2WHLA

Understanding how diverse mannanases recognise heterogeneous substrates
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
294
structure length
294
Chain Sequence
GFSVDGNTLYDANGQPFVMRGINHGHAWYKDTASTAIPAIAEQGANTIRIVLSDGGQWEKDDIDTIREVIELAEQNKMVAVVEVHDATGRDSRSDLNRAVDYWIEMKDALIGKEDTVIINIANEWYGSWDGSAWADGYIDVIPKLRDAGLTHTLMVDAAGWGQYPQSIHDYGQDVFNADPLKNTMFSIHMYEYAGGDANTVRSNIDRVIDQDLALVIGEFGHRHTDVDEDTILSYSEETGTGWLAWSWKGNSTSWDYLDLSEDWAGQHLTDWGNRIVHGADGLQETSKPSTVFT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-MANNANASE
publication title Understanding How Diverse -Mannanases Recognise Heterogeneous Substrates.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 127
structure length 294
sequence length 294
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2whlA00
1VFOA 2BY1A 1W1PA 4KGLA 3AS2A 3GM8A 4PN2A 1DTUA 3PN8A 2D2OA 3ZJ8A 3U7BA 4AC1X 3OLGA 4TTUA 2CETA 2J78A 2D22A 5FKYA 5A3HA 5I6SA 4BQ2A 4DUVA 5CPSA 3VDBA 1V3MA 3WF4A 3WH9A 1VRXA 5A6AA 2VNCA 2PI6A 1E6ZA 4M80A 2O9TA 1KXTA 2XJ7A 4BQ3A 3MUIA 1Q6CA 4OOZA 3VD3A 5JIWA 2XVPA 4XZWA 1FFQA 1LG2A 3QOKA 1MFVA 1CXIA 3MO4A 1I1WA 1JZ3A 4H04A 5EBAA 1B31A 1XD1A 1V03A 1BYBA 1QVBA 1R8LA 1G5AA 5D4YA 2J7HA 3CMGA 4DM2A 2BXZA 1PPIA 2WSKA 1DWGM 1JG9A 3B8SA 3T0AA 4JZ5A 2X09A 1HIZA 4HA3A 2J7GA 4OIFA 1KQZA 2DPEA 1UWRA 1DP0A 5E09A 1JZ4A 1ISVA 3NDZA 4IUGA 2DSWA 3U5YA 3SUVA 3ARQA 3RCNA 5ABHA 2E9BA 1O7AA 1W9VA 4HZ7A 3RM4A 1JD9A 2ZUMA 1R85A 1B3ZA 3WDIA 4J27A 4C7GA 3GDBA 1GJUA 3WKZA 1CLVA 4GPNA 1ISWA 2J7FA 2A3CA 1WDRA 2VURA 1Q4NX 2F61A 4UFLA 2QF8A 2VT0A 4BCEA 5A69A 1UD6A 3CUGA 2E9MA 4OJYA 3POHA 1HP5A 4V28A 1AQMA 3IANA 3WY1A 3OGRA 1J0IA 4GO9A 4JFUA 3VPLA 4UZUA 1B3WA 3W25A 1P6WA 4CD4A 3T09A 1E1EA 4LXFA 1OGSA 3UCQA 5BCAA 1KWKA 1BG4A 1UKTA 3WNKA 2CCRA 4IPLA 1ITCA 5ABFA 1EDTA 3N1AA 2J77A 4FLSA 1CTNA 4QCFA 1B90A 2IXVA 4NRRA 2OWCA 1PZ2A 4CU8A 5IHRA 3AICA 1HKMA 3VGEA 4DWSA 5M17A 1V08A 2XGBA 1V0KA 4W5ZA 3FAWA 4TX6A 1V3IA 1SFSA 1B0IA 1W3JA 3SUUA 3AJ7A 5A2CA 1UKOA 4DWSD 3AHTA 2XM2A 4D6HA 1CZ1A 2WHMA 3NYDA 2EBNA 4HA1A 3B9DA 1GONA 3F5LA 1UR4A 