2QIWA

Crystal structure of a putative phosphoenolpyruvate phosphonomutase (ncgl1015, cgl1060) from corynebacterium glutamicum atcc 13032 at 1.80 a resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
GMSDLKSLATKFASDHESGKLLVLPTVWDTWSAGLVEEAGFSGLTIGSHPVADATGSSDGENMNFADYMAVVKKITSAVSIPVSVDVESGYGLSPADLIAQILEAGAVGINVEDVVHSEGKRVREAQEHADYIAAARQAADVAGVDVVINGRTDAVKLGADVFEDPMVEAIKRIKLMEQAGARSVYPVGLSTAEQVERLVDAVSVPVNITAHPVDGHGAGDLATLAGLGVRRVTFGPLWQKWLAATSAQQLKGWA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords PEP phosphonomutase
publication title Crystal structure of putative PEP phosphonomutase (NP_600288.1) from Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 Kitasato at 1.80 A resolution
rcsb
source organism Corynebacterium glutamicum atcc 13032
total genus 92
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.8.23: Carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase.
pdb deposition date 2007-07-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13714 PEP_mutase Phosphoenolpyruvate phosphomutase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.5.510 Mainly Alpha Up-down Bundle Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces Single helix bin 2qiwA02
3.20.20.60 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Phosphoenolpyruvate-binding domains 2qiwA01
2KX9A 3PUGA 4B5VA 2E28A 2QJKC 1ZLPA 3QV7A 4L80A 3SRHA 1M1BA 4JPGA 1AQFA 3G2GA 2FYNC 2WPVB 3FA4A 2O01J 2HROA 2BG5A 3KTXA 1S2WA 4YJ5A 1PKLA 1S2VA 2VGBA 4WJ8A 4B5XA 2WSCJ 1VF5B 3HQOA 2VWSA 3HQNA 4L9ZA 2E76B 1UJQA 1F8IA 2XZ7A 2QJPC 4OGQB 2HJPA 1E0UA 2WQDA 3PP7A 4L7ZA 4ROQA 3E0WA 1A49A 1Q90D 5JVLA 2QSIA 3GG8A 4PV1B 2WSFJ 2VGGA 4H0LB 3N25A 3B8IA 3LYEA 3GR4A 4IMAA 1PKYA 2XDFA 1O68A 1XG3A 2R82A 4HYWA 2HRWA 3QZ6A 4LSBA 3EOEA 2E75B 