2R3LA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 with inhibitor
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
298
structure length
275
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLATLWYRAPEILLGKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Structure-guided discovery of cyclin-dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 275
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r3lA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r3lA01
1OPKA 3QZGA 4E93A 3IECA 1KOBA 1WBPA 3JS2A 4QYEA 3QQFA 4D1ZA 3GEQA 3DBDA 3SOAA 3RPRA 3KF4A 4GK3A 3T9TA 2XCHA 2XBAA 4U41A 2QOKA 2Y7JA 2ZMDA 2OK1A 3QTSA 3RJCA 4O7YA 5CS6A 3DA6A 4EK6A 3P86A 5CU6A 4DFYA 1STCE 2X4ZA 2ZAZA 4FTUA 3F3TA 5CEQA 3D5UA 3FHRA 3V8TA 2C3IB 4FKJA 4FTIA 4ASZA 2ERZE 3ZH8A 3RAWA 1R78A 2HZNA 1QPCA 3NSZA 4HPTE 2YERA 4DHFA 2B9HA 3NCGA 3V04A 1IAHA 4F70A 3VBWA 4Y5HA 3O23A 3TUBA 3MTLA 3AC2A 4MTAA 4R3PA 4PUZA 2BAJA 4IBMA 4ZS0A 1T46A 3OT8A 4BR3A 5H8BA 5E8TA 4C8BA 2WU6A 3HMIA 3FXZA 2YJRA 3KCKA 5IUIA 5IH6A 4KSQA 3G2FA 3KQ7A 3PFQA 3TZ9A 5A4CA 3E88A 4YC8A 3AQVA 5CEIA 4RT7A 5IQHA 4QNYA 3MJ2A 5AP7A 5DA3A 4KABA 1FQ1B 5DEYA 5FD2A 5EI2A 3QYZA 3PY0A 4QO9A 4FTKA 3ORIA 2UW4A 4O0SA 4OTFA 4EH4A 5KMNA 3LMHA 4EJ7A 3F5UA 4P4CA 5ETFA 4DH7A 2NNWB 3DXPA 2GTNA 5HVYA 3Q6UA 4G1WA 4TNBA 2C6OA 4AZVA 4E73A 4FZAB 3HMMA 3OCSA 3W18A 2JDRA 4RJ6A 3H9RA 5DR9A 5H8EA 3HUCA 4X2GA 2YIWA 3VO3A 1UU8A 4DEDA 1UWHA 2CMWA 3MSSA 1WVWA 5FQDC 4YSJA 3EQPA 2BIKB 2CKEA 1OPJA 5DWRA 1YXXA 4JVGA 5CSHA 2C30A 1NW1A 2QOHA 4JRNA 2CHLA 5KO1A 1QMZA 1KUTA 2IZUA 2R4BA 5AAGA 4N70A 4C2WA 4FT9A 5TF9A 3TV4A 4MWHA 3UODA 3CY2A 2VN9A 3FYKX 3OY3A 5B0XA 1J7IA 2H6DA 2UZWE 4YO4A 4UYAA 3R1YA 3FXXA 2FVDA 2CJMA 2QCSA 3E63A 3NGAA 4FMQA 2BZHB 2QQ7A 5HTIA 5LVNA 2PU8A 1SVHA 2YCFA 3HVCA 4JDJA 3A60A 4DC2A 3MBLA 3H9OA 4RC4A 3TNPC 4DINA 2LGCA 5ICPA 2VX1A 2OF2A 2R3IA 3D0EA 4RLKA 5DLSA 3UP2A 1CKJA 4G6OA 2F7XE 1PKDA 4FF8A 2BZJA 5AFVA 4U79A 3R9HA 3L1SA 5EM7A 