The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
GPTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTAVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
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| publication title |
Distinct Binding Modes of Two Epitopes in Gab2 that Interact with the Sh3C Domain of Grb2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
13
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-10-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BU1 A; 2DJQ A; 2OJ2 A; 2AKL A; 3VS5 A; 1E6G A; 1SRM A; 1M3C A; 2EYY A; 4CC7 A; 2EGE A; 1GCQ C; 2CT3 A; 1M3A A; 1I1J A; 2CSQ A; 1JEG A; 1X69 A; 2X3W D; 1JXM A; 5FWC A; 4LUD A; 3M0P A; 2W0Z A; 1K0S A; 1NG2 A; 1YWP A; 2F2W A; 3IQL A; 4CC3 A; 1VA7 A; 4E6R A; 2FPD A; 4J9H A; 1UEC A; 1AOJ A; 2DL5 A; 3UF4 A; 4A63 B; 5ECA A; 1M30 A; 2RNA A; 4F16 A; 2JM9 A; 2EGA A; 1MV0 B; 2RQR A; 2HCK A; 1AWX A; 3JV3 A; 1W6X A; 2LQN A; 2D8H A; 2KRS A; 2BZX A; 4Z89 A; 2KRN A; 1JO8 A; 1BBZ A; 3M0S A; 2KT8 A; 1U5S A; 3UAT A; 4LN2 A; 2EW3 A; 2DVJ A; 3ULR B; 3VS6 A; 3PE0 A; 2QDL A; 5HCK A; 3TSZ A; 4AFS C; 1CKA A; 1SEM A; 2FEI A; 2FPE A; 3I35 A; 2EYZ A; 1WA7 A; 1T3L A; 3VS0 A; 2MIO A; 1OOT A; 2EBP A; 4AG1 C; 1WIE A; 1N5Z A; 2B86 A; 1NLO C; 2O31 A; 2EYX A; 3NMZ C; 1T3S A; 2C0O A; 1PKT A; 4J9B A; 4ORZ A; 3UA6 A; 3FJ5 A; 2K6D A; 2JW4 A; 2GQI A; 3I5R A; 2KGT A; 3ZL7 C; 1YN8 A; 2DL3 A; 2YUP A; 4DEX A; 2BZ8 A; 2DX1 A; 2LX7 A; 3NHN A; 1H92 A; 3VS3 A; 2KNB B; 1QWF A; 1W70 A; 4JJD A; 1QWE A; 1GBR A; 1VYT A; 1U3O A; 1LCK A; 2E5K A; 2OI3 A; 4LNP A; 1EFN A; 2KRO A; 1Z9Q A; 1K0X A; 4RTW A; 1QKW A; 1RUW A; 2XMF A; 4OML A; 4D8D A; 2J05 A; 4M4Z A; 2CSI A; 2H8H A; 1UUE A; 3U23 A; 1UHC A; 4X1V A; 4F17 A; 2KT1 A; 2X3X D; 4LE9 A; 1JQQ A; 2ROT A; 2DF6 A; 1AZG B; 2L2P A; 2DLP A; 1GCP A; 2EQI A; 1NEG A; 1TG0 A; 2DBM A; 2I0N A; 2G6F X; 1G83 A; 1QCF A; 4J9F A; 2C0T A; 2HEQ A; 2CH4 A; 2NWM A; 2RQT A; 2A28 A; 2V1Q A; 2KRM A; 3EG1 A; 5IXF A; 4F14 A; 4GBQ A; 2JS2 A; 1PKS A; 1UFF A; 2D8J A; 3VS4 A; 2KEA A; 4EIK A; 2JMC A; 2EVR A; 2O2O A; 1KSW A; 2ESW A; 1YCS B; 1IO6 A; 2V1R A; 3NGP A; 1YWO A; 2O9V A; 1I0C A; 4JJB A; 4Y92 A; 2J6O A; 