2V2CA

The a178l mutation in the c-terminal hinge of the flexible loop-6 of triosephosphate isomerase (tim) induces a more closed conformation of this hinge region in dimeric and monomeric tim
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAIAKSGAFTGEVSLPILKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVLTPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE GLYCOSOMAL
publication title Structural Studies Show that the A178L Mutation in the C-Terminal Hinge of the Catalytic Loop-6 of Triosephosphate Isomerase (Tim) Induces a Closed-Like Conformation in Dimeric and Monomeric Tim.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 91
structure length 249
sequence length 249
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2007-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2v2cA00
1I45A 1IIHA 4UMCA 3RK8A 3L0GA 4N4PA 3DI1A 1M7PA 3EX1A 1G6CA 3M9YA 4KKXA 3WJYA 3LLFA 3NEVA 3NQDA 3WK2A 2YW3A 3DENA 2YPIA 4ICNA 5C2XA 4PFMA 3P67A 4GFSA 1FQ0A 1TPEA 4ORMA 2RH9A 4W9TA 3W7PA 3W1QA 2J27A 3G1HA 3STEA 2ZYFA 3PG9A 1QR7A 1QOPA 1XI3A 5F1UA 5K9CA 1TPDA 3QF0A 5LHEA 3TH6A 4KFOA 1GEQA 3BG3A 5EPDA 3L2IA 2EF9A 3F1QA 1YPIA 1VLIA 2FLIA 2NX9A 3UWWA 5AC7A 3NL6A 4JTUA 3O06A 3W1TA 2VFHA 4UR7A 1FUYA 2A7NA 1SFLA 4FNRA 3EKZA 3UNDA 5AN7A 1NAL1 4GWEA 3GZ3A 5G4EA 2YSWA 3CPRA 1JQVA 2ZRYA 1EIXA 1MEHA 1ZNNA 2GPTA 3FJLA 3HJZA 1O5XA 3QZEA 4RK8A 4O11A 3W07A 1O5KA 1ME8A 1IXQA 1TO3A 2J9ZA 1OX4B 3ELFA 3W1XA 2QUVA 2B7OA 3U8GA 1I2NA 4MY8A 3PG8A 3NG3A 3F03K 3MBFA 4C1KA 3UD6A 4B5NA 3W70A 3HG3A 5D37A 3NO5A 1S5TA 4N4QA 4JD4A 1GTHA 4MYAA 5AHEA 3L5AA 3GIYA 1OFPA 2ZRXA 3QSRA 3LB0A 1FWNA 4LW7A 3NQCA 4O1CA 4LT9A 3ABSA 3QH2A 3BW3A 4LVFA 3OVRA 3E02A 1W3IA 4IPJA 3W1RA 7TIMA 3TDFA 2I1OA 3G1YA 2RDWA 5IBXC 3M44A 1KM6A 1G67A 3MBDA 3MYPA 5I3FA 1YYAA 4WJEA 2NZLA 2GOUA 4JDYA 3C3NA 3WFAA 3HPXA 3FIGA 4WOQA 1IF2A 2EGZA 3MUXA 4RV8A 3WK1A 5KINA 2C6QA 3LBCA 1C29A 4JY9A 2NV2A 4O54A 3R89A 4POCA 1D9EA 4LVGA 2HMCA 4Y9AA 5K4ZA 1M5WA 1J5TA 2BXVA 1K02A 1TPFA 1TV5A 1XUUA 1SW0A 3HB9A 4NT0A 2ATSA 