The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Caspase-7
|
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
18
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RWV B; 3GJS B; 4DCJ B; 2QL7 B; 4ZVR B; 2H5I B; 3KJQ B; 1I51 B; 2CDR B; 1RHU B; 2H65 B; 1SC3 B; 3EDR B; 3R7N B; 2CJY B; 2CNO B; 1PYO B; 2HBR B; 2QLJ B; 3R7S B; 4ZVU B; 2H5J B; 4ZVS B; 2FQQ B; 2XYP B; 1SC1 B; 1GFW B; 2QLF B; 3P4U B; 3R6L B; 2H51 B; 3D6M B; 3R6G B; 1QDU B; 3SIP B; 2H4W B; 1RHR B; 2XYH B; 5IC6 B; 1RHK B; 1ICE B; 4DCP B; 4ZVT B; 2QLB B; 3P45 B; 2Y0B B; 2C2Z B; 3R5J B; 1IBC B; 1NME B; 4DCO B; 4JB8 B; 1RWM B; 2HBY B; 2CNK B; 3D6H B; 3QNW B; 4LSZ B; 2DKO B; 1RWP B; 1RWX B; 2HBQ B; 1RWK B; 2CNL B; 1F9E B; 1QTN B; 3GJQ B; 2XZD B; 5K20 B; 3EDQ B; 3IBF B; 1PAU B; 2C2K B; 2C2M B; 3KJF B; 3KJN B; 3D6F B; 3RJM B; 2H54 B; 2XZT B; 2C1E B; 3GJR B; 1RWO B; 2QL5 B; 1BMQ B; 1RE1 B; 2C2O B; 3NS7 B; 1RHM B; 2H48 B; 4ZVP B; 4ZVQ B; 1I3O B; 1SC4 B; 2XYG B; 3GJT B; 2CNN B; 2HBZ B; 1RWN B; 1RHQ B; 3IBC B; 3R7B B; 1RWW B; 2QL9 B; 4ZVO B; 5IC4 B; 2CJX B; 2H4Y B; 2P2C B; 1RHJ B; 2Y1L B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1C0T B; 4Z7C A; 3EGW B; 2W8K A; 2K8G A; 1UJ6 A; 2RF2 A; 1HD1 A; 2LA4 A; 3I5A A; 4IRK A; 2E5L F; 4ZPD A; 1FTC A; 1HA1 A; 5DQI A; 5BJR A; 4LIW A; 4YB1 P; 5ETO A; 1YZ7 A; 4ZS6 A; 1RUS A; 2M9K A; 1YBA A; 2SXL A; 4J9V A; 2FZK B; 5I3U B; 1JXL A; 2BJ7 A; 4QIE A; 4XO0 A; 2ZDP A; 5ETS A; 3ENA A; 1ELO A; 4N77 A; 3O3L A; 3OL9 A; 1FO1 A; 1S48 A; 3EX7 B; 3FEX B; 4CM0 A; 3IS9 B; 3RW6 A; 3BDP A; 4PWD A; 4OZ1 A; 2DNM A; 5B0C A; 2F65 A; 2FVP A; 3FK4 A; 4OZ0 A; 4PQA A; 3L09 A; 2HWI A; 5KT2 A; 2QT7 A; 3HVR A; 2XTJ P; 3HX9 A; 1HQ2 A; 1N5V A; 3M2R B; 2KHD A; 2C3M A; 5CD4 A; 3QZ8 A; 5CA5 A; 1LFP A; 5I3Q A; 3VWS A; 3ONQ A; 2V63 A; 1KP6 A; 3LP0 B; 4M5I A; 1OS5 A; 3NY0 A; 2H5J B; 3M9N B; 1GFW B; 3H2U B; 2H51 B; 1KN6 A; 4H54 A; 4DSI A; 2VG7 A; 1DUR A; 4MK7 A; 4CLW A; 3MAQ A; 1I1G A; 3R1H A; 2WBM A; 2FVQ A; 3A3N B; 3SQG A; 3MEE B; 2YQ0 A; 1UET A; 4RUB A; 3LUY A; 1MWZ A; 3V4I B; 2N4C A; 2HHH J; 5D4L A; 2HSE B; 2O5D A; 2HND A; 2C2K B; 