2VI0A

Lichenase ctlic26 in complex with a thio-oligosaccharide
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
275
structure length
275
Chain Sequence
GLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPGALAAYREAIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase H
publication title Probing the beta-1,3:1,4 glucanase, CtLic26A, with a thio-oligosaccharide and enzyme variants.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium thermocellum
total genus 111
structure length 275
sequence length 275
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2007-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vi0A00
1BVNP 3SUWA 4B3LA 4DWSD 1GW1A 2HISA 5HBFA 1E73M 3KL5A 1E6NA 3ARPA 4PTWA 5FOOA 3EMCA 3OZOA 1XV8A 3EMZA 3WH9A 4U3CA 2VNCA 4HOWA 1GQLA 2QMKA 3HN3A 1FOBA 5I6SA 1C8XA 1G01A 1CECA 5CPSA 3MANA 3EDFA 4DUXA 2UY4A 5LA2A 4D71A 5CGMA 3WFZA 4A4AA 4UTFA 4F79A 2G3NA 2E4TA 3PZ9A 3POCA 5D9PA 2VOTA 1V3MA 1J11A 1B3YA 1GOMA 1K9EA 2PBOA 3THCA 1DWFM 5GPRA 3SCWA 4U31A 3GXIA 4UFIA 4HMEA 1H5VA 2PWFA 1OGBA 4UQAA 3FY1A 1J9YA 1E4MM 4ZFMA 3GXMA 1M01A 3BAWA 4AYSA 1E71M 1MFUA 2IXUA 4HZ6A 4MJ2A 3AHYA 3BCFA 2BHZA 2F8QA 1LJYA 2WC4A 8CGTA 1E72M 3DECA 2WZIA 4U33A 2BVDA 1ZU8A 1UD3A 3W53A 2AAAA 3PTMA 4C7FA 2ZUTA 1GQKA 3N9KA 2D24A 2UY3A 4PMUA 1MQQA 1MYRA 1LQ0A 3T08A 3VTRA 5M5DA 3F4VA 1V08A 1VJSA 3CGTA 3WEMA 1JF6A 1AQMA 3M6DA 5CQ1A 1VAHA 2BHYA 3O9NA 5ABEA 4W5UA 1L0PA 1VIWA 1ITCA 1XD1A 1JF5A 1QI4A 6A3HA 1UWTA 3K46A 4FLSA 5JBFA 2EJ1A 2G3MA 4GPNA 1HVQA 1E1FA 2OYKA 1UKOA 1W3KA 3CO4A 4JFTA 3L4TA 1NWRA 4LGXA 1BTCA 2EPKX 1WZAA 4JCMA 3VGBA 3ZT7A 4CD4A 1KBKA 3II1A 2ZXBA 1DP0A 1OWQA 2DDXA 3SCVA 2WCSA 4UQ9A 1CXHA 3LPFA 2DSKA 3WH8A 4AZCA 3T0DA 4UZSA 5LA0A 3CUGA 2CBVA 1J0IA 3UETA 3ZJ6A 4BQ3A 1VJZA 1ISXA 3RO8A 5CSUA 1PPIA 3CIVA 4OJYA 1NOWA 3CH9A 3MKKA 1AQHA 4WJXA 2J8FA 1US3A 1KXTA 4NSBA 2DSVA 4PUDA 4JHZA 4W7UA 4J3TA 4HU0A 3UCQA 4GI9A 1XRVA 3NSXA 2JF7A 1ZB5A 2WANA 3VX1A 2XJ7A 2OYLA 3OLDA 2WHMA 1HN1A 3E1F1 4IM4A 1J0KA 1WZMA 4H8HA 1KBBA 5M17A 1W3JA 