2VX3A

Crystal structure of the human dual specificity tyrosine- phosphorylation-regulated kinase 1a
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
347
structure length
346
Chain Sequence
VYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTKDGKREYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE
publication title Structures of Down Syndrome Kinases, Dyrks, Reveal Mechanisms of Kinase Activation and Substrate Recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 126
structure length 346
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2008-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2vx3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2vx3A01
5LVOA 4QMSA 4IWPA 3VRZA 2JAMA 3ZUVA 3R0TA 1GIJA 2Q83A 1LEZA 5BUEA 3ULZA 3FXXA 3QC9A 4MK0A 3TIZA 4CT1A 2OIBA 2UZLA 1NW1A 3W2QA 4J98A 4ANNA 5CLPA 4TW9A 4MXZA 4TZRA 3FJQE 3NYNA 4M84A 5CU0A 4GJ2A 3BBWA 4H05A 1H00A 4ASEA 3HYHA 1OM1A 2Z7LA 2ZVAA 2C6DA 4USFA 2YA9A 1J91A 3B8RA 4UMQA 3HMOA 4FEXA 3HMPA 2E9VA 5D7AA 2BFXA 2V7OA 4M69A 2YDJA 4FZ6A 5L3AA 3DNDA 1H24A 2O65A 3E87A 4L7SA 3JY0A 1UKIA 4L53A 3U9CA 3DAEA 3PVBA 4BCGA 2OXYA 3MFTA 4L43A 4XYFA 1OI9A 5EQEA 3IPHA 3D83A 4ACCA 4OTWA 3PRFA 2HZIA 2QCSA 3PXRA 1PXPA 3Q6WA 3ROYA 3RK5A 4BFMA 1X8BA 2C6LA 2ITVA 2H8HA 2BKZA 2ITQA 2YERA 4O84A 1P5EA 3BWFA 4A4LA 3F5GA 4W9XA 5JRSA 4CZYB 5AUXA 3ZZEA 3SAYA 3SKCA 1E1XA 1KE6A 4FG9A 4KIQA 5I9VA 2BKKA 3QA8A 2XBJA 5IA2A 3HMIA 2IG7A 1OKZA 2YDKA 3DPKA 4FG7A 2XK6A 4BDGA 1XH5A 3EFWA 3BGZA 2V0DA 4ONAA 1ZYLA 4DITA 4GJ3A 3EQCA 5EG3A 4TNDA 1F3MC 3CLYA 4ZTRA 5GZAA 1OITA 4QMMA 2XK9A 4IFCA 4AT3A 4JG8A 4E73A 2VWBA 3W2PA 3DS6A 4QP6A 5EOLA 4OTGA 4ZS0A 3PJ8A 4XMOA 5EKNA 2UV2A 3EHAA 4TKSA 1NXKA 2CGUA 3NUAA 4FL2A 5E8ZA 2B9HA 2Y4IB 3CKXA 1H08A 2FB8A 4CFNA 3B8QA 3FI3A 3LFQA 4AE6A 5CSXA 4YTCA 3HP5A 5K4IA 3P1AA 4M69B 4F9CA 5K4JA 4BCFA 4RFYA 1WBTA 2RSVA 3PXFA 4LOOA 3QRIA 5C8MA 3E8CA 2Y9QA 3C4WA 4YURA 5CEOA 1PKGA 3UZRA 3FDNA 3WYYA 5AV4A 2J6MA 3I7BA 3DAJA 2I40A 3KKVA 2XK7A 4C4IA 4EEVA 5JH6A 