2QWQA

Crystal structure of disulfide-bond-crosslinked complex of bovine hsc70 (1-394aa)r171c and bovine auxilin (810-910aa)d876c in the amppnp hydrolyzed form
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
383
structure length
383
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLCIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock cognate 71 kDa protein
publication title Structural basis of J cochaperone binding and regulation of Hsp70.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 115
structure length 383
sequence length 383
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 2qwqA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2qwqA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2qwqA04
1SQKA 2IVPA 3H3NO 5AZJB 4FL9A 1KAXA 3FR0A 4FWRA 1E4GT 4BRKA 4BROA 3O80A 4BVPA 1YXQA 1C0GA 2QWMA 3FZLA 1BO5O 1H1VA 3VERA 4CD1A 1XQSC 2E2OA 2CH5A 2YJFA 2VYPA 4BG9A 2E2NA 3C7NA 3M3ZA 2A6AA 4XEIA 5AQHA 5AQNA 3VEYA 3DXMA 4A2AA 4EFHA 1ATRA 2FSJA 5LJVA 1GLFO 1XUPO 3B8AX 5AQMA 1ATSA 5KPTA 3CJ1A 4CZHA 3WEEB 3CERA 2AA4A 2HOEA 2BTFA 3DXKB 4CBUA 1IG8A 5AQVA 1BG3A 3BP8A 3U8XA 3UKUB 4FWKA 4MLHA 4XH5A 4CD3A 4BVOA 1NGJA 3SK3A 3FFKB 3H45C 1QQNA 3SMSA 1GLLO 3BF1A 3FZKA 3LDPA 2D0OA 1C0FA 4BR7A 1NGBA 1HLUA 3U4LA 3IMXA 3HI0A 5BRFA 2FF6A 2P9UB 4FOIA 5AQKA 4BC5A 2Q2RA 1T6CA 3M1FA 3UKRB 3QFPA 1NM1A 3QBXA 1V4TA 2FSNA 2P9NA 1MDUB 4FWOA 3O1BA 3QB0A 5ADXH 1JCGA 4BRNA 4H0VB 3D2FA 3VF4A 5TKYA 5AQSA 4BQZA 2QWLA 3BUZB 1BOTO 2FF3B 4FWPA 3UE5A 3QFUA 1R59O 4B1XB 2YHXA 3HM8A 4BGAA 4RCHA 3VF6A 5EVZA 3O4WA 1BWFO 1QHAA 5ADXA 4BRDA 4E1JA 1HKGA 2QW9A 2ASOA 5I9EB 4DB3A 3CHWA 4H5WA 2VCPA 1EQYA 5CE3A 3EZWA 3HBTA 4H0YB 2QWQA 3D2EA 2CGLA 4IJAA 3KVGA 4I6MB 1LCUA 1DGKN 4AM7A 3O8MA 3VEWA 1X9JA 3EO3A 1S22A 4DHYA 3CJCA 2J4RA 4JD2A 5AQPA 1K8KB 3AY9A 4FPAA 3VGMA 3HSCA 4YDUA 3CJAA 4BRQA 3WXJA 4CBWA 4FWSA 3O6WA 4PKIA 