2QNEA

Crystal structure of putative methyltransferase (zp_00558420.1) from desulfitobacterium hafniense y51 at 2.30 a resolution
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
476
structure length
476
Chain Sequence
GLLPKYNILTEDQVQKIHENTMKILEEIGIEFEYEPALEVFRREGQKVEGKRVYLTREFVESKLKSAPAEFTLHARNPENNVVIGGDNIVFMPGYGAPFIYELDGSRRKTTLQDYENFAKLAGASKNMHLSGGTMAEPQDIPDGVRHLQMLYSSIKNSDKCFMGSAEGKERAEDSVEIAAILFGGKDVIKEKPVLVSLINSLTPLKYDERMLGALMAYAEAGQAVIIASLVMAGSTGPASLAGTLSLQNAEVLAGISLAQSINPGTPVIYGSTSALSDMRSGSLSIGSPECALFISASAQLARFYGVPSRSGGGLNDSKTVDAQAGYESMMTLMAANLTGVNFVLHTAGILQYFMAMSYEKFIMDDEIAGMLLHYMKGYTFDEDGMAFDVIEKVGPGGHFLTQKHTRKNHKREFYTPTLSDRSAYDTWAKEKLETKQRAHARWQQILANYVPPALDPEIDAKLQAFIAQRGKEVGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Putative methyltransferase
publication title Crystal structure of putative methyltransferase (ZP_00558420.1) from Desulfitobacterium hafniense Y51 at 2.30 A resolution
rcsb
source organism Desulfitobacterium hafniense
total genus 167
structure length 476
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-07-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.480 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 2qneA01
2QNEA 4YYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2V6AA 4FLSA 3AU6A 3WLIA 2G5WA 2VDIA 2PDGA 3FLUA 1SMAA 9XIAA 1GOOA 2ZX7A 4LVFA 1QO5A 3L4ZA 2Z7GA 1KB3A 3UD6A 1LT8A 4DLFA 3M7SA 1I75A 3U8GA 2P8CA 1BEUA 3HJZA 1VH7A 3C2RA 3ZFHA 4Z2JA 3FJLA 4J3VA 2E9MA 2TSYA 2C1HA 4WGHA 1XLLA 3SCWA 3VPLA 3C2OA 3EMQA 4LSBA 4U5IA 3OZPA 5FJJA 4S3BA 3GXNA 1WUEA 4G5DA 3UNTA 4N6EA 4UTUA 2V5BA 5I3DA 1K9FA 3JZEA 3TROA 4IMEA 1XDMA 1ZQ5A 3VC6A 3QMSA 3NCOA 4UTJA 3SN4A 1E1FA 2GLKA 2ONEA 1ML1A 2PBGA 3DFSA 3KS6A 5JH2A 5DCDA 5EMKA 3IS4A 1F6PA 3PNZA 2D0GA 2GL5A 3VNKA 1WZKA 3RX4A 1HVQA 4XTIA 3UETA 2FGBA 3IAPA 