2R0PA

K252c-soaked rebc
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
529
structure length
512
Chain Sequence
MNAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVEQTDGTITHPRVGTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPQHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALFFFLMLLRFPLRALDGRGLYRLTVGVDTMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords RebC
publication title Crystallographic trapping in the rebeccamycin biosynthetic enzyme RebC
pubmed doi rcsb
source organism Lechevalieria aerocolonigenes
total genus 161
structure length 512
sequence length 529
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 2r0pA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2r0pA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2r0pA01
3FBSA 2XVJA 1L9DA 4NTCA 1PJ6A 2WBAA 1PJ7A 3LZWA 3NLCA 3GMCA 2XFUA 2YWLA 2EQ8A 3LOVA 2GV8A 1NHRA 3NNEA 3P4QA 2C7GA 1B8SA 3CN8A 1PXAA 1GRBA 2GQWA 2YLSA 3DH9A 4YTNA 4GF7A 1LJ1A 3GYJA 4DNAA 1H84A 4C74A 1TYPA 3CTYA 4LU6A 3GD3A 3G5RA 3K30A 4ZN0A 5BRTA 4KPRA 4K2XA 4K5RA 2YLTA 2GH5A 4GUVA 1DJQA 4AP3A 1JRXA 2XFPA 4U2TA 5EB5A 1DOBA 2GEWA 1PXCA 4RSLA 1F3PA 3CGDA 2YG3A 3EANA 1B4VA 3M12A 5TR3A 1OJ9A 5BVAA 4TM1A 1CJCA 1H81A 2C65A 2YLWA 3CNTA 1GTEA 1GRAA 3CNDA 3AE8A 3BI4A 2X99A 1FEBA 4P9SA 4JNAA 1K4QA 2GB0A 4DGKA 1YQ3A 2R9ZA 3QJ4A 2XVFA 2VRMA 4TLXA 1CC2A 4OPCA 2R4EA 3HZLA 3ICRA 1FL2A 1EL9A 4LIIA 2RABA 1IUUA 3NYFA 5M10A 1NENA 2XLRA 3K7MX 4HA6A 2A87A 2QA1A 3LZXA 3BHKA 3GSIA 3AE2A 3GYIA 5FS7A 4PABA 4TM3A 1PBBA 2W0HA 3OC4A 1XPQA 3IHMA 3QSSA 4U8IA 4H4SA 1Z6LA 1DOCA 2EQ6A 4GDEA 2BABA 3I6DA 1N4UA 3UP5A 2Q6UA 1ZX9A 2WU2A 4YSHA 1K0LA 2V5ZA 3NK0X 2CDUA 2VOUA 2WPCA 1E7PA 2XFNA 3UTFA 3GMBA 4U8KA 1E39A 4Z25A 2WHDA 2YR5A 2TMDA 4GRTA 4OPLA 