2V52B

Structure of mal-rpel2 complexed to g-actin
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
373
structure length
360
Chain Sequence
DETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRKDSYVGDEAQSILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein/contractile protein
molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Molecular basis for G-actin binding to RPEL motifs from the serum response factor coactivator MAL.
pubmed doi rcsb
total genus 123
structure length 360
sequence length 373
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v52B01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v52B02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v52B03
3WXKA 1ZBSA 3QB0A 2WUSA 3UE5A 3W0LA 4BRAA 5JICA 2FSKA 2V52B 4FSVA 1GLBG 4H0VB 5AQPA 4CBWA 5AQYA 1WOQA 2D0OA 5I9EB 1DEJA 3DXMB 5EY4A 3IMXA 3L6QA 1D4XA 2ZGYA 3D2FB 1NGGA 3BP8A 4M7XA 4XH4A 4QS9A 1HKGA 3VPZA 4BRQA 3BUZB 2P9NA 3LM2A 1EQYA 1LOTB 4KBOA 4XH5A 4MO5A 4B1ZA 1QZ6A 3O80A 1BOTO 4CZFA 1TYQA 2BUPA 3C7NA 3CJ1A 2E88A 2FSJA 3O1WA 4A2BA 4BRIA 3QBWA 1JCFA 1ESVA 4BGBA 5BR9A 4K41A 1E4FT 2P9KB 5KPRA 4FPBA 5AQIA 1G99A 1X3MA 5BREA 3FGUA 3L0QA 3ENHA 1BA1A 1TUUA 2QWMA 4ISGA 3A5LC 4IJAA 2QWRA 1GLAG 3FR0A 3VESA 3UKUB 3VGMA 4M63C 4FPAA 2P9PA 4BQLA 2FSNA 5AQTA 3GBTA 3WQTA 4RCHA 1NGFA 4FWKA 3RSEB 5KQ8A 5FPMA 3MMVA 3H3NO 2F9WA 3S41A 5FPEA 3H46O 3KVGA 2P9UB 1IJJA 5AQMA 1V4TA 3C0BA 5LJVA 3AY9A 3GOIA 2GWJA 4PKGA 4EHTA 4BR4A 3MN6A 4RTFD 3R9PA 3EL2A 5AQKA 4H03B 3KHYA 3WT0A 4H5WA 2W41A 3CIPA 4BGAA 1ATRA 3OHRA 5AQXA 1GLJO 3U4LA 1DGKN 2D0PA 2CGLA 1K8KA 4BRDA 2YJFA 4DB3A 3U9DA 3R8EA 3SK3A 3UB5A 4FWSA 2YHXA 5AFUA 4BRKA 4EHUA 1XUPO 4JAXA 5AZIA 2P9LA 2Q97A 1NGEA 3EZWA 3DAWA 1KXPA 4CBUA 1T6CA 2ZWHA 3ULEA 5EXWA 4BVPA 4CZLA 1NGCA 4E1JA 1E4GT 3CHWA 3WXLA 4B1YB 4BR2A 5AQGA 1OKJA 1QZ5A 3QMLA 1T6DA 2D4WA 2Q36A 5AQSA 3VF4A 3ZEUA 4BR0A 2Q1NA 3SMSA 4CD1A 3FZFA 3ID8A 4CBXA 1GLLO 4BRNA 3EO3A 4CD3A 4MLEA 1H1VA 2HF3A 3WEEA 1QQMA 3QBXA 4BR5A 2AA4A 3CJBA 3SMPA 3A5OC 3FZHA 3O8MA 3AAQA 4FOIA 4QS7A 3QICA 1HKCA 2A5XA 