 1BOR A; 3N9L A; 1VFY A; 2BAY A; 3T7L A; 2K16 A; 1Z6U A; 3LRQ A; 2YSM A; 4LJN A; 2LGG A; 4GNE A; 5EYA F; 1WIL A; 2VJE A; 4A4B A; 1XWH A; 2YSJ A; 4CCG X; 4UI9 B; 4WZ3 B; 2KWN A; 4S3O C; 2EA6 A; 3L11 A; 5LCW B; 1RMD A; 1WEN A; 3LQJ A; 2LGV A; 2KWK A; 4LK9 A; 4LLB A; 4WZ0 A; 4FK5 A; 4IC3 A; 3M63 A; 3PUQ A; 5B76 A; 5I3L A; 3ZTG A; 4QF3 A; 2M1R A; 5TDW A; 2XB1 A; 4BBQ A; 5D1K B; 3U5M A; 2ECT A; 3HCS A; 5KH9 A; 5D1L B; 1ZBD B; 1X4U A; 3N9Q A; 3HCU A; 3QZV A; 5LKZ A; 5AIT A; 5J3X A; 3KNV A; 2YHO A; 2K1J A; 5G05 B; 2HYE D; 5B75 A; 1VYX A; 2MUM A; 3ZPV E; 2PNX A; 5KH3 A; 2XEU A; 2KGG A; 2M6M A; 4BHW A; 1JOC A; 4F52 B; 3GL6 A; 2YQL A; 5H1T A; 1K2F A; 1MM3 A; 2VJF B; 2FUI A; 2JMD A; 5B79 A; 2VJE B; 2LXH C; 4TKP B; 4A49 A; 1WES A; 5H1V A; 5TDR A; 5LKU A; 1WEE A; 2K17 A; 4R2Y A; 3O7A A; 4AVX A; 3SHB A; 2EGP A; 2LRI C; 2ECG A; 2L80 A; 3I2D A; 4FO9 A; 3HCT A; 4YBT A; 5FB0 A; 4R7E A; 2VJF A; 2VP7 A; 1E4U A; 4X3G A; 4AP4 A; 1JM7 A; 1VD4 A; 4I7B A; 3NG2 A; 1Z60 A; 2YUR A; 2YU4 A; 2MNZ A; 2YRE A; 4UP5 A; 3HTK C; 2IDA A; 3DQV R; 4ZDT A; 2ECW A; 4YC9 A; 5G04 B; 2F6N A; 4WA6 A; 2G45 A; 1LDK C; 2M3H A; 2KFT A; 3ZPV 1; 3GV4 A; 2L75 A; 3KV5 A; 2LDR A; 3RPG B; 3MHH A; 2UZG A; 1WEP A; 4I7C A; 2LGK A; 5DIN A; 3FL2 A; 5AIU A; 2Y43 A; 5FEY A; 3PUR A; 1T1H A; 1WEU A; 4GND A; 4C9Z A; 5FER A; 5H1U A; 1WE9 A; 2YW8 A; 2KWO A; 5LKX A; 5KH7 A; 4WZ2 A; 3LQH A; 4Q6F A; 2YT5 A; 3O34 A; 2RSD A; 2K4D A; 4AUQ B; 2VPB A; 1WEM A; 1FBV A; 3ZYQ A; 3LQI A; 2L5U A; 3M62 A; 2KE1 A; 4PPE A; 3RTR B; 3O33 A; 1WEQ A; 2G43 A; 2M85 A; 2KU3 A; 3PHD A; 3M99 A; 1JM7 B; 1WGM A; 3U5O A; 2ECV A; 4GNG A; 2Y1N A; 3L1X A; 2LV9 A; 2OXQ C; 4IC2 A; 2F6J A; 2NAA A; 1WIM A; 3ZVY A; 2VNF A; 3N9N A; 2YQM A; 4B7Y C; 2MD8 C; 4ZQL A; 4V3K C; 2MD7 B; 2QJ0 A; 