2R0GA

Chromopyrrolic acid-soaked rebc with bound 7-carboxy-k252c
Total Genus 156
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
156
sequence length
527
structure length
522
Chain Sequence
APIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLSSSLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPETEVATGGWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 156
structure length 522
sequence length 527
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0gA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0gA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0gA01
1JRXA 2NVKX 2PHHA 1DXLA 2A89A 1IUWA 4FDCB 2BS2A 3SFDA 1PJ5A 2R0PA 3DGHA 2VQ7A 2IVDA 4MJWA 3M13A 1N1PA 4IA5A 1BKWA 1TYPA 4FX9A 3NN0X 3UKHA 1B5QA 2X8GA 3II4A 4AP1A 3SQPA 5JCIA 1OJAA 5HXIA 1E1NA 1K0LA 4LA1A 1GNDA 1LPFA 2O9ZA 4U8JA 3LADA 2GH5A 3UKLA 4J31A 2JKCA 1CJCA 1D7LA 4B63A 4C77A 2GEWA 1GXFA 4UP3A 1NHPA 2VRMA 3DH9A 3G5SA 4YSXA 4CY6A 1PBCA 4UDPA 3M12A 4EMJA 1D5TA 1JU2A 3KLJA 4NTDA 5EB5A 2OA1A 2BK3A 1ZP0A 2YM1A 2E5VA 1K0JA 1QO8A 1H6VA 2A87A 2C66A 2XFUA 2XLTA 3ISHA 4Z44A 1E1MA 2E1MA 4C3XA 2CULA 1CL0A 2BS3A 1PXCA 2V61A 5BUKA 1DJQA 3L8KA 2WP6A 3B6DA 4B68A 1ZKQA 3UOYA 4K7ZA 3ZYXA 4DNAA 3BI4A 3GWDA 5FS6A 1EL8A 1GOSA 2JBVA 2GR1A 4H4PA 3ZDNA 1XDIA 2WEUA 1N4UA 3CIRA 4DGKA 1DODA 1H83A 3UKPA 1Q1RA 4WX1A 4H2RA 5KXJA 1YQ3A 1GREA 2VVLG 2XDOA 2YVFA 1X31B 1NEKA 4J2WA 2VVLA 3G5QA 3P4QA 4CCRA 1KSUA 4TM4A 2GF3A 1F8RA 4OPCA 4UDQA 4H4VA 3WE0A 2PYXA 3OZ2A 5IQ4A 1L9DA 3GRSA 1UKVG 4YSYA 1D7YA 3NKSA 5L46A 4YT0A 4JNAA 2C64A 2BCPA 3CGBA 2JK6A 2XCGA 1FEAA 1NHQA 1ZX9A 2YAUA 3GYIA 3JSKA 4USQA 1F3PA 1PJ6A 1V59A 3AE4A 3F8RA 2XLRA 2BK4A 3UP5A 3KA7A 1MXTA 1PXAA 1YQZA 3PS9A 3URHA 1F8SA 1DOBA 2YR5A 3EAOA 