4BGBA 1BA1A 1Q18A 3CIPA 1TYQB 4JNEA 1JCEA 3ENOA 4LC9B 5BN8A 5LJWA 3QICA 3AARA 2PBDA 4CZFA 5JLFA 1NGCA 2D1KA 4J8FA 1NGGA 3AAPA 3DAWA 3ZETB 3P4IA 4K43A 4FPBA 2P9KA 4K42A 1NBWA 3EN9A 3L6QA 2IIRA 2ITMA 3EKSA 2YCHA 5AQLA 3WT0A 2V52B 3WXKA 3GG4A 3TPQA 1WOQA 3SJHA 2D4WA 4BC4A 4CZGA 2NLXA 1KAYA 4EHUA 1ZXOA 4WQ4A 3EL2A 4M7YA 1RDWX 4BRHA 3GL1A 3QBWA 3WXLA 3BF3A 1S3XA 2IVOA 1BDGA 4NB4A 3WQTA 2V7ZA 3GE1A 2P9PA 3A5MC 3BEXA 2CGKA 4XH4A 4QS7A 3C7NB 2BUPA 1GLEG 2YI1A 4H5TA 5AQTA 3DXMB 4MLEA 5KQDA 1HPMA 3H1QA 3F9MA 3MN6A 3WXIA 3U9DA 3R8EA 3FE1A 4H5VA 5EY4A 1QZ6A 5E84A 2WUSA 2W41A 4CZIA 3IUCA 4BRFA 5F1XA 3L0QA 3ZEUA 1OKJA 4K41A 3C0BA 2A42A 4BC3A 1V4SA 2FXUA 3ULEA 2GWJA 3A5OC 3QDKA 3MN9A 5BREA 3ATUA 2P9SA 3QMLA 4B1YB 1GLCG 2GTDA 3FGUA 4RTFD 2E88A 2QWRA 4FOEA 2FLOA 4Y0WA 2E1YA 2V51B 2P9NB 2GWKA 3VEXA 3RSEA 3U9ZA 4O5FA 1TUYA 4QS9A 2A3ZA 3KZBA 3ZX3A 4BQLA 3D2FB 1HX1A 1G99A 2CH6A 4H0OA 1JCFA 4FWQA 1KAZA 4HWIA 2P9IA 3O5BA 3WQUA 4BR0A 3HZ6A 2QWNA 1WUAA 1E4FT 5AQRA 1U2VB 2Q36A 3VETA 3GBTA 5JLHA 4A61A 3L4IA 4BC2A 3EKUA 3VEZA 3VEOA 4IWVA 4GNIA 2E2QA 4A2BA 4BRLA 3LL3A 3D2EB 4YDUC 4B1UB 3GDQA 4JHDA 4I6MA 4BRGA 3CI5A 2QWOA 2E1ZA 2Q31A 4CZLA 3LDLA 4QS8A 3VGLA 4JD2B 3ZX0A 4EHTA 3H6EA 4CJ7A 3A8YA 1LOTB 2Q0UA 5EX5A 1DEJA 3MN7A 2E20A 5AQQA 1X3MA 1GLBG 5EXWA 1MA9B 4M63C 5JMVA 3A5NC 1QQOA 4FWNA 2NZTA 3W0LA 2ZGZA 2ZWHA 4H5RA 5BRDA 3CJ7A 1J6ZA 1ATNA 4BG8A 2AP1A 4C23A 4Z94A 1YVNA 1SZ2A 1ZBSA 3VPZA 1NGAA 4CZJA 4BREA 4XH1A 1Z05A 5AZIA 1DKGD 4PKGA 1TUUA 2FSKA 3A5LC 4B1ZA 4F9OA 3GOIA 2UYTA 2P9LA 4BRAA 1IJJA 3IFRA 4H5NA 1HKCA 4H0TB 5B8HA 3MDQA 2P9KB 3R9PA 4FO0A 2D0PA 2W40A 4H0XB 1NGFA 2ZF5O 3A0IX 2E8AA 4WQ5A 4BRPA 5AZJA 4BRCA 4PKHA 3VENA 5ELZA 5AQYA 5AQJA 3ATVA 2A5XA 5AQOA 4JN4A 3VF2A 4AM6A 2GUPA 3DJCA 4M7XA 2HMPA 5KPZA 1KXPA 3KHYA 2NRHA 2P9PB 5BN9A 2GEMA 5AQZA 1HUXA 1QZ5A 2Q1NA 3FZHA 4GY2B 5F0XA 3M6GA 2GELA 5BPNA 1NWKA 3FZMA 4JAXA 