2W4XA

Btgh84 in complex with stz
Total Genus 229
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
229
sequence length
586
structure length
579
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Structural Insight Into the Mechanism of Streptozotocin Inhibition of O-Glcnacase.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 229
structure length 579
sequence length 586
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-12-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2w4xA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w4xA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2w4xA01
1MQRA 4CD4A 1KWKA 5CLWA 1A3HA 4JCMA 5BRPA 1UH3A 3ZQ9A 3PN8A 2B31A 5IHSA 3AIWA 3BH4A 1FHLA 3FAWA 1EXPA 2FH6A 4DWSB 2XTKA 2X09A 2BHUA 4CD5A 3VM7A 5CQ1A 3NDYA 4ZEPA 4R27A 2VOTA 2CHNA 3MO4A 4ACZB 2XIBA 4HA4A 3VDCA 3W38A 7CGTA 3PTMA 1UA3A 2ZUUA 4JKKA 1G9HA 3NSXA 1FP8A 1GJWA 7TAAA 3WDPP 4ATWA 1E5JA 1EHNA 1VFUA 3B9EA 1DHKA 3PHAA 4B3KA 2E8ZA 4U5IA 3AMLA 2VMFA 3N04A 5A8PA 3F5KA 2HVMA 4HU0A 3LPFA 2FDMA 3VGEA 2OSXA 3PZTA 4CD8A 1UD6A 1OBAA 1R87A 2CITA 2GFTA 1DWHM 3MUAA 3ZT6A 4RE3A 1V3KA 3AS2A 1CXEA 2WPGA 3RM8A 1UH4A 3AIEA 1UR8A 2EPOA 1V6VA 3UEQA 3VGDA 1J9YA 1E4NA 1X6LA 2CYGA 1VEOA 2WMJA 3WSUA 3HN3A 5A2BA 1H3GA 1UUQA 3T0DA 1FH8A 4D6IA 3OZOA 3VGBA 4WSKA 4WIWA 3MV01 3WD3A 1UWUA 1CDGA 1ISWA 3A4XA 4MB3A 3WEZA 2J7CA 2VJXA 2WVUA 1QHPA 4AD5A 1WZKA 4W93A 2J74A 3PZOA 2WZIA 1H09A 4CGTA 2Y2WA 2CBIA 5LA1A 2WWDA 1WDRA 1GW1A 2CBUA 4YHGA 1J0JA 4HMEA 3WQ6A 1H0GA 3ZT5A 1GHSA 1DWJM 4PMYA 4EKJA 5A6KA 1OGSA 2FGZA 5ABFB 4B16A 5A8MA 1V6YA 1V02E 4WK9A 4N0RA 3VD4A 3GBEA 3T2QA 4ZFMA 4C91A 3BMVA 2O9OA 1UR1A 4ATDA 3IJ8A 4OBRA 1QI0A 1XH0A 1C91A 2WC7A 3ZO9A 4M29A 3AMGA 5BXPA 1JZ7A 4TXEA 4J3VA 3GNOA 3OZPA 2DEPA 4JKMA 4TVDA 5E09A 3W6LA 3POCA 4N42A 