4EIAA 5JLFA 2P9PB 1C0FA 2A3ZA 2W40A 1YXQA 3F9MA 4H0PA 4H5TA 4BRCA 5EOYA 4PKHA 4K25A 1NMDA 1MWMA 4BQZA 4FWMA 1JCEA 2P9IA 4CZHA 3L4IA 5LY3A 3M3ZA 1HPMA 1NM1A 3D2EA 2YI1A 1ATSA 2CH5A 1U2VB 3VEOA 4BC4A 3TPQA 3H45C 4BR9A 3M1FA 1GLFO 2J4RA 4XEIA 5F2RA 5ELZA 3HBTA 4Y0WA 4BRPA 3UKRA 1GLDG 4F9OA 4Z94A 2E8AA 3A0IX 4CZMA 1ZC6A 4YDUA 3WXIA 3ZETA 3FLCO 3H1QA 1NWKA 1QQNA 4BVOA 2I7PA 5ADXH 2Q31A 1NGHA 1NGJA 2A41A 2NLXA 2IIRA 1KAYA 5F0XA 1NBWA 2V7YA 3LDLA 3VGLA 3LDOA 4A61A 5CE3A 2BTFA 3ZX0A 2EWSA 4XH1A 3CJ9A 2D1KA 3IFRA 3CJAA 1YAGA 1Q18A 3GG4A 2HF4A 5E84A 3MDQA 4EFHA 5BN9A 2E1YA 3MN9A 2E2QA 3FZKA 3WUHA 1MA9B 2FF3B 4K43A 2AP1A 3ATUA 4O8KA 1SQKA 2P9SA 3W3DA 3O5BA 1TUYA 1C0GA 4IZ9A 2NZTA 1X3NA 4IWVA 2HOEA 1NGAA 3ZEUB 4L3QA 4BG9A 1ATNA 1SAZA 4JD2B 1YUWA 5BPNA 5AZJB 4YDUC 3VGKA 1LCUA 4JHDA 3BF1A 5BRFA 3CQYA 5AQHA 5BPMA 3ENOA 3O6WA 2ASMA 3GE1A 4BRGA 2CGKA 2V7ZA 4O5FA 5AQRA 5BRHA 4CZEA 1XC3A 3HI0A 3I8BA 1XQSC 3JS6A 3H6EA 3CETA 3TU5A 1RDWX 1DKGD 4A62A 1BG3A 3EN9A 3IUCA 4H0XB 1SZ2A 3LDNA 1V4SA 1HUXA 3HTVA 2Q0UA 1CZAN 2GELA 3WXJA 3DXMA 3VERA 3LL3A 2PBDA 3ZX2A 3D2FA 4H5NA 4B1WB 1RFQA 5BPLA 2GTDA 4B1XB 2FF6A 2P9NB 4GNIA 3AARA 2QXLA 5F1XA 2ASPA 1MWKA 4FWRA 5AFUH 1TYQB 2CH6A 4IXCA 3C7NB 3BF3A 4CZGA 2QM1A 3VEZA 4NO7A 3VEWA 4IO8A 2VWBA 3J8AA 4LC9B 2E2PA 2P9KA 4CJ7A 4RWTA 2DPNA 2ASOA 3VENA 1Z05A 2OANA 1JCGA 4JN4A 4B1UB 4CZIA 2E20A 2A6AA 3QFUA 2NRHA 5AQLA 2QWOA 3UKUA 3O1BA 4AM7A 3I33A 3DWLA 5FPNA 4BC3A 2E2NA 3LM9A 2FXUA 3IDHA 3RSEA 2VCPA 1NLVA 3EKUA 3FFKB 4AM6A 4FO0A 2Q2RA 4H0OA 1NGBA 1HJOA 2P9UA 4ISEA 3A5NC 4FL9A 2E2OA 1S22A 3VEVA 3FZLA 2I7NA 3SLCA 1U6ZA 3CJCA 2QW9A 3VOVA 1QQOA 4PL7A 5AQOA 3VEYA 1BO5O 4C23A 4DCHA 4A2AA 4B9QA 5AR0A 4PKIA 4BR7A 4CZJA 5ADXA 3MCPA 1K8KB 5AQNA 3VF6A 3ATVA 5EX5A 2PAVA 4ISFA 2CGJA 4NB4A 4FWOA 4H0YB 3O4WA 3KZBA 5AZIB 2P9LB 2ZGZA 3DXKA 1R59O 2YCHA 1RGIA 4WQ4A 3ULEB 4DHYA 2V51B 5AQJA 5JMVA 2A40A 5AQZA 5EVZA 4FWLA 4K42A 5AQQA 4BC2A 3WQUA 3HSCA 4EAHD 1BU6O 3JXUA 1HX1A 2GUPA 1S3XA 2IVPA 2QWNA 1BDGA 4FOEA 1HKBA 2ZF5O 3GL1A 4MLHA 3WEEB 5AQFA 1Z6RA 3O08A 4CI6A 4BC5A 3H1VX 