4H13B 1GGOA 2ZE3A 2OLSA 4Y28J 3MA8A 2VGFA 3OYZA 2HWGA 2V5JA 4L9YA 4TV5A 3LG3A 2QIWA 3BJFA 3H6OA 4KS0A 2K9YA 4MF4A 4RPPA 1OQFA 1U5HA 2G50A 4QG9A 3M0JA 1F3XA 4FXFA 1JDEA 1OY0A 3LW5J 1A3WA 4B5UA 2VGIA 4I7ZB 3T0TA 3QV9A 1DXFA 3SRKA 3E5BA 3P0XA 3R4IA 4YNGA 3U2ZA 4KRZA 4B2DA 2DUAA 1PKMA 3EOOA 1KC7A 4B5TA 5L8RJ 4KCVA 4IQDA 3BJTA 3T05A 3GQYA 3C8VA 3T07A 4IP7A 3QLLA 3KHDA 4KCWA 1Z6KA 3EZ4A 3ME3A 4B5SA 4B5WA 5KKZC 3QV8A 2ZT9B 2QJYC 4IL6X 1F8MA 1S2UA 4KCTA 3HQPA 5TAOA 4HYVA 4KT0J 3EOLA 1A5UA 4IQEA 3QQWA 1IGWA 4TV6A 4QG6A 3QV6A 3E0VA 1PKNA 2VWTA 1DXEA 3FA3A 1F3WA 1KBLA 1VBHA 4DRSA 1VBGA 4QG8A 1T5AA 4KCUA 1SGJA 2DIKA 2E74B 2D2CB 1XG4A 1U5VA 2WSEJ 3SRFA 2YIUC 1O66A 4FXJA 1S2TA 1JB0J 1IZCA 4MG4A 2L5HA 1S5LX 4RKUJ 1PYMA 1MUMA 4QGCA 3VAVA 3I4EA 4G1NA 1DQUA 1O5QA 2X0SA 3IS4A 3OQ8A 3OYXA 1A3XA 1F61A 2XZ9A 1ZJHA 5KLIC 1M3UA 4B2DD 3M0KA 3SRDA 2V5KA 1E0TA 3QTGA 1DIKA 1ZRTE 4H44B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YJQA 4R7JA 2UBPC 1DJNA 1YADA 1H0GA 3FA4A 4HNUA 3BASA 3PZGA 1VQ7P 1L4AA 1GW9A 4DHGA 2KSEA 3HFTA 2OB3A 1SZRA 3EPOA 1XH2A 1KYOI 1TFVA 1HKIA 2Z1KA 4E8GA 4NSBA 2D2GA 2OQQA 2NW0A 3TGUJ 3AC0A 1SFCA 2JIEA 2BCCD 3M0IA 1YIJP 3FSTA 5TQLA 5A8QA 5HWNA 4ZBCA 2X42A 3W3OA 3AE6C 1LRQA 1XD1A 1SFSA 1RD6A 1Z3NA 4GXPA 2FZBA 3T0TA 4QISA 4GI6A 1JTHB 3BMVA 3BOLA 3EOOA 2B89A 1FE6A 2YL5A 4JTQA 3LV6A 4LRTA 2D2JA 1ZRTD 2Z1XA 2Z7GA 2AGTA 4PB5A 3THDA 4QDPA 4KCWA 5HQMA 3ME3A 2EJ1A 3CAVA 1YQ2A 4LC6A 5LXXA 2A85A 4FR1A 3WLPA 1VFUA 2BHYA 4ONVA 4M19A 2CZEA 1P84D 2X16A 3H1KD 1L6WA 5L9FA 3LBCA 1B3WA 1GD2E 1VBHA 4R5EA 5DEZA 2Y85A 5ABFA 4YPCA 2F7FA 1UWSA 4Q7IA 4MYXA 1P0BA 4DBUA 5IFTA 3DI0A 3CK5A 2QUVA 1SQVK 1EJTC 1GKQA 2H8XA 2V2HA 1J1EC 2Y1HA 1X79B 4IPIA 1VBJA 4QCEA 2BMBA 4C5YA 2NRGA 1DTNA 4E2OA 2QGHA 2KX9A 3S6OA 1NP0A 2XU2A 3DAQA 2IPPA 5K4ZA 