2WB5A

Glcnacstatins are nanomolar inhibitors of human o-glcnacase inducing cellular hyper-o-glcnacylation
Total Genus 227
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
227
sequence length
585
structure length
584
Chain Sequence
QVLVPNLNPTPENLEVVGDGFKITSSINLVGEEEADENAVNALREFLTANNIEINSENDPNSTTLIIGEVDDDIPELDEALNGTTAENLKEEGYALVSNDGKIAIEGKDGDGTFYGVQTFKQLVKESNIPEVNITDYPTVSARGIVEGFYGTPWTHQDRLDQIKFYGENKLNTYIYAPKDDPYHREKWREPYPESEMQRMQELINASAENKVDFVFGISPGIDIRFDGDAGEEDFNHLITKAESLYDMGVRSFAIYWDDIQDKSAAKHAQVLNRFNEEFVKAKGDVKPLITVPTEYDTGAMVSNGQPRAYTRIFAETVDPSIEVMWTGPGVVTNEIPLSDAQLISGIYDRNMAVWWNYPVTDYFKGKLALGPMHGLDKGLNQYVDFFTVNPMEHAELSKISIHTAADYSWNMDNYDYDKAWNRAIDMLYGDLAEDMKVFANHSTRMDNKTWAKSGREDAPELRAKMDELWNKLSSKEDASALIEELYGEFARMEEACNNLKANLPEVALEECSRQLDELITLAQGDKASLDMIVALNEDTEAYESAKEIAQNKLNTALSSFAVISEKVAQSFIQEALSFDLTLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE NAGJ
publication title Glcnacstatins are Nanomolar Inhibitors of Human O-Glcnacase Inducing Cellular Hyper-O-Glcnacylation
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium perfringens
total genus 227
structure length 584
sequence length 585
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2009-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2wb5A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2wb5A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2wb5A01
1HJVA 1PBGA 2DT0A 1GJUA 3SCRA 4PEEA 1NWSA 1MW0A 1E40A 3CZLA 1C90A 1MFVA 4K68A 1UWTA 1JZ8A 1EGZA 1HJXA 3G6MA 3NSXA 4BQ2A 1CPUA 1ZBWA 2WMFA 3WDRA 2X2YA 2CKSA 2OYLA 4W93A 4S3KA 3N13A 3MMWA 4PBGA 3VD3A 4HTYA 2JIWA 1W3JA 2X05A 2XSBA 4CN4A 3RJYA 3VIFA 4M56A 1XCWA 3W4RA 4PRWA 1H3GA 4CUCA 3VDAA 1KQYA 3DHPA 4UOZA 4IPLA 4ZE4A 4PSPA 2QHAA 4CD6A 1V0MA 1HP4A 2JIEA 4GZEA 4UCFA 1G94A 2V5DA 1GHRA 2ZUNA 3GBDA 5EFFA 3CZJA 1HF6A 4B15A 1OB0A 3WQWA 1JZ5A 3AJ7A 2DPEA 1NARA 1J10A 1GCYA 1Q6CA 3WSUA 4Q7NA 5CQ1A 5FCZA 5LYRA 2VOTA 1JZ6A 2PWDA 1P6WA 