The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLSSEEKSAVTALWGKVNVEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSSANAVMNNPKVKAHGKKVLAAFSEGLSHLDNLKGTFAKLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVIVLSHHFGKEFTPQVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen binding
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-1/2
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| publication title |
X-ray crystal structure determination of hemoglobin from rabbit at 2.0 angstrom resloution
rcsb |
| total genus |
54
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-09-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1I3E A; 1A0U B; 3NMM B; 1QXE B; 1XZ7 A; 3GKV B; 1MNJ A; 1GLI B; 4NI1 A; 4HHB B; 1VXB A; 1GVH A; 1HBH B; 3PIA A; 1DWT A; 1YEN A; 1LFV A; 1YZI A; 1JEB B; 3ZH0 A; 4MQC B; 1Y4R B; 3WI8 A; 1UC3 A; 4MPM A; 1HHO B; 2IG3 A; 2Z6T A; 2DN3 A; 3LQD B; 2Z6N B; 5KKK A; 3HC9 A; 2G3H A; 4ROM A; 1V75 A; 3GQP A; 2PGH B; 3UHQ A; 1FDH G; 1QSI A; 1LUE A; 1ABW A; 1MTK A; 2XKG A; 4ESA B; 1MLQ A; 1YVT B; 3OZU A; 2BK9 A; 3WCP B; 1SDL A; 1RTX A; 1C7B B; 4HRR A; 1Y4P A; 5ILP A; 1DO4 A; 2SPO A; 1XY0 B; 4MBN A; 5MBA A; 1XZU B; 3WTG B; 3NG6 A; 3HEP A; 3D1A B; 3GOU A; 1UT0 A; 2OHB A; 3UHR A; 3DUT A; 1JF4 A; 2DN2 A; 2O5M X; 1MDN A; 5CN6 A; 1MOH A; 3WCV D; 1C7C A; 1FLP A; 1HDS B; 1OUT B; 4HRT B; 2W72 B; 2ZS1 B; 1BZZ A; 2R50 A; 2HHD B; 2D2N C; 4M4B A; 5EV5 A; 4VHB A; 2OHA A; 3RJN B; 2LH1 A; 3SZK B; 2ZSZ A; 1MWC A; 2ZLU A; 1UX9 A; 3WCT A; 1K1K B; 1JWN A; 1BZ1 A; 4HSW A; 1O1M B; 2GNW A; 1CMY A; 4C44 A; 2RAO B; 1LFZ B; 3HHB A; 1BZ6 A; 3LR9 A; 1HCO B; 3PI8 A; 4X0L B; 1MLK A; 1QI8 B; 1XXT B; 3AT6 B; 3QZX A; 1YEU B; 1YHU B; 1MLG A; 5MBN A; 3QM9 A; 1HBR B; 1VRE A; 1YHR B; 1X9F C; 3UHC A; 1SI4 A; 2PEG A; 1UMO A; 2R80 B; 1YCB A; 1SPG B; 2QSP A; 4FWZ A; 1G9V A; 4ROL B; 4BJA A; 1Z8U B; 3H58 A; 2ZS0 C; 1J7Y B; 3IC0 B; 2W6Y A; 3D7O B; 1Y0C A; 3NL7 A; 1MBA A; 2G10 A; 2AUO A; 1BIJ A; 5CN4 A; 2GNV A; 2O5T X; 1CO8 A; 1JL6 A; 3EOK B; 1LFL A; 2DXM A; 3BJ2 A; 3UHV A; 1HGA B; 1Y8K B; 5CNC A; 2ZLV B; 1BJE A; 1NZ2 A; 2HBS B; 3A5G A; 1XZ7 B; 1M9P A; 4NI1 B; 2VYZ A; 107M A; 3PIA B; 1YEN B; 4ODC A; 1LFV B; 1DLW A; 1O16 A; 1YZI B; 3HXN A; 3D4X A; 1Y0D