The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYFNDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Solution structure of GB1 A34F mutant
rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
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| total genus |
13
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-10-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1F2R I; 2LUM A; 3FIL A; 2JXT A; 2KDM A; 2N9K A; 2ZW1 A; 2N9L A; 2PTL A; 1HZ5 A; 5BMI A; 2K0P A; 5HI1 A; 1QKZ A; 2IGG A; 1JML A; 2I38 A; 4MAC A; 5BMG A; 2GB1 A; 2PLP A; 1EM7 A; 2JSV X; 4GLS C; 4OZC A; 2JWU A; 1IBX A; 1MPE A; 1PGA A; 1MI0 A; 2KN4 A; 1FCC C; 1HEZ E; 2IGH A; 2IGD A; 2GI9 A; 2RPV A; 2KWD A; 1P7E A; 1K50 A; 1GB4 A; 2ZW0 A; 2ONQ A; 2EEL A; 2JU6 X; 1K51 A; 1PGX A; 2NMQ A; 2ON8 A; 1F2R C; 1Q10 A; 2KQ4 X; 1UWX A; 3FIL B; 1IGD A; 5JXV A; 1XCQ L; 1C9F A; 4IOI E; 1FD6 A; 2LHD A; 1K52 A; 2LHE A; 4KGS A; 1MVK A; 4D2K A; 1ZXH A; 1XF5 L; 1IGC A; 4HKZ E; 5BMH A; 4OZA A; 1D4B A; 4KGR A; 1P7F A; 2QMT A; 1FCL A; 1MHH E; 2OED A; 1GB1 A; 2I2Y A; 1HZ6 A; 2QSD A; 5HFY A; 4IKG A; 1YMH E; 2RMM A; 2PW9 A; 4HJG E; 1K53 A; 1YNT E; 3MP9 A; 2LGI A; 1PGB A; 1KH0 A; 1MHX A; 3V3X A; 4WH4 A; 2KAC A; 2N7J A; 3UI3 A; 4KGT A; 3GB1 A; 4OZB A; 2J53 A; 1IBX B; 5HHD G; 2JZP A; 5HG2 A; 1XCT L; 2J52 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2NBU A; 4PT5 A; 3HUI A; 5H92 C; 1DOX A; 1WXV A; 3MJW A; 3MFG A; 1E0Z A; 2JZZ A; 1HZ5 A; 2BYE A; 3SR6 A; 1SXT A; 1XO3 A; 1YD8 U; 3P63 A; 4JWS C; 3N1X C; 1WR1 A; 4FLH A; 4HVB A; 2PMV A; 5D3I B; 1ZDV A; 5GMV A; 1N5X A; 2KLG A; 3NVY A; 1EO6 A; 1VR9 A; 4OZC A; 5I4D A; 4Q2J A; 2G9H D; 4RCO A; 2GBJ A; 2R61 A; 1C4C A; 3B0A A; 3RCZ A; 3JVZ X; 1JWA D; 3RN9 C; 1FXT B; 4HKQ A; 3ENE A; 5EE9 A; 3R7R A; 3WAO A; 1YOV B; 4REZ A; 1QOA A; 2X8X X; 1WMH B; 4PS8 A; 1Q10 A; 1WRI A; 4QAY A; 2KTR B; 2JYE A; 4TMA B; 1C9F A; 3PTF C; 3AED B; 1MJD A; 3A33 B; 2J7Q B; 1T0R C; 2WQY B; 