1CJ4A 3KPFA 1Q9IA 2C3CA 2YM2A 3JSKA 1D7LA 3AEAA 3NT6A 2JK6A 4U8NA 1PJ5A 2WP6A 4K5SA 1GRTA 3AE9A 2IVEA 5CKUA 1GOSA 5U1OA 1CF3A 3M0OA 4B68A 1H7WA 3CPJG 2QCUA 1LQTA 2R4JA 2YLZA 2F5ZA 1NPXA 1FOHA 3CNPA 2VZ2A 1LPFA 3PVCA 3SGLA 2J3NA 4YTPA 3ABVA 3AE1A 3CGBA 5DBJA 4Z2UA 5GSNA 1NHPA 5HHFA 2GAHB 4FK1A 1PBCA 4FX9A 2XYOA 2YG7A 4YSXA 1TDOA 3F8RA 1D5TA 2B9YA 2XLTA 2WEUA 1VDCA 2FJBA 2C70A 2JB2A 3C96A 3ALLA 3AWIA 3UOVA 2C67A 2GVCA 3VRAA 3AECA 2GAGB 4N9XA 1H83A 3ALMA 5IQ1A 1B37A 1SEZA 2V6OA 2BCPA 2R0GA 2YG4A 2HQMA 4UDPA 1KF6A 3KA7A 2VVLA 1NG4A 2WPEA 1E1NA 1JU2A 1LQUA 2IIDA 2YG5A 4O5UA 5EB4A 1YKJA 3BI2A 4CRTA 4C3YA 2OAMA 4AT0A 2XVHA 2R0PA 1F8SA 2B76A 4BV6A 2GMJA 1NDAA 1GALA 4FK1C 5KOWA 3GRSA 4YXDA 3P4RA 1P2HA 1GRHA 2JAEA 4EIQA 5KXJA 3UTEA 1D7YA 2BYBA 3CPHG 2OLOA 3D1CA 3OZ2A 3NKSA 2AAQA 4NEWA 3DGHA 2FBWA 1DOEA 1KNPA 2R46A 1QO8A 4J36A 1H82A 1TDKA 1D4DA 2A8XA 2XLUA 3UTGA 2YAUA 1S2QA 4A65A 4A6NB 1YY5A 4DSGA 1GERA 5FS8A 1IUWA 1JNZA 3NK2X 2IVDA 1V59A 3NH3X 1AOGA 2C76A 2E1MA 3ADAB 4H4UA 4D04A 1EBDA 2YR6A 1PN0A 2GF3A 4OVIA 2VQ7A 1M64A 4JQ9A 4GR1A 2RGHA 3CIRA 4EMIA 2BS2A 2XDOA 3L1RA 5KVIA 1OJDA 4REKA 1VG0A 3BI5A 2WDRA 1PS9A 1ZY8A 1DNCA 5CQFA 4EQSA 4H7UA 4OPIA 1L0VA 1PBFA 3ICSA 3BHFA 2ZZBA 1N1PA 5IPYA 2C64A 4J34A 2WETA 2WP9A 2WP5A 2X8CA 4B65A 4DSHA 4H4YA 2ZZCA 1E1MA 3AB1A 3DJGX 4J31A 4U8MA 5C3JA 2C72A 2YM1A 3R9UA 1GREA 1IUTA 1PHHA 4H50A 2OA1A 1YQZA 4H4TA 1VQWA 3B3RA 2UZZA 4B63A 1FEAA 3S5WA 2APGA 5J7XA 2BCGG 4Z26A 4JY3A 2PHHA 2B9XA 3ISHA 3QSMA 4C77A 1O95A 4J56A 4YKFA 1Q1WA 1JRYA 2WESA 2BK4A 4U2LA 1DODA 4H4XA 1CHUA 1Q1RA 1CJ2A 2GQFA 3M13A 1P2EA 5JCIA 4D03A 4U2SA 3VR9A 3ALJA 3DK4A 3NIXA 4C3XA 4NTEA 1H86A 1ZP0A 3UKPA 3UKHA 1K0IA 1PBDA 2JB3A 4EIPA 4WX1A 5FS6A 4BURA 3AE5A 2ARDA 4J57A 4NEVA 2C66A 4BJYA 