The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
KIPVEADFLFAYSTVPGYYSWRSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVVSMLTKELYFSQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Caspase-7
|
| publication title |
Plasticity of S2-S4 specificity pockets of executioner caspase-7 revealed by structural and kinetic analysis.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
16
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
|
| chains with identical sequence |
D
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.60: Caspase-7. |
| pdb deposition date | 2007-07-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C2Z B; 4ZVP B; 2QL7 B; 2C2O B; 4JB8 B; 3QNW B; 3EDR B; 1GFW B; 2XYP B; 3R5J B; 3R6L B; 2CNN B; 1SC3 B; 3D6F B; 2XZT B; 2CNL B; 2C2M B; 3SIP B; 2XZD B; 1PAU B; 2QL5 B; 2Y1L B; 3P45 B; 3KJF B; 4DCJ B; 3R7B B; 1QDU B; 3KJN B; 2HBZ B; 4ZVU B; 3GJQ B; 1SC1 B; 3D6H B; 4DCO B; 2H51 B; 1BMQ B; 1RHM B; 1RHK B; 1PYO B; 5IC6 B; 3R7N B; 3D6M B; 1RWW B; 3IBC B; 2H54 B; 2H48 B; 1RWX B; 2H5I B; 2H5J B; 3IBF B; 2QLB B; 3R6G B; 2XYG B; 1I3O B; 1RWP B; 2CNK B; 2H4Y B; 1NME B; 3GJR B; 1RHR B; 3GJS B; 2CNO B; 4ZVR B; 1RWV B; 1RE1 B; 2H4W B; 2QLJ B; 2QL9 B; 1RWK B; 2CJY B; 1SC4 B; 2Y0B B; 3KJQ B; 2H65 B; 5K20 B; 4ZVT B; 1RHQ B; 2XYH B; 2HBQ B; 4LSZ B; 3NS7 B; 4ZVO B; 1RWO B; 1RWN B; 1IBC B; 1I51 B; 1RHJ B; 3GJT B; 3RJM B; 4ZVQ B; 3P4U B; 2CJX B; 2C2K B; 2C1E B; 5IC4 B; 1ICE B; 1QTN B; 2CDR B; 2HBR B; 1F9E B; 2P2C B; 3EDQ B; 2QLF B; 1RHU B; 2FQQ B; 2DKO B; 2HBY B; 4ZVS B; 1RWM B; 4DCP B; 3R7S B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3G4S S; 3D68 A; 1TL5 A; 5AXN A; 1AT1 B; 4DR7 J; 2ZC3 A; 4XTT A; 2HVD A; 2DNN A; 1U47 A; 2YH1 A; 4DUZ F; 3AJ1 A; 1EAY C; 2N3L A; 2RRN A; 4USJ C; 1FVS A; 3RZA A; 4KSE B; 2HWI A; 3QT7 A; 1ACM