5CHF A; 4WJQ A; 2EMS A; 4IW0 A; 1E90 A; 4EEW A; 2C60 A; 3VH3 B; 1NEK B; 4YSZ B; 3ZIM A; 4I6N B; 3CWI A; 4KIK A; 4W9G A; 4C4V B; 4W9D A; 2QSD A; 5HFY A; 3RT3 B; 4IKG A; 1GOZ A; 2WDT B; 4AOF A; 3NG0 A; 3MP9 A; 3SFD B; 1UUP A; 2LGX A; 1V6E A; 2D3C A; 2DX5 B; 1OQQ A; 4ZHO A; 1WXM A; 1SSN A; 3SEB A; 1FNU A; 3DHG C; 2KYW A; 3Q3J A; 3FC4 A; 2EMT A; 2LUM A; 1UGJ A; 3P1M A; 2MQJ A; 1LO5 D; 4YWG G; 3ZRF A; 4GDK B; 4KV2 A; 2M0X A; 3A9J B; 3GS2 A; 2ZNV B; 3HIZ A; 2WDQ B; 1UH6 A; 2W3S A; 1UBI A; 2BBC A; 3N3K B; 3GZN I; 5CX3 A; 4YTM B; 4DK5 A; 1V80 A; 4C80 A; 2JPH A; 3TBL D; 3H7S A; 5IOI A; 1SF0 A; 1H4R A; 4HWI B; 2IPK D; 4W9E A; 2AL6 A; 4M0W A; 2ON8 A; 3AU4 A; 1EF1 A; 4KSK C; 1F2R C; 4TQ1 A; 2BGF A; 1NVI D; 2D3G A; 3DBR I; 2CKH B; 3T3N A; 5JH5 C; 2IYD B; 4IOI E; 3R2T A; 4GDL A; 3VHT C; 1MVK A; 3EEC A; 3ZXV A; 4I6L B; 5EE0 A; 2BS4 B; 4NAM A; 4NJ6 A; 4DDI D; 3NHE B; 4NAW B; 1XLP A; 2FCS A; 5IA7 A; 2QIL A; 2H88 B; 2LRW A; 1UD7 A; 3PRM B; 1E6E B; 2LVQ A; 3BVG A; 1YNT E; 1ESF A; 3WAP A; 2HTH A; 2V1Y A; 2XEW A; 3RUL A; 1ACC A; 3QAR A; 4FJV B; 4BKS A; 1YN3 A; 3BY4 B; 3NS1 A; 3PSE B; 4EUT A; 1WMH A; 2ZJD A; 1P9D U; 5H8Y E; 1UBQ A; 1XCT L; 3AH7 A; 1WR6 E; 3A9K B; 1FNW A; 2I1K A; 2M1M A; 1JQ4 A; 5GXG B; 3HVD A; 5C23 A; 4OVV A; 2AL3 A; 3JSV B; 1UWM A; 1Z5S B; 2KWC A; 2JXX A; 1QKZ A; 2GLS A; 1UZX B; 1YQ3 B; 4MAC A; 2WDR B; 4F7Z A; 2LEK A; 4XWW A; 1ZGU B; 1WZ0 A; 4HLE A; 4GLS C; 1WX9 A; 1S3S G; 4KZC A; 1UF0 A; 4C4V A; 4XGA B; 3ZXR A; 1V8C A; 2AYO B; 2FCM A; 2V4L A; 1E8Z A; 2V9H A; 2WU2 B; 1GB4 A; 2TSS A; 2A5U A; 2LVP A; 2KO3 A; 3KQ4 A; 3GP7 A; 1KOT A; 1P0R A; 4A90 A; 2INN E; 2MP2 A; 3UQA A; 3Q3N C; 3TUO A; 2AX5 A; 3QX1 A; 1I4G A; 1TIF A; 2AQ1 B; 3VUW A; 4HPM B; 1P3Q U; 1WGK A; 4ARC A; 4GDK A; 2OJW A; 5AUI A; 3P4S B; 3L54 A; 3A9J A; 3B08 A; 4BBN F; 1CMX B; 1N6Z A; 1TS4 A; 4RH6 A; 2K8C A; 2G45 B; 3L16 A; 2LMC A; 3AU5 A; 2D3B A; 3AE2 B; 4MGK E; 2Z0E B; 2C7M B; 1YMH E; 2BYF A; 4HJG E; 