2ZXAA 2A3CA 1NOWA 3EDDA 5FOOA 1TFVA 4M8UA 5DF0A 2DIJA 3WQ8A 4RE4A 4E4PA 4EE9A 1LF1A 1WP6A 4P7OA 3B8SA 1BAGA 1OGGA 3WEZA 5C71A 4P7LA 1QBBA 5AYIA 4D6JA 4B16A 5A6MA 1US3A 4YHEA 2WKLA 3ARXA 2ZUVA 4U5KA 1E1FA 1OWQA 5F7UA 1H0IA 4AD0A 5DO8A 3W37A 4CCCA 3GDBA 3WFLA 1TMQA 2QMJA 4ATLA 3NDZA 4MB4A 1L8NA 2X0HA 3L4XA 3T2QA 3VX0A 5M17A 4CGTA 1VRXA 1UZ4A 4XUYA 1E3XA 4C7DA 1V03A 3NSMA 1XD1A 1HKJA 1UKSA 4UFKA 4PMVA 5A3HA 1B1YA 1CLVA 3UG4A 5BXSA 3WH8A 1OBAA 2ZX9A 1TR1A 2GJXA 1GOIA 2GDVA 1GQIA 1PPIA 5HOSA 3UESA 2XIIA 4AYSA 1H5VA 4HU0A 3VIGA 3LPFA 1G9HA 5A6LA 5FD0A 2JF6A 1J0HA 4JL1A 1Y7VA 5CPTA 3T0BA 4CKQA 3NSNA 1ODUA 4H2CA 3GZAA 3ALGA 3B9DA 1CEOA 3MU7A 3AIWA 4WKAA 3GM8A 3A47A 3AQUA 3CHDA 2WMIB 1DHKA 3GXMA 3FHQA 4DWSD 1M7XA 2YOCA 3D3AA 4HMEA 1NH6A 2YKKA 2OWXA 2F2HA 4RE2A 1GVIA 1K9EA 2J8GA 1GPFA 4KRUA 1JZ2A 5FL0A 1GOOA 1TE1A 2CBUA 4S3JA 1B3XA 3ZT5A 3GH7A 2AOSA 1KBBA 4BA0A 4MDPA 3K4AA 4AZGA 4W7VA 1QBAA 3W26A 4UFJA 2DT1A 4AIEA 1XH1A 3W6LA 4HP5A 4PSRA 5CJ5A 5E6YA 3SCPA 4TX8A 3BLPX 5CLTA 1FFRA 1EH9A 3KL3A 4FLQA 3SCUA 3PZVA 1CECA 2WVVB 3AHTA 4MPKA 2J62A 3MSGA 1WE5A 2MANA 2WVSA 2J7HA 4PMZA 4WKFA 2O9PA 1PAMA 2DSZA 4U2YA 1DWGM 2W66A 2W61A 2QPUA 1V3IA 2DH2A 2Y8KA 1ZJBA 2NW0A 1NWUA 4OJYA 5A6BD 1QW8A 4D6FA 3PZOA 4PYSA 4BZYA 2CHNA 4TTUA 1RH9A 3CIVA 2WSKA 4W8AA 2BY2A 2OSWA 1XC6A 1UD3A 3AMLA 3OB8A 2WB5A 4F8XA 2E9BA 5CZKA 2EXOA 3WNOA 3N17A 3VGBA 3CUIA 3OZOA 3VO0A 1XSJA 4Q22A 1W2PA 5A95A 3ARZA 1J9YA 4EKJA 1R7AA 4JIEA 1ZS2A 1JGIA 1UWQA 4GZJA 1HJUA 5D8ZA 5D9MA 1UQYA 4OOUA 3GH4A 1B3ZA 1VFOA 1EHNA 1E3ZA 4D6IA 3UCQA 2VUYA 3AXXA 4GI9A 1MFUA 4RE3A 1B31A 1H09A 2IUZA 2XYLA 1EQPA 2O92A 1YHTA 1G0CA 1SMAA 2FH8A 3VX1A 1E6NA 2YL5A 2YDSA 4AISA 4P8WA 2BNJA 4FK9A 8A3HA 1WCGA 1ISVA 3SCNA 3OGSA 3WY1A 5JBFA 3ZJ8A 1FHDA 3EMQA 3TTSA 3WEOA 3HMCA 4JCMA 2WCSA 3VIMA 1SFSA 1EHAA 2ZUSA 5IHSA 3GYCA 4C91A 1E56A 1ZL1A 3WFZA 1ZU8A 1NP0A 1MVYA 1BLIA 3DHUA 1UD5A 2VCBA 4UTFA 4UFHA 1WZAA 1HKMA 5EB8A 3SIMA 4AIUA 4P8VA 2Y4SA 3NIYA 