2W9FB

Crystal structure of cdk4 in complex with a d-type cyclin
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
288
structure length
261
Chain Sequence
RYEPVAEIGVGAYGTVYKARDPHSGHFVALKSVRVPNGEEGLPISTVREVALLRRLEAFEHPNVVRLMDVCATSRTDREIKVTLVFEHVDQDLRTYLDKAPPPGLPAETIKDLMRQFLRGLDFLHANCIVHRDLKPENILVTSGGTVKLADFGLARIYSYQMATLWYRAPEVLLQSTYATPVDMWSVGCIFAEMFRRKPLFCGNSEADQLGKIFDLIGWPRDVSSVVPEMEESGAQLLLEMLTFNPHKRISAFRALQHSYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords G1/S-SPECIFIC CYCLIN-D1
publication title Crystal Structure of Human Cdk4 in Complex with a D-Type Cyclin.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 261
sequence length 288
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2w9fB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2w9fB01
4GL9A 4XH6A 3W8QA 1BMKA 3ORMA 4HPTE 3ORKA 2VTNA 5JEBA 4A9TA 4CCBA 4XLVA 2YZLA 4FKJA 4QPAA 3SOAA 2QOHA 3VBQA 5BVNA 4IJ9A 4WNKA 5CAUA 2WTDA 4OTGA 4X7QA 5AFVA 3RP9A 4FYNA 5DHJA 5E8WA 4C34A 3HMIA 1KE8A 5I3OA 3HA8A 4GIHA 2GHMA 1UV5A 1ZWSA 4Y72A 4B6LA 2C68A 2IZSA 4W4YA 3QD3A 5CU2A 5EYMA 2ZDTA 4BDHA 2GQGA 2R2PA 1MRVA 2C5VA 2ETRA 4WD5A 5FXQA 4BYIA 1RDQE 4QPSA 2B54A 4DC2A 2QU6A 3F5GA 4TW9A 5ANIA 2YERA 2R3QA 3DJ5A 2J0MB 4AT5A 4TYHA 4QTEA 4IAIA 4YLJA 2YM8A 1M2QA 4O27B 3KA0A 2YAKA 1XJDA 5AA8A 2WMVA 4XG9A 4A4OA 4EHVA 3QQUA 4IEBA 1PF8A 1RQQA 2FSOX 3IG7A 5F4NA 4OTPA 4AZEA 1KV2A 4CZTA 1K2PA 4E5AX 4EH2A 2V7AA 2W17A 4X2NA 2ITZA 3NUAA 4EK5A 3OY1A 2VU3A 2WGJA 3FI8A 2PVKA 1Y91A 4AOTA 4B9DA 3AC1A 5BUJA 4FEXA 2F7XE 4HYSA 3D14A 1ZARA 3ORZA 4D28A 4O84A 3PJ1A 2Z02A 3V5QA 1GOLA 5HTCA 3DZQA 4DTAA 4FIJA 1KV1A 4IAZA 3LIJA 2DS1A 3KQ7A 5AADA 5M44A 3S2PA 3GU7A 5HBHA 3D5XA 2X2KA 4FIGA 4JLCA 5EOLA 4YZCA 5GJFA 3TG1A 4EUTA 3Q4ZA 3TXOA 3ZUUA 4A7CA 3FMDA 4D2RA 5FGKA 2OSCA 3NUXA 4EKKA 2C30A 2VTPA 3TKHA 4RFZA 4FTMA 2ZV2A 3FPMA 3LXKA 3G0FA 2Y6OA 2GFSA 4MBJA 2HXQA 2OZAB 3RI1A 4AE6A 3D7TA 4V0GB 1OPLA 1MRUA 3R02A 3FXXA 5DE2A 5B2KA 5LCKA 5GIOE 5F94A 3CPBA 4GEOA 1CKJA 3F82A 2QKWB 3CBLA 3LPBA 4IM2A 4R6VA 4BF2A 