2CBVA 3WIJA 1ZB5A 2WSKA 1ZS2A 1IZKA 3MSGA 1LQ0A 1UR9A 3II1A 1WP6A 1KBBA 3UESA 1QNSA 2JF6A 1D7FA 2WMKA 3OIHA 2CCRA 3GH7A 3WKZA 3L4VA 4UQ9A 5CLTA 1VBRA 3G6LA 2G3IA 3AIVA 1E1FA 1V3MA 2VNCA 4OOZA 4UR9A 4NRRA 4W7VA 4FF5A 4EE9A 1Z32X 3VMNA 3VUPA 1I75A 1B3WA 1V6WA 2FHFA 2E9BA 3EDEA 2ZUNA 1J11A 4HOWA 1WKYA 1GOKA 5DMYA 2WVVA 2E9MA 3ALFA 3IJ9A 4IPLA 1EHAA 2YDQA 1CNVA 1K6AA 2ZE0A 3M07A 4PTWA 1ECEA 1J0KA 1CXHA 1FFQA 1V3HA 2JFEX 3WL1A 2GVYA 3CHFA 3NSMA 2QV4A 2XJ7A 3AFBA 4M81A 1GONA 1W91A 2BS9A 5DEZA 3MMUA 1UKSA 4P7OA 5A1AA 1NP0A 2CPUA 4JFVA 5E0CA 4W86A 2D22A 2WZEA 1MW0A 4LX4A 3GNPA 5A94A 1H49A 2XHYA 5ABEA 2BXZA 2W92A 2RGMA 1OWQA 3NJ3A 1BPLB 2CHOA 3LPGA 4D6EA 5HOSA 3MMWA 5HPOA 3RDKA 1H5VA 3SUWA 4PUDA 2GSJA 2DGAA 4TVCA 2XVLA 3WNNA 3AQUA 1MFUA 1DEDA 3W29A 3AIQA 1QPKA 1UKPA 4WKAA 4Z2KA 5D9NA 2GDVA 3ZR5A 2VVSA 4IM4A 2A3AA 1CGYA 2ZXQA 1B31A 3IK2A 1RP9A 2CBJA 4KGLA 2O92A 1VB9A 4HMDA 2D23A 3WQ8A 4B9YA 1RPKA 3MV11 3IAQA 3ZOAA 3O2LA 4Q22A 3AXHA 2UY3A 4W7WA 4AZ5A 4AWEA 4BA0A 2YL6A 2MANA 5EB8A 2WANA 6A3HA 4MNJA 3SCOA 3WEMA 1BG9A 3N1AA 3POHA 3VIFA 4K68A 4HA1A 2X8RA 4UFHA 5DF0A 1LWHA 4WJXA 4AMCA 2PWHA 4AEFA 1EOMA 1E71M 1UKOA 2GJXA 1DWGM 2WVSA 1KGWA 1OT1A 2BVTA 1HL8A 3OLGA 2V3DA 4OIFA 3FN9A 4JL2A 2DT2A 4A3HA 3HMCA 4UFLA 3VGHA 1BTCA 4PTXA 2EO7A 1US2A 1D3CA 4EANA 1CZ1A 3VIKA 2WVTA 3HJEA 3DYMA 4LYRA 2Y5EA 1NQ6A 2A3CA 2F61A 3CZGA 2VX6A 1CWYA 4GKLA 5IFPA 1W3JA 3BC9A 5E6YA 1BF2A 2VCAA 1WE5A 2WBKA 1GQJA 1K9EA 4HOXA 1W3LA 1PIGA 1M7XA 3WF4A 1W1PA 5LYRA 1CGWA 1LG1A 3CHCA 2OYKA 2OWWA 4C7DA 2XVPA 1UQZA 1W2PA 4E4PA 2YKKA 1EOKA 2G3MA 4PSRA 1GORA 1E70M 1UA7A 1JDDA 4D6DA 2XVKA 2D0FA 4J3SA 3W81A 1MXGA 5I77A 5GNXA 3DHPA 3VMOA 2EPKX 2XYLA 4QDMA 2DSWA 5FD0A 3LMYA 2J7BA 2XWDA 1G1YA 3MS8A 4D6JA 2WHJA 4J3UA 1HN1A 3N13A 2J75A 3VIHA 4CU6A 3AICA 1V3LA 3FNDA 2UY4A 