2UWFA

Crystal structure of family 10 xylanase from bacillus halodurans
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
356
structure length
356
Chain Sequence
NQPFAWQVASLSERYQEQFDIGAAVEPYQLEGRQAQILKHHYNSLVAENAMKPVSLQPREGEWNWEGADKIVEFARKHNMELRFHTLVWHSQVPEWFFIDENGNRMVDETDPEKRKANKQLLLERMENHIKTVVERYKDDVTSWDVVNEVIDDDGGLRESEWYQITGTDYIKVAFETARKYGGEEAKLYINDYNTEVPSKRDDLYNLVKDLLEQGVPIDGVGHQSHIQIGWPSIEDTRASFEKFTSLGLDNQVTELDMSLYGWPPTGAYTSYDDIPEELFQAQADRYDQLFELYEELSATISSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNNGVGVDAPFVFDHNYRVKPAYWRIIDHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ALKALINE ACTIVE ENDOXYLANASE
publication title An Alkaline Active Xylanase: Insights Into Mechanisms of High Ph Catalytic Adaptation
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus halodurans
total genus 135
structure length 356
sequence length 356
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2007-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2uwfA00
1VIWA 2B31A 5CLTA 3ARUA 5LA2A 3WDPP 5CLWA 1JAKA 3EDJA 4AYSA 3VX1A 4U31A 1HKJA 1E40A 2VX4A 4WF7A 1JZ4A 1PZ3A 5A69A 1J11A 5EB8A 1FOBA 1UWSA 2DSUA 1JZ3A 3AMCA 1GQIA 3CZJA 3WF1A 4DM2A 1KGWA 1E6RA 4AY1A 3E1F1 5E0CA 1JZ6A 1ITXA 2YL9A 3A6OA 2GJPA 1C8XA 4J27A 1UKPA 2D20A 2VZUA 1CXHA 1UZ4A 2VX7A 4AD1A 3F4VA 3VINA 1KQYA 3DHPA 3VIIA 1FH8A 2VZVA 3ZMRA 1QPKA 3T08A 3WNPA 4UQBA 3WF0A 3II1A 2D2OA 2ZXDA 1J10A 2NSXA 1JL8A 2GJRA 2DGAA 4UOQA 1W3HA 3FHQA 4CD4A 1DP0A 1FH7A 1B3ZA 1W2VA 4PTMA 4Z2KA 1GVYA 4HMEA 2YA0A 1JNEA 4XB3A 3WF3A 3WBAA 1WZMA 2E3ZA 4PTWA 1UR1A 2TAAA 3NCOA 3UESA 1E5JA 1C8QA 1R86A 1QBAA 4YHEA 3QOMA 1W3JA 1K9TA 2YLAA 1GOKA 3ZJ6A 1GQLA 1CXKA 1ZBWA 3AIVA 2J8FA 4QLKA 1KXQA 4M8UA 1HIZA 1UD3A 4GZJA 6TAAA 3BAYA 2FHCA 1E6SM 1ZBKA 4KH2A 4DWSA 2J75A 5IXEA 3GDBA 2OYMA 5BXTA 1LWHA 3KL3A 3QHNA 4MB1A 1B90A 2WAGA 1BAGA 3MUAA 1D7FA 1G01A 3VD5A 3N1AA 4E2OA 