2QM1A

Crystal structure of glucokinase from enterococcus faecalis
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
SNAMDKKIIGIDLGGTTIKFAILTTDGVVQQKWSIETNILEDGKHIVPSIIESIRHRIDLYNMKKEDFVGIGMGTPGSVDIEKGTVVGAYNLNWTTVQPVKEQIESALGIPFALDNDANVAALGERWKGAGENNPDVIFITLGTGVGGGIVAAGKLLHGVAGCAGEVGHVTVDPNGFDCTCGKRGCLETVSSATGVVRVARHLSEEFAGDSELKQAIDDGQDVSSKDVFEFAEKGDHFALMVVDRVCFYLGLATGNLGNTLNPDSVVIGGGVSAAGEFLRSRVEKYFQEFTFPQVRNSTKIKLAELGNEAGVIGAASLALQFSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal Structure of Glucokinase from Enterococcus faecalis.
rcsb
source organism Enterococcus faecalis
total genus 104
structure length 324
sequence length 324
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qm1A02
1NGFA 3RSEB 4CZHA 5BRFA 3LDOA 4CZMA 1U6ZA 4FO0A 4IJNA 3VEZA 3CHWA 4K43A 1EQYA 4H5RA 3VF6A 2E88A 3VF4A 5AQLA 3IFRA 3GE1A 3WXJA 2QM1A 3GBTA 4YDUA 4H5NA 3LM9A 5F0XA 4WQ4A 1X3NA 1GLBG 4F9OA 4QS9A 4XH5A 3WEEA 2D1KA 4H5TA 3MDQA 2P9LB 1E4FT 2VCPA 2A3ZA 3O1BA 3DXMB 1SZ2A 5AQGA 3LDLA 1DGKN 2V7YA 5KQ8A 3VETA 4M7YA 3BF3A 5ELZA 4BRDA 4B1YB 1MWKA 3VENA 3C7NB 2ZWHA 4H0OA 4RCHA 4CZKA 4M7XA 1GLJO 3MN6A 4I6MB 4BRLA 1V4SA 2GUPA 3G25A 4YDUC 1NGCA 3S41A 4BC2A 2HMPA 4BRIA 1V4TA 4WQ4C 4B1ZA 4FSVA 2D0OA 3HM8A 3MN9A 5AZJB 1BUPA 1NLVA 3VESA 3AY9A 2NRHA 1TYQA 1MWMA 5BR9A 4CD3A 1T6CA 3BUZB 3FZMA 3U8XA 4GY2B 5BN8A 1QQMA 1H1VA 3M1FA 1Z6RA 3GOIA 3DJCA 3R8EA 2FSKA 5LJVA 2P9SA 1JCEA 1RFQA 2QWRA 1BDGA 2QW9A 5EXWA 4O8KA 4L3QA 4JHDB 1QZ5A 5AQVA 5I9EB 1KAYA 4H0TB 2VWBA 4BRFA 2D4WA 2ZF5O 4BRAA 4FPAA 3D2EB 2ZGZA 5AQTA 3L0QA 4FL9A 3SK3A 4DCHA 1GLAG 4B1WB 3D7EO 1IG8A 3ZX2A 1D4XA 4H0VB 2J4RA 4B1VA 3FE1A 3AARA 4FWMA 5FPNA 4B1UB 5JLFA 4EHTA 1RGIA 2QWPA 4IZ9A 2CGLA 2P9PB 2IIRA 3H46O 4BREA 3H45C 4PKIA 5AQZA 4PKGA 1P8ZA 2E2OA 4H5WA 1NGAA 3P4IA 2V7ZA 3DXKB 4A2AA 1QQNA 2YHYA 4CZGA 4BVOA 1SQKA 2V51B 2E2PA 2QWOA 1J6ZA 