4AYGA 1EQ7A 5FEZA 2A7RA 3KXQA 5HATA 2WPVB 2Q3IA 5FESA 2FYUG 4D6TD 1J1EB 3E38A 1M56D 4M6PA 1IEIA 4C7GA 1M6JA 3ZYZA 2QJPC 3M0AA 1HVQA 2CLLA 1NGMB 5HANA 3MUY1 3SUUA 4JTGA 2C3ZA 3SY5A 1BF6A 4LW7A 1M1JC 4C1NB 4MUZA 3STFA 3W75A 2YMYA 2QJPB 1SQ7A 2P53A 3KBNA 4CN4A 4YHGA 3BO9A 4D6CA 1L0PA 1JD9A 1K4GA 3MKVA 4FXFA 3EA3A 2M8RA 1FOBA 1PCKA 1SQPK 3LQGA 1M1JB 4JGDA 3VMZA 1W3JA 2HXTA 4W5UA 3WD3A 3TLQA 4HPGA 4BCEA 1NF0A 3CV7A 3CS2A 1NKNA 4OZOA 4ASTA 5BRBA 3FN9A 4C6LA 5H8UA 3EWBX 2DQXA 4NNCA 3AOFA 4PN2A 3F1QA 3CZJA 4DJEC 4EWND 4G7FA 4NVTA 1PPJD 1EP2A 1FKXA 4MWAA 4HCHA 3O15A 4JFVA 1L6GA 3H26A 3W81A 3HGOA 1W5MA 1Q7QA 4QROA 2OARA 3HOJA 3LLDA 1J0JA 4W7WA 2ZE0A 5EMUA 3NSNA 2BVWA 3V75A 4OVXA 4IT1A 1QUMA 4NPEA 3LXBA 1MEHA 5MHBA 1K02A 3K8KA 1FDIA 5E70A 2ZUUA 3NM3A 3IACA 3F7JA 2QCFA 4JNYA 4ICMA 1SMDA 3WQCA 3H7UA 2PDKA 1NWUA 3GNXA 4LVGA 4O19A 5C9UA 1LT1A 4WDTA 2KNCA 4LQ1A 1HH0A 3OW1A 1WNOA 3D6NA 3MMUA 1F74A 3MJYA 1E6QM 1JYVA 4K68A 5BZAA 4PRWA 1IFIA 4LY4A 4AZCB 4UXDA 4A3QA 3KDNA 4FOKA 2QPXA 3AO0A 1JNDA 4ASVA 1J2WA 1E3ZA 3BW2A 1LWUC 1A02J 5AYYA 1SZFA 5IHRA 4GUGA 3L5LA 4GXMA 2OT0A 5DBUA 5J5DA 3B8WA 5HULA 3HF3A 1W9XA 3I56P 1J0YA 3KE0A 1JXKA 3M9QA 3F4WA 3TR9A 3HG3A 3VIHA 4FXSA 4TT3H 3W9ZA 3ABSA 5E0KA 3QMRA 3WNOA 1LWUB 3BG9A 1JGIA 3IJ7A 3P14A 3P7KA 3OZOA 1N7LA 2D22A 3PPGA 4IICA 1OVVA 2CEQA 3UD6A 3CBWA 4FEZA 2Q71A 3O8ZA 1X7FA 4KEVA 1ITUA 3AICA 1YJ9P 4GVIA 4KW2A 1KILC 3C61A 1GW1A 4FS9A 1E6PA 3TTEA 4RJTA 4CEXC 1A5MC 4O1AA 4IGNA 3PZQA 4WXYA 3A3WA 3SN1A 1F76A 7REQB 1G6CA 3UXKA 4GOFA 3KLLA 4HB7A 4NZ4A 1KILB 5I3FA 3WKZA 1MZHA 2ZZ7A 4L9XA 3KBWA 1H7XA 3QH9A 2Z2UA 3ALGA 2NVDA 3S1GA 3U7BA 3ZM8A 2H90A 3Q58A 1XDLA 3M47A 1KXHA 3TAKA 3CCMP 1PZ0A 4XAFA 2KB7P 2ZUNA 3UF9A 3TNUB 1ZHAA 5K5GB 3B4YA 3NQ2A 4MADA 3RG6A 4QIUA 3M6DA 1OYAA 5KAFH 5J04A 2AOSA 4I9AA 4IP5A 