2WMRA

Crystal structure of checkpoint kinase 1 (chk1) in complex with inhibitors
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
264
structure length
254
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
publication title Identification of Inhibitors of Checkpoint Kinase 1 Through Template Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 254
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wmrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wmrA01
1Q41A 4W8DA 4EQCA 4FIJA 2GS6A 4U81A 4BGHA 1WAKA 4QMSA 3P79A 4CZUA 2R3GA 2VTTA 3BBTB 5ACKA 5CEKA 3QQKA 3W1FA 4XJ0A 4ZXTA 4NFNA 1CM8A 4V0GB 2R64A 5CU6A 3WILA 2XKEA 3GC8A 4ASXA 4FX3A 2YERA 3Q04A 2GQRA 4FTJA 3OEZA 3VN9A 3QRIA 3O8UA 4HW7A 4CMOA 5LWNA 3KK8A 3QLGA 3UMXA 3DAKA 5IZFA 4CRLA 4NW5A 3GCPA 2BALA 3P5KA 2XNEA 3KREA 5AR4A 4TNBA 3SX9A 3WYXA 4N6YA 4AOJA 1W84A 1WVYA 1QPJA 3CJGA 4WRGA 4BZNA 3BGPA 4TT7A 4GU6A 3VUDA 4EOQA 3TEIA 3UQCA 3EFLA 2XMYA 3FI3A 4KBAA 4WT6A 2W1FA 2Y9QA 3PE2A 4UYAA 4CLIA 2XK9A 3V5JA 4QTBA 3V5PA 1NVQA 3D5VA 4IX3A 3EN9A 3TJDA 3V3VA 4L6QA 4QMUA 3PG1A 3SOAA 5F9EA 2JFMA 3CS9A 3VF8A 4O2ZA 2VO6A 3LLTA 4P5ZA 5M51A 3QD3A 4YZ9A 4U80A 4G1WA 2VNWA 3WZKA 3QZFA 3ANQA 2YIXA 3NMUF 2XK3A 3POOA 3ZDIA 2PUUA 4MXOA 4I41A 5DIAA 3TKHA 5JRSA 4O0RA 3RVGA 4C3PA 3OOGA 1GIIA 4ZZNA 1YHWA 2QOCA 4KNBA 2FGIA 3RWQA 4PY1A 2PSQA 4FOBA 5KMIA 3TCPA 2BIYA 3F6XA 3NVKI 4GU9A 4O7NA 5JT2A 5L2TA 2QCSA 4D5KA 2VZ6A 4AOIA 4EYJA 4DA5A 2ITTA 1UV5A 2A0CX 2B9HA 4JX3A 4L8MA 2O3PA 3ALNA 3DBDA 4F09A 5M4UA 3ZS5A 3WE8A 3UP7A 4BHNA 3HMPA 4ZTQA 4EOSA 4RFZA 3FZRA 5CWZA 2IVVA 3TUCA 1OM1A 5HBHA 3F3ZA 2PUPA 5BPYA 3D83A 4O86A 3MIYA 4WBOA 5DR6A 2CMWA 4E5WA 1J7LA 5AAEA 3QRKA 4YMJA 3ORTA 3U8WA 2BHHA 5K4IA 3HMNA 4MXXA 4AN2A 4XG7A 1CKJA 3NCGA 4DG3E 1GNGA 2KULA 2BTRA 2JDVA 2JDRA 2W1DA 3VHEA 1XH6A 4CT1A 1TQPA 2ITZA 5FXSA 5EQEA 3DOGA 2BVAA 3GU4A 4FSUA 5HG9A 4O0WA 5JGAA 1PXIA 4JNWA 4EH2A 3PY0A 3EH9A 2ETMA 2B9FA 2OIQA 5CNNA 4XP0A 2WMUA 3D5XA 