The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GMERGIVQYDFMAESQDELTIKSGDKVYILDDKKSKDWWMCQLVDSGKSGLVPAQFIEPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| molecule keywords |
CYTOSKELETON ASSEMBLY CONTROL PROTEIN SLA1
|
| publication title |
Structural Genomics of Yeast SH3 Domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
12
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-05-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1B07 A; 3EHR A; 1X69 A; 1Z9Q A; 3M0P A; 2YUO A; 1WYX A; 2KT1 A; 4LUE A; 2CH4 A; 1W70 A; 2GTJ A; 2YSQ A; 2KEA A; 3VS5 A; 2PZ1 A; 1M8M A; 2DM1 A; 1OOT A; 1GCQ C; 2EBP A; 2QDL A; 1FYN A; 3PVQ A; 3M0S A; 5EC7 A; 1RLP C; 4OMP A; 2V1Q A; 2EPD A; 1T3L A; 4LUD A; 2LQN A; 2OI3 A; 3VS3 A; 1UEC A; 3UA6 A; 2RPN A; 4Y92 A; 4OMN A; 1WX6 A; 2JMA A; 3SEM A; 3FJ5 A; 3RBB B; 4LNP A; 2KT8 A; 5FWC A; 2EVR A; 2CUB A; 2L3Q A; 1K4U S; 2FO0 A; 1PKT A; 2MIO A; 3TSZ A; 4J9B A; 4Z89 A; 4J9D A; 1U06 A; 2H8H A; 4KRT A; 4RTV A; 2ECZ A; 2LMJ A; 4D8D A; 2HDA A; 2L3S A; 2KYM A; 5I11 A; 1NYF A; 2LQW A; 1E6H A; 4EIK A; 4R0K A; 2X3W D; 3RNJ A; 2FG0 A; 1UG1 A; 2JS0 A; 2SEM A; 1UUE A; 5HCK A; 2C0O A; 3VS6 A; 4JJB A; 2DVJ A; 5I22 A; 4JJD A; 1B3Q A; 1QKW A; 2JTE A; 1GFD A; 2VVK A; 4DEY A; 2M0Y A; 3PE0 A; 3UF4 A; 1V1C A; 1AD5 A; 2LJ1 A; 1AVZ C; 1PNJ A; 1H92 A; 2MOX A; 4LN2 A; 2L2P A; 1M30 A; 2A37 A; 2F2W A; 2ROT A; 1H3H A; 2NUZ A; 1OPK A; 4J9F A; 2YUP A; 1PKS A; 1WXU A; 2DF6 A; 2CSQ A; 1T0J A; 4OML A; 3UAT A; 2FPF A; 2DA9 A; 5IXF A; 2CT3 A; 2K7A A; 3LH5 A; 1KSW A; 2DL5 A; 1X2K A; 3H0I A; 2KRN A; 1NLP C; 3I9Q A; 5GJW B; 4CC3 A; 1AWX A; 2FEI A; 2AKK A; 1YWP A; 2EYY A; 2CRE A; 3I5R A; 3M0T A; 2D8J A; 3UA7 A; 1ZLM A; 1AZG B; 5L23 A; 1VYV A; 2K3B A; 2DBM A; 2DL8 A; 4GLM A; 2O9V A; 1ABO A; 1TUD A; 1MUZ A; 1JQQ A; 2KXC A; 5IHK A; 3TVT A; 2FRW A; 4JPB W; 3M0R A; 1QCF A; 1MV0 B; 3EHQ A; 1T0H A; 3NPF A; 2OJ2 A; 2ESW A; 1OV3 A; 2J7I A; 2O9S A; 3IQL A; 2EKH A; 2B86 A; 2KRM A; 3EG1 A; 3VS4 A; 2ENM A; 2KRS A; 4RTT A; 4HVU A; 2RQW A; 1K0S A; 2GTO A; 2BZ8 A; 3ZL7 C; 3C0C A; 4AFQ C; 1KIK A; 2KGT A; 2VWF A; 3SHW A; 1RLQ C; 4FSS A; 1UHF A; 3U23 A; 1PRL C; 4JZ3 A; 1YP5 A; 2JMC A; 4GBQ A; 1NLO C; 1JO8 A; 1GRI A; 1T3S A; 1QLY A; 1WLP B; 3M0Q A; 4LE9 A; 2K6D A; 3VRY A; 1KJW A; 2NWM A; 4ESR A; 2HSP A; 2K79 A; 4AFZ C; 2D0N A; 2J6F A; 2EGC A; 2AZS A; 2EW3 A; 2EYW A; 4RTZ A; 1ZX6 A; 1VA7 A; 1SRM A; 2FRY A; 1GBQ A; 4RTU A; 1ZUY A; 2DLP A; 4X1V A; 2J05 A; 2JT4 A; 1FMK A; 1WDX A; 4RTW A; 2KBT A; 4IIM A; 2DRM A; 2A08 A; 4J9H A; 3EG3 A; 2AK5 A; 2EYX A; 3I35 A; 2O2O A; 2M51 A; 2GNC A; 2DBK A; 2D8H A; 1GFC A; 2RNA A; 1BU1 A; 1U5S A; 3ULR B; 1OEB A; 3VS0 A; 2P4R A; 3H41 A; 2DX1 A; 5IHN A; 1M3C A; 1JXO A; 2I0N A; 1ZUU A; 3KFV A; 1X6B A; 4E6R A; 1YCS B; 1NEB A; 1TUC A; 4AG2 C; 2LNH B; 3VS2 A; 1K0X A; 1Z9Z A; 2ROL A; 2YUQ A; 2CH4 W; 4OMO A; 2J6K A; 2CUD A; 2KYB A; 2LJ0 A; 1Y57 A; 4RUG A; 2F2X A; 1I0C A; 2D1X A; 2HCK A; 1UJY A; 2GGR A; 3NHN A; 2KE9 A; 4RTX A; 1K9A A; 2JS2 A; 3QWY A; 4F14 A; 4F16 A; 1YN8 A; 2L0A A; 3VS1 A; 4AFS C; 3QWX X; 2DJQ A; 4JZ4 A; 1JXM A; 3VS7 A; 1ZBJ A; 1WIE A; 4CC4 B; 1J3T A; 2EGE A; 2X3X D; 4J9I A; 4D8K A; 1UJ0 A; 2G6F X; 2FPD A; 4CC7 A; 2BTT A; 1AEY A; 2XMF A; 1K1Z A; 1M3A A; 2KNB B; 1X27 A; 1PWT A; 1HSQ A; 1H8K A; 1X2Q A; 2DE0 X; 4HVW A; 1UE9 A; 4A63 B; 2BZX A; 1UDL A; 1HD3 A; 2DNU A; 4HVV A; 4AG1 C; 1JU5 C; 1W1F A; 4OMM A; 1PRM C; 4Z8A A; 3M0U A; 2J06 A; 2DYB A; 2RF0 A; 5FWB A; 2W10 A; 1NG2 A; 2LJ3 A; 2LP5 A; 2RQV A; 3EGU A; 1GCQ A; 1SHG A; 3TSW A; 3A98 A; 1AZE A; 1VYU A; 2A36 A; 2RN8 A; 1WXB A; 4QT7 A; 1SSH A; 1WA7 A; 