4XV1A 5M4IA 5E4HA 3QRKA 4RIXB 5EW8A 3WZEA 3P23A 3H10A 4CG8A 5BVKA 4KD1A 1PY5A 5BMSA 1Z9XA 3TDVA 4JQ7A 4F0GA 3G9NA 4I4EA 5KBRA 2CKQA 4DG2E 2ITWA 2FO0A 1QCFA 2OZOA 4L46A 3ZUUA 4B0GA 2YM8A 4RX7A 2CNQA 2EVAA 4BN1A 1IEPA 3FY0A 2GS2A 2PVKA 5ANJA 3MA3A 4YZNA 4C59A 3QCXA 3PJ3A 2R3RA 4O7RA 4FV2A 2C0TA 1K3AA 3Q9YA 3WE8A 4TXCA 3DLSA 4PL3A 4EYJA 3I5ZA 3NW5A 2R3LA 2XIXA 4KUJA 2XH5A 3ZO1A 3Q53A 3PXQA 5CVGA 5HIDA 4ZK5A 4FG7A 1G3NA 4E6CA 3KVXA 4Y46A 5C8KA 3DU8A 1OIRA 4M68A 3KRWA 4WSQA 2OJ9A 5EYKA 2EXMA 3B2TA 4F65A 2C3LA 3TUDA 4QNAA 2ZOQA 2WU7A 2XZSA 5GJDA 2H8HA 2GU8A 4K1BA 3DJ5A 3F2AA 1MQ4A 2RFDA 3VF9A 3VRYA 5A14A 4D4RA 4X2NA 3U55A 1OGUA 1BI8A 2XM9A 4KSPA 5EOBA 3KMMA 4IJPA 3TJCA 1PXIA 4P7EA 1F0QA 4IANA 4IWQA 4FVQA 1JOWB 3QZHA 5DPVA 2J4ZA 2R3FA 3DOGA 1OL2A 5LVOA 3CE3A 1JBPE 4KNBA 5JGAA 5AR5A 4YU2A 4JDIA 2X7GA 4PNIA 3UE4A 4EQUA 4DLIA 3P9JA 1MRYA 1ZOGA 3V5PA 5FTQA 3LAUA 4FBXA 3HAVA 1OBDA 2UW3A 4CCBA 2W5AA 2ETKA 3GT8A 3KK8A 3NAXA 5FEQA 3JXWA 5EI6A 4FZ6A 3C7QA 4TYIA 1G8SA 1YDTE 4K9YA 4A4OA 4CMUA 3Q2JA 3BELA 4U44A 1RE8A 2G15A 4M0ZA 4D4SA 4J8MA 2BMCA 3COIA 5AM6A 1MQBA 4NZWB 4DITA 2R3GA 1FPUA 4XUFA 4MD7E 3FLQA 3KRRA 3W2OA 5DVRA 2XJ1A 5E8SA 3HRFA 5GINE 3LJ2A 5IMEA 2YAKA 4EI4A 5B2MA 3E62A 4P2KA 3FKLA 1WZYA 4IB1A 1ZRZA 5J79A 4U42A 4G3FA 3K5UA 3QQUA 1PXPA 3V01A 5BYZA 5A6NA 5CXHA 3R1SA 4CZYB 3OP5A 3AC1A 2XNOA 2C6MA 2OZAA 4TY1A 5LCKA 4EOQA 3ELJA 2VO7A 3TV7A 3U6HA 2J50A 4FV6A 2C47A 2X8IA 4FIFA 3MH3A 4ZAUA 4IDTA 2C4GA 4BWKA 3VUHA 5E9EA 4GYIA 5HORA 3ULZA 2I1MA 2QR7A 4IM0A 3C50A 4YJVA 3NW6A 5CVHA 2BDJA 5EM5A 3SGCA 1BI7A 4QOXA 4GJ3A 4YUQA 1NVRA 4FVPA 1XJDA 1ZYLA 3BLRA 4N57A 3KRLA 3BYMA 3OBJA 3TXOA 4ALWA 4NH1A 5EOLA 4CQEA 2VWUA 3FBVA 5CTPA 5H2UA 2PVNA 5FDPA 2HK5A 2XB7A 3TNWA 3QX2A 4ASXA 3D4QA 4O38A 4QMNA 4DAWA 4QQJA 3Q32A 3DT1A 5L6WL 2PZYA 3RHXA 5IA5A 2X4FA 5IQFA 4RPVA 4IB3A 3FMKA 4E6AA 3JY0A 4BZDA 1UA2A 2PUPA 5HG5A 5KE0A 1U59A 4C4GA 5A4EA 5CZHA 3GCSA 1NVQA 2X6DA 3K3JA 4JQ8A 4QTDA 4RIOA 4MBLA 