4QF2 A; 3L1Z B; 2FUU A; 2KR4 A; 2QIZ A; 4MVT A; 3SOU A; 4N4F A; 3MHS A; 3O36 A; 5D1M B; 4I7D A; 2CT2 A; 4FIP A; 1LDJ B; 2E6R A; 2G6Q A; 3KV6 A; 3N9O A; 2ECI A; 2YUC A; 3C6W A; 1F62 A; 2LXP C; 3DPL R; 2KWJ A; 4N3W A; 5B8D A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4A0C D; 2VPE A; 2JRJ A; 4GNF A; 2CKL B; 2HDP A; 4AYC A; 1V87 A; 2RI7 A; 2YHN A; 2EXU A; 2ECN A; 2Y1M A; 1DVP A; 4GB0 A; 4XI1 A; 3IHP A; 2CSZ A; 4V3L C; 5C11 A; 3N9M A; 4YAB A; 3O37 A; 4LKA A; 5B77 A; 4O64 A; 2C2V S; 2CSV A; 2JM3 A; 2FFW A; 2H0D A; 2ZET C; 1HYI A; 3T6R A; 2MA5 A; 3VK6 A; 5TRB A; 1FP0 A; 3E2D A; 3KDE C; 4YAX A; 2PUY A; 1N87 A; 2VPD A; 4YAT A; 1IYM A; 1MM2 A; 3T9K A; 2C2L A; 2KYU A; 4PTB A; 2L43 A; 2F42 A; 4YBM A; 3U5N A; 5TAB A; 1X4I A; 2LQ6 A; 2LN0 A; 3ZNI A; 3N9P A; 2LGL A; 5B78 A; 2E6S A; 2VPG A; 3O35 A; 2ECJ A; 1WFK A; 4YAD A; 2JMI A; 3ASL A; 2MNY A; 2CKL A; 2MIQ A; 2QIC A; 2KIZ A; 4B86 C; 5SVY A; 4MSX A; 4NN2 A; 2AN6 A; 1WEO A; 2MA6 A; 1WEV A; 2I50 A; 1HYJ A; 3Q1D A; 4YBS A; 2KRE A; 3EB5 A; 4OGE A; 2MT5 A; 4A4C A; 3KQI A; 1CHC A; 5FB1 A; 4S3O B; 2YVR A; 4R8P K; 2KGI A; 5JG6 A; 5LKT A; 3V43 A; 3O70 A; 5DKA A; 4W4U A; 2DX8 A; 3DWD A; 1WEW A; 2KKX A; 2MKE A; 2B0O E; 3FAN A; 4UP0 A; 2CSY A; 2EOD A; 4AYC B; 4L58 A; 2IQJ A; 4CA1 A; 5G0F A; 5C13 A; 4FJC A; 2L0B A; 3EB6 A; 3RPG C; 2H0D B; 4OGC A; 4ZUX U; 4L7X A; 3SOW A; 2JMJ A; 2YYR A; 3C5K A; 1X4J A; 1G25 A; 5TBN A; 5SVI A; 4P5O B; 3ZVZ B; 3SOX A; 2D8S A; 2FSA A; 1U6G B; 2M13 A; 2P57 A; 4LAD B; 3U5P A; 5H9M A; 1Z2Q A; 1BOR A; 3N9L A; 1VFY A; 2BAY A; 2XOC A; 3T7L A; 2K16 A; 1Z6U A; 3LRQ A; 2YSM A; 4LJN A; 2LGG A; 4GNE A; 5EYA F; 1WIL A; 2VJE A; 4A4B A; 1XWH A; 2YSJ A; 4CCG X; 4UI9 B; 4WZ3 B; 2KWN A; 4S3O C; 2EA6 A; 3L11 A; 5LCW B; 2DSM A; 1RMD A; 1WEN A; 3LQJ A; 2CON A; 3FM8 C; 2LGV A; 2KWK A; 4LK9 A; 4LLB A; 4WZ0 A; 4FK5 A; 4IC3 A; 3M63 A; 3PUQ A; 4QQ4 A; 5B76 A; 5I3L A; 3ZTG A; 2XOY A; 4QF3 A; 2M1R A; 5TDW A; 2XB1 A; 4BBQ A; 5D1K B; 5K3Q A; 3U5M A; 2ECT A; 3HCS A; 4Z0R A; 5KH9 A; 5D1L B; 1ZBD B; 1X4U A; 3N9Q A; 3HCU A; 3QZV A; 5LKZ A; 3PLW A; 5AIT A; 5J3X A; 3KNV A; 2YHO A; 2K1J A; 5G05 B; 2HYE D; 5B75 A; 1VYX A; 2MUM A; 3ZPV E; 2PNX A; 3FJU B; 3LJU X; 5KH3 A; 2XEU A; 2KGG A; 2M6M A; 4BHW A; 5SVI B; 1JOC A; 4F52 B; 3GL6 A; 2YQL A; 5H1T A; 1K2F A; 1MM3 A; 2KKY A; 2VJF B; 2FUI A; 2DJA A; 4H9D A; 3M7K A; 2JMD A; 3MDB C; 5B79 A; 2VJE B; 2LXH C; 4TKP B; 4A49 A; 1WES A; 5H1V A; 2D8U A; 5TDR A; 5LKU A; 1WEE A; 2K17 A; 4R2Y A; 3LVR E; 3O7A A; 4AVX A; 3SHB A; 2EGP A; 2LRI C; 2ECG A; 2L80 A; 3I2D A; 4FO9 A; 2LAU A; 3HCT A; 4YBT A; 5FB0 A; 4F1P A; 4R7E A; 2VJF A; 2OWA A; 2VP7 A; 1E4U A; 4X3G A; 4AP4 A; 2JUN A; 1JM7 A; 1VD4 A; 4I7B A; 2XP0 A; 3NG2 A; 3FAO A; 1Z60 A; 2CRR A; 2YUR A; 2YU4 A; 2MNZ A; 2YRE A; 4UP5 A; 3HTK C; 2IDA A; 3DQV R; 4ZDT A; 2ECW A; 4YC9 A; 5G04 B; 3O47 A; 2F6N A; 4WA6 A; 1DCQ A; 2G45 A; 1LDK C; 2M3H A; 2KFT A; 3ZPV 1; 3GV4 A; 2RR4 A; 2L75 A; 3KV5 A; 2EGM A; 2LDR A; 3RPG B; 3MHH A; 2UZG A; 1WEP A; 4I7C A; 2LGK A; 5DIN A; 3FL2 A; 5AIU A; 2Y43 A; 5FEY A; 3PUR A; 1T1H A; 1WEU A; 4GND A; 4C9Z A; 5FER A; 5H1U A; 2CRW A; 2E61 A; 1WE9 A; 2YW8 A; 3JUE A; 2KWO A; 5LKX A; 5KH7 A; 4WZ2 A; 3LQH A; 4Q6F A; 3DDT A; 2YT5 A; 3O34 A; 2RSD A; 2K4D A; 4AUQ B; 2VPB A; 1WEM A; 3SUB A; 1FBV A; 3ZYQ A; 3LQI A; 2L5U A; 3M62 A; 2KE1 A; 4PPE A; 3RTR B; 3O33 A; 1WEQ A; 2G43 A; 2XOZ A; 3FEH A; 5SVX A; 2M85 A; 2KU3 A; 3PHD A; 3M99 A; 1JM7 B; 1WGM A; 3U5O A; 2ECV A; 4GNG A; 4Z0O A; 2Y1N A; 3L1X A; 2LV9 A; 2OXQ C; 4IC2 A; 2F6J A; 2NAA A; 1WIM A; 3ZVY A; 