1S9G A; 3D6F B; 2CQP A; 2WVB A; 1XC9 A; 2BW7 A; 3CW2 C; 3B78 A; 1IBK F; 3QFW A; 2KVI A; 2ZBC A; 5BR8 J; 4I6A A; 3FFI B; 3R2D J; 3MUM P; 3DRX A; 3OXF A; 2W01 A; 3DHX A; 4GKK F; 1F2H A; 4FF4 A; 4BCA A; 4CTA B; 3CJ3 A; 1SL1 A; 2V8H A; 4KGZ B; 4DCJ B; 4ENO A; 2NPI A; 5D0G A; 2MKY A; 3ZTR A; 1I51 B; 1SC3 B; 3MAH A; 1WEZ A; 2CJY B; 3OXG A; 3LPE A; 4ZVF A; 2DPI A; 3C15 A; 1IBM F; 3OT9 A; 4DQQ A; 4KT0 C; 4PXD A; 1UEK A; 1RAF B; 1NDK A; 1WOS A; 4B02 A; 1H7W A; 5FII A; 4DG1 A; 1FRK A; 2MZT A; 4JI7 J; 1KD1 T; 2J0Q D; 3QAE A; 5HN0 A; 3BH7 B; 1XMQ F; 1RWP B; 4HHU A; 4ES3 A; 1L3U A; 1UPM B; 4AYB D; 4NA2 A; 3KJN B; 3O5T B; 3FBB A; 4ZIW A; 4R0J A; 4IG3 B; 1A6L A; 2QMX A; 3KFW X; 4LBI A; 2QIF A; 3PW5 A; 2R2U A; 1GH8 A; 2NXJ A; 3SCL E; 3EIC A; 2CJX B; 2I5J B; 3IR7 B; 4P7V A; 2I0X A; 2F63 A; 4ZJL A; 2V0N A; 3FZB A; 2AX1 A; 1KLM A; 3QJJ A; 2B3T B; 5HRO B; 3MPV A; 4Y2I A; 3HO1 A; 1WC0 A; 1KTQ A; 4QCL A; 2QMW A; 1GXU A; 3FZ2 A; 1G6B A; 2AZ3 A; 1BE4 A; 3D6T B; 4Q45 A; 3EXC X; 2HFO A; 5LMU J; 1G4C A; 2GIF A; 2UXB F; 3W2W B; 1KOO A; 4RW4 A; 5D3G A; 4RX6 A; 3I96 A; 2X1F A; 5J2Q A; 2BJ9 A; 3HK2 A; 4IO1 A; 3E3X A; 2CQ1 A; 3CJ2 A; 4MYU A; 4ELU A; 3OQ2 A; 2UUT A; 1KSP A; 4KAI A; 4QWD A; 4DV1 J; 1IKX B; 5BYR A; 2AYM A; 3KLE B; 2W24 A; 1GNK A; 3EZO A; 3V81 A; 4YR0 A; 1EET A; 4DSF A; 4URG A; 1YVF A; 3EUN A; 4FP9 A; 1U0S A; 4X64 J; 3N9U C; 1BXN A; 4NLV A; 1QLN A; 1YI2 S; 2DHX A; 1HBO A; 3MTJ A; 2I8E A; 3PDN A; 4G6V B; 2V8P A; 2XNR A; 4ED2 A; 4ZCI A; 3BKF A; 3E01 A; 3M8P A; 3MM7 B; 4PR6 A; 4YP3 A; 2IRX A; 2AGO A; 1K44 A; 2GIR A; 2G1H A; 2VG5 A; 4ID5 A; 1CS4 A; 3KJV A; 4PWU A; 1DZ5 A; 2E44 A; 3UD5 A; 3ZZR A; 2IA0 A; 4WXO A; 4DL2 A; 2ACY A; 4C48 A; 3H4D A; 3LP2 A; 3FGV A; 4RNM A; 2NXU A; 3DLG B; 3J7Z 5; 3EYZ A; 1HBN A; 4JV1 A; 2QC3 A; 3PRV A; 2I38 A; 2EC0 A; 1RTD A; 2ZOM A; 2KG0 A; 2M5Y A; 2KDO A; 3FCH A; 2F8H A; 2PGC A; 2HAI A; 3P5B P; 3RB3 A; 2IJN A; 5HMY A; 4WFZ A; 3LO3 A; 4DR6 F; 4OYO A; 4FNH A; 5IXU A; 1T9X A; 4OJH A; 5LJ3 Y; 1FXD A; 2OP5 A; 4WIQ A; 3MM5 B; 1TL7 B; 2BJE A; 3OTD A; 4MK9 A; 2RQK A; 4EFA C; 1PG5 B; 3GIK A; 2WBR A; 4WU2 