3I60A 4CQGA 4F9YA 2CNVA 5L2QA 2RF9A 5HIBA 4Z55A 5L8JA 3BU5A 4ZY5A 1JLUE 3DXQA 2PK9A 1LEWA 4KIOA 4JL9A 3QQGA 5HG7A 4EC8A 2P2HA 4OTIA 4QQ5A 2PYWA 4NUSA 4U9AA 3UP7A 4MXYA 3R8ZA 3VUTA 1XH4A 4FR4A 2A27A 3DCVA 2F7ZE 4Y46A 5AM6A 4TZRA 2UZVA 5AMNA 4KABA 4FTIA 1J91A 3ZRKA 3Q6WA 2XYNA 2C47A 3SGCA 3IOKA 4FKOA 5EYDA 4O96A 1S9IA 5L8KA 3W2OA 4DGLC 4EYJA 1OIYA 1YXUA 4LV8A 3BZ3A 5H2UA 2PUPA 3GUBA 3DU8A 1U46A 5IQCA 4EH5A 3VC4A 3R7UA 2GU8A 4C4EA 5CF4A 2VV9A 3E8NA 3SAYA 2SRCA 5FQDC 3RPOA 3C4CA 5LVNA 3WF9A 5JZNA 3OCTA 3W2QA 4DH7A 3FSFA 3ODYX 4PDYA 4J52A 3G6HA 4UYAA 4AT3A 3DB6A 1UA2A 4TXCA 4BBMA 5CU0A 5CZHA 4TPTA 3EQCA 3QA0A 3QHRA 4JNWA 4XMOA 4ENXA 1ZZ2A 3VUHA 3PJCA 5LJJA 4EBWA 3ZU7A 4KIKA 4BGQA 2QO9A 3DBFA 4DYMA 3GU6A 4QYYA 1STCE 2XCHA 5CX9A 2XYUA 2EUFB 5CF6A 2BRHA 2C0TA 1MUOA 3DFCB 3RBWA 3DBCA 4Y85A 4E4MA 2C5YA 4EI4A 5KMOA 3C4FA 3LJ0A 2YABA 3P23A 4D2TA 3Q2MA 4PP7A 5C4LA 1UU9A 4HCVA 5B2MA 3MH1A 3MV5A 4YO4A 5G6VA 3FKOA 5CANA 4U5JA 5FM2A 4EZ5A 2XK9A 4JT3A 4JXFA 1SNUA 2ZMCA 3MVMA 4KAOA 2GSFA 2PMIA 2NO3A 2BDJA 4UEUA 5B0XA 3TKIA 1JPAA 1K9AA 4NIFA 1NW1A 1FVVA 1TQMA 2XNGA 1OL1A 5I5ZA 2I0HA 4QMUA 3B8RA 4CFFA 5K5XA 5CEMA 4OTQA 3VS6A 4CYIA 4L3JA 3ZSGA 5HE0A 4PL3A 1U54A 2FSMX 3KN6A 4K18A 1F0QA 1O6YA 4FKQA 2JFMA 1LP4A 2QOOA 4JDIA 4QYGA 4DGOA 3NMUF 4KNBA 3R9RA 1XR1A 4NCTA 3QGWA 4FK6A 4Y8DA 5FM3A 3VRYA 3ZEPA 4EK6A 2X6DA 3UZTA 1G8AA 3UIUA 4E5BA 2WIPA 4RIXB 1FMKA 5J8IA 4UWBA 2XJ1A 3P7BA 4FV3A 2ZM1A 3HAVA 4O7SA 4TTHB 3R1YA 2ITQA 3F2NA 4F7LA 3U54A 1PXLA 3PA4A 3CP9A 1QPEA 4IHPA 1Z5MA 4G3CA 4AACA 4NW6A 4R7HA 4DFXE 4NTTA 4IX3A 3GC9A 4LL0A 1JBPE 4DA5A 2VWYA 5T3QA 4KSQA 4JR3A 3U55A 4ZJVA 3S0OA 2BROA 5DT4A 3KRXA 2GNGA 3LKMA 1IA8A 4E6AA 2C3KA 2FSTX 4O2PA 1MRYA 3E8CA 4FBXA 4BTMA 2C5NA 3SRVB 3QX2A 3QQLA 5EQYA 4L68A 5JH6A 5HG8A 1TQIA 1Q8WA 3QLFA 1P2AA 4CKIA 4DFBA 2UVYA 3DTWA 4FT0A 4KKHA 3R8PA 5E8TA 1E1VA 4ZAUA 1BI7A 2BILB 4G3GA 4DF3A 2Y6MA 3JYAA 3ZUTA 3TN8A 1UWHA 3FLWA 3DGKA 3O51A 4F9BA 3FV8A 3PXYA 1GAGA 2O5KA 5H3QA 3VAPA 4GT4A 4MXAA 3TCPA 2C5OA 4C58A 2V0DA 3ZXTA 4FODA 5IH6A 1ZMUA 