2DIJA 5GNZA 3L4ZA 2E9LA 2GK1B 3QHMA 4L4OA 1DWIM 1JD7A 3LPOA 1KQYA 2GJXB 1TVNA 3BSHA 4Z2GA 3KL5A 3AIBA 2DIEA 4UQDA 2UY2A 3WDQA 3WBEA 1TA3A 3BLPX 2G8ZA 5JBDA 1XH1A 3VDHA 1V3JA 4CN4A 4V2XA 4M82A 5JIWA 3DHUA 4L4PA 3WENA 1OSEA 3NSNA 4MB4A 4PBGA 4M56A 2E0PA 4W5UA 1XSIA 2WYSA 5D9MA 2WNWA 1UZ1A 3EMQA 4TUFA 1VRXA 3WNPA 1QI4A 1UR4A 1W9XA 2G3NA 5HDRA 2YOCA 3VM5A 3ARVA 5A6MA 3THDA 3GXIA 1WDQA 1XHGA 2UWFA 1UYQA 5A6SA 3S6TA 1L0PA 3T2PA 1J0IA 2F2HA 3CZKA 3WD2A 4JIEA 1PZ2A 3AISA 1CBGA 1HIZA 2JF7A 1QBAA 1R85A 4OOUA 2EPMX 2J7FA 2X05A 1CIUA 1B1YA 1SMAA 3VIPA 4C90A 4UTFA 4PYSA 1JYWA 4XB3A 3RM9A 3HU7A 2NT1A 2J8GA 3RCNA 1UWSA 2OYLA 5LA2A 3VD9A 3NDZA 2YDSA 4CCDA 2JEQA 2XWEA 2YA0A 3AMCA 4GIAA 4JHOA 5A3HA 2VI0A 3T2OA 4TVUA 1E43A 4AZCA 4AD2A 2CESA 3AOFA 3I3BA 1K9FA 3THCA 4M80A 4YN5A 4PUEA 1QW8A 2V5CA 1S46A 2NT0A 2AMGA 1CLXA 4FK9A 2DSZA 3FAXA 4UNIA 5M17A 3VVGA 5I23A 2GJPA 3SCTA 1EIBA 1ZBKA 3D5HA 4D1JA 4MNLA 3VX0A 3A3HA 3ZR6A 3NYDA 2W61A 2VC9A 2PF0A 1H0IA 4AZIA 1TA3B 2D20A 1B9ZA 3CZ8A 1CLVA 1HF6A 1JZ2A 1XYFA 4PN2A 1JAEA 1C92A 3WH9A 4M8UA 3K8KA 1MXDA 1LL7A 2DH3A 4H2CA 4X0VA 2VZSA 2D3LA 3AI0A 4M24A 3WDHA 4U3CA 1JZ3A 4URIA 1WB0A 1KXHA 1QVBA 4J7RA 4X9YA 1KGUA 2FHBA 1HJVA 3EMCA 3L4YA 1FP9A 4DUVA 5A95A 3WNMA 4Q7NA 1BYAA 3W27A 1U2YA 3U57A 1UHVA 4W87A 2Z1SA 3VOCA 3L4XA 5E6ZA 1C93A 4UZSA 1QOXA 4UFIA 3W25A 1NOFA 1A47A 1BLIA 3PTQA 2C7FA 3UERA 1W32A 2VZTA 4FLSA 3BSGA 1U30A 1HX0A 2VZVA 1NOUA 3GM8A 1V6XA 3WMBA 3ZM8A 1MYRA 1DWAM 3WMCA 2EJ1A 1R7OA 2BVYA 4PMDA 3PBGA 4UCFA 2PWGA 1CGVA 1CGUA 4AZCB 1CEOA 3F5LA 2AOSA 4GXPA 4DUXA 1OD0A 4W7UA 3AHVA 4ATLA 1ITCA 2J7DA 4D6FA 2BY1A 4PMVA 3W53A 5BXTA 2O9TA 2O9PA 1E3ZA 1YQ2A 1E40A 3UG5A 3ZJ8A 3DC0A 1M04A 3J7HA 3AHTA 3K46A 1GUVA 2AAAA 1JGIA 1NARA 1JYVA 2DSUA 3AZRA 2PC8A 3W0KA 1HJUA 1GOQA 1I1WA 4UFMA 1ZBWA 4JFWA 4P8UA 