2QJIA

M. jannaschii adh synthase complexed with dihydroxyacetone phosphate and glycerol
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
271
structure length
271
Chain Sequence
ELFKDIKNLGKLVRLERIFNRESEKTVIVPMDHGVSNGPIKGLIDIRKTVNDVAEGGANAVLLHKGIVRHGHRGYGKDVGLIIHLSGGTAISPNPLKKVIVTTVEEAIRMGADAVSIHVNVGSDEDWEAYRDLGMIAETCEYWGMPLIAMMYPRGKHIQNERDPELVAHAARLGAELGADIVKTSYTGDIDSFRDVVKGCPAPVVVAGGPKTNTDEEFLQMIKDAMEAGAAGVAVGRNIFQHDDVVGITRAVCKIVHENADVEEALKEIRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Putative aldolase MJ0400
publication title Structure of 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonic acid synthase, a catalyst in the archaeal pathway for the biosynthesis of aromatic amino acids.
pubmed doi rcsb
source organism Methanocaldococcus jannaschii
total genus 91
structure length 271
sequence length 271
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 2.2.1.10: 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase.
pdb deposition date 2007-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qjiA00
4UC5A 4O1BA 1TRIA 2DZSA 2FPVA 1LCOA 2V8ZA 3FEMA 3L21A 2OMAA 3M6YA 3DHFA 4MJZA 3TQ0A 1IXNA 4N02A 5AHNA 1F6KA 2EF9A 1DKWA 1QWGA 1Q6RA 1L9WA 4FEZA 3F4NA 1ZAIA 4JNMA 4BFAA 3DI0A 3UXDA 5K4ZA 4I7VA 2R94A 4K8EA 4IMEA 4NJGA 3HB9A 1I2QA 1XI3A 1LP6A 3GXPA 3OG3A 3TC7A 1YXCA 4MFEA 2HS8A 3NG3A 1I4NA 4UXDA 3W9ZA 1DQXA 1EUNA 1WQ5A 5HR7A 3HG3A 1Q6OA 3MWAA 4LS1A 3JRKA 4MYAA 4DPPA 2R14A 1SQ7A 4E38A 2ZQ0A 3QPYA 1XBVA 3NPVA 2WQPA 4BI7A 3N3MA 1GG0A 1W5OA 3UWVA 5FESA 2GUUA 3LCLA 1TRDA 1TO3A 2QUUA 2A7RA 1Z41A 3MJYA 1Q45A 1GVSA 3Q37A 3W7KA 4O1CA 4JTEA 2GQ8A 1NSJA 4I9AA 4M19A 1JCMP 1JCJA 3I7QA 3NYZA 5LGXA 3IVUA 2FIQA 3M5VA 1PCKA 1ZY9A 5CPOA 1KFEA 1T99A 2B7NA 1N8FA 5T26A 1DBTA 4NVTA 2DZTA 3IVTA 1TPVA 2YDAA 1R47A 2ZFAA 3RU6A 3DFOA 5K9DA 3T55A 2QCFA 4AMAA 4O17A 2BWGA 4WOZA 3HO8A 3GLCA 3EWZA 1MEIA 1NVMA 1SZNA 1K7XA 2DZXA 3PC0A 1SUXA 3W7PA 1JRCA 4RJEA 2Z2UA 1OFOA 1G6CA 2ZZ6A 3W7DA 3TJLA 4LVDA 1X1ZA 4JY8A 3OEXA 2PRHA 3TXVA 3VE7A 3UZ5A 3CM4A 1I2OA 3PUEA 2CLMA 1EP3A 1QPNA 1FCVA 5AHEA 3M5YA 5CZ0A 3NQMA 4KFNA 