1PBEA 4U8IA 4Z43A 3AEBA 2YVJA 2ZZ0A 3M0OA 3GD4A 2BC1A 2E4GA 2WHDA 3C4NA 4AOXA 2X8CA 1GERA 1VDCA 3AE1A 2V5ZA 1RSGA 2Y6RA 3AE3A 3NGCX 4K5SA 1GALA 1BGJA 1MO9A 2Q0LA 4GDPA 4U8PA 5C3JA 3NK0X 3NK1X 4TLZA 3EPTA 1BGNA 1L9EA 2C76A 2YLRA 3O0HA 4J57A 5U63A 3AYIA 5JCMA 4U2SA 5KVHA 1JOAA 1GESA 4I59A 2R0CA 2GQWA 4B66A 2ACZA 3UKAA 5HYMA 2FJEA 4C74A 3AWIA 3GSIA 2XVHA 3LB8A 4H4YA 1GRAA 1S3EA 1TRBA 1XHCA 1ZOVA 2Z5YA 3D8XA 4BURA 1NHRA 2I0ZA 3CGCA 2WDQA 3VR8A 4EQXA 5J7XA 2FJDA 3KU9A 4B65A 1GT8A 1S2QA 5KOXA 2B9YA 3DJGX 2B9WA 4HA6A 2XFQA 2YLWA 4GF7A 3NH3X 3NYCA 3SGLA 5JCNA 5BULA 3DK4A 4Y4LA 4B1BA 3NYFA 4K22A 1EL7A 2V3BA 2XLUA 1FL2A 3P4SA 3QFAA 1CJ4A 3C96A 3V3OA 4J34A 4XXGA 2IVEA 4K2XA 2BYBA 3ATQA 3CPIG 2Q0KA 3S61A 4A9WA 4XWRA 4EM3A 2YG6A 3EF6A 1ONFA 1LTXR 3BNUA 1GTEA 3PVCA 4OCGA 3CNJA 2B9XA 4OPUA 2X99A 4CNKA 1NDAA 1YY5A 2XVEA 3AD7B 3UKKA 4ADWA 2R4JA 4CBQA 1REOA 3DMEA 4Z2RA 4BK3A 1OJDA 1S2YA 1TYTA 2CFYA 5FS8A 4EQSA 4K8DA 1LV0A 3E1TA 4YSHA 1IUXA 1M6IA 2JB2A 2WQYA 4EIQA 2WP9A 3CNTA 4EM4A 1BZLA 1GRGA 4YWOA 2ZBWA 4IVOB 1F8WA 3NIXA 4ZCDA 4H2QA 3UTFA 2RGOA 3ABVA 3AEGA 3UKQA 4AT2A 1YKJA 1ZDLA 3S5WA 2VVMA 3P4RA 4H7UA 3K30A 1KNPA 1Y0PA 2V60A 2QAEA 5FS9A 3SFEA 5CQFA 4XWZA 1DNCA 2BS4A 3ITJA 3RP6A 4A99A 2TMDA 4YTMA 3GRTA 3LZXA 5GSNA 3RNMA 2OAMA 4X9MA 4CNJA 2WOIA 1N4WA 3AE9A 3AD9B 3KPFA 4GDEA 1BF3A 5KRQA 4X4JA 4U8NA 2ZZCA 4IA6A 4BJZA 1Q9IA 2YLSA 3BI2A 1N4VA 4LIIA 1GPEA 3IC9A 4PAAA 2WOWA 2Q7VA 4RSLA 2EQ7A 2B7RA 2GRTA 4BK2A 3IHMA 4EQWA 2QCUA 1B8SA 1NPXA 3PO7A 2WU2A 4YTPA 1PBFA 1PBBA 2GMHA 2YG4A 1F6MA 1Y56B 2C65A 4ZN0A 3AYJA 1CJ2A 2WP5A 1LJ1A 3QVRA 2AAQA 4Z2TA 2RGJA 4OPDA 2OALA 2F5ZA 2VQBA 2VZ2A 3UOXA 1E1LA 1H81A 3DGZA 2OLOA 5EB4A 1CBOA 1O95A 2BA9A 5EOWA 4Z24A 2C70A 2WDRA 2QA1A 3H8IA 