5HXMA 2YLAA 4GI8A 5A2AA 3AZTA 4W84A 1C8YA 3I3EA 3RPMA 2DSKA 2XFRA 2DQXA 1ISZA 3N17A 1CTNA 1JZ4A 3NUKA 3SUVA 2J47A 2DT0A 4CU8A 3VIMA 1B3YA 2XPKA 4ZE5A 4MB5A 3WNKA 4MJ4A 4P8XA 2RGLA 4P7RA 1GZJA 1US3A 3UR8A 4GINA 1GJUA 2WMIA 2W63A 1P6WA 4AD3A 2ZXBA 5LA0A 4QLKA 2A3BA 1WCGA 1E73M 1GCYA 3K4DA 4PCTA 1BVZA 3SIMA 2QMKA 2YL9A 1SMDA 4J3TA 4F8XA 2D0HA 1EH9A 4BQ3A 1JL8A 2BHYA 1OCQA 3CLWA 5I79A 5D9OA 4ZXLA 3B8SA 3ZMRA 1NWTA 1E0XA 4AW7A 3ARXA 5I6SA 4JAWA 5D8ZA 3BAYA 3EDKA 2YL8A 4GPNA 3WELA 3ARZA 1CGTA 2YIHA 1HNYA 3FY1A 4BQ4A 4F9JA 3WMSA 3T09A 5IFTA 1E6SM 3KZSA 1TUXA 4X0NA 4AZ6A 4CVUA 4C7FA 4E8CA 1HVQA 4DWSC 5IHRA 5DO8A 5BXRA 3PZ9A 3S2CA 1ESWA 3GXFA 4U2YA 3AROA 4NRSA 4U2ZA 3AS0A 3MUZ1 1JIBA 3L4TA 3BAWA 4D6CA 4ACYA 3AZSA 1IZJA 4QLLA 1E4MM 4PTMA 5EFDA 2FGLA 5TD4A 3KWXA 1GQIA 3EMZA 3PZIA 1DP0A 2FHCA 3CBWA 3D3AA 1B0IA 5C71A 2XG9A 1BFNA 1DTUA 4H7VA 1J18A 2WW5A 4B15A 3OLIA 1NM9A 1PX4A 4H8UA 2ZX6A 3DECA 4JZ5A 4BQ2A 3QOMA 2EQDA 1WZAA 4PMUA 3TTQA 4PRWA 5BYWA 3WUEA 4AC1X 4H8VA 1JG9A 1KXVA 2VX5A 3CUJA 4H8HA 4TX8A 3VILA 5ABGA 2CIPA 1UKQA 5CSYA 1VFOA 3WD0A 4FLOA 5A6LA 1U33A 3U7BA 3ZIZA 1NWUA 3CMJA 2Y4SA 1HKJA 3NCOA 2G3JA 1E1EA 3SCPA 5BWFA 2BHZA 1E4LA 4H04A 5FKYA 4AZBA 2YA1A 1WZLA 2V3FA 5KZ6A 1JYNA 3VNZA 4FMVA 2IXVA 3VIGA 4HA3A 2TAAA 3WF0A 1JI1A 4CU7A 1UWTA 4Z2HA 2YBUA 1AQ0A 1QNRA 1KR0A 5FIPA 1TG7A 2BV9A 3QHOA 2DSVA 1V6UA 5AC5A 4TTGA 2XSBA 4EAMA 2E3ZA 2WC3A 4MDPA 1QI5A 2DT1A 8A3HA 2WVVB 1ISYA 4PMZA 2XM2A 3TOPA 3TA9A 4D6GA 1GVYA 1TVPA 1V0NA 4UQBA 5A2CA 4AIEA 5CXPA 1HJWA 1XD0A 4CN1A 3MANA 1TR1A 3MUY1 3AYRA 3SCWA 1J12A 1ISVA 1LJYA 1MFVA 3CZJA 1UD2A 1IT0A 3N12A 4KRTA 1WDSA 4NZCA 1UD5A 3W37A 1EA9C 2CNCA 5DT7A 4AD1A 4QAWA 3M46A 1PX8A 5C70A 5EMYA 5JUVA 1JXKA 2WLZA 1W9VA 3KL3A 3WQWA 2WMFA 3CUGA 1J0YA 5FL0A 4GI6A 2ZUTA 3EDJA 3WUGA 3KEHA 1NP2A 2VVNA 