3OG2A 2J47A 1E43A 1EHNA 1QNRA 1U30A 3KZSA 5D9NA 3N11A 2J8GA 1J10A 1PEZA 4AIUA 1OD0A 3IJ9A 3N17A 4KMQA 2BXYA 1FA2A 3PN8A 2XWEA 4H41A 1CENA 1V02E 1CGWA 2WHLA 1HL9A 5C8BB 1HKJA 2CITA 1F4AA 1W1YA 3CHDA 1S46A 2C0HA 3VM7A 3UESA 4HMCA 5A8QA 1EH9A 2BVTA 3EDDA 2DT1A 1CDGA 3W4RA 1B3WA 1HJSA 2A3AA 3W0KA 1HJQA 2BXZA 2GJPA 3IJ7A 4UQEA 3GNOA 4BF7A 4QAWA 4HMDA 1TCMA 4AD4A 1CEOA 4AMCA 1U2YA 3VGHA 1BAGA 2WSKA 3ARYA 2D0GA 1XYFA 4AEFA 1WDQA 4A3YA 1UR0A 1K9FA 1WO2A 1W1PA 1PX3A 3BGAA 1B31A 3MUAA 1LWJA 3W81A 1BVZA 1XCXA 1RP9A 1U33A 2J7CA 1KCKA 4NF7A 4UFKA 5E0FA 1KQZA 5FD0A 5A2BA 1VFOA 4LX4A 1V3LA 2E40A 2EPOA 4QFUA 3SCTA 5D8WA 2WVUA 1QNQA 1M03A 2YL5A 4P8WA 2ESCA 3HJEA 4W7WA 3WD0A 1WZLA 3VGEA 3N18A 1VFFA 2V5CA 5IFPA 5ABFA 4AZHA 4WLCA 2VR4A 3IJ8A 2CHOA 4PCSA 4WKHA 2BV9A 3AZRA 1KR0A 1GVIA 2O92A 5AC4A 3IAPA 1DWIM 4WK9A 5A2AA 4D6GA 3L4ZA 1IZJA 5CGTA 3CZ8A 1UYQA 3N1AA 3GYCA 5DO8A 3W6MA 1JL8A 3AHZA 3VIKA 1ISVA 1RP8A 2GJXA 4KGJA 3GNRA 4AWEA 3PTKA 4HPGA 4U2ZA 2VX5A 3AYRA 4JL2A 1HKIA 4E8CA 1H09A 3FAWA 4Q7NA 3THDA 1VENA 1ZBKA 3VO0A 2E8YA 4C7GA 1B3VA 1KGUA 1GJUA 3FN9A 3EYPA 4XV0A 2PWEA 2Y2WA 4PCTA 1V03A 2GJRA 3U5YA 1UR8A 2VJXA 2XFFA 3CZKA 3A47A 2OYMA 3EDJA 1JZ5A 3POHA 1WZKA 1EO7A 5EB8A 1KB3A 4AIOA 2VMFA 1GOWA 5A6MA 5F7UA 1DWHM 3T0AA 3AIRA 4DWSB 5AYBA 4PYSA 5BCAA 1F4HA 1DWGM 1HJVA 2G41A 2ZUNA 1JXJA 4NZCA 4W8LA 1E4LA 1B3XA 1HX0A 4W8AA 2VX7A 2QMJA 1B1YA 3VMPA 2YOCA 4ATLA 1FFRA 5E70A 1NARA 5LYRA 1CXKA 1E6SM 4S3KA 2WKLA 1VBUA 4OIFA 3UR7A 3UR8A 1JYWA 1I1WA 4D1JA 1DTUA 2OWWA 4URIA 2ZUSA 1XH0A 2QF8A 4J27A 3TONA 3FHQA 2BNJA 4CCEA 4H7VA 3SEPA 1BG9A 1PBGA 4UOJA 3WQ4A 3WSUA 5KEZA 4QDMA 2A3EA 4FLOA 2FGLA 1W2PA 4OZOA 3PZOA 5DMYA 1E5JA 5A94A 2CBUA 3VIMA 1A47A 3CHFA 2YA1A 5D8ZA 1E3XA 1QI0A 2E9MA 3WF4A 3ARSA 4UOQA 3CTTA 2DT3A 1BHGA 3CZJA 1D2KA 3QHOA 3WDRA 1HL8A 1PIFA 4AY1A 4LYQA 3WF3A 1JAKA 1Q6CA 2YDSA 4J3SA 4DM1A 4UFMA 2J77A 4M82A 1JZ3A 2F2HA 1JYXA 3QR3A 1JYNA 2VO5A 4AXNA 2XSAA 3AIWA 4CCDA 2FDMA 4U3AA 2YL8A 1NP0A 5IFTA 3DYPA 3QOKA 2J4GA 3MUIA 2VRQA 2CBIA 3LPPA 3NJ3A 1W3HA 