3NNEA 2TPRA 1EL9A 5JCKA 4A6NB 3IWAA 4IVMB 4B67A 4NZHA 5LV9A 2VRLA 2WDVA 2BK5A 1NG4A 4LU6A 1ELIA 3RP7A 2ZZBA 3I3LA 1OJTA 4D04A 3GWFA 4RG4A 4UDRA 3UOVA 1PXBA 2J3NA 1EL5A 1GRHA 2GMJA 3DJDA 4EQRA 4ECHA 3VRAA 1ZMCA 5HY5A 1Y56A 2GAHB 1JRYA 3BHFA 4A5LA 3GD3A 3UP4A 1M64A 2C7GA 4APNA 2XVJA 1IJHA 1TDKA 2GR0A 2BCGG 4U2LA 3UKFA 4CY8A 1PN0A 2XVFA 1W4XA 3AD8B 5FS7A 3UCLA 1ZMDA 2WETA 5M10A 3CNDA 3RHAA 4NEWA 3KD9A 4JNQA 2R0GA 2RABA 3LOVA 3AEEA 3AYLA 1GRBA 3P9UA 4TM0A 5KVIA 3Q6JA 4A6NA 3NK2X 4EMWA 3AB1A 4JY2A 1ZK7A 3UTHA 2WBAA 3AE5A 2WPEA 3NLCA 3ALMA 3NRNA 3H8LA 1LVLA 4H4TA 4A79A 1TDOA 4CCQA 2C73A 2WOVA 4U8LA 3DA1A 1ZY8A 2YG3A 3F8DA 3KKJA 2WESA 4O5UA 1GRTA 1PJ7A 3AE6A 4YKFA 3VRDB 5JCLA 4GCMA 1K4QA 2WU5A 1Q1WA 3DJJA 3L1RA 3AXBA 1CHUA 1CC2A 4REKA 3K7MX 4J36A 1O94A 4FK1A 2XLSA 2YG5A 3ICRA 3CPHG 2H89A 1OJCA 2R4EA 3P4PA 4NTCA 3CPJG 4OPLA 1PS9A 1GETA 3UTEA 3NG7X 2GR3A 4EIPA 1B4VA 2C72A 2R9ZA 4NTEA 2GB0A 4TLXA 3FIMB 2YLZA 4E0VA 3P1WA 3G5RA 4P9SA 4N9XA 5IPYA 1KFYA 2RGHA 3QSMA 3FPZA 4AOSA 1IUUA 1H82A 1OJ9A 4OVIA 2EQ9A 4TM3A 4EMIA 1DOCA 2A8XA 4H50A 2EQ6A 1FEBA 2XYOA 3VRBA 4IV9A 1D4DA 3CN8A 5J60A 2Z5XA 2YLXA 1VG0A 1KNRA 1PDHA 2X3NA 3GDPA 4USRA 4TM1A 3ADAB 4C3YA 2X8HA 3NHOX 3FG2P 4GUVA 2VOUA 1HYUA 2IIDA 1CJ3A 3CGEA 4U2TA 3V76A 3RP8A 3QVPA 3ICTA 3CNPA 2YQUA 4O5QA 1IUSA 3BHKA 2QA2A 2JAEA 1JNZA 3AEDA 5EBKA 3SM8A 4BV6A 2UZZA 1H84A 4A65A 4JQ9A 4YSZA 4AP3A 5U25A 2C75A 3ATRA 1QLBA 4J56A 4JY3A 4H4SA 3IF9A 5U1OA 1MOKA 2BABA 4BK1A 1JEHA 2FBWA 3I6DA 2Y6QA 2HQMA 2ARDA 2NPXA 2BACA 1VQWA 1BWCA 3AE8A 1EBDA 1VRQB 1XANA 4PABA 1D4CA 2X50A 3FMWA 2R46A 1L0VA 4JDRA 2DKHA 1IUVA 4A7AA 1P2EA 4M52A 3GMBA 5M0ZA 2YWLA 3VR9A 4I58A 2GAGB 4ICYA 2XLPA 1SEZA 1PBDA 4HB9A 3F8PA 4Z2UA 4H4WA 3GYJA 1E6EA 2YG7A 