2XRUA 5ACBC 2XBAA 3ZC5A 2RG6A 2VTHA 4KKHA 2G15A 5DLSA 3QD2B 3P9JA 2HW7A 3NNWA 3I1AA 2PUNA 2PZRA 2Y7JA 4EYMA 3ZH8A 5AUXA 5HBEA 2CKOA 4JXFA 4XEYA 2WMRA 1W98A 5CVHA 2GNJA 4QMWA 2WB8A 4BDIA 2PVMA 2XYUA 4F08A 3F2AA 5BUIA 4Z7GA 4B9DA 3R9NA 1CSNA 3RP9A 3FLZA 2YFXA 1O6KA 3AMYA 3HGKA 3E8CA 3WZDA 3UE4A 4QNAA 5BVOA 5AV0A 2CKPA 3LCSA 2ZV2A 1YXSA 5AV2A 4GSBA 2HZ4A 5L2SA 2JEDA 3L9MA 4QMLA 4EORA 4CKJA 1FVRA 1Y8GA 2VWUA 4X3FA 5HGIA 5DYJA 3V5LA 3S1HA 3LJ1A 4JRNA 2F4JA 3FYJX 4RFYA 4QP4A 2XJ1A 3V8SA 2QI8A 2C5OA 5GIPE 1WBNA 3C5UA 4O38A 5DN3A 3DB8A 2OICA 4X6QC 3UNZA 3A8XA 1H24A 1H4LA 4EEVA 3ORXA 4IM2A 5FP6A 3CSVA 3BYOA 3QCYA 4Z3VA 2VWWA 2W1CA 5A4TA 4P2KA 4D4RA 3TTIA 4ASDA 4AFEA 4XCUA 4U40A 4O0TA 3NUSA 3TZ8A 5L8LA 1YHVA 2BDJA 4ZJVA 5KMKA 3I7BA 4IWQA 4O7WA 5E8TA 2ZYBA 3CQEA 5L8KA 2H9VA 3QXOA 3KN6A 4EC9A 1KE7A 2JBOA 4HNFA 2JKKA 2X9EA 2UZDA 1PKGA 2XK4A 5AP2A 4E4XA 3SG8A 3LMHA 4JBPA 5EHOA 2IPXA 4ZY5A 3V8WA 4NT4A 2FSTX 4PL5A 3QFVA 4UN0C 3PA3A 5CU2A 5AUYA 2GNGA 1LUFA 3FMLA 3D14A 1MUOA 4O1PA 4TXCA 3BV3A 4OLIA 2WMXA 3UIBA 1V0PA 3OD6X 1FQ1B 4Z16A 2GMXA 3MY0A 4WKQA 2QODA 5IQBA 3C51A 3MB6A 4GVAA 4M97A 4JG8A 5D1JA 2QLQA 2IZUA 2BTSA 3FSKA 3FI8A 5EM8A 4FT3A 1XH4A 2Z7LA 3CKXA 1OKVA 4I0TA 1HOWA 4EWQA 3ET7A 5AUUA 3PP0A 4O91A 3GB2A 3MW1A 4XP3A 3F82A 5E92A 4I93A 2B52A 4C61A 4QMZA 1P14A 4M3QA 3V5QA 5KUPA 3A61A 4GG7A 2YEXA 3QA8A 1GY3A 4XBRA 3GFWA 2R9SA 1KE5A 5HU9A 4AW5A 3RPRA 4FZ7A 2ITXA 4EWHA 3FSFA 2AC3A 3JYAA 3PWDA 4IDTA 2ETRA 3GGFA 4FTOA 3NUYA 4D2SA 3HRCA 4MXCA 2RF9A 1OPJA 4O83A 3M1SA 4O2PA 4FKUA 4O22A 3VS4A 2UZLA 3PDTA 5FEDA 3TTJA 4TWPA 3DBEA 4L68A 2FSMX 1PMVA 3QUPA 4ANNA 3GXLA 3R02A 4OW8A 4PNIA 4W9WA 4DCEA 4ERKA 3RWPA 3CY3A 5KNJA 3LLAA 2C6DA 4G6NA 4H3QA 1Q8UA 5HI2A 3N51A 5K4JA 4EH6A 5LMKA 1KUTA 5DH3A 4PTEA 2XK7A 4CFWA 3FZTA 2FUMA 4YTCA 5HORA 4FT0A 4DFYA 3SRVA 5CAOA 5I9XA 2XA4A 4LG4A 2BKZA 2WMVA 1WBPA 4EOMA 4XH6A 5FEQA 2QG7A 4NM5A 3GCVA 4EHVA 3DZOA 2QURA 3C4FA 5JZNA 3A7JA 4KAOA 4L52A 3VUMA 4ZZOA 