3NAXA 4PUZA 4ARKA 2VD5A 5KKRC 1NVSA 3UE4A 2HY0A 5HVKA 4CV8A 3FLNC 4LGDA 2PMNX 4OR5A 5HO6A 5FTGA 1H28A 4MXZA 2UZUE 4PV0A 4IZAA 4C4HA 4YHFA 4FZ7A 2CGWA 3ITZA 3MDYA 2W4OA 4O6EA 3RWPA 3W10A 4PTGA 5HE2A 3DB8A 5EM6A 3QX4A 3TT0A 3R7OA 3H0YA 4QTAA 2W5AA 3MSSA 4AWIA 2R3IA 3F9NA 4TYJA 3HECA 3W18A 5D41A 4BDEA 2RG5A 3L9LA 4I20A 5A4LA 4OAVB 1NT2A 5I9ZA 4G5PA 1W98A 4GT5A 4QYHA 2X8DA 2OIDA 2XS0A 3L8VA 4AOIA 4DEIA 5ETFA 2XNPA 4L7SA 3PJ2A 2F2UA 4IANA 4D2SA 5EM7A 4GVAA 2I7QA 4FKSA 2BAQA 3FQHA 4ZEGA 5IA4A 3Q60A 5IA1A 4D4VA 3UQFA 3A4OX 4HVHA 4ZTMA 4FGRA 4BTKA 3JY0A 2WMQA 2NPQA 1W8CA 2W5BA 5J1WA 1OKWA 3EFKA 1U4DA 2W1CA 3VS3A 4K6ZA 3EHAA 4W8EA 3CJGA 4AW1A 5KMNA 2GFCA 4ZSEA 2BZHB 3G0EA 4CRSA 4K2RA 3TZMA 4PDOA 1IEPA 2CN8A 3FMMA 4E93A 5HZNA 4BR3A 4FVPA 4OBQA 2ITPA 4KINA 3ET7A 5L4QA 4P90A 3SKCA 4L3PA 2OZAA 4V0GA 3C4XA 4IX6A 4ZTSA 3C7QA 3I79A 4P7EA 5L2IA 4MXCA 3EIDA 3ZMMA 4C7TA 3HRFA 4IFCA 5L2TA 4S33A 3PA5A 3R71A 5E1SA 2OZOA 3G9LX 5KHXA 1UVRA 4MAOA 2FUMA 4YPDA 3HRBA 3E3BX 4DFZE 3W2RA 5EDQA 2BPMA 2WTWA 5EQEA 2WOUA 4RG0A 4HVGA 4J1RA 4XV2A 3U4WA 4U40A 4CT2A 2I0VA 4AF3A 4RX9A 2B9JA 3VBXA 4HGTA 1Q3WA 4BCPA 2VTAA 3VBVA 4F6SA 1ZYLA 2VNWA 3Q4TA 5IEYA 2OIBA 1NA7A 4LMUA 2OH4A 4ZLOA 3EQPA 4XG2A 3QD0A 1YXXA 4CLJA 3GP0A 4DFLA 3ORPA 3Q9ZA 1W84A 3ENMA 4HJOA 5FP5A 4CTBA 2RIOA 4C37A 2ZJWA 4AW0A 4XP0A 2QO2A 3R8LA 2YM7A 3FZTA 3IW5A 3OWLA 3PRFA 2R3JA 2A0CX 3UOJA 2ITVA 2FGIA 1EH4A 2LAVA 3OEFX 4GT3A 3KXGA 4FTAA 5CNOA 4CSVA 5KO1A 3GC0A 3E62A 5JSMA 3QXOA 2IW9A 2YCSA 3KXXA 5M53A 4OTRA 2B9FA 4V01A 3R7IA 3WYYA 4I0RA 5DR2A 2OJJA 3AC8A 3C51A 1IRKA 5AJQA 2OKRA 2XMYA 4I6QA 1M17A 1KWPA 2R3GA 2YIWA 5HORA 3RZBA 4U44A 4OGRA 4YJRA 1I09A 4YJUA 4EOPA 2QO7A 2JAVA 5EKOA 1JKSA 4I6FA 4BWXA 2KULA 4D0WA 4B4LA 3D5WA 3ORLA 5AAFA 3HNGA 4ENYA 1G5SA 1LEZA 3DNEA 3NNXA 4F7SA 2VO0A 4E26A 3MFRA 3R63A 2HZ0A 2NRUA 4JBPA 5EM8A 3NRMA 5FWKK 2BTSA 1QCFA 5CQUA 3PLAE 3H30A 3AD5A 1R3CA 2ACXA 4L43A 4DE4A 1JSVA 2UVZA 4CXAA 3PIYA 3QTRA 4UMUA 2WMWA 4JX7A 3VVHA 3IW7A 4YSJA 4PMMA 2FYSA 3P0MA 4RT7A 3HGKA 5IQFA 3P7CA 4JAJA 