4OUEA 1AVAA 4D6EA 4GQRA 1VB9A 1BVNP 4FLOA 4HZ6A 4X9YA 4DM1A 2JEPA 1UR4A 4PMOA 3K8MA 2D0HA 2VRKA 1O6IA 1W3HA 2J78A 2ZWZA 4N42A 2BVYA 3VTRA 1C3FA 4AXNA 3AIRA 1JXJA 2E8ZA 3VGDA 2WC4A 1JDCA 3WQ4A 1W91A 4TVDA 3PZIA 4A4AA 3MUZ1 1JD7A 3WNKA 4E2OA 3W81A 3WDHA 5HPOA 1J0KA 3WEMA 3GNRA 1W9UA 2V3EA 5D9PA 1L0PA 2DSVA 3J7HA 3K4DA 4PMYA 1PZ3A 1CNVA 1HVQA 2IXUA 2G3MA 3OLDA 3ECQA 2F8QA 2WLZA 5CPSA 3BSHA 3UR8A 3VM7A 2VZUA 4FLRA 5E6ZA 1AQ0A 3SUWA 1JL8A 2VURA 1C91A 1UA3A 2OSYA 1ISWA 1MXDA 1UHVA 4ZE5A 1UQZA 5CXPA 1JZ3A 3ZSTA 3WDPP 3ZIZA 2ZUMA 3VDCA 5HNNA 2EPNA 1QI4A 1W1YA 1UWUA 1QVBA 4Z2IA 1B90A 1XYFA 1HT6A 4NRRA 3W0KA 1FA2A 4JFSA 4FLSA 2A3HA 4OZOA 3CHEA 5GNXA 1HJWA 1K9FA 1XHGA 1E4MM 1I1WA 4J3UA 4AD1A 3SCQA 3TTQA 3HN3A 3GXDA 4OKDA 3VILA 3SUTA 5A6AA 1KBKA 4XZBA 5HXMA 1GONA 4JHOA 2PWFA 2CERA 1HIZA 1BSIA 2JF7A 4GO9A 4QCFA 3OA5A 2CBIA 3BXWA 1EO5A 2Y8VA 3FAWA 3S2CA 2XVKA 1ECEA 1VEPA 2WMHA 1EDQA 3RM8A 2PB1A 2WLYA 1V3KA 2WW5A 3TA9A 1CYGA 3RM9A 2V5CA 1UA7A 2D3NA 6TAAA 2BY0A 1BYAA 2WZHA 3N15A 4OOZA 1JG9A 1QNPA 2QLYA 2GJXB 3VD5A 5A69A 3UG3A 2CEQA 4L4PA 4UZSA 2YJQA 3GH5A 1KB3A 1G1YA 1CDGA 4H8VA 2DQXA 2WK2A 3BCFA 2PWGA 1CXFA 3SCVA 1C8XA 2DIEA 3GNPA 1DWHM 1V6VA 5A8QA 1V6YA 2JE8A 3BAYA 5BCAA 1WZMA 4UQDA 3AYRA 1GUVA 5FIPA 1BTCA 3II1A 4UQEA 4GQQA 1HXJA 3RMEA 1UR8A 3APGA 1CXEA 1TVNA 5C70A 4EAMA 5CPQA 1OIMA 3THCA 2V38A 2WWCA 3CUJA 1BGAA 4AD3A 2UY2A 1OT2A 2OWWA 2GUYA 1F4HA 3AIUA 4J27A 5FKYA 4C7GA 9CGTA 3W82A 3WF0A 2ESCA 4JKLA 1QI5A 1H49A 3W6MA 1CZ1A 5A2CA 3ARPA 2D20A 3EDKA 4WF7A 2X1IA 3TOPA 4HOWA 1UZ1A 4QLLA 4GZIA 1GHSA 1K9TA 4NI3A 3BCDA 1UKTA 1FH9A 2BXYA 3OLIA 3CBWA 3ZJ7A 3WD0A 1E0WA 4XV0A 4AW7A 2BHYA 4PCTA 1LWHA 3UG5A 1V3HA 4DM2A 1UKOA 3B9EA 4AZBA 4HZ8A 3IAQA 3T0DA 2VRJA 4MDOA 4WSJA 1ZBKA 5LA1A 4ZXOA 4U3CA 1XCXA 1UR1A 4GIAA 5M5DA 2CNCA 3I3DA 4AWEA 4IPNB 1ISZA 3PZQA 4GI6A 2WAGA 1MQRA 4GI8A 2Y2WA 4JZ5A 2WHMA 2VQUA 3VNZA 1GNXA 1V6WA 3LMYA 1V08A 3VM5A 3AMKA 1JFXA 4J7RA 1ZB5A 2NT1A 3BAXA 4AZCB 1WDRA 