2V5BA

The monomerization of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
242
structure length
236
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAGNADALASLKDYGISWVVLGHSERRLYYGETNEIVAEKVAQAAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title The Monomerization of Triosephosphate Isomerase from Trypanosoma Cruzi.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 84
structure length 236
sequence length 242
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2008-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2v5bA00
2DZXA 3H55A 4X3ZA 2AAMA 2J88A 2Z6JA 1L6SA 5F4XA 4NVTA 4AWUA 1VJIA 1TCDA 2NZLA 3EX3A 3JR2A 4MLJA 1Q45A 2RHGA 4CQ9A 4L4MA 1ICPA 5D30A 1ADOA 3W22A 3IVUA 3EB2A 3C2RA 1MEWA 3GB6A 1VPXA 4RX0A 4N9EA 1WOAA 3W71A 4ZQMA 5LGZA 3LTYA 1QFEA 3MJYA 5AC6A 1SO4A 1IF2A 1YYAA 1ZAHA 2DZTA 4AWSA 1I8JA 4ML9A 3L2IA 2FJKA 2NXGA 5EYWA 4FNRA 4NX5A 2P10A 4OBTA 1QWGA 1R2TA 3W7NA 2CLMA 3W1PA 4PFMA 2QAPA 1W56A 3MHFA 3W1NA 5AC7A 3QMSA 1PHWA 3EX6A 1G4EA 2V2HA 2RDUA 1PE1A 3OVPA 4RXGA 5I3IA 8TIMA 4M6QA 1FDYA 4FXSA 1NF0A 2PCQA 5D09A 1GVFA 4OU1A 2CLEA 4XTDA 1KA9F 2F84A 3IVSA 3W76A 3NZ1A 1A53A 1KM0A 4UR7A 5FEZA 3LHZA 4O57A 3TMQA 1LBMA 1ME9A 3W70A 4J9JA 3S5ZA 4KFPA 1N8FA 2GOUA 4IPIA 4NT0A 1ZJIA 1K8XA 4RK8A 4JDBA 4QQ3A 3V1PA 4TR9A 1CI1A 1I2QA 1ZNNA 3T7VA 1LORA 2Y62A 1TTQA 3DKLA 1N55A 4MY9A 5CZ0A 4WOZA 2ZTJA 3H53A 2BZNA 3PVFA 1T0OA 3N2XA 4UIOA 3O05A 4K8HA 3TA6A 1FUYA 1ZAIA 1SW0A 1OFOA 3B4UA 4FNSA 1D9EA 4K7YA 3FS2A 4ONVA 3MP3A 4C1LA 4MZ1A 3M9YA 5D37A 3H54A 3NQ2A 3KVJA 5L9FA 4MPQA 2QCGA 1LYXA 1TPB1 4RZ6A 4WZHA 3GAKA 4KFOA 3O06A 4IX2A 1WAUA 2Y7GA 4CNNA 4MLRA 3W2JA 2Y63A 3WJSA 5FF2A 1VCFA 3S1XA 4EWND 4CCCA 3MI3A 4YLWA 2ZRVA 4DQWA 2YZRA 5E93A 4JTKA 4L4LA 1ML1A 2XFWA 2CU0A 2W6RA 3IRDA 5I3KA 3E49A 5K9CA 1F05A 2H90A 5CKSA 1OG0A 3O15A 3GX9A 6TIMA 1JCLA 3DAQA 4JGDA 1KFEA 2YPIA 5HULA 2ZZ6A 1OFPA 3C4UA 4JICA 2NLIA 1GYNA 3M41A 1I2OA 5FEXA 3STGA 4EF9A 2B7QA 4IMGA 4YWIA 2NX3A 1ICSA 1TMHA 