5A8OA 3NIYA 3GDBA 1W32A 2ZXAA 3N13A 1NWUA 1QW9A 3SURA 4UQDA 5JBEA 1TE1A 3OGRA 3VMOA 1GOOA 2J62A 1JZ4A 2DH3A 3AISA 2VL4A 1WDSA 3AYSA 4JHOA 1OBAA 5HOSA 4CVUA 4ZXLA 3ZJ8A 3ZOAA 3RM8A 1V6VA 3GBEA 5HPOA 1G9HA 2X05A 2YLAA 1DHKA 4GKLA 2ZICA 1FH8A 2VURA 4OBRA 1QNOA 3IK2A 2YA0A 4PSRA 4X0VA 2CPUA 4HPHA 1JG9A 4HOXA 1EOMA 1XGZA 3MSGA 1W9PA 4AD1A 2QPUA 5FKYA 1UH3A 1BYAA 3RJXA 3FHAA 4M80A 4QCEA 3VIFA 2X0YA 1H4PA 1QI2A 1JFHA 4J3UA 4B9ZA 4C7DA 3WN6A 1ZBVA 3L4UA 3OZPA 3ARXA 2Y8VA 3N12A 4CN4A 1TVNA 1V0MA 1CGXA 5FIPA 4PTXA 1H3GA 2V3GA 2ZWZA 3ZJKA 2O9OA 5BRQA 2UY5A 1HVXA 4L4OA 2G4FA 2W63A 5HNNA 5BRPA 3FW6A 5I0DA 2VZUA 3WMSA 1VRXA 3PZUA 3ALGA 3TTYA 4CN1A 1W9UA 3TTOA 2DH2A 4MB5A 4BA0A 2IXVA 1X6NA 3S6TA 3PZTA 4P7NA 3W29A 2PWDA 4RE2A 5I77A 4OBSA 1ISWA 1J18A 3SUSA 4RE3A 5JIWA 4WF7A 2WWDA 3PZIA 4YHEA 4ZENA 1SR0A 2GK1A 3QOMA 3B8SA 4MAZA 4QLLA 2FHBA 2VVNA 5AY7A 4D6FA 3NUKA 1VBRA 1GOQA 2AMGA 5DEZA 5I79A 4AD0A 1CPUA 1MXGA 2WWCA 5ABGA 4GZJA 7TAAA 2EPMX 4HOZA 5A3HA 1E6PA 4QLJA 4W5ZA 2WLZA 3K8MA 3W27A 2DSZA 3AICA 4NRSA 3ALFA 3VNYA 3QGVA 1BSIA 4TUFA 2X2YA 4UFHA 1EDTA 4MAVA 2E3ZA 5E9AA 3CZLA 5DT7A 1VEMA 1M7XA 4GI8A 2J75A 3CUIA 3APGA 1QI3A 1KGWA 5A6BD 2A3BA 5CG0A 1R7OA 1Q6FA 1CLVA 3TOPA 4FK9A 4P8VA 2F61A 4MADA 1AMYA 4Q22A 5BXTA 2XFYA 4EE9A 1PZ2A 2XIBA 2XVNA 3VMNA 1LL7A 4AISA 1ZJBA 3OLIA 3DC0A 2DSWA 2V3DA 2WKGA 4DWSC 2CKRA 1GNXA 5A8NA 3JUGA 4W86A 1W3LA 3CUJA 3CUHA 5DFAA 2J7EA 1G1YA 1BPLB 4GO8A 4UCFA 1SYTA 5EBAA 4BZYA 5ABHA 3VINA 4JL1A 3VVGA 4D6EA 1XSJA 4N0RA 3VPLA 4V28A 2E9BA 5BROA 3CZGA 2YKKA 1ZL1A 4Z2LA 1Y7VA 2NT0A 1JNDA 1TR1A 2WMIA 1E0VA 1J0ZA 2J7GA 4AZ6A 1OM0A 3U5UA 3F5KA 2C7FA 3OIHA 1DWAM 1EXPA 3WUBA 2FH6A 1LL6A 4Z2HA 4EAMA 2EBNA 1XCWA 4IPLA 1GVYA 3OA5A 2XVKA 4LPCA 3WQ6A 5A6BA 3OB8A 1UD6A 3RIKA 3ZSTA 2DIJA 3WFLA 4Z2JA 4Z2GA 1UWQA 4WSKA 1KXVA 1E40A 3AS1A 4D6CA 3O6AA 2DGAA 3GXDA 3RMEA 2FH8A 1HKKA 1SMAA 1B90A 1UD4A 2X0HA 1V0NA 3WD3A 4W8BA 4ML4A 1V6YA 1H1NA 2WYSA 1UD2A 3SCNA 3NDZA 2WZEA 3M7SA 2G8ZA 1NOUA 1V3JA 4CU6A 2ZUMA 1KGXA 4LYPA 1JIBA 1C7SA 5EFFA 1XYZA 