4OPTA 2JBVA 1CBOA 4JDRA 4H2NA 2Z5XA 3E1TA 4X4JA 5GRTA 4BK2A 2BC0A 2GR2A 3Q9TA 2YVJA 1GV4A 2WDVA 4X9NA 2X3NA 2X50A 5C2TA 1LTXR 2OALA 3DGZA 4APNA 2RGOA 4JY2A 4U8OA 4UDQA 3IWAA 4B67A 4OPUA 1EL7A 2BA9A 2YQUA 3CNSA 3H4KA 4ZCDA 4B1BA 4USQA 4CY8A 1FECA 3LJPA 5JCLA 2X8GA 2GRTA 1GXFA 3PS9A 3UP4A 3PO7A 1ZMCA 3QVRA 1F6MA 4A79A 4H2RA 2B7SA 1CJ3A 4H4WA 2BK5A 5JCMA 3P4PA 4XWZA 3IC9A 2C75A 3F8PA 4H4PA 5HYMA 3BNUA 2GR1A 3UKLA 1JEHA 3AEGA 5LV9A 2VRLA 3UKQA 1TYTA 2E5VA 4YKGA 1E6EA 5ER0A 3ICTA 5KOXA 2WOVA 3K7TA 3NK1X 3AEFA 5KRQA 4NZHA 1LV0A 1VG9A 2XLSA 3ATQA 3S61A 1MOKA 2H88A 4H4VA 4CNKA 1ONFA 1MXTA 3EF6A 3NHOX 4X9MA 4XXGA 3RHAA 3WE0A 4USRA 3C4NA 3AD7B 1IUVA 4LA1A 1IUXA 2WDQA 2YLXA 3LXDA 2JKCA 4H4QA 5U63A 4K22A 1M6IA 2E4GA 4TM0A 4UP3A 3KU9A 1KNRA 1L9EA 4Z2RA 2QA2A 3ATRA 4IA5A 1OJTA 2NVKX 1VRQB 2C73A 4A6NA 3VRDB 3NN6X 4CCQA 4YT0A 3GWFA 5HXIA 4AT2A 4Y4NA 1B5QA 2YLRA 4B69A 4EQRA 1ZKQA 2R0CA 2Y6RA 2DKHA 4Y4MA 3UOZA 2VQBA 3RP7A 3B6DA 3AYJA 3H8IA 4U8JA 4ADWA 1FCDA 4K8DA 3AD9B 1GETA 2B9WA 4OCGA 1D4CA 1EL5A 1ZOVA 2BS4A 3UKFA 1XANA 4TLZA 4AOXA 3FG2P 5L46A 1GRFA 1BWCA 3QFAA 1K0JA 3URHA 5IQ4A 5JCNA 4J2WA 3KKJA 2ZZ0A 5M0ZA 1MO9A 3G5QA 2WQYA 3SQPA 4B66A 1Y56B 1ZDLA 4EM3A 4H2PA 1BF3A 2JB1A 3II4A 5KWFA 2BXRA 1E1KA 1PXBA 4MJWA 4U8LA 2EQ7A 4IV9A 1JOAA 3Q6JA 2V60A 2WU5A 3UOYA 1OJAA 1NAAA 1N4VA 1ELIA 4O5QA 2B7RA 1BZLA 1X31B 3GDPA 1TDFA 3AE7A 2AR8A 1EL8A 3O0HA 1H7XA 2Q7VA 3P9UA 4HB9A 1ZOYA 2XVEA 3AE4A 2O9ZA 3FPZA 3K7QX 4TM4A 1GESA 4XWRA 4BK3A 4EM4A 1O5WA 4IA6A 3C4AA 2VVLG 1KDGA 2BACA 1CL0A 1PBEA 4PAAA 2XVIA 4Z43A 3AEDA 3V3OA 3NRNA 2XLPA 3DJDA 1F8WA 2GMHA 3AYLA 3KLJA 4JN9A 4EMJA 3CPIG 3GD4A 4A9WA 5BUKA 3QFBA 1HYUA 4BK1A 3REDA 1IUSA 2BS3A 2X8HA 2XFOA 3DJJA 2Q0LA 4I58A 3SFEA 4KX6A 2EQ9A 3DMEA 1BGJA 1GTHA 4JNQA 4CBQA 