3BK1 A; 2MWS B; 4WJN A; 4A6Q A; 3ZNG C; 3EA6 A; 1I4X A; 2IY1 B; 1ISN A; 3BWU D; 1EWY C; 2FAZ A; 3Q14 C; 2LGY A; 1QLB B; 4OVU A; 2KLC A; 1WX8 A; 3GOE A; 4W9L A; 1QIL A; 4XDC A; 3MJ5 A; 1WXS A; 2L32 A; 3ZLZ A; 3ZVV A; 2LAS A; 1T3Q A; 2K0P A; 2KDB A; 1GG3 A; 2GOW A; 3QK0 A; 4WQM A; 5J2R A; 1VD2 A; 2WX1 A; 3EFC A; 2BKF A; 3RPF C; 4J3O D; 2JYT A; 3VR8 B; 4NAW A; 4L1B A; 1FCC C; 1LM8 B; 2BPS A; 4DHJ D; 3QCA A; 1WY8 A; 3O65 B; 1WGY A; 1BT0 A; 2JF5 A; 2K9X A; 1FEH A; 1C1Y B; 3WIM A; 3VRB B; 1YX6 B; 4WIP A; 2VH1 A; 1Y8R C; 1V97 A; 1OEY A; 5KHQ A; 3PT2 B; 2N9X A; 3AE5 B; 5JZE B; 1FO4 A; 2QDF A; 1TS3 A; 3ZJT A; 2PIA A; 3DBH B; 3AE3 B; 3A9K A; 4XC2 A; 1JRO A; 5D7G A; 3W5U B; 2BB6 A; 4NJ7 A; 1XF5 L; 2JVC A; 4RM8 A; 2KJR A; 3LB8 C; 3JSV A; 3TEW A; 2UWQ A; 2HJ8 A; 2BYV E; 3VQI A; 4CHK A; 1C79 A; 3AE8 B; 2K5P A; 5C3J B; 4LNO A; 4E74 A; 4WJO A; 2ICI A; 2WXJ A; 2IY0 B; 2CHW A; 2KKC A; 1AYF A; 2LGI A; 2KWV B; 1NEN B; 1RRB A; 3P4Q B; 2E3T A; 2J53 A; 2QC8 A; 1ZXI A; 2Q5W D; 1RFK A; 2DWQ A; 5D2M B; 2PE9 A; 4HPL B; 1VZ8 A; 3PLU A; 4MSQ B; 3ZRC A; 3U4E G; 2SEB D; 3VRA B; 3QWZ B; 3T8M A; 2N9L A; 5IN7 A; 1L5P A; 2L05 A; 3VFK A; 3NY5 A; 4ZDV A; 1N62 A; 2L52 A; 1VCB A; 1N60 A; 1WWT A; 4WQO B; 1YJJ A; 2CU1 A; 2KAN A; 2CJO A; 3W2D A; 4KKI A; 1XEE A; 4OVZ A; 1ZPS A; 1IBX A; 1MPE A; 2K39 A; 3AEF B; 3NUH B; 1PGA A; 4NPN A; 1SE4 A; 2A4Z A; 4WWO A; 1HEZ E; 4BBN C; 2KZR A; 2L83 A; 3UF8 A; 1QOF A; 5BYQ A; 1T0Q C; 3H7P A; 1IP9 A; 4EZJ A; 1PGX A; 3AE1 B; 3S2A A; 4TKN A; 2K1F A; 4DDG D; 1UWX A; 4S17 A; 4M01 A; 3VVW B; 1WGR A; 3KUZ A; 1WFY A; 4JIO U; 2Y3A A; 3V05 A; 5FR6 A; 4HKZ E; 3NZ3 A; 2LJI A; 4OZA A; 1JW9 D; 3B9J A; 2WYQ A; 2KWU B; 3NS8 A; 3DWG C; 4RGO S; 2C5L C; 1KFY B; 4NQK E; 2IJ0 A; 2WU5 B; 4BKS D; 1HE8 A; 2AEH A; 2WWZ A; 1N5W A; 1KTK A; 1K53 A; 1FRD A; 1J7C A; 2UU7 A; 2WXN A; 3DVG Y; 1SGH A; 1QF6 A; 2ZZP B; 3ZDT A; 1CK1 A; 1VRA B; 1MG4 A; 4HJK A; 2MJD A; 1WZ3 A; 3BZD B; 3IXS A; 2GRI A; 