5KMOA 3ZBFA 1DS5A 3KVXA 1MQ4A 2JKOA 4XBUA 3NW7A 3RALA 1E1XA 2UW5A 4FL3A 4O0XA 1R78A 4I5MA 4A9SA 4L42A 4IMYA 2YDKA 3OCTA 2WNTA 5I3RA 3WI6A 3PXFA 5AFVA 1Q62A 4FODA 2C6LA 2W96B 3HA8A 4HYSA 4HGSA 3OFMA 4KBCA 4O0SA 2PU8A 5F20A 4R3CA 5CXZA 4Q9SA 3B8RA 3DK3A 3NEWA 4EOLA 4PDSA 5LVLA 4ZSAA 2B54A 4H39A 4A4LA 1XWSA 2OXDA 3LOKA 4L44A 4HGEA 3U55A 5CZHA 2BRMA 3NYNA 4EKLA 2CCIA 3AXWA 5K3YA 4IWOA 2LGCA 4X3FB 1FBNA 4C4JA 3QKKA 3HP2A 3VUKA 4JI9A 2QD9A 4FSWA 4WG4A 4F63A 4AU8A 5L6OA 2X6DA 3ULIA 4TPTA 2ETKA 2G01A 3R30A 2XCHA 3JY9A 5IQEA 3M42A 4LL0A 3HAVA 3ID6C 4FIIA 4CLJA 3R7GA 2J5EA 3D15A 1FPUA 3MA6A 2YM4A 4HJOA 5CZIA 3UVQA 3BHTA 3QLFA 4Y5QA 1WBWA 2FSOX 1P4OA 1GZKA 2YCQA 2JDSA 2XK6A 4BFMA 3KMWA 4E4MA 3MESA 1ZRZA 5CSXA 3N9XA 3QKMA 2QQ7A 3FKOA 5DT0A 3BE9A 4W4WA 2WO6A 2C3JA 4EH7A 2V7AA 2BRBA 2CJMA 2YLFA 3S2PA 2OFUA 3HV6A 4X6RA 2YJSA 2WXVA 3IGOA 1LPUA 2QOOA 2UV2A 3NUUA 4NM3A 4RX7A 2VO7A 4GUBA 4O7SA 3SG9A 2PVFA 3DJ7A 2Z7RA 3W2QA 5J9YA 4FC0A 1YDRE 2GHMA 4C37A 5K5NA 4CG8A 5IQHA 4J53A 3ZLWA 4DGNA 3GI3A 5LMBA 3RAWA 3R1NA 4K8AA 3EQPA 4IXPA 3OF0A 3R2BA 4CFVA 4RLKA 2BAKA 3E62A 5C26A 3F3WA 4ANLA 5B7VA 3NDMA 5E8XA 5FBNC 5HU3A 4MWIA 1K9AA 4QYYA 4ZZMA 5A14A 3UZRA 4QTDA 1BYGA 3ZFXA 4D9TA 2XCKA 3HKOA 3RI1A 3FY0A 1WZYA 5ANEA 5EI2A 4Z55A 3FMJA 1E9HA 3LQ3A 3TUBA 3V51A 3EFJA 5GZ9A 3R1YA 2H96A 3F7WA 4BGGA 4K9YA 4BYIA 2HZIA 4FG8A 1FOTA 1TVOA 1ZYSA 4AW0A 5M57A 5ETAA 4KIOA 3ZLXA 2WFYA 5IUHA 4XNEA 1UWJA 3QF9A 5LMKC 3GBZA 4TWCA 4CNHA 4GEOA 4FMQA 4U42A 2W5BA 4AQCA 4C8BA 4F0IA 2WU7A 4TZRA 3ZRKA 4UMTA 3GU5A 2P4IA 3ELJA 3LW0A 3FBVA 4F7NA 2WQOA 4ZK5A 1ZYDA 3PA5A 3PRFA 1YWRA 3GNIB 4HZSA 4O96A 2R4BA 2JIUA 3HX4A 2PK9A 3FL5A 5FBOA 2R3IA 2O8YA 4FYNA 3EJ1A 3FLNC 3COHA 4NJDA 5GJGA 5KZ0A 2QOHA 3UMWA 3GU8A 1R1WA 1F3MC 4AZTA 2AC5A 3LFBA 1YI3A 1J3HA 3DJ6A 3HRBA 4KKEA 4M69A 3VS1A 5IDPA 4O7LA 5M09A 4J99A 4O84A 2OJGA 3VUTA 2BCJA 2VNYA 2ZAZA 1FINA 4NM7A 3VS7A 1OL7A 4ZY4A 5AM7A 1WBTA 2PE2A 3VO3A 1GOLA 3Q32A 3IQ7A 2WQBA 3OWJA 