4R5EA 3M07A 3AMKA 2OYLA 1QI5A 1XSJA 2UWFA 1TR1A 1EGZA 4AZHA 4URIA 2HVMA 5TD4A 1J0KA 4W5ZA 1J0YA 2VC9A 3AHXA 2DDXA 1H11A 1CENA 3WUEA 4ACZA 4NF7A 1E4LA 2ZICA 1E56A 3O2LA 4OBRA 1XYFA 2VR4A 1C7TA 3TP4A 2W67A 3F5LA 2YDQA 3TOPA 7TAAA 3PZQA 2WHJA 2C8NA 2VTFA 1WZLA 3WIJA 1GQKA 4H8HA 2VQTA 2DH3A 4AD3A 2YOCA 1W9UA 2X05A 3WNNA 3WUFA 1E71M 1QW9A 4A3YA 3VIKA 2DSKA 3MV11 3EMCA 1MXDA 1E6QM 2WMJA 3GXFA 1UQZA 3PHAA 2G4FA 3PZOA 5E6YA 2ZUMA 5D4YA 3VIFA 4LX4A 4DWSB 2D0GA 2WZHA 1JD9A 1JDCA 3DYMA 1K9EA 2PBGA 2WMFA 3MUZ1 1FFRA 2IUZA 2QHAA 3LPOA 1OD8A 3IANA 1DWJM 3SCSA 1W2PA 1ZU8A 2OWCA 1CGVA 5DF0A 2WMGA 1GOIA 1XH0A 3SCNA 1HNYA 1MQPA 4TVUA 1AQHA 1M01A 3B9EA 2XIIA 4PTXA 1NWRA 2FHFA 4MAVA 1M04A 1HP5A 3L2LA 4PBGA 2XVGA 4AIEA 1UR9A 3OA5A 1XCWA 3TONA 2Y5EA 4W86A 1LLOA 2A3AA 4NSBA 3POCA 2X2YA 3MU7A 4J3VA 1B3VA 2GSJA 2WMKA 3L4WA 5C71A 3GNRA 4PMXA 3OZPA 1OB0A 1B1YA 5F7UA 2F61A 3S2CA 5HOSA 4WKAA 5AY7A 1XRVA 1J9YA 1CWYA 2VRKA 3RPMA 4TVCA 2W66A 3AS1A 2OWXA 4ZE4A 4CU7A 3WF2A 4UFMA 4N42A 5CSYA 3CH9A 2BY1A 2CKSA 3WQ4A 5CGMA 1J0ZA 2PC8A 3AYSA 4K68A 1EIBA 3T0DA 3NDYA 2W4XA 3WN6A 3ZQ9A 5FIPA 4B15A 4ATWA 2WWCA 3AI0A 3WH9A 5GPRA 1UD8A 3ARTA 4GZEA 3WMCA 3L4UA 5A8OA 3N04A 1ISYA 2V3DA 1QNPA 4UNIA 2XGIA 2DEPA 4MDPA 2X8RA 4Z2LA 2XFRA 3WQ5A 4QAWA 5A2BA 3DYPA 2Z1KA 3W26A 1QNOA 2QPSA 2BY0A 4NRRA 2WVUA 3ZJ8A 5BYWA 3UR7A 4DWSC 3A4AA 3TA9A 1EQCA 3K8LA 1PPIA 1NARA 1B3YA 5FD0A 4D6JA 2ZXBA 1U33A 3M6DA 3VGGA 3PTQA 3HMCA 1G94A 1PX8A 1OD0A 4YPJA 5BXSA 1TA3A 1PBGA 5JUVA 4X9YA 4D6CA 3UCQA 2IXVA 2CHOA 2E8YA 4GXPA 1XYZA 1AVAA 3AIQA 3WMSA 2V5CA 4A3HA 1MWOA 2XYLA 3ZOAA 2YBUA 4TVDA 1BG4A 3OGVA 4UCFA 1J0HA 3U7BA 3WH6A 3ARSA 1CECA 1WZKA 2QF8A 3CO4A 1E9LA 1U2YA 5D8ZA 1M7XA 1KR0A 3O6AA 3IAPA 3BXWA 2DT0A 1GQJA 2EO7A 2BVYA 4CVWA 3VDCA 2DIEA 3WQ8A 3F5JA 1PX4A 5CSUA 2WWDA 3G6MA 3WH8A 2G3JA 2WHLA 3CHEA 1S46A 3AHVA 2D23A 3AYRA 2XFYA 1UWRA 2G3NA 3GBEA 3VGFA 4JIEA 