1YADA 2WNQA 5I5RA 1PHQA 4JFSA 3BW3A 4AY1A 3OYZA 3LBCA 4JIPA 3AMKA 3CHFA 1Y7VA 1IWAA 1FDYA 4J3UA 3EKGA 1M7OA 3H2EA 3UG5A 1XIBA 3NL2A 1POKA 3ALFA 4IP5A 4H01A 1QNVA 5DF0A 1QASA 2PTXA 1K9TA 4BK9A 4ZGYA 3OZOA 3FYPA 5CBIA 3KVJA 3TLLA 2QJGA 3CPGA 3O7UA 3TAOA 4H7VA 1MFUA 1PX3A 2EPHA 3WNMA 4N9BA 4JZ5A 3WNOA 2EPMX 1ITUA 2O7QA 4UMCA 1WBHA 3AIWA 3B9DA 2V2HA 4KWOA 1A4MA 2QS8A 4WJEA 2VX7A 2XDFA 3RO8A 3UG4A 2IQDA 4AZBA 4X9YA 4DAIA 4U3CA 5AHEA 3BJSA 3NEHA 4EAYA 4FNRA 4L6HA 5JQ9A 1T8QA 2J9ZA 4N9DA 1RZMA 1K7XA 3WL1A 4WJXA 3H2MA 2DZSA 1G0CA 1LWIA 2FQIA 5DELA 3C2YA 3FAXA 3CZ8A 2WBGA 4JKMA 5H91A 2CLMA 7TIMA 4Q33A 2V3DA 2J8GA 4GMEA 1W3LA 3L4YA 5LGZA 1UHVA 3NQEA 3QHOA 1EO7A 2WVTA 1FWRA 1PVNA 4UUIA 3NYZA 1UH3A 4MUPA 4PR4A 2DZPA 4RE3A 1SYTA 5GJMA 3K1GA 3T2OA 3PVFA 4AU0A 3GYEA 3N2MA 1XIFA 2EG7A 2KZHA 1FWSA 1XW8A 3FVMA 5I3GA 3AMGA 5MKGB 4PCNA 1RXOB 3V7PA 1AZ1A 3R0KA 3VD9A 2BOEX 3OU8A 3IVSA 3A13A 1JD9A 1O1HA 1ESWA 4FX6M 1MI3A 3MSGA 4Y9NA 3RN6A 1OG0A 3CBWA 1GVIA 4D8AA 4GGHA 1G5AA 4PMRA 3A3XA 2Z28A 2PWEA 3TYDA 3CZJA 4IP7A 1KM2A 5CPOA 1OFDA 4Q22A 2ALDA 3WK0A 2DZXA 2OOGA 3CWOX 4ZB0A 3OGVA 3VD5A 4AHQA 3CYVA 4NF7A 2V81A 2BHUA 3U2OA 5M5DA 3QV9A 4L5ZA 2PUZA 1VEMA 1OC7A 3VTRA 3O63A 1M68A 3I68A 4UCGA 4QR6A 1AUSL 3LSCA 4JL1A 1K77A 5I0DA 1E4IA 5CCZA 2GDVA 4NZ4A 4NRSA 3RPTA 1OZMA 3CHDA 1E6XM 4IL0A 4KEMA 2P10A 1YNPA 2VCAA 4E4PA 3AZRA 3CQKA 4ZO7A 3GK0A 3AXHA 4NJJA 3UWZA 3PWGA 1ZAHA 3SGGA 1JGIA 3S6DA 1FWWA 1A5LC 4H04A 4XTDA 4YNGA 4C6MA 1EIBA 2OSYA 1HKMA 1IIGA 2PEVA 1X8CA 4XISA 1XIMA 3DYPA 3NIYA 1T0OA 2NUWA 4IOTA 4GO8A 3FAWA 2H9AB 4BHYA 1QNOA 1TV5A 4WDWA 1E4LA 1E0TA 5HA7A 2JKAA 3RCNA 3TE9A 2E5CA 4R33A 3ZT6A 1W1ZA 3CV7A 2ZWZA 1DHPA 2XWEA 1L8PA 2ZXDA 2DV0A 2E7FA 3BCJA 1OFOA 3PFMA 1W91A 3IGUA 2C1GA 3SQMA 1PTAA 2BODX 1V77A 5GQBA 4HHLA 3THDA 1X6UA 3L4UA 2R1LA 3RO6A 2QV5A 4FOJA 4O50A 1XBVA 