A; 1L3S A; 1EIY B; 1RXO B; 4LT6 A; 1VLY A; 5JUM A; 2AEM A; 4NPO A; 2XI2 A; 5B0A A; 2HHV A; 2U2F A; 5AE3 A; 1X4A A; 4R5P B; 4DV6 J; 1TKZ B; 5LM7 E; 2JLE A; 4QW9 A; 1HR0 F; 3BBC A; 4ED8 A; 4LRC A; 1N34 F; 4DN0 A; 1X5O A; 5E2Q A; 3DFE A; 1RAI B; 1PBA A; 3AJD A; 4UT4 A; 3LAM A; 3SCK E; 5B0F A; 3MI7 X; 4P2M A; 4Y6I A; 3SZ2 A; 4IQM A; 4KGM A; 2CQD A; 4FXD A; 1UW4 A; 2WVE A; 3HD1 A; 5H9F J; 5C2G A; 3OHB A; 4OX6 A; 3VVT A; 3PYD A; 4J9N A; 2HBZ B; 7FDR A; 4MK8 A; 1UW9 A; 2BUN A; 4OZL A; 2WON B; 2G1D A; 3TVK A; 2NRE A; 1QE1 B; 3BYP A; 4HYK A; 4LRF A; 3M8S A; 1YBT A; 2Q6B A; 1RT7 B; 1MNE A; 4G65 A; 1BC6 A; 5DZ6 A; 4RW9 A; 1HIY A; 1U09 A; 2HS0 A; 4I56 A; 3NOG A; 5EX0 A; 2VZ9 A; 3HVW A; 3IR5 B; 1FNM A; 1TKT B; 2XYP B; 4BHQ A; 1U1O A; 1FRH A; 2HMI A; 2KKH A; 2HHP A; 3DI6 A; 2MQO A; 5E5N A; 2IM0 A; 3TUZ C; 4CM2 A; 4OYW A; 3L4B C; 3K58 A; 4V19 X; 1RT1 B; 1RAE B; 5A0Y A; 4UUW A; 3PAC A; 4F4A A; 1FT8 A; 3HI9 A; 4LF1 A; 3Q89 A; 2XCP A; 4NLW A; 4ALZ A; 1TUV A; 4TU8 A; 2EPI A; 3VHQ A; 3QRR A; 2YKM A; 2AKW B; 3RB4 A; 2ADC A; 4NML A; 1X0F A; 5KFU A; 2W4C A; 5KFD A; 3CCU S; 5EGY A; 4WE1 A; 4ICL B; 2FZG B; 5LXR A; 2LCW A; 2Q79 A; 1JX4 A; 2MYF A; 2VIC A; 3A12 A; 1S1V A; 4F25 A; 1HHT P; 5D8H B; 3C14 B; 3NBP B; 3SDE B; 8AT1 B; 4GVB B; 3TW0 A; 4F8R A; 1AZS A; 2W8L A; 4HDH A; 3NMA A; 4CNZ A; 2OEJ A; 3Q8Y A; 4EBC A; 1UJ5 A; 1HNX F; 1YGY A; 2RD5 C; 3OFF A; 2I9S A; 4RKU C; 1Q81 T; 3AD7 C; 3KWM A; 4KQZ A; 2Y8W A; 4PXE A; 2GO8 A; 5KFY A; 4P2X A; 4M5H A; 4DV7 F; 2YNG A; 1WOO A; 4TLR A; 5A8W B; 2QV6 A; 4DL6 A; 3T19 A; 4DV5 F; 1MML A; 4Y3C A; 5J2P A; 3J7A 1; 5K8N A; 2VIH A; 3M8Z A; 3AA8 A; 3AQO A; 5C24 B; 4JV5 J; 2AJ0 A; 4P75 A; 4CLF A; 4BWM A; 1PYS B; 1RE1 B; 5GAG I; 4OLP A; 4K4V A; 1WEX A; 2D3O 1; 4X4R A; 3HVT A; 1F9H A; 2QEX S; 5H9E J; 4QIF A; 2VDH A; 1HYS A; 4LRA A; 3WIV A; 4Q8E A; 5AE1 A; 2BA9 A; 4DV2 J; 2E5J A; 4I0W A; 2XUL A; 1HL6 A; 5J1E A; 2ZH5 A; 1FNX H; 4OV6 A; 2ZD1 A; 4RBV A; 4LF5 J; 2BE2 B; 4C6A A; 2YVS A; 2MZJ A; 2GZO A; 1WHX A; 2DCL A; 2OSQ A; 1SCJ B; 1LW0 A; 3KLF B; 2F8M A; 1ZPW X; 5DQH A; 1ZM4 A; 2WHO A; 3BBB A; 5KFO