5E26A 2Q0RA 4I6MA 3U9ZA 1ZXOA 3G25A 3HM8A 1QHAA 4WYBA 2VYPA 3B8AX 4GY2B 3LDQA 4QS8A 3FE1A 4BG8A 2ITMA 2YHWA 3CERA 4FWQA 1P8ZA 4WQ5A 5AQWA 4B1VA 4FWPA 2P9IB 5B8HA 4HTLA 3P4IA 3D2EB 1HLUA 4BRFA 1U2VA 4WQ4C 4BRHA 3MN5A 3QDKA 5KPZA 1YVNA 3CJ7A 3BEXA 4BROA 5BN8A 2GEMA 3VETA 1WUAA 3UKRB 2UYTA 1NGIA 4FWNA 3CI5A 4H0TB 3D7EO 2A42A 3QFPA 3ZETB 5KPTA 1BWFO 2H3GX 5KQDA 4JNEA 4PL8A 1T44A 3HZ6A 2F9TA 1Y64A 3U8XA 4BRMA 4M7YA 2QWPA 3DJCA 5AQVA 4H5RA 5LJWA 5JLHA 3DXKB 1IG8A 2E1ZA 4IJNA 1X9JA 2QWLA 2GWKA 3A5MC 4H5VA 3SJHA 2IVNA 2HMPA 4WQ5C 3R6MA 4MO4A 2YHYA 2YJEA 1NGDA 2P9SB 4J8FA 3VEXA 1J6ZA 3EKSA 1KAXA 2QWQA 2FLOA 1KAZA 4JD2A 3MN7A 5AZJA 3GDQA 5AQUA 1BUPA 1GLEG 3VF2A 3FZMA 3ZX3A 1BA0A 4JHDB 4HWIA 3A8YA 2IVOA 3LDPA 3M6GA 3H3OB 4I6MB 2KHOA 4BRLA 3MK6A 5FPDA 4DQ8A 3CQXA 4CZKA 1GLCG 1MDUB 3AAPA 5TKYA 4BREA 5BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKBA 2NUBA 2Z1GA 4JK7A 3UE5A 4DV5K 2FSKA 2V52B 3VQ6A 5CHIA 1OH7A 4DKWA 5I9EB 5DK5A 2G8HA 3PO5A 1NGGA 3BP8A 3G10A 4LSNA 1BI4B 1RDCA 2W6LA 4Y1CA 3QEPA 2HVHA 1SL0A 3LP1A 2GUIA 1EQYA 1LOTB 1KVCA 4CHNA 2VQFK 3NH0A 1L3VA 1RBTA 3O4NA 1HNXK 3ALYA 4A2BA 4BRIA 4DR1K 4W5QA 1ESVA 4DTJA 3PUFA 3T3FA 1E4FT 4Q0BA 5AQIA 1G99A 1X3MA 1BA1A 3G0ZA 4L8RB 4G1QA 4DR2K 2D0AA 2E6LA 4FPAA 2DFFA 3GBTA 3QINA 3RSEB 5KGXA 3MMVA 2F9WA 5FPEA 4FJ7A 2WONA 1BQMA 1IJJA 4CIEA 4CHZA 2BGGA 4AH9A 3T69A 4CGDA 4B08A 1CLQA 4PKGA 4BR4A 3MN6A 4RTFD 3QETA 2A1RA 5AQKA 1RT5A 3KHYA 3THWB 1S72N 1Y97A 1WSHA 3MWTA 3SZ2A 1GOAA 1U45A 1N5YA 1IBLK 4KI4A 1K9MO 4IG3A 3I55N 1GLJO 3U4LA 4PHTX 3K5OA 1XNRK 2D0PA 4JKEA 1YIJN 4JEPA 1K8KA 1VQ9N 2O8BB 2HMIA 1ZBUA 4JAXA 4M42A 1SL1A 5AZIA 2Q97A 3EZWA 1KXPA 4KH5A 1T6CA 4Z4IA 1NGCA 4LH5A 4JKHA 4CHYA 4B1YB 1UAXA 4UQGA 4BR2A 5AQGA 3QMLA 4B9SA 1D8YA 4K8ZA 3HYFA 1KVBA 3E01A 3SMSA 3FZFA 4KHQA 4BRNA 3FFIA 3EO3A 3THYB 4JI4K 1H1VA 2HF3A 1N6QA 4M3YA 1QQMA 4E7JA 3OJUA 4JI3K 3NMUA 4JS4A 4FJHA 1D5AA 2D0CA 4C8LA 3O8MA 2O8CA 3I0SA 4FOIA 3QICA 4U7BA 2A5XA 4EIAA 5JLFA 4DUYK 3SV4A 1QSYA 2W40A 4BRCA 1YXQA 5FRNA 4CHQA 4Z4GA 3OYBA 4FW1A 4K25A 4E89A 3CYMA 1NMDA 