4J9G A; 1AWO A; 3VS2 A; 4RTY A; 4R0K A; 1WLP B; 1AWJ A; 2EGC A; 3UA7 A; 4JZ4 A; 4CC2 A; 3QWY A; 2JMA A; 1KJW A; 3QWX X; 2O88 A; 1TUD A; 2K9G A; 1WX6 A; 3R6N A; 2ED0 A; 4CC4 B; 2LZ6 B; 1SPK A; 2KR3 A; 1H8K A; 2RQU A; 2DL8 A; 2RPN A; 2K79 A; 4AG2 C; 1ZUY A; 1UE9 A; 2FG0 A; 2LP5 A; 5GJV B; 1E6H A; 1H3H A; 5IHK A; 1MV3 A; 2A37 A; 1Y0M A; 3SEM A; 2O9S A; 3REA B; 2CDT A; 3PVL A; 1OV3 A; 2DL4 A; 2F2X A; 3VS7 A; 1VYU A; 2K2M A; 1ZSG A; 2J06 A; 4Z8A A; 2YT6 A; 4K11 A; 2J6K A; 1ZX6 A; 2KYB A; 1X2Q A; 1RLQ C; 1AD5 A; 5FW9 A; 5IXB A; 3RBB B; 2DYB A; 4HVV A; 2CH4 W; 3NPF A; 3VS1 A; 2KBT A; 2M0Y A; 2K7A A; 1E7O A; 2GNC A; 4LUE A; 1S1N A; 1WXU A; 2YUN A; 4AFU C; 1VYV A; 2L3Q A; 2RQV A; 5IHN A; 4GLM A; 1UG1 A; 2LJ1 A; 3TVT A; 2JM8 A; 1CSK A; 2GTJ A; 5I11 A; 1GL5 A; 5IH2 A; 4RUG A; 3LH5 A; 2NUZ A; 1ZUK A; 2DA9 A; 1BB9 A; 1YP5 A; 1UGV A; 1Y57 A; 5FWB A; 4HVU A; 4IIO A; 1OPK A; 1GBQ A; 4IIM A; 1XOV A; 1X43 A; 2YSQ A; 2JS0 A; 1QLY A; 1J3T A; 1G2B A; 3H0H A; 3H0F A; 1WXT A; 2BTT A; 2IIM A; 4WCI A; 1W1F A; 2FO0 A; 1PWT A; 1ZLM A; 1SHF A; 2VVK A; 2A08 A; 2ECZ A; 1NYG A; 2L0A A; 1T0H A; 1X6G A; 2RF0 A; 1JXO A; 1FMK A; 4OMM A; 1BK2 A; 1QKX A; 2AK5 A; 1ZUU A; 2F2V A; 1AEY A; 2MOX A; 2HBW A; 4OMQ A; 4J9E A; 1UHF A; 4RTX A; 4RTT A; 1FYN A; 1PRL C; 2D1X A; 5I22 A; 4QT7 A; 1GFC A; 1WI7 A; 3M0T A; 2C0I A; 2DMO A; 2AKK A; 1RLP C; 2ABL A; 1I07 A; 1X6B A; 3KFV A; 4JPB W; 1SSH A; 2ROL A; 2DBK A; 2RMO A; 2W10 A; 4JJC A; 3TSW A; 4DEY A; 3PVQ A; 2CRE A; 1AVZ C; 2FPF A; 2HSP A; 1HD3 A; 1GRI A; 1U06 A; 3GBQ A; 3REB B; 3SHW A; 1UJ0 A; 1SRL A; 1Z9Z A; 2BZY A; 1TUC A; 2CUD A; 2RQW A; 2VWF A; 1GCQ A; 2P4R A; 4ZNX A; 4HCK A; 3O5Z A; 2VKN A; 1KFZ A; 1ABO A; 2HDA A; 2DRM A; 1K1Z A; 2KE9 A; 2EKH A; 1WXB A; 2DE0 X; 4HXJ A; 4RTZ A; 1B07 A; 3M0R A; 1NM7 A; 2DIL A; 3H41 A; 2LMJ A; 1B3Q A; 4J9D A; 1KIK A; 2YUQ A; 2OAW A; 2GTO A; 4RTU A; 4JZ3 A; 1V1C A; 4AFZ C; 3EG0 A; 1A0N B; 1PNJ A; 1OEB A; 1ZBJ A; 1K76 A; 5L23 A; 1AWW A; 3EG2 A; 2PTK A; 2KYM A; 2RN8 A; 2M51 A; 4OMP A; 1NYF A; 2MCN A; 1HJD A; 2L3P A; 4D8K A; 3RNJ A; 4OMN A; 2SRC A; 2PNI A; 4J9C A; 1X2K A; 4FSS A; 4AFQ C; 3CQT A; 1M3B A; 2PZ1 A; 2LQW A; 3M0U A; 2ENM