3SUVA 1K3UA 3CPRA 3M44A 2A2IA 4D6CA 3CV2A 2WV8A 2OZ8A 4EANA 3D5HA 3RU8X 1G4SA 3G8RA 4HPXA 4LANA 3ANYA 2JK2A 3SIZA 4C6DA 1GTEA 4S3JA 4A29A 3TYZA 3SRKA 4JYDA 1TO3A 4R7WA 1KBIA 4TXEA 2QF8A 3MP3A 1PV8A 4KESA 3AFBA 3Q45A 5LSMA 3WLNA 3WLSA 3G1DA 2I9UA 4LS0A 4Y2WA 4HOXA 2IPFA 1R9ZA 1KCXA 3VKKA 3AICA 3F7JA 3TC6A 5HNTA 5E9AA 1PX8A 4RV8A 4Q6XA 4AXKA 4KGLA 4B5NA 3BG3A 3KCJA 4DRSA 5I09A 4C6PA 2DP3A 2F2KA 4AWTA 2Z0IA 1LDCA 4HSOA 1DIEA 3WLHA 2P88A 3GKAA 4J7RA 4NT0A 1TR9A 2QAPA 3DHUA 4JTJA 2VOMA 2Z2UA 2D22A 2NVCA 2DIEA 4O15A 2DIKA 4F9JA 4IX0A 4ADSA 1HNYA 4UTMA 4QG9A 3SFWA 3ABOA 1OFQA 3AIBA 4OV4A 3CHEA 1HVXA 5LNRA 3B3DA 1KRAC 3KHJA 4D8ZA 2Y89A 3FKKA 2ODOA 1L6YA 2CLLA 4LUJA 3KP1A 4B3KA 4EVZA 1QWKA 4HGXA 1MSSA 4B15A 2VL4A 4K1WA 4X9SA 1XGDA 3RF9A 1UD8A 1FXPA 4UFMA 1BKHA 4ORMA 4C6EA 1NARA 3FSTA 7XIMA 1XBYA 3G22A 2W4XA 3TMQA 1OYAA 4E2BA 3LSBA 1UOZA 3VMOA 3PM6A 5GNZA 3PZUA 1AQFA 3WUBA 1QUMA 1OFPA 3LNMA 4GIAA 4MM1A 1IEXA 1H7XA 2XFFA 1MYRA 4N9EA 1SSGA 1G7VA 3BMXA 2J66A 3KDNA 5CGMA 3OGSA 3WNNA 3OLDA 1UA7A 3ZJ6A 1LQAA 2ZRYA 3VGGA 4DNMA 2POTA 2E67A 3GVRA 1QR7A 3VMNA 4HMEA 1X98A 2YIHA 3THCA 5AHFA 5DY2A 4JFVA 4IGNA 5T91A 2VKZG 1CEOA 3O07A 4MZ1A 2YX0A 3SCPA 7ODCA 4YTQA 4ZQOA 3GVQA 3GC2A 1H0IA 3CM4A 3UYCA 5DCBA 5A8GA 1X1NA 3T4CA 5F2GA 3S9YA 4HYRA 3WQ8A 4GYFA 3L4TA 3WQCA 1E4MM 2PCQA 4H9MA 4RW5A 4FZIA 2AL2A 1KRCC 3QGVA 5F1VA 3W27A 3CK5A 3HO8A 3MCOA 4CD4A 3P74A 4ZB5A 4J28A 2X16A 2O4QA 5CJMA 3ES7A 1W5NA 3ZR4A 3WQVA 1RV8A 2PC8A 3T07A 3Q94A 4MIMA 4Q8QA 1HKJA 1T40A 3CUHA 3MU7A 4MJMA 2XISA 1JZ5A 4E8CA 1ZLPA 3PTQA 1H63A 4GQGA 6TAAA 3S1GA 1UASA 1UMLA 3LG3A 5CZKA 4DUOA 4HZ8A 4ORIA 1JYNA 3DAQA 3B8DA 5TNVA 2X1SA 3W7PA 3GX9A 1KXTA 5LIXX 3BQ6A 4M1RA 1L6SA 4EX4A 4H2CA 3PTMA 1QPRA 5E93A 3AI0A 2VZOA 4DO6A 4ZFMA 5A2BA 4U10A 3HJEA 5LA1A 1BPLB 3C2EA 1BTMA 3E2SA 3WMCA 1EJWC 3LZ3A 1V0NA 5EBAA 3VIFA 