4FEUA 4L68A 5CXZA 2VTPA 3Q5ZA 3VBWA 4X2KA 1I44A 4BDBA 4L9IA 4C02A 3POZA 4BDJA 4CNHA 2B9IA 4BDCA 3L8XA 5FEQA 3ZRMA 4BIEA 3D5XA 4D4RA 5BPYA 1W0XC 1WZYA 3K2LA 3SLSA 3SOAA 2XNMA 3FQSA 2QO2A 2WELA 2VTQA 3CD3A 3L1SA 3PFQA 5C4KA 1YWRA 4J52A 4U81A 4CGAA 4G34A 5EW9A 1M7NA 5KCVA 3W1FA 3QQUA 4YPSA 4OTDA 3V01A 4AG8A 3SVVA 2QURA 4IX3A 4IANA 2JBPA 2OO8X 5DH3A 4O7TA 3IW6A 1OIQA 4X2GA 3RHXA 3ZHPC 2X39A 4DTBA 1O9UA 4QP8A 2C6IA 1BL6A 1JBPE 5DFPA 1AQ1A 4GU9A 3MH3A 4MQ1A 5CU3A 3QHRA 4WUAA 4FT0A 1R3CA 3EN9A 5HU3A 4EJ7A 2IWIA 1J1BA 3RZFA 3ELJA 3DBQA 2PTKA 3K5VA 4Y5HA 5GJGA 4HZRA 3PXYA 1WVWA 2C30A 4FKJA 4U8ZA 4FL1A 1SNUA 2OH4A 2QR7A 2Y8OA 4ZY4A 4BGGA 4WSQA 4ACHA 3NYXA 4GL9A 3M11A 4GV1A 4RJ7A 5C26A 5F4NA 1YVJA 5HLPA 3KXZA 4LMUA 2VZ6A 1UU3A 2ZOQA 1LR4A 4D58A 2J50A 4CTBA 2ITTA 4KBCA 3O17A 4EQUA 1M17A 4QP3A 3GU5A 5JFVA 4C36A 4U6RA 4FIGA 4XRJA 1UWJA 2X9FA 5EYDA 5IA0A 3OVVA 2OLCA 2Z02A 3BPRA 2BZKB 3K5UA 5ETFA 2OKRA 4JT3A 3R04A 2CKPA 2VTJA 2QNJA 2ERZE 4OAUC 4WRSA 3OWLA 5HE2A 4GU6A 3ZYAA 4E20A 4BF2A 4AW1A 4N6YA 2R3PA 3RP9A 3VULA 2QKWB 3JVRA 4RRVA 5M4FA 1WVXA 4RX5A 4FNXA 3JUHA 2R3MA 2GFCA 4UWCA 1BUHA 3QCYA 4IZ7A 4EK6A 5LQFA 4M68A 3LJ1A 4W8DA 3PIZA 3O51A 5IH5A 5EOBA 4FSNA 1E1VA 2EU9A 2PL0A 5AP6A 5DR2A 2OIDA 4FVRA 1W98A 3PA5A 4ZY5A 2UW6A 5AV0A 3F3TA 4ZTSA 4DEBA 5KBQA 5EYMA 2CNQA 4MBIA 2YDIA 3RVGA 4O7NA 3DXQA 4JX7A 4JQ8A 2CGXA 2W5BA 2C0IA 1NVQA 4U3ZA 4WNMA 3ATTA 3P23A 1H8FA 2VTMA 3HMNA 3VQUA 4O7WA 3PG3A 1W82A 5C27A 1FOTA 1JKLA 3JR1A 4FKQA 4K8AA 3UBDA 4EI4A 4Q9ZA 2ONLA 4QNYA 2X2LA 3QALE 3HVCA 3FBVA 4PL4A 3UNZA 3EN6A 4FZDB 4HYIA 3KGAA 5G1XA 3AXWA 3LLTA 4A9YA 3KVXA 4Y8DA 3R1NA 3ULIA 3VS6A 4FKGA 3CEKA 5HIBA 3UJGA 2JIUA 3VN9A 2F4JA 5C8NA 2JEDA 4QMPA 1OL5A 3CP9A 3WZUA 4AU8A 3LIJA 4FKSA 3R9OA 1PXJA 4QMNA 1GZ8A 1GIIA 3VVHA 3P7BA 4OBQA 3SRVB 4XP0A 5J9LA 4P7EA 4YZDA 1ZMWA 3VUKA 1OGUA 3IGOA 2C5VA 3FPQA 3L8VA 4FKLA 4QPMA 4YU2A 4QYYA 2NPQA 3LVPA 1MRVA 3FMLA 4RX7A 4B7TA 2XIKA 3COHA 5HLWA 3V5QA 4FTAA 3ZLWA 4BI1A 3IGGA 4W4YA 4EBWA 5BVFA 2PZRA 4A07A 1CKIA 