2E2QA 2A5XA 2P9IA 2W41A 3ULEB 1X9JA 4CJ7A 1HPMA 5JLHA 3VOVA 4DHYA 4BC3A 4BG8A 2E20A 5AQXA 2A6AA 3TPQA 2FSNA 3CQXA 4BRMA 3U9ZA 3HBTA 4BR0A 4JN4A 3U4LA 2P9NB 2P9LA 4BR5A 2P9KB 4FWRA 3TU5A 5BRDA 2Q0RA 3A5NC 3QBWA 3UKRB 3CJ7A 5AQWA 2YJEA 3KVGA 5AFUH 3BEXA 1YUWA 5BN9A 5AR0A 3CJ9A 4DQ8A 4H03B 5LJWA 2KHOA 3R9PA 4XH1A 5EOYA 3M3ZA 1WUAA 2BUPA 3H1VX 1NGBA 2NZTA 5AZIA 3MK6A 2HF4A 3A8YA 1NBWA 1BOTO 2A42A 1ATNA 5ADXA 3QB0A 3WQUA 5AQUA 2YHXA 2F9WA 3KZBA 5BPLA 3CJAA 4FWNA 5FPDA 1K8KB 5B8HA 2E1ZA 5AQRA 1NGJA 5CE3A 1U2VB 3VEWA 1JCGA 1T44A 4BR7A 2FXUA 1T6DA 2IVNA 3HZ6A 1QHAA 4CZIA 4A62A 5FPMA 4CZEA 2YCHA 4FPBA 3QICA 3AAPA 3FLCO 4BQLA 5AQOA 3AAQA 3LDPA 2GELA 1QZ6A 1ATRA 3D2EA 4NB4A 4Z94A 1KAXA 2ASPA 2HOEA 2E8AA 1YVNA 1HX1A 2PBDA 3VGMA 1Q18A 2Q31A 4RTFD 2F9TA 4CZJA 2CGJA 4MO4A 5F1XA 3VEOA 3SLCA 3FZLA 4FWOA 3WT0A 3H1QA 4Y0WA 1LOTB 4NO7A 4RWTA 3BP8A 1XUPO 2YI1A 4K41A 4BR9A 4PKHA 1ZBSA 3DXKA 3IDHA 4BGBA 3ATVA 4K42A 4HWIA 4O5FA 1S3XA 3OHRA 4K25A 2FF6A 2QXLA 3HTVA 3ZX3A 3KHYA 3IUCA 5BPNA 1HLUA 4JD2B 1XQSC 2FLOA 3LDQA 1BG3A 1CZAN 2VYPA 4QS7A 4WQ5A 5AQHA 2NLXA 2E2NA 3LL3A 4B1XB 3WEEB 4BR2A 3EZWA 4BRHA 2Q0UA 3A5OC 5AQFA 3B8AX 4FWSA 5F2RA 2P9NA 3VERA 2CH5A 1BU6O 2Q1NA 4BG9A 4BRNA 3O4WA 3FFKB 3VPZA 2GWKA 3L6QA 4MLHA 4JAXA 3VEXA 3UKUA 2P9UA 1TUUA 4ISGA 5KPTA 3C0BA 1X3MA 2QWNA 3RSEA 3EO3A 2PAVA 1SAZA 1NGDA 3CJBA 2GWJA 4BC4A 3EL2A 3MMVA 1NGEA 4A61A 4DB3A 5EVZA 3ATUA 1TYQB 3CIPA 3ZETB 4BQZA 1GLDG 2AP1A 1S22A 2GEMA 3D2FB 1C0FA 2UYTA 3EKSA 3QFPA 4EAHD 2ASMA 1U2VA 3FZHA 3DXMA 1BO5O 2D0PA 5EY4A 4FOIA 1ZC6A 4CZFA 1NM1A 2EWSA 2WUSA 3C7NA 3FZFA 3WQTA 1ATSA 3ZEUB 3BF1A 3EN9A 4CI6A 4XH4A 4I6MA 3MN5A 2GTDA 3SMPA 5BRHA 2FSJA 3ID8A 4BRKA 4H0YB 3VGKA 4CBUA 1KXPA 4M63C 5KQDA 5AZJA 5FPEA 2FF3B 3R6MA 1NGHA 3UKUB 3ENOA 1HUXA 2HF3A 5AQYA 3I8BA 3L4IA 3A5MC 3MN7A 3MCPA 3F9MA 4JHDA 2P9IB 4KBOA 1GLCG 4IWVA 3H3OB 3HSCA 4A2BA 