4F6UA 1ZY5A 3R7UA 2BZIB 2R3KA 2RIOA 2IJMA 4M69B 2A0CX 3DBEA 2C0IA 2G2FA 4AX8A 2YWVA 2VWWA 3HP2A 2NRYA 4S2ZA 2YDIA 4FKGA 2VTJA 2WIHA 4FV0A 2X1NA 3BHVA 2C5YA 4FTTA 4EWQA 4C4FA 5LWMA 2C5VA 3NCZA 4IZYA 4H58A 4O2ZA 4C3PA 5F20A 4EOOA 3QHWA 4W4XA 3PY1A 1U54A 3QTWA 4XG4A 3ZYAA 3FMNA 1HOWA 1VR2A 4FOCA 5HU3A 3GFEA 3W55A 4ZP5A 4DGMA 1FMKA 2YM4A 4HGEA 5EKNA 4MVFA 4WG3A 2R0UA 4QP3A 3HZTA 2XYUA 5CWZA 5DH3A 5ETAA 4BC6A 5EQYA 1VZOA 2PUIA 5IU2A 4BCIA 3GB2A 1QL6A 2BRHA 3LFDA 4ZLYA 4NSTA 2YJSA 2JDOA 3D5WA 3DKCA 3BE9A 4YJOA 4DFUA 3ENHA 1UKIA 4U97A 5EH0A 5CAUA 4XG2A 3PZEA 4S32A 3EQCA 3E8DA 1Q4LA 3PIYA 3LKMA 4FTMA 1OPLA 5DHJA 4AF3A 4O2PA 4PNKA 2PSQA 4F63A 3P79A 5CAPA 5GZ8A 2F2UA 5HVJA 3KXZA 1CM8A 5AUUA 4I0RA 4S30A 4W9WA 4AACA 3CQUA 4HZSA 5M53A 4M7IA 4EK3A 4MD8E 5GIOE 1GIJA 2W5HA 5HI2A 3LCDA 3MS9A 4MXOA 3QC9A 3HA8A 2QKRA 4MHAA 2HAKA 5GNKA 4R5YA 5CAVA 5GIPE 4YSMA 4RIXA 3FSKA 5L2WA 1BLXA 1W82A 1W83A 3ZLXA 4KAOA 5AX9A 5F9EA 3GOKA 5FLFA 2BRGA 3LVPA 4IH8A 4UMUA 3RVGA 4EBVA 5TKDA 3RALA 4E4MA 3V5QA 4NK9A 3HAMA 2B4SB 4JXFA 3PVBA 1OIQA 4IEBA 4Q5EA 1JKLA 1UVRA 2A27A 3C0GA 4TWCA 2QURA 4OTPA 3NNVA 1I44A 5CQWA 3PJ1A 3HV4A 1TKIA 4KIOA 3FXWA 3AC5A 3LE6A 3HV7A 2OWBA 4MH7A 5HCXA 4BDFA 4BZOA 1IAJA 5CXZA 4M0YA 3CR0A 3ODYX 5AAFA 1YWVA 3TIYA 4BDJA 4KS8A 3QBNA 3ORLA 3TKIA 4O27B 1Q8WA 1J7UA 3FI3A 4DGOA 3DS6A 3P4KA 2ZDUA 4JBVA 4FNWA 1R39A 2OGVA 3FLSA 3L8XA 3TCPA 5AV3A 4Y85A 2HXLA 5LXMA 3OXZA 1YI3A 3FL4A 2ZV9A 4ANNA 3R0TA 4BBEA 2PVYA 3O8TA 2GCDA 4QMTA 3GNIB 3SLSA 4EUUA 4R78A 5E91A 2HYYA 4FV3A 3R2BA 4XP0A 5ACKA 4PDOA 1OUYA 3DLZA 4YJRA 5EW3A 2WQBA 4EZ7A 2UVZA 4Y8DA 4CTBA 2HW6A 1DI9A 4KWPA 4AA5A 5C1QB 1WBNA 4D55A 2X6EA 3MJ1A 5IQBA 5F1ZA 2B9JA 4Q9ZA 5HVKA 2X39A 3D15A 3P1AA 4GIIA 4NTSA 3QU0A 4YC6A 5EDRA 4NFNA 3UO5A 4G31A 4FV8A 3R9NA 3F3ZA 1UNHA 4JS8A 2QNJA 4AU8A 4EKKA 3VBYA 3DAJA 4PTEA 3N4UA 2HY81 3MH0A 2Q83A 4O7LA 4GRBA 1AQ1A 4ZSGA 3G9LX 4ZLZA 4MXZA 2A19B 1OB3A 5DGZA 1H8FA 3H4JA 3IW4A 2O65A 4OT6A 2GQSA 1OZ1A 