2V7YA

Crystal structure of the molecular chaperone dnak from geobacillus kaustophilus hta426 in post-atp hydrolysis state
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
504
structure length
504
Chain Sequence
MSKIIGIDLGTTNSCVAVLEGGEVKVIPNPEGNRTTPSVVAFKNGERLVGEVAKRQAITNPNTIISIKRHMGTDYKVEIEGKQYTPQEISAIILQYLKSYAEDYLGEPVTRAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKEEDQTILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFEVKATAGDNHLGGDDFDQVIIDYLVNQFKQEHGIDLSKDKMALQRLKDAAEKAKKELSGVTQTQISLPFISANENGPLHLEMTLTRAKFEELSAHLVERTMGPVRQALQDAGLTPADIDKVILVGGSTRIPAVQEAIKRELGKEPHKGVNPDEVVAIGAAIQGGVIAGEVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIERNTTIPTSKSQVFTTAADNQTTVDIHVLQGERPMAADNKSLGRFQLTGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVRAKDLGTNKEQSITIKSSSGLSEEEIQRMIKEAEENAEADRKRKEAAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords CHAPERONE PROTEIN DNAK
publication title Crystal Structures of the 70-kDa Heat Shock Proteins in Domain Disjoining Conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus kaustophilus hta426
total genus 116
structure length 504
sequence length 504
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 2v7yA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2v7yA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 2v7yA03
5AQOA 1GLAG 2D1KA 3HM8A 4H0VB 1S22A 4RWTA 1BA1A 2GWJA 4BRGA 5EX5A 1YXQA 3WQTA 2ZWHA 3WQUA 3DJCA 3O08A 4DHYA 3CJCA 4AM6A 4BG8A 3LDOA 5JMVA 3CI5A 1NWKA 1DGKN 3AAPA 4XEIA 3H45C 3VENA 3IMXA 4BR9A 3SJHA 1NGFA 4F9OA 1BPRA 2AP1A 5KQ8A 2ZGYA 3H3OB 1T44A 5B8HA 3J8AA 1DG4A 1NBWA 3GDQA 1NGJA 2ASPA 3DWLA 2P9NB 4JNEA 2IVOA 1ATSA 4EZOA 4MO5A 4ISEA 2P9PB 1Q18A 4B9QA 3I8BA 4FPBA 2GUPA 1D4XA 3A8YA 3VGLA 2D0PA 3LDPA 1X3MA 4BR7A 3FE1A 4BGBA 3ZEUA 3AY9A 3W0LA 4A2BA 5AQKA 3GBTA 3B8AX 4WYBA 4O8KA 5CE3A 1NGGA 3R6MA 5AFUA 3O80A 1DEJA 3MK6A 4JWDA 4B1YB 1SZ2A 5F1XA 1X9JA 1P8ZA 4R5GA 4XH1A 4BC5A 3KVGA 2Q97A 3D7EO 4HWIA 1U2VB 4EHUA 4FWLA 3U9DA 1QHAA 5ADXH 2E2NA 2CH5A 4EAHD 3VF6A 2E1YA 5JLHA 3HZ6A 4C23A 3VOVA 5BRFA 2BPRA 2YHYA 2GEMA 3DXKB 1YUWA 4EZSA 3WEEB 1XQSC 3FZMA 1SQKA 4FWSA 1LOTB 2QW9A 1E4GT 