3TXOA 3I4BA 4J97A 3WE4A 3ZFMA 1F5QA 2VWYA 1KE5A 3HUCA 1ZOEA 3CQUA 5CTPA 5D41A 5FEEA 5A6OA 4FT9A 2BRGA 2PVYA 5AV2A 3HDNA 5CEPA 4ID7A 3D5WA 4NM7A 5CF8A 5T6KA 1Q41A 4DBNA 4FV0A 4FTLA 4MXAA 4O81A 3T3UA 4CQGA 2UZOA 1J1CA 2OSCA 4QRCA 5DWRA 5IUHA 4U3YA 2WIPA 3F2NA 3WE8A 4BBFA 3ZRKA 5IH6A 4YNEA 4JDJA 3V8WA 3KXMA 4IAIA 4BCQA 2X7OA 3H0YA 3FKLA 4MAOA 2H6DA 1J3HA 5H2UA 4D28A 3FXZA 4S2ZA 3GC7A 3DT1A 4WUNA 4C33A 1U5RA 3OBJA 4M3QA 4AWIA 1UA2A 4Z7GA 4IAZA 3EQIA 3PXQA 1OUKA 4UY9A 2QU6A 3GC9A 5EFQA 1U46A 4HYSA 2P2HA 2XIZA 1BKXA 1HOWA 2EXMA 3HECA 1H0WA 4H1JA 4PTEA 5H9BA 4B8MA 4BZDA 4ORKA 3LCOA 3PJCA 4XOZA 3VS2A 1TQMA 3DA6A 3OG7A 4XEYA 3C4EA 4BDFA 3GXLA 2WTJA 1B38A 3VS3A 2YIQA 1JKSA 4C59A 5J5SA 5KBRA 3QTRA 2WQOA 3ENHA 5HI2A 4AZTA 4DE4A 2YZLA 4L42A 4EK5A 4K77A 3GQIA 3LCSA 1OIUA 2WOUA 2WMAA 3E7VA 5DT3A 5E7RA 1JSTA 4QYFA 1NVRA 4EOSA 3R9NA 2OJFE 2Y0AA 4G6OA 4AFEA 2XCKA 3OOMA 5C9CA 4UB7A 3SHEA 4DG0E 1IAJA 4QTBA 2WTKB 4Y72A 4AW2A 3GU7A 2ZDTA 3R9RA 4P2KA 3UPZA 4DTAA 4OTPA 2QOKA 3A4OX 5E8UA 5TO8A 4TT7A 5GINE 3O8UA 5AA8A 2XNGA 2VO6A 3LFCA 3D15A 2GHGA 3ZONA 1JKKA 2J5EA 2IN6A 3MW1A 4LV5A 4RVMA 3DZOA 3FMEA 4U97A 4R5SA 2PZYA 1H1PA 1ZY4A 2IZTA 3GGFA 2JGZA 3LJ2A 4JG6A 3ZMMA 3GI3A 5EQYA 2GMXA 4PDOA 2A4LA 3I6UA 3OEZA 2A1AB 3P86A 4AX8A 4F70A 4HNFA 4O6LA 4IACA 2QOFA 3FMMA 1OUYA 3FXWA 5CANA 2SRCA 3F3ZA 1ZY5A 3NX8A 4ZAUA 2BZJA 4K33A 2QODA 4FYNA 3OT8A 5HG9A 1XJDA 4X2JA 2DUVA 1YWNA 3CXWA 3GOKA 1UNHA 2PMNX 2JLDA 4JIKA 5JT2A 2Y4PA 2R3OA 1AGWA 4RJ4A 2HZNA 2XP2A 4RX9A 4BTFA 1JOWB 3VW8A 2EB3A 3UVPA 4FK6A 3DB8A 5TR6A 2JD5A 1ERKA 5F94A 1R78A 1IR3A 3L8PA 3RK9A 2BRHA 3DCVA 1ZZLA 3QQGA 4Z16A 3UO5A 3Q4ZA 5FRIA 4QP4A 3GCVA 2PUNA 2JC6A 1PXNA 4E5BA 4IM3A 4ZTNA 1ZMVA 2XJ2A 3M42A 2C3IB 4EOQA 2CGVA 2RFEA 1STCE 3UNJA 4GEOA 4I20A 4IB0A 3DK3A 2CKEA 4II5A 2HIWA 3UOHA 3R28A 4H39A 2QI8A 5IQGA 5FM3A 2DYLA 4N4SA 4TPTA 2GTNA 3IG7A 2FSMX 3QRTA 4EHGA 4D1XA 4RWLA 4FE2A 3O50A 3QFVA 4EOJA 1GJOA 1V1KA 5CZIA 2WTIA 4MD7E 2LAVA 4OTRA 3H9FA 3FZRA 4FT5A 4ACMA 5T3QA 4BCMA 5M55A 2XIYA 3UDBA 