3VO0A 1PJ9A 1XH2A 1Y7VA 2E40A 1H1NA 4E2OA 3QR3A 1SR0A 4HU8A 1OIMA 1M03A 3AXIA 4F9DA 4LXFA 1W3HA 1JFHA 2X2YA 3VIIA 3GNRA 4PTVA 1V3IA 3ARRA 1MWOA 4GO9A 1V08A 2VCBA 2YL5A 4CD7A 1HJSA 2DH2A 4CKQA 3L4WA 2VT0A 2VQUA 2J7GA 4QCEA 1GHRA 3EBVA 3U5UA 2ZUSA 1XD1A 2VZUA 1QHZA 3OGVA 1E6XM 3CZEA 3GXMA 4D71A 5FCZA 5IDIA 3UETA 3OGSA 4U3AA 1FOBA 4GZEA 3RMEA 3SUTA 2JIWA 1VAHA 2BNJA 2W91A 1EDGA 2BY2A 2QF8A 2WK2A 4M1RA 1I1XA 5D4YA 3B9AA 2ZXDA 2DDXA 1PBGA 4PCSA 3A6OA 1KBKA 1HT6A 1D2KA 1LL6A 3OA5A 2WAGA 3CMGA 1JNDA 4JFUA 1X1NA 2VCCA 4PSPA 2VX7A 2WSPA 1CGXA 4BCEA 1XSJA 2OSWA 4H41A 5EFFA 2JE8A 2X0HA 4KH2A 4MAZA 2WLYA 3UR7A 3WN6A 4XV0A 1UOKA 3VMPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1MQR A;  4CD4 A;  1KWK A;  5CLW A;  1A3H A;  4JCM A;  5BRP A;  1UH3 A;  3ZQ9 A;  3PN8 A;  2B31 A;  5IHS A;  3AIW A;  3BH4 A;  1FHL A;  3FAW A;  1EXP A;  2FH6 A;  4DWS B;  2XTK A;  2X09 A;  2BHU A;  4CD5 A;  3VM7 A;  5CQ1 A;  3NDY A;  4ZEP A;  4R27 A;  2VOT A;  2CHN A;  3MO4 A;  4ACZ B;  2XIB A;  4HA4 A;  3VDC A;  3W38 A;  7CGT A;  3PTM A;  1UA3 A;  2ZUU A;  4JKK A;  1G9H A;  3NSX A;  1FP8 A;  1GJW A;  7TAA A;  3WDP P;  4ATW A;  1E5J A;  1EHN A;  1VFU A;  3B9E A;  1DHK A;  3PHA A;  4B3K A;  2E8Z A;  4U5I A;  3AML A;  2VMF A;  3N04 A;  5A8P A;  3F5K A;  2HVM A;  4HU0 A;  3LPF A;  2FDM A;  3VGE A;  2OSX A;  3PZT A;  4CD8 A;  1UD6 A;  1OBA A;  1R87 A;  2CIT A;  2GFT A;  1DWH M;  3MUA A;  3ZT6 A;  4RE3 A;  1V3K A;  3AS2 A;  1CXE A;  2WPG A;  3RM8 A;  1UH4 A;  3AIE A;  1UR8 A;  2EPO A;  1V6V A;  3UEQ A;  3VGD A;  1J9Y A;  1E4N A;  1X6L A;  2CYG A;  1VEO A;  2WMJ A;  3WSU A;  3HN3 A;  5A2B A;  1H3G A;  1UUQ A;  3T0D A;  1FH8 A;  4D6I A;  3OZO A;  3VGB A;  4WSK A;  4WIW A;  3MV0 1;  3WD3 A;  1UWU A; 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