1U6ZA 3I33A 4AM7A 4JD2B 2ZF5O 4H5RA 4BRMA 3CJ9A 4BR5A 3MN6A 1GLJO 2P9NA 4PO2A 3H46O 3U8XA 4H0OA 5KPTA 2P9PA 3HTVA 3CQXA 2YI1A 3DOBA 1TUUA 2FF3B 3LL3A 3A0IX 1NGDA 3BF1A 1S3XA 1NGIA 4CZEA 3GG4A 1EQYA 3R9PA 5BN9A 3R8EA 4YDUC 1RGIA 4BRIA 4CZFA 2QXLA 1BG3A 3O4WA 3VEYA 5AQXA 3A5LC 4NB4A 4EZTA 2PAVA 2GWKA 4GNIA 5BPNA 5BRHA 1TYQB 1U2VA 1NGBA 1JCFA 1V4SA 4FOEA 2Q1NA 4DB3A 3L0QA 5AQHA 1C0FA 4FL9A 4FWNA 1BU6O 2E88A 2D0OA 2Q31A 4H0TB 4CD3A 5AQVA 3G25A 3DAWA 2VCPA 3DXKA 5AQGA 2E2QA 4K43A 1T6DA 5AQIA 4XH5A 5AQYA 3ZEUB 1JCGA 2AA4A 4CZKA 3WEEA 5I9EB 1LCUA 5EVZA 1J6ZA 2A3ZA 2CGLA 2E1ZA 2A42A 4EZVA 4BRPA 1H1VA 4JD2A 4JNFA 3H6EA 4FWPA 3U9ZA 4BQLA 1NMDA 3HI0A 4BRHA 4B1VA 3ENOA 3BUZB 3A5MC 3M6GA 3JS6A 5KQDA 1BUPA 4FWQA 3SK3A 5BREA 4IZ9A 2Q2RA 4BGAA 4JHDA 1ZXOA 2VYPA 4BRCA 1Y64A 1HLUA 3DXMA 4BRNA 4BRLA 1ZBSA 4FWRA 4H0YB 3VEZA 2VWBA 4H5WA 3N8EA 1Z05A 1DKGD 3ID8A 3WXIA 1NGHA 3VESA 4ISGA 4WQ4A 3QBWA 4K41A 5EY4A 1NM1A 3UE5A 4JWCA 2FLOA 4CBWA 1TYQA 4FO0A 5FPDA 3MN7A 4JAXA 1C0GA 4FOIA 4EZQA 5KPZA 3A5NC 2F9WA 2YCHA 2FSKA 4IO8A 2A41A 3VPZA 5LJWA 2QWMA 2V52B 1GLCG 2P9LA 4CZIA 4CZGA 1KXPA 3DPQA 2P9SA 1GLEG 1HPMA 4H0XB 4H0PA 3LDNA 4WQ4C 5AR0A 3H3NO 3SLCA 2ASOA 3L6QA 2WUSA 2Q36A 1V4TA 3GE1A 1MA9B 1RFQA 2A6AA 4RCHA 3MMVA 4IWVA 2QWQA 3RSEA 4BROA 3QBXA 4MLEA 1GLFO 4A2AA 4CZLA 1NGAA 4J8FA 4EFHA 3D2FB 4EZYA 3EZWA 3O6WA 3VERA 2V51B 4JN4A 1BA0A 5EXWA 1R59O 4JWIA 4QS9A 2OP6A 5AQLA 1BOTO 3UKUA 3VETA 1HX1A 1MWMA 1NGCA 4BC2A 5AQWA 3UB5A 5FPMA 4H5VA 3FGUA 3LDQA 4MO4A 5BN8A 1QQOA 2Q0RA 1TUYA 4BC4A 3U4LA 4I6MB 1NGEA 3DPPA 4PKGA 4KBOA 5AQQA 4BRAA 2OANA 3QDKA 2DPNA 4FWOA 4B1WB 2YJFA 3VF2A 3EL2A 4K25A 1KAXA 3LM2A 1QZ6A 3IDHA 4WQ5A 4NO7A 1ATRA 4JHDB 3TU5A 3S41A 3VEOA 3GOIA 3DXMB 2IIRA 5BR9A 3ZX3A 4H5NA 1Z6RA 4WV7A 3FZKA 5JLFA 3EN9A 2QM1A 4O5FA 5F2RA 4CI6A 1JCEA 4BRQA 4BR2A 1BO5O 1IG8A 2P9UB 4BQZA 4F00A 1GLLO 3D2EA 3D2FA 5AZIA 1KAZA 2W41A 3FR0A 4BREA 3BF3A 2E2OA 2E8AA 4L3QA 4CZHA 4Z94A 1YAGA 3O5BA 3MN5A 1KAYA 4H5TA 4XH4A 4PL7A 3DQGA 1GLDG 2P9LB 2I7PA 1HKGA 3WXJA 4BVOA 3ZETB 4BRFA 3VGKA 2P9SB 3O1WA 1Q5LA 3WXKA 1NLVA 2NRHA 1DKYA 3EKSA 3IUCA 4I6MA 5AQRA 2BUPA 1OKJA 4CZJA 1WOQA 4EHTA 3RSEB 2I7NA 1CKRA 