1DEJA 1ESVA 1HKCA 1Z05A 5AQPA 3DWLA 4CBXA 4JD2A 3GL1A 5E26A 4QS8A 4BRPA 3M6GA 1NWKA 3EKUA 3JXUA 1KAZA 4JNEA 3VEVA 4MLEA 1NGGA 3IMXA 2OANA 3WXKA 1XC3A 3WXLA 4CD1A 1NMDA 4H0XB 1GLEG 2P9PA 1C0GA 4J8FA 1WOQA 5AQKA 2I7PA 2Q36A 5AQMA 3H6EA 2YHWA 3DAWA 2Q2RA 4MO5A 4ISFA 2Q97A 3J8AA 2AA4A 2QWMA 1YXQA 3I33A 3FGUA 5ADXH 3CQYA 1HKBA 4FWKA 3CETA 4E1JA 1OKJA 5JICA 2QWQA 5AZIB 4LC9B 2CH6A 3O08A 5LY3A 5AQJA 1TUYA 4IXCA 1HKGA 1NGIA 2ITMA 3O80A 3ULEA 4BC5A 2BTFA 4XEIA 1QQOA 3ZETA 3VGLA 5BPMA 3CERA 1IJJA 1G99A 3JS6A 4IO8A 1BA1A 3VEYA 2ZGYA 5BREA 3D2FA 3QFUA 1DKGD 4H0PA 4GNIA 5E84A 3UE5A 4BRGA 4BRQA 2P9KA 3W3DA 1MA9B 5JMVA 3SMSA 3CI5A 3GDQA 4H5VA 2CGKA 1MDUB 3ZX0A 3W0LA 4EIAA 2IVPA 3SJHA 3UB5A 4WYBA 3UKRA 1E4GT 3LDNA 2IVOA 4BROA 3ZEUA 1YAGA 4FWQA 3A5LC 3O6WA 3CJ1A 3H3NO 4WQ5C 5AFUA 4PL7A 1GLLO 4BR4A 4BRCA 3HI0A 5KPRA 2W40A 4BGAA 2A41A 5AQSA 5KPZA 3ENHA 3GG4A 1Y64A 2A40A 3O8MA 1K8KA 2P9SB 3CJCA 1RDWX 2H3GX 4PL8A 4IJAA 4C23A 4FOEA 2YJFA 4CBWA 4BVPA 5AQIA 3QBXA 1ZXOA 2I7NA 3U9DA 5EX5A 2E1YA 2DPNA 5AQNA 4EFHA 3LM2A 2V52B 3WXIA 3WUHA 4FWLA 4AM6A 4EHUA 1GLFO 1R59O 1BWFO 2ASOA 4AM7A 4ISEA 1JCFA 2QWLA 3QDKA 4HTLA 3VF2A 3O1WA 1LCUA 5TKYA 1BA0A 1HJOA 3O5BA 3QMLA 4B9QA 4FWPA 4CZLA 3FR0A 3FZKA 3A0IX 5AQQA 2P9UB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HRNA 5BRFA 3K5MA 4JI0K 4CZMA 1DTQA 1U6ZA 2DY4A 4H4MA 1YJ9N 4K43A 1EQYA 1KQSM 2PFUA 2B4JA 1BCOA 3VA3A 5AQLA 3NH1A 3GE1A 4GW6A 4WCEL 4FLWA 3OS1A 4YDUA 4H5NA 4OPHA 4LFBK 1X3NA 1GLBG 4F9OA 3RR7A 4Q0BA 2KKZA 3G71N 2P9LB 4N41A 5AJ3K 3IS9A 2HVIA 1LWEA 3LDLA 4FZZA 4BRDA 4B1YB 2HHWA 4IG0A 4IOCL 4EP5A 3DLGA 4I6MB 4E7KA 1SL2A 3OYKA 3G25A 3S41A 2HMPA 1WSGA 1R0AA 1V4TA 4FJ7A 1NK8A 3MN9A 4ZTJA 1KTQA 5GAGP 1NKEA 1BUPA 3VESA 4DLEA 4CD3A 4W5TA 3E9LA 4OJRA 1WB9A 1JLAA 5FLXO 3OYLA 3M1FA 4E7HA 3DJCA 3TAFA 3AO3A 5LJVA 3OYGA 4FJXA 1IBMK 5AQVA 5I9EB 3N4QA 1WLJA 