4D1IA 1OM0A 2PC8A 2NT1A 5E0FA 2WBGA 1KXQA 4PBGA 3G6LA 5FD0A 2W61A 1E71M 4GZJA 3PZIA 1C92A 5BXSA 1WZAA 2ZIDA 4LQ1A 3HN3A 1QNQA 4ATWA 5CSUA 3AMGA 1VEMA 1KXHA 3GNRA 3M46A 2J75A 2VZVA 1JYXA 2XVGA 5E9AA 1HKJA 2OLHA 5CXPA 3GH7A 1K9TA 1XH1A 1XGZA 1KBKA 3WH5A 1G9HA 3NSXA 3WF1A 2VX5A 3GXIA 4BS0A 4PMNA 3BXWA 1FHDA 4B15A 2C7FA 2ZUUA 1FH9A 1QBAA 3D5HA 2XTKA 4ACZB 1E70M 2WVVB 2G3NA 1HJQA 3RPMA 1NARA 2CPUA 4PCTA 1K6AA 3PTMA 1HKKA 2BNJA 1UQYA 3TA9A 4D6EA 2XUCA 2CBIA 1KGXA 1I75A 3KE0A 4HP5A 2OSYA 3EMZA 3SUSA 2WW5A 2XSBA 3OLDA 1UUQA 2WSPA 1V3JA 4UFIA 2DGAA 3L4WA 3LMYA 3T0BA 3SCVA 2VCCA 7A3HA 4W8AA 3OLEA 3MUAA 1Q6DA 3MSGA 3WD4A 4WF7A 3EDKA 1XYZA 3ZJKA 2YIHA 3O9NA 1ZB5A 2Q8XA 2CNCA 3UG5A 3UESA 3N12A 1LJYA 4GKLA 1GHRA 4HU0A 4MAZA 3UR7A 3VIPA 1GOQA 4MADA 1R7AA 1Y7VA 5ECUA 5HPOA 1CXLA 1HP4A 3N9KA 3W81A 3GH5A 1JAEA 1UG6A 3U7VA 1JNEA 3LPGA 4QP0A 2WMJA 4GI6A 3UG4A 1JZ7A 4NF7A 4UOZA 5E0CA 1HXJA 1V6VA 1C90A 5GNYA 4AZ5A 5D8ZA 3ZT7A 5HDRA 1RP9A 2C8NA 4Z2KA 3U57A 1V0MA 1D3CA 3W29A 3WUFA 1J12A 3IJ8A 3VIIA 1JXKA 1OGGA 2UY3A 1KBBA 3APGA 1WNOA 2BV9A 1QI0A 2BVYA 2ZWZA 2CKSA 1J01A 4E4PA 1NWTA 2XWDA 2V38A 3RIKA 3SCUA 3WNLA 1B9ZA 2DEPA 4ACYA 4PSPA 4U33A 5HOSA 1CGVA 1IZJA 4V2XA 1OT2A 1MWOA 4MNLA 2YA0A 2WNWA 1JF6A 4CN1A 2ZX9A 3M7SA 3PTKA 1DEDA 3NCOA 4AYSA 1LWJA 5EB8A 2EO7A 1FA2A 4AZGA 1UKSA 1MXGA 1BPLB 1NWSA 2O9OA 4UQAA 4PMZA 5A6SA 1MQQA 4CD7A 3BCFA 1PX4A 4CCDA 4FLRA 4ZE5A 1O6IA 2G3MA 2Y8VA 2Y4SA 2ZWYA 3EYPA 3O6AA 2WK2A 3AHYA 1AVAA 5I78A 1KR0A 1HT6A 2VZUA 2DT0A 3N15A 2X2YA 2WYSA 5E6ZA 3VKKA 5IFTA 1PX3A 1M04A 1PBGA 3NJ3A 5I79A 1W3KA 1VF8A 2W63A 3L4YA 4AZBA 1VENA 7TAAA 1LQ0A 1GOIA 3WELA 4JKMA 4PTWA 3CLWA 2WMFA 2UY5A 3VUPA 5FL1A 1W1VA 2WKLA 3OBAA 4PMVA 1ZBKA 3WH6A 4AIEA 2PWGA 2YL9A 1UR0A 1NP0A 3WL0A 1H0IA 1Q6FA 4PUDA 3MUZ1 2OSXA 1JZ2A 4AD4A 1CGTA 3AROA 1NWUA 4TOQA 1TVNA 4UFHA 3VILA 4A3HA 4M56A 5A6MA 3VD7A 1JI1A 1HJUA 2VX7A 4J3UA 4HU8A 1UOKA 1V02E 4D72A 4JFVA 3K1DA 3VD5A 2WMIA 1C8YA 4JCMA 2GDUA 3CZGA 5A6BA 2DSVA 2MANA 5A6JA 4WKHA 8CGTA 4FLOA 1JI2A 5TD4A 2VUYA 4UNIA 1EQCA 3AIEA 3WQVA 4PYSA 3VD4A 3VVGA 1HJSA 