B; 1EIY B; 3CD6 S; 3L7O A; 2ZHB A; 1QSL A; 3H20 A; 2FDN A; 3C14 A; 2KXF A; 4UOH A; 1N5T A; 5AJ3 J; 1NJX A; 3VVT A; 5CZX A; 3DRR B; 3R5G A; 1K0T A; 3MEC A; 1OY6 A; 5FDL B; 1UWA A; 2DY1 A; 4DZD A; 5ETS A; 5D78 A; 1EQM A; 3BGR A; 2XYH B; 2BKO A; 4KFB B; 4U6P A; 3EWG A; 3GFX A; 3T41 A; 4C3L A; 1DAR A; 2ILZ A; 2KN4 A; 5IT4 A; 4HDG A; 3C6T B; 1NK6 A; 4LF1 A; 1FRX A; 1VBK A; 2K1R A; 3SFU A; 3KG1 A; 1S9G B; 2F8M A; 2XLK A; 2LKZ A; 5D0G A; 1F1B B; 2KH9 A; 2XMV A; 4PG4 A; 2MGZ A; 4GMK A; 2HQ3 A; 1S1T A; 4RBV A; 2R2T A; 3CC4 S; 3RUB L; 2XSJ B; 1LW0 B; 5D15 A; 2CQ2 A; 2BQ3 A; 2HWT A; 3KJF B; 4WU2 A; 5IT0 A; 1VRT A; 4O3P A; 4U9R A; 3LTO A; 3C8Y A; 4CIO A; 2E44 A; 2XS2 A; 1ZOT A; 3UNY A; 2LVW A; 5F8I A; 4JV0 A; 1WTF A; 4EI2 A; 4USI A; 3B82 A; 2EFN A; 3OTB A; 4WZM A; 1BY9 A; 1TL1 A; 3UVJ A; 4TLQ A; 2V8P A; 4WFX A; 4CH7 A; 3KJQ B; 3ITH B; 1XIQ A; 3O8W A; 1RT4 A; 2K7K A; 2MQM A; 2DNY A; 1VCT A; 4J9M A; 4Y2M A; 2FYX A; 3D4J A; 3WX8 A; 1S6U A; 2YQ1 A; 1RKJ A; 4NLP A; 3VR1 A; 3OUY A; 1JQG A; 1ZAV A; 1SKR A; 3KK3 B; 5B0B A; 2D3O R; 1G4C A; 3JSB A; 1R6Y A; 3DI6 A; 3DRP A; 1S99 A; 3WC2 A; 1GFW B; 2RNE A; 3DKD A; 3PKM A; 3U02 A; 1IR1 A; 2C2N A; 1X4A A; 2LP4 A; 3F56 A; 1ZZN A; 2GW8 A; 2Z30 B; 4P7T A; 3VGT A; 2OEK A; 3KK1 A; 1CG2 A; 1UVL A; 4KPY A; 4MK7 A; 3RAQ A; 4MJK A; 2L48 A; 2IPO B; 1HLW A; 4F0K A; 4KO0 A; 1MN9 A; 2W9C A; 4UOF A; 1VIX A; 3KDN A; 1C0T B; 4NAS A; 3LA0 A; 1G1X A; 4L75 A; 1UEK A; 3OBI A; 5JUM A; 3BV8 A; 5ETV A; 8RUC A; 4NCB A; 2X3G A; 4R0J A; 4LFB F; 3DMJ B; 2V63 A; 1VQP S; 2CJY B; 3J81 j; 2DEI A; 3EXC X; 2YNG B; 2ZH8 A; 1RAG B; 4KE5 A; 2VH7 A; 1LQ9 A; 2QLX A; 1L3S A; 3HUL A; 3C6U A; 4N77 A; 2KVI A; 2HGM A; 1PJ5 A; 4GVB B; 4ZN1 A; 5F9N A; 4B9M A; 3OJS A; 2DRA A; 2OPS A; 3KG4 A; 5B09 A; 1SVD A; 4Y00 A; 4PG8 A; 3T5H A; 1NDK A; 2I38 A; 2DXD A; 1ITP A; 4PXB