2WPAA

Optimisation of 6,6-dimethyl pyrrolo 3,4-c pyrazoles: identification of pha-793887, a potent cdk inhibitor suitable for intravenous dosing
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
PLVDMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Optimization of 6,6-Dimethyl Pyrrolo[3,4-C]Pyrazoles: Identification of Pha-793887, a Potent Cdk Inhibitor Suitable for Intravenous Dosing.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 302
sequence length 302
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wpaA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wpaA01
3T3UA 4O0WA 5ICPA 4FR4A 3QLFA 4J52A 5JMSA 1BX6A 1SVEA 4IAZA 1Q62A 1JKKA 3LOKA 1YQJA 5FXRA 3HAVA 3F2RA 3O50A 3PG3A 4FMQA 4RVKA 4BZDA 4JI9A 3U9CA 2BPMA 2WTIA 5J95A 4MF1A 5B2MA 5HX8A 3TDWA 4O6LA 3FLQA 3BHHA 5CZHA 4BCGA 1W8CA 4O21A 4EUUA 3SXFA 1OKVA 3LFNA 2CMWA 3MVLA 2QURA 3KFAA 3MPTA 4X3FC 3SQQA 4RFMA 3RM7A 1BI7A 3S2PA 2ZV9A 4FV7A 4USDA 4YJOA 3UMWA 3ZRLA 3DV3A 2GFCA 2UZLA 3W32A 4E4XA 2YZLA 1R3CA 2J50A 3KK8A 1R78A 3OVVA 4IDTA 5FLFA 3U4WA 4BC6A 5DT0A 4E4NA 4DH7A 1APME 2R3NA 3PP1A 4FL3A 4L53A 4F6UA 5DI1A 2YWVA 2ZV7A 3AD4A 2IZRA 4A06A 3LFAA 3QQGA 4P7EA 3MGYA 4MK0A 3PXRA 3PSBA 4FSZA 4AT4A 5LCKA 4BBMA 2V62A 2J0JA 4IXPA 2YA9A 2ZM3A 3NNVA 3FPQA 2WEVA 3Q96A 2UW6A 5DVRA 1IR3A 3VF9A 4CG9A 3LLAA 3UQFA 5H3QA 3ZC5A 4XH6A 3P7BA 4NM0A 4MBIA 5AV2A 4GKIA 2OICA 4RX9A 4D5HA 2WQNA 3F69A 3NDMA 1IA8A 2ZDTA 1H01A 4RJ8A 4KUJA 5DRDA 2HXQA 1Q8UA 4IDVA 4NFNA 3CY3A 4NIFB 3IGGA 5F20A 3GOKA 4U3ZA 4R7BA 3SGCA 5E8SA 2BDWA 1OL5A 3K2LA 4DEIA 4L44A 4K2RA 3C50A 4EOSA 5C03A 4YU2A 2BFYA 4JNWA 3VO3A 5IQGA 2ITPA 4GV1A 3TKHA 4BDJA 4AW5A 3LHJA 4M84A 3TZMA 4FV8A 3OY3A 4JIAA 1S9JA 3CGOA 3C0HA 4R77A 1GZKA 4FX3A 3R02A 2BKZA 3ZFYA 4YHJA 1KUTA 5HG8A 1ZOEA 3KRXA 3IO7A 3PVBA 1B38A 4TT7A 2F7XE 4M69A 3G0FA 3L1SA 4C4EA 3KCFA 3P08A 4O7LA 2J6MA 5J9LA 4CFVA 2B0QA 3NUAA 3O2MA 4U97A 2DQ7X 3KRJA 