3W26A 3WBEA 1H09A 4N42A 1CEOA 4ZENA 4UOJA 4UR9A 1EH9A 5A6BD 1U30A 3BAXA 2UY2A 3CZ8A 4YHEA 4ATDA 1XYFA 1HKIA 3VDAA 4AD5A 2WWCA 1E4MM 3AMKA 3TOPA 4DM1A 4B9ZA 4YPJA 2QHAA 5JIPA 2WANA 1JFXA 1UH4A 2A3BA 5A8PA 1DWFM 4OKDA 3ZIZA 1CENA 1V3HA 5IXEA 1JDAA 1L0PA 2CXGA 2JIWA 1JYWA 3W53A 1GCYA 2OYKA 3TTYA 2V3DA 2WXDM 4TX8A 4WLCA 1LWHA 4BQ5A 3L2MA 1B3XA 4AEFA 1C8QA 1H1NA 3RM8A 1OSEA 3D3AA 1EQPA 3WH7A 5CPTA 1LL7A 5BXRA 4PMXA 3N17A 3VMOA 4AZHA 1QNRA 3BSHA 2ZUWA 3RM9A 1EO7A 2GK1A 1J0JA 3PZTA 1GHSA 2WZIA 2D23A 3AHZA 3AS3A 5AY7A 4BF7A 3SURA 1QBBA 1BLIA 4W5UA 2F8QA 1AMYA 4UOQA 3WD3A 4UFKA 2ZX6A 4WKFA 2DT1A 4U3CA 2WHJA 5EFDA 2WKGA 3WQ4A 2J7EA 1H5VA 1DHKA 1HJWA 3WDJA 3DYPA 3HJEA 1NQ6A 4JFTA 2YJQA 3JUGA 1R87A 4QLJA 2WVUA 3II1A 3L4VA 4F8XA 2XG9A 4J3SA 1E1FA 5CQ1A 2ZOXA 2X8RA 1XH2A 1RPKA 1QI4A 2JEPA 1WP6A 5BXPA 4PEEA 3MS8A 4QDMA 2Y8KA 5A6LA 2ZUTA 1W32A 3VIMA 2Z1SA 3WNNA 2ZXAA 2G4FA 4B9YA 1OGBA 2X05A 4WKAA 4RE2A 1W9PA 2FHCA 3AS0A 4W86A 4R5EA 4CD8A 3CUHA 4QAWA 3KL5A 2A3HA 4GI8A 2WM0A 3WFZA 3BMWA 1WO2A 5I2UA 3ZSSA 4MPKA 2EPNA 4DUXA 3S6TA 2UWFA 4BQ4A 1XRVA 2D24A 1TA3B 1NM9A 1CNVA 3K46A 2WCSA 5AYBA 2W5FA 3CHCA 3AQUA 1BHGA 1QHPA 2XFFA 3BLPX 2VZSA 1GUVA 1UWTA 2BFGA 4BA0A 4TVUA 3MV11 4PSRA 5A8OA 3AMLA 1E40A 3ALGA 3CZJA 5F7UA 3IAPA 1MW2A 2W66A 5JUVA 3DHUA 4WJXA 3VIKA 1WE5A 3MU7A 3ZT5A 3SCPA 1US2A 4UQBA 5ABEA 3HU7A 1E9LA 2CBVA 2XIIA 1US3A 4AZIA 4PMDA 2XHYA 4M82A 4URIA 3LPOA 1BF2A 3AIBA 4F9JA 1ITXA 1CBGA 3ECQA 3KL0A 3QGVA 1GNXA 2WZEA 2VI0A 2D1ZA 1Q6EA 2GVYA 3F5KA 3EDDA 1PZ3A 1VIWA 2J62A 2VQUA 3RDKA 4D6CA 2V3FA 4RE3A 1KR1A 4D6FA 4PMUA 2OSWA 1B1YA 4Z2JA 2XPKA 1R86A 3OZPA 3B9AA 5IHSA 2GJPA 3WN6A 4DWSB 3OGVA 1S46A 4GINA 5HXMA 1VEPA 1V6WA 3AZSA 4D71A 3F5JA 3WMSA 1UD5A 1CLXA 1IZKA 3AIRA 2XVLA 3AI0A 2WAGA 3CO4A 2EQDA 3ARSA 3L4UA 1CDGA 5BRQA 1PJ9A 3PZ9A 1W91A 2J47A 1DWJM 1M03A 1TE1A 4GI9A 4UTFA 1ZBVA 2BY2A 1FFRA 4CD6A 3KZSA 4YHGA 2ZXQA 4HMDA 1KGWA 2VCAA 1V3KA 4UQCA 1E56A 2GJXB 2DT2A 3AFBA 2AMGA 3L4TA 3WNOA 4W7WA 4OBRA 5DFAA 2CHOA 4E8DA 1BQCA 2WHLA 4U5KA 1HF6A 1PIFA 1OCQA 3ARYA 5HBFA 1JYNA 4KRTA 2BS9A 