2W6R | Genus

Total Genus 69

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	69
sequence length	233
structure length	223
Chain Sequence	MQRVVVAIDAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKALAASVFMRELKEYLKSGQAVVVAIDAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADAALAASVFH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	IMIDAZOLE GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE SUBUNIT HISF
publication title	High-Resolution Crystal Structure of an Artificial (Betaalpha)(8)-Barrel Protein Designed from Identical Half-Barrels. pubmed doi rcsb
source organism	Thermotoga maritima
total genus	69
structure length	223
sequence length	233
ec nomenclature	ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2008-12-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2w6rA00

2PURA 4FX8A 3B4UA 3BVJA 3CIXA 3G18A 3PF3A 2I14A 1KV8A 3VI2A 1IXNA 1JCXA 3S0CA 5DBUA 1LBFA 1ML1A 5DELA 1VRDA 2PRHA 3TC6A 5AC7A 4ZQOA 3TSBA 3G1AA 1GVSA 4Q4KA 3HQ1A 3A23A 5F4WA 3HG4A 1FUYA 3I7SA 3LX9A 3N19B 3NPWA 4KWVA 4WZHA 1UBSA 3L21A 4UTIA 3G0SA 1DHPA 4PCFA 1JQVA 5I3IA 1QWGA 4O52A 2FTPA 2H90A 2NX9A 1OHLA 3C52A 1GJPA 3I6RA 3O8AA 2PC4A 2HSAA 3M7WA 4YXGA 1W31A 3L0KA 3QSRA 3SI9A 4IUOA 4UC5A 1DKWA 1WYIA 2VENA 3ABRA 1XFBA 1P1XA 3GDKA 3S6DA 3EWXA 4UFHA 3UQNA 3BARA 1OFBA 2P1FA 3IIPA 3N14A 5DCEA 4O57A 3R2GA 4RV8A 2FIQA 3T4CA 3QM3A 1GVQA 2FPYA 2ABAA 4FNQA 3MHGA 1TTQA 3TX9A 5DXYA 1ME7A 4MY9A 1OABA 1YLVA 2YR1A 1G4EA 1XI3A 2QUTA 1A5CA 2A85A 3Q2DA 4O0ZA 2DU2A 3W1QA 2RDTA 3LTYA 4O1AA 2R94A 3P80A 3HF3A 4UTKA 3C6CA 1PCKA 5HR6A 1OX4A 2EKCA 5D2TA 5I3GA 1O4UA 4N6FA 1OG0A 2Y6ZA 2X1UA 3W1PA 3L65A 4U28A 4GXMA 3ZS4A 3WJWA 3IIOA 1VHCA 4NJHA 2XN0A 1CW2A 1SSDA 1V5XA 4UTHA 2Z0IA 2X2GA 4WY0F 4E0CA 1VPXA 2PRLA 2VFHA 2EPHA 1GG0A 2TMDA 3UZJA 4EOUA 3K30A 3TC7A 4QSHA 3RNDA 3UWUA 3S1WA 3GNNA 2ZA1A 3GZ3A 2Y7DA 4BWLA 1OX6A 3LCFA 1XXXA 1TPEA 1JUKA 3BGGA 2A7RA 1H1YA 3QPZA 4S2BA 3H53A 4MY8A 2FQIA 2NLIA 1R30A 3IIVA 3QMRA 4J9JA 4O16A 3EX2A 1YYAA 5AOUA 3P8IA 3W88A 5HUOA 5D30A 4HSOA 