1XH2A 2W91A 4PCSA 1WE5A 3LPGA 2FH6A 1LG1A 1E55A 2E40A 3AHYA 1P6WA 3WQWA 1Z32X 1W9BM 4XX6A 4B3LA 3DC0A 3WEMA 3WF4A 1YQ2A 3PZVA 1FHDA 2IXUA 1C90A 1K9FA 1ZBVA 2FHBA 3CLWA 4PN2A 4UOJA 5E0FA 4ZFMA 2GFTA 4D1IA 1WCGA 1TA3B 3PZNA 1V08A 3N13A 1JAEA 1KBBA 5A6KA 1LQ0A 1OIMA 4U3CA 2YL5A 1DEDA 3OGSA 3M7SA 2JE8A 1E0XA 1Y7VA 6A3HA 1O7AA 4GI9A 4WKHA 2CPUA 2XM1A 2EXOA 3VDBA 3GXMA 3VO0A 5C8BB 1PEZA 2XWEA 1BF2A 3SIMA 1CIUA 1E6XM 4LXFA 3VNYA 3A3HA 4B16A 1R7OA 5A8MA 2QV4A 5A1AA 3EMZA 5I78A 3TTSA 4M80A 4EANA 1V6UA 1WKYA 3VIJA 4TX6A 2G3IA 1X1NA 1JYWA 2WPGA 2WC3A 4D6IA 4WKFA 1NP0A 2PWFA 1MW1A 1QNSA 4WSKA 3WQ6A 4HA1A 3ZJKA 2WMIA 4LYRA 5D9OA 1NOUA 3POHA 2VJXA 1HP4A 2JALA 2ZX8A 1UG6A 3CZEA 3CIVA 1GHSA 1E15A 1DTUA 1E3XA 1E73M 1NQ6A 4D6DA 1TZ7A 3U57A 1EDQA 4OOZA 3RM9A 2ZE0A 1M03A 1HX0A 4CVUA 2PWDA 3ZSTA 2WNWA 1LL6A 3BC9A 4LYPA 4HOWA 1CGXA 1ISVA 2J74A 2WCAA 2ZWZA 1QI2A 4GKLA 4BZYA 2EPMX 2X0HA 4KGLA 1CGYA 2J7GA 4UFJA 2VT0A 3B9DA 5E6ZA 4AD4A 1BSIA 1HJVA 3VMPA 4OBSA 5JIWA 3CMGA 2J62A 1BVZA 4FMVA 1TUXA 3VMNA 4GQQA 1BYBA 4JHZA 2Y8VA 1K9DA 3SUUA 1B0IA 2XSAA 4W93A 1QNQA 1UH4A 4RE2A 4JFTA 4TUFA 4D72A 4XZWA 1FH9A 4IISA 3CPUA 1R7AA 1KGXA 4W89A 1UKQA 5CPSA 2XHYA 3O9NA 3WL1A 4D6FA 9CGTA 4JL2A 1UKTA 2ZWYA 2RGLA 4JCMA 5A8QA 3PN8A 1E6NA 2G3MA 3G6LA 3I3DA 4GZIA 5AYIA 1DWFM 2CCRA 3FAXA 2WMIB 3GH4A 1KR1A 2X1IA 3ZSSA 3UERA 4PSRA 5D9PA 4CD5A 4AZ5A 4F9DA 4C7GA 2O9RA 1GOMA 1HL8A 1PIGA 2J79A 3U5UA 4CCCA 4PYSA 4UFLA 2XIBA 3SUSA 1YHTA 2UY4A 2WBKA 2J77A 4UQCA 3WEZA 1VBRA 2WSPA 2XFFA 4HZ6A 4WSJA 1GCYA 4HZ7A 1VAHA 3EDKA 4M81A 4OOUA 4L4PA 3OLIA 1D2KA 3BLPX 2D3LA 2BXZA 3ZJ7A 1EA9C 3NUKA 2VCAA 5E70A 5CG0A 3ARVA 3UG3A 1G9HA 3PZTA 2W63A 1BVNP 3QHOA 3NSNA 4EK7A 2VVSA 2DPEA 2VZSA 1VEPA 3EBVA 5BROA 1XD1A 1QW8A 2BVDA 4W88A 2DSVA 3EDEA 3T2OA 1UD4A 2ZUNA 5LYRA 1V3MA 5I5RA 2J8GA 4U33A 3CHDA 3PZIA 1JDAA 4FLQA 3BAKA 3ARQA 1WO2A 3AFBA 3D5HA 3AZSA 1GVIA 5JBDA 1CEOA 