The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
30
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sequence length |
92
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structure length |
92
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Chain Sequence |
DPEKLKILEWIEGKERNIRALLSTMHTVLWAGETKWKPVGMADLVTPEQVKKVYRKAVLVVHPCKATGQPYEQYAKMIFMELNDAWSEFENQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Chaperone
|
| molecule keywords |
Heat shock cognate 71 kDa protein
|
| publication title |
Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bos taurus
|
| total genus |
30
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| structure length |
92
|
| sequence length |
92
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2007-08-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | DnaJ domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QWP B; 3UCS C; 3AG7 A; 2PF4 E; 3APQ A; 3UO3 A; 1BQZ A; 3APO A; 2M6Y A; 1N4C A; 1NZ6 A; 1WJZ A; 2CTQ A; 2CTP A; 2N04 A; 2QWR B; 2Y4T A; 4J80 A; 2GUZ A; 2OCH A; 2LO1 A; 1GH6 A; 2DMX A; 4RWU A; 4IT5 A; 2CTR A; 1FPO A; 1IUR A; 2QWO B; 1HDJ A; 2GUZ B; 2QWQ B; 2LGW A; 2QSA A; 2CUG A; 1FAF A; 4J7Z A; 2CTW A; 2L6L A; 2YUA A; 2YS8 A; 2N05 A; 2QWN B; 3UO2 A; 1XBL A; 3BVO A; 2KQX A; 2Y4U A; 1BQ0 A; 2EJ7 A; 2DN9 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4JV5 B; 3RVY A; 2E3C A; 2IH1 C; 3JAW A; 1T5E A; 2FYU H; 4LWS A; 2GDS A; 3K57 A; 1ZL8 A; 4WCE V; 1XMQ O; 5FPR A; 1QCE A; 3JCZ A; 1X59 A; 2LJ2 A; 1FFT B; 4DUZ O; 5B3S C; 1Y76 B; 5KA6 A; 4LF8 O; 5GW7 A; 4QE7 A; 1Q81 W; 2P90 A; 5B1O A; 4J9Z B; 4B7K A; 3OEE G; 3ASN B; 2Y4T A; 3PN1 A; 5F2V O; 1XHX A; 4FZ1 A; 1NTM H; 2B5U A; 2WA4 A; 1SQB H; 2G38 A; 4DV2 B; 1JOY A; 1QQC A; 1K5S A; 5BMV A; 3U0Z A; 2ZR3 A; 1JR9 A; 4BIO A; 2YI8 A; 2EIK C; 2HJF C; 4JAU A; 1K33 A; 5JCO A; 1H2S B; 3RYI B; 4RQE A; 2HHH O; 2GTA A; 1IBK O; 2DYR C; 4JI2 O; 1SRY A; 3X2Q B; 3MD0 A; 5K1P A; 3E8B A; 1N32 B; 2EX3 A; 3JAM N; 5CBG A; 3TET A; 4DR1 O; 4ZKI A; 4IHJ A; 5IE9 A; 3B4S A; 