4M6QA 4XZ9A 4ICNA 1DORA 5G4EA 3NR0A 3DU0A 3W2KA 5DCEA 1OJXA 1XDLA 2PCQA 1BKSA 4NQ1A 3LCWA 3KRSA 3EWBX 4YLWA 5LNWA 4GJ1A 2ZA1A 3ABOA 1D9EA 5AN7A 3GX9A 2YYUA 2NWSA 3LLDA 3B04A 4O50A 5DCBA 2ZDRA 1TPEA 3FA5A 3SY5A 4ML9A 4WUIA 1LOQA 4BR1A 1BEUA 3VNDA 4LU0A 4IX0A 2CLHA 2I14A 5EA9A 1F76A 5G2WA 5C54A 1IXQA 1H60A 4S2CA 2ZRXA 4K7VA 4AB4A 4E0CA 1GYNA 4M7TA 3C2VA 4UMCA 2VFDA 3CC1A 5ABTA 3PR2A 4H3DA 2QCCA 5K7JA 2C19A 4CLMA 1JQXA 4RLIA 3M5ZA 2HTMA 3TUUA 3L9CA 4NZJA 4IMDA 5C2XA 3JR2A 1T0OA 3OIXA 2A4AA 1KFKA 1K3UA 3P5ZA 5EYWA 3W7CA 4TR9A 5AC6A 2QCLA 1A5BA 3LHYA 2E6FA 4B5NA 1MZHA 1H5YA 3HGJA 1JR1A 2LLEA 3C2FA 3P7YA 4KKXA 4AVFA 4PA8A 1LLWA 1KM6A 2CWNA 2DZPA 3E96A 1KFJA 4DO4A 5BW6A 4Z1CA 3LCIA 2CFFA 1F5ZA 3B0UX 1KM2A 5HQEA 1RD5A 5H91A 3H53A 2HS6A 1KLYA 1XL9A 4ZMGA 1EWEA 3W2LA 4AHQA 1DVJA 3Q94A 3C2EA 4Y90A 1QO5A 1ICPA 3IRDA 3TJXA 4NJIA 5K3VA 2QEZA 4HPXA 1I2RA 2Y62A 1ONRA 4LRTA 1FWRA 3S8HA 1OYCA 2YW3A 3MI3A 1YXYA 5AYYA 1H62A 1T96A 5DY2A 2V5LA 1TV7A 2Y7EA 4K8HA 3EXSA 5HWJA 3G1HA 4PL2A 2A21A 1XXXA 3GDMA 3R2GA 4N9BA 2TRSA 2CLKA 4E2BA 4NZFA 1W54A 2VEKA 3G3DA 2ISVA 4QQ3A 4HN4A 2B7OA 3EX2A 3G18A 5F1VA 5KITA 1OFQA 1XM3A 3SW6A 4FF7A 1LM1A 5HJLA 1SPQA 3NM1A 3LCHA 3UWYA 1OYBA 4Y9AA 4IX2A 2X16A 4AWSA 1SFLA 4GRSA 2GVLA 4XQ6A 2GVGA 4XTDA 1LRTA 1IXOA 1QO2A 5AOUA 1KM5A 5I3GA 1QPRA 3W71A 1LROA 2EGZA 3PBWA 4NXSA 4LVAA 3M1ZA 5DLCA 1VRDA 3G24A 3ZWTA 1FXQA 3E0IA 5D05A 5F2MA 5U4NA 1KW1A 3NA8A 2J6XA 3PB0A 2VKZG 4LOCA 3MP5A 2NX3A 4JTFA 4UIOA 1VCVA 3GB6A 2V0TA 1GVRA 3PSVA 3F03K 4FXSA 2J88A 1OFRA 4O52A 1CX9A 5DY3A 4MYXA 3NOEA 4JIQA 2B7QA 1PS9A 4IJBA 1ZAHA 3W1LA 3GDTA 3W7RA 3O06A 2A85A 2CLFA 3CWOX 4MZ8A 1I2NA 2P1FA 2Y6ZA 1Z44A 4YCPA 4LWWA 3MP4A 2J9XA 3TDFA 1QOPA 1TYGA 3NQEA 3WK1A 1C9DA 2PRLA 3UXAA 2Q8ZA 3W6YA 1AW1A 2Y7FA 3GR8A 4O4VA 1OF8A 3STCA 4NX0A 3NQVA 2YX0A 5FEXA 3GR7A 3G1AA 2TPSA 1OFBA 1CW2A 4UFHA 1GQNA 4A3UA 5EPDA 3E49A 1OFDA 4X2RA 5CPMA 4R53A 1GPWA 3S6DA 1SO5A 3LTSA 4CCDA 1W3NA 5AHLA 3M9YA 3DKLA 3MHFA 1UASA 4FO4A 1WX0A 4JX6A 3TU9A 4TIMA 4JYDA 2NUYA 3GYEA 1A50A 1J2WA 3M47A 5KZMA 3NPXA 5LGZA 1VR6A 1QOQA 1UJPA 1X1OA 3A5FA 2OJPA 5D2VA 