1V6VA 1JF5A 1HKIA 3N15A 3FY1A 4P7NA 1O6IA 4PUDA 6CGTA 5DMYA 3ZIZA 4IPNB 4TTGA 5ABEA 1XSKA 3U7VA 4RE3A 3TTQA 1ESWA 3KEHA 3N9KA 1TCMA 1HXJA 2YIHA 3AICA 1LL4A 3DHUA 1UD2A 3RJXA 4HU0A 4J3TA 3OLGA 4UFIA 1Q6CA 3PTKA 1XH1A 1VB9A 4P8WA 3GXIA 1VJSA 3MV01 1BGAA 1R85A 2CERA 4FLSA 4D6EA 1I1WA 3AMLA 2O9PA 2CNCA 2EPOA 3RM4A 3VIMA 3AIUA 3K1DA 4UZUA 1E6ZA 1GONA 2GVYA 4WLCA 1BG9A 4MB3A 4QLJA 3UETA 3EDFA 1JXJA 2VUYA 2WSKA 3M46A 1TMQA 2PB1A 3WNMA 5FOOA 3GNPA 3AJ7A 2WK2A 1QI0A 5JBFA 2C0HA 2J7DA 1H5VA 3K8MA 2BXYA 2VX5A 5D9MA 1UR8A 1GHRA 4PRWA 1NWTA 1CBGA 4AZGA 2YKKA 3W6LA 1X6NA 1W9DM 2UY2A 4B9ZA 1IZKA 4F9JA 3HJEA 4JCLA 1CXFA 2BHUA 3K4AA 5A6BD 4AZ7A 3EYPA 5BXPA 3KE0A 3RILA 2VMFA 3L4XA 4M29A 3AHZA 1PX3A 4MNJA 3WD2A 3IK2A 4ZENA 2VZTA 1W32A 2PWHA 1RH9A 4JKMA 3OIHA 3T0AA 2BHYA 4KRUA 1UH2A 2WM0A 1W1PA 1UKSA 1C92A 1HT6A 3J7HA 1G1YA 3W4RA 3B8SA 2CETA 1HJSA 2BY3A 3WEOA 4PMNA 3VPLA 4OUEA 1JYVA 5M5DA 3GYCA 1Q6EA 1B3XA 1KFWA 1B31A 4AXNA 1KXTA 1Q6GA 1V6XA 5I23A 1M53A 2XWDA 2XVLA 4CKQA 2JIWA 4AISA 2E9MA 5I24A 3BH4A 2VI0A 8CGTA 1B9ZA 2D0HA 1NH6A 1HJXA 1WDSA 2Y2WA 2YDRA 3VUPA 1I75A 3ARPA 4BF7A 3L4YA 1IZJA 1LF1A 4GIAA 1KXVA 4W87A 1LJYA 4IM4A 1N82A 4GINA 4DUVA 4ACZB 3VX0A 1I1XA 3VILA 1GUVA 5CGTA 1J18A 3BCFA 4CD8A 3BMWA 1E43A 2ZUWA 3WMBA 1HN1A 1VFOA 4CUCA 3K46A 4CD7A 2XSBA 3VGHA 1LL7A 4EAMA 2VRQA 1UUQA 2XVPA 3BLKA 2FH8A 3U5YA 2WZIA 4B3KA 5M17A 1EHAA 5HPOA 1JFHA 4CCEA 4ZXOA 3ZM8A 1UWUA 4JKKA 2DIJA 4LYQA 2PWEA 1CYGA 1EXPA 3CHCA 4MB5A 2V5DA 1JZ2A 1UD5A 1AQMA 4CN6A 5KEZA 1V6WA 4Z2GA 3VDAA 4XZBA 1CXIA 5A6JA 1KCKA 4W8LA 4P8UA 1G0CA 3AXXA 2VRJA 1JG9A 2CXGA 3SCPA 5HDRA 2CBUA 2VOTA 4QLLA 5A8PA 1TVPA 4GI6A 4UFKA 1PAMA 4AZIA 3BCDA 5IHSA 1MFUA 4MNMA 3VKKA 1TFVA 1J12A 4TTUA 1W9XA 1WZAA 2OSYA 3L4ZA 5A2AA 3BAWA 3VTRA 3AQUA 3BMVA 1RP9A 1DWGM 1J01A 1HF6A 2QMJA 1US2A 3VIHA 1H0IA 1OGSA 2J7EA 3N11A 1UZ1A 3NDZA 1F4AA 4JFSA 5ABHA 1JYXA 2RGMA 1V6YA 3K4DA 