1NGEA 2QXLA 3WEEA 3WUHA 3DXKA 3DWLA 4ISFA 1HKBA 5E26A 4NO7A 3UKUA 3ID8A 3LM2A 1YUWA 2YHWA 2OANA 3CJ9A 2EWSA 3HTVA 3MN5A 5FPNA 1MWKA 3FZFA 3LM9A 5KQ8A 3ZEUB 1D4XA 4IZ9A 2F9WA 3ZX2A 1SAZA 2YJEA 1HJOA 2ZGYA 1T44A 2P9UA 3G25A 3JS6A 3ULEB 2A40A 4A62A 5JICA 1NGIA 3UKRA 4B1WB 1GLJO 2P9SB 2DPNA 5AQWA 3JXUA 5AFUH 2Q0RA 2QWPA 4ISGA 2I7PA 4MO5A 1MWMA 4MO4A 4KBOA 3RSEB 3O08A 1NGDA 4PL8A 1RFQA 4K25A 1BA0A 1QQMA 5FPEA 4CZMA 5AQFA 5BPMA 3VOVA 4IJNA 3H3OB 2E2PA 4O8KA 4FSVA 4ISEA 5BPLA 3SMPA 4BR4A 2P9IB 3IDHA 2IVNA 2HF3A 5AFUA 2CGJA 4CZEA 1RGIA 4FWLA 4H03B 4L3QA 2QM1A 1NGHA 2V7YA 3MMVA 1BU6O 3TU5A 4EAHD 5F2RA 4BRIA 1U2VA 5AQUA 2YHYA 1ZC6A 3H1VX 4WYBA 4H0PA 5FPMA 4IO8A 3LDQA 1Z6RA 2ASPA 4PL7A 4RWTA 5AQGA 4CI6A 3CQYA 3VEVA 4BRMA 3I33A 3S41A 3I8BA 1Y64A 1K8KA 1U6ZA 4HTLA 4JHDB 3W3DA 4B1VA 2Q97A 5AQXA 2KHOA 2VWBA 2PAVA 3CJBA 1XC3A 5FPDA 3VGKA 3FLCO 2I7NA 5KPRA 3J8AA 3MCPA 1YAGA 4BR9A 3LDNA 1ESVA 3D7EO 3LDOA 2F9TA 3CQXA 1TYQA 4CZKA 1T6DA 3VESA 5EOYA 4DQ8A 3CETA 4BR2A 1BUPA 3SLCA 2HF4A 2H3GX 5AZIB 3UB5A 5LY3A 5BR9A 5AQIA 4EIAA 3ENHA 5AR0A 1NMDA 4WQ4C 3ZETA 3R6MA 4B9QA 2P9LB 4CBXA 1X3NA 4WQ5C 1GLDG 1P8ZA 2A41A 3H46O 1CZAN 2ASMA 4BR5A 4IXCA 1NLVA 4DCHA 5BRHA 3O1WA 4FWMA 3AAQA 3OHRA 3MK6A 1GLAG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SQKA 3H3NO 5AZJB 3CF5L 1SN1A 1E4GT 4JKAA 4JKBA 3OYLA 1C0GA 2HW3A 1EWQA 1HNZK 2FBYA 3B6OA 4BWMA 1L3VA 2YJFA 1AYJA 3K9JA 2E2NA 1FJGK 3F73A 1CXQA 5AQNA 1ATRA 3F9KA 4QCLA 1HYZA 3B8AX 5KPTA 4JI7K 1ICAA 2AA4A 2HOEA 1QE1A 5AQVA 4B9NA 1BG3A 4RW7A 4FWKA 3T19A 2WFBA 4CJWA 4E7LA 2NUBA 4E1NA 4JV5K 3RTVA 4DQIA 2D0OA 3VQ9A 4NLCA 1NGBA 1HLUA 3CCEN 3VQBA 3HK2A 2FF6A 2P9UB 5AQKA 3M1FA 2O8CB 3UKRB 1W9HA 5M1NA 1DJTA 4KB0A 4JKCA 3O1BA 2B6AA 2I61A 3D2FA 3CQ8A 2Z1JA 3E9LA 3AGRA 3MAQA 3AA2A 4ILJA 2QWLA 3KLHA 1L3UA 4CF2A 3PSFA 1ZBHA 3K58A 5C2DA 1WB9A 4DFKA 2O8BA 2NY8X 3O4WA 1QHAA 5M1PA 5ADXA 3PIPL 