3IIVA 3S5YA 5I3FA 5FEPA 3PUOA 4DEFA 1IIHA 1PS9A 4U28A 3PM6A 3PBYA 5AHEA 1JCMP 2Q3RA 4TMCA 1W5OA 4O8RA 3NL6A 3SSJA 2E09A 1AMKA 2ZA3A 4DF1A 1XUUA 1W37A 3A5VA 2YR1A 1NVMA 3DHFA 3T4CA 3VI2A 5DXXA 1FWRA 1W54A 5H2ZA 1F6KA 3AJXA 2WKJA 3BVJA 3TW7A 1EX5A 2V5BA 2JGYA 4W9TA 1FWWA 3ABQA 2E5CA 2V8ZA 3PG9A 5TQLA 1PCWA 3MP5A 2PRHA 4AAJA 3A23A 1P1XA 1ZHAA 2ATSA 3ABSA 4IMCA 4N9CA 5LNVA 1B9BA 5F2MA 5A5WA 2WSRA 3LM7A 3W1QA 4FF7A 3NL3A 3P5ZA 2A4AA 2E5DA 3CEUA 4FEZA 4JYEA 3MWAA 4LVFA 3VFLA 3G22A 3TXZA 4BI7A 3FKKA 5DCEA 2E68A 3M16A 4IXHA 3C52A 4O1CA 5EY5A 4XKYB 4X9SA 3L5MA 1Y0EA 2ISSA 3EEGA 3GR8A 4KWWA 1FBAA 2Q8LA 1K03A 1GVSA 4MVAA 3NR0A 3TIMA 1HO4A 1MO0A 2A21A 4FO4A 2RH9A 4LNYA 4YXGA 2V9DA 3F1QA 5KZDA 4OHQA 1SFJA 3F4NA 3HO8A 5DCDA 1WX0A 4JN6A 1G7VA 1JRBA 1DQWA 2NX9A 4LU0A 1LRQA 5A8GA 4IUOA 2CLHA 3WJZA 1A5SA 1QPRA 4E0CA 2TRSA 3B0PA 3W7QA 2QEZA 3W84A 5BOOA 1G6CA 5DELA 3W23A 4BWLA 3W7CA 4MYAA 1CX9A 1W31A 1DVJA 2P0OA 4RKAA 1UUOA 3EXRA 3B8DA 1JJKA 1MSSA 1TPWA 2EPHA 2PRLA 2X1SA 4UNKA 3W1AA 3LDVA 2NUWA 4I7WA 1KTBA 3NGJA 3TQ0A 3O6YX 3EX4A 4LUJA 3QW4B 3R13A 2QCMA 3PBUA 1YDVA 3GLCA 4IPJA 1THFD 3IIZA 4N2YA 4XBSA 2ATMA 2A7RA 2KZHA 2X1RA 3UWWA 2R94A 2ZRYA 3FJLA 3TC7A 3HGSA 3VKJA 3KRZA 3UQNA 3BO9A 2TPSA 2Y7FA 1C9DA 4YCPA 3S5OA 3CIWA 4XWUA 5DLCA 4O0ZA 4E2BA 1VZWA 3WJXA 2J6XA 1RQHA 3B04A 3CWNA 2C14A 4FNUA 4PCFA 3DFOA 3LHVA 3GIYA 2QCEA 3UWYA 1LBLA 1M5WA 1RVGA 4C1KA 5HWJA 2Y6ZA 5AHNA 3IGSA 5CPMA 5CPOA 5C2XA 1GTEA 1YTKA 1KM3A 3PULA 3MW7A 1SPQA 2X1TA 3R12A 3W1XA 5F4WA 4FNPA 3ZWTA 5AHLA 1TYGA 2CLFA 4FNQA 1RD5A 1OX4A 1W5NA 1HO1A 5EKYA 3B0UX 1W5QA 5F2LA 4MY8A 2E6DA 3G0XA 3QQ0A 3MYOA 1TPVA 3U8GA 4JX5A 1RPXA 2AQWA 2VEIA 4QSHA 1OFRA 1BTMA 1F6PA 3PB0A 4O13A 5AB3A 4JS3A 3EWWA 4NJKA 3FYOA 5AOUA 5HNRA 5K2ZA 3EWXA 4ZVJA 4CLMA 5F4SA 5E0KA 2E6YA 4JTSA 1MEIA 1I2NA 2I14A 3W85A 2BSLA 3TFXA 3C56A 3QFEA 2OT0A 2J9ZA 1OYBA 2ZA2A 3W72A 3QPYA 2A5HA 1PL9A 1LCOA 4O12A 1DBTA 1WDWA 4UTTC 5AFDA 5GVJA 1DHPA 5G4WA 1F76A 3INPA 1TV8A 4MJZA 2I9EA 