2W66A

Btgh84 in complex with hq602
Total Genus 244
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
244
sequence length
712
structure length
647
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMLPLQVKANRVLISPVEIELDAIYPGENIQINFRLSAGLQKAPVKFVRFFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Molecular Basis for Inhibition of Gh84 Glycoside Hydrolases by Substituted Azepanes: Conformational Flexibility Enables Probing of Substrate Distortion.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 244
structure length 647
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2w66A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2w66A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2w66A01
3BC9A 2YDRA 1K6AA 4C7FA 4AD1A 2DIJA 5JIWA 3HU7A 2JE8A 3SURA 2W4XA 3MUIA 1CGTA 3VD4A 3MUY1 1CXLA 2CERA 1AQMA 1Q6DA 4N0RA 3PZNA 3AMKA 1JZ7A 3TP4A 2OWWA 1J0YA 1E55A 1V3JA 5DT7A 5A2BA 2WMHA 5IFTA 4UFKA 3WL1A 2A3HA 3DECA 5M17A 1MW2A 1JD9A 3AQUA 4GI9A 1KWKA 1XC6A 1E3XA 3HJEA 5DO8A 5A2CA 2G3NA 5FIPA 1L8NA 3PN8A 1JXKA 2OLHA 1ZBVA 3AMCA 3NUKA 2XJ7A 2VRQA 3ZOAA 1JZ2A 2DIEA 4M81A 1WDSA 2XM2A 3SUSA 3OG2A 1OINA 3BAYA 1M7XA 4UR9A 1VFFA 3WSUA 1J10A 1R7OA 5HXMA 2WHKA 3NYDA 3PZMA 1H11A 1WZLA 1BFNA 2E3ZA 4JHZA 1V6XA 3ECQA 2FH8A 1V02E 2Y8KA 2VQTA 5ABFA 4PUEA 5HBFA 2AOSA 2WW5A 3SIMA 3FN9A 2VR5A 1QBAA 4W8LA 1US3A 2D24A 4UZUA 3WMSA 1XGZA 3K4AA 4PBGA 4XX6A 2CBVA 2XSBA 3LPOA 3SCUA 4WKFA 1XH2A 4AWEA 2EBNA 3RILA 2ZX8A 1OM0A 2GJRA 1VFOA 4GQQA 3OA5A 1KBBA 3L4ZA 4QCEA 2UWFA 3AOFA 1J0IA 4P7LA 2DT2A 3UG3A 1GJWA 4CVWA 3DHPA 1LWJA 2X2YA 3WDJA 3ARYA 4BCEA 4U33A 2BVYA 5E6ZA 5BXPA 1OSEA 2XVPA 3RIKA 3N1AA 3WUGA 3F5JA 3CZ8A 4X0VA 3UCQA 1EDGA 1PAMA 2J74A 4QLJA 2ZOXA 1PZ3A 5EFDA 2WSKA 3EDEA 3A4XA 3VILA 1BHGA 2D23A 1OD8A 4MB5A 1KQYA 2DH3A 1C8XA 1H4PA 1U2YA 4QFUA 2IXUA 4N42A 1J0JA 1VJSA 3MMDA 3OZOA 3AFBA 1EOMA 3FW6A 1ODZA 2D22A 5I0DA 3AHXA 1V3MA 3WEZA 5JBDA 1UD3A 1RD6A 3MKKA 3OLEA 5AYBA 1HJXA 3AIVA 1MWOA 1RPKA 4L4PA 3AXIA 4C7GA 4UFHA 3AICA 3AMLA 1WZAA 