2LCS A; 2LX7 A; 1M3B A; 2JXB A; 2A28 A; 4ORZ A; 2DMO A; 1HJD A; 1JEG A; 3H0F A; 2J6O A; 1GCP A; 1CSK A; 1Y0M A; 1K76 A; 1ZSG A; 4J9E A; 1AWO A; 1W6X A; 4HCK A; 3PVL A; 2FPE A; 1I1J A; 1SHF A; 2RQR A; 2K9G A; 2E5K A; 5IH2 A; 2BZY A; 1WFW A; 2CSI A; 2RQU A; 1GL5 A; 1UGV A; 3GBQ A; 2EYZ A; 2DRK A; 2JM8 A; 1ZUK A; 1I07 A; 1GBR A; 1RI9 A; 1A0N B; 2C0T A; 2EGA A; 1ABQ A; 1EFN A; 5IHI A; 1QKX A; 2KR3 A; 3JV3 A; 2DL7 A; 3THK A; 4Z88 A; 2ED0 A; 1SRL A; 2CT4 A; 2YT6 A; 2AZV A; 3CQT A; 4RTY A; 2VKN A; 2AKL A; 1NM7 A; 3H0H A; 4OMQ A; 3NMZ C; 3EG0 A; 1QWE A; 1OPL A; 1RUW A; 1KFZ A; 1NEG A; 2ED1 A; 1YWO A; 2HBW A; 2O31 A; 2DL4 A; 2HEQ A; 2L3P A; 2O88 A; 4HXJ A; 4CC2 A; 1CKB A; 1MV3 A; 2KXD A; 1UHC A; 2EQI A; 1ARK A; 1BBZ A; 2YUN A; 1S1N A; 1TG0 A; 1WXT A; 1U3O A; 2K2M A; 4IIO A; 2MCN A; 1X6G A; 1LCK A; 2W0Z A; 4JJC A; 2DIL A; 1CKA A; 3NGP A; 1X43 A; 1UTI A; 4J9G A; 4F17 A; 4WCI A; 2KRO A; 2YDL A; 2GQI A; 1BB9 A; 2SRC A; 1G2B A; 3REA B; 1YNZ A; 2C0I A; 1QWF A; 1SPK A; 4DEX A; 1M27 C; 1N5Z A; 3REB B; 2DL3 A; 2GBQ A; 3VRZ A; 2LZ6 B; 1AOJ A; 1XOV A; 2ABL A; 1NYG A; 1IO6 A; 5GJV B; 4J9C A; 2RMO A; 2IIM A; 4ZNX A; 2JW4 A; 3EG2 A; 4K11 A; 2F2V A; 1E6G A; 1G83 A; 5FW9 A; 1SEM A; 2RQT A; 3O5Z A; 1AWJ A; 3I5S A; 2JM9 A; 1AWW A; 5IXB A; 2OAW A; 1WI7 A; 2CDT A; 3R6N A; 4M4Z A; 2PNI A; 5ECA A; 1PHT A; 1UFF A; 2PTK A; 4AFU C; 2V1R A; 1E7O A; 1BK2 A; 1VYT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1B07 A; 1X69 A; 1Z9Q A; 3BDL A; 4PJO E; 2YUO A; 4NL2 A; 1YJW A; 1W70 A; 5AYF A; 4BDY A; 2YSQ A; 3VS5 A; 4N4I A; 2P0P A; 1OOT A; 2EBP A; 3PVQ A; 2QAZ A; 5EC7 A; 3MEV A; 4M78 F; 2E41 A; 3S3N A; 1D1A A; 2BIV A; 3NTH A; 4ZGD B; 2EPD A; 1IHV A; 4LUD A; 2LQN A; 5DM7 R; 1D0X A; 3C4S A; 4Z02 A; 5GAN 6; 1WX6 A; 3SEM A; 4IKF A; 3DKM A; 1NJI R; 2QI2 A; 