A; 2C2O B; 2BJ8 A; 4OX8 A; 4UTG A; 3W66 A; 3HX9 A; 3D6F B; 2RQC A; 2PE8 A; 3DM2 B; 3TVY A; 3P45 B; 3D0G E; 4E98 A; 4EMD A; 1YDL A; 1Q16 B; 4DL0 C; 2CZ4 A; 4ZLP A; 3BR8 A; 2AX1 A; 4FXV A; 1RT6 A; 3LAM A; 4K2X A; 4ZP7 A; 2I5J B; 3QJL A; 1SIW B; 5HK4 A; 5T14 A; 4ZHR A; 4NA3 A; 2BAC A; 3UDV A; 4ECW A; 1AZS B; 1U1L A; 5HP1 B; 1OMS A; 3EX7 B; 2EK6 A; 1X7V A; 2RRA A; 5LMU F; 4J9S A; 1DJ0 A; 4OHX A; 4WE1 A; 3I4H X; 2F4F A; 3EJM A; 4RPF A; 2IMW P; 4F4Y A; 3FUY A; 2HBY B; 2MZQ A; 5L46 A; 4RJV A; 5HBM A; 4OZ1 A; 2LEP A; 2HZV A; 3MCN A; 3MM8 A; 4KGV B; 3I31 A; 4LJM A; 1FDD A; 2HUR A; 4AT1 B; 4Y34 A; 2RDD A; 4C8K A; 2CNL B; 3KJV A; 5J2N B; 3THP A; 2C22 A; 3PIO Q; 1NHU A; 4P2F A; 4FYD A; 4JBC A; 3MPV A; 2B9E A; 3OTE A; 1OY8 A; 3QFH A; 1JWW A; 2HRT A; 2VG5 A; 3OJU A; 2JZ5 A; 3KUG A; 3A13 A; 3TWZ A; 2PA8 D; 4M5N A; 4YR3 A; 3FVY A; 3NG8 A; 3IG1 A; 2DNO A; 3ILL A; 2P9C A; 5KOX A; 2BJ3 A; 2G4B A; 2EFP A; 1E6Y A; 2B4U A; 4KGX B; 1VQS A; 5GME A; 2UUB F; 2OSR A; 3MEG B; 2YKN B; 2IDL A; 4NI2 A; 2KHD A; 4YS2 A; 3TUZ C; 5F8J A; 3NBP A; 1UMJ A; 2G2O A; 3BR9 A; 2IC3 A; 3EIC A; 4NLS A; 2W9A A; 1WDT A; 2VFV A; 1RT2 B; 4UOC A; 5KFA A; 4KRW A; 1XMB A; 4CRJ A; 2HWH A; 3MPY A; 2F3J A; 4L73 A; 1DFD A; 3THV A; 2GHW A; 2FJE B; 4TYB A; 3TA0 A; 3FSI A; 1H7W A; 3DLB A; 4JI2 J; 2R8H A; 4IFY A; 1RYS A; 1LW2 A; 5K5M A; 3JTN A; 4M94 A; 3CDW A; 3BKT A; 1UET A; 2YX4 A; 2XSF A; 4DQP A; 3JAM U; 4JI8 F; 2HBZ B; 4C8O A; 2HNY B; 2PDA A; 1XR7 A; 1R8P A; 4I2P B; 3OVB A; 5DS7 A; 1S1V B; 3KMS A; 3IFE A; 2WON B; 1FJE B; 5DLF A; 2DXE A; 3NY0 A; 4R8U A; 1NZ8 A; 2NSB A; 4PWD A; 2J9D A; 2UUC F; 3ZZP A; 1EJ7 L; 5KFI A; 3FFI A; 1TL3 B; 3ENA A; 3QJP A; 2ZKU A; 1R31 A; 4KC5 A; 4GKJ J; 5K8M A; 2P9G A; 2OEM A; 4ZPC A; 4TNO A; 2BZ2 A; 3DLJ A; 1HHQ A; 1V3Z A; 1VI7 A; 4KKO B; 2LQJ A; 2RIL A; 5HMZ A; 1R43 A; 