4DA5A 5HIDA 4RWIA 1PMUA 4RX8A 5ANEA 2WOTA 1SYKA 2ITYA 3HV5A 4G9RA 2VNYA 4C3FA 4EYJA 1JSUA 2WNTA 2ITNA 3CGOA 4BC6A 4EJNA 4F7JA 4CV8A 4JBQA 3GVUA 2JDVA 4ZP5A 5D1JA 3VC4A 1NY3A 3FZOA 4FKOA 2IZSA 4FSWA 3HUBA 4R78A 1REJA 2W1DA 3OWPA 3QD3A 2F49A 3FMHA 3F3UA 3ALOA 3QHWA 4H3PA 3UG1A 2AC5A 5E1EA 5JGAA 3EL7A 2AYPA 3ODZX 2IW8A 4TRLA 3W32A 2W1EA 5CEIA 4AACA 5HO8A 1DI9A 3FLNC 4H58A 5FP6A 4HW7A 5J8IA 3WZKA 5JFWA 3QBNA 1IRKA 4AN3A 4EH6A 1ZOGA 2QC6A 1L8TA 4PQNA 2CJMA 3TKHA 1OKWA 3R30A 2BDFA 2OZOA 3R7IA 4ZS4A 2R64A 3U4UA 2R3NA 5ETAA 1TVOA 2Z8CA 4WSYA 4C61A 1DM2A 4E93A 3SX9A 4XX9A 1IA9A 5JSMA 3BRBA 4I92A 4UYNA 3R6XA 5LJJA 4GK2A 3S0OA 4FODA 4EUTA 3TZ9A 4YJQA 4TYIA 3ZO2A 3MJ2A 4KUJA 3E92A 3OWJA 4LGGA 4C34A 1OKYA 2QD9A 4EC9A 3LFEA 1TQIA 1BX6A 3QD0A 2GS6A 3UC3A 4MWHA 4YBKA 5CAOA 5AP1A 3QGYA 4ASZA 2VX0A 2NP8A 3F66A 2HW6A 4RVLA 5C01A 4OGRA 3WILA 1OKVA 3AT3A 3LXLA 2YAAA 2OU7A 3MBLA 5GNKA 3QZFA 3WI6A 1WAKA 3ZBFA 5AR7A 4ASDA 5BUJA 3KULA 4K0YA 1H1SA 2GHLA 4I4EA 4KKEA 4MTAA 5IH4A 2CNUA 4NTSA 1KE9A 2QLQA 3Q2JA 4TYJA 3OBGA 4LOPA 4QPSA 4HVHA 4FTJA 4HGLA 1Q62A 5BVOA 2XK4A 4LOQA 4R77A 2R7BA 4OTFA 3Q52A 4FI1A 4PL3A 2EVAA 4MBLA 3U9NA 4AT4A 4DHFA 5DT4A 4BTKA 3RPSA 4BKYA 4F0FA 3O2MA 2UVZA 3R7UA 4ZZOA 4OUCA 5KE0A 5IQEA 5H8EA 3C51A 3DU8A 5DPVA 3TUCA 3BYMA 4ACGA 4FTOA 4AW0A 4LL0A 5EYKA 3UNKA 3SG9A 5L6WL 2PZIA 1YXVA 4HJOA 3L9LA 2ZB1A 3IDBA 4D2PA 1FPUA 3BKBA 4KIKA 3EFLA 4O38A 4BCOA 3LFBA 3DXNA 3CTJA 4IM2A 4W4WA 1WBPA 4A7CA 4FTKA 4TTHB 4C3RA 3OCGA 3UP2A 2XBAA 2CDZA 4I4FA 4WKQA 4CFFA 4WD5A 3F61A 3QA0A 3EZRA 3DTWA 5FM2A 4MX9A 3AC3A 3OXTA 1PKDA 4EZ5A 3AOXA 1CKPA 4IZ5A 3VUGA 4JRNA 5IA3A 3BEGA 3U6IA 2FSTX 2JDRA 3LFFA 3QZHA 4KAOA 3LPBA 4PPAA 1EH4A 3LJ0A 2J0MB 1PXMA 4I5PA 5AR8A 1R0PA 3U51A 3UQGA 4DT9A 3KK9A 3G2FA 4B0GA 4D2TA 3BYOA 3F69A 4FIHA 2B4SB 4NK9A 2H96A 3KULB 3OTUA 4Y46A 3TIYA 5I9XA 3FZSA 4IJPA 4D2SA 2ZYBA 4IW0A 4C35A 4DEIA 2PVRA 4E6QA 3NUXA 1F0QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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