2RGLA

Rice bglu1 beta-glucosidase, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
471
structure length
471
Chain Sequence
WLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structural Insights into Rice BGlu1 beta-Glucosidase Oligosaccharide Hydrolysis and Transglycosylation
pubmed doi rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 196
structure length 471
sequence length 471
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2rglA00
1OIFA 4AC1X 3AISA 2Q8XA 5A8OA 4WKHA 1E15A 3VIJA 2CETA 2UY3A 2B31A 1XSKA 4PSPA 3QHMA 4W86A 2WWDA 3AI0A 2J7DA 1K9FA 1W9UA 5JUVA 4H41A 1NWUA 2BS9A 2DH2A 5BXRA 3EDKA 4F79A 5A8PA 3MUZ1 3VMNA 2ZX5A 2JALA 4GKLA 1CEOA 3E1F1 1G01A 2DSWA 3EMCA 3AIUA 2WVVB 3HJEA 1UA7A 1EHNA 3VKKA 3ALFA 1W3LA 1JDAA 2CITA 5E0CA 2J79A 3W53A 2D0FA 4YPJA 4LQ1A 3VTRA 5HNNA 2ZWYA 2J7EA 1EDTA 1GZJA 1TA3A 4C7GA 1J0HA 4P8WA 1ISZA 2ZXAA 1AVAA 2BNJA 3WF3A 1JNEA 5IHRA 1HVXA 4TTGA 1QNOA 4UQEA 4CKQA 4FK9A 4HU8A 1E5NA 4EAMA 2XWEA 4TUFA 4HMDA 2ZXBA 3VINA 3GXDA 3WFZA 3CUFA 3L2LA 5M17A 5CGTA 3CZGA 1C8QA 3NJ3A 4TX8A 2G3JA 1V03A 3WD0A 3L4WA 3TTSA 1BQCA 1DWGM 3GBEA 1JD9A 1G9HA 1HKKA 3VIPA 1E1EA 3W6LA 2W91A 5A6KA 4CD4A 1FH9A 1VENA 3VDCA 2WLZA 3BMWA 5CG0A 5E6ZA 1ZBVA 1BPLB 1R85A 5ABFB 4P8VA 2V5CA 1DEDA 5KZ6A 4UFHA 4JL1A 1XD0A 4W93A 2E9BA 2O9TA 4BZYA 3FAWA 2GSJA 4D6GA 3O9NA 1NP0A 4YHEA 2WMGA 1EGZA 1R87A 4PBGA 2YLAA 3ZOAA 2RGLA 3BAIA 5CQ1A 4QAWA 3WIJA 1TZ7A 2CHNA 3BC9A 1KCLA 3WH9A 2OWXA 3WH8A 1BGAA 4E2OA 5A6BA 3KL3A 1FH8A 3CHFA 1B2YA 5A6BD 3WF4A 1ZJAA 4R5EA 1SMDA 3WNNA 1GOIA 1TMQA 3ZJKA 4JZ5A 1UWSA 3SCPA 1CBGA 4MNKA 5FOOA 1CXHA 2QPUA 2XGIA 3PTQA 1X6LA 1FA2A 1UD4A 3QHOA 5ABHA 3MMWA 3S2CA 1BG9A 2DEPA 2EPKX 1VFMA 1PEZA 1VBRA 2J8FA 4ZFMA 4QCFA 2WCGA 3ZT6A 5AC4A 1QHPA 4KGLA 1V3KA 2OWCA 3L4YA 2E4TA 2GFTA 4OKDA 1XV8A 3SCOA 3QHNA 1CZ1A 1UR2A 1ISYA 2ZUMA 4AD3A 2PWGA 4J3VA 1I75A 2WVVA 3ARQA 5DT5A 1QOXA 3VO0A 1E0VA 3AXXA 3L4TA 3MV11 3SCTA 4LYRA 3A4AA 3WNOA 2EPNA 1ODUA 1AQMA 4W85A 2JEPA 1CXFA 2BVTA 