4GOAA 3UJ2A 4DJED 3AYRA 4CQBA 4LCSA 3WF2A 1UWAA 2X30A 2GQ3A 3VDHA 3KAOA 4LF2A 4C6IA 3L5MA 2I5QA 4MFEA 4W89A 3WSUA 5FCZA 1M7PA 1ISXA 2J7FA 4IX2A 2OYMA 3VFLA 4A2SA 1N8FA 3TFCA 1M53A 1TMLA 3WNPA 1HL8A 2J7BA 4YHEA 2OX1A 2A5HA 3OLIA 4S3EA 4HHMA 3P6LA 5CSSA 3AWOA 4N6FA 2ZBTA 6A3HA 3KCOA 4H00A 5A6KA 1XXXA 4P8XA 4R85A 8CGTA 3RHGA 3PP7A 3I7SA 1AW1A 3U2ZA 2ISDA 3SY8A 3F4NA 3UPWA 5CSRA 5MKGA 5FEWA 3CH0A 3QEZA 4V33A 1ZZMA 2QUTA 4KFPA 1W32A 4CNUA 5AHIA 1E6QM 3RCMA 4B9YA 4EKJA 1U83A 5DMMA 3C2FA 3V0UA 4EOUA 4ERIA 3W7EA 4GGBA 3TZFA 4YVVA 2FIQA 3CV1A 3IAQA 1SU5A 4IMFA 1YE4A 4IXHA 1QHZA 1UKSA 3OG2A 3OHIA 3NQ6A 1QU4A 4NIRA 2XIIA 3NO5A 3S47A 4KFNA 3FYYA 3GXMA 2EAWA 3LHUA 4YYFA 3DFHA 4CLMA 3MZ2A 3AXKA 5FOOA 2O9TA 4P5UA 2JKEA 3C0LA 1K8XA 2QQ6A 4HMDA 1GUVA 4U3AA 4GRSA 4HZMA 4CQDA 2ZC1A 4PA8A 4DIAA 7REQB 4PBEA 5C9ZA 1H51A 3ISIX 1F3XA 3BAJA 3BAYA 3HGJA 1FP9A 4RZ6A 3N1AA 4JX4A 4E6MA 3PULA 3DU0A 3GO2A 3FKRA 5C54A 2GDUA 2CXEA 2Z25A 3ABZA 4LYRA 1BQCA 1IXQA 4HK6A 4FOUA 4JFUA 4AY8A 2I56A 2V30A 3KL3A 2HWGA 3STCA 4LV4A 4C65A 1TQJA 4AZCA 1H3GA 4M3PA 4AIBA 4H6KA 4B4FA 3NJ3A 5G2HA 2E1WA 3TP4A 2WMKA 4K8HA 3SUUA 3WF4A 4RCXA 4FIQA 1GK8A 3B9EA 3N9KA 2H9AA 4GJ1A 4DBSA 2QPUA 5I7GA 3WK1A 4D6GA 4HU4A 4I9JA 1EZWA 3VM5A 4GI8A 1RK5A 1B0IA 4S39A 4DI8A 3WLLA 4Z1AA 3EMZA 4NX0A 1F6YA 4ROQA 2CWNA 1E6ZA 3W1XA 3BSMA 1VKFA 2CZEA 3WJZA 2YR1A 3CNYA 4A3UA 1T41A 4PEEA 2QGHA 3O9NA 3CV6A 1LL4A 3MUXA 4GYKA 1RHCA 1V08A 4I6KA 4XBSA 2PGRA 5EU9A 1IZKA 1C9WA 2VFIA 3TQPA 6CGTA 2Y7DA 5DEZA 1J6OA 1D3CA 3BSGA 1MRAA 4GQBA 4DZIA 1F3EA 2GGJA 2BXZA 1XLEA 5EB8A 4QJ3B 4AMCA 5L6UA 3OVGA 4PUMA 4OV9A 1B3ZA 2UY3A 1RP9A 3N15A 3FS2A 1T96A 1OSEA 3W7IA 1H7NA 3CMFA 4OZOA 1NWRA 4QLKA 2PPGA 3ZJKA 3G3DA 2CHNA 2Y4SA 2PP1A 3BAKA 4RDYA 5F4XA 4J5NA 3PZIA 2H8XA 3I6TA 5D2TA 4KW2A 1AVAA 4DY1A 2GVLA 2WSKA 2J7HA 2CLFA 2GK1B 2PD5A 4DZHA 