4GUHA 1Z42A 3NPUA 2A7NA 4FIRA 3W87A 1F6KA 3FOKA 4GWEA 5EPDA 1O94A 1R47A 4OV4A 3W6YA 3GDMA 5T26A 1DOSA 3W1MA 4IMEA 3W72A 1QAPA 4O8RA 3HGRA 5I3FA 1TPDA 4YMZA 2ZZ1A 4DF0A 2Y62A 1B4EA 4LRSA 5AYXA 4JR5A 3EKLA 4MYXA 5AB3A 1S3HA 1L9WA 5LNVA 3R8RA 2Z6JA 4XZ9A 2DZXA 2AAMA 2E5BA 2BSLA 3C2VA 4EVZA 1YXDA 4PEKA 4AHPA 5HJLA 3RMJA 3S5OA 1GVRA 1C8VA 3N2XA 3QPYA 2YPIA 3PULA 1SFJA 3E0IA 1UB3A 1IGSA 2E68A 1N8FA 3W2JA 1THFD 2DP3A 4FX6M 4PH6A 3TAKA 4BK9A 1UUOA 3CT7A 3S9YA 1FDZA 2Y63A 3MJYA 3LHVA 4JYDA 4R34A 3HO8A 4ORIA 3SW6A 1V7YA 4FO4A 3W2NA 4AXKA 2ZZ5A 3W75A 4KKXA 4OT7A 2J9XA 1AG1O 1FWRA 1G4PA 2JBMA 4B5NA 2G5WA 4O18A 1J4EA 1M7PA 1XBZA 3W1TA 4NZFA 2NZLA 4IMGA 1LBLA 4LS1A 5E1QA 4FNUA 1R2SA 3EX4A 3NR0A 2B7NA 4MZ1A 4YCPA 3W1LA 3KRUA 4K6AA 2NUWA 3C0JA 4DO5A 5FF2A 4MFEA 3Q58A 4IXHA 1JRBA 4AB4A 4BI5A 8TIMA 1KTCA 3W7CA 4JTTA 1GYNA 1EWDA 1WXJA 4O19A 3HGJA 5FEZA 4A2SA 1UJPA 4O1CA 3CM4A 2YCEA 1SSGA 1W8SA 4IX0A 1SZEA 1QPQA 5DCBA 3C4UA 3S5YA 1GEQA 2Q8LA 4BI7A 1YTDA 5L9FA 4PTNA 2YZRA 1AL8A 1C29A 4IJBA 2J9ZA 5LNUA 3FYOA 3TJLA 4LVFA 4MVAA 4LVDA 4RZ5A 4ZQCA 2NXGA 2PE4A 5CKSA 1MEWA 3KXQA 3G1XA 3MHFA 4NUWA 2W79A 3HBLA 5KINA 5K4ZA 4LV9A 1TSIA 1QPNA 1FX6A 2ZRYA 1BEUA 1QNVA 2I1OA 3THAA 4QNEA 1LTDA 3HPSA 3TW6A 3L67A 4NJJA 3PY2A 3TQ0A 3P61A 3TE9A 3LBCA 2QCGA 4NXKA 3LV5A 4K39A 4K7YA 1MEHA 3ZR4A 5L6UA 1E51A 4ORMA 2NXIA 2BX7A 2RH9A 3GB6A 2BLEA 2PCQA 5CZTA 1EP3A 3A9IA 3TNOA 2ISWA 5HULA 4ALDA 3LDVA 1PE1A 3DKLA 3A24A 2FFCA 2Z2UA 1M6JA 2WNZA 3S5NA 4OBTA 1XM3A 2YX0A 3AO0A 3T78A 1OJXA 5LNWA 3W7JA 3PC0A 3PVFA 3NQ7A 3STEA 2QCHA 1RQBA 3UWWA 1TPVA 2NWSA 1Q6RA 1OFAA 4Z0SA 4FEZA 4MKNA 4DELA 5AC6A 3MW7A 2Q8ZA 3NQMA 3IV3A 3C2EA 1ME9A 3VFLA 2GPTA 2VEIA 5LHEA 1KFBA 4LT9A 1C9DA 3EXSA 3IVUA 3ABQA 1F5ZA 2R91A 4HT3A 2F84A 2FDSA 5H2ZA 2W6RA 4MY1A 3W83A 5DBTA 4UR8A 2WPBA 1JCLA 2BXVA 5A8GA 5EKYA 1Z48A 2VKZG 1W37A 1QPRA 1TRIA 4EF8A 5FF0A 4HN4A 2GQ8A 3CU2A 1KLYA 3NNTA 3GDLA 2C15A 2DZUA 3DH7A 4ZL1A 3DHDA 4FHAA 2VXNA 3P82A 3NDOA 2V30A 2WV8A 3AJXA 2NV1A 1WA3A 1F74A 3L5AA 2ZRUA 3LLDA 3VKJA 4HPXA 2TSYA 1QCWA 3SFKA 