4O54A 4IPJA 4RXGA 3PSWA 1XUUA 2QKFA 5KMYA 3OVQA 4O8RA 4KWWA 4ADTA 1TSIA 4O16A 5A8GA 1OX4B 4JTIA 1TPFA 1NAL1 1WBHA 4MY8A 3QQ0A 2A2IA 2F7FA 2VXNA 3TK7A 5BMXA 4UNLA 4DBEA 1I45A 2UV8G 1LORA 1W1ZA 1O5KA 1RVGA 1ZCOA 2C14A 2W0UA 4YMZA 3NM3A 1S5VA 4H4IA 3I7RA 4Z1AA 3NQAA 1P5BA 4HNVA 2ISWA 4UTIA 3S1XA 3QFEA 3W2MA 4JTTA 4RR4A 3W7IA 4XWUA 1H7OA 1KLZA 3P84A 4HSOA 5KZDA 1QPOA 1W5QA 1XDMA 2ZZ7A 1HFBA 1QAPA 4WXZA 5J5RA 3G8EA 4XKYA 3TC6A 4TO8A 2Q3RA 2XFWA 3TX9A 1S3HA 4KFPA 2H3DA 4D2JA 4DO6A 1TPUA 4XUGA 2BZNA 1B3OA 1TIMA 2I1OA 1Y0EA 1OABA 1RZMA 2FPTA 3IGSA 2CLOA 2QAPA 5LNVA 3G8RA 4ORIA 2OX1A 4IXHA 2E5BA 1J5TA 3N9RA 1Q6LA 3DAQA 4TMBA 1FUYA 3L67A 5AHIA 3B0VC 3KRUA 4PC8A 1QMLA 4BWLC 3EX4A 1P1XA 5FF4A 4UTLA 1H7PA 3G1DA 3S9YA 4JIPA 3VFLA 3CHVA 2DP3A 3F4WA 4UTMA 1BWKA 4OBTA 4QNEA 4A2RA 1QNVA 4OT7A 3G1VA 3NPWA 3TIMA 1FWSA 2W79A 3G3MA 3CPRA 3LHTA 3NQCA 5IM51 2GOUA 3QMSA 4O11A 1WBJA 1KFCA 2V9DA 5K4XA 3I6RA 1ICQA 4YXGA 3NQ7A 4NJHA 1GEQA 3NNTA 5F2LA 3PS7A 4P61A 2Y88A 3GNDA 2DZUA 3I7SA 1B4EA 1MEHA 3P60A 1I2PA 2CW6A 5AC7A 5D38A 3W7JA 4RZ6A 4K38A 3NL3A 1LOLA 4C1LA 1FX6A 2NXHA 3LXCA 4O1AA 1K7FA 4WXYA 2QCDA 2PC4A 2JKEA 1T8XA 3FYOA 3M16A 4PL1A 2E6AA 1YTKA 2PURA 1OX6A 3EKLA 1W3IA 5I3IA 2F84A 3M44A 4TMCA 1H1ZA 1OFPA 1E51A 3C0JA 4UTTC 1WV2A 2C16A 2QCNA 3W23A 4Z0JA 1ZENA 1UCWA 2ALDA 2JBMA 4U4MA 3FYPA 3LBCA 4RK8A 3QF0A 4UTUA 1KFBA 1TQJA 3W7NA 3NZRA 2Q8LA 3S1VA 5LNUA 3CQ0A 4IUOA 4UMBA 1W37A 3NQ2A 3O05A 4DELA 2R91A 1W31A 4JDBA 1L6YA 1GT8A 5GVJA 4HNTA 4M6PA 4MY1A 4NUWA 3VI2A 2OT0A 3T40A 3SGUA 1SW3A 4JS3A 4PCFA 4JYFA 3PVFA 4O15A 3GXNA 5K9CA 3KX6A 1D3HA 5CZTA 5EY5A 2OZ0A 2ZRVA 1EIXA 3EB2A 5A5WA 2ZRUA 5KTLA 2JGQA 1QFEA 2ZYFA 3B03A 2VC6A 3MI6A 1ZFJA 4O0ZA 1XC4A 1NF7A 3HF3A 3EWWA 4KFOA 2WSYA 4MIMA 5LHEA 2EKCA 4LVFA 4GUGA 1YDNA 5U7SA 2AAMA 4RX0A 5AB3A 2J27A 2ZTJA 1MXSA 2C15A 4WOQA 3IVSA 4ZQOA 1R2RA 3LCXA 3W7GA 4JDYA 2CLIA 3W1UA 1N7KA 3BG3A 4ZQNA 3EX6A 2A0NA 4JN6A 3LXAA 1ME7A 3GZ3A 4UFIA 4DF1A 2H90A 3RK8A 3WK3A 1EUAA 4OU1A 1O5XA 1F6PA 3W7HA 1OF6A 1DJNA 3BK0A 3S0CA 4X22A 3MP3A 3C6CA 4OV4A 3W86A 5C6MA 3HBLA 3FLUA 3HPSA 3BARA 2WNQA 4HKPA 1AL7A 