4LQ1A 3I3EA 5M03A 4FLQA 3WF0A 2XGBA 3I3BA 2C8NA 2WSPA 2W61A 2J78A 4LXFA 1EDGA 5HDRA 3FNDA 5A2CA 3WNMA 4AZIA 1CXFA 3VDAA 4CD8A 1EIBA 2CXGA 4D6JA 3MUY1 3AMDA 5C71A 1E4NA 3WEZA 3ZJ7A 1MFVA 1MWOA 1JZ6A 2J7HA 2JEPA 5E09A 4EK7A 2WNWA 3WDHA 1E0WA 2D3LA 3CMJA 4GO9A 3U7BA 1HNYA 3SUVA 3M46A 4J3VA 4UZUA 1BGGA 3TTQA 5TD4A 1BYDA 1WDRA 3D5HA 4M29A 2W62A 3EDKA 1CBGA 3W25A 4UNIA 4B15A 2CCRA 3BAKA 4ATDA 2J7FA 4BCEA 3A4XA 3VD7A 1CGYA 2JF6A 3HMCA 3L4YA 1UR4A 3PTQA 1GUVA 1MW1A 1QBAA 1OGSA 1OSEA 1QHOA 2VTFA 1UKSA 3SCPA 4W93A 4M1RA 3WF1A 1MW3A 3WKZA 1QNPA 2WZHA 4FLRA 1PX8A 2ZUVA 4Z2IA 1Q4NX 5M3WA 1B30A 3PZNA 2YDRA 1K9DA 3GH4A 1UD8A 1JNEA 3AMKA 1LG2A 4W7VA 4TOQA 5D9MA 4HA1A 2ZX9A 1TG7A 3LMYA 3ARQA 3OGSA 2WAGA 3B9EA 2BS9A 3BAIA 4N42A 5IXEA 4AW7A 5CJ5A 1JD7A 1MW0A 4XUYA 1C93A 5A6LA 1TA3B 5A8PA 4NI3A 1B3ZA 4JKLA 2YDQA 4LYRA 1BFNA 1UKTA 2O9RA 2VC9A 2XTKA 4DUWA 4AZ7A 3VIGA 4ZE4A 2G3JA 4XZBA 3RM9A 4UOZA 1UH2A 1IV8A 4KRUA 2WVVB 3BLPX 4PBGA 5EFDA 3SCUA 3ARTA 1EO5A 3WIJA 4PTMA 3G6LA 3OLGA 1LL4A 1WE5A 1VEOA 5I3DA 2PF0A 4FMVA 1C7TA 3VD9A 3CHCA 1UWIA 2XYLA 1JI1A 1M04A 5JBDA 4E8DA 1EGZA 7CGTA 2WPGA 4W84A 1XH1A 2ZX6A 3W24A 2W91A 3KL0A 4F9DA 3OLEA 3WBAA 1OB0A 3RCNA 2BY0A 4JCLA 4J3WA 2Y4SA 5I78A 1TMQA 1CGUA 5A8MA 2XWDA 3I3DA 3PBGA 4PMXA 1HIZA 4OKDA 4AC1X 1NQ6A 2FGZA 4HZ7A 1E6QM 5I23A 4TTGA 7A3HA 3ZMRA 1W9BM 2DIEA 1H0IA 3PHAA 3WNLA 4D6DA 2CETA 1X6LA 2NSXA 4D6IA 3AXIA 4AZBA 4ACZB 4GZIA 5A6JA 2D2OA 3AIEA 3VGDA 1E6XM 4HU8A 4M8UA 5KZ6A 1UKPA 5A6KA 3VIHA 3VM5A 1ECEA 5AYIA 1H11A 1V3IA 1W1TA 4JIEA 4KH2A 4P7QA 3AFBA 1N82A 1VFUA 2Q8XA 1FFQA 3BSGA 1GQIA 2WW5A 4ZXOA 1EOKA 1V6XA 1V3HA 2XG9A 1MXDA 2EPNA 3M07A 4J3XA 3WEOA 3IAQA 1NM9A 2XGIA 2Z1SA 1EQPA 4W85A 3VIJA 3QHMA 1UQZA 5GNXA 3TA9A 2DT2A 3VIIA 3TTSA 4MNKA 2VX6A 2WHKA 3RDKA 3ZO9A 2DQXA 4MNJA 5D9OA 5JIPA 2ZUUA 4BQ2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BVN P;  3SUW A;  4B3L A;  4DWS D;  1GW1 A;  2HIS A;  5HBF A;  1E73 M;  3KL5 A;  1E6N A;  3ARP A;  4PTW A;  5FOO A;  3EMC A;  3OZO A;  1XV8 A;  3EMZ A;  3WH9 A;  