1OY0A 3I6EA 4PBEA 3OAKA 3N6HA 5FAJA 4B4FA 3NQGA 1I1WA 2OTJP 1OF8A 3T1GA 2KS1A 5ECUA 5E1QA 4F8XA 1KW1A 2A6NA 4NZ3A 1BSNA 3WY1A 3UNDA 5GNYA 1GEQA 2HS6A 4K8HA 3SWFA 1E5WA 1XSKA 1TR9A 3LCXA 5JUVA 1JFXA 2AEFA 2NVCA 1XCFA 4AZGA 4PRTA 3FXYA 4FOUA 1TUFA 1OW8A 1LTIC 2KK7A 1DE5A 3AE9C 2UY3A 1QI0A 2KP8A 1B4KA 3PBYA 3SJNA 3ALFA 1TU3F 2GUVA 1QU4A 1P7TB 3DN5A 4GWEA 5E93A 3IIZA 1WA3A 1XIFA 5CPTA 2JQXA 3O6CA 4BWLA 2HK0A 1Z8AA 3EWDA 1BCCE 4XBKA 3ZVHB 3NG3A 5AHIA 5HINA 1S3TC 3C52A 3U5UA 2PZNA 3M44A 4US5A 1W1A1 2VEGA 1K04A 1KQZA 3QV7A 4XAGA 3WMBA 3HE4B 1UHVA 3STGA 1WMKA 2FH6A 2YKKA 4LS2A 1EL3A 1TO3A 3SQSA 3PANA 4M0XA 1KM6A 2BVDA 3B0YA 4V1XA 4H00A 3RX2A 1WKEA 3ZOAA 2CERA 3NIYA 4UMCA 3GUGA 3QHMA 1E9LA 2Z4EA 1XLEA 3VD9A 1S5LH 4RDYA 4D8LA 3WH8A 3W85A 2V5JA 2VC6A 3D46A 2E6AA 2G8YA 3N9SA 2PURA 5TIMA 3Q5SA 4UOQA 1DWFM 3CZKA 2REQB 4DT0A 5DCDA 2HYNA 1V4YA 4YL2A 4TMCA 4DXVA 1BWLA 1DHPA 4HA1A 3DFPA 1RCXB 3PVFA 5BOEA 3STEA 1VAHA 1XH1A 2E74C 4WLCA 4YLWA 4UB8H 2NUYA 3NUKA 3OBKA 1FH8A 3BAYA 5EYWA 1V7AA 2BOEX 1NQ6A 3KOFA 4P8XA 1DWGM 1VFFA 1N8FA 1XLLA 3IK2A 1RLCL 3M5XA 1EPVA 5BCAA 3RITA 7ENLA 1HJ0A 2VI0A 3DYOA 4GKGA 2P7JA 1MSSA 4AD0A 2I5IA 4PUWA 1Q6LA 1NTMG 3GK0A 5IXEA 2E74B 1UR2A 3VE7A 5D9OA 1NELA 3PUEA 5D02A 2CHRA 2XYLA 4S3GA 3Q5RA 1XIBA 2L5HA 2WJDA 1BGYG 1BPLB 4P8WA 2XDJA 4LUTB 4KRUA 2W27A 5CCGC 3SRDA 2WOQA 4FA3A 2G8ZA 4UQAA 3WDPP 2QJKC 1Q7ZA 2OWXA 4CU6A 3ITGA 4XUGA 3EA1A 3WJYA 1TKKA 3KS5A 2EBNA 5BRPA 1G9HA 1KRBC 1EDGA 1XXXA 5GTHE 4GH3A 3W24A 4Z1AA 5D4YA 3N2TA 4AQRD 1HZYA 2QJKB 4I7WA 4A8RA 5G2HA 1SZNA 1G4TA 4RKAA 2CNCA 3CQJA 1FWIC 4UOJA 1XYZA 1QVGO 1ISYA 1YXYA 2IUZA 4NKCA 3CL7A 3EX2A 4DELA 3L65A 5CAHA 2FYUD 2FB2A 1FWHC 1HKVA 2QVAA 2IXVA 1P1MA 2YKPA 4AD2A 4LUYA 4D1JA 3EDKA 3CMJA 1SU5A 3S83A 4CN1A 3A64A 4XD3A 3W7PA 4UZUA 1PZ1A 4F3HA 1T7LA 