2QWNA 3AARA 3QNJA 3MN9A 5AQJA 1BDGA 2QWOA 4EZNA 1HUXA 2CGJA 7HSCA 4F01A 1RDWX 4GY2B 2IVPA 3UKUB 5E84A 3AAQA 2P9IA 1QQMA 3KHYA 2F9TA 2GTDA 3CJBA 4A61A 2NZTA 3CHWA 5AQZA 5FPEA 3O8MA 2FSJA 2YHWA 4CJ7A 3F9MA 4FPAA 4EZXA 4IJAA 2J4RA 4FWMA 3SMPA 3DPOA 2P9KB 1HKBA 2P9UA 4QS8A 1QQNA 2UYTA 1SAZA 3L4IA 1X3NA 4BG9A 3FZLA 1XC3A 1CZAN 4PKHA 4B1UB 3HBTA 4M7XA 4PKIA 3QFUA 3QICA 4MLHA 3CJ1A 3ZETA 2ASMA 1DKXA 3C0BA 2ITMA 4R5KA 3ATVA 4EZRA 1IJJA 1MDUB 3CJAA 3QB0A 4EZZA 4HY9A 5E26A 4CBXA 5LY3A 4R5JA 5AQFA 5BRDA 3WXLA 3EO3A 3H0XA 4QS7A 3BEXA 2IVNA 4HTLA 1G99A 2NLXA 3O1BA 3CETA 3CERA 3D2EB 5AZIB 5BPMA 5F0XA 3FFKB 5EOYA 3ULEB 3JXUA 2V7ZA 3VEVA 3MCPA 2HOEA 3C7NB 2H3GX 4CZMA 3BP8A 5AQNA 2CGKA 1XUPO 4EIAA 4DQ8A 2BTFA 1YVNA 2YHXA 4R5LA 3OHRA 2P9KA 3ZX0A 4M7YA 1ZC6A 2QWPA 4FWKA 2FF6A 4BC3A 1T6CA 3VEXA 4B1ZA 3VEWA 3ATUA 1K8KB 2Q0UA 5AZJB 5BPLA 4BR0A 4CBUA 5AQUA 1WUAA 3UKRB 3FZFA 4HYBA 2A40A 4Y0WA 3KZBA 4FSVA 4DCHA 4IXCA 2P9IB 3M1FA 1HKCA 4B1XB 2YJEA 3QMLA 4BRKA 3HSCA 3WT0A 4EZUA 4RTFD 2D4WA 1U00A 4R5IA 1DKZA 2PBDA 3A5OC 3ENHA 3W3DA 4A62A 1MWKA 3M3ZA 4LC9B 3CQYA 4YDUA 4M63C 4WQ5C 3EKUA 3IFRA 2HMPA 3ZX2A 2GELA 5JICA 4IJNA 3GL1A 3ULEA 2E20A 1ATNA 2HF3A 2HF4A 2CH6A 3QFPA 2KHOA 3C7NA 3CIPA 5LJVA 5AQPA 3VF4A 2FXUA 5AQTA 5FPNA 2W40A 3VGMA 4CD1A 4E1JA 1ESVA 1E4FT 3CJ7A 3LDLA 3LM9A 1GLBG 4WV5A 2E2PA 4EZPA 4JWEA 3H1QA 5KPRA 1QZ5A 3FZHA 3P4IA 4ISFA 5AQMA 4BR4A 4BRDA 4BVPA 2QWLA 3H1VX 5ELZA 4PL8A 3TPQA 3WUHA 2ZGZA 4EZWA 1K8KA 5AZJA 5AFUH 2A5XA 3UKRA 3MDQA 2EWSA 2FSNA 5AQSA 5ADXA 3SMSA 4E81A 4K42A 1BWFO 5TKYA 4H03B 1HJOA 3FLCO 2V7YA 2QWRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GLAG 4H0VB 1S22A 5TKWA 1IG9A 3WQTA 3SV4A 3T3FA 1YTAA 3CCMN 1MU2A 2FBXA 4AM6A 1TKDA 1C1AA 4LD0A 4JI3K 4FJ7A 3LZIA 1VQ8N 4CIGA 4FLXA 4F9OA 3OA9A 3CCVN 4CJ3A 1T44A 3RMCA 4B3RK 3J8AA 1EX4A 3PV8A 3LWMA 2G8HA 3EY1A 1VSJA 4GV3A 3I8BA 3PLAA 1OVYA 3SQ0A 3WNGA 1D4XA 1NU0A 3CFOA 3VGLA 2D0PA 5C42A 1JLFA 4BR7A 3QLHA 4BGBA 4FXDA 3AY9A 4A2BA 3KWGA 3MK6A 4I9LA 4R79A 4B1YB 1P8ZA 4BE0A 3TAQA 2NNWA 3I55N 1I3AA 1ZBFA 3HL8A 3M8QA 3WXMB 3AVFA 4HWIA 2ITGA 4EHUA 3U9DA 4LF5K 2E2NA 1K73O 3SUQA 4BE1A 4EAHD 4GV9A 3F9KA 5M1PA 1RT6A 