1A50A 4UTUA 2ZYFA 3DZ1A 3BV4A 3PY2A 4XUGA 1NAL1 1QR7A 4UTIA 4UFMA 4DELA 3TW6A 2QCFA 1HUVA 4NXSA 2DZVA 2TMDA 4A2RA 2X16A 3OEXA 4CNOA 4EOUA 4H3DA 3LCGA 3LERA 2E1DA 4FB7A 4JTLA 4JY8A 3WK3A 3I68A 1FXPA 4BFAA 4AXKA 3R89A 3EWZA 1VH7A 1FQ0A 4K37A 5FF4A 3NZRA 3W3OA 4LY8A 5DY2A 3UNDA 3MI6A 1EP1A 3N2MA 3P82A 1JVNA 4JYDA 1MXSA 3CEPA 3PBVA 3KVLA 4O11A 3T78A 2QCDB 5HQEA 2VENA 5K4XA 2XN2A 4WJEA 5G2IA 3NL2A 3IV3A 2EKCA 1BWLA 1AL8A 4A3UA 5FF0A 1P0NA 4X2RA 2ZRWA 5HJLA 3W9ZA 3S5NA 3NPVA 2VEPA 2E77A 1XBXA 3LCWA 4WD0A 4JIPA 4O0KA 3GDTA 3JS3A 3QEZA 4NU7A 4TX9A 4FIRA 3DFSA 3O16A 2NUXA 4JX4A 1S5TA 1XL9A 1XBYA 4LV4A 3QRHA 1M6JA 3LCLA 3GNNA 1GVOA 1X7FA 1VYSX 4GRSA 2X30A 3RLVA 1JCJA 3LHWA 2Y61A 3W7IA 1QPOA 3KVKA 3MHGA 4ZQNA 2GVGA 4UTWC 2ZRXA 4Z1CA 5CPLA 2FB2A 3NM1A 1XI3A 2C16A 4AF0B 2OJPA 4R53A 3W07A 3DI0A 3TH6A 4P2VA 1P0KA 4B5NA 3SR7A 4LW7A 2NWRA 4S2CA 1AW2A 3KOFA 2FTPA 4A2SA 1Q3NA 2QUUA 3W7DA 2ABAA 2G95A 2W79A 5MHBA 1H1YA 3BGJA 3P7YA 1GG0A 1HL2A 2YDAA 3NM3A 4GJ1A 2FDSA 5I3JA 1FXQA 1SUXA 2JKPA 4O52A 1KLZA 4Z0SA 4ZQCA 1CW2A 3HF3A 3HMJG 4IGHA 5LNUA 3ZFHA 2YW4A 1L6WA 4Y90A 4QISA 1JQVA 4HSNA 2C15A 4Y9AA 1TPEA 2GPTA 1GT8A 2JBMA 1OX4B 4H4IA 3LLFA 1KTNA 5FEWA 1E51A 2PURA 4LTSA 1ALDA 4K6AA 2QKFA 3CM4A 1BKSA 3O07A 1OYCA 2GVJA 2BX7A 4MUZA 4OWGA 1W3IA 7TIMA 3LHYA 2ZDRA 3PS7A 3W7GA 4O53A 4AB4A 3TQKA 1SZEA 2W0UA 2ZZ7A 3IEBA 4FIQA 5K7JA 1GWJA 1O60A 4XKYA 3C8FA 1PV8A 4M19A 1SSDA 1LROA 3WJWA 1UJPA 1LOSA 3W7OA 3QMRA 4LV9A 1W3TA 1U5JA 2V2DA 3FEMA 3G3MA 2NXIA 2YX0A 1X1ZA 4HN4A 3G1VA 1RQBA 1OFDA 4JYFA 4UTKA 3JRKA 4Z1BA 3NQCA 1EB3A 1LZOA 1JCYA 1O5XA 3GXPA 4Q33A 5FF7A 4N6FA 2C19A 3BG3A 3SIZA 4N4QA 2ZA1A 5C5YA 1K3UA 4RJEA 3ZS4A 3LXAA 2X2GA 1TPFA 5F2GA 1VLWA 3C3NA 3MHUA 3NG3A 2HS6A 1FCQA 1QPNA 4LC6A 5D2YA 1FCUA 1QAPA 2PE4A 3GR7A 1TPUA 4O18A 3W1UA 1RZMA 1D3GA 4O14A 2YCEA 3C2VA 4P61A 1LOLA 3L68A 2EAWA 4NXKA 3WK0A 3GDRA 1SU5A 3M5ZA 4NJHA 3ZR4A 1T99A 5EBUA 3IIXA 3QW3A 1YLVA 4I9AA 4IMDA 4NZJA 1IXNA 1XC4A 1J4EA 3LRLA 4S1FA 2WPBA 