4EMK B; 4LNP A; 3CC2 Q; 4PKC C; 3CCM T; 4XK8 E; 3URG A; 1Q82 R; 1M8V A; 2K5L A; 4E7S A; 5DLO A; 3TSZ A; 5LJ5 j; 1NE8 A; 2EFI A; 3H9N A; 5I11 A; 2CZ0 B; 3RNJ A; 2FG0 A; 8AT1 B; 4F7U A; 2JS0 A; 1IHW A; 1UUE A; 3M4G A; 4JJB A; 2DVJ A; 5I22 A; 3LWH A; 4OGE A; 3E9G A; 1GFD A; 2XD0 A; 5GMK m; 3FC3 A; 4PNO A; 2R57 A; 2RM4 A; 4QQ6 A; 3CBM A; 1AD5 A; 1LJO A; 1PNJ A; 1VQO T; 4LN2 A; 4N4H A; 2ZPB B; 2F2W A; 2EJ9 A; 1VQM A; 1OPK A; 2YUP A; 2DF6 A; 2LT4 A; 2YLC A; 2E65 A; 3P8H A; 5LJ5 g; 2EQK A; 3UAT A; 2CP2 A; 4J6X A; 5KYX A; 2DTI A; 1TWB A; 2VGM A; 1K73 C; 5LJ5 e; 1VQ9 Q; 3CEY A; 3CCR T; 1OU9 A; 3QZ5 B; 1X2K A; 4M78 G; 5GJW B; 4CC3 A; 1YWP A; 2CRE A; 3G71 A; 1VQ6 Q; 2KI7 A; 4PJO B; 1N9S A; 1VYV A; 3L2Q A; 4OB3 B; 1MMD A; 3LYI A; 5D6W A; 2O9V A; 3CMA A; 1MUZ A; 2XDD A; 2EKO A; 2KXC A; 5IHK A; 2ZPI B; 3M0R A; 1QCF A; 4O6J A; 1MV0 B; 2OJ2 A; 5CKD A; 3E1S A; 1BI0 A; 2J7I A; 1IGU A; 1M4Z A; 2KRS A; 4FW1 A; 1AT1 B; 4HVU A; 2CP3 A; 1K0S A; 3ZL7 C; 4AFQ C; 1KIK A; 2VWF A; 4FSS A; 1O75 A; 3X25 B; 2DD4 A; 2JMC A; 1R0C B; 2HQX A; 4C92 B; 4OB0 B; 2HSP A; 4AFZ C; 2D0N A; 2L3R A; 4RTZ A; 3PGG A; 1S72 Q; 1VQ7 T; 1VA7 A; 1SRM A; 1WGS A; 2QQ9 A; 2PUK B; 4LD9 K; 1FMK A; 3L2V A; 3MCA B; 2KBT A; 5KH6 A; 1YJ9 A; 3I35 A; 3QXE B; 2VGN A; 2MMP A; 1YIJ Q; 2GNC A; 2D8H A; 4RMO A; 1WJS A; 1UB4 A; 4IUR A; 4LDY A; 1U5S A; 2IVW A; 3ULR B; 1VQ4 Q; 5HK0 A; 4HCB A; 1ZQ1 A; 4BE0 A; 3VS0 A; 3CC7 A; 2DX1 A; 1TSF A; 3QJY A; 1JXO A; 1ZSZ A; 4B6M A; 3DB4 A; 4HT8 A; 4D6W A; 2CP5 A; 2KK4 A; 2OTJ T; 2R5A A; 1NEB A; 1NJI C; 2QA4 T; 3I56 Q; 4PL6 A; 1K0X A; 2ROL A; 4QKU A; 4A4F A; 3M9Q A; 1G3W A; 4IUP A; 2KYB A; 2LJ0 A; 2M1H A; 1UGR B; 3SWN C; 1YFN A; 1Q82 C; 2HCK A; 1MMA A; 2V8I A; 3CC4 A; 4QVC A; 4X9D A; 2VXF A; 3NHN A; 3EFO B; 2P0Q A; 1BIA A; 4C92 F; 2JN0 A; 3CCS A; 