A; 2DL7 A; 2FRW A; 1MUZ A; 5EC7 A; 1UJY A; 1AZE A; 2LNH B; 1T0J A; 4RTV A; 2J6F A; 3EHQ A; 1ABQ A; 1OPL A; 2L3S A; 2LJ3 A; 1K4U S; 2ED1 A; 2EPD A; 1YNZ A; 2JTE A; 1M8M A; 2AZS A; 2FRY A; 3VRY A; 2A36 A; 3A98 A; 1SHG A; 2LCS A; 4KRT A; 3M0Q A; 2D0N A; 1RI9 A; 2GBQ A; 2J7I A; 5GJW B; 1ARK A; 2KXC A; 2GGR A; 3I9Q A; 2YDL A; 2YUO A; 3H0I A; 2CT4 A; 3THK A; 2LJ0 A; 3I5S A; 1K9A A; 1GFD A; 3EG3 A; 2JT4 A; 4HVW A; 5IHI A; 1PHT A; 2DNU A; 1UDL A; 2DM1 A; 3EHR A; 2JXB A; 1X27 A; 3C0C A; 1WFW A; 2CUB A; 1JU5 C; 1NLP C; 3EGU A; 1UTI A; 2K3B A; 1CKB A; 3VRZ A; 1M27 C; 2DRK A; 1NEB A; 1HSQ A; 1WDX A; 2SEM A; 2AZV A; 1PRM C; 4J9I A; 2EYW A; 1WYX A; 4OMO A; 4ESR A; 4Z88 A; 2KXD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GMK m; 2QA4 Q; 1BU1 A; 2AKL A; 3CCS Q; 2ZPI B; 1M3C A; 1VQK Q; 1GCQ C; 2X9H A; 2Z0W A; 1YIT T; 1N6A A; 1WGS A; 4J5Y A; 2QTX A; 1WPY A; 3A8O B; 1D09 B; 1RI0 A; 3RKX A; 4JRK A; 1YJW Q; 1Y96 A; 4LUD A; 4A4H A; 3QUI A; 1G3T A; 1K9M R; 2F2W A; 4OP0 A; 2LCL A; 3UF4 A; 1UEC A; 1AOJ A; 1M30 A; 4F16 A; 3NTI A; 2EGA A; 3RUX A; 1ZQ1 A; 1PSF A; 5KH6 A; 5CAI A; 1V76 A; 2NUP A; 2A0F B; 2K3Y A; 4CI0 C; 3M53 A; 2HQH A; 4FCY A; 4L59 A; 5CKB A; 2VGN A; 1JO8 A; 1IGQ A; 3MEA A; 1U5S A; 5KYY B; 2AT1 B; 1WQW A; 5HCK A; 3E1S A; 3E9F A; 3PFS A; 1SEM A; 2FPE A; 2BIV A; 4XTY A; 4M78 E; 2EQJ A; 5GAN 7; 4DBR A; 2GQV A; 3MHX A; 3E2U A; 4AG1 C; 2CP6 A; 3JCM b; 1WIE A; 2QTV A; 4PJO D; 1NLO C; 1Y7X A; 3TEE A; 4M75 C; 4ORZ A; 3FJ5 A; 1OX9 A; 4M78 C; 3I5R A; 2WSF E; 1PM3 A; 2E64 A; 1B34 B; 3C4S A; 4DEX A; 2DD4 A; 3VS3 A; 1QWF A; 1LNX A; 2QQR A; 4JJD A; 1GBR A; 2KMT A; 4VUB A; 3CCR T; 3JCM e; 3CCU A; 5IT9 E; 1C6V X; 3BE3 A; 3MEV A; 4RG2 A; 4ZGE B; 4L6V 5; 2XMF A; 2PUO B; 3CXC A; 1Q86 U; 1RAD B; 2X4X A; 1M1K U; 3OMG A; 2ZPH B; 5DM7 R; 5KCO A; 1MMG A; 1Y96 B; 2YXY A; 2ROT A; 1VIE A; 4M75 D; 1PCX A; 4E7S A; 1NEG A; 1TG0 A; 2I0N A; 2G6F X; 4J9F A; 1X01 A; 3RMS A; 5GAN d; 3CCJ T; 2NUP B; 2KRM A; 2VYT A; 4GBQ A; 3GOX A; 5KYU A; 2YHT A; 3OMC A; 3QYH B; 1KSW A; 4B9W A; 1IO6 A; 1YWO A; 4ZTJ A; 4M77 F; 2QEX A; 3OBW A; 4J9G A; 3VS2 A; 4RTY A; 2YLC A; 1WLP B; 4CC2 A; 1BI0 A; 1VQ5 T; 4FW2 A; 3QWX