A; 112M A; 101M A; 1Y8W A; 2C0K A; 1DTM A; 2R4Z A; 2ZT3 A; 3E5O A; 7HBI A; 2DN3 B; 3UHT A; 4MQI A; 1FSL A; 4ROM B; 1XZ4 A; 3GQP B; 1V75 B; 2NSR A; 1NWI A; 3MJU B; 1QSI B; 2EB9 A; 5EET A; 1ABW B; 5EU2 A; 1T1N A; 1YEQ A; 2ZST A; 5JDO E; 3A59 A; 1YE0 A; 1SDL B; 1RPS A; 1HRM A; 1Y09 A; 4HRR B; 4FH7 A; 106M A; 1Y4P B; 3ZOM A; 5E6E A; 3NG6 B; 3RJ6 A; 1TES A; 3GOU B; 1MOD A; 3QQR A; 3DUT B; 2DN2 B; 1CBM A; 2GTL D; 1C7C B; 2LH6 A; 1H97 A; 1YMC A; 1IT3 A; 1BZ0 A; 3A5A A; 2O58 X; 1BZZ B; 1HBB A; 1O1J A; 2VLZ A; 4M4B B; 5CN9 A; 2BKM A; 1Y4G A; 1MNO A; 2MHB A; 1HLM A; 1GCW A; 3MYM A; 1LFQ A; 2ZLU B; 3S66 A; 3DHR A; 3ARJ A; 1QPW A; 3WCT B; 4MQH A; 1BZ1 B; 2ZLW A; 2H8D A; 1DO1 A; 1CH5 A; 1CMY B; 3WFU A; 1CLS A; 1VXC A; 1XZ2 A; 3HHB B; 1NZ4 A; 3WFX A; 2HZ3 A; 3PI8 B; 4N7N A; 4U8U C; 1DLY A; 1F5O A; 1HLB A; 1HBI A; 1VXA A; 1MBS A; 3G4V A; 3ECL A; 3AT5 A; 1O1L A; 1AZI A; 2ZT0 A; 3AQ9 A; 1SI4 B; 1YIH A; 102M A; 1DUK A; 1CG8 A; 2QSP B; 1G9V B; 4DWU A; 1Y35 A; 3WCU A; 3NMM A; 2VLY A; 1M6M A; 1GDK A; 1DXU A; 4F6I A; 1MLL A; 1LH2 A; 2JHO A; 4IRO A; 3A0G A; 3EU1 A; 1Y0C B; 2IN4 A; 3G4U A; 4MQC A; 3NL7 B; 1S69 A; 3VRE A; 1RSE A; 3UHH A; 4JAC A; 6HBW A; 1R1X A; 109M A; 3QM8 A; 1FAW A; 3UHY A; 3GLN A; 2QLS A; 2QSS A; 3ASE A; 1S5X A; 1LFL B; 2E2Y A; 1NEJ A; 2DXM B; 1HJT A; 3BJ2 B; 2EF2 A; 4UUR A; 2MGH A; 1IRD A; 1S61 A; 2AV0 A; 3GDJ A; 1Y7D A; 3A5B A; 1MYJ A; 5CHQ A; 3FH9 B; 3PI2 A; 1M9P B; 2G14 A; 3G4W A; 1MYH A; 1CQ2 A; 3ZHW A; 4F6B A; 3QMA A; 3WCP A; 4ODC B; 3HXN B; 1Y0A A; 3MN0 A; 3D4X B; 1Y0D B; 4MAX A; 1Y7G A; 3WCW A; 1Y8W B; 1A00 B; 2MGD A; 103M A; 4OF9 A; 1EWA A; 2G0R A; 3WFW A; 1ECN A; 1MZ0 A; 4MQI B; 3D1A A; 1XZ4 B; 1MBO A; 1YGD A; 3UGY A; 2D6C A; 3UI0 A; 1MCY A; 1T1N B; 1Y22 B; 4L2M A; 3UHW A; 1YEQ B; 1A6G A; 3OVU C; 3WCW D; 3A59 B; 2EB8 A; 3KUO A; 1RPS B; 1Y09 B; 1MGN A; 1V4X A; 1A3N A; 1Y8I A; 3TLD A; 1A01 B; 1K1K A; 5E6E B; 2H8F B; 4O2G A; 5F2A A; 2Z6S A; 4MBA A; 1N9F A; 2RAO A; 1FDH A; 1FCS A; 4GZG A; 2W6V A; 4MXK A; 4LPI A; 5EE4 C; 1LH3 A; 1SHR A; 1BZ0 B; 1HBB B; 1O1J B; 1A3O A; 4KN3 A; 1J3F A; 2V1G A; 3ED9 A; 5HLX A; 1LTW A; 1OUU B; 1GCW B; 3S66 B; 3DHR B; 1QPW B; 3VHB A; 4MQH B; 3DHT A; 3ARK A; 2W72 C; 3R0G A; 5HAV A; 2ZS1 C; 1O1O A; 2ZLW B; 2H8D