4HCCA 1JCEA 3A2FA 3L4IA 4CZHA 3M3ZA 1BCOA 3OYMA 3CD6N 4YORA 4I9LA 2PZSA 3H45C 4JKGA 1JKHA 2J4RA 5F2RA 3HBTA 3L3UA 4AHRA 4O0IA 2OTJN 1NK6A 4CEQA 3KLFA 3WXIA 3ZETA 2RKIA 4E7LA 4F2RA 1K6YA 2I7PA 4YOUA 2ITGA 3QNOA 1VQMN 2IIRA 4RW9A 1KAYA 3LDOA 3T1AA 4A61A 2BTFA 3ZX0A 2EWSA 4XH1A 4OX9K 3AV9A 4JS5A 4LF9K 1RDAA 4CJRA 3K0SA 3IFRA 3CJAA 1YAGA 1EWRA 3PV8A 1KCFA 3MAQA 3K59A 3VQCA 2W00A 2GV9A 3ATUA 3KLEA 2P9SA 5HP1A 4IZ9A 1X3NA 4KTQA 4IWVA 2HOEA 3HP6A 4AILC 1N33K 3G6EN 1SAZA 4JD2B 5CR4A 3NVKA 1T3VA 3HPGA 3SPYA 4Z4CA 4ILHA 3T1YK 1W9HA 3E9PA 3V4IA 3AVAA 3PX6A 2YHAA 5FLXO 1XC3A 3DRSA 1NMNA 1XQSC 4JKDA 3JS6A 4DR5K 1RDWX 3AVFA 1GOBA 1BG3A 4CF2A 4FJ9A 2HW3A 3TTFA 1V4SA 1TVRA 1GOCA 5CZ1A 4CJLA 1CZAN 4KHPK 4AHTA 4I7FA 3R1XA 3CQ8A 4B1WB 1N8RO 1KLMA 1RT3A 4BWJA 4B1XB 3KKRA 4FJ5A 3KIOA 2QXLA 5F1XA 3J80O 4IXCA 4JRQA 4CZGA 3OYHA 4NLCA 3K9JA 2RHKA 4ILJA 2P9KA 4JKFA 4CJ7A 2ASOA 1Z05A 1JCGA 3CM5A 4DF4A 4OKJA 3L2VA 4CJ4A 3QNNA 4E1MA 5AQLA 2QWOA 4HTUA 4AM7A 4YOTA 2ZQBA 3DWLA 2E2NA 5AJ3K 3L2RA 2FXUA 4CK3A 1JL2A 1NLVA 3VA0A 2FBVA 4FO0A 1O1WA 4H0OA 1TK0A 2P9UA 4E72A 1VSLA 2E2OA 3VEVA 1RTDA 2HHHK 4CVNE 1S6QA 2EX3A 3SLCA 1U6ZA 3J81O 1DTTA 2ATQA 4YY3K 3VOVA 4DV4K 1RBUA 4A5BA 1XMQK 5AQOA 1BO5O 4DCHA 3O3GA 4BE1A 4OPJA 4B3MK 5AR0A 1G15A 1K73O 3OVNA 2Z1HA 1K8KB 3K57A 4DTMA 4NB4A 1EETA 2X74A 4CK2A 4XIUA 3ENBA 2IC3A 4OKEA 5AZIB 2ZGZA 5LL6Z 1R59O 4M3ZA 3U3GA 4CEBA 2V51B 1KVAA 3AO3A 4B9UA 4IEIA 5AQQA 3SUQA 3THVA 3OYCA 1BU6O 4AHCA 1HX1A 3OBWA 3F9KA 4JKCA 5C12A 4CGIA 4ZHRA 4F4KA 3AA2A 2YNGA 4Z4FA 5C2FA 2P5OA 2ZF5O 4W5NA 1BHLA 4ICLA 5AQFA 3ID6A 5J2NA 4FLVA 4GVEA 3C6UA 4CI6A 5E26A 4B9LA 4BEBA 2Q0RA 4W5TA 2O8CB 5M1KA 4LY7A 2XO7A 1QHAA 1Q81O 3LDQA 3OYJA 3FE1A 2ITMA 3TR8A 2YHWA 3CERA 3MXJA 4B9TA 5AQWA 3DYAA 4FWPA 1ITGA 5B8HA 5HL7L 3LDSA 2VG5A 1HLUA 4BRFA 4WQ4C 2UU9K 4CJKA 4JKGB 3QDKA 5KPZA 5BN8A 2GEMA 2ZJQL 3MEEA 3UIQA 1OVYA 4X64K 2RN2A 3VQDA 4FWNA 4IEEA 4CFCA 2Q3SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3QEV A;  1OH8 A;  3S3O A;  2Q2R A;  5J2Q A;  1Z25 A;  1HJO A;  4E7I A;  4FLZ A;  2OPQ A;  