5LHH A; 5E79 Z; 1SQF A; 3TK1 A; 5L3E A; 3JD3 A; 1Y4M A; 2WA3 A; 3DGE A; 2JGU A; 2DN9 A; 1RSO A; 2ZDI C; 4FLU A; 2F43 G; 2ZCE A; 4LFB O; 2QWO B; 1VQN V; 3I55 V; 5C93 A; 2CUG A; 4ZOL A; 4BW9 A; 4D7S A; 3H1J H; 3CXC U; 2L35 A; 2B1I A; 3W7U A; 1AJP A; 4PDR A; 1AI6 A; 1ZX3 A; 5IYC O; 3EVK A; 1KB9 F; 2XND G; 4X65 B; 2Y69 B; 1L8D A; 4DK0 A; 2LFS A; 1IUR A; 3CC4 V; 1F51 A; 4JYA O; 4MVO A; 2P5O A; 3E2E A; 1FAF A; 1XMO B; 4MVR A; 1MNG A; 2B9Z A; 1XL4 A; 1BZK A; 5B66 Z; 4KHP O; 2X7R B; 5JVD A; 3O9O A; 3SYC A; 3GWK C; 1Q8I A; 1W59 A; 4WFE A; 2D2C B; 5CA0 A; 2V4D A; 5HFM A; 2ZE8 A; 4OX9 B; 3ZIA G; 2IJK A; 1LUV A; 3UT5 A; 3ZJZ A; 3EXA A; 4X64 B; 1YXB A; 5GTH Z; 3L72 H; 1K8A W; 2ZNI A; 2IW5 A; 5CB4 B; 1OCO B; 5EZY A; 2HLD G; 1OCR C; 4YIP A; 1JJO A; 5KAF Z; 3JAK A; 1XDC A; 3AG3 C; 4OPA A; 4DR6 B; 5IYD O; 1Z2G A; 2A9H A; 4BIU A; 5KHG A; 3P32 A; 4GKK O; 2DWD C; 2XAQ A; 1JFF A; 5KAI Z; 4YJ2 B; 1BQ0 A; 2EJ7 A; 5LOV B; 2JRI A; 5LMU O; 1FJG B; 4UB6 Z; 4FLY A; 3CP1 A; 2XT9 A; 4JPR A; 1K4C C; 4FLW A; 1JCH A; 4FPP A; 4AHC A; 4PA9 A; 4YY3 B; 1RM1 C; 3ETE A; 4DUY O; 2RCV A; 1JQ0 A; 4JGS A; 4UCT A; 3ZED A; 3OTF A; 1SF9 A; 2QDO A; 1ORQ C; 3E35 A; 5JJE B; 1TA8 A; 2PF4 E; 2P67 A; 2DOS A; 2QKC A; 5IWA O; 2EIJ B; 1XL6 A; 2RJZ A; 1KBH A; 4KP4 A; 4LWS B; 1N33 B; 1ZL8 B; 1EM1 A; 3SYQ A; 4WF9 V; 4JI6 B; 4J41 A; 4CZZ A; 3OTO O; 5EYP A; 5LHI A; 4MVS A; 1M57 B; 5JH7 A; 3LUT B; 2JVD A; 3SYA A; 5IYZ B; 1PNM A; 3LNN A; 2HJD A; 1B04 A; 3VQV A; 3GWO A; 1V55 B; 1R6T A; 3N2K A; 3RYH A; 3T1Y O; 4CH5 A; 4X66 O; 1GRJ A; 5BMV B; 2AZ0 A; 3QNE A; 4I50 B; 2CGO A; 2A0L A; 2UUB O; 4JI7 O; 1XUQ A; 1K5Q A; 4MS2 A; 2UXX A; 1IBL B; 4DV5 O; 1YDX A; 2LFR A; 5L3D A; 3TXS A; 3P30 A; 4DR4 O; 2W0F C; 3AEI A; 2PGG A; 1GTO A; 2ZXW B; 4CS2 A; 1YF2 A; 4LF9 B; 1WNS A; 3FFQ A; 4UVB A; 4LF7 O; 3T1C A; 4IHJ B; 4O4H A; 2NLJ C; 2X6A A; 2ZQM A; 4PV1 B; 1J95 A; 2DJV A; 2VQE O; 2CTQ A; 2X0L A; 3RW0 A; 4GX2 A; 3QO7 A; 2HEP A; 2EIN B; 5IT9 N; 1Q43 A; 5LP6 C; 2WLK A; 2IU0 A; 1P49 A; 4ZOL B; 5L3B A; 2BOC C; 1R1B A; 4TV9 B; 3OD4 A; 2P4K