2IC3A 3OYEA 3V81A 1P90A 1TKZA 2D4WA 3CCMN 1BISA 2NRTA 5KRSA 2KZMA 4DTPA 5AQTA 3L0QA 4FJ9A 3HVRA 4JI7K 2F4VK 1C0UA 2KLAA 4FJKA 4H0VB 4N76A 4B1VA 3SQ4A 3FE1A 3L4QA 4FWMA 4B1UB 5JLFA 4IZ9A 2CGLA 2KTQA 3H46O 3PSIA 4GV9A 2O8EB 4PKIA 5AQZA 1B9DA 1LW2A 1JXBA 2XY5A 1NGAA 3IKMA 4M3XA 3DXKB 2YHYA 4CZGA 2JLEA 4JLHA 1SS6A 3CCQN 1FK9A 3OJUA 2W41A 4CJ7A 5JLHA 4DHYA 4W5RA 4BC3A 1LAWA 4BG8A 2A6AA 3TPQA 4C8MA 4BR0A 1QTMA 2P9NB 3KK3A 4AILC 1QSSA 4DG1A 3TU5A 4M3YA 5J2NA 5BRDA 3D0PA 2QK9A 3OJSA 1DTTA 3O9QA 4FLVA 1HPZA 4DQRA 3CJ7A 3SQ1A 2WTUA 5AFUH 4YHHK 4CK1A 5AR0A 3HT3A 3CJ9A 4CFDA 4H03B 4CJ4A 1XNQK 2HBKA 1WSIA 2GV9A 2QI2A 4LF6K 4KHUA 3TTDA 3OTOK 2HF4A 2A42A 3QB0A 4DR3K 3CMEN 5AQUA 2YHXA 1T7PA 4CJVA 3KZBA 5BPLA 3HO1A 2D0CA 2E1ZA 5AQRA 1NGJA 1ZBFA 4E7LA 3CCUN 3OS2A 2A1SA 2IVNA 5FPMA 4X66K 4CZEA 4FJ5A 2YCHA 4FPBA 2VG7A 3I0SA 3AAQA 3T1YK 3D2EA 4YY3K 2E8AA 1NU0A 1YVNA 1HX1A 2R7YA 1RT7A 2XY7A 2F9TA 4CZJA 4DV6K 1NJWA 3OYDA 3AGRA 5F1XA 4DV5K 4AQYK 4FK0A 1SL0A 5I3UA 4NO7A 5J1EA 3C6UA 2Z1IA 4BR9A 3OA9A 3P5JA 4PKHA 3IDHA 4BGBA 2UXBK 3UIQA 4G1QA 3RMCA 3OY9A 5BPNA 1HLUA 1SL1A 4JD2B 1RT1A 1N32K 1ZYQA 1CZAN 3LANA 4QS7A 5AQHA 4FK2A 4GMJB 3WEEB 4YORA 4QAGA 4BRHA 3P38A 4FZXC 4DF4A 4IDKA 5E41A 5M1FA 4HHTA 3VTHA 4BRNA 4JI1K 4PQUA 1OH5A 1JLFA 3L6QA 3UKUA 4ISGA 1OH7A 3VQ8A 4JKBA 3EO3A 3QEVA 1SAZA 1NGDA 1UOCA 4I9LA 1TL1A 3THXA 3R1XA 1IBKK 2RF2A 4GKJK 4BC4A 4JKHA 1NGEA 5J2MA 1IKVA 1ASUA 3L3UA 1NOZA 1VQ6N 3ATUA 4JI2K 4C1NK 4DR5K 3AVMA 4FW1A 2AP1A 1QSLA 3CCLN 4F3OA 1C0FA 2UYTA 3QFPA 4ELVA 3CQ8A 3CD6N 4EAHD 3C6HA 3OVNA 3FZHA 3N4PA 2D0PA 1NK6A 2HSTA 4KO0A 3TWHA 2KQ2A 5CR4A 4JS4A 3G6EN 2P51A 3TAEA 4Y1CA 1LWCA 3M5RA 3EN9A 4DTMA 2O8DA 1ZBHA 4LH5A 4XH4A 3MN5A 3VQQA 3CMAN 3CXCM 4DFKA 2NUBA 2YNFA 3ZT4A 4JI4K 1B9FA 4FLUA 4W5NA 1WAFA 1KCFA 1RBRA 3ULDA 1HQEA 3HP6A 4DFMA 1HUXA 1OH6A 3I8BA 4CEQA 1ITGA 3L4IA 3M8QA 3A5MC 