B; 1Y4Q A; 5EYJ A; 3OZW A; 1CLS B; 3W4U B; 4FH6 A; 1XZ2 B; 5ILM A; 1YIE A; 1YHE A; 2OH9 A; 4N7N B; 1BZR A; 3M3A A; 1XQ5 B; 3ZJP A; 4KMW A; 3AQ5 A; 3AT5 B; 1O1L B; 3UHN A; 1BAB A; 1DKE A; 1YE2 A; 1YHU C; 1HBA A; 2ZLX B; 1A9W A; 1BIN A; 1C7D A; 2HBS A; 1U7R A; 1Y35 B; 3WCU B; 3PI3 A; 1OR6 A; 3KMF C; 1DXU B; 1NXF A; 1YFF A; 1JP8 A; 5B84 A; 2W6X A; 4B4Y A; 4IRO B; 3ZJI A; 3A0G B; 2ZSQ A; 3EU1 B; 3OO5 A; 3ZJL A; 3GQR A; 5CN8 A; 3VRE B; 4FWY A; 6HBW B; 1R1X B; 1LH1 A; 1JZK A; 1FAW B; 2OH8 A; 1YGF A; 3HYU A; 2QLS B; 2QSS B; 1S5X B; 4MU5 A; 1RVW A; 1NEJ B; 1Y2Z A; 3M38 A; 3OJ1 A; 2ZSS A; 3HEO A; 1IRD B; 2NX0 A; 3MJU A; 3MKB B; 4TYX A; 3VAU A; 3GDJ B; 1Y7D B; 4PQ6 A; 3TM9 A; 2V1F A; 4TWV A; 3WCV A; 1Y0A B; 4NS2 A; 2XKI A; 1Y7G B; 3UHX A; 3WCW B; 2HBD A; 3G52 A; 3TM3 A; 1G0A A; 1QXD A; 1W92 A; 1BBB A; 3G53 A; 5HLQ A; 3VRG A; 4PQB A; 1YGD B; 2G0X A; 4H2L A; 3LB1 A; 3A9M A; 2MGL A; 3SDH A; 1X3K A; 4NZI A; 2MYC A; 3S1J A; 1YCA A; 4JYQ A; 2D2N D; 1SWM A; 3FS4 A; 1MBC A; 5CN5 A; 4WCH D; 2V1K A; 1NAZ A; 1NQP A; 1V4X B; 1A3N B; 1Y8I B; 3QJC A; 1O1N B; 2ZFB B; 2ZT1 A; 2MBW A; 5HY8 A; 1I3D A; 3DR9 A; 1CIO A; 2ZT4 A; 1MLH A; 1YH9 A; 2MGB A; 3V2Z A; 2GDM A; 2W6V B; 1CH9 A; 2GRZ A; 1Y01 B; 1SHR B; 1O1K A; 1Y5F A; 1CH3 A; 1OFJ A; 3AQ6 A; 4DWT A; 1X9F D; 1A3O B; 2MYD A; 2MYA A; 1S5Y A; 4DC7 A; 5CHR A; 1KFR A; 1Y0T B; 3DHT B; 1MOB A; 1TU9 A; 2FRK X; 1O1O B; 4G1V A; 1CQX A; 1Y4Q B; 2GL3 A; 1A6N A; 2EKU A; 1YIE B; 3BJ3 A; 1YHE B; 1IOP A; 3WCT C; 1VWT A; 1O1P A; 3AG0 A; 3PT8 A; 2MGM A; 4NI0 A; 3ZJR A; 1BAB B; 2R4Y A; 1DKE B; 1V07 A; 1COH A; 1PBX B; 1V4W A; 1YE2 B; 5JDO C; 1OJ6 A; 1HBA B; 2VLX A; 3NFE A; 1C7D B; 5HLU A; 4F69 A; 3ZOL A; 1DXT A; 3MYN A; 3D17 A; 3FH9 A; 1YFF B; 1DXC A; 1OR4 A; 2BMM A; 3OO5 B; 1YMB A; 1ECO A; 3GQR B; 1MBI A; 4L7Y A; 1Y46 A; 1A00 A; 1VHB A; 3A2G A; 3QJB A; 111M A; 1YGF B; 1Y85 A; 3HYU B; 1VXE A; 1RVW B; 1UVX A; 3UHI A; 3V2V A; 1Y2Z B; 5IKS A; 3CY5 A; 4O4T A; 2MYB A; 2R1H B; 1CP0 A; 1URY A; 1S0H B; 1Y22 A; 1DWS A; 3OK5 A; 1JW8 A; 3ZJM A; 2GTL A; 3WCV B; 2BNL A; 3ARL A; 1OFK A; 4XDI A; 2GKM A; 2LH2 A; 5AB8 A; 4G1B A; 1U7S A; 2HBD B; 1A01 A; 1G0A B; 3K3U A; 3LB3 A; 5EQM A; 1QXD B; 5HU6 A; 3PT7 A; 1BBB B; 2H8F A; 3CIU A; 1Y4V A; 3VRG B; 1DM1 A; 