2DNF A; 2W9N A; 4G11 A; 4HEA 1; 4EZK A; 2FE8 A; 2MBQ A; 1V5T A; 2JRI B; 5DPW A; 4XDD A; 1I4P A; 4FBJ B; 1HXY D; 3IAM 1; 3ONS A; 3N9Y C; 3VTV A; 3Q8E A; 2OOB B; 1QOB A; 1CQV A; 3CST A; 3A4R A; 4ZRK A; 1I4H A; 4ZHP A; 2N4F A; 4B95 A; 1R4N B; 5BO4 B; 2R2O A; 3Q69 A; 2KX0 A; 3AUL A; 1YQ4 B; 4GDL B; 2J0M A; 3U7D A; 1E8W A; 1SEB D; 2KN5 A; 4WWN A; 1LFD A; 4MEM A; 5L83 A; 2WXO A; 2C7H A; 1J8C A; 2IO2 B; 4ANV A; 4DXG A; 4IM0 A; 2KFJ A; 4BOZ B; 3OLM D; 1NI2 A; 3L10 B; 4JE3 B; 1PUT A; 1OGW A; 3KUD B; 1FMA D; 3AI5 A; 2WXK A; 2RSU A; 1B9R A; 3FKY A; 2D5G A; 1VZ7 A; 4BOS C; 2FIF A; 1DOI A; 3KVF B; 4PS7 A; 4ACF A; 2BWE S; 1S1Q B; 1SJE D; 3IBE A; 2PJH A; 3L13 A; 2ZEQ A; 3I9V 1; 3QIJ A; 2KAJ A; 2I2Y A; 4ZRQ A; 3OAW A; 4RGT A; 2JY6 A; 2K6D B; 5IP4 D; 2Y5B B; 2NS5 A; 2KMC A; 2ZNV C; 3Q8B A; 4BKT A; 1MHX A; 2JX5 A; 3R3M A; 3VDZ A; 1OQR A; 4IUM B; 1NYR A; 4K7S A; 3GB1 A; 3W1S A; 1D5Z C; 1JAL A; 2XN9 C; 4AJY B; 2ASQ A; 1Z2M A; 5CHW A; 5L95 C; 2LJ5 A; 2BT6 A; 4W9K A; 2V3N A; 3KUC B; 2K3U A; 3DWM A; 4AQ7 A; 4DXF A; 2KDM A; 2N9K A; 3AXC A; 1YN5 A; 1WIA A; 1ZKH A; 2MEK A; 1TGZ B; 1MFW A; 2J0J A; 1SE3 A; 4FUL A; 5G55 A; 3UIP B; 2CR5 A; 3QC8 B; 1V1O A; 3UQB A; 1SIJ A; 3BYY B; 2ZPN A; 3APC A; 4AUQ C; 4EZL A; 1BUI C; 2IO3 B; 2JWU A; 2MP2 B; 2WGS A; 2DBY A; 5D6J B; 4TUU A; 1C77 A; 3AEA B; 2KN4 A; 1UNS A; 1C4A A; 4US9 A; 4JLC A; 3P2B A; 5C2T B; 2DAJ A; 1L4D B; 3ZUN A; 3DVN U; 3RNE C; 1WM3 A; 2DYO A; 2L8J A; 2OJR A; 1N63 A; 5LXI B; 4GGQ A; 5AUK A; 1GPX A; 1C3T A; 1XT9 B; 1FPY A; 1DGJ A; 1NDD A; 3DBS A; 5E6N A; 1F52 A; 3M63 B; 2LHD A; 2LUE A; 3AE7 B; 2M0A A; 1ZXH A; 4JX1 C; 4LJO B; 3UIO B; 4UDU C; 4X57 B; 3VTU A; 1GAQ B; 3ETR A; 4WWP A; 1QT9 A; 1TBE A; 2WXP A; 4L2Y A; 4W9F A; 2M56 B; 3NRZ A; 2RMM A; 1V86 A; 1WJ6 A; 2RR9 A; 4A8X C; 1F1H A; 4BFR A; 4LK0 M; 1WGG A; 1PGB A; 3V3X A; 3Q6B A; 2MJE A; 3AE4 B; 2FBW B; 2VZK B; 1I42 A; 2HJ1 A; 1I4Q A; 5E6P A; 3X0W A; 2Y5C A; 2KVR A; 3A4S C; 1V2Y A; 