1TDNA 5DBJA 3Q9TA 2GV8A 2XFOA 1AOGA 1GSNA 3NTDA 1RP0A 3KVEA 1VG9A 3LJPA 4U8KA 3REDA 3K7QX 3EANA 4Y4NA 3QSSA 1K0IA 3GDNA 4GRTA 2YR6A 3FBSA 3NT6A 4FK1C 2WPCA 1NAAA 4H4ZA 3LZWA 1GRFA 2YR4A 4RG3A 2XFNA 4B69A 5KOWA 2FJAA 2V6OA 2WS3A 4D03A 4DSHA 2CVJA 4Z25A 4YTNA 2JB3A 1YQ4A 4ZCCA 1B37A 4H2NA 5C2TA 1S3BA 4YKGA 4OPTA 2DKIA 3LXDA 4JN9A 5TR3A 5BRTA 1DOEA 1DJNA 2WPFA 3COXA 3V3NA 2BXRA 2C3CA 3R9UA 1KDGA 3D1CA 4YXDA 4J33A 2APGA 2B76A 3IHGA 3GMCA 3CNSA 4OPGA 1CC6A 4Z26A 3ICSA 1IUTA 1CC4A 3AEAA 1ZOYA 1COYA 4B64A 1CF3A 4H4RA 4X9NA 2C67A 2V3AA 4DSGA 2C3DA 1E7PA 4H4XA 4H4QA 4WCTA 3C4AA 3DK9A 4AT0A 2BXSA 1TDFA 3NN6X 4K5RA 3UOZA 3QJ4A 2GVCA 2BC0A 2B7SA 4CRTA 3DK8A 3CGDA 2YM2A 3AE7A 5CKUA 3T37A 4GR1A 3DJEA 1GTHA 1FOHA 3K7TA 1KSSA 1E39A 5ER0A 5GRTA 4H2PA 3CTYA 1KF6A 1JNRA 4H4UA 3BI5A 4Y4MA 1GEUA 1LQUA 2XVIA 1NG3A 2AR8A 4U8OA 1QJDA 1JRZA 1LQTA 1NHSA 3AE2A 2R45A 3UTGA 1GV4A 1Z6LA 2FJBA 2Q6UA 1PHHA 3QFBA 4NEVA 2XFPA 1P2HA 2CDUA 5HHFA 1E1KA 3NTAA 3BNMA 4C5OA 3AECA 2W0HA 2YVGA 5IQ1A 4U8MA 3HZLA 2AQJA 3ALLA 1TDEA 2GQFA 4BJYA 5BVAA 1RYIA 1O5WA 1FCDA 2JB1A 1H7XA 5FMHA 1NENA 5KWFA 3B3RA 2GR2A 3NYEA 3VQRA 3H4KA 2H88A 3OC4A 2EQ8A 3AEFA 1H86A 1H7WA 4OPIA 1D4EA 2YLTA 3QSEA 4KPRA 2OLNA 3ALJA 1FECA 4KX6A 1L9CA 1XPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GURA 1JRXA 2H6YA 2PHHA 1DXLA 3T2YA 4QFCA 2BS2A 4PQHA 2R0PA 2C3QA 4LMVA 2IVDA 2MMOA 2E48A 1BKWA 1EV9A 3IE3A 1TYPA 3CBUA 4ZL9A 4AP1A 2B5XA 4TXOA 1GWCA 4NMUA 3MAKA 1TXXA 3UKLA 4PNGA 1CJCA 3C1SA 1E2YA 4YSXA 4UDPA 4MABA 3ZLPA 5KNLA 1FVKA 4N0VA 3GL3A 2C66A 1E1MA 1XWCA 1EZKA 2VL2A 1CL0A 1VF2A 1K0AA 3RHCA 4I97A 2VLVA 4ULXA 1DJQA 4OD7A 4B68A 1WE0A 4K7ZA 2RM5A 1KBNA 3BI4A 2G2QA 5FS6A 1EL8A 1GOSA 4H4PA 3L78A 2B6MA 3TJKA 3DGQA 