3BGAA 1F4HA 5EB8A 2PWEA 3SCRA 5CPTA 1E0WA 1WDPA 4LYPA 3WF1A 1C7TA 5M03A 1XD0A 2QMKA 5D8WA 1OGBA 2VJXA 4PSPA 2DSKA 3CZGA 1E4MM 5M3WA 1ZJBA 1U30A 2DSWA 3W6LA 1US2A 2VURA 3UG4A 4W5ZA 3SEPA 2DSVA 1QOXA 1Y7VA 3WQ8A 3SUUA 3VDBA 1GCYA 1Q6GA 2WHJA 1DHKA 1W9VA 3O6AA 2X0YA 1E1FA 1UUQA 1W9BM 2XVKA 3WNMA 2X1IA 1V6YA 1DTUA 2WVVB 4MNMA 2DDXA 4DUVA 1PPIA 2ZWZA 3EMZA 2XFYA 1RP9A 1CBGA 1PX3A 2F61A 1C7SA 3D3AA 1EHAA 5IDIA 2WBKA 3BAIA 4XUYA 4Z2IA 2WHMA 3F4VA 1H09A 3GH7A 1EHNA 1EQCA 3WUBA 4M24A 2ZX9A 2VZOA 1GW1A 1E56A 5I2UA 2FHFA 4AZBA 3AIWA 1HJWA 3BCFA 4U5KA 5A8NA 3T0BA 4HMDA 1OT2A 4UQAA 4JKMA 3O9NA 1K9EA 2RGLA 2YLAA 3K46A 1GJUA 1U33A 2VUYA 2J8FA 2W61A 4LXFA 3NIYA 1L0PA 5HOSA 1HKJA 1E73M 2BFGA 5C70A 3RJYA 2J7DA 1UKSA 3OLIA 1W9DM 2DEPA 1BQCA 3RDKA 3AROA 5GQBA 3EDJA 2XVLA 3RM9A 4DWSB 2WC7A 4IISA 3T2PA 2WCSA 3ARTA 1H49A 3N04A 4BZYA 5FL1A 1GHRA 3PZQA 1ITCA 3SCSA 4ATDA 1E70M 1W9PA 1QW9A 4B3KA 3CH9A 2XTKA 4Z2JA 1UQYA 1PZ2A 2VOTA 1OGSA 1TA3B 1CXFA 3EYPA 2MANA 3FHAA 4JAWA 4JFTA 1UA7A 3VD7A 1LLOA 1QVBA 1GVIA 2VVSA 4F66A 2ZXAA 1JF5A 1LG1A 1KR0A 1GQIA 5A6KA 3WEOA 1R87A 2Z1SA 3IAQA 1UD6A 3AS3A 4B3LA 3VNZA 1H41A 4AZ7A 3AIRA 3SUWA 3PTMA 3ARUA 3WMCA 2WLYA 5ABHA 2WMJA 4ZENA 5A8MA 4PMQA 3PTQA 4WKHA 2XGIA 1CIUA 5JUVA 4AMCA 5LA0A 1UH2A 1NOWA 1UD5A 4YN5A 2A3AA 1JNEA 3L2MA 1V3LA 1E71M 2WNWA 5BXRA 5FL0A 2V3EA 4KMQA 6A3HA 3BSHA 3AMGA 2NSXA 1E4IA 1V3HA 5TD4A 3L2LA 1NWUA 2BXZA 1ZBCA 2C7FA 4CVUA 4JL2A 3T0AA 5GNXA 1TVPA 1GORA 1E43A 3BSGA 4PTVA 2VC9A 1B3WA 1CXKA 2V3GA 1E9LA 4ZE5A 2V3FA 1NOFA 3K8KA 8A3HA 3ARZA 3HN3A 3TTYA 4HP5A 1WB0A 3SCTA 5F7UA 4J3SA 3UEQA 2YL5A 3WY1A 3L4TA 1JDDA 4QLKA 1B3YA 4DWSD 2XFFA 3OIHA 3THDA 2W62A 2O9PA 2A3EA 3U57A 2J75A 3IJ7A 2E0PA 1HT6A 2WVVA 3DC0A 3CIVA 3CBWA 3VDAA 2E9BA 2J7GA 4H8VA 4EKJA 4PMNA 1XH0A 4OIFA 1KBKA 3WEMA 4JL1A 5BCAA 2X8RA 5IHRA 3W29A 2VTFA 1V0NA 8CGTA 1JZ6A 3M07A 3AXHA 4UFJA 2OYLA 4M8UA 2XWEA 2DPEA 2E4TA 1UKTA 1RH9A 5A8PA 3EBVA 1UR2A 3UR7A 3B9DA 2HVMA 3LMYA 4D6EA 2OYKA 3N18A 1LJYA 4KGJA 4P7NA 4PMDA 4PN2A 1E0XA 1V03A 4GI8A 