2VNF A; 3N9N A; 2YQM A; 4B7Y C; 2MD8 C; 4ZQL A; 4V3K C; 2MD7 B; 2QJ0 A; 4QF2 A; 3H7H A; 2FUU A; 3L1Z B; 2L7P A; 2KR4 A; 2QIZ A; 4MVT A; 3SOU A; 3LDY A; 4N4F A; 3MHS A; 3O36 A; 5D1M B; 1MBM A; 4I7D A; 2CT2 A; 4FIP A; 1LDJ B; 2FD4 A; 2E6R A; 3LVQ E; 2G6Q A; 3KV6 A; 3N9O A; 4O62 A; 2ECI A; 2YUC A; 3C6W A; 1F62 A; 2LXP C; 3DPL R; 2KWJ A; 4N3W A; 5B8D A; #chains in the Genus database with same CATH homology 4A0C D; 2VPE A; 2JRJ A; 4GNF A; 2CKL B; 2HDP A; 4AYC A; 1V87 A; 2RI7 A; 2YHN A; 4XI1 A; 2ECN A; 2Y1M A; 1DVP A; 4GB0 A; 3IHP A; 2CSZ A; 4V3L C; 5C11 A; 3N9M A; 4YAB A; 3O37 A; 4LKA A; 5B77 A; 4O64 A; 2C2V S; 2H0D A; 2ZET C; 1HYI A; 3T6R A; 2MA5 A; 3VK6 A; 5TRB A; 1FP0 A; 4YAX A; 2PUY A; 1N87 A; 2VPD A; 4YAT A; 1IYM A; 1MM2 A; 2C2L A; 2KYU A; 4PTB A; 2L43 A; 2F42 A; 4YBM A; 3U5N A; 5TAB A; 1X4I A; 2LQ6 A; 2LN0 A; 3ZNI A; 3N9P A; 2LGL A; 5B78 A; 2E6S A; 2VPG A; 3O35 A; 2ECJ A; 1WFK A; 4YAD A; 2JMI A; 3ASL A; 2MNY A; 2CKL A; 2MIQ A; 2QIC A; 2KIZ A; 4B86 C; 4MSX A; 4NN2 A; 2AN6 A; 1WEO A; 2MA6 A; 1WEV A; 2I50 A; 1HYJ A; 4YBS A; 2KRE A; 3EB5 A; 2MT5 A; 4A4C A; 3KQI A; 1CHC A; 5FB1 A; 4S3O B; 4R8P K; 2KGI A; 5JG6 A; 5LKT A; 3V43 A; 5DKA A; 3O70 A; 4W4U A; 2DX8 A; 1WEW A; 4UP0 A; 2CSY A; 2EOD A; 4AYC B; 4L58 A; 4CA1 A; 5G0F A; 5C13 A; 4FJC A; 2L0B A; 3EB6 A; 3RPG C; 2H0D B; 4ZUX U; 4L7X A; 3SOW A; 2JMJ A; 2YYR A; 3C5K A; 1X4J A; 1G25 A; 5TBN A; 4P5O B; 3ZVZ B; 3SOX A; 2D8S A; 2FSA A; 1U6G B; 4LAD B; 3U5P A; 5H9M A; 1Z2Q A; 1BOR A; 3N9L A; 1VFY A; 2BAY A; 3T7L A; 2K16 A; 1Z6U A; 3LRQ A; 2YSM A; 4LJN A; 2LGG A; 4GNE A; 5EYA F; 1WIL A; 2VJE A; 4A4B A; 1XWH A; 2YSJ A; 4CCG X; 4UI9 B; 4WZ3 B; 2KWN A; 4S3O C; 2EA6 A; 3L11 A; 5LCW B; 1RMD A; 1WEN A; 3LQJ A; 2LGV A; 2KWK A; 4LK9 A; 4LLB A; 4WZ0 A; 4FK5 