1QI3A 4JHZA 4M81A 1CXFA 5A8MA 3OA5A 3CHFA 3AISA 2B31A 1UH3A 1BGAA 3VNZA 3BMVA 3KWXA 4R27A 4UQ9A 5FIPA 5KZ6A 1DWHM 1H2JA 4KGJA 3CHEA 4KRUA 6A3HA 1EOKA 3GTNA 1CYGA 2ZXBA 4OUEA 1H4PA 3MV01 3ARRA 3W6LA 1KWGA 4AIOA 3A6OA 4ACZA 1CXEA 1K9EA 2WVVA 2VR5A 3ARTA 4NSBA 3AIQA 1QOXA 2Y24A 4AD3A 1JZ8A 1VB9A 1JIBA 1SYTA 3TTSA 1F4HA 4M1RA 3ZR6A 1A47A 3W4RA 1QNSA 2OYLA 5M3WA 4WSJA 1TCMA 3FHQA 3VGBA 1UHVA 3BAIA 4W87A 5GPRA 3SIMA 3FY1A 3OGSA 4NRSA 1VFMA 1W9XA 1H49A 2D0HA 4FMVA 3N18A 1E4LA 1OD0A 4KH2A 3I3DA 4M24A 2XFRA 5LA2A 2E8ZA 4DUWA 4AISA 2VOTA 5FL0A 4KWUA 1JNDA 1LLOA 2TAAA 2VL4A 1UR8A 3TP4A 1JFHA 4PMQA 3PHAA 1MYRA 2CHNA 2JF7A 3WMBA 4EE9A 1JZ6A 1UD8A 2NW0A 4M29A 1VBUA 3BSGA 3L2LA 3VDHA 1W9BM 2QV4A 3WDPP 3VIGA 3ZR5A 1HL8A 5JBDA 4RL3A 3DHPA 1H3GA 3K8LA 3A47A 3WD0A 4D6IA 2WPGA 1J0KA 2W4XA 4PMOA 2WVSA 3VTRA 2DSUA 5A6KA 1SMAA 3PZUA 3BC9A 2D0GA 1WZMA 4H8UA 1UWIA 1UR9A 4AZCB 3EDEA 3ARXA 1TR1A 5E70A 2W91A 1EXPA 4Z2IA 1NOWA 2FH8A 1H11A 1UR1A 2EXOA 1KB3A 2A3AA 4ML4A 4B3KA 5A2BA 1NOUA 1XCWA 4W8BA 3ZJ6A 1ISXA 2EPMX 3RILA 1QI2A 3VX1A 3B9EA 3CHDA 1VBRA 1E4IA 4Z2HA 2XM1A 6CGTA 4H8HA 1UR2A 4M8UA 1EHNA 5CG0A 3VGFA 4GXPA 2DH3A 2BHUA 3AIWA 3TTQA 2VRQA 5I3DA 4XX6A 2WZHA 1JF5A 3EDFA 5I5RA 2XSAA 3AMDA 3QOMA 1GQLA 2E0PA 4HOZA 2X0YA 3MMUA 3SCQA 5LA1A 4MAVA 3W82A 4HZ6A 3WEZA 2VRKA 1BVZA 2RGLA 2QMKA 5AC5A 4W88A 1ZJBA 2J8GA 1UWUA 1HJXA 3WNPA 3AIUA 3PZGA 2FHBA 2ZE0A 4W8LA 3RJYA 1WZLA 1BYDA 4LGXA 1XSIA 4JCLA 3ZSTA 4UZSA 5DMYA 1CGXA 1JZ5A 1UD2A 4HPGA 3ZOAA 1ZL1A 1JYVA 2YOCA 3FNDA 1W9DM 1CIUA 3WD1A 3MMWA 1TZ7A 3WDQA 2BHYA 4HMCA 3FAXA 5A8NA 3OB8A 3I3BA 1GOKA 5DT7A 3ALFA 1CXHA 3I3EA 2Y2WA 3A3HA 1UA7A 4P8XA 3PTQA 4P8WA 5E6YA 1QW9A 3NIYA 3GNOA 2UY4A 5C70A 4A4AA 1JGIA 3FN9A 4AY1A 2E3ZA 1V6UA 1K9FA 3T2OA 4PUEA 3MKKA 3AXIA 1OIMA 4LX4A 4N0RA 2GDVA 4H2CA 1G01A 1N82A 5GNZA 1J11A 1VFFA 4AD0A 3GXMA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VFO A;  2BY1 A;  1W1P A;  4KGL A;  3AS2 A;  3GM8 A;  4PN2 A;  1DTU A;  3PN8 A;  2D2O A;  3ZJ8 A;  3U7B A;  4AC1 X;  3OLG A;  4TTU A;  2CET A;  2J78 A;  2D22 A;  5FKY A;  5A3H