4BRDA 2P1JA 1YF5L 2ASOA 1T7PA 3NH2A 1RTDA 1SS6A 3CHWA 4H5WA 3EZWA 3LP2A 1BHLA 2CGLA 3KVGA 2MZ0A 4I6MB 3ZCMA 1SEGA 3VEWA 4CK2A 4JRPA 1S22A 1J5EK 3J80O 3CJCA 2J4RA 1P00A 4JD2A 3NFAA 1K8KB 2HB5A 4HHTA 3CCVN 1ZYWA 4YDUA 3CJAA 3WXJA 3TAMA 4AEIA 1L3SA 4DR3K 3AVKA 3E9OA 1VQ7N 4ELUA 1F21A 4FJIA 4PKIA 2GL1A 3CIPA 2N2QA 4NYFA 5MLCQ 1QSLA 4JNEA 4DU3A 2KFZA 4CQKA 4MFBA 4LC9B 3ENOA 1RT1A 3KKRA 5M1QA 4AHRA 4DLGA 1RDUA 2PBDA 1NK8A 3MEGA 3O9RA 1RT3A 3DAWA 4I7FA 3LZIA 3P4IA 1VQMN 3TAQA 2KQ2A 4DSKA 3THVA 4K42A 1TVRA 1B9DA 3EKSA 1I6FA 4DTNA 3SUPA 3GG4A 2P5GA 1YTUA 3TR8A 3SJHA 1KAYA 2FC0A 2G8FA 3EL2A 3IRXA 1RDWX 4BRHA 2E6MA 2IC3A 3BF3A 1YIJN 1S3XA 4G9ZA 1XNQK 1I2UA 4NXMK 3GE1A 4W5TA 5I3UA 3BEXA 2P5OA 4JI0K 4QS7A 1VSIA 1RBUA 3IS9A 3C7NB 1TV6A 4Z4CA 4H5TA 3DXMB 4X65K 1HPMA 1PE4A 3H1QA 4ID1A 4AHUA 1X1PA 3MN6A 3WXIA 3R8EA 3LDSA 4B9TA 2GV9A 2W41A 4Z4HA 3N4PA 4CHYA 5F1XA 3ZEUA 3NVKA 4OPHA 3O4NA 4KKOA 3CC4N 1UAXA 2HHVA 4BC3A 3S5TA 1HQUA 4OKJA 3ATUA 4DTUA 1YT3A 3CCSN 3QEVA 3I55N 2GTDA 3OYJA 4LFBK 4I9LA 2QWRA 2FLOA 3AVLA 4FLTA 1Q9YA 3JYTA 4BWJA 4QS9A 3KWIA 4FLUA 4FZXC 3J7AP 2RF2A 3L2WA 4CEOA 1TI5A 3ALYA 1KAZA 4HWIA 1ZUTA 2P9IA 3O5BA 2O8FA 3KIOA 1OH5A 2ZM6K 1E4FT 2JWLA 1QS4A 1ILYA 2YNIA 1SKSA 3CCRN 3GBTA 1B92A 1WNSA 2OZSA 5JLHA 3L4IA 5H1SQ 1NOZA 2UXDK 3DLKA 3LL3A 4YDUC 2ZD1A 3KWGA 4EP5A 4CK1A 4B3TK 2MBKA 4JHDA 3CYGA 4F2RA 4UAEF 4CZLA 1M1KO 3VGLA 4DSJA 2IOCA 3H6EA 4CJ7A 1WSFA 1YI2N 3BY5A 1KFDA 1OH8A 2PYLA 4LH4A 4OPAA 2OYQA 1U49A 1BIZA 4M63C 1NKBA 4H5RA 3ZSRA 4I2QA 3PV8A 1VQKN 1S1UA 4C8LA 5CR4A 4Z94A 2QKKA 1ZBSA 1Q81O 2KFNA 5EU7A 1DKGD 1WSIA 3C94A 3M8QA 1TAQA 3GOIA 4E0DA 2LY6A 4FJJA 4CCHA 3VQ4A 4H5NA 3SQ4A 4DS5A 4LFCK 2HMIA 1VSMA 1A5WA 3S3NA 1C55A 3HP6A 4BECA 2ZF5O 4BE2A 4CF9A 5AZJA 4BRPA 4KAZA 4PKHA 1I3AA 3L3UA 3VENA 4DQSA 1VAZA 5KGWA 4YOTA 3ATVA 5AQOA 3DRPA 4M3UA 3K5NA 1WAJA 3ZSVA 2IDOA 2O8DB 2WBNA 4DSIA 2NRHA 5BN9A 