4U3C A;  2VNC A;  4HOW A;  1GQL A;  2QMK A;  3HN3 A;  1FOB A;  5I6S A;  1C8X A;  1G01 A;  1CEC A;  5CPS A;  3MAN A;  3EDF A;  4DUX A;  2UY4 A;  5LA2 A;  4D71 A;  5CGM A;  3WFZ A;  4A4A A;  4UTF A;  4F79 A;  2G3N A;  2E4T A;  3PZ9 A;  3POC A;  5D9P A;  2VOT A;  1V3M A;  1J11 A;  1B3Y A;  1GOM A;  1K9E A;  2PBO A;  3THC A;  1DWF M;  5GPR A;  3SCW A;  4U31 A;  3GXI A;  4UFI A;  4HME A;  1H5V A;  2PWF A;  1OGB A;  4UQA A;  3FY1 A;  1J9Y A;  1E4M M;  4ZFM A;  3GXM A;  1M01 A;  3BAW A;  4AYS A;  1E71 M;  1MFU A;  2IXU A;  4HZ6 A;  4MJ2 A;  3AHY A;  3BCF A;  2BHZ A;  2F8Q A;  1LJY A;  2WC4 A;  8CGT A;  1E72 M;  3DEC A;  2WZI A;  4U33 A;  2BVD A;  1ZU8 A;  1UD3 A;  3W53 A;  2AAA A;  3PTM A;  4C7F A;  2ZUT A;  1GQK A;  3N9K A;  2D24 A;  2UY3 A;  4PMU A;  1MQQ A;  1MYR A;  1LQ0 A;  3T08 A;  3VTR A;  5M5D A;  3F4V A;  1V08 A;  1VJS A;  3CGT A;  3WEM A;  1JF6 A;  1AQM A;  3M6D A;  5CQ1 A;  1VAH A;  2BHY A;  3O9N A;  5ABE A;  4W5U A;  1L0P A;  1VIW A;  1ITC A;  1XD1 A;  1JF5 A;  1QI4 A;  6A3H A;  1UWT A;  3K46 A;  4FLS A;  5JBF A;  2EJ1 A;  2G3M A;  4GPN A;  1HVQ A;  1E1F A;  2OYK A;  1UKO A;  1W3K A;  3CO4 A;  4JFT A;  3L4T A;  1NWR A;  4LGX A;  1BTC A;  2EPK X;  1WZA A;  4JCM A;  3VGB A;  3ZT7 A;  4CD4 A;  1KBK A;  3II1 A;  2ZXB A;  1DP0 A;  1OWQ A;  2DDX A;  3SCV A;  2WCS A;  4UQ9 A;  1CXH A;  3LPF A;  2DSK A;  3WH8 A;  4AZC A;  3T0D A;  4UZS A;  5LA0 A;  3CUG A;  2CBV A;  1J0I A;  3UET A;  3ZJ6 A;  4BQ3 A;  1VJZ A;  1ISX A;  3RO8 A;  5CSU A;  1PPI A;  3CIV A;  4OJY A;  1NOW A;  3CH9 A;  3MKK A;  1AQH A;  4WJX A;  2J8F A;  1US3 A;  1KXT A;  4NSB A;  2DSV A;  4PUD A;  4JHZ A;  4W7U A;  4J3T A;  4HU0 A;  3UCQ A;  4GI9 A;  1XRV A;  3NSX A;  2JF7 A;  1ZB5 A;  2WAN A;  3VX1 A;  2XJ7 A;  2OYL A;  3OLD A;  2WHM A;  1HN1 A;  3E1F 1;  4IM4 A;  1J0K A;  1WZM A;  4H8H A;  1KBB A;  5M17 A;  1W3J A;  3OG2 A;  2J47 A;  1E43 A;  1EHN A;  1QNR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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