3IJ8A 1VJZA 1QI5A 1MW0A 3OGSA 1SR0A 2D23A 1FHLA 1UG6A 1JNDA 4D6IA 2VX4A 3FXYA 3KL5A 3NCOA 4XB3A 3ZO9A 1J18A 4HMCA 3WKZA 1JYXA 2XSAA 3WL0A 1UWTA 4B9YA 4PYSA 4TXEA 4OBSA 1B90A 3AIVA 2E8YA 6CGTA 3NIYA 1JI2A 1XD1A 4P7OA 1F4AA 4AZ7A 1QPKA 2WK2A 4UQDA 3VPLA 3W27A 3FN9A 4W5UA 1JYNA 4TVDA 5A8MA 1H11A 1TFVA 4BQ2A 5FCZA 4GZJA 1BYAA 1UKQA 3QOMA 4Z2LA 3SCRA 3M07A 1JF5A 4AW7A 4MDOA 1GPFA 2HVMA 5A2AA 1CLVA 3VGBA 1JYVA 1H41A 2F61A 1HL9A 1VRXA 4UOQA 3WUGA 2F2HA 3CHEA 4D6JA 1HJSA 6TAAA 3CLWA 2VCBA 5C71A 1JDCA 1QW8A 2J75A 7TAAA 1JZ3A 1G0CA 2G3IA 3G6MA 4U3AA 1FP9A 1HN1A 3ECQA 1JZ7A 2DSUA 5ABFA 4OZOA 3MU7A 3VIHA 2WWCA 1XC6A 2XHYA 2VVNA 4WLCA 4JKLA 4W5ZA 5AC5A 5I23A 5JBFA 1B3XA 4DUXA 4OOUA 4MB4A 3TTOA 2WHJA 1FP8A 1W9DM 4U5KA 1ECEA 1UWIA 2PWFA 2WVUA 3WELA 4J3SA 1CGVA 1W9BM 1C8XA 1JAKA 1NOUA 4U5IA 1C7TA 3RCNA 2YKKA 1UR1A 4J7RA 1W1VA 1BGGA 5I3DA 4B15A 2E0PA 1HJUA 3BGAA 1UD8A 4XZBA 1A3HA 4D72A 1CXIA 1ZJBA 3WUBA 3VILA 3RILA 3DECA 4QLKA 1J01A 2GK1B 2VMFA 2DSKA 1E3ZA 4PN2A 3GM8A 5EMYA 1E6ZA 4JL2A 3SUSA 4CVUA 3OGVA 2XJ7A 1J0IA 1DWIM 2ZX8A 3BSHA 4LX4A 2VZSA 3CMJA 5JBEA 1VFUA 1OD8A 2CBIA 3U5YA 4GO9A 2OYMA 3GTNA 1SMAA 2WZHA 4PTXA 5GNXA 2XG9A 5LA0A 2WKGA 3FHQA 4AIEA 1VEOA 4DM1A 1W2PA 2WLYA 4N0RA 1JXKA 4AIUA 1ZB5A 1YHTA 1KR1A 1OBAA 1V0KA 1GQKA 2VRQA 3BCFA 6A3HA 1UHVA 2YA0A 3SCQA 1W32A 3K8LA 3KZSA 3CMGA 2O9OA 4P7LA 1GOMA 2IXUA 2TAAA 1MYRA 4DUVA 1MWOA 2YDSA 3AJ7A 1H2JA 2O92A 1ISWA 1XCXA 3F5LA 5CZKA 2WXDM 5BYWA 1OM0A 2G4FA 4PMOA 3RDKA 1WZKA 3BLPX 2ZUWA 4M80A 1UWRA 2YL9A 3A47A 1KGUA 3O2LA 1UWUA 3GNOA 4DM2A 2WM0A 4MADA 1KGWA 1HNYA 2VL4A 2CIPA 1OD0A 2BVDA 3MMDA 3T0BA 3GNRA 1R7OA 1XH0A 3VX1A 2WMFA 2A3BA 5CLTA 3UG4A 1QI3A 1ITCA 2J47A 2OYKA 5D9PA 3ZSSA 3T2PA 4NSBA 1E6PA 4M29A 4AD0A 4QLJA 2WHMA 3I3EA 1G94A 4W8BA 1JFHA 1CXLA 3OGRA 3EMZA 3G6LA 1CTNA 3VGFA 1KXHA 5AY7A 2ZOXA 3LPOA 1M03A 1PIGA 2GVYA 2YBTA 2XSBA 1E40A 4P8XA 5AYBA 3KWXA 1W2VA 4CU7A 2XVGA 2FDMA 2NT1A 2J7BA 1HF6A 3NUKA 1BSIA 1FH7A 1TVNA 1UR8A 1H49A 4J28A 5BXPA 2CEQA 1WDQA 1C3FA 1NM9A 3AIRA 2J78A 4XUYA 4ZENA 4HZ8A 3WMCA 2VT0A 2CBJA 3K4AA 1HKIA 1V3MA 4CN1A 3VIIA 1E0XA 2Y5EA 1M01A 1UKSA 4E8CA 1NP2A 1YQ2A 2E8ZA 1VF8A 1LL4A 1GHRA 3WSUA 3AMDA 4PEEA 4BCEA 2CXGA 5E6YA 3WQ5A 4Y7EA 3QR3A 1UWQA 2OSXA 1B30A 1HKJA 2GK1A 1UZ4A 4QDMA 1U2YA 1V6YA 2W67A 5ECUA 2DDXA 3TTYA 3WUFA 1DWAM 1VJSA 2OSYA 3EBVA 3WMSA 4URIA 5IDIA 3WNPA 2VX6A 2W92A 1QNQA 2JF6A 1ISXA 1O6IA 2ZUNA 3W4RA 1C93A 4Z2IA 5KEZA 4M8UA 2J8GA 2ZXQA 3WEOA 4D6DA 4JHZA 4Q7NA 2A3HA 1V3HA 4HZ6A 2WMJA 3A4WA 4B16A 2WVSA 4KRUA 2A3EA 3CZEA 3CZJA 1ZL1A 4W7WA 3AQUA 4MB1A 3AMKA 4Z2HA 5A8NA 3F4VA 4HU0A 4OIFA 4GQRA 4MTVA 1WAWA 3IJ7A 3D3AA 2YBUA 3UESA 1EO7A 1E4NA 1HIZA 3K8KA 1PPIA 2CHOA 4D6CA 1UYQA 1V3JA 4AZBA 1PBGA 5I0DA 2D3NA 1B3VA 1FFRA 3WEMA 4H8HA 4CU8A 3CZLA 3B9AA 3CH9A 5M03A 2PBOA 1BTCA 2CKRA 1W3KA 2QPSA 1CGWA 8CGTA 5M3WA 2QHAA 5GNYA 2ZUTA 4UQBA 2NW0A 1E6XM 1GOKA 3L4ZA 2XVKA 4UFLA 2BFGA 1DWHM 2VZOA 2CPUA 1UZ1A 2X2YA 2DT0A 1HP4A 2Z1SA 2DGAA 4BF7A 1IZKA 4JFTA 4OBRA 3GXIA 2DIJA 1SYTA 4W84A 1JYWA 5GNZA 3VIOA 1OSEA 4HP5A 3WUEA 4GQQA 3UG3A 3MSGA 2VTFA 5E70A 3ZJ6A 1IV8A 4CGTA 1K9TA 1X1NA 4X0VA 1J11A 4H04A 1CWYA 3VM7A 4AIOA 4BQ4A 1L0PA 1UH3A 5I2UA 3VDAA 3VD3A 4B3LA 3QOKA 2BHZA 4PRWA 4UFJA 3ZM8A 1PZ2A 1P6WA 4OOZA 3RJYA 7CGTA 5E0FA 1QW9A 4UZUA 3TONA 4UZSA 4HPGA 2GJXB 1WDPA 3GNPA 2UY4A 3SCVA 2X0HA 4M56A 5D8ZA 2AMGA 4JFVA 1Q6EA 3GXMA 3VGHA 1ZS2A 2OYLA 2V3EA 4PUEA 3SUUA 4AZIA 4C7DA 3W38A 1HXJA 2Y2WA 4AZ5A 3DHPA 3LMYA 3WDRA 2V3DA 3VD9A 1UR4A 5TD4A 2W62A 1GUVA 2J7GA 3GYCA 1ODZA 4HOZA 3K46A 2E40A 4M1RA 1UQZA 2D20A 1K9EA 5BRQA 4AY1A 4RE2A 4ZE4A 1HVQA 4PMDA 3WD3A 2JIWA 3IAPA 5A6MA 3T2OA 2FH8A 1Z32X 5AYIA 3ZMRA 1OB0A 3CO4A 3UR7A 4MNMA 1KQYA 4B9ZA 2XTKA 2XVPA 2O9PA 3N04A 4K68A 1JL8A 1V6WA 2VQUA 3U7BA 3I3BA 2CCRA 4Q22A 3WDHA 1UA3A 2DQXA 2WPGA 2XIIA 2ZIDA 3DYOA 1Q6GA 3SCUA 3U57A 1EHAA 3AYRA 2MANA 3LPFA 2NSXA 4MNJA 2XIBA 2VX7A 2VUYA 1DP0A 2VJXA 2D24A 2XFRA 3HU7A 4WIWA 2E9LA 1W9PA 3WD4A 4J3WA 1UUQA 2ZWZA 3WY1A 1R8LA 1VBUA 3PZNA 1B9ZA 4XV0A 3W25A 5CPSA 3II1A 4E8DA 1GVIA 3T08A 1LWJA 2WC4A 4UFIA 1JZ5A 3PZGA 1LL7A 4WSJA 1MQQA 1UD3A 5D8WA 3VX0A 4UR9A 1VFOA 3KEHA 5ABGA 1FOBA 1Q6CA 2QV4A 1WPCA 3AMGA 1QHOA 3N13A 3U7VA 5BWFA 3HN3A 3AXHA 4P7QA 4KGJA 1CGYA 2WANA 3KL0A 3UERA 3AHZA 3OZOA 1J12A 1GQIA 3WFLA 1LF1A 4ATLA 4N42A 4TTUA 2YL6A 4EK7A 3CHCA 5I78A 2YLLA 1GJUA 3IAQA 3OLEA 3POHA 1XH1A 1QVBA 2BY3A 1NWRA 1XHGA 2D0HA 2GJRA 1BAGA 1UR0A 3AZRA 4PMUA 3WDQA 2XM2A 1PX4A 5I77A 4CVWA 2DPEA 3CUHA 3PHAA 1C8YA 2VRKA 2A3CA 4GIAA 1HT6A 3GH4A 1S46A 5EBAA 4ZE5A 4QCEA 4TVUA 2GJXA 3BMVA 1Q6DA 3HMCA 1NWSA 1LL6A 3POCA 4PMNA 4S3JA 1V08A 1XYZA 1Q6FA 3AOFA 3IJ9A 2QMKA 2DT3A 4WKFA 4LXFA 1QHZA 3CPUA 5DFAA 3AMCA 2G3NA 3ARSA 5I6SA 3MKKA 3K4DA 3RIKA 1US2A 1WZAA 1JZ8A 2IXVA 4ZXLA 4DWSB 3DYMA 1C90A 3VGGA 1XYFA 3ARVA 5BRPA 2VURA 3LPPA 3QGVA 4M81A 3JUGA 5ABEA 4YHGA 3GZAA 4ATDA 1BF2A 2EEXA 4W7UA 1TCMA 2JEQA 3ARZA 2J62A 3WL1A 2VC9A 4FLSA 5FIPA 1I1XA 1CPUA 1WCGA 2ZE0A 2CBUA 2J77A 3ARXA 1KBBA 3AIBA 2Y8KA 1JF6A 5EB8A 3WD1A 4V28A 4AMCA 1BYDA 3I3DA 3RM9A 5D9MA 1E6RA 3VGEA 1D2KA 4AISA 4D6HA 3WQVA 3WMBA 1E73M 1J0YA 1B0IA 3WH5A 2W61A 3EDEA 1WDSA 4CUCA 4PTMA 3SCSA 3PZOA 1KR0A 1UH2A 4AWEA 1UKOA 3VDBA 3PZVA 3CZ8A 1WNOA 4Z2KA 1OT2A 1IZJA 1E70M 2PC8A 3OB8A 4GINA 1QNPA 1DWFM 3AHVA 3CGTA 4A3HA 1MFUA 2W4XA 3WENA 4HA1A 4WJXA 1TR1A 3L2MA 4AZCB 4PCTA 5C8BB 1NQ6A 3CZKA 5DMYA 3DC0A 2BY1A 3PTKA 3NDZA 1H3GA 5A6JA 3BSGA 3K1DA 3WH7A 1OGSA 4CN6A 4EANA 4UOZA 2PWHA 2Z1KA 2WCAA 1US3A 3ARPA 4HOXA 1EH9A 3L4UA 2X1IA 1WDRA 2ZUUA 3EMQA 4HA3A 5F7UA 1H0IA 4Z2JA 2W66A 3EDDA 3GH7A 2VVSA 3OLGA 1LQ0A 1OCQA 2XVLA 1ZU8A 2QLYA 3CHDA 1PAMA 4AZHA 3SUVA 1QNRA 5HPOA 1HJXA 4J3XA 4UFKA 1JDDA 1UQYA 1EA9C 2BXZA 3J7HA 1I1WA 1H5VA 2WAGA 1NH6A 2X0YA 3VNYA 1K9DA 1CLXA 1EIBA 1HX0A 4S3KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OIF A;  4AC1 X;  3AIS A;  2Q8X A;  5A8O A;  4WKH A;  1E15 A;  3VIJ A;  2CET A;  2UY3 A;  2B31 A;  1XSK A;  4PSP A;  3QHM A;  4W86 A;  2WWD A;  3AI0 A;  2J7D A;  1K9F A;  1W9U A;  5JUV A;  4H41 A;  1NWU A;  2BS9 A;  2DH2 A;  5BXR A;  3EDK A;  4F79 A;  5A8P A;  3MUZ 1;  3VMN A;  2ZX5 A;  2JAL A;  4GKL A;  1CEO A;  3E1F 1;  1G01 A;  2DSW A;  3EMC A;  3AIU A;  2WVV B;  3HJE A;  1UA7 A;  1EHN A;  3VKK A;  3ALF A;  1W3L A;  1JDA A;  2CIT A;  5E0C A;  2J79 A;  3W53 A;  2D0F A;  4YPJ A;  4LQ1 A;  3VTR A;  5HNN A;  2ZWY A;  2J7E A;  1EDT A;  1GZJ A;  1TA3 A;  4C7G A;  1J0H A;  4P8W A;  1ISZ A;  2ZXA A;  1AVA A;  2BNJ A;  3WF3 A;  1JNE A;  5IHR A;  1HVX A;  4TTG A;  1QNO A;  4UQE A;  4CKQ A;  4FK9 A;  4HU8 A;  1E5N A;  4EAM A;  2XWE A;  4TUF A;  4HMD A;  2ZXB A;  3VIN A;  3GXD A;  3WFZ A;  3CUF A;  3L2L A;  5M17 A;  5CGT A;  3CZG A;  1C8Q A;  3NJ3 A;  4TX8 A;  2G3J A;  1V03 A;  3WD0 A;  3L4W A;  3TTS A;  1BQC A;  1DWG M;  3GBE A;  1JD9 A;  1G9H A;  1HKK A;  3VIP A;  1E1E A;  3W6L A;  2W91 A;  5A6K A;  4CD4 A;  1FH9 A;  1VEN A;  3VDC A;  2WLZ A;  3BMW A;  5CG0 A;  5E6Z A;  1ZBV A;  1BPL B;  1R85 A;  5ABF B;  4P8V A;  2V5C A;  1DED A;  5KZ6 A;  4UFH A;  4JL1 A;  1XD0 A;  4W93 A;  2E9B A;  2O9T A;  4BZY A;  3FAW A;  2GSJ A;  4D6G A;  3O9N A;  1NP0 A;  4YHE A;  2WMG A;  1EGZ A;  1R87 A;  4PBG A;  2YLA A;  3ZOA A;  2RGL A;  3BAI A;  5CQ1 A;  4QAW A;  3WIJ A;  1TZ7 A;  2CHN A;  3BC9 A;  1KCL A;  3WH9 A;  2OWX A;  3WH8 A;  1BGA A;  4E2O A;  5A6B A;  3KL3 A;  1FH8 A;  3CHF A;  1B2Y A;  5A6B D;  3WF4 A;  1ZJA A;  4R5E A;  1SMD A;  3WNN A;  1GOI A;  1TMQ A;  3ZJK A;  4JZ5 A;  1UWS A;  3SCP A;  1CBG A;  4MNK A;  5FOO A;  1CXH A;  2QPU A;  2XGI A;  3PTQ A;  1X6L A;  1FA2 A;  1UD4 A;  3QHO A;  5ABH A;  3MMW A;  3S2C A;  1BG9 A;  2DEP A;  2EPK X;  1VFM A;  1PEZ A;  1VBR A;  2J8F A;  4ZFM A;  4QCF A;  2WCG A;  3ZT6 A;  5AC4 A;  1QHP A;  4KGL A;  1V3K A;  2OWC A;  3L4Y A;  2E4T A;  2GFT A;  4OKD A;  1XV8 A;  3SCO A;  3QHN A;  1CZ1 A;  1UR2 A;  1ISY A;  2ZUM A;  4AD3 A;  2PWG A;  4J3V A;  1I75 A;  2WVV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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