A; 4N21 A; 1NKD A; 3AG2 B; 2DYS B; 4DYL A; 4TQD A; 2IU3 A; 1EN6 A; 4JI8 O; 3JD2 A; 1I08 A; 4X20 A; 3THO A; 2Z3Y A; 4LP8 A; 1Y74 A; 1AJN A; 3LSU A; 3B77 A; 2YIB D; 4RAI A; 4I0X A; 2QR4 A; 4DV6 O; 2JIZ G; 3CRR A; 3WG7 B; 1W0J G; 1XIL A; 2AW9 A; 3ABM C; 3CPW U; 2OCC C; 1AR4 A; 2PY5 A; 1VEW A; 4HYO A; 2UUC O; 5IY5 B; 3E89 A; 1Z5V A; 1QVF U; 3RYC B; 1K73 W; 1QBZ A; 5JVD B; 2ADP A; 2DQ0 A; 1F4M A; 3H1I H; 1S77 D; 5CA0 B; 1ZAU A; 1AB3 A; 3CCL V; 4JI0 O; 3D36 A; 3ETG A; 3N27 A; 3K59 A; 3SYP A; 3VBB A; 3UT5 B; 4NXN O; 3H1H H; 5D5P A; 2AXT Z; 5EZY B; 3O65 A; 4DV7 O; 1G6U A; 2OTL V; 1JMK C; 2UXC B; 5HFL A; 3JAK B; 3OE7 G; 1HR0 B; 2X6B A; 4LBE C; 4DR3 O; 3L71 H; 2H3O A; 1Y66 A; 4CC5 A; 4K8Z A; 2YEV A; 4J42 A; 2PYJ A; 2YIC A; 2UXN A; 1JJ2 U; 1BHA A; 1XBL A; 1XNQ B; 2JJ1 G; 1AI7 A; 1SES A; 3FB6 C; 4WBN A; 4I9W A; 3ASN C; 4JI1 O; 4BW5 A; 1G4Y B; 2JJ2 G; 2CK3 G; 3CEI A; 1H2N A; 4EKW A; 2AZ2 A; 3ZN1 A; 4R8C A; 3ZBH A; 3IFX A; 1FFX B; 1L0L H; 1WPB A; 4X89 A; 2JEX A; 1GMG A; 5BXZ A; 4NR1 A; 4IIJ A; 3E8F A; 4N23 A; 1N0J A; 4DR2 B; 3VQX A; 2BCC H; 1WP7 A; 3X2Q C; 4B3M B; 4X62 B; 5B1N A; 1A32 A; 1SQV H; 4FFK A; 4FJC C; 4X1I A; 1S3J A; 3SPH A; 2EJR A; 1VQO V; 3EFF K; 1N0N A; 4H13 B; 4PEL A; 4DV4 O; 3RT3 C; 1THZ A; 1OZ0 A; 5LMN O; 3WB1 A; 1XEQ A; 1NBM G; 3ZHQ A; 4CH3 A; 3CCU V; 1GAX A; 3S3W A; 1J5E O; 4FMT A; 4MSW C; 5EYP B; 2FKX A; 3K08 A; 4NTW A; 5JH7 B; 1R3J C; 2RNB A; 1FPO A; 1HP8 A; 4JI3 O; 4L87 A; 3H9V A; 3MHH C; 2OIE A; 1KKC A; 1OCC B; 4TUY B; 4DV0 O; 3K04 A; 3RYH B; 4MTG A; 5LGU A; 1AI4 A; 2RMK B; 3MAQ A; 1SKV A; 1B3Q A; 4W4L A; 1E1R G; 2Y69 C; 5JJJ B; 3OUF A; 3NXS A; 4WFH A; 3ZMU A; 4DR5 B; 2O57 A; 2Y0I A; 4PHZ A; 2NNU A; 3CJH A; 1EZV H; 4J11 A; 1Y67 A; 1K97 A; 2ILM A; 4GCZ A; 2YID A; 2P6J A; 2WLM A; 3UO3 A; 1I94 O; 3A8T A; 4O4H B; 3CC2 V; 2DMX A; 2K1E A; 1Q86 W; 3B8M A; 4B3S B; 2HFE C; 3I5D A; 5EIB C; 2E74 B; 4FM2 A; 4LF8 B; 2L6L A; 1OCO C; 4GT1 A; 3J7A U; 3CRM A; 5CBH A; 1GM7 A; 1P7B A; 1TGO A; 1IBM B; 5DN6 G; 5B1A C; 1AR5 A; 4E4E A; 3ABL C; 2KSD A; 3CRC A; 1HNW