4NH1A 2OJIA 3FY0A 3VN9A 1DI8A 4IWOA 4NKSA 2YISA 1XKKA 2CHLA 1JKLA 2OJ9A 4RWJA 4RIXA 1YOJA 2UUEA 4FKPA 3GCSA 4M15A 5JQ8A 2PU8A 5IQGA 4EH4A 5EHLA 2JDTA 2XM8A 3ORIA 2XZSA 4ZLZA 2IVUA 2AYPA 4GK3A 3KC3A 3M11A 4RLKA 1QL6A 5HLPA 4FNXA 2GDOA 3RWQA 4BTJA 2PZYA 3L8SA 3TNIA 4BCHA 2WMBA 1PXOA 4UXLA 1XBAA 4F1OA 3LCSA 3DS6A 5JRQA 2VTJA 3M2WA 3CXWA 4AW5A 1WCCA 4RMZA 5AP4A 5IF1A 5C03A 4X2JA 5DVRA 2WMUA 2WEIA 2W7XA 3FHRA 5LXMA 2OXDA 3IOPA 3SRVA 4EQMA 4FEVA 3AXWA 3FMJA 5E91A 3F66A 4BGHA 4CCUA 5A4TA 5KKRB 5K3YA 4NFNA 4EOOA 2ITWA 4IWDA 4GW8A 3ZLYA 5FDXA 2CDZA 4BCOA 4JIAA 4ERKA 4Y5QA 4U0IA 4BI1A 4FT5A 3IO7A 2X81A 4E7WA 4CKRA 3NW7A 3D15A 3GB2A 5FLFA 4ACDA 3CS9A 5CF8A 5IEVA 2PVMA 3FY2A 3FZPA 4NM3A 4S32A 5HEZA 2VX0A 2WTCA 2QOKA 2VTMA 2YM6A 2XK6A 3A2CA 1YXSA 3EB0A 2CMWA 3BIZA 2ZAZA 4RVLA 5EW3A 4F6UA 3GCQA 4BCJA 2JIVA 1YI3A 5E8VA 4NL0A 3UQCA 4R1VA 5D7AA 1B38A 3ATTA 2XEYA 2ZVAA 4MK0A 4HCUA 3UOKA 4ZTRA 4RVKA 3FYKX 1R78A 1OL2A 3GC7A 4FZAB 5M57A 5AP1A 2Q0NA 2J7TA 3AGMA 2Y0AA 4IDVA 4NKAA 4BVUA 3L1SA 4E4XA 5HTBA 2XF0A 4QNAA 3QTQA 1WFCA 1BUHA 4ZIMA 4BDDA 3OWJA 3GU8A 4GVJA 1KE6A 4IDTA 3NEWA 1YI6A 3UO4A 3PIZA 1APME 2F9GA 3UIXA 2C6DA 2OG8A 4QMMA 3O17A 2BR1A 3O2MA 4R3RA 4N4SA 4B8MA 5JKGA 3A7GA 1S9JA 4LI5A 4DEHA 5ETAA 3UGCA 1HCLA 1WBOA 4IVDA 4RWKA 3PXZA 3R7GA 4KRCA 5CT7A 3UO6A 3BYMA 3DKCA 3SX9A 4CZYB 4DCEA 4M0ZA 4R1YA 4XV3A 3E87A 1CTPE 4X2KA 3OG7A 4FYOA 4IWQA 2BDFA 4O0TA 4QP6A 4E20A 5J95A 5KX8A 2WTKC 3U8WA 2GS7A 5AUWA 3DJ7A 3HV5A 4YJNA 3SHEA 4AT4A 4ZLYA 4HPUE 3LJ2A 5CEPA 2XBAA 2VTSA 3ZEWA 4ZS4A 4RC4A 1W83A 4ALVA 1LR4A 4OTHA 5CZIA 2EXEA 2JKOA 3FZ1A 4QTDA 4NM7A 5HCXA 2X4ZA 4HVSA 4P5ZA 3U9CA 4R7BA 2EVAA 2IZRA 2WAJA 3BGZA 3G2FA 3CD3A 4RJ5A 4G9CA 1PXNA 2UW9A 3V5JA 1Q61A 3F3TA 4FG7A 2GHGA 4FOCA 1ZMVA 2JKMA 3HZTA 2E9PA 5IA0A 2HCKA 4FTRA 4GG7A 4X0MA 4FTKA 4GG5A 2IN6A 3FKNA 3HL7A 4FSWA 4YJSA 3P1AA 1H1PA 1B39A 3VO3A 4PTEA 4N70A 3LXNA 4H1JA 4V04A 5CAPA 2GNIA 4H58A 2X8EA 4M14A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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