1DWAM 1U30A 4V2XA 4MDOA 3PTMA 4MNKA 3WH7A 1QHOA 3WUBA 2XVNA 3IJ9A 3AIRA 3MO4A 5I77A 1KWGA 1E4IA 3BGAA 3WSUA 4UFHA 1WDQA 2BHZA 3HN3A 1KGUA 1V3JA 4LGXA 4AD5A 2WVVA 1H1NA 2WB5A 4CN4A 1ISZA 1G5AA 2YLLA 3AXIA 1C3FA 1QHPA 1EO5A 1W1YA 1MQQA 2CBJA 3ARXA 1OT2A 4IPLA 4OZOA 1EHNA 2GDVA 3WELA 2O9TA 1NOFA 2W62A 3CMJA 1OBAA 2E9LA 3WDIA 4HPHA 5IHRA 3GZAA 3VGBA 4HOXA 4JFWA 4B9YA 2A3BA 1GOWA 1SMDA 1NOWA 4PMOA 1UHVA 3ALGA 1QVBA 3MANA 1OCQA 1L8NA 3OLDA 2DH2A 3CHFA 5AC5A 4W84A 2PF0A 1H49A 2J7BA 4U5KA 3NYDA 4KMQA 3AOFA 1MQRA 3LPPA 1WB0A 2QLYA 1QI3A 2XGBA 4AIUA 1HL9A 1FFQA 4MPKA 2VQUA 1VRXA 3VGEA 4H8UA 3AHTA 1W3LA 2J7FA 2BNJA 3ARRA 4M24A 3TTYA 4M82A 2GJXA 2CEQA 3APGA 1DWIM 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VIW A;  2B31 A;  5CLT A;  3ARU A;  5LA2 A;  3WDP P;  5CLW A;  1JAK A;  3EDJ A;  4AYS A;  3VX1 A;  4U31 A;  1HKJ A;  1E40 A;  2VX4 A;  4WF7 A;  1JZ4 A;  1PZ3 A;  5A69 A;  1J11 A;  5EB8 A;  1FOB A;  1UWS A;  2DSU A;  1JZ3 A;  3AMC A;  1GQI A;  3CZJ A;  3WF1 A;  4DM2 A;  1KGW A;  1E6R A;  4AY1 A;  3E1F 1;  5E0C A;  1JZ6 A;  1ITX A;  2YL9 A;  3A6O A;  2GJP A;  1C8X A;  4J27 A;  1UKP A;  2D20 A;  2VZU A;  1CXH A;  1UZ4 A;  2VX7 A;  4AD1 A;  3F4V A;  3VIN A;  1KQY A;  3DHP A;  3VII A;  1FH8 A;  2VZV A;  3ZMR A;  1QPK A;  3T08 A;  3WNP A;  4UQB A;  3WF0 A;  3II1 A;  2D2O A;  2ZXD A;  1J10 A;  2NSX A;  1JL8 A;  2GJR A;  2DGA A;  4UOQ A;  1W3H A;  3FHQ A;  4CD4 A;  1DP0 A;  1FH7 A;  1B3Z A;  1W2V A;  4PTM A;  4Z2K A;  1GVY A;  4HME A;  2YA0 A;  1JNE A;  4XB3 A;  3WF3 A;  3WBA A;  1WZM A;  2E3Z A;  4PTW A;  1UR1 A;  2TAA A;  3NCO A;  3UES A;  1E5J A;  1C8Q A;  1R86 A;  1QBA A;  4YHE A;  3QOM A;  1W3J A;  1K9T A;  2YLA A;  1GOK A;  3ZJ6 A;  1GQL A;  1CXK A;  1ZBW A;  3AIV A;  2J8F A;  4QLK A;  1KXQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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