4H86A 1VF4A 5GAPD 4GSSA 1R5PA 3UKPA 3LXTA 2E2GA 4AJ7A 1PKZA 4H2RA 5KXJA 1YQ3A 5DJMA 2OA7A 1NEKA 4IW9A 2VVLA 2XBQA 1Q98A 3NIVA 3P4QA 4EXJA 1KSUA 4AJ6A 2VL9A 4OWYA 3FK8A 4H4VA 3APSA 2PYXA 5IQ4A 1UKVG 16GSA 4WEYA 1I5GA 3NKSA 1BEDA 3JSKA 3GYIA 1ZX9A 2YAUA 2DU8A 1PJ6A 1GLPA 2BK4A 1QFNA 3I9V2 1MXTA 1YQZA 3VFIA 1MD3A 3TKQA 1ERVA 1R4WA 1WWJA 2WRTA 4EE0A 2KP1A 2E4GA 2WHDA 3F4TA 3TRPA 4AOXA 1OC9A 1RSGA 5JCWA 1BGJA 1MO9A 2H19A 3L4NA 4MCUA 1BGNA 1L9EA 3M3MA 3ZVJD 3O0HA 4U2SA 4YJFA 2HZEB 4HDEA 2KLXA 3TKSC 4XIHA 1XBSA 2B1LA 4F9ZA 3AWIA 2YOIA 3GSIA 1FG4A 1K0MA 1XHCA 4FYBA 1JHBA 1NHRA 1OE7A 5JWOB 3D8XA 4BURA 3QOUA 3MWHA 3KU9A 1M3JA 3TJBA 3GX8A 1S2QA 5KOXA 1V2AA 2B9WA 1UN2A 1GP1A 2XFQA 3LQ7A 4GF7A 3SGLA 4XCSA 5JCNA 5BULA 4K22A 3V3OA 3C96A 4LMWA 4DSSB 1LBKA 3TRXA 4A9WA 3IPZA 4EM3A 1LTXR 2VL3A 4HU9A 2X99A 2F8AA 2YN1A 2XVEA 2JZSA 3KTLA 2P5QA 4CBQA 1REOA 4YJHB 3DMEA 3DMLA 4G0KA 2IMEA 4IP6A 1GNEA 2CFYA 1IUXA 2DLXA 2GQKA 1TU8A 4K2DA 2LNTA 4ZL7A 4E8HA 1M0UA 3QAGA 2LJKA 1F8WA 2C3TA 3LXZA 4H2QA 2RGOA 1M3IA 2L6DA 3P4RA 3ZMLA 3O3TA 4I8BA 2VIMA 1IYHA 5E4WA 3Q6OA 2QAEA 17GSA 4ZB8A 5H5QA 4EVMA 5FS9A 2LJRA 2OACA 3SFEA 4XHMA 4ZILA 1M99A 4YTMA 5GSNA 1GH2A 1N8JA 2OAMA 4X9MA 4YAVA 2FWEA 2WOIA 4NHWA 6GSVA 3AD9B 1XZOA 3CQFA 4U8NA 1TRSA 3GV1A 2OE3A 4BJZA 3GRXA 2IJYA 5E59A 5D9TA 1GPEA 3IC9A 2L57A 3UL3A 4KAEA 3HZ4A 2MYGA 2C0FA 1Z9HA 4HZ2A 1NPXA 3QFBC 1V40A 2PVOC 3EC3A 2Z9SA 5ECOB 3AYJA 2B5EA 1IYIA 4OPDA 3TUEA 2F5ZA 4ID0A 5IOXA 2VQBA 2VZ2A 2E2MA 2D2ZA 2WGRA 5EB4A 3T31A 5DQSA 2LS5A 4FQUA 4A6NB 3IWAA 1VE9A 4POLA 1TP9A 5LV9A 1M2AA 2VRLA 2BK5A 4HZ4A 1XCCA 3KP9A 5D93A 4BVYB 4FYUA 3I3LA 2PWJA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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