4ALVA 4IFGA 4B0GA 3R63A 4L53A 2VWYA 3CD8A 2W4JA 1QPCA 2XUUA 2OH0E 4PDOA 3ZXTA 1ND4A 4PDYA 3SXSA 1MRUA 3KRRA 4LGHA 5C1QB 3BEAA 4TN6A 5IQFA 1CKIA 5HKMA 4BCOA 3D0EA 1HCLA 4HGLA 4UMQA 4EL9A 2X9FA 1IA9A 3SRVB 4F9CA 3TI1A 3TUDA 3LJ2A 1NVSA 2QR8A 4Y95A 4AN9A 4CD0A 1G8SA 2UZOA 2IW8A 4GKIA 3IDPA 3LXLA 3EWHA 4FZAB 4NEUA 4B4LA 3QZIA 3L8SA 3UOHA 3C1XA 2BAQA 2GHGA 3M2WA 3BLRA 4YGAA 3ACJA 3OHTA 4IH8A 4O7TA 4DTBA 3CGFA 5JGDA 2HAKA 2RFEA 2BZKB 4GV1A 1M2PA 3KF4A 1GZ8A 4CFMA 4PMMA 1KOAA 3KN5A 2ZM4A 4BCIA 5LARA 4E6QA 2J0IA 3O7LB 1Q99A 4DITA 2R7BA 5C9CA 4WSYA 4RGJA 1Q61A 1PKDA 1RE8A 3AG9A 3IDCA 3PUPA 1H00A 1ATPE 4D5HA 3MVHA 2R3LA 1Q97A 5T6KA 2OJ9A 5IF1A 3SQQA 5IQDA 4XRJA 4RZWA 4O1OA 3GC7A 3K54A 3QD4A 2UW6A 1YDSE 2X81A 1IASA 5AP5A 4FTQA 1UNHA 4USDA 4EK5A 4OTQA 3P7AA 1URWA 2W5HA 3ZCLA 2OI4X 3MH1A 1RW8A 3IW5A 1H8FA 3BEGA 5A4QA 3TDVA 1H0WA 4BCQA 3W2SA 1UKIA 3R9DA 3Q9ZA 2FSLX 4PQNA 3TV7A 2REIA 3BYVA 2VTQA 1E1VA 4BDGA 3PVGA 5CALA 3LQ5A 4M13A 4AP7A 4YP8A 4FUXA 3RHKA 3H9FA 4D1SA 4V05A 4X3JA 5IMEA 5EYKA 3W55A 1Q8TA 2JAMA 5EOLA 3CLYA 3U6IA 2YAKA 2XVDA 5CT7A 4ZP5A 3KRJA 3VWAA 3R9RA 3G51A 5CS6A 3TACA 3CY2A 2P33A 3C4WA 3DKCA 2H34A 2WKMA 4G3DA 5EH0A 3TV6A 1M7NA 3TZ9A 3UIMA 3QX2A 1R3CA 4WSQA 4EH8A 3TG1A 2FB8A 1OUYA 5DGZA 5KBRA 3TNQB 3BU5A 5H8BA 3PTGA 3WZUA 4BDHA 4XYFA 4LFIA 2DWBA 4G5PA 3UG1A 5E4HA 2X7GA 2FH9A 2XBJA 4XG6A 3AD6A 4J96A 4BKZA 4HVIA 2B9JA 5CF4A 4I5CA 2C5XA 3R01A 4E3CA 5A4LA 4UX9A 3EN6A 5IEYA 3VC4A 4PL3A 4FKRA 3WYYA 2Y8OA 4OUCA 2C5VA 3HDNA 4J8MA 4D1XA 5CEQA 3OY3A 3UC4A 4JOAA 2DUVA 2EB2A 4BCNA 2UZWE 4KSQA 1Y8YA 3KVWA 3CPCA 4K11A 3NR9A 5HE2A 4BTFA 4JQ7A 3OMVA 4R7IA 4UMRA 5I4NA 2WU6A 3D9VA 4GYGA 4MX9A 4ZLYA 2PZIA 4FV2A 4W4XA 2O65A 2X7OA 4PMSA 4DGOA 4TTHB 3BV2A 4X0MA 1F0QA 2OLCA 3TKUA 3V5TA 4FK6A 4NIFA 3KKVA 3FPMA 2OW3A 3R8MA 2XEZA 4CEGA 3JS2A 4A07A 3F3TA 4OTHA 2C0TA 1A9UA 3LFEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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