1A5XA 4R5PA 4O0IA 1TK5A 4K8XA 2YKNA 3HSTB 1GLCG 4WF9L 3SNNA 3WXMB 2FBXA 1DEJA 3PIOL 1HKCA 3NGYA 3MECA 3L8BA 3NFAA 4EZ9A 3V6DA 3S9HA 1U04A 4QS8A 3M6GA 1NWKA 5C2DA 1UWBA 3VEVA 1IG9A 3IMXA 2OANA 4OKEA 3WXKA 1XC3A 3KD1E 2VGMA 2E6MA 1REVA 1U4BA 1GLEG 3TR8A 4YFUA 1VRTA 2W6LA 4IFEA 4ILGB 2I7PA 1O13A 2HBJA 4U7BA 2XO7A 2VWKA 4ID1A 3U6FA 4CGDA 4DFJA 3OYNA 3J8AA 3QIOA 3QEWA 3MX2A 1OKJA 1N33K 2QWQA 4LSLA 4ILJA 5AZIB 2HHQA 2CH6A 3TANA 3MCAB 1UA1A 1TUYA 2ITMA 1NK7A 2E5LK 3LALA 3ZETA 3VGLA 5BPMA 1G99A 2ZGYA 3EYZA 2G8IA 5BREA 3D2FA 2P9KA 4CJWA 4WE1A 4FXDA 3V9XA 2BGGA 2CGKA 3E9PA 3W0LA 2IS3A 1RTHA 1VQ9N 5LL6Z 4IEEA 3CCEN 2G8KA 1M90O 4LFCK 1WSFA 3ZEUA 1HYVA 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1SKRA 4DV1K 2KFNA 4CGFA 3HM9A 3NH2A 3T69A 2V7ZA 4I2PA 3ZSOA 1YTUA 4ELTA 2E6LA 2QXFA 2V51B 3WNGA 2QWOA 1YJNN 5JS2A 3EY1A 1L3UA 1J54A 1D5AA 3ULEB 1F21A 5DM6L 3VOVA 3DLRA 3A2FA 4X62K 3OYMA 4FW2A 4BRMA 3PV8A 1RBUA 3HBTA 4BR5A 2P9LA 3OYCA 4FWRA 3BZKA 3F5TA 1RBTA 1K73O 4B9VA 1RT4A 1FKPA 3A5NC 2IOCA 3O3GA 1JJ2M 3CFPA 2YJEA 1YUWA 2HHHK 1HRHA 2ZM6K 5BN9A 2NRXA 1E3MA 3CFOA 4DQ8A 5LJWA 4DLGA 2KHOA 3R9PA 3LWLA 4KFBA 3NCIA 2BH1A 1NGBA 5EU7A 2NZTA 3MK6A 3A8YA 2PY5A 1W97L 1TVRA 1BOTO 4JKGB 5ADXA 3ZSZA 2PYJA 2F9WA 4CJRA 3WNFA 3CJAA 4FWNA 2PYLA 1K8KB 1LWFA 1U2VB 4BACA 4YOUA 4KH6A 1JCGA 1T44A 1IV0A 2EHGA 3AA2A 3NF7A 4H8KA 4CZIA 4W5QA 1NKBA 3AVGA 4B9NA 3SCXA 5HRPA 1EWQA 1LAVA 3TI0A 3KLEA 4M3ZA 4DTOA 4BQLA 4DSIA 2GELA 1QZ6A 4JKFA 1T3VA 4NB4A 2HOEA 3VQAA 4DKWA 4RTFD 4CJKA 4JKDA 5CZ1A 3HPOA 3K5OA 4IDHA 3VEOA 3SLCA 3QO9A 2O8EA 4CGIA 3BP8A 3SV3A 1VQNN 1XUPO 4FLZA 4K41A 3LPTA 3DXKA 4FM2A 1CZBA 5KGWA 2EX3A 1S3XA 3V9ZA 5C15A 3V4IA 2QXLA 1TKXA 5KTQA 1J9AA 2RN2A 3O4NA 4FVUA 4ID5A 4FM1A 2WFBA 1NOYA 3QLHA 2HMIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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