1FP8A 2ZE0A 1JAKA 4F66A 3AHZA 3W28A 2RGMA 1VFMA 4AD4A 4W86A 1E43A 4J3TA 3LPPA 2NSXA 3BMWA 4QDMA 4ZXLA 2J75A 3CUHA 1E1EA 2WHJA 5HBFA 2DSUA 3A4XA 2DGAA 3PN8A 2DDXA 4HZ7A 3ALFA 3A4AA 1OIFA 1OCQA 4V27A 4LX4A 3SCTA 2C7FA 2G41A 4PTXA 3FY1A 2WM0A 5A8NA 1JFHA 3N1AA 3ZOAA 3W38A 3AICA 2J7GA 1KXTA 4P7NA 2GJPA 4LQ1A 1KGXA 3AROA 3WH5A 1WNOA 4R5EA 1J01A 2J4GA 4WKHA 3F5KA 3ARUA 4B3LA 1AQHA 3AMDA 1PJ9A 2Y24A 5BXRA 4AZIA 1E4NA 3ZQ9A 3K46A 2O9RA 3W29A 1TG7A 3AHVA 1KR0A 4U3AA 3MO4A 1QHZA 2W67A 4PMRA 4RL3A 3WF2A 1NWTA 2ZX8A 3WKZA 3VIOA 1WB0A 6A3HA 3UERA 5D9OA 3AISA 3QHOA 4J3WA 2B31A 2W63A 2C8NA 1E6RA 3UETA 1GOQA 1OGSA 2BFGA 2J7BA 4W8BA 1H0GA 4NSBA 3WBAA 1JI2A 4CCDA 2XM1A 5EBAA 2GK1B 1UWSA 3NUKA 2ZX7A 5A2AA 2X09A 4CD5A 4D6DA 4YPJA 4Y7EA 3AS1A 5AC5A 2WPGA 1BG4A 2D23A 5BWFA 1R8LA 3OLGA 2YBUA 3F5JA 4URIA 3WNNA 2VO5A 1JI1A 4HOXA 3ZR6A 2J7CA 3DC0A 5E09A 3PTQA 3DECA 1J0IA 2Y5EA 2ZX6A 1KCKA 2G4FA 1HX0A 1M03A 1BGGA 2WANA 4X0NA 3DYOA 1K6AA 1QHPA 5A2BA 2E9LA 2VX5A 4PTVA 1E71M 1HNYA 4DWSA 2WSPA 3WDQA 3WN6A 3WQVA 2PWEA 3ARTA 3RILA 4WK9A 1WDPA 4KGLA 1MW3A 3QOKA 4MB1A 3SCSA 2WVUA 1FOBA 1W9XA 1B3WA 1E4IA 2QF8A 3VIHA 2BS9A 4CN6A 3BAIA 1OINA 1UD8A 3WMSA 3LPGA 3M07A 5CSUA 4JL2A 4ML4A 1Z32X 2WMKA 4AC1X 1W3KA 4AZHA 2DSKA 2PBGA 2DH3A 3L4VA 5I24A 3KL5A 2XTKA 1UOKA 2Q8XA 2CCRA 2YA1A 3EDEA 3NDYA 4W5ZA 3VMNA 4Z2GA 2D0FA 3WL1A 1OT1A 2AAAA 1RP8A 1JF5A 3U7BA 3CPUA 1VFFA 5A6BA 1MW1A 2BXZA 2UWFA 3L2MA 1F4AA 4E8DA 2VZSA 1DEDA 5E9AA 3K8KA 3VINA 1RP9A 3BAKA 1C93A 2XG9A 3RIKA 2BY3A 4CU6A 1BF2A 1LWJA 1JDAA 1O7AA 4D72A 2DEPA 2O9OA 1VJZA 3OGVA 4QCEA 5JIPA 4PUDA 5I6SA 1KGWA 5ABFA 3KL0A 5M3WA 3BC9A 3AZTA 1GOWA 1BPLB 1WZLA 5D8WA 1QI2A 4CVWA 1M53A 2J7DA 3OZPA 5A6SA 4AZ5A 1UH2A 1TCMA 5AYBA 3AHYA 3AS2A 3VNYA 1LJYA 1WDSA 3KWXA 3O9NA 1R7OA 4GXPA 1H2JA 4GPNA 2XVPA 1E6ZA 3PZGA 4ZEPA 4UNIA 3HU7A 1V0LA 4QAWA 4UOJA 2J77A 4V2XA 1UWRA 1LL7A 4UZUA 5A1AA 1TUXA 2ZOXA 4ZENA 2EPOA 1IV8A 5IHRA 5LA0A 3AIVA 2OWCA 1HL8A 1R86A 3PBGA 