5KYW B; 2PVD B; 1KG1 A; 1RAD B; 1YN8 A; 2DKG A; 4V2S A; 4JZ4 A; 3GNF B; 5KYY B; 5A0L A; 1K9M U; 1IGQ A; 4A54 A; 4LD6 A; 2BKD N; 4KGX B; 4CC4 B; 4XTW A; 2DER A; 1J3T A; 1UJ0 A; 2G6F X; 5A0G A; 2FPD A; 4CC7 A; 2QDY B; 2KNB B; 1AHJ B; 1X27 A; 3FDR A; 1X2Q A; 1VQM T; 1NPP A; 3CCV A; 4M7D D; 2RI5 A; 3FB9 A; 1WHJ A; 3CXC P; 2DNU A; 2CZ6 B; 4PJO G; 4AG1 C; 4C8Q A; 1IB8 A; 4QQG A; 1WZO A; 5FWB A; 4C0Z A; 1NG2 A; 3G71 T; 4M7D E; 2RD1 A; 3EGU A; 3CCU Q; 2YLB A; 2MWP A; 1IRX A; 4LDV A; 3A98 A; 4LDW A; 1VYU A; 1QVP A; 2RN8 A; 3I55 A; 3QYH B; 5C0M A; 4KGV B; 2LCS A; 2QYZ A; 1QVF A; 1M3B A; 1N8R R; 2A28 A; 1HJD A; 1JEG A; 3RKX A; 3PFS A; 2BE7 D; 3H8Z A; 8ATC B; 1PD1 A; 5GAN 8; 2CZ7 B; 1Y0M A; 1K76 A; 1ZSG A; 4M7D C; 4FYW B; 3GPL A; 1AWO A; 1I1J A; 1JRI A; 3UDC A; 5IH2 A; 2BZY A; 3PT9 A; 1VQL Q; 2CSI A; 1GL5 A; 4C92 G; 1ZHI A; 4E2F B; 2DZC A; 1I07 A; 2JTM A; 1VQ5 A; 2C0T A; 5HK3 A; 1ABQ A; 1EFN A; 3MP6 A; 4XTZ A; 5IHI A; 2KR3 A; 1PSF A; 4FW2 A; 5IT9 E; 2MPX C; 3EGX A; 2ED0 A; 1D3B A; 3CCJ A; 3E9F A; 2VKN A; 2KY9 A; 1NM7 A; 4OMQ A; 3NMZ C; 1K73 U; 3GF5 A; 4N4G A; 4M75 D; 3EG0 A; 1QWE A; 3CXC S; 1KFZ A; 5CKB A; 1NEG A; 1NZ9 A; 2ED1 A; 2L3P A; 3QO3 A; 4CC2 A; 3TU4 K; 2QEX A; 2LTO A; 4IUT A; 1BBZ A; 2PQW A; 1K8A R; 1TG0 A; 5GAN 2; 1MND A; 1VQK T; 4M75 E; 4FM4 B; 4KGZ B; 3CC7 T; 5LJ5 h; 4J8O A; 3LH0 A; 1YJW Q; 2MYS A; 4QVD A; 2BUD A; 2DJZ A; 1UTI A; 5CKH A; 1VQ8 Q; 2KRO A; 1NPR A; 2GQI A; 5GMK j; 1YNZ A; 1QWF A; 2DTO A; 2KVQ G; 4M75 C; 5CR2 A; 4XU2 A; 1XNI A; 2F69 A; 1N5Z A; 1M1G A; 3Q1J A; 2DXU A; 2LZ6 B; 2DEU A; 5LJ3 j; 4KBM B; 2EIF A; 5CK9 A; 2IIM A; 5LJ5 f; 5D7U A; 4ZGJ B; 5KCH A; 2JW4 A; 4K11 A; 4M78 D; 3CME Q; 5FW9 A; 1B7T A; 1SEM A; 2RQT A; 3O5Z A; 3G4S A; 4C0D B; 1AWW A; 2OAW A; 1FXX A; 4M4Z A; 2NUP A; 5ECA A; 4BY6 C; 5L8R