1YUWA 3TARA 3P38A 4BY9C 3QEXA 3WEEB 4CJ4A 4OO1J 4KB1A 2ZF5O 4YHHK 3RRHA 1M90O 4GKJK 4NCGA 1GLJO 3U8XA 5KPTA 4F3TA 2PFUA 2QKBA 3DLEA 4JKFA 4EZ6A 4FVMA 2YI1A 3NFAA 3LL3A 4B9UA 4CHQA 2P51A 5M1FA 5HRNA 4CZEA 4LSNA 3GG4A 3R8EA 2ZJPL 3SBGA 1S1UA 3QNNA 3LAMA 4CZFA 4CJ5A 2PAVA 3MXIA 2RPIA 5BRHA 4IFEA 1JCFA 1TKXA 4G1QA 2Q1NA 3F2KA 4FL9A 1NKBA 1QVFM 4FWNA 4GKKK 5A2QO 2RKIA 4DQIA 4I43A 4XH5A 4CZKA 5M1KA 1WAFA 3WEEA 1QTMA 1LCUA 1J6ZA 2A3ZA 3OY9A 3VN5A 3QIOA 5JVGL 3U9ZA 1KCFA 3HI0A 4B1VA 4CF9A 3WNFA 3BUZB 3A5MC 2YX6A 1FXXA 4FWQA 3SK3A 5BREA 3I0SA 1ZXOA 2VYPA 4ELUA 3DRPA 3HRGA 4JKGB 4H0YB 2BGGA 4H5WA 3PX4A 3SPZA 4JI5K 4NLCA 3HPOA 4E7JA 1DKGD 3V6DA 3ID8A 2DFFA 3WXIA 2NRRA 1HMVA 1NGHA 3VESA 1R0AA 1HYSA 4BEBA 3VQBA 4JI6K 4FM1A 1RTHA 3ZSWA 5CHIA 4KFBA 4DF4A 4FO0A 3MN7A 1BQNA 2KFNA 1C0GA 5KPZA 3SAFA 5LJWA 2V52B 2PZSA 2P9LA 4CECA 4N56A 1GLEG 3ZT0A 3SLCA 1RBUA 2WUSA 2Q36A 3OVNA 4CJFA 1S6PA 3VMFB 3OYHA 3K0SA 1VQON 3ISNC 4CEBA 4DQPA 1RFQA 2A6AA 3MX5A 4CFAA 4CEFA 3I56N 4A2AA 4W5RA 1NGAA 1TK5A 5D3GA 3EZWA 4B9NA 2AJQA 3DRRA 4JN4A 4JWIA 3OYJA 2OP6A 5AQLA 3L8BA 4DV3K 1WLJA 2OZSA 3CQ8A 3LDQA 4FJGA 5FRNA 1S5JA 5BN8A 1RDUA 1QQOA 1NKCA 4CJEA 1TUYA 3SBTB 3CFRA 1L3TA 4CGFA 4PUOA 1VSDA 4PKGA 4ID5A 1J5EK 4BRAA 3QDKA 5C2FA 4B1WB 1WBBA 2F4VK 2HBLA 2RE2A 2VGMA 3V81A 4JKBA 1CXUA 3EL2A 4NO7A 1DT9A 4JHDB 3RRGA 3TSUA 3SQ2A 1KVCA 2IIRA 3EYZA 4FK0A 1NJIO 4OPAA 3VQEA 1JCEA 4GVEA 4BR2A 1CLQA 1CZ9A 5C10A 1GLLO 3ZCMA 2R7YA 4BREA 2E2OA 2E8AA 2UXDK 4JK8A 4DSEA 5FROA 1EWRA 4PL7A 4BVOA 1HKGA 2F8TA 3ZETB 3VGKA 3O1WA 4YOTA 1DLOA 2RHKA 3SBTA 5C24A 1EWQA 3EKSA 1S72N 3IUCA 2BUPA 1RTDA 1OKJA 4EHTA 4MDAA 3ZT3A 2I7NA 4MFBA 3P83D 1CKRA 3J7ZO 2DY4A 3QNJA 5AQJA 3TANA 4EZNA 2CGJA 4DV4K 7HSCA 1RDWX 4GY2B 4E89A 4WE1A 2X78A 2IAJA 3UKUB 3NVKA 3K5MA 2P9IA 4B8AB 4JS4A 1JKHA 3OS2A 1QQMA 1J5OA 2GTDA 4A61A 2OA8A 2FSJA 2YHWA 3F9MA 4E1MA 2KQ2A 5CY4A 4EZXA 5C0YA 1HKBA 2LSNA 4CGIA 1OVQA 1NK0A 4Z0UA 4CHOA 3CD6N 3KK3A 2UYTA 3L4IA 1XC3A 3AVMA 1VQNN 4B1UB 3HBTA 4DTXA 3QICA 5T7BA 3E9LA 3ZETA 4IEEA 2X6SA 4F3OA 3PSIA 3ATVA 4EZRA 1BHLA 4RW8A 2E6MA 1U48A 4KHQA 5KTQA 1MDUB 5E26A 4DS4A 4R5JA 1BQMA 3THWA 1WB9A 5AQFA 4DSKA 4KRFA 2RF2A 