4UTWC 2QDGA 3W87A 2V30A 3KOFA 3W70A 1K03A 4P2VA 1OVDA 3QEZA 1ZHAA 1AW2A 4RV8A 3GDKA 4IMFA 4NX5A 3O6DA 3C3NA 3PWAA 3D0CA 1R30A 5LKYA 3TH6A 3W1XA 1WOBA 5DCDA 3INPA 3M7WA 1DQWA 3STGA 3TSBA 3KVMA 3Q58A 1XBXA 4A2SA 4N9CA 2NLIA 4O12A 1JCXA 4TX9A 4OHQA 3C4UA 3R89A 4O1DA 2ABBA 5D37A 1AG1O 3KVLA 4K36A 4N2YA 4LNYA 1V7YA 4MFDA 3M41A 3QQ1A 3MO7A 1TPB1 3ABQA 3YPIA 3P8JA 1KM0A 3W74A 3O1NA 3LCFA 5G2IA 4JTJA 3FKRA 3IV3A 4OWGA 2GQAA 4EOUA 5D2YA 2ZZ2A 1THFD 1CI1A 2GVJA 1UUOA 2NX9A 3NEVA 3TAOA 3W84A 4NU7A 1TJPA 3OHIA 4LRSA 1GYLA 2C13A 2V2CA 3W75A 3L5AA 3PF3A 1EX5A 3VKJA 3HGRA 3BV4A 4JTLA 3QM3A 4N9EA 2G95A 2AGKA 3CWNA 3UPBA 1RQEA 3W1RA 1SO4A 3HG4A 2BSLA 2X1TA 1R2TA 5TQLA 3C52A 3LCGA 3S42A 3U6WA 1Z42A 3MBFA 2PRMA 3SFKA 3KRZA 1YTEA 4AWTA 3PY2A 3QH2A 3PBUA 1KM4A 4DQWA 2WO5A 2VEPA 3DGRA 1JUKA 3P82A 1NF0A 2CU0A 5BMWA 3HIJA 3G0SA 5K2ZA 4MY9A 3UYCA 2NXIA 2VOMA 2C1HA 4UCGA 1JQVA 3L0KA 5FI8A 4O53A 3M0ZA 3MYOA 1W8SA 2Y7GA 3HGOA 5KSWA 4JTHA 1TPDA 1ZAJA 2DJLA 5LZLA 2A7PA 3A9IA 4JX4A 1JRBA 3GAKA 3L65A 4JTGA 5F2IA 1TPH1 1ML1A 3EKZA 2ZZ4A 3STEA 4Y6GA 2WOQA 4LT9A 4FNUA 4CNPA 2JKPA 2Z0IA 3A23A 5E0KA 3N73A 1TJRA 1SO6A 1DL3A 4LTSA 4GBUA 1VJIA 3SGZA 1L2UA 2YFOA 3NAVA 1ALDA 2ATMA 3WJSA 3N34A 3EWYA 4PTNA 2E5DA 3TFCA 2YW4A 3BLIA 3BLEA 4IMCA 1SZFA 3PULA 3E9AA 3IIXA 3W3OA 3ZR4A 1LYXA 4J9JA 1ZJIA 1L6WA 3FJLA 1V5XA 1YXDA 2ZZ5A 5HINA 2XN0A 3ABRA 2WSQA 2CZ5A 4AEOA 5KZEA 4O57A 3WJZA 1RQHA 1IGSA 1PCWA 3L0NA 4QITA 4DO5A 2FQIA 4FX6M 3MW7A 5DELA 3BW2A 3DH7A 4UR8A 1B57A 2X1UA 3I65A 3LDVA 2HSAA 1OG0A 4AXKA 1PL9A 1C29A 1K7EA 1MSSA 4AH7A 1LLZA 4JTSA 3GDRA 3LOTA 3N2XA 1G4PA 2NV1A 5D32A 3C56A 2EAWA 1VYPX 3NVTA 5CSSA 3P8IA 4S2BA 3E12A 4W9TA 1FDYA 2CZFA 5E1QA 3QJAA 1AK5A 4L4LA 1TMHA 5AHMA 3W2UA 1R46A 2GQ9A 4ALDA 2ZZ1A 1M5WA 2C6QA 1HG3A 4Y8FA 4BF9A 2YCEA 3SSJA 5AHFA 4K37A 3GDLA 1G69A 4ADUA 1WXJA 3P81A 3IGXA 4XTIA 4MPQA 2JK2A 2A5HA 3WJWA 1JJKA 3THQA 1MO0A 2YSWA 4JR5A 3TMLA 5I3HA 5EL1A 1KTCA 1SZGA 1SFJA 3W1AA 4HIBA 1TREA 5D02A 3BW3A 5D2WA 2I9EA 5HWMA 3FOKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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