2F84A 2NUWA 4M19A 2KZHA 4ZMGA 1FDYA 4LS1A 1EWDA 2NWSA 1DOSA 2G96A 3KX6A 5F4WA 1OK4A 4NNCA 4K8HA 2TYSA 3LXBA 1HO1A 3E9AA 5LSMA 1ZALA 3KOFA 2CLKA 3UY8A 1XBYA 3LM7A 1P5BA 4HPXA 2ZDRA 1V7YA 1SU5A 4LV4A 3CHVA 2C1HA 4O12A 1K7FA 4JIQA 2ATMA 2E5BA 2AQWA 5DXYA 2NUYA 3MHFA 2WV8A 5D2YA 1YTEA 4XKYA 1W5OA 3RNDA 5HNRA 5DY3A 1DKWA 2GJNA 1VRDA 1TJPA 4Q33A 1R30A 3I6RA 3WJZA 1KM2A 1PHQA 3QQ1A 2WO5A 1KLZA 1KM5A 1JRCA 5BW6A 1OFRA 4DO6A 1EP3A 5AOUA 3BGGA 3CEUA 1TTJA 2Y70A 1TJRA 4HNUA 3M41A 3Q58A 4N2YA 1ME9A 5E1QA 3TK7A 2C19A 5H2ZA 1FY6A 3GK0A 4JTIA 3GXTA 2C18A 3SGUA 3FYOA 2I14A 3L66A 3NYZA 3P8IA 2QCCA 3BVJA 3V1PA 5K9DA 4QISA 1LRQA 1ICPA 2VENA 5AHIA 4GBUA 3KFTA 4PCFA 5G4WA 4IQLA 1AL7A 1PE1A 1H5YA 4JYDA 3FA5A 3UWZA 4MIMA 2HTMA 3IIZA 5C54A 4MJMA 1CI1A 3FKRA 3W88A 5CSSA 2Q3OA 4UXDA 2B4GA 2Y89A 4FNUA 4GC4A 4GUFA 3WK0A 4MYXA 2WNNA 1JUKA 3MWAA 4Y96A 1ZAHA 3ZR4A 1UBSA 3EEGA 4NX0A 3P60A 2ZZ5A 3KRSA 2PRHA 1JUBA 2WSQA 3C6CA 4U4MA 4LUJA 1MZHA 2H90A 1L6SA 3EX2A 1YDOA 1NVMA 1OFBA 3NL3A 3DFPA 3W74A 3CLMA 4NZJA 3S5ZA 1OFOA 3LCXA 5F2MA 3TSDA 3LCLA 3CM4A 1GG1A 4O1BA 4N6FA 2XN2A 1JRBA 3MI2A 1FXPA 3RU6A 3L21A 2VXNA 2PRMA 1H7RA 4J9JA 4GNJA 4IPIA 4AWTA 3W7IA 4IXHA 3MP4A 4R34A 3E49A 5DCBA 4MVAA 4O57A 1G7UA 3IIVA 1SFJA 3UPWA 4O28A 1D3HA 1EP1A 2DZSA 4YXGA 3W23A 3E0IA 1WDWA 3A24A 3NR0A 5U4NA 4K37A 4XBKA 5LNSA 1Q6QA 5I3KA 1SO5A 2VC6A 3T7VA 1YDVA 3H55A 3PB0A 4AHQA 2Y7EA 4IWWA 3PWAA 1JVNA 1VYPX 4RXGA 5LKYA 4HT3A 1S5WA 1TV8A 1A5CA 2J24A 5CZTA 3L67A 3W2UA 1ZHAA 3FOKA 4NJKA 3QW4B 3PUOA 3G1DA 3LBMA 2BSLA 4PH6A 2E77A 1NF7A 1N55A 1K8YA 4AHOA 1SO4A 3DKJA 4O4WA 5K9XA 4IMGA 3SECA 2ZZ7A 2ZRVA 1FCBA 4FEZA 3EWZA 4Z1AA 4RXFA 2VOMA 1LLZA 3P5YA 4K8EA 5AYYA 5LGZA 4JICA 2O7QA 1SUXA 2NUXA 3P62A 1G7VA 5G1TA 1TPH1 3T55A 5EMUA 1X1ZA 3C0JA 4FB7A 3G8RA 3NQAA 4AHPA 3Q37A 3CIWA 3W7JA 3FJ6A 1K8XA 4ADTA 3GDKA 1ZJIA 3TSMA 3W87A 1W3NA 1WXJA 3IVTA 4JR5A 3U6WA 3QJAA 1BWKA 3C2EA 3W1MA 1GVOA 1W3TA 3NQ2A 5ABTA 4TMBA 1LDCA 4WY0A 1OFAA 5FF4A 3DGRA 4UCGA 2CLIA 1DL3A 4MZ8A 2GJLA 3DZ1A 4O16A 4UFJA 2E09A 2NX3A 4N9BA 4PL2A 4TIMA 