O; 3K5M A; 3SJQ C; 4P30 A; 3U11 A; 2JS3 A; 1F4N A; 3JAL A; 1GKF A; 4EFE A; 2WAM A; 4H44 B; 2XAS A; 3K3W A; 4JI2 B; 1BL8 A; 4EFB A; 4JYY A; 1BCC H; 1UJW B; 1R3I C; 5GTI Z; 3K03 A; 2QM7 A; 1TUB A; 3K0G A; 1Q3E A; 4LCU C; 1KUQ A; 2Q5Z A; 1H2G A; 3ZHT A; 1NQT A; 3OMA B; 5KMG A; 2ZNJ A; 5L3F A; 1M56 C; 4NVP A; 4DR1 B; 3G4S V; 3L9D A; 5IJ9 B; 1YEW A; 4QPK A; 3C3S A; 2LGQ A; 1PP9 H; 3AG1 B; 1TVK A; 1SZX A; 1SQQ H; 1GM9 A; 4O4I A; 2V7Q G; 5IYZ A; 3G6B A; 2QWQ B; 2WWW A; 2ETN A; 3K5L A; 2OWO A; 5LXT A; 4LFB B; 4UCU A; 3KZI Z; 2OCH A; 3AK1 A; 3HKD A; 4DK1 A; 1VQ5 V; 1MAB G; 2CH7 A; 3W7X A; 2QSA A; 1HNZ O; 5CN0 A; 3JAR A; 3UKM A; 2E5L O; 4I50 A; 1M57 C; 3OMN B; 5GON B; 2F1M A; 2YEV B; 1JPX A; 4MT8 A; 1Q6H A; 1VF6 A; 4GX1 A; 1IZ3 A; 1GH6 A; 2ODM A; 4WFG A; 4WBN B; 1LUW A; 3VOU A; 4DV3 O; 4QPJ A; 4B3R O; 1PNK A; 3BEH A; 2Q67 A; 1V55 C; 3OEH G; 1LNQ A; 1XNR B; 1MSD A; 2KB1 A; 1FXV A; 1I7F A; 2ZIN A; 1UPG A; 3BA9 A; 4KHP B; 4UV8 A; 5JCO C; 1FXK B; 3F7Y C; 4C7U A; 1CEZ A; 1E1Q G; 4IIJ B; 4UFZ A; 3OMI B; 5H2F Z; 4LF6 O; 5A9G A; 5BR8 O; 3I56 V; 4W4K A; 3ETQ A; 4LF4 B; 2UXB O; 4LC1 A; 5B1B B; 3SJC C; 2ZXW C; 5BZB A; 4X1I B; 4UUJ C; 4RUE A; 3CB2 A; 4TV9 A; 3CRA A; 2ZE7 A; 3T4Z A; 3B09 A; 3UM7 A; 3JAS A; 2KQX A; 2AHY A; 3IJ4 A; 4I9Q A; 4UCR A; 2WSS G; 4ZHQ A; 1E79 G; 1DTO A; 4I5S A; 1B06 A; 4RQF A; 3RBZ A; 2EIN C; 3SR2 C; 4F6E A; 5J9P C; 4GKK B; 2ZE6 A; 1SET A; 1N36 O; 2HR3 A; 3SPI A; 4IYI A; 3BCC H; 1I5X A; 5KUM A; 1EN4 A; 1RP3 B; 1SS3 A; 5LMU B; 4WFF A; 3AG2 C; 4UVC A; 3RYC A; 2YSU B; 2DYS C; 1WJZ A; 1NR1 A; 3STL C; 4J80 A; 4ZI7 A; 1AI5 A; 3ASO B; 3STZ C; 4DUY B; 4GX0 A; 5KHK A; 1BMF G; 3HKB A; 4TWK A; 3RVZ A; 1ROP A; 2BTO A; 1BGY H; 3LSS A; 1GN2 A; 3JYC A; 4J9Y B; 3WG7 C; 3E8H A; 2Q4P A; 3AG7 A; 3CJH B; 4TSF G; 1VQ6 V; 2CAZ C; 1PL0 A; 3CX5 F; 1QNM A; 1EN5 A; 1SA0 A; 3AG4 C; 2WLL A; 2Y0P A; 2R9R B; 2YXH A; 4LH7 A; 1I0H A; 4LFA O; 3OTO B; 2ZM6 B; 4GKJ B; 2VRZ A; 3ZHV A; 2X6C A; 1TAE A; 2UU9 O; 3AK3 A; 2UXD O; 1URF A; 4QJF B; 4LFC B; 4ZBM A; 4LF5 O; 5EC2 C; 1QHT A; 1AP6 A; 