1Y0PA 2QAEA 2XCGA 2TPRA 4Z44A 4CNJA 3V76A 1GSNA 5EOWA 3RP8A 3COXA 4J33A 4UDRA 3T37A 2BC1A 3F8DA 3DJEA 1IJHA 2ACZA 1KSUA 1XHCA 1JRZA 1CC4A 5BULA 4M52A 1QJDA 2V3AA 1CC6A 1GT8A 4K7ZA 4YTMA 1D4EA 3GDNA 3L8KA 3VR8A 2WOIA 1PDHA 1TDNA 4WCTA 1GPEA 4CCRA 2FJAA 3QSEA 4A5LA 3H8LA 4AOSA 3EPTA 3QVPA 4B64A 4A7AA 2YR4A 3RP6A 1ZK7A 4C5OA 3SM8A 2NPXA 2GR3A 1NEKA 1L9CA 3NTAA 4U8PA 2AQJA 3GWDA 2DKIA 3NTDA 5EBKA 4Y4LA 3AEEA 4GDPA 4RG4A 3ZDNA 1KSSA 3SFDA 1S3EA 4AP1A 1H6VA 1NG3A 2FJEA 4IVOB 4A99A 1NHSA 1UKVG 4Z24A 2FJDA 3LB8A 2A89A 4EMWA 3AYIA 2WPFA 3DK8A 3NYEA 3RNMA 4Z2TA 1XDIA 4YSYA 3I3LA 1COYA 2RGJA 1QLBA 4E0VA 4OPGA 2CULA 3NG7X 3NGCX 3AD8B 1E1LA 4NTDA 2XFQA 3VQRA 2R45A 4GCMA 1YQ4A 5U25A 3UCLA 1KFYA 3FIMB 2VVMA 3VRBA 3ITJA 3LADA 3CGEA 4ECHA 2YVFA 3KVEA 2H89A 4H4ZA 3V3NA 2WS3A 5JCKA 3AE3A 1NHQA 1RP0A 2C3DA 2Q0KA 1BKWA 4BJZA 4YSZA 5HY5A 3D8XA 1TDEA 1TRBA 3UOXA 4CY6A 3NYCA 2Z5YA 3CNJA 3DK9A 1JNRA 4RG3A 4YWOA 5J60A 1OJCA 1GEUA 2OLNA 3IF9A 2CVJA 3G5SA 2Y6QA 2V61A 3P1WA 1Y56A 2GR0A 4H4RA 4FDCB 1GNDA 3DA1A 2WOWA 3AEBA 3P4SA 3UTHA 2V3BA 3EAOA 3IHGA 1S3BA 4EQXA 4ICYA 4OPDA 1BGNA 2BK3A 1N4WA 3AXBA 3CGCA 2CFYA 3FMWA 1RSGA 1ZMDA 1GRGA 4IVMB 3ZYXA 1F8RA 2BXSA 1W4XA 5FMHA 1O94A 3BNMA 2PYXA 5FS9A 2I0ZA 2YG6A 5KVHA 1REOA 3GRTA 1LVLA 3KD9A 2ZBWA 3UKAA 3AE6A 1S2YA 4EQWA 4ZCCA 2YVGA 1RYIA 4H2QA 3NN0X 4I59A 1DJNA 1DXLA 3UKKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K7NA 1ZYQB 1PJ6A 2OADA 3C73A 3NLCA 1GSYA 2MBSA 1DE2A 3IK7A 1FW1A 3BCIA 3CSJA 4J56E 1Q4JA 4GF7A 2MYGA 3KGKA 1LJ1A 4WBJA 1Z7RA 1TYPA 4KCAA 3K30A 3A5IA 4KPRA 4K5RA 1QFNA 4WKWA 1PX6A 2HT9A 2XFPA 3G9BA 3T2ZA 4K0NA 1PXCA 2B6MA 5TR3A 1OJ9A 1SJZA 5FT3A 4DSQA 2YLWA 3TKQA 4JR4A 5KNLA 1JZDA 3BI4A 2R2JA 2O87A 2K9FA 3LWAA 4JNAA 3NOFA 1K4QA 2GB0A 1RQMA 