3WH9A 2WM0A 1OWQA 4UTFA 2V5CA 1PX8A 3AIEA 5ABFB 4D1JA 2XIBA 4MPKA 5GNZA 2E9LA 1HF6A 5GPRA 2GSJA 1VEOA 1UQZA 5CXPA 1XHGA 4W7WA 1W1YA 1Z32X 1E6SM 4PTXA 3AS2A 4GO9A 1CDGA 1KFWA 2ZX7A 2D1ZA 1DWJM 1ZS2A 4HZ8A 2CCRA 1B0IA 1J11A 4JKLA 1O7AA 4E2OA 2PWGA 3OBAA 3WBAA 3GXFA 1BYDA 3LPGA 4QP0A 3U5YA 5FKYA 1TG7A 1OIMA 4ML4A 1I1WA 1E6QM 2VCAA 4F9JA 2OSYA 3O2LA 2ZX6A 3VIMA 1LL7A 4DUXA 3FNDA 3KE0A 2VZVA 2IUZA 1K9FA 3AHVA 1SMAA 1F4AA 4GZEA 1IT0A 1GOKA 2VL4A 9CGTA 5CPQA 1B9ZA 4F79A 3NJ3A 2QHAA 1HKKA 3MMUA 1VBUA 2OSXA 1MQPA 2VX6A 4HOZA 3MSGA 4AD4A 3GZAA 4J3TA 2CPUA 2GJXA 4UQ9A 1IZJA 1JYXA 2D0HA 3AJ7A 4HPHA 2C8NA 1JI2A 5A6MA 4JFWA 5A95A 3VU2A 2ZXQA 4UOJA 4R27A 3AYRA 1SFSA 3WQ6A 5BXSA 2GJPA 1M04A 2BS9A 1JAEA 3K8LA 3T0DA 4KRUA 2WKLA 1JYWA 5E09A 1TVNA 1B1YA 3VIOA 3WUEA 4M80A 3MMWA 4MAZA 1JG9A 1MXGA 1XV8A 3EDDA 1WE5A 1N82A 4FLQA 4P8VA 2WBGA 4PMZA 5IHSA 2EXOA 1J9YA 4A3HA 1ISWA 4BQ2A 5A6JA 3APGA 2XVNA 1MFUA 3AIQA 4PEEA 3EDFA 1KGWA 1WP6A 4PCSA 4KWUA 3WF3A 5CGMA 4MJ2A 1XSIA 1FH9A 4UQBA 1QI0A 4GZJA 3WDHA 1LWHA 4GQRA 5CSYA 4OZOA 3WD2A 1EH9A 4CU6A 1KGUA 1I1XA 3ALFA 1VFUA 2CKSA 4UFMA 5AC4A 2BHYA 4FLRA 3AISA 4D6DA 5C8BB 3BAKA 4RE2A 4D6GA 1HJVA 5ABEA 1JZ4A 5D9PA 2O92A 1ESWA 4Q22A 2A3BA 4V28A 1CGXA 5CGTA 4W87A 1QI4A 2J7BA 3WDPP 1W9UA 3EMCA 3W82A 3WNPA 4P8WA 1XYZA 2VR4A 4PRWA 4BQ4A 3KWXA 3ALGA 3ZT6A 3LPPA 3K1DA 2W67A 2GK1A 3VIJA 3M6DA 1CXHA 2VX4A 5BRPA 4QAWA 5A69A 3W25A 1VFMA 3L4XA 4P8XA 3BLKA 4FMVA 3ZSTA 2HISA 2JF6A 3ARPA 2WVUA 4Q7NA 2XFRA 5D9MA 1UR1A 3BAWA 4AD3A 1EGZA 5I79A 4GIAA 1E6RA 1MW3A 3MS8A 4DWSC 1E5NA 3VDCA 1JFHA 1D3CA 4ATWA 2J7HA 1A47A 4AZCA 1OT1A 1VRXA 4JHOA 1YQ2A 4RE3A 3MANA 3CUIA 2CEQA 1GQLA 2PC8A 3TA9A 3GBDA 1KB3A 1UZ1A 5E0CA 1TE1A 4HPGA 4F9DA 4XZWA 1EXPA 2J7FA 1UR9A 3QHMA 4U3CA 2C0HA 4C91A 4MB1A 1QHZA 4GXPA 1G01A 2CBUA 1W32A 1CENA 3BMWA 2W91A 2WZHA 5CPSA 4M56A 1OB0A 1C3FA 2ZE0A 4QDMA 2W63A 3TONA 1KXHA 1UWUA 1FHLA 2Q8XA 1HL8A 1E72M 4MDPA 2D2OA 2AMGA 3WDQA 4CD7A 1DEDA 3S2CA 1GVYA 1EIBA 3VM7A 4NI3A 2XM1A 2E9MA 5A6BA 2FGLA 4CU8A 2ZXBA 2YIHA 