2V2HA 2AGKA 4YL2A 3OG3A 1GVFA 4JN6A 5EBUA 3M0ZA 5G5IA 1S3HA 3W7QA 4Q4KA 3RF9A 5FF3A 4NX5A 1TRDA 3M6YA 1KV8A 3TC7A 2E68A 1W5MA 3EXRA 3TC6A 2ZRZA 1CX9A 4CNNA 4LVDA 4XQ6A 1TPUA 2ALDA 2GQ8A 2QJGA 1FBAA 3K30A 4FXRA 1DJQA 1KFBA 1JCNA 4EIVA 1DBTA 1OYAA 2VELA 3PULA 1TV7A 4JYFA 3G0UA 1R2SA 4O18A 1EX5A 5AYXA 4WUIA 2DJXA 3W7GA 1VCFA 3GX9A 3TE9A 5CPNA 4QNEA 3QQ0A 2P1FA 3AJXA 3O63A 1VCVA 3B8DA 4MZYA 4YLWA 4MUZA 3P84A 2IQTA 4UTUA 5E0KA 4RZ5A 3W83A 5DXXA 2Y7DA 4RR4A 1PL9A 5AC6A 3NNTA 4AF0B 4IMFA 1JCXA 4X22A 3M5XA 1KW1A 3DBPA 4A2SA 3LI0A 3NGJA 4NVTA 4NUWA 2GQ9A 3B4UA 2JK2A 1W56A 4JIPA 1OHLA 5F2LA 2QDHA 1TSIA 2PURA 4I7UA 3LGEA 1ICQA 1QMLA 3RMJA 2CZDA 5CGQA 1XCFA 1SZEA 3EWUA 3PBYA 1I2PA 1W1ZA 3QRHA 3PAJA 1YTDA 3W2LA 5HWJA 1K7XA 4FNSA 3W1UA 4OWGA 3TCEA 3F4NA 1DV7A 1T99A 3C52A 3M43A 3SGZA 3EXSA 5DBUA 4WXZA 3KHJA 1GYLA 5DBTA 2H3DA 4ZQMA 3HGSA 1KTNA 3LTSA 1SPQA 4AVFA 1OX5A 2V9DA 3PC0A 4DQWA 2D73A 3G8EA 3QMSA 3UWVA 3B0PA 3HOJA 2YW4A 4DPPA 4RCXA 3IIXA 2PCQA 4HNNA 2W79A 3IIOA 3DXIA 1LM1A 4UFIA 1LBFA 1JQXA 3CTLA 3QW3A 1FWTA 1L6YA 1XUZA 1RD5A 2JKEA 4JTKA 1O4UA 1K03A 2ZCGA 1WV2A 3DFOA 3W7CA 2JKAA 2ZZ6A 4ZVJA 2DJLA 4D2JA 2FTPA 4BWLA 1RZMA 1VC4A 2A6LA 1EA0A 3VFLA 5D33A 5T26A 2DZPA 1EUNA 1QOQA 1PHWA 3OHIA 2GVJA 3GAYA 3QEZA 3DI0A 4EOUA 1ZFJA 3UZJA 2GQAA 3W86A 1HUVA 1ADOA 1UB3A 1TB3A 5FESA 2J6XA 3RFAA 3TW6A 1NEYA 2QDGA 3SIZA 2E5CA 8TIMA 4MY1A 4QIUA 2WKJA 4JXCA 3GNDA 5DELA 2Z2UA 3OIXA 1ZCOA 3PM6A 2WJZA 3I65A 1TTPA 1KBJA 3DFNA 5KITA 2CLMA 3STFA 2WNQA 3L5LA 1Q6RA 3ZWTA 1C9DA 4LRTA 4FIQA 2A5HA 5MHBA 3EX3A 3EWXA 2Z0IA 4UNLA 1FX6A 2EHHA 4E38A 1H7PA 3GKFA 2ZFAA 3W3OA 3BARA 1VH7A 4JYEA 4WOZA 3MHUA 5FF2A 3GAKA 3SW6A 1K7EA 4ZQOA 3HO8A 3LOTA 5FF0A 3EXTA 1UJPA 4LNYA 2QF7A 4H4IA 4R33A 3NPVA 3TUUA 4LVBA 5G2IA 3LCWA 2BTMA 2A4AA 1A5SA 3BG9A 2E5DA 5FEZA 1FWWA 2OMAA 1F6KA 3S42A 5LHFA 5CZ0A 3NL5A 4YCOA 4M7TA 5D2VA 2BLEA 2ZA3A 1EB3A 5F2IA 1AMKA 1OG0A 3EKLA 4K39A 4AMAA 1H63A 2FB3A 3NPUA 1QPNA 3HGJA 3B0UX 4UTWA 1LCOA 2J88A 1KM4A 4FF7A 3S1UA 4ZL1A 1ZAJA 1W31A 3I68A 4DF1A 5J5DA 3S5NA 4GUIA 