4NLBA 5CZ2A 3QESA 2XY8A 3BEXA 2IVNA 5IT9O 2NLXA 2P1JA 3AGRA 3O1BA 4CF0A 3HVTA 2XRIA 3D2EB 5AZIB 1RT7A 3TAEA 5KGWA 3AVNA 1LAWA 3ULEB 2VG6A 1KFDA 4MDBA 3VEVA 4W5OA 3BP8A 3OW2M 1Q82O 1HNXK 2HSTA 3WNEA 4EIAA 3D0PA 1YVNA 4IOXA 4Z4HA 3ZSOA 1KLMA 1KTQA 5GIPA 2PYLA 3VEXA 2Q0UA 5BPLA 3K9JA 4CBUA 3OYIA 2KZMA 4IFVA 4Y0WA 4DCHA 3M8SA 1IV0A 1HKCA 5CYQA 5FLXO 3SQ4A 4BRKA 4AH9A 3BGRA 3RMDA 2D4WA 4U7BA 2PBDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3CIP A;  5LJV A;  5AQP A;  3VF4 A;  2FXU A;  5AQT A;  5FPN A;  2W40 A;  3VGM A;  4CD1 A;  4E1J A;  1ESV A;  1E4F T;  3CJ7 A;  3LDL A;  3LM9 A;  1GLB G;  4WV5 A;  2E2P A;  4EZP A;  4JWE A;  3H1Q A;  5KPR A;  1QZ5 A;  3FZH A;  3P4I A;  4ISF A;  5AQM A;  4BR4 A;  4BRD A;  4BVP A;  2QWL A;  3H1V X;  5ELZ A;  4PL8 A;  3TPQ A;  3WUH A;  2ZGZ A;  4EZW A;  1K8K A;  5AZJ A;  5AFU H;  2A5X A;  3UKR A;  3MDQ A;  2EWS A;  2FSN A;  5AQS A;  5ADX A;  3SMS A;  4E81 A;  4K42 A;  1BWF O;  5TKY A;  4H03 B;  1HJO A;  3FLC O;  2V7Y A;  2QWR A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GLA G;  4H0V B;  1S22 A;  5TKW A;  1IG9 A;  3WQT A;  3SV4 A;  3T3F A;  1YTA A;  3CCM N;  1MU2 A;  2FBX A;  4AM6 A;  1TKD A;  1C1A A;  4LD0 A;  4JI3 K;  4FJ7 A;  3LZI A;  1VQ8 N;  4CIG A;  4FLX A;  4F9O A;  3OA9 A;  3CCV N;  4CJ3 A;  1T44 A;  3RMC A;  4B3R K;  3J8A A;  1EX4 A;  3PV8 A;  3LWM A;  2G8H A;  3EY1 A;  1VSJ A;  4GV3 A;  3I8B A;  3PLA A;  1OVY A;  3SQ0 A;  3WNG A;  1D4X A;  1NU0 A;  3CFO A;  3VGL A;  2D0P A;  5C42 A;  1JLF A;  4BR7 A;  3QLH A;  4BGB A;  4FXD A;  3AY9 A;  4A2B A;  3KWG A;  3MK6 A;  4I9L A;  4R79 A;  4B1Y B;  1P8Z A;  4BE0 A;  3TAQ A;  2NNW A;  3I55 N;  1I3A A;  1ZBF A;  3HL8 A;  3M8Q A;  3WXM B;  3AVF A;  4HWI A;  2ITG A;  4EHU A;  3U9D A;  4LF5 K;  2E2N A;  1K73 O;  3SUQ A;  4BE1 A;  4EAH D;  4GV9 A;  3F9K A;  5M1P A;  1RT6 A;  1YUW A;  3TAR A;  3P38 A;  4BY9 C;  3QEX A;  3WEE B;  4CJ4 A;  4OO1 J;  4KB1 A;  2ZF5 O;  4YHH K;  3RRH A;  1M90 O;  4GKJ K;  4NCG A;  1GLJ O;  3U8X A;  5KPT A;  4F3T A;  2PFU A;  2QKB A;  3DLE A;  4JKF A;  4EZ6 A;  4FVM A;  2YI1 A;  3NFA A; 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