3Q2A C; 1BXT A; 4EKU A; 1TYG B; 4FJY A; 2JXT A; 4OW0 A; 2D3A A; 2M4N A; 3LDZ E; 1WXA A; 4DWF A; 1LGR A; 3AB5 A; 1SIF A; 3PZD A; 5BMG A; 4M02 A; 2PVO D; 1HA5 A; 3AN1 A; 4DQO C; 3J9C A; 5EDS A; 3DVG X; 3QAQ A; 1EUV B; 2VH2 A; 4LDT B; 3DVN V; 2KDE B; 2DEN B; 1JWU D; 4NQL B; 3RZW C; 4GOC A; 4ASW C; 4EE2 A; 4M8M A; 4DHZ E; 3IFW B; 1DYQ A; 1HQR D; 4LTU A; 3U52 E; 1D5M C; 2FCQ A; 4FAD A; 1E5W A; 2WLB A; 3QA8 A; 4ITK A; 1R4N I; 4B6W A; 2AWT A; 2JRH A; 4W9C A; 4URK A; 2SAK A; 1KRH A; 1UEL A; 1YJI A; 2YVC A; 4A3O A; 2IND C; 4CQN A; 1FIQ A; 2GBR A; 2ZVN A; 1HTO A; 1P7F A; 1L0X B; 4FJZ A; 2B3A A; 1ZW7 A; 3RFZ B; 1Q0W B; 4LNF A; 3OJ4 B; 2MLB A; 4G0N B; 4M8N A; 3D32 A; 2WNM A; 3GE3 C; 3ZNH B; 2QHO A; 2W82 A; 3APF A; 1D3Z A; 4KX6 B; 4A55 A; 2NBW B; 1FM0 D; 4YL8 A; 4MJS A; 4XWT A; 1TT5 B; 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2D2Q A; 1RAX A; 4P16 A; 3SHQ A; 5EE3 A; 1WI0 A; 2G4D B; 2KTF A; 5D3D A; 1GNU A; 1STE A; 1PDX A; 4WAF A; 1XD3 B; 2BWF A; 3Q3O C; 3BVZ A; 2K25 A; 2O6V B; 3RNG C; 1LQB A; 1T6B X; 2IGD A; 3EGR A; 4YTP B; 2GI9 A; 2V4I B; 5AZG A; 2MH7 A; 3B2F A; 4CYE A; 5DPR A; 2LGS A; 3VAW A; 3KWV A; 2Z0D B; 2ONQ A; 4R3D A; 2WXL A; 3SDL C; 3ZTC A; 2KQ4 X; 1L0Y B; 2L0T A; 1T0S C; 1N61 A; 2N7D A; 2M17 A; 4P7I A; 1JRU A; 2ZCB A; 2WXF A; 3PGE A; 3DDC B; 4HDO A; 2W3R A; 2RD0 A; 3APD A; 1PFD A; 2YEP B; 4KDL B; 3GZN B; 5BMH A; 2NCN A; 1D4B A; 2QMT A; 3K9O B; 2NR2 A; 1MHH E; 2KFK B; 2OED A; 1C4P A; 2XK5 B; 5G2N A; 1XLQ A; 2KJ6 A; 4H2A A; 3ZTD A; 1R7S A; 3OG5 A; 2DZJ A; 1KLV A; 4I6P A; 1M94 A; 3RZF A; 4N6E B; 2WXI A; 1TKY A; 3DBR B; 4O1N A; 2I1J A; 4KGT A; 4OZB A; 2OHF A; 3EC8 A; 1WJ4 A; 4B9K A; 3RNF C; 1Q1O A; 3FIL A; 3VR9 B; 3RMK C; 3HHM A; 1QZE A; 2XNA C; 3PVL A; 1VLB A; 5EE1 A; 1UGM A; 4G3X B; 1CZP A; 1TZ1 A; 4ANU A; 4LLG M; 3W1Y A; 3ZNI D; 2I38 A; 3GE8 C; 5E6O A; 4FA6 A; 2LRU A; 2H89 B; 3DOW A; 3IT4 B; 3Q3F A; 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