A; 4IC3 A; 3M63 A; 3PUQ A; 5B76 A; 5I3L A; 3ZTG A; 4QF3 A; 2M1R A; 5TDW A; 2XB1 A; 4BBQ A; 5D1K B; 3U5M A; 2ECT A; 3HCS A; 5KH9 A; 5D1L B; 1ZBD B; 1X4U A; 3N9Q A; 3HCU A; 3QZV A; 5LKZ A; 5AIT A; 5J3X A; 3KNV A; 2YHO A; 2K1J A; 5G05 B; 2HYE D; 5B75 A; 1VYX A; 2MUM A; 3ZPV E; 2PNX A; 5KH3 A; 2XEU A; 2KGG A; 2M6M A; 4BHW A; 1JOC A; 4F52 B; 3GL6 A; 2YQL A; 5H1T A; 1K2F A; 1MM3 A; 2VJF B; 2FUI A; 2JMD A; 5B79 A; 2VJE B; 2LXH C; 4TKP B; 4A49 A; 1WES A; 5H1V A; 5TDR A; 5LKU A; 1WEE A; 2K17 A; 4R2Y A; 3O7A A; 4AVX A; 3SHB A; 2EGP A; 2LRI C; 2ECG A; 2L80 A; 3I2D A; 4FO9 A; 3HCT A; 4YBT A; 5FB0 A; 4R7E A; 2VJF A; 2VP7 A; 1E4U A; 4X3G A; 4AP4 A; 1JM7 A; 1VD4 A; 4I7B A; 3NG2 A; 1Z60 A; 2YUR A; 2YU4 A; 2MNZ A; 2YRE A; 4UP5 A; 3HTK C; 2IDA A; 3DQV R; 4ZDT A; 2ECW A; 4YC9 A; 5G04 B; 2F6N A; 4WA6 A; 2G45 A; 1LDK C; 2M3H A; 2KFT A; 3ZPV 1; 3GV4 A; 2L75 A; 3KV5 A; 2LDR A; 3RPG B; 3MHH A; 2UZG A; 1WEP A; 4I7C A; 2LGK A; 5DIN A; 3FL2 A; 5AIU A; 2Y43 A; 5FEY A; 3PUR A; 1T1H A; 1WEU A; 4GND A; 4C9Z A; 5FER A; 5H1U A; 1WE9 A; 2YW8 A; 2KWO A; 5LKX A; 5KH7 A; 4WZ2 A; 3LQH A; 4Q6F A; 2YT5 A; 3O34 A; 2RSD A; 2K4D A; 4AUQ B; 2VPB A; 1WEM A; 1FBV A; 3ZYQ A; 3LQI A; 2L5U A; 3M62 A; 2KE1 A; 4PPE A; 3RTR B; 3O33 A; 1WEQ A; 2G43 A; 2M85 A; 2KU3 A; 3PHD A; 3M99 A; 1JM7 B; 1WGM A; 3U5O A; 2ECV A; 4GNG A; 2Y1N A; 3L1X A; 2LV9 A; 2OXQ C; 4IC2 A; 2F6J A; 2NAA A; 1WIM A; 3ZVY A; 2VNF A; 3N9N A; 2YQM A; 4B7Y C; 2MD8 C; 4ZQL A; 4V3K C; 2MD7 B; 2QJ0 A; 4QF2 A; 3L1Z B; 2FUU A; 2KR4 A; 2QIZ A; 4MVT A; 3SOU A; 4N4F A; 3MHS A; 3O36 A; 5D1M B; 4I7D A; 2CT2 A; 4FIP A; 1LDJ B; 2E6R A; 2G6Q A; 3KV6 A; 3N9O A; 2ECI A; 2YUC A; 3C6W A; 1F62 A; 2LXP C; 3DPL R; 2KWJ A; 4N3W A; 5B8D A;
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