2P9PB 2Q1NA 1OMYA 4FM0A 4J2AA 3CMEN 1B7DA 3OVNA 1NK7A 4Q0BA 1NWKA 2YX6A 1NGEA 2EX3A 1U47A 4FM1A 1HKBA 5E26A 4NO7A 3WNGA 1S5JA 3ID8A 3LM2A 2KZZA 1FKOA 1FH3A 3HM9A 2X74A 1ZBLA 3TSUA 2EWSA 5FPNA 3LM9A 3HYFA 4CFDA 4O4GA 1NJYA 2WC9A 4BACA 1W7AA 3KLIA 3DRRA 2P9UA 4CJTA 3JS6A 2A40A 1JKZA 1VRUA 1NGIA 2O8CA 3UKRA 4B1WB 2NRWA 2DPNA 4E7KA 4FK0A 2OZMA 2VGNA 5AFUH 4Z4IA 1WN7A 4CJQA 4L8RB 4ISGA 4NYNA 2I7PA 3KOXA 5C2FA 4LF7K 1UWBA 3RSEB 3KLEA 1NGDA 1ZFUA 5JVHL 4CZMA 2YHBA 3VOVA 3CMAN 1IV0A 3ULDA 4A5AA 4JLHA 4GVEA 1N8RO 4FSVA 5BPLA 3SMPA 3T1HK 4BR4A 3NBPA 3MECA 4FJ9A 1N32K 1BU6O 4KPYA 1RT7A 4E7HA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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1GLAG 2NRTA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1SQK A;  3H3N O;  5AZJ B;  3CF5 L;  1SN1 A;  1E4G T;  4JKA A;  4JKB A;  3OYL A;  1C0G A;  2HW3 A;  1EWQ A;  1HNZ K;  2FBY A;  3B6O A;  4BWM A;  1L3V A;  2YJF A;  1AYJ A;  3K9J A;  2E2N A;  1FJG K;  3F73 A;  1CXQ A;  5AQN A;  1ATR A;  3F9K A;  4QCL A;  1HYZ A;  3B8A X;  5KPT A;  4JI7 K;  1ICA A;  2AA4 A;  2HOE A;  1QE1 A;  5AQV A;  4B9N A;  1BG3 A;  4RW7 A;  4FWK A;  3T19 A;  2WFB A;  4CJW A;  4E7L A;  2NUB A;  4E1N A;  4JV5 K;  3RTV A;  4DQI A;  2D0O A;  3VQ9 A;  4NLC A;  1NGB A;  1HLU A;  3CCE N;  3VQB A;  3HK2 A;  2FF6 A;  2P9U B;  5AQK A;  3M1F A;  2O8C B;  3UKR B;  1W9H A;  5M1N A;  1DJT A;  4KB0 A;  4JKC A;  3O1B A;  2B6A A;  2I61 A;  3D2F A;  3CQ8 A;  2Z1J A;  3E9L A;  3AGR A;  3MAQ A;  3AA2 A;  4ILJ A;  2QWL A;  3KLH A;  1L3U A;  4CF2 A;  3PSF A;  1ZBH A;  3K58 A;  5C2D A;  1WB9 A;  4DFK A;  2O8B A;  2NY8 X;  3O4W A;  1QHA A;  5M1P A;  5ADX A;  3PIP L;  4BRD A;  2P1J A;  1YF5 L;  2ASO A;  1T7P A;  3NH2 A;  1RTD A;  1SS6 A;  3CHW A;  4H5W A;  3EZW A;  3LP2 A;  1BHL A;  2CGL A;  3KVG A; 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