A; 3LQV A; 3W65 A; 1YK9 A; 3FRY A; 3AB2 B; 5B08 A; 4X66 J; 1RJJ A; 2GQQ A; 3TZY A; 3GV7 B; 3UDE A; 1EAY C; 4NEZ A; 4I2P B; 2ZBI A; 2BVZ A; 4DQS A; 4A8Q A; 3QJL A; 2MKH A; 2XZT B; 2NXN A; 4TN2 A; 1FJG J; 3MEG B; 1A7G E; 1KR4 A; 1IKW A; 4MIW A; 4OJG A; 3JYT A; 2A2C A; 1Q8I A; 3H4B A; 3IMQ J; 4HKQ A; 3DLH A; 2DR7 A; 7FD1 A; 2YNI A; 3MMC B; 2QN6 B; 4OI2 A; 2BMB A; 2BAC A; 2FJW A; 2JFK A; 1M0S A; 4TYB A; 3D5M A; 3PJW A; 2ATL A; 2R42 A; 1RLD A; 5BR8 F; 3DMJ A; 1QM9 A; 5FJ4 A; 4OI0 A; 2PMH A; 3CJ5 A; 1S9F A; 3CJ4 A; 3TA1 A; 1NK6 A; 2BAN A; 3M8W A; 3LAL A; 3EE3 A; 1N33 J; 2G13 A; 3OLB A; 1SL2 A; 3DRS B; 3W9H A; 3QRQ A; 1QAX A; 2GFF A; 4CCH A; 2V9W A; 2KT2 A; 1G1X A; 4NXM J; 4ZHR B; 1YJ7 A; 3LGN A; 5HAN A; 1FJ7 A; 2YKQ A; 2IRY A; 1S6U A; 3ZC4 A; 1BQX A; 3D0H E; 2ZNY A; 1QAY A; 3BSN A; 3NEK A; 2OGU A; 3C8Y A; 1PC4 A; 3BS9 A; 1WF0 A; 2YH1 A; 4OX7 A; 4C8N A; 2ZH1 A; 5ITH A; 1S49 A; 5KFF A; 4ECT A; 3EVO A; 1UVK A; 1UVN A; 3HFK A; 4JI7 F; 1U1Q A; 2GMJ A; 2HNZ B; 4GMK A; 3EGN A; 3CT9 A; 3IN5 A; 3SFG A; 4ED0 A; 2XYG B; 2LMI A; 3GB0 A; 2V50 A; 3UQS A; 3QGI A; 3K17 A; 3W66 A; 5KT5 A; 1NBE B; 5HO4 A; 3R2C J; 5KFB A; 4FPI A; 4TVA B; 3WIU A; 3NXZ A; 4KJI A; 1NPP A; 3AOA A; 2M52 A; 3F56 A; 2HRY A; 5C42 A; 1XWL A; 3K5N A; 1RT6 A; 3NCP A; 2FHK A; 4PAA A; 1Q5V A; 5FLX Y; 3T9Z A; 2CUY A; 4IFV A; 4AD6 A; 3IWL A; 4A8K A; 2XMM A; 2NPF A; 5K8P A; 4J9S A; 4CLP A; 1Q1K A; 2ZKU A; 3DOL B; 1CJV A; 4TXS A; 5IFM A; 2YKN B; 1L3V A; 3D4J A; 1JLB B; 1FFG B; 1FWK A; 3CCL S; 2VG6 B; 4UY8 5; 4RW8 A; 4O3S A; 5LMU F; 2C2R A; 2W7O A; 2CPZ A; 3PEH A; 3DLK B; 2G0J A; 1RTJ A; 2ROE A; 4GRS A; 5GMD A; 1S1X A; 1DLO B; 2OJ3 A; 3QLH A; 4L73 A; 4YN3 B; 4DL3 A; 2J76 E; 1BD6 A; 3TZZ A; 2DGW A; 4RNH A; 4U95 A; 5IS2 A; 2MEW A; 4DX7 A; 4DV1 F; 4KHP J; 2HFZ A; 2BQU A; 1HQE A; 1MWY A; 1UTA A; 2HMI B; 5L1K A; 1VBX A; 2PII A; 2JJ4 D; 5IM0 B; 3X3U A; 3H5U A; 4DR7 J; 1N32 J; 2LYV A; 4DF8 A; 2IIH A; 1C2P A; 2XZW A; 2DGT A; 2CVI A; 1HBM B; 5K9F A; 2ZH4 A; 2R3V A; 3MM6 A; 5L8R C; 4X64 F; 3LW5 C; 1PYT A; 4P2F A; 3MAA B; 3P45 B; 1J5O B; 2BJ8 A; 3V6D B; 2FUG 9; 4KFB A; 