3QQHA 1P4OA 2JD5A 4CYJA 3ERKA 4W4YA 1PRYA 1URCA 3BWJA 1NW1A 4WT6A 1QPEA 2R3GA 3DZOA 4Q5EA 5KHXA 1X8BA 4FI1A 2BTRA 5FWKK 5H8EA 2ITXA 1J7LA 3FWQA 1XHAA 3MPMA 3TL8A 1VR2A 3LM0A 3EN6A 4FTIA 3ULZA 4OTHA 1YOJA 4NEUA 5E9EA 2X8IA 3Q32A 2ZOQA 4CZTA 5M4FA 4IWPA 5TKDA 3FZ1A 1FMKA 5HO6A 5EI2A 3T8OA 3PJ3A 4NJDA 3UOLA 3BRBA 3IGOA 4Q9ZA 4GG5A 3L9LA 3BCEA 2PE1A 2GNLA 3P4KA 2FGIA 3CP9A 3O71A 4IQ6A 4IFGA 3ZLXA 2C0TA 4DFYA 3LJ2A 5AADA 1WVYA 2PULA 5HBJA 1CTPE 3A7FA 3QD3A 3G9NA 2GMXA 2CGXA 2YN8A 5LOHA 2PMOX 3NZ0A 5HO7A 2E9VA 2W17A 4RG0A 5HE0A 5M08A 1FPUA 4ANQA 3KRRA 4LM5A 4L8MA 2CSNA 5LMAA 4JIKA 4OBQA 3U6JA 4I0SA 4CCUA 4XBUA 2YCQA 2GCDA 1KOBA 5ANDA 3EH9A 4AZSA 4QRCA 3F3VA 4TYGA 1ZRZA 1R1WA 5E90A 3GU5A 4DFLA 2YAKA 2W05A 2EXCX 1LR4A 2QOBA 1CKPA 2R64A 2XNGA 3QYWA 4IX6A 4OTIA 4DGMA 4MH7A 5BMSA 4PP9A 5DOSA 5L6OA 2XNEA 3LE6A 5TE0A 4DC2A 4AUAA 4YMJA 5CF4A 1WBVA 4ANNA 4D55A 2W1EA 2XRWA 2OXXA 1P14A 3EL7A 3EL8A 1E1XA 3OG7A 4NM3A 3JYAA 3R8PA 1RE8A 3QD4A 2F2UA 4IZAA 4MNEA 1QCFA 3EYHA 4FYOA 4U42A 4UMTA 5C9CA 2C69A 1UU3A 1A9UA 5FM3A 5LVMA 3LQ3A 4V05A 2YHVA 3FXZA 2HZNA 2QU6A 4FTQA 5EHLA 4M15A 3R9DA 4U41A 4ASXA 4MAOA 4EK5A 3FZRA 1Q61A 2BHHA 4FV6A 1MQBA 4P4CA 5FXSA 3THBA 4FSRA 2BUJA 3WBLA 3ET7A 4AF3A 3T9TA 3E7OA 5LVLA 3UE4A 3JVSA 5CU6A 3AC1A 4BCHA 4CTBA 1H1WA 4PQNA 5CEIA 2IG7A 4ZS0A 5AV3A 1IEPA 3NS9A 1YI4A 5K0KA 3TIZA 1E1VA 4G17A 4NTTA 4R1YA 4UZDA 2C3LA 4W9XA 3BYOA 5FP5A 4APCA 4CRLA 2R7BA 5HNIX 2HIWA 3QUDA 4QYFA 4W4VA 5KUPA 1ZYSA 2I40A 4IAKA 4J96A 2UW5A 5EFQA 4A4XA 4GL9A 4DYMA 4NH1A 3VRYA 3VJNA 5JZJA 4G5JA 1STCE 2OWBA 4YC3A 4JG7A 3R01A 4FZ6A 4N0SA 2BFXA 4QMPA 4E6DA 4CQGA 3D0EA 2VWXA 2PZPA 3VIDA 2YIXA 3VS2A 2GQRA 2V55A 3AT4A 3I0OA 4RWIA 2PZIA 3L8XA 2BRMA 4AS0A 1JPAA 3ITZA 4NL0A 2VTAA 1QPJA 5GJDA 3NMUF 2VUWA 2VWYA 4IAIA 1IG1A 5AUXA 3GGFA 3CPBA 4WG3A 4D2RA 2P55A 4M0ZA 2XBAA 3VUIA 4U44A 3UG2A 4AGWA 4ANBA 4D0WA 2YWPA 3DXNA 3LXLA 3GUBA 3RINA 4CT2A 4DE4A 2YLFA 