5SW7 A; 5E83 A; 4H2L B; 1J7S A; 3R5I A; 108M A; 1MTJ A; 4WJG A; 4UIQ A; 2FRJ X; 2ZSP A; 2XKH A; 2H35 A; 4N7P A; 1Y8H A; 3FS4 B; 1HV4 A; 4PNJ A; 1J41 A; 2MGC A; 1ABY A; 1LHT A; 1URV A; 3ZJN A; 1HGC A; 1NQP B; 1V4U A; 3QJC B; 1OUU A; 2SPM A; 104M A; 5HY8 B; 1HDA B; 3GK9 A; 1S6A A; 1CG5 A; 1MYT A; 1LHS A; 2LHB A; 3QJD A; 3W4U A; 2MGF A; 1YOG A; 2V1E A; 5KER A; 2OIF A; 4U8U D; 1YH9 B; 3O7N A; 1XQ5 A; 1O1I A; 1ECA A; 1JP9 A; 1O1K B; 1G08 A; 1Y5F B; 1AJH A; 4N8T A; 2VM0 A; 2Z85 A; 1HGB A; 1MLR A; 4AVE A; 5CMV A; 2ZFO A; 2NRL A; 2M6Z A; 1FHJ A; 1LH6 A; 2MGJ A; 1GBV A; 1S5Y B; 2ZLX A; 1HBS B; 1JDO A; 3G4Q A; 110M A; 2ZLT A; 3QZZ A; 3BJ3 B; 3UHD A; 2D2M D; 3UHE A; 4NXC A; 1VWT B; 1O1P B; 1GBU A; 2D60 A; 3MJP B; 1MNI A; 4HSX A; 3M39 A; 1NWN A; 2ZFO D; 3RGK A; 3E5I A; 3E55 A; 2ZSX A; 3PT8 B; 4NI0 B; 3K8B A; 4FWX A; 2GRF A; 1COH B; 3EDA A; 1V4W B; 3UHG A; 2W31 A; 2AA1 A; 3NFE B; 5E29 A; 1XYE B; 2BLJ M; 4OOD A; 3MKB A; 2MB5 A; 1DXT B; 3D17 B; 1IT2 A; 1B86 A; 3WHM A; 1VRF A; 2NRM A; 4N7O A; 1DXV A; 1VXD A; 1J7W A; 1VXF A; 3PI9 B; 1Y46 B; 4L7Y B; 4UZV A; 1KD2 B; 3WCU C; 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2VHB A; 1ASH A; 2D5Z A; 1IDR A; 4O4Z A; 2ZLT B; 4QAU A; 2DC3 A; 2QRW A; 2VEE A; 5ILR A; 1PMB A; 2LH7 A; 1JY7 A; 4KMV A; 1YDZ A; 3ZJH A; 1J40 A; 2D60 B; 1GBU B; 2ZSY A; 1IWH A; 5CNG A; 3UBC A; 3P5Q A; 4DC8 A; 1MLJ A; 3K8B B; 1LFY A; 2G0V A; 3S65 A; 2AA1 B; 2HBF A; 1Y5K B; 5E29 B; 5JGG B; 3QJE A; 2R1H A; 1NPF A; 1RQ3 B; 1S0H A; 2D5X B; 3GQG A; 1A0Z A; 5EYS A; 2FRI X; 1MYI A; 1CH2 A; 1MKO A; 4NK1 A; 1B86 B; 3WHM B; 1CH1 A; 3SDN A; 2ZT2 A; 4MQJ B; 5D1V A; 4N7O B; 1DXV B; 1G0B A; 1SDK A; 1YG5 A; 1J7W B; 1G09 A; 1MYG A; 2D2N A; 1H1X A; 1NS6 B; 1A6M A; 1CIK A; 3ECZ A; 3BJ1 B; 4G51 A; 3S1I A; 4MQK B; 1Y4B A; 2AUP A; 3LB2 A; 1AJG A; 2DHB B; 5CNF A; 3UHK A; 1RQ4 B; 3BCQ A; 4H07 A; 1Y5J B; 1HAC A; 3ONZ B; 1MYF A; 1X9F A; 1HDA A; 1Y7C B; 1A9W E; 2BWH A; 3WCV C; 3BOM B; 1WMU A; 1XZ5 B; 3AQ7 A; 3OO4 A; 1QSH A; 4ILZ A; 2V1I A; 3ZJO A; 2ZWJ A; 2ZS0 A; 4M4A B; 3QM7 A; 2QU0 B; 1EBT A; 4YU3 A; 4MQG A; 2EVK A; 2HZ2 A; 2HBE A; 3WR1 B; 2QMB B; 4ZVA A; 3O89 A; 2B7H B; 4SDH A; 4NK2 A; 1Y45 A; 2XYK A; 2OLP A; 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