4CCEA 3UG5A 1JL8A 3W53A 3ZT7A 3WUFA 3SCNA 4C90A 5D9OA 2OWCA 4HOWA 2BY2A 1W1PA 2JEQA 3U7VA 4P8UA 3SCQA 4HOXA 4ZXLA 1QI3A 3CHEA 3W0KA 4CD6A 1NP2A 3RMEA 2WVSA 5FOOA 3ZJ8A 3U7BA 2BHZA 3F5LA 4U31A 3AYSA 4AZ5A 4PMVA 2Y8VA 1OBAA 1PX4A 3WKZA 1JF6A 2VCCA 4UQCA 4C7DA 4E4PA 4AY1A 3SUTA 1XSKA 4AIUA 2A3CA 4AEFA 2ZWYA 3WQVA 2EPNA 2X0HA 1VB9A 2B31A 3CMGA 4LQ1A 1JXJA 1QNRA 3ARRA 2XUCA 4AD5A 3VIPA 3W28A 1HNYA 1J01A 3IJ9A 4CKQA 1CTNA 1B31A 4H41A 3RM8A 4AIEA 4D71A 3WH5A 4FLOA 2J47A 3QHNA 5A1AA 5I77A 1DWHM 2EPMX 3U5UA 1ISVA 5DF0A 4AXNA 1NOUA 4W84A 3WDRA 3N17A 1DWGM 3TTOA 1FH7A 2Y4SA 1Q6FA 1UZ4A 2EPOA 1MXDA 1V3KA 1X1NA 1KCLA 3VD3A 1J18A 5E6YA 3F5KA 4J3VA 4X0NA 1IZKA 3VDHA 1W3HA 5E9AA 1WPCA 3FHQA 2DSUA 1VEPA 3N13A 2DQXA 4LX4A 2XYLA 3M46A 4UNIA 1X6LA 4MB4A 1NWRA 1B30A 1A3HA 2WMKA 1E1EA 1EOKA 1HJQA 4CN4A 2ZXDA 1C93A 1XYFA 1E6ZA 1X6NA 2X05A 2CHNA 3T09A 4F8XA 1ZBKA 3ARQA 2ZUMA 2G3MA 1JGIA 3VKKA 5I24A 2ZUWA 3WDIA 3GH4A 1CPUA 3WNOA 1BYBA 1XD1A 1WAWA 1R8LA 4E8DA 1EQPA 5LYRA 5CG0A 1BAGA 1GQKA 1EDTA 3NSXA 1DWAM 2PWFA 2J4GA 2XIIA 4A3YA 5ABGA 1W91A 1ISYA 2WWCA 1UD4A 2CXGA 3IANA 1BVZA 1J12A 1SYTA 1GOIA 4JFSA 4UQEA 1EDQA 3WD4A 4GO8A 1M53A 3VINA 2DT1A 3T2OA 2QLYA 4TTUA 1D2KA 2WC3A 4JKKA 2WSPA 1PEZA 2PBGA 3GXDA 4D6IA 1NP0A 2PI6A 3N11A 3ZJKA 2GJXB 2W5FA 3OGVA 1W9XA 3W37A 2VX5A 4D6JA 4CD5A 3AHZA 3WQWA 2RGMA 2NT0A 1V6WA 2WMGA 4HU8A 5LA1A 1CXEA 2PWDA 3PBGA 1WNOA 3QOKA 3WF2A 1V0KA 3VTRA 3ARXA 5FD0A 3AHYA 5C71A 3OGSA 5BRQA 1HJUA 1UKQA 1JFXA 3MO4A 4TX6A 1LF1A 2WAGA 2YJQA 4IPLA 4MB3A 1HKMA 1ZU8A 1E15A 2WHLA 4OBRA 3TTSA 5A8OA 4UOQA 6TAAA 2XG9A 1V02A 2WPGA 3CMJA 4CN6A 4OUEA 4PYSA 3PTKA 4IUGA 5A3HA 1M03A 3W6MA 3W4RA 2WKGA 3ZMRA 3WL0A 4Z2LA 2CYGA 3WF0A 1VENA 3CLWA 3W38A 2YKKA 1H3GA 1ZJAA 4CU7A 1FHDA 4W89A 3IJ8A 1UD2A 1ZB5A 2O9RA 2YA1A 1JZ3A 1Q6EA 3MV11 3T08A 2EQDA 2WB5A 2XVGA 3THCA 1BGGA 4D6CA 1HVQA 2BY1A 2YLLA 1KR1A 1H0IA 2D0GA 4QLLA 2W92A 4KGLA 3WH7A 4XV0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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