1XG8A 3GX0A 4OO4A 1YQ3A 2R9ZA 1PFOA 4TLXA 1CC2A 4OPCA 2R4EA 3ICRA 1FL2A 4LIIA 2RABA 2FNOA 5CRDA 2XLRA 2HSHA 2CT6A 1SK0A 3K7MX 2A87A 3LZXA 3BHKA 4WBRD 3AE2A 3MYDA 4POBA 2W0HA 4HU7A 4ZB8A 1ABAA 3T0KA 3UP5A 2Q6UA 1ZX9A 4YSHA 2ES7A 2H0HA 2H1DA 2V5ZA 5AGYA 4O92A 2WPCA 1X0RA 1PKZA 2NDOA 4JU5A 4KDYA 3V1WA 1YDKA 4NNJA 1FVJA 4GRTA 13GSA 3FZ4A 3KPFA 2PVOC 3F9UA 1U3AA 2LV3A 3NT6A 3KM6A 3AEAA 2R3XA 3AE9A 2JSZA 2IVEA 1GOSA 2XC2A 1B48A 2DC5A 3M0OA 1X5CA 5IMFA 2MBTA 2VL2C 1LQTA 3ZRDA 2R4JA 1NPXA 1WOUA 4CW9A 1LPFA 2H66A 1PD21 2OE3A 1SL1B 1BQ7A 3ZMKA 2J9HA 1NHPA 5F06A 3H1NA 1T00A 2DIYA 1ZYEA 2B1LA 4L0UA 3TCOA 2H1AA 2M72A 3F8RA 2GSQA 4TXOA 2WEUA 6GSYA 5ECKB 2GGTA 2JB2A 3RHCA 2WRTA 2IMKA 3IXRA 3U6VA 1Y25A 3UOVA 3TGZA 1O7UA 3AECA 4K1FA 1H83A 1QUWA 5IQ1A 1LU4A 1SEZA 4TR4A 3QDNA 2CX3A 3J7Yb 2ZUPA 2VVLA 1NG4A 5DAKB 2IIDA 1YKJA 3BI2A 4KDXA 4KE3A 3UBKA 4EDYA 1GALA 4FK1C 1M9BA 3Q6OA 4G0IA 5KN0A 3IAS2 2LKUA 3D1CA 2OLOA 2BJXA 3M9KA 3F4RA 4DVCA 2R46A 1QO8A 5IMAA 1THOA 2A8XA 4TKYA 1YY5A 2UZ8A 4GQCA 1K0OA 1MEKA 2YR6A 1PN0A 4TR1A 4NMUA 4JQ9A 5D9TA 4DEJA 5ABRA 3TKPA 4QFDA 2VCZA 3VWXA 4EMIA 2XDOA 3P8WA 3FEUA 1VG0A 1SD9A 2D2ZA 1M7TA 4II2A 4EQSA 1E6BA 1M3JA 4GAVA 2XPDA 2H19A 1G6YA 4EKZA 2GQLA 2PBJA 3AB1A 4J31A 4NXIA 1GREA 3SXIA 1IUTA 1OE8A 1PHHA 4H50A 2CAIA 1GSQA 1K0NA 1EEJA 2L6CA 1AUCA 4IS0A 2UZZA 2G2QA 3VWUA 5J7XA 1C0KA 2BCGG 4Z26A 1Q1WA 3DYRA 3VURA 1CHUA 3M13A 1P2EA 3C7MA 2LEGA 5EVOA 1JFUA 2PU9C 2X49A 4D03A 3Q74A 3DK4A 1ZP0A 1K0IA 1J08A 4IQAA 2JB3A 5ELAA 4MJAA 4BJYA 2JBVA 2GT6A 5INYA 3BBYA 2FD3A 3EMXA 1Z9HA 5D9WA 4X9NA 2WDVA 1MDIA 3GV1A 4KUNA 3VPTA 2WB9A 2RGOA 1A2LA 4U8OA 5HR2A 1EL7A 5IMCA 5D73A 1GH2A 2P5QA 1VF3A 4FYBA 3FZAA 3GSTA 4GAPA 3UP4A 3PS9A 1MTCA 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