3J7A N; 4NCG B; 4DDF A; 3QZ7 A; 2V6A A; 1H74 A; 4CLY A; 3WX8 A; 2ZC4 A; 4OZJ A; 1CJT A; 2W2M P; 2JWN A; 1W2B R; 5GME A; 4Z2X A; 3AJ1 A; 2ZIT A; 2E29 A; 1RTI A; 4FDF A; 2OH2 A; 1RAH B; 5D0R A; 3BZQ A; 4QIW D; 3MCN A; 3UDC A; 2JRS A; 1U02 A; 2DRA A; 5KFM A; 1PSD A; 2RUG A; 4AL7 A; 1U6F A; 2YWG A; 1RT2 A; 2V8D A; 1WC3 A; 1VQM S; 4CO1 A; 3KK1 B; 4B9T A; 1SQE A; 2RHQ B; 5HVG A; 2BKO A; 1C4A A; 1NKB A; 3WBZ A; 1KS2 A; 1MRO A; 4F67 A; 2MZR A; 2ZNZ A; 4KBI A; 1VJW A; 1U2R A; 3CWJ A; 3ZNU A; 4ID8 A; 4QOT A; 2XY6 A; 4QBU A; 1U1N A; 3CE8 A; 2R2T A; 3HUL A; 3CB4 A; 1TL3 A; 1FI4 A; 2HG4 A; 4USJ C; 3MMA A; 1OIA A; 3UCZ P; 2OFG X; 1AA1 B; 4EZ6 A; 3G71 S; 1MMD A; 1HWI A; 4C8L A; 1NXI A; 2Z2L A; 3LH2 S; 4G1P A; 1K1Q A; 3D67 A; 4WBF A; 3RBZ A; 2ZE2 B; 4GKJ F; 5DGB A; 2JZ5 A; 3TJ9 A; 1H7X A; 2OI2 A; 3QT6 A; 1RHQ B; 1M5S A; 2MPU A; 2EKY A; 3IRX A; 3KLG B; 1B70 B; 4HHJ A; 1TFY A; 1KQG B; 1O8B A; 3PG9 A; 5J2N B; 1TMM A; 2R7U A; 2E1A A; 5KFH A; 4DUY J; 3VQT A; 3GII A; 4F4Z A; 2EK6 A; 5F8N A; 4B9L A; 2EBE A; 1RLC L; 2HPU A; 1P9Q C; 1LW2 A; 4EO6 A; 2RUS A; 3HSG A; 5EHH A; 2L3M A; 2UXD F; 4B3M J; 3TNV A; 3JTN A; 4YEA A; 2DNP A; 1WF2 A; 1FA0 A; 1IKW B; 2N7C A; 1NUE A; 3Q22 A; 4JV0 A; 1TVR A; 3GFY A; 3NCR A; 3KHH A; 3PEJ A; 5CXT A; 2NLW A; 4ERD A; 1RA7 A; 2M4M A; 3D3B J; 3RJM B; 2O67 A; 4LBP A; 5HP1 A; 1U1K A; 3DU5 A; 3CJK A; 4GO7 X; 1JLA A; 1XBW A; 4DR2 J; 1F0X A; 2LQ9 A; 3DOM A; 5KTQ A; 3L7U A; 4WKR A; 2QFJ A; 3M30 A; 4OHY A; 3IWN C; 5T7L B; 2LA6 A; 2C3U A; 1RK8 A; 2VC0 A; 2XHC A; 1F5C A; 4WYL A; 2BOA A; 4X62 F; 2M2B A; 4ES2 A; 3MMB B; 3BGU A; 4NEY A; 2P9E A; 4KYZ A; 4K0K J; 5L9X A; 3TRG A; 3RZA A; 4OHV A; 1X4F A; 1NDL A; 2VV5 A; 4RNN A; 4OI1 A; 4TY8 B; 4P6Q A; 1VJQ A; 3MEC B; 2GVD A; 3WDO A; 3UVJ B; 1ZZF A; 1WWH A; 1RTZ A; 1TU0 B; 3PYG A; 4NMX A; 3L7O A; 2AQ4 A; 1JLC B; 3MXH P; 1EKR A; 3VQS A; 1PIE A; 4RBU A; 3HP6 A; 2AGP A; 2ALY B; 3OSP A; 3MD3 A; 3IO1 A; 1SVD A; 3NOC A; 4A8O A; 4AE5 A; 1N88 A; 2NXE A; 1VQ6 S; 4MJK A; 5A8K B; 1S4E A; 4JV5 F; 2OMO A; 4NLQ A; 1DAR A; 4ECX A; 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