1DOSA 5K4ZA 1SW3A 3I65A 1MZHA 2ZFAA 3TUUA 1H61A 2YYUA 4UC5A 2ZZ4A 1NEYA 1QOPA 4FHAA 1H7OA 3M5YA 1B4KA 3FA5A 2DZSA 1TSIA 3QZEA 5D32A 1F2JA 3NQEA 4KFNA 3W7EA 4WY0F 4PEKA 3LGEA 2V30A 3UPWA 4EF8A 4Z08A 1ZAJA 4O10A 1H7RA 3BPWA 4FXRA 3MBDA 5D2VA 2BXVA 5FI8A 3SECA 1OYAA 3GVGA 2G5WA 3DENA 3NYZA 3W1RA 1H5YA 1WXJA 1FX6A 4WY0B 2V2CA 4UFJA 3G1DA 2HMCA 5IM51 1K8YA 2EHHA 2GQ9A 3W7HA 4DBDA 2CZFA 4S2BA 3M47A 3M7WA 3N19B 2ZZ5A 5AHMA 1WA3A 3NVTA 1VCGA 3PB2A 4IMFA 4UMAA 3UZ5A 2G97A 3G1FA 2O7SA 3C2EA 4UFLA 4HNUA 1V7YA 2J24A 3MP4A 3QF0A 2WOQA 3N34A 1Q6LA 4LVAA 3KX6A 1ZY9A 2NWSA 1I45A 1LTDA 5LHEA 3EXSA 2CZDA 4NNAA 1UASA 1RQEA 4WUIA 4LRSA 4A29A 3THAA 1H7WA 3S0CA 1YXCA 2AGKA 1F73A 2A6NA 5G1YA 4TO8A 1OFAA 5HWMA 4UFHA 3PBWA 1EA0A 1YTDA 1JCXA 2WSYA 4K39A 4JXCA 3B05A 4JY9A 3I7QA 1UBSA 3SJ3A 2QCLA 5BMWA 4FX8A 3KHJA 2OCZA 3EXTA 3LV5A 1I2RA 1RV8A 3Q94A 3RNDA 5TBOA 3FLUA 1QDSA 3O63A 3D0CA 3HG2A 3S6DA 3W2MA 4JTTA 3CC1A 3E0IA 4RLIA 3DH7A 3LTSA 2H3DA 1VQTA 3TQVA 1DJNA 2VXNA 1O5KA 3LI1A 3BARA 4XBKA 3C61A 4ICNA 5AYXA 1FCVA 1OFBA 3GYEA 3HG3A 1WBJA 3UXDA 3HGRA 3UWUA 1OVDA 1LM1A 2BTMA 3P5YA 3L21A 4UFKA 5BNKA 2GUUA 5U4NA 1TQJA 3BW4A 2EGZA 2NV1A 1TRDA 1VYRA 5HUPA 5D05A 3HPXA 4TIMA 5LGXA 1DQXA 1VC4A 3KRSA 2QCDA 1GYLA 2R91A 5LZLA 1BEUA 2Z0IA 3NQVA 2CZEA 4NUWA 3C2OA 3Q2DA 1XFBA 4AMAA 4OT7A 3WK1A 2YW3A 4N6EA 3ATYA 5F1UA 1G4SA 3G1YA 3STFA 4BK9A 2WV8A 3DFPA 3DFQA 1KV8A 2VFGA 1AG1O 3GZ3A 5F1VA 1SQ7A 2QUVA 4LS1A 1R2SA 3STEA 4GUJA 4O54A 1Z48A 1KBJA 3CB8A 4M5PA 1IGSA 4WXZA 1I4NA 1UUMA 2R8WA 1KLYA 4Y8FA 3B03A 1FDZA 3LCXA 1GPWA 3L0NA 3M1ZA 3RLUA 3LI0A 4IOTA 4WXYA 4AHPA 1EIXA 2JGQA 4NQ1A 5G5IA 5AN7A 4QM1A 3CPRA 2J27A 4GC4A 4JTEA 4AF0A 2PC4A 5LNSA 3LLDA 3EX1A 5LHFA 5AYZA 3O8AA 3KFTA 2WNZA 3PUEA 3R5EA 3SW6A 4ADUA 3BLFA 4CQAA 3T55A 1LP6A 3W86A 1SZGA 1TTIA 1T96A 5D2WA 3SGZA 1VCVA 2ZRUA 3FKRA 3T44A 3QJAA 1W5PA 1JQXA 2DJXA 2TYSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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