3CFO A;  4IG0 A;  4GW6 A;  4FL9 A;  1K8A O;  4FZX C;  4IKF A;  3TI0 A;  4DV0 K;  3FZL A;  1IO2 A;  4LFA K;  4FVM A;  1LAW A;  3CJC A;  3VQE A;  3D45 A;  3THW A;  1QQO A;  3ASM A;  3NVM A;  1NJX A;  1YTU A;  3ISN C;  3DI6 A;  3VEY A;  4W5O A;  4C23 A;  3ZSZ A;  4IDK A;  3HVR A;  4KB1 A;  4CK1 A;  4B9Q A;  5CY4 A;  4PKI A;  3NCI A;  3ZT1 A;  2YHB A;  3CG7 A;  1WSI A;  2O8B A;  1RDB A;  4BAC A;  4FWO A;  4H0Y B;  5HBM A;  4BEC A;  4E19 A;  2BE2 A;  2P9L B;  1IV0 A;  2YCH A;  3CPE A;  3ULE B;  4DHY A;  3E9O A;  4ZTJ A;  5AQZ A;  2HBL A;  2WFB A;  5EVZ A;  4FWL A;  4NCG A;  3MEG A;  4F3O A;  2HBK A;  3JXU A;  4OJR A;  2QWN A;  4KKO A;  2HBJ A;  4NXN K;  3NF8 A;  3THY A;  1HKB A;  3GL1 A;  4FYD A;  3WEE B;  2IDO A;  1BQN A;  1TV6 A;  4GMJ B;  3BZK A;  4BC5 A;  5HRO A;  2NRZ A;  1QSL A;  4FM1 A;  1IKV A;  1VQL N;  4K0K K;  1S1V A;  3KWI A;  4IBN A;  4I6M A;  3U9Z A;  3HM8 A;  5JEN A;  2VYP A;  3B8A X;  4BG8 A;  4Z4H A;  2YKM A;  1ZBH A;  1NJI O;  4OLA A;  1P8Z A;  1TKT A;  4B1V A;  3DOK A;  4BRH A;  3MN5 A;  3LAL A;  3BEX A;  4LF4 K;  4JV5 K;  4FJJ A;  3C6H A;  3UKR B;  3KD5 E;  1VRU A;  5SZT A;  1D9F A;  1JXE A;  2XY7 A;  3QFP A;  4KHU A;  2F7T A;  5KPT A;  1L5U A;  3E66 A;  4UY8 O;  1OVQ A;  1S6P A;  1JJ2 M;  1YTA A;  4CES A;  1Y64 A;  3LZI A;  3RMD A;  4M7Y A;  2QWP A;  4R79 A;  3S3N A;  1IBM K;  3IAY A;  4X66 K;  1KFS A;  5JLH A;  4IJN A;  1X9J A;  4YOY A;  2GWK A;  2NRT A;  1KQS M;  3VTI A;  3DLE A;  2HMP A;  4ELT A;  4BE7 B;  3V9Z A;  3KK3 A;  2HHW A;  4DSI A;  1F21 A;  3PSF A;  3OS1 A;  4XJX A;  4KRF A;  3EKS A;  2P51 A;  1NKB A;  3T1H K;  2HB5 A;  3ZSY A;  3PX0 A;  4PUO A;  4JD2 A;  3MN7 A;  3VQ8 A;  1HNV A;  5AQU A;  3FZM A;  3ZX3 A;  5M1N A;  1BA0 A;  3E1Y A;  4DLE A;  2FBY A;  3LAN A;  4EZ6 A;  2IVO A;  3H3O B;  1XHX A;  2KHO A;  4G9Z A;  1YT3 A;  5FPD A;  3OA9 A;  3CQX A;  3H08 A;  4CZK A;  2W42 A;  4B8C A;  1MDU B;  1S5J A;  1M90 O;  3LP0 A;  4DSL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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