X; 2O88 A; 1VQ9 Q; 1TUD A; 2EQM A; 1SKU B; 5J26 A; 2CGH A; 4BI3 A; 4JRQ A; 2ED0 A; 1VQN Q; 1H8K A; 2K2V A; 4XU3 A; 5HY6 A; 1ZUY A; 2FG0 A; 5GAN 4; 3LH0 A; 2CP0 A; 5IHK A; 1NJI U; 5CKH A; 4BDZ A; 4OVA A; 3OW2 P; 4ATO A; 3EG9 A; 2L8D A; 3CPW A; 2DL4 A; 2F2X A; 4E7L A; 3VS7 A; 1YJN T; 1BI2 A; 1ZSG A; 4M77 G; 1PG5 B; 3CBO A; 3VJP A; 1TUG B; 2LT1 A; 1UGR B; 5CQY A; 3OSS C; 3ZBD A; 4C92 A; 4PJM A; 3G7Z A; 3QPH A; 1RLQ C; 1UB4 A; 2E6N A; 5IXB A; 3RBB B; 2DYB A; 1VQ4 Q; 2DZ9 A; 2RH2 A; 4OGC A; 4LUE A; 1WXU A; 3PT9 A; 2YUN A; 1IHW A; 9ATC B; 3DLL A; 5IHN A; 5KYX A; 2ZPE B; 2LJ1 A; 4GLM A; 2WSE E; 2O4X A; 2FZG B; 4PJO F; 2DD5 A; 2GTJ A; 5I11 A; 1LPL A; 1U1S A; 3LH5 A; 2EJ9 A; 3E9G A; 2NUZ A; 3NTH A; 4FL6 A; 3CCQ A; 4JJN K; 3LYI A; 1BB9 A; 1KC8 R; 4JLI A; 2H3J A; 4A53 A; 3HRS A; 4IIO A; 3VYH B; 3FRN A; 1M1G A; 1RAF B; 3H0H A; 3CD6 Q; 1YIJ T; 5KYU B; 1WXT A; 4WCI A; 3MKD A; 2E3I A; 2FO0 A; 1BYM A; 1PWT A; 1AT1 B; 3OYE A; 2DVE A; 1ZLM A; 1SHF A; 1QVF A; 3TQ7 P; 3J80 E; 5LJ3 j; 2ECZ A; 1XNI A; 1NYG A; 2X4J A; 2P84 A; 1YJ9 A; 4OB3 B; 1X6G A; 2QQ9 A; 2BKD N; 3OS5 A; 4PJN A; 4OMM A; 1QKX A; 2AK5 A; 2R5A A; 4IUQ A; 5FU7 B; 4PJO G; 2F2V A; 4BY6 C; 1VIF A; 4C0Z A; 3QSU A; 1OU9 A; 2K5L A; 3JCM g; 4RTT A; 1FYN A; 3BW1 A; 4JRI A; 3OYN A; 1G3Y A; 1PRL C; 3CCE Q; 3CC2 A; 4LD9 K; 3CME T; 3J81 E; 2LT4 A; 2AKK A; 2O01 E; 3SDZ A; 1I07 A; 3EG9 B; 1VQL T; 2RMO A; 2W10 A; 2KVQ G; 4JRP A; 2RI3 A; 2CRE A; 1AVZ C; 2QAZ A; 5DY9 A; 4C92 B; 1IGU A; 2YWW A; 1QP2 A; 4MML A; 2XK0 A; 1HD3 A; 1SF9 A; 4XU2 A; 1VQ6 T; 1F1B B; 3CCV A; 2E5Q A; 2V8K A; 5GMK e; 1N27 A; 4DBH A; 3A8L B; 3M55 A; 4A4G A; 3CCL T; 3H9N A; 2BZY A; 2CUD A; 1GCQ A; 4C8Q E; 3GPL A; 4HCK A; 3O5Z A; 2VKN A; 2AHJ B; 3JAM E; 2RJE A; 5KYX B; 1KQ1 A; 3GP8 A; 2O4X B; 2PQW A; 1Q86 C; 1NM7 A; 3HPW A; 2HL5 C; 3H41 A; 1YI2 A; 4PJO A; 2QA4 A; 4E7Z A; 1M1K C; 5FRN A; 2LMJ A; 1B3Q A; 3H6Z A; 1FXX A; 3CCS A; 4M7D F; 3JCM h; 3OS1 A; 3CC7 A; 1VQK A; 4AFZ C; 3EG0 A; 5GAN f; 1LVK A; 1KQ2 A; 5GAN 3; 2MPX C; 1PD0 A; 5I2S A; 3RR6 A; 5FRM A; 2M51 A; 2XI9 A; 3OYF A; 4D8K A; 4N0A A; 3M59 A; 2R58 A; 1UGQ B; 2PNI A; 4J9C A; 4M7A F; 3JB9 I; 2LQW A; 3M0U A; 4FYW B; 