3MI3A 4UNLA 3MP4A 1DL3A 3NQ6A 2FPVA 5F2MA 3UXAA 2H8ZA 4JTKA 3HG5A 1T8XA 3V75A 5BRBA 4ZMGA 3UD6A 1Q6OA 1WV2A 4Z08A 5EMUA 4N2YA 2YW4A 1QOPA 1RZMA 4WUIA 1G6CA 1Q45A 3BW3A 1FBAA 1EWEA 5LGZA 1X8FA 1VLIA 4Q32A 4XBKA 2Y7EA 2V2DA 3SECA 2Y61A 3SSJA 3QQ1A 4IQLA 1PHWA 3MMTA 4XKYA 3L66A 1XC4A 3TIMA 4KFNA 3V1PA 1TV7A 3SGZA 3NM3A 1KM0A 2VEKA 1FWWA 1K7FA 1ZAJA 4UMBA 4K38A 3CC1A 3M16A 4WOZA 3L5LA 2A0NA 5G2HA 4XBSA 1EUAA 2WO5A 5AC8A 4ADUA 1P0NA 5LGXA 3W70A 1YTEA 4W9TA 3IRDA 3WK2A 1TPC1 1JCMP 4LVBA 2NWRA 4JTUA 1TMHA 4RZ6A 3TXVA 5I3HA 3PWAA 1Q6LA 4IXXA 4JY9A 3W7GA 1F2JA 1X6UA 4AWSA 4LUIA 4I7UA 4S2CA 3LHZA 3TCEA 1SZNA 2A7PA 2CZEA 4RJEA 5F1UA 1VZWA 4EIVA 2HS8A 3W9ZA 3W22A 2A5HA 1J2WA 1F7BA 4FNRA 5BNKA 3B0VC 4GUFA 5CZJA 2DZPA 3E02A 3I7QA 2ZTKA 2QDHA 4NJGA 5GVJA 1GWJA 4OU1A 3MBDA 3P60A 5KITA 1QMLA 2ZZ4A 4S1FA 3NL3A 5EYWA 3E9AA 5AHMA 4CQ8A 4FF7A 3HPXA 1XKYA 3W86A 1LRNA 3FKRA 5D2XA 2ZZ2A 1VCFA 3UWZA 1A53A 3W74A 1QR7A 1VYSX 3I7RA 1B3OA 3FFSA 3T55A 1KTNA 3STFA 1ADOA 5F1VA 1KTBA 3ABOA 1M5WA 1VH7A 3GXNA 2C16A 2ZYFA 5KTLA 4ICNA 3ABSA 4NT0A 3W23A 3C2OA 1FDJA 3UXDA 1QOQA 3P7YA 2Q3OA 4DF1A 3HPZA 1X1OA 1LBMA 2YYTA 1JUEA 3IVTA 2C3ZA 4O4VA 5D2YA 1B4KA 3TR2A 3DI1A 2OZ0A 2BWGA 3ELFA 3DXIA 3H55A 5AHEA 2BTMA 4NJIA 3W2UA 3W3OA 2AQWA 1TO3A 3HJZA 1SO5A 4Z1BA 1GQNA 3KOFA 4JXCA 5A5WA 1KFEA 4NX0A 1W5PA 3HGOA 1I2NA 2FJKA 1UUMA 2AGKA 5E0KA 2X16A 3EWWA 1EX5A 2CLLA 5CG7A 4A2RA 1A50A 3EEGA 5D02A 1FWTA 2QCNA 4XWUA 2YW3A 4A29A 4YWIA 5D33A 2QEZA 4LOCA 4UFLA 4GC4A 5CGQA 3W1AA 4IMFA 3LTSA 5F2GA 3PUEA 3FYPA 1LROA 3W1RA 4UUIA 2WNQA 4CNOA 3DZ1A 4N4QA 3W1UA 4IMDA 1KA9F 4FNSA 1DV7A 1FY6A 2Z6IA 3NG3A 3DFSA 5DLCA 4A3UA 1SZGA 3HG2A 2GVGA 2LLEA 3A21A 3GXPA 1ICSA 1W5QA 2YYUA 3HGSA 3N34A 3LRLA 2Z1BA 2ZZ3A 1NSJA 4LY8A 1OYBA 2C1HA 2V2HA 2R14A 4JTHA 3KVJA 5K4XA 3UWQA 3A5FA 4CQAA 2VFFA 3P5YA 2J27A 1K7EA 2E6DA 3PUDA 3M1ZA 1TPFA 3W7QA 1PVNA 3C3NA 2WSYA 3RF9A 4AAJA 3G3DA 3NOEA 1H61A 3WK0A 2EGZA 4JYFA 4BI6A 3BO9A 1BKSA 2QUVA 4HHPA 3HIJA 3N73A 4IX2A 3B06A 3NA8A 3S42A 2XN1A 3PUOA 2PRMA 4EF9A 2NXHA 1TTPA 2EF9A 4UIOA 3WK1A 