E; 2OX7 A; 5FU7 C; 2JUF A; 4AFU C; 3HRT A; 3CD6 A; 4ANJ A; 3CCV T; 3LW5 E; 2K3X A; 4IUQ A; 1C0M A; 4EMH A; 3EHR A; 1O9S A; 4YTL A; 1WYX A; 2KT1 A; 4LUE A; 1YI2 Q; 1Q95 G; 2GTJ A; 2KEA A; 3N5B B; 3CCM A; 5LJ3 g; 1U1T A; 1P92 A; 4F7U B; 2CP6 A; 1FYN A; 3M0S A; 5LJ3 e; 3VJP A; 2CGH A; 1NJI U; 3JAM E; 2D9T A; 1XJW B; 2B8A A; 1UEC A; 3I55 T; 1Q82 U; 2RPN A; 4Y92 A; 4HA8 A; 4IUV A; 3X20 B; 4M77 E; 1LOJ A; 2VYT A; 1R8O B; 3RBB B; 3M57 A; 3MJX A; 1I5O B; 1TOV A; 1M1K R; 1B34 A; 3X24 B; 1N8R C; 2R58 A; 3QKJ A; 2Z0W A; 2L3Q A; 1SKU B; 2K4Y A; 5KYX B; 2FO0 A; 2MIO A; 1QP3 A; 1Q81 R; 3SD4 A; 1U06 A; 2FB7 A; 3CMA Q; 4KRT A; 1KC8 R; 4M77 C; 3O8V A; 2LMJ A; 5I2S A; 4D8D A; 3AT1 B; 2KYM A; 3SWN A; 1E6H A; 4EIK A; 4XU3 A; 4MZP A; 2HNI A; 4JJD A; 2JTE A; 3GOX A; 4C0G A; 2VVK A; 4LDX A; 3BDU A; 1VQ6 T; 5LJ5 d; 4F7U F; 1H92 A; 2QGG A; 2MOX A; 1M30 A; 3BY7 A; 2ROT A; 3VYH B; 3RKY A; 2E12 A; 5GAN 5; 1WXU A; 2GFA A; 2QEX T; 2RH2 A; 3EG9 A; 1T0J A; 4GY5 A; 2HQH A; 1YIT T; 2FPF A; 3ASK A; 5IXF A; 3OW2 P; 1BI2 A; 2EYQ A; 2K7A A; 3WXM B; 2DET A; 4JDS A; 2EYY A; 1QVG P; 4EMK C; 1JBM A; 5FU6 B; 3M0T A; 3M59 A; 2KSS A; 3S3O A; 2OTL T; 1ZLM A; 3GNG A; 4WF2 A; 1SG5 A; 5CVI A; 2DL8 A; 1TUD A; 5IAY A; 5KCO A; 4GLK A; 1MNE A; 4B9W A; 5FRM A; 3EHQ A; 1M5Q 1; 3NPF A; 3A8M B; 1VQ7 A; 3L42 A; 2DAQ A; 3GIB A; 1D1B A; 3OYJ A; 3IQL A; 2EKH A; 3EG1 A; 2RK1 A; 2ENM A; 3J80 E; 2BZ8 A; 3C0C A; 1ZSZ B; 4RG2 A; 1OI1 A; 4M7D A; 4XTY A; 3G4S T; 3CC4 Q; 1JO8 A; 1EIF A; 1ZA1 B; 3M0Q A; 4A4K A; 1KJW A; 3CCS Q; 2EGC A; 2AZS A; 2EW3 A; 2EYW A; 3KUF A; 3L2R A; 1YJN T; 1XTD A; 2X4W A; 3CD6 T; 3J81 E; 1ZX6 A; 3RMS A; 2PVO B; 4CI0 C; 1BIB A; 1GBQ A; 4F7U G; 1ZUY A; 4BAC A; 1I5L A; 2J05 A; 1WHG A; 2OTJ A; 4EPC A; 2JT4 A; 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