4Z2HA 1V6TA 2X42A 1NFBA 3S1VA 4AHOA 2OEMA 2PDLA 2VZSA 4P7NA 3UR7A 3NQAA 2PLJA 4JQAA 4DI9A 1S5VA 5JBFA 3TTOA 3ECQA 1DOSA 3RR4A 3BGAA 3ARWA 3N25A 4RXGA 4E2OA 1W9PA 3WH9A 1NF0A 3WX7A 5I23A 4A6GA 2WZMA 2Y2WA 1QHOA 4TVUA 2R1PA 3ITCA 2UZ9A 3W2MA 4AF0A 2J7CA 1B2YA 3HG5A 3PG8A 1VCGA 4R3UA 5KINA 1A5OC 2VMFA 4XZNX 1GKPA 2NXHA 4LALA 1O94A 1E0WA 4O4WA 1LUCA 4NP7A 1TWDA 2XIMA 1A53A 1Z9AA 1J0YA 1LYXA 1F3TA 1TRDA 2O9RA 2NSOA 3MV01 2W5FA 2Y7GA 4MJ4A 4GIYA 3AZTA 3WH6A 1TV8A 3L0GA 4IJCA 3T0BA 1FDZA 1ADSA 4L9ZA 3TTEA 4AZ6A 3WH7A 4Z1DA 1AH0A 2GGIA 3WN6A 2TPSA 1DQXA 2PBOA 4KPLA 2A0NA 3U5UA 3ABQA 4IIGA 4J9JA 2WC4A 1UBSA 4W8BA 1E3ZA 1FWDC 3TTYA 3QV7A 1TV4A 1S2WA 5CC7A 1L2UA 4I9AA 1V93A 3RCYA 3W02A 4UTFA 4Q4QA 4DJDD 3ALGA 3SRFA 3A3WA 3F2BA 1HJWA 5XIMA 2C0HA 1OD8A 2FKPA 2E3ZA 3R25A 4RDWA 1KFEA 5ABFB 4GCXA 5A8QA 1YDYA 5C2XA 3U6WA 4B16A 1WXJA 3RITA 3EPOA 4JN6A 1TCMA 1V8EA 5HBFA 5H2ZA 3ZLFA 2EG8A 3N4EA 2VC7A 2VFGA 4UMAA 3MMUA 3N13A 2ZOXA 5CLTA 1ZS2A 2ZCGA 1UUMA 1P1XA 4NX5A 3QY6A 4GPNA 1XIGA 4TX8A 1ECEA 1QAPA 3KW3A 3W1PA 4HSNA 1C9DA 4DBDA 1TTJA 1ZGDA 3IEBA 2PLCA 3N29A 1XL9A 2VR4A 4LRTA 1B3OA 2YL8A 1OY0A 1JVNA 1GVRA 2PDHA 2OG9A 4L61A 5D32A 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 2CLP A;  3KVK A;  3CIV A;  5D33 A;  5KSW A;  3CUX A;  1ZPT A;  3ZS4 A;  4WY0 B;  2WSY A;  1KM1 A;  4IG2 A;  5TD4 A;  3FCP A;  1TTQ A;  9CGT A;  3VIJ A;  1TRE A;  1SZN A;  3DH7 A;  5EMJ A;  2OCZ A;  5BXS A;  2WKG A;  1UIO A;  3LB0 A;  4DZA A;  3F2C A;  1OAB A;  4CU8 A;  4IF2 A;  3SCR A;  4I7V A;  4UFK A;  1IXN A;  3W1U A;  2W62 A;  1JRB A;  5EML A;  2PDU A;  3RDK A;  1D7F A;  4IHC A;  5CG0 A;  4YJ5 A;  1LWJ A;  3GXF A;  3R8H A;  3RRX A;  3KRZ A;  3EOE A;  2J79 A;  1XV8 A;  3ITX A;  2QW5 A;  4EIV A;  3OB8 A;  1GGO A;  1AW2 A;  4IMD A; 
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