1EA9C 2F61A 1PIFA 4W88A 4UR9A 3W24A 2OLHA 2ZXDA 3WENA 1UG6A 4Z2LA 2VT0A 3WBEA 3ZM8A 3QR3A 2WCGA 1UR0A 1KWKA 3AIBA 3TTOA 4TVCA 2XFFA 7CGTA 3AMGA 2VNCA 1EQCA 1VJSA 4MB3A 2WHKA 4GINA 4KWUA 4DUWA 1V3MA 1VFUA 3EDJA 5D4YA 3WMCA 1I75A 3ARRA 2E0PA 4P8UA 1BHGA 2EPKX 1QNOA 4AMCA 3U7VA 4HOZA 2VZVA 1H41A 4D6HA 1EIBA 3AI0A 3N04A 5KZ6A 4CD7A 4PMNA 3SCWA 1R85A 1KWGA 1FFQA 1PZ2A 1J0ZA 4ACZA 3GBEA 3CZ8A 1E15A 4M24A 3MV01 1U33A 1WZKA 4F79A 1KXQA 1W3LA 1UR2A 2CESA 3PTKA 5CGTA 2XFRA 3AOFA 3WD1A 5I2UA 4X0VA 5I3DA 1N82A 1AMYA 2ZUWA 1MXGA 3L4WA 3PZ9A 2EBNA 1W9VA 2PBOA 4MAZA 1LQ0A 4EANA 5A6KA 1W32A 1CGTA 2XGIA 4C7FA 4MB5A 2PWHA 2E40A 1UH3A 2XFYA 3E1F1 4JAWA 1ZBCA 2DT2A 3ARQA 3BAWA 1ISYA 1UD6A 3MUIA 1AQMA 2GJRA 4GKLA 3PZTA 2WWDA 2WMIA 2FH6A 3AMCA 2EPMX 1HN1A 3U5YA 4AIOA 4M29A 4DUVA 1V6UA 3CGTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1HJV A;  1PBG A;  2DT0 A;  1GJU A;  3SCR A;  4PEE A;  1NWS A;  1MW0 A;  1E40 A;  3CZL A;  1C90 A;  1MFV A;  4K68 A;  1UWT A;  1JZ8 A;  1EGZ A;  1HJX A;  3G6M A;  3NSX A;  4BQ2 A;  1CPU A;  1ZBW A;  2WMF A;  3WDR A;  2X2Y A;  2CKS A;  2OYL A;  4W93 A;  4S3K A;  3N13 A;  3MMW A;  4PBG A;  3VD3 A;  4HTY A;  2JIW A;  1W3J A;  2X05 A;  2XSB A;  4CN4 A;  3RJY A;  3VIF A;  4M56 A;  1XCW A;  3W4R A;  4PRW A;  1H3G A;  4CUC A;  3VDA A;  1KQY A;  3DHP A;  4UOZ A;  4IPL A;  4ZE4 A;  4PSP A;  2QHA A;  4CD6 A;  1V0M A;  1HP4 A;  2JIE A;  4GZE A;  4UCF A;  1G94 A;  2V5D A;  1GHR A;  2ZUN A;  3GBD A;  5EFF A;  3CZJ A;  1HF6 A;  4B15 A;  1OB0 A;  3WQW A;  1JZ5 A;  3AJ7 A;  2DPE A;  1NAR A;  1J10 A;  1GCY A;  1Q6C A;  3WSU A;  4Q7N A;  5CQ1 A;  5FCZ A;  5LYR A;  2VOT A;  1JZ6 A;  2PWD A;  1P6W A;  2ZXA A;  2A3C A;  1NOW A;  3EDD A;  5FOO A;  1TFV A;  4M8U A;  5DF0 A;  2DIJ A;  3WQ8 A;  4RE4 A;  4E4P A;  4EE9 A;  1LF1 A;  1WP6 A;  4P7O A;  3B8S A;  1BAG A;  1OGG A;  3WEZ A;  5C71 A;  4P7L A;  1QBB A;  5AYI A; 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