2DNK A; 4XDD A; 3A8E A; 2HMI A; 1N5Y B; 2V8D A; 3BSA A; 3H0P A; 2VG7 A; 2VKZ G; 1S0N A; 3N5F A; 4ZJO A; 3HK2 A; 3OR1 B; 1JJC B; 1R3N A; 4I6W A; 3JYT B; 1HQU A; 1N33 F; 4B3R F; 1SH3 A; 1HBN B; 2H3E B; 2LEC A; 3GU0 A; 2DHH A; 3G6Y A; 2DHS A; 3QO9 A; 2XB2 D; 2CQD A; 4Y2C A; 1A6L A; 3SYZ A; 1JLC A; 2AF6 A; 2NXJ A; 2XS7 A; 1EP4 A; 5A6W A; 4ZVE A; 4CLK A; 2CQB A; 2BUN A; 4ZVR B; 3GYG A; 1XER A; 2W2P P; 1NDL A; 3QLH A; 5L1K A; 3EGV A; 4O3R A; 1XMO F; 4OV1 A; 4FXW A; 1NK7 A; 1CLF A; 2F63 A; 3PHE A; 5D0R A; 3RBE A; 1WEL A; 1S1U A; 3MDF A; 3S8S A; 4FPI A; 3N6L A; 2PII A; 1JNR B; 3L7P A; 4IOB A; 1LXN A; 4KGZ B; 3RR7 A; 3HHL A; 1VLY A; 3EDR B; 4JI4 F; 1T9Y A; 3MM9 B; 3M8Z A; 1T9T A; 2EC2 A; 3PY8 A; 4WK3 A; 4LRE A; 2J0X A; 1SJ4 P; 4LBH A; 5AXL A; 3ZFV A; 4LT6 A; 4DV4 F; 1R89 A; 5KFZ A; 3DYA A; 4LSL A; 2G0J A; 4OZ5 A; 2DIV A; 3M30 A; 2ADC A; 4I2Q B; 1NKB A; 3FGV A; 4ELV A; 4F0H A; 5DQG A; 2UVU A; 4DR6 J; 1HNX F; 2B6A A; 4B08 A; 4XAK A; 3IAS 9; 2IYI A; 2BJ1 A; 4DR1 F; 1ZPW X; 1RE1 B; 4XPE A; 3W62 A; 4H4M A; 4A8Q A; 3CE8 A; 1P6T A; 2CQ1 A; 2HBQ B; 3X3U A; 1CQN A; 1WG5 A; 1RTH A; 2I0X A; 2ZNY A; 4HAC B; 3TQE A; 3P5B P; 4ILR A; 1N0V C; 4LR8 A; 3K58 A; 4K0K F; 4D3G A; 4RU9 A; 4DX6 A; 4DSE A; 2D7S A; 2W25 A; 4DSJ A; 1MU2 B; 2V9K A; 2G1D A; 3IGV A; 2MJN A; 1RDR A; 3N6N A; 1DTQ B; 2HHQ A; 5KFS A; 1JXV A; 3PJW A; 4MIA A; 1FFW B; 1G6B A; 2KKH A; 5IQ6 A; 2W7P A; 3IRW P; 2FPH X; 9RUB A; 3MM5 A; 5A0Y B; 4ZVU B; 2PN6 A; 3BO3 A; 4Y6I A; 4I67 A; 2CPD A; 3OD2 A; 3SZ2 A; 4DQS A; 1R0A B; 3MMA B; 4A47 A; 3SI8 A; 3CTR A; 4OJH A; 3GV7 B; 1K44 A; 2VFR A; 2KHC A; 2BKN A; 1P1L A; 1WTB A; 1TKD A; 2YWH A; 3OR2 A; 3BBB A; 2RF2 B; 2Q79 A; 4A8O A; 1DBD A; 2RKI B; 3VTI A; 2UZA A; 3N79 A; 1UPM B; 3PX0 A; 2K7J A; 1FI4 A; 1H2T Z; 3IP0 A; 4O23 A; 2AQ4 A; 1XMQ J; 2LDY A; 3OTD A; 3RJM B; 2J7W A; 