A;  5I6S A;  4BQ2 A;  4DUV A;  5CPS A;  3VDB A;  1V3M A;  3WF4 A;  3WH9 A;  1VRX A;  5A6A A;  2VNC A;  2PI6 A;  1E6Z A;  4M80 A;  2O9T A;  1KXT A;  2XJ7 A;  4BQ3 A;  3MUI A;  1Q6C A;  4OOZ A;  3VD3 A;  5JIW A;  2XVP A;  4XZW A;  1FFQ A;  1LG2 A;  3QOK A;  1MFV A;  1CXI A;  3MO4 A;  1I1W A;  1JZ3 A;  4H04 A;  5EBA A;  1B31 A;  1XD1 A;  1V03 A;  1BYB A;  1QVB A;  1R8L A;  1G5A A;  5D4Y A;  2J7H A;  3CMG A;  4DM2 A;  2BXZ A;  1PPI A;  2WSK A;  1DWG M;  1JG9 A;  3B8S A;  3T0A A;  4JZ5 A;  2X09 A;  1HIZ A;  4HA3 A;  2J7G A;  4OIF A;  1KQZ A;  2DPE A;  1UWR A;  1DP0 A;  5E09 A;  1JZ4 A;  1ISV A;  3NDZ A;  4IUG A;  2DSW A;  3U5Y A;  3SUV A;  3ARQ A;  3RCN A;  5ABH A;  2E9B A;  1O7A A;  1W9V A;  4HZ7 A;  3RM4 A;  1JD9 A;  2ZUM A;  1R85 A;  1B3Z A;  3WDI A;  4J27 A;  4C7G A;  3GDB A;  1GJU A;  3WKZ A;  1CLV A;  4GPN A;  1ISW A; 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 5IFT A;  1PX3 A;  1M04 A;  1PBG A;  3NJ3 A;  5I79 A;  1W3K A;  1VF8 A;  2W63 A;  3L4Y A;  4AZB A;  1VEN A;  7TAA A;  1LQ0 A;  1GOI A;  3WEL A;  4JKM A;  4PTW A;  3CLW A;  2WMF A;  2UY5 A;  3VUP A;  5FL1 A;  1W1V A;  2WKL A;  3OBA A;  4PMV A;  1ZBK A;  3WH6 A;  4AIE A;  2PWG A;  2YL9 A;  1UR0 A;  1NP0 A;  3WL0 A;  1H0I A;  1Q6F A;  4PUD A;  3MUZ 1;  2OSX A;  1JZ2 A;  4AD4 A;  1CGT A;  3ARO A;  1NWU A;  4TOQ A;  1TVN A;  4UFH A;  3VIL A;  4A3H A;  4M56 A;  5A6M A;  3VD7 A;  1JI1 A;  1HJU A;  2VX7 A;  4J3U A;  4HU8 A;  1UOK A;  1V02 E;  4D72 A;  4JFV A;  3K1D A;  3VD5 A;  2WMI A;  1C8Y A;  4JCM A;  2GDU A;  3CZG A;  5A6B A;  2DSV A;  2MAN A;  5A6J A;  4WKH A;  8CGT A;  4FLO A;  1JI2 A;  5TD4 A;  2VUY A;  4UNI A;  1EQC A;  3AIE A;  3WQV A;  4PYS A;  3VD4 A;  3VVG A;  1HJS A;  3W26 A;  3WBE A;  1H09 A;  4N42 A;  1CEO A;  4ZEN A;  4UOJ A;  4UR9 A;  1EH9 A;  5A6B D;  1U30 A;  3BAX A;  2UY2 A;  3CZ8 A;  4YHE A;  4ATD A;  1XYF A;  1HKI A;  3VDA A;  4AD5 A;  2WWC A;  1E4M M;  3AMK A;  3TOP A;  4DM1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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