3L9CA 5H91A 5D32A 1H1YA 1XDLA 2NX1A 1LTDA 1PCKA 2ZQ0A 3BV4A 5HR6A 3PY2A 4OV9A 3S5YA 3E12A 5KZDA 3G1VA 1KBIA 4NNAA 2TPSA 1G4PA 3GYEA 3EX4A 2UV8G 3C61A 4OHQA 3S1XA 3PUEA 1GG0A 2FPTA 4NXKA 3C8FA 3O16A 1ALDA 2Z6JA 1PV8A 2B7NA 2DZXA 4HSOA 5HULA 1GOXA 5CZJA 3QPYA 2OJPA 1GZGA 3SR7A 3UPBA 2O7SA 4FXSA 3TSBA 5A5WA 4Z1BA 4U28A 1F73A 1OK6A 3G1FA 3QMRA 1XKYA 5D02A 3A5FA 4HNVA 5AHFA 2WOQA 3SZ8A 1SZGA 4UTHA 2PRLA 3W2JA 1S5VA 4E0CA 3TMLA 4UMAA 5CG7A 2VEIA 5HINA 3GXNA 3W6YA 2QKFA 3O6DA 3GVGA 3B06A 4ORIA 2QUTA 4FX7A 2ISSA 3S5OA 5D09A 4TO8A 1SW7A 1IXOA 2QUUA 3G1SA 1K3UA 4LS0A 4YMZA 3W2KA 3W7DA 3THAA 1L6WA 3W2MA 1A53A 3CC1A 4PL1A 5LNUA 1WBHA 5DLCA 5LNVA 1VQTA 4O1AA 3PR2A 3TMQA 3TXVA 3M5YA 5EYWA 3WJXA 3TQ0A 4BR1A 2C15A 3O15A 3UQNA 1L9WA 3DH7A 3NQ8A 4O15A 1X8FA 3LRMA 4N9DA 4LRSA 3QPZA 2DP3A 2RDUA 3ANYA 3QM3A 5BRBA 1H1ZA 3ABRA 2Q3RA 3LXCA 3LHTA 3EWBX 1EWEA 1UUOA 1P0KA 2YYUA 2R8WA 4NNBA 3LV6A 2ZZ2A 4IX0A 4O13A 3TX9A 2JBMA 1FCVA 4JTFA 4TU1A 1RQEA 2ZZ1A 3DAQA 1J4EA 3ABOA 4RJEA 4UFMA 4Z0JA 5HR7A 3GDMA 3B04A 4JTEA 5HQEA 1P1XA 3DU0A 2Y62A 1FCUA 3S8HA 1B9BA 1X7FA 2YFOA 3C2FA 3PVFA 2EAWA 1LOQA 2OCZA 3C2OA 1K8ZA 4XTDA 2VFDA 3G22A 4FIRA 1C8VA 1WYIA 3GDLA 3P81A 3N9SA 5CSRA 2H3BA 3S6DA 1VJIA 1KFJA 5D38A 1OYBA 1LBLA 3SI9A 4UNKA 5G2WA 1XXXA 1DQXA 1EPXA 5CPLA 5HWNA 4ZQCA 4PODA 4XUGA 3N2MA 1U83A 3HPZA 3FEMA 3PSVA 3GLCA 2DORA 1W5QA 4JTLA 3NL2A 2F7FA 1X6UA 1PS9A 4ADUA 2CFFA 5AFDA 1W8SA 5AHMA 3W7OA 2HSAA 4I7VA 3LCGA 1H7XA 3R12A 4ZQPA 3S1VA 3BK0A 1A5BA 4DELA 4QQ3A 1OX6A 3W73A 3G1XA 4EWND 3N73A 1Q6LA 4CCCA 4GUHA 1QPOA 4QITA 3O07A 2DU2A 1TYGA 3F4WA 5IBXA 1LZOA 2RDTA 1PCWA 6ALDA 4FNQA 1W0MA 3SJ3A 4KWVA 1VZWA 5D04C 2C0AA 4JGDA 1ONRA 2ZZ3A 4BI6A 2QAPA 3S1WA 4QJ1A 4BK9A 2WNZA 3G1AA 3WK3A 3NQMA 3P7YA 3S0CA 5LGXA 3LI1A 4JX4A 5FEPA 3LRKA 2C3ZA 3INPA 2TMDA 4RZ4A 2ABBA 3O1NA 2XFWA 3NPWA 2OX1A 1SSDA 3OA3A 1F74A 4CNPA 2R91A 3LHZA 1I2OA 3NPXA 3L0KA 4QM1A 5DN1A 4AWSA 5EL1A 1VGAA 4WXYA 2B0MA 3NQVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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