3RTPA 4MNFA 5EKNA 4DH3A 3RWPA 5D7AA 4BVUA 4D58A 4D1ZA 2WMRA 4XYFA 4A9SA 2W0JA 2HY81 5CX9A 5TO8A 3BIZA 4F7LA 4F70A 5AA9A 2ETMA 4QPAA 2UW7A 4PL3A 4UY9A 2WKMA 3VS1A 4EK3A 4ENYA 2BIYA 2EU9A 4ASZA 4JR3A 3HMNA 5T68A 2UZNA 4NM7A 5K9IA 3V5QA 1WVXA 4H3BA 3ZC6A 2X81A 3L8VA 4HGLA 2R0IA 3DAKA 5IQCA 4WUAA 4F9AA 5IQFA 2VO0A 2W9ZB 3SG8A 2R7IA 3MV5A 5DHJA 3DB6A 4Q5HA 4JRVA 4DEHA 3RMFA 4Z16A 4ZY6A 4OR5A 3HMMA 5EOBA 2P0CA 3R22A 5CYIA 2OF4A 5IQIA 4I94A 2J0LA 4JT3A 4UWYA 5IQBA 4TL0A 4RVTA 3VBTA 5CU2A 2BZJA 2AC5A 2YEXA 4HYUA 3TNIA 2C4GA 5DRBA 3MBLA 2UZDA 4EBWA 3ZEWA 3SX9A 5EI6A 4JAIA 2XP2A 3QTIA 4G6OA 3DXPA 1V0PA 1Z57A 4GSBA 2ITYA 5AR3A 5L2WA 2XYUA 1AD5A 4MQ2A 4LOQA 5CVHA 3W55A 5HU3A 4O96A 4BCKA 4EK6A 4OTWA 5ANEA 1B39A 4DHFA 4Z7HA 2QHMA 1H00A 2WQBA 2JAVA 2FA2A 2IW9A 4F64A 2QOQA 5BUIA 5JGBA 2R2PA 4TWPA 2O3PA 3ORXA 3N9XA 4FV0A 2ZB0A 4ZLOA 4ZZMA 3OF0A 2OGVA 3FSKA 5L3AA 3AC5A 4P2KA 4RC3A 4V0GA 3EN9A 4ZMFA 3GU6A 4YJRA 2EXMA 1Y91A 2YDJA 2VWBA 4F1MA 3GI3A 4A4LA 4CMUA 5DFPA 3CXWA 4BWKA 3DGKA 4U9AA 3P5KA 4IBMA 4AZWA 1YDTE 2XEYA 5L8JA 3SAYA 4EI4A 2OF2A 3HGKA 3QCXA 2DS1A 4UEUA 3JVRA 2WTKB 3GU4A 3UC4A 1DI9A 2VD5A 3NNXA 4IWOA 4GK4A 4XG7A 2NRYA 3DPKA 2HY0A 5ITAA 4FIIA 2GNIA 3VC4A 4LGGA 3FQSA 4C8BA 4L9IA 3GU8A 2R3FA 2H96A 4GU6A 3DFAA 3G6HA 4QP4A 3FEGA 3NUUA 4ZIMA 2PUIA 3BE2A 3Q4ZA 3OROA 3QZHA 4BCQA 4O86A 4EJ7A 3FQEA 4C0TA 3CQEA 2PVJA 3ZM4A 4JR7A 3I7CA 3PIXA 4YTFA 3WZDA 3NUSA 4BCMA 5I9XA 3BGPA 4WD5A 5LWMA 4GFGA 5K5XA 3CIKA 3GT8A 4RIWB 3MH3A 4FOBA 4L6QA 2XKCA 3F61A 3QFVA 3VUMA 3BEGA 3QRTA 4FT7A 4XG8A 2ITUA 2WO6A 4XRJA 2XNBA 2CLQA 4FSNA 4GIIA 4O0VA 1GIJA 4Z55A 2XK6A 2X39A 3OBJA 4V0GB 4QP1A 3QX4A 4IMYA 5JRQA 4TWOA 3ORZA 1Q8WA 4ZSJA 1R0PA 3E92A 2I0VA 5CAOA 4O7VA 2X7GA 4GYIA 3F3WA 4LMNA 3EFJA 5HBEA 5HIDA 3RK5A 4FKPA 2WHBA 4BDDA 4DA5A 1WBNA 5AUYA 4CV8A 4PMMA 5IUGA 3G5DA 5BMMA 3FMNA 4K1BA 2X9FA 5KO1A 1JBPE 3B8QA 4KSPA 4AT3A 5KMKA 4AW2A 3DBCA 5BUJA 4FF8A 2QