2RH9A

Tryptophan synthase complexed with igp, internal aldimine, ph 9.0
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
268
structure length
254
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
publication title Tryptophan synthase complexed with IGP, internal aldimine, pH 9.0.
rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 95
structure length 254
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2007-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2rh9A00
2QCMA 2J9XA 4IPIA 1OK4A 1ZALA 2DZVA 5HNRA 1X1OA 2DORA 3W07A 2C18A 4QIUA 3G1AA 3HF3A 5AYYA 3C61A 4XKYA 2FQIA 3DFQA 4CNPA 4AVFA 1SUXA 3STCA 3W1LA 2QCCA 5K2ZA 2G5WA 1EP1A 1ZY9A 1FDYA 2D73A 3N2XA 4UTWA 3HG2A 1MEWA 3VNDA 1X7FA 2P1FA 4P2VA 1KM5A 2GVLA 5FI8A 3TC7A 1W5OA 5H2ZA 4M7SA 4K37A 3RLVA 1ICSA 4A29A 1T8XA 2A1YA 1O60A 4O50A 1ZFJA 3P82A 2WNZA 5CPLA 4LVDA 2YW3A 4NXSA 1RQBA 1XFBA 5D2TA 4ADSA 2AAMA 4IWWA 1P0KA 5DY2A 1H50A 3EWUA 2CLMA 3G18A 2A0NA 3TSMA 1GYNA 2EHHA 3S6DA 4XBSA 1WBHA 2E6AA 1TPFA 2YZRA 4O1AA 4UTLA 2QAFA 3G0XA 1V7YA 4JTFA 4AHOA 1K03A 4Y96A 1QO2A 3M7WA 4H6KA 5D09A 3L5MA 5K7JA 5LZLA 4N6EA 4HNUA 4IMDA 1RD5A 1GVSA 2YR1A 3LTPA 2V2DA 1Z48A 3W7IA 4MYXA 3M41A 1A5CA 5D33A 1W0MA 4JIPA 3GIYA 4Q32A 2CLFA 4MPQA 3B0PA 4DPQA 3CIXA 1OJXA 1W3IA 4O12A 3L2IA 3OVPA 4OT7A 5F2LA 2E5CA 1V5XA 2WSYA 1S5WA 3HPZA 3NQEA 3I6RA 4FEZA 1FWRA 1W3TA 1VYRA 1DKWA 4JTTA 3MBDA 4N4QA 1AL7A 3F4NA 1VLIA 3S0CA 4K8EA 1OG0A 4I7VA 3W6YA 5F1UA 1KTNA 3STEA 1IXOA 2B7NA 3O8AA 4NJHA 5AHLA 1J4EA 2A6LA 3AO0A 4JTHA 4S1FA 4X22A 5KINA 4LT9A 1TIMA 2BX7A 3PM6A 1YTKA 4LU0A 1O4UA 4O53A 5CSRA 3QH2A 1VC4A 1XUZA 1YPFA 2KZHA 1TTIA 3W70A 4CLMA 1LYXA 3O06A 1KTBA 2WSRA 5FF7A 4YCOA 1GT8A 3OBKA 5ABTA 1DL3A 3C2VA 1KLYA 2CZ5A 5CGQA 1QOPA 3G0UA 5KZMA 3G22A 3GNNA 3MJYA 1XBZA 4KWWA 2YGYA 5H91A 3W73A 4CCCA 3SSJA 3LCWA 3W7LA 3S5YA 1AK5A 3LCHA 3GXPA 4S2CA 1F6PA 1ME7A 3N34A 1H7NA 4N9CA 2ZRWA 1OFBA 2XFWA 4QQ3A 3UD6A 3HG4A 1ONRA 1EUAA 1W56A 2W0UA 1BEUA 5AHFA 3KX6A 1LOLA 3HO8A 2X2GA 4A22A 1KM6A 3PF3A 3R12A 2TYSA 1H1ZA 1PVNA 3W85A 1K8YA 1GPWA 1JCYA 4GRSA 5D30A 4GUJA 5HQEA 3C52A 1Y0EA 5KMYA 1HL2A 2BSLA 3LV5A 3F4WA 3QMTA 3HG5A 5DCEA 4O57A 4N2YA 3IIPA 4HT3A 4IGHA 3NL6A 3PUDA 3GDKA 3IVUA 3DFSA 3TQVA 1H60A 1GZGA 1OX4A 1W37A 3GLCA 2NUWA 3E9AA 3ATZA 4OQVA 4NX0A 5CSSA 3QMRA 4RV8A 3O16A 3STGA 5KZEA 3W7NA 4HNTA 4IJBA 4LS2A 2BXVA 3LHZA 3PUEA 3DH7A 1A5BA 1F76A 4CCDA 4OHQA 3QF0A 3W7KA 4CCEA 3LRKA 1GG0A 4JD4A 4N4PA 4KFPA 1ME9A 5CG7A 3PVFA 1KFLA 4YL2A 2E09A 5K4XA 3R89A 4JTUA 1U83A 4M6QA 3W1TA 3QC3A 3L68A 5EPDA 2NV2A 4OE7A 2QCGA 2TRSA 3OHIA 4TR9A 1Q3NA 2E6FA 4WY0F 2YYUA 3STFA 1FX6A 2PE4A 4FNSA 3SW6A 4LOCA 3S1WA 5G5IA 3UQNA 1H63A 4AWSA 2ZA3A 4UC5A 3IVSA 4O1DA 1H1YA 4PEKA 3GXNA 2J24A 4NZFA 2NX1A 2Y88A 4R53A 1W5NA 4IXHA 2GVGA 4H3DA 4Y90A 2Y7EA 4M7TA 3L0KA 2EAWA 3KXQA 3JS3A 3JR2A 5LNWA 7TIMA 4FX8A 1TPDA 4ZMGA 4NX5A 4OV9A 4B5NA 3P67A 1H7XA 3KVJA 2ZYFA 3DXIA 1LM1A 1SZEA 1N8FA 3T40A 3CB8A 3N3MA 4A21A 3C3NA 3AJXA 1GOXA 3FEMA 3INPA 4GBUA 5FF2A 4D2JA 4BWLC 5AHEA 3SGUA 2YPIA 4LV9A 2Y85A 1JQVA 4EIVA 4QITA 3IRDA 3MBFA 4PA8A 2DP3A 1JR1A 1UB3A 5K9CA 1VCGA 3FYPA 3WJWA 2Z6IA 5D32A 3KVLA 1GVFA 5TIMA 3Q2DA 1I2NA 2WO5A 5AC7A 3UZJA 4N9BA 2PRLA 3PBVA 1ADOA 2FFCA 2I14A 3EKZA 2JBMA 3S5ZA 1UCWA 4UMCA 4AF0B 2H3BA 3LBMA 3E96A 4FX6M 3UWQA 3MMTA 3MW7A 1LRQA 5F4XA 3TFCA 5EL1A 1FWWA 3NL5A 4TMBA 3SY5A 1JCMP 3BW2A 4GUHA 4RZ5A 1KFEA 2R91A 4LC8A 3MUXA 4Z08A 4LVAA 3GAKA 1SSDA 3P81A 1JRCA 5C54A 1EPXA 4R7JA 3SECA 3WK0A 1MSSA 2HTMA 4JYFA 3BG5A 4BWLA 4I9AA 2NWRA 4IMFA 5CZJA 2RDTA 4TU1A 2V2HA 1BKSA 4FXRA 1JULA 4MZ8A 5DLCA 3G1SA 1B57A 1KFJA 3TJLA 3L5AA 2V81A 3H55A 4G1KA 4UNLA 4MKNA 1WQ5A 2NXHA 2TSYA 3IVTA 3LB0A 1TQJA 3V1PA 1LZOA 3B06A 3WJXA 2VFHA 3BG3A 5FF0A 1LRNA 4RJEA 1PE1A 3A9IA 3UWVA 4HNNA 3IIZA 5LHFA 3GX9A 3VE9A 4DBEA 4AH7A 1KFBA 4K39A 3F03K 4WXYA 4WXZA 4UTJA 4UXDA 1LLWA 4W9TA 3BG9A 3N2MA 1ZNNA 2YX0A 5HWNA 1DHPA 2YW4A 2ZA2A 2HS8A 3LGEA 4CNOA 4MJZA 1G7VA 2B0MA 3S5NA 1IIGA 3NQVA 3CC1A 2NX3A 2Y7DA 1JCXA 1PS9A 5F4WA 1SU5A 4OV4A 2BLEA 1QAPA 5IBXC 2FLIA 3PG8A 3P5YA 3ABQA 4JTIA 5BNKA 3GKFA 1F74A 1VGAA 1FDZA 1KM4A 2E5BA 5D2XA 1XC4A 5F2MA 3NQGA 4NT0A 3O15A 1H7WA 4ZL1A 4PFMA 3UWUA 3YPIA 1G67A 4E38A 3EWZA 3QW3A 4A3UA 4MFEA 3SFKA 3VCRA 3DHFA 5BW6A 1O5XA 5IM51 1LBFA 3DFOA 4XBKA 3BVJA 1TPWA 3PB2A 1L9WA 3IIXA 3NQCA 4NNAA 4JTSA 3RF9A 1C8VA 2ZRZA 3L65A 1HG3A 3EWWA 5I3IA 4NVTA 4O19A 4ZQCA 4UTUA 1ME8A 4U4MA 1X8FA 4JX5A 1GVQA 1WV2A 1GVRA 4BF9A 3S5OA 1FCVA 3W87A 4UFIA 4NJJA 4QM1A 5CPNA 3TU9A 3C4UA 4DQWA 3PWAA 1DBTA 3T7VA 1VCVA 1XXXA 5IBXA 1HO1A 4RR4A 3FKKA 1YXDA 3LTYA 4WOQA 1JRBA 2B7PA 2ATSA 1H7OA 5K4ZA 3S42A 4HHPA 2QUTA 4PH6A 3UNDA 3NL2A 4OWGA 3W71A 3TAKA 4LY8A 1F2JA 1KW1A 4E0CA 3DU0A 3G1XA 3LHUA 4JYDA 4JDBA 1J5TA 1X6UA 3NGJA 4IXXA 5DCBA 1OABA 3T4CA 3TAOA 3TSBA 4XZ9A 2ZZ4A 3VE7A 3S1XA 1I4NA 4GUIA 3RU6A 3C2EA 2WOQA 3I68A 4FNPA 5HUPA 5HWJA 1TMHA 1ZAHA 1O94A 4LNYA 3WJZA 3W86A 3G8EA 1B9BA 2YFOA 4O16A 3BV4A 1W8SA 4FNUA 3GR8A 4E2DA 2NXIA 3MI3A 4X2RA 5AC8A 2QCHA 2CU0A 4CQ8A 3EWXA 5FEPA 3QM3A 4CQAA 3JRKA 2RFGA 2J27A 1ZJIA 2QEZA 5AHNA 3TW7A 1TRDA 1JCLA 2NLIA 1WOBA 2V5BA 3B4UA 4LRTA 5A8GA 1FCBA 1GYLA 1F5ZA 1UBSA 3C2FA 3E12A 4CNNA 3KRZA 4LTSA 5D02A 3W1XA 2GUUA 3I65A 5CZSA 1X1ZA 2ZZ3A 4O52A 2A21A 3LHVA 2E5DA 4YMZA 1OX4B 3MYPA 4LUIA 2A4AA 1LOQA 5G2IA 3P84A 3Q94A 2DJXA 2FB3A 1H62A 3M6YA 4U28A 2Z2UA 3LHWA 1TV8A 1AMKA 1BWKA 3NQ6A 4Q33A 2BWGA 3DFPA 1EWDA 3FOKA 2WV8A 2VKZG 4XTIA 3S9YA 1P1XA 3CWNA 4O10A 3DAQA 1XCFA 3GR7A 1YDVA 1P0NA 5FEXA 1IGSA 3TKFA 3LLFA 4LRSA 3W1AA 2QUUA 1TREA 3M1ZA 5I3KA 4AB4A 1YXYA 2CZFA 1K02A 2VFGA 1GTHA 2EF9A 2V0TA 3HGOA 4GXMA 3SJ3A 4EWND 2CZEA 3W7PA 5I3GA 4UTHA 3SZ8A 4AEOA 1NF0A 2A85A 3PBUA 2FJKA 4UIOA 3TR2A 2Q3RA 5EYWA 1SZFA 3TDFA 3ZWTA 2Q8ZA 3KFTA 3LCIA 3W1MA 4O4WA 2C14A 1EB3A 3U6WA 2CLHA 1U5JA 4LVBA 4WY0A 1FXQA 4UTMA 1AW5A 3M5ZA 5AOUA 5HWMA 2C3ZA 2ABBA 3PULA 3IEBA 1SW3A 4MIMA 4WZHA 2A7NA 1R46A 5GVJA 1G69A 1HO4A 3TMLA 3QEZA 5K9DA 4DO6A 1R47A 4GC4A 3SIZA 4R34A 5LNUA 1GTEA 3ANYA 4NQ1A 2CLLA 4JDYA 3EXRA 3GDRA 1YPIA 5L6UA 1PHQA 1WBJA 2HS6A 4O1BA 2Y6ZA 1B4KA 1KM3A 4JS3A 1Z42A 5A5WA 3IGSA 4IQLA 1TV7A 1JUBA 4HN4A 3SGZA 1EUNA 2VEMA 3NQ2A 3A5VA 2Y70A 4HSNA 3Q58A 2DZWA 2VFDA 3THQA 2NWSA 2VEPA 5D38A 1QPRA 3UYCA 2ZBTA 3LCXA 4UTIA 1KFKA 5D2WA 4UFJA 3THAA 3DGRA 4DF0A 3TE9A 4LS0A 3RNDA 4MY8A 2ZDRA 3GNDA 2QCDA 5D2VA 4ICNA 2CWNA 3HGSA 1HTIA 1QPOA 3VFLA 1QPQA 4WOZA 1SFLA 1EP3A 3EWBX 2DZSA 4I7UA 4CQ9A 3A22A 1OFEA 3GYEA 3O6DA 3W7OA 3VI2A 1A50A 3VKJA 1PHWA 2NX9A 5KTLA 3TV8A 5EKYA 1FCUA 3ABSA 1KA9F 2YDAA 4JGDA 1TJRA 1SO5A 2WPBA 1EEPA 5AFDA 3HJZA 1VS1A 3HOJA 3A24A 1TJPA 4J9JA 1VHCA 3EX4A 3UY8A 2FTPA 1TO3A 3W7RA 2A2IA 2ZRUA 1VYPX 3GDTA 3H54A 5C6MA 3N14A 4UFKA 3C2OA 2G95A 1PCKA 3G0SA 3WFAA 4JNMA 3BGGA 3PC0A 2Y89A 1RV8A 1VJIA 5TQLA 3WJYA 4BI7A 4NJGA 4Z1BA 1UJPA 3T55A 1TYGA 1ICQA 4IOTA 2V8ZA 4JY8A 4ORIA 5MHBA 5EMUA 4MY9A 1Z44A 4JX4A 3BLFA 3PG9A 5CPMA 5L9FA 3FIGA 1FWTA 2QJIA 2H6RA 1FWSA 3TK7A 3V75A 1EA0A 4JYEA 4ALDA 3C2RA 3W1UA 1RPXA 5BOOA 5T26A 5HR6A 2XN2A 3CIWA 5LNVA 3NNTA 4UMBA 5D03A 1QCWA 1W3NA 3G1HA 4LS1A 5G2WA 4FNRA 2F7FA 3S8HA 3B0UX 1TPH1 2Z6JA 1WDWA 3TA6A 1TQXA 3LRLA 3FFSA 4FNQA 3ELFA 1G4EA 1XBXA 3DZ1A 2LLEA 3BLIA 3QYQA 4ZQMA 1XL9A 2TMDA 4DF2A 1I2QA 4PL1A 5LKYA 2FPTA 4OGZA 1Q6QA 4K38A 1IIHA 3EKLA 4EVZA 4JY9A 5G4EA 3W2LA 2P0OA 3NR0A 5D37A 2OZ0A 3QJAA 2DZUA 2JK2A 2GJNA 3TXVA 3DKJA 2VEIA 4HPJA 1O5KA 2QCEA 2NZLA 1TCDA 3QFEA 2Y7FA 2B4GA 1DJNA 1TTJA 1S5VA 2PCQA 1SSGA 3T44A 4C1LA 1GJPA 3HPXA 4JR5A 4O0ZA 3UPBA 4LVFA 3OIXA 4XWUA 1OFAA 3IV3A 2WNQA 1G4PA 1SPQA 4RZ6A 1SO4A 3DI0A 4ADTA 3N9SA 4JTEA 4OU1A 1CX9A 1QNVA 3TFXA 1HUVA 5D05A 3I7RA 1XDMA 3FA5A 3O6YX 1ALDA 1ZCOA 3A21A 3LCFA 5DY3A 1GEQA 3PY2A 1H7RA 1DVJA 2ZZ1A 4ZQRA 2EGZA 2Z0IA 1E51A 1RQHA 2JKEA 3M16A 3PB0A 1XDLA 3ATYA 2PRHA 1LRTA 2XN1A 3MWAA 5G1TA 4X3ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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