2BRBA 4F99A 4FNXA 3ZBXA 5BUEA 2WTIA 2BUJA 2XKCA 4W4WA 4NKAA 4BKYA 3R02A 4WG5A 5AUVA 3UZPA 5C26A 3GC9A 4MBIA 1Q8UA 3EZVA 5TOZA 3BGPA 1E1XA 4O81A 2YDJA 4WRGA 4MAOA 5FP6A 4A7CA 1H1SA 3NYXA 4EHGA 1YOJA 3RWPA 1XQZA 5J95A 4YR8A 4QMZA 4K11A 3A4OX 5JZNA 2OI4X 1GOLA 1GZKA 2F2CB 3KULA 4KKHA 3QRJA 4YPSA 3UVPA 2P2IA 1U5RA 4IVAA 4HYUA 3KVWA 4I6QA 1VYZA 4M12A 4OLIA 3QGWA 1ZYCA 4U0IA 4BBMA 2XEYA 4LV8A 3D7ZA 1XH9A 5D1JA 1SYKA 5ANOA 3NW7A 5HD7A 4BTFA 3ZDIA 5HBHA 5CY3A 5BPYA 1XH8A 3R21A 3AXWA 3R01A 3NUUA 4ANBA 1SM2A 1WBSA 3EN9A 4AOIA 1OIYA 3PWDA 3BU3A 4LGGA 4C4IA 1IASA 4FV5A 3A7GA 3WZUA 3IW5A 4K6ZA 3ZO4A 4TYHB 3IGOA 3F66A 1GIIA 4ZIMA 5K5NA 2J0JA 2YISA 5HBEA 3BPRA 3MVHA 3L9MA 2IN6A 4TRLA 1KE7A 4RQVA 5DIAA 5E7RA 5LWNA 3FDNA 3CCNA 1H28A 4XG6A 4IE9A 4PMMA 3DPKA 4GUEA 3UBDA 4D2VA 4NM3A 4FKVA 5DE2A 3GFWA 4MQ1A 1FGKA 4ITIA 5ANEA 4CRSA 4YZMA 3BIZA 3R00A 4NKSA 3WBLA 1KE6A 3BLHA 5AP1A 4UX9A 4RC3A 3GU5A 5DRBA 4A4XA 5JKGA 4HCTA 3RAIA 4CGAA 1PMNA 1JKKA 2GFSA 3TEIA 4F1OA 2UZVA 2FSTX 3R9OA 3EQIA 2A1AB 4WHZA 5AP2A 5CSWA 4U81A 3UIXA 4ARKA 2RF9A 3FYJX 4C61A 4TYGA 3EB0A 2RGPA 4P5ZA 4RGJA 5FUTA 5DFPA 4E1ZA 2X2LA 3R7EA 2W7XA 3O96A 3LPBA 4ZY4A 4DLJA 4RQKA 1H4LA 2CDZA 4JG6A 3P5KA 3L9NA 3KMUA 3R30A 2CNVA 2HZ0A 4YTCA 5HCZA 4IC7A 3A99A 1ZMWA 1REJA 3CPCA 3A7IA 4CVAA 1GZOA 2NRUA 2YAAA 2XEZA 2YN8A 1YOMA 4KINA 4XG7A 5KMKA 3QCQA 2WPAA 4FKOA 5EG3A 4YJPA 1W7HA 2QOQA 4C3FA 3DFCB 1DAYA 2QC6A 4FYOA 4HZRA 4LUEA 1MRVA 4XRJA 3R8VA 3VUDA 4IFCA 3BKBA 5E8UA 3T8OA 3TZ8A 3W2SA 5HLWA 1UV5A 3LJ0A 5LMAA 1NA7A 4PDPA 2EXCX 5FTGA 2V7OA 3RTPA 3ZLSA 2XKFA 2BAQA 3QWKA 2ITQA 4FL1A 4R7HA 2UV2A 3LFCA 4FKQA 4CLJA 3GI3A 5BVEA 3MPTA 2FSOX 4M13A 4CRLA 5T68A 5BVOA 1IA9A 3DNEA 4YNOA 4QTCA 4C57A 4O0RA 2YIXA 4Q5HA 1K9AA 5DR2A 2WNTA 3TUCA 4UEUA 2E9UA 3MIAA 4D1XA 3Q2MA 4H3QA 4EEVA 3VQUA 2W0JA 4U7ZA 3BEAA 1VJYA 3FY2A 3IS5A 4FSWA 3C4WA 2PZIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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