2Q7CA 2YCLA 4QSFA 2I1JA 3HD7C 2X40A 3GTIA 3JR2A 3GQYA 3W02A 1D3CA 1B3ZA 3B06A 4PMJA 1TTJA 2DQWA 4O14A 4P8VA 4C6MA 2A7NA 3VNDA 1BE3G 1NJJA 1IJDB 3HMJG 5T26A 1O6IA 1FZAA 3HD7B 3EOSA 3G8RA 4HCDA 3VX1A 1ZBVA 1DJZA 3PWIA 3SQLA 1A02F 1O12A 2ZZ1A 3C8NA 3MY9A 1ZQ5A 3VYIA 4QCFA 3HTKB 5D2WA 3SCVA 3CTLA 2WQPA 3MC5A 1YDYA 1XR2A 2IXUA 2PTYA 1QLED 1RE3A 4EIVA 1ISVA 1W5OA 2E74D 4DF1A 3A0HE 3CCRP 3MUIA 2W63A 5I3GA 2IKGA 4U5IA 1S9KD 2VFFA 4XD5A 3S9IA 4LVAA 1GQKA 3O9NA 3HFYA 3MCMA 4JAWA 4HJGH 1JPHA 4LBSA 2NWRA 2HVNA 2VOTA 2ZVNB 1YRRA 4A05A 3PWAA 2EPOA 4L1XA 1KD1Q 1F4HA 2CPSA 1F4AA 1GQIA 4FP1A 4MKNA 5JIPA 1IF2A 4GQ0A 2AL1A 5CCGD 3WBEA 4L1GA 4BHYA 3LBMA 1MW1A 1OFDA 5J8LA 4DXXA 3VMOA 3LM3A 3L67A 2J88A 2BV9A 3TCEA 4FHAA 2WO5A 3AE4C 3N17A 1FZCA 2OELA 4DWSC 2Z5IA 2BX7A 1UIXA 1IXQA 2DZXA 1BFNA 3CAKA 4NAFB 1JGMA 1GYLA 3BGGA 3TKFA 2RJHA 3MWCA 3W07A 4IISA 3N2CA 3MUCA 5HNRA 1QCWA 2Y9ZA 4IOTA 4J3XA 5FF2A 4JPZB 1S5TA 3TCSA 5A6BD 3LV5A 2WSQA 4RE4A 4DWSB 3C2YA 3TYAA 3FXEA 4O54A 3W2MA 3OVGA 3U2OA 4POCA 4F9DA 2QPSA 1HT6A 1KB9I 1H09A 2M5AA 4C1LA 4WKAA 1MUMA 4LF1A 2J7FA 3BH4A 2QCHA 2JGYA 2GQAA 1HVVA 3HD7D 1E3XA 3BC9A 3VM7A 2I56A 4L80A 2PFHA 1W1VA 1L0NG 4GYKA 2C1IA 4JEJA 3CUZA 4M8UA 2PPGA 4EPKA 2W83C 3ZJKA 4RCXA 2D23A 3EB2A 1M04A 4MMWA 1PS9A 4O15A 4GHRA 4DBEA 1W3IA 1A5LC 1XRTA 2GVEA 4GABA 2ZRXA 5AW2B 3GXPA 3HG4A 3VMNA 3DEQA 5DXYA 2WMFA 4MGGA 2J25A 1FZGA 1HVXA 1ZAIA 1KM5A 3PZ9A 3LXAA 4AF0A 4CNOA 5CBJA 4IMGA 2E9BA 4UB6E 4Q4RA 1BYCA 4TOQA 1UKOA 2A5HA 1FZEA 2RAGA 3P74A 1JPMA 2ZWZA 3W6YA 5HNNA 2R24A 3CYJA 3TLLA 1JYNA 3K2GA 4Q8PA 2VX7A 2ZRYA 1Q6RA 1MWOA 3ZMRA 8RUCA 3EPMA 1Q6QA 4BKNA 1XIIA 4PYSA 3AHXA 4G1KA 4JTFA 4FLQA 4NRRA 4R33A 4L6HA 2PDXA 4YPJA 5FSEC 3XINA 5F4WA 2XGIA 4CQBA 1AQHA 1NIUA 4Q8MA 3L7RA 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