5GAH I; 3QWP A; 4EYI B; 3D66 A; 3BM7 A; 1HBO B; 3EDQ B; 2XGP A; 4QW9 A; 1KOH A; 1BQN A; 2JEG A; 1HI1 A; 1FXR A; 1QLN A; 5HRO A; 4MIW A; 2CJK A; 1FWK A; 4NCG A; 2AW0 A; 2YPZ A; 2J7U A; 3H5X A; 2CVE A; 4EYH B; 4AL7 A; 1REG X; 5CYM A; 2IVF B; 3QGG A; 2BM0 A; 4J5O A; 3IS9 B; 1I94 J; 4DV6 J; 4R5P B; 2D9O A; 3CC2 S; 3RRK A; 4DL7 A; 1FNX H; 5E0O A; 1X5S A; 3QGP A; 2KZM A; 2RS8 A; 2PSZ A; 4RW9 A; 3RU0 A; 2KYX A; 4AXI A; 4QJV A; 3GG1 A; 4USV A; 3CUL A; 4DFP A; 5HVH A; 2E1A A; 5DG9 A; 1JJ4 A; 1HHT P; 4DR7 F; 4UOG A; 3M8S A; 4OX6 A; 2AJQ A; 4G1Q B; 4M5D A; 4CLY A; 4YQW A; 2CAD A; 2CPI A; 1D0E A; 1RTJ A; 3PZP A; 3PW0 A; 2OEJ A; 1IKW B; 1FK9 A; 2ZOF A; 5KT3 A; 1T7P A; 1KLM A; 3EGZ A; 2CPY A; 1RLD A; 2A6O A; 1SUQ B; 5U47 A; 4DL3 A; 1LWX A; 4NWB A; 1HIY A; 1PJ7 A; 3ICL A; 2EFQ A; 1IKX A; 4DSI A; 2CUY A; 1GEH A; 1AUS L; 5AJ3 F; 1S76 D; 4U67 Q; 2HNZ A; 3PNI A; 4NEY A; 1XN9 A; 2BYC A; 3K5M A; 4FP9 A; 2AGP A; 2XZD B; 3NWG A; 1KVJ A; 1WI6 A; 5D4N A; 3GR1 A; 2YKP A; 2PEH A; 3CO9 A; 1KKH A; 3HPO A; 3QRP A; 3W5X A; 1ZBT A; 4WXW A; 4DX7 A; 1HNI A; 3QZ7 A; 1OY9 A; 3CCL S; 1U2C A; 2Y9H A; 1FJ7 A; 3QIP A; 2CA9 A; 5B0D A; 3JTP A; 2VA3 A; 3GJS B; 5JVH Q; 3IWN C; 4XK8 C; 4ECZ A; 3M8P A; 1R0B G; 1FWL A; 2Q3P A; 2CQ3 A; 2VPW B; 2R2U A; 3D3C J; 4HT5 A; 1BQX A; 2DTJ A; 1NCL A; 4K4S A; 4OQJ A; 1ZTW A; 4YDD B; 2HBR B; 4LRF A; 4MKY A; 1VOM A; 2DEJ A; 3AB2 B; 1KN6 A; 1NK5 A; 2XMJ A; 2MLX A; 3SXL A; 5GAH U; 2LQB A; 4HT7 A; 3RBZ A; 3MEE B; 5IT9 Y; 2WCX A; 1V5V A; 4A8X A; 4OZ3 A; 4LRD A; 3OLA A; 4I69 A; 3GON A; 1SC1 B; 2GS8 A; 3DLG A; 3G82 A; 3KUE A; 2FC8 A; 4NLW A; 3DLL Q; 3T3F A; 3I96 A; 3MMB A; 2YQ0 A; 4USM A; 4B9N A; 3GYX B; 3CED A; 1VBX A; 4P7V A; 3HJF A; 3ZC4 A; 3LAK A; 1NDP A; 3I9Z A; 2G13 A; 2D3O 1; 3G8T A; 3V4I A; 2VOD A; 4TU7 A; 3UDE A; 3I9V 9; 2DK2 A; 3UDC A; 1TZ0 A; 1N34 