3GKFA 3IGXA 3JR2A 2ZRZA 2Y89A 3O6YX 3RLVA 5FI8A 4CNNA 1B57A 4QQ3A 5EL1A 4Z0JA 1I45A 3OBKA 5K9CA 3L5MA 1L6YA 4JTGA 2TRSA 1M7OA 3FJ6A 1H50A 3DFPA 2ZRWA 2NX1A 4O28A 5DY2A 3WFAA 5F4SA 5G2IA 3NVTA 1LRTA 3LHWA 3BG3A 1EA0A 5C55A 1W5OA 1OFOA 5FESA 1GVFA 4Y6GA 1IF2A 2B0MA 2DZVA 3NQVA 3W2MA 3VNDA 3FA5A 3BLIA 2GJLA 4NXSA 2GUUA 2A6NA 3O6DA 3PR2A 3GDTA 1P0KA 1XUZA 5HNRA 4UFKA 3SZ8A 1W5NA 3TFCA 4RXFA 2ZZ7A 1XBYA 1YDNA 1Q3NA 1FDYA 5AFDA 4HIBA 1VC4A 1IXOA 1FCBA 1H7NA 2E77A 1GPWA 3NL2A 3LHYA 3MBFA 3MHUA 3QQ0A 1IXQA 4RR4A 1FCQA 4M6QA 3MUXA 4DXVA 2ZCGA 3N9SA 4ZVJA 1WDWA 3GX9A 1H7RA 3A22A 1Z44A 1JCYA 1VLWA 1TRDA 2DZSA 2J24A 1LOLA 4JICA 4OQVA 1QO2A 3O63A 4ADTA 3W85A 1EEPA 2RKXA 3W07A 4GUGA 2OCZA 2VFIA 4AHQA 2B7OA 3KVKA 4C1LA 4MFDA 4UTTC 2OJPA 1YXCA 3TSMA 3MYOA 3PSVA 2H3DA 3UZ5A 1R46A 1DBTA 2V9DA 5AHNA 1JULA 5FEWA 2GOUA 2E5DA 4OWGA 3LI0A 3NZ1A 5LNRA 3EXTA 4Z1DA 5LZLA 2Y85A 2QCFA 4P2VA 1LOQA 2GVLA 1F76A 2Y88A 3GR7A 3O06A 2V5BA 4BFAA 1KM6A 1EB3A 4N9EA 4K37A 5CPLA 1I2RA 1O5KA 4M6PA 1TJRA 1A5AA 1ME8A 1W3IA 4MYAA 4D2JA 4UTMA 3PSWA 1TB3A 2RDWA 4K36A 5TQLA 1I2OA 4C1KA 4NJKA 3R89A 1ZAIA 4LC6A 4LVAA 2QCMA 3M9YA 2WSRA 1ZENA 4M7TA 3TMLA 4NNAA 3W76A 3DFQA 4U4MA 3WJYA 4DPPA 4QNWA 1N55A 2G95A 2H6RA 2JKPA 3NQGA 2QDGA 5AYZA 1SFLA 1K3UA 5CSRA 1MXSA 3TKFA 2X30A 3QMTA 5G2WA 3C2RA 3QRHA 1NVMA 1AMKA 3TUUA 1H51A 1T99A 1G7VA 1TPWA 2YSWA 4LWWA 1OFPA 4R33A 1G4TA 3F4WA 3C2FA 3QMSA 3SY5A 5DN1A 4LC8A 3BLFA 3ZWSA 1DORA 3EWBX 3OVRA 4I7WA 3W84A 4MLRA 2CFFA 4AWTA 1TPUA 5CPOA 5FF4A 1J5TA 2CLHA 4JYEA 3IEBA 5D37A 4LVGA 2QCEA 2VC6A 3JS3A 3RK8A 2VEPA 1CX9A 3PM6A 3N9RA 3UY7A 3IIZA 1IIGA 1RVGA 5HWNA 1N7KA 4WQ6A 4M7SA 2JKAA 3B04A 4WD0A 3UNDA 1YADA 3E96A 3LCWA 3QH2A 1MO0A 3S1XA 4HKPA 3P5ZA 3B8DA 1LM1A 3CTLA 1ICQA 4WY0B 4ZQMA 5BOOA 3WJXA 4AWUA 3S1UA 1XBXA 4HPJA 1U5JA 3LERA 1PIIA 2ZA3A 4JTFA 2VFDA 1VGAA 4NZJA 2RFGA 3W7IA 1OYCA 4R53A 3TXZA 1SO6A 4JGDA 3L2IA 1D9EA 5CPMA 1JCJA 1VCVA 3NYZA 4E2DA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2W6RA

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