3A0H Z; 3ZMT A; 3T1Y B; 2VQF B; 2IJH A; 1FFX A; 5LBQ A; 4X66 B; 5EC1 C; 1GK9 A; 4XDL A; 3OFN G; 1K4D C; 1XMO O; 4B7E A; 4UXN A; 1U97 A; 3JAL B; 4FM1 A; 4JI7 B; 4EB6 A; 2Q0A A; 4JAS A; 4I4T A; 2W6J G; 4BWA A; 1BQZ A; 3BRC A; 4G2K A; 1XQ8 A; 1XI1 A; 4DR4 B; 2EZO A; 3G6E V; 1TUB B; 4YXW G; 1L1F A; 1PM9 A; 5KLV H; 2ZD9 A; 1AVM A; 2FL4 A; 4OX9 O; 5KMG B; 1NU1 H; 3D3Q A; 1OJH A; 3JAT A; 1ZTE A; 2IBZ H; 1TVK B; 4DRX A; 1RPO A; 4JI5 B; 4O4I B; 3T2M A; 2BOB C; 4DV1 O; 4WFA V; 2AHZ A; 1KKD A; 4X8A A; 1H38 A; 5LXT B; 3F7V C; 1SZT A; 4DR6 O; 2WPD G; 4GX5 A; 3M99 B; 3HKD B; 4TUY A; 3QO5 A; 2EIK B; 4P2Z A; 3RFR A; 1JA8 A; 2N05 A; 2CH7 B; 2F95 B; 4FVM A; 4F6R A; 3ZHU A; 1OV9 A; 5H6Q A; 3Q4H A; 3JAR B; 1SQX H; 2DYR B; 3RWR D; 4PDV A; 2Q6A A; 4MW3 A; 3HPL C; 1CXZ B; 4JI8 B; 4KUM A; 2H94 A; 4D7T A; 2OYQ A; 2IJJ A; 1VF7 A; 3L73 H; 3H01 A; 2PZS A; 3OGI B; 3OUS A; 1OCC C; 4DV6 B; 4UVA A; 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1KP2 A; 1YCI A; 1YVW A; 3HKC B; 4O2A A; 2F23 A; 4UCS A; 3QTC A; 2GUZ A; 3TGU H; 4JI3 B; 3C90 A; 2MW2 B; 2R9I A; 1YJW V; 2XUM A; 5FNV A; 5K1X A; 4DV0 B; 5EBL C; 1R6K A; 4TOI A; 1D5A A; 1GN4 A; 1HW7 A; 1MOF A; 1FS0 G; 1PNL A; 1FXK A; 5LYJ A; 5CA1 B; 4NKG B; 3UCS C; 4PA4 A; 2GTS A; 3NR7 A; 3ABU A; 1Q6I A; 4OXS A; 2UUA O; 1Y6X A; 4EB6 B; 4I4T B; 4K8X A; 4MTX A; 3CS5 A; 3MDS A; 1QR8 A; 2M7W A; 1AIL A; 2XAG A; 1ZUQ A; 3RN4 A; 2QWN B; 4PI2 A; 1S0V A; 1D2D A; 1I94 B; 1JVM A; 3JAT B; 1EBO A; 1DLB A; 2JGD B; 5JJN B; 1MMM A; 4DRX B; 3OGC C; 3SYO A; 4P9P A; 4O4L A; 4U3F H; 4QIW F; 3IC7 A; 5B1B C; 1HR0 O; 2CTW A; 4D6T H; 3QF7 A; 1BSM A; 4O4J B; 4R6Z A; 5IJ0 A; 1VMG A; 1BT8 A; 4G28 B; 4F6R B; 3APQ A; 3Q4H B; 3J81 N; 2YDE A; 1QVG U; 1HNW B; 5E1A C; 2E76 B; 4MVM A; 3FYI B; 1W0K G; 3K5N A; 4K0K B; 4CC6 A; 4GYC B; 1CP9 A; 2CGN A; 4L8J A; 4JI4 O; 1S76 D; 4R7C A; 1D5N A; 2DWE C; 1WB7 A; 3ZRW B; 1NVP B; 4BIZ A; 1NZ6 A; 4DR2 O; 2RQ6 A; 4PD4 F; 4JZG A; 1ARO P; 4X62 O; 1XMQ B; 2A3Q A; 2RDC A; 1US6 A; 3HKE B; 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