3PIO A; 2ENM A; 5EC7 A; 3MEW A; 1RAG B; 3EHQ A; 4M7D G; 2ED1 A; 3RER A; 1X75 C; 2E6Z A; 1YNZ A; 2JTE A; 2AZS A; 3VRY A; 3URG A; 1SHG A; 2QXF A; 4Z02 A; 2L5Q A; 2RHI A; 2VAS A; 4ELZ C; 2GBQ A; 1ARK A; 4M75 A; 1ZA1 B; 2GGR A; 3A1P A; 2FZC B; 4OMF B; 3I9Q A; 5I2M A; 2YUO A; 3H0I A; 3THK A; 2LJ0 A; 3FJP A; 3OYI A; 4M7A G; 2JNG A; 4PKC C; 1GFD A; 4HVW A; 5IHI A; 3EHR A; 3LGF A; 2ZAE A; 3C0C A; 2VB6 A; 2Y4X A; 5GAN 6; 2CP7 A; 1JU5 C; 1NJI C; 2DKG A; 3VRZ A; 3G4S Q; 2GFU A; 5DLO A; 1HSQ A; 1WDX A; 1PRM C; 3OYD A; 2MK5 A; 4OMO A; 3JRZ A; 1K8A U; 4DA4 A; 4Z88 A; 4XTZ A; 2DIG A; 3MCA B; 2HQE A; 5GAM e; 1VQ8 T; 4PJO B; 2WAC A; 1SRM A; 4XTU A; 4CC7 A; 4M7D A; 3OYJ A; 3CCM Q; 1P92 A; 1KQS S; 1OU8 A; 1M3A A; 1G8X A; 1I1J A; 2CSQ A; 1X69 A; 4JS4 A; 1G3W A; 1K0S A; 5HK3 A; 1IRE B; 2YRD A; 3M54 A; 3MP8 A; 3IQL A; 5LJ5 e; 5FU6 C; 4CC3 A; 4E6R A; 1FX7 A; 4A63 B; 2DL5 A; 3ER0 A; 1VQP Q; 1MV0 B; 2LVM A; 3EGX A; 2RQR A; 2HCK A; 1AWX A; 4DBQ A; 4KT0 E; 3PGG A; 1W6X A; 2LQN A; 5J3B A; 3L2Z A; 1VUB A; 2DTO A; 2KRS A; 1WQ7 A; 3EGD A; 2F1L A; 1JB0 E; 2F5K A; 4C0D C; 3TU4 K; 2KT8 A; 4LN2 A; 5GAN 5; 3PE0 A; 1NPR A; 4M75 B; 1JJ2 A; 1XQH A; 2FEI A; 2ZZD A; 1YJ9 Q; 1O9S A; 1MGQ A; 2GCX A; 1T3L A; 4QVD A; 3VS0 A; 3JSC A; 1OOT A; 1QP3 A; 4PK4 A; 1SSF A; 4FYX B; 2B8A A; 1N5Z A; 1D0Y A; 4LDV A; 2EYX A; 2HKN A; 4J9B A; 4D6W A; 1JBM A; 2R5M A; 2KGT A; 2YUP A; 2F69 A; 2CZ6 B; 3CC2 Q; 3BY7 A; 3NHN A; 1EZZ B; 2KNB B; 4PLI A; 2QI2 A; 4PFO A; 1QWE A; 7AT1 B; 4M77 E; 1U3O A; 1LCK A; 3NFC A; 3G71 Q; 2E41 A; 1IHV A; 4EMG A; 3SB2 A; 1QKW A; 3NTK A; 2MWP A; 4OML A; 2OTJ T; 2CP5 A; 4Y28 E; 2J05 A; 3MET A; 2CSI A; 2OX7 A; 4M7D B; 2E65 A; 3I56 A; 1R77 A; 1UHC A; 3OB9 A; 1QVG S; 2CZ0 B; 1JQQ A; 5AT1 B; 1K9M U; 4QW2 A; 3QKJ A; 4R55 A; 5GMK i; 1KQS P; 1YJW T; 1UGS B; 1IB8 A; 2CS7 A; 5GMK h; 3OBY A; 4LD6 A; 4JS5 A; 4Y91 A; 2JVV A; 1OI1 A; 1VQO T; 1QCF A; 1YI2 Q; 3G6E Q; 3EGX B; 2RJC A; 3S6W A; 5D6X A; 2V1Q A; 4WTO B; 1WHM A; 3CC7 Q; 4BB7 A; 4F14 A; 2JS2 A; 1Q7Y R; 3WVE B; 1VQ7 Q; 3VS4 A; 2PU9 B; 1TS9 A; 2QGG A; 2KEA A; 4BE0 A; 3EGD B; 1WJR A; 5LJ5 f; 3CD6 A; 5GAN 8; 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