F; 5KFC A; 2J7K A; 1Y4Z B; 3D54 A; 1KBR A; 2ZBI A; 1ZZF A; 5A8W A; 1JKH B; 2EFG A; 1IWA A; 4RW8 A; 2RQM A; 4QWD A; 4ZK7 M; 4K4T A; 3P49 B; 4F2R A; 1RA6 A; 3MR3 A; 4AE5 A; 1FRI A; 1B3T A; 1M5P C; 3QQC D; 3ZO7 A; 4CWB A; 2R7T A; 3J7Z 5; 3HZG A; 4DV1 J; 1ZTT A; 4KY3 A; 3E8O A; 5HVG A; 4Q45 A; 5KFU A; 2ERR A; 2AEM A; 2Q1L A; 3ELH A; 2VJV A; 4PUO B; 7FD1 A; 1VMB A; 2QT7 A; 2X7I A; 3Q8R B; 4OI6 A; 1YQH A; 3IWL A; 3BS9 A; 5ETK A; 4OLP A; 3D67 A; 2EPI A; 1K1Q A; 4DV5 J; 2R42 A; 2XLJ A; 4ITS A; 1TKZ A; 4X65 J; 3LH2 S; 2EEY A; 4WYW A; 2ZJQ Q; 4QPT A; 1NK8 A; 4F2S A; 1T9V A; 2WHO A; 3UDL A; 3WC0 A; 2GVZ A; 3C66 A; 1ZA1 B; 1XNQ J; 4PEO A; 1TKX A; 2DR7 A; 2V2V A; 2DH8 A; 4MKA A; 1TAU A; 3AJ2 A; 3K7R A; 3OXF A; 4X4T A; 2ZE2 A; 4HEA 9; 4OIX A; 1XR5 A; 1RAH B; 2CJX B; 2VDH A; 1YJR A; 1UEV A; 4ILL A; 1ELO A; 1PYS B; 1V6H A; 4O3O A; 1HW9 A; 3M32 B; 2ZJP Q; 5C2G A; 1BQM B; 4CTA B; 3C16 B; 2Z56 B; 4M5L A; 4F36 A; 2HFO A; 1Q7L B; 1SH2 A; 4ZVP B; 2HYI B; 4DU8 A; 2XYP B; 3KLI B; 2Z2L A; 1Q82 T; 3NGU A; 4R0E A; 3MD3 A; 2FLP A; 2XS5 A; 4DV0 F; 3OHB A; 2NZC A; 1VRU A; 3HM9 A; 2OAU A; 4ZPB A; 1YK9 A; 3PEH A; 2QG9 B; 2HND A; 1YSJ A; 1VQ7 S; 1VJQ A; 2UU9 J; 5E3A A; 2GA7 A; 1XK8 A; 4CYU B; 4XO0 A; 1QAY A; 2RB7 A; 1S0M A; 1L3T A; 3FCH A; 3PW4 A; 3BKF A; 3BPD A; 2VFU A; 4RBU A; 3TA1 A; 4CO3 A; 1QVG R; 4P75 A; 2BA9 A; 1SL2 A; 3Q8U A; 2EI5 A; 3MR7 A; 1FRH A; 2DH7 A; 3AJD A; 5KFQ A; 4P2X A; 1R8B A; 1LWC A; 3I5B A; 4FZV A; 3B4M A; 1YWX A; 1S9E B; 4KH0 B; 2L41 A; 3EVW A; 3JTO A; 2LDI A; 4ZA1 A; 2ZFH A; 2FHM A; 5C24 B; 4WFN Q; 1EKR A; 5EN1 A; 3MD1 A; 1HPZ A; 1A0O B; 2ZH7 A; 5HAN A; 3AOB A; 1T9U A; 3R7B B; 1HBM A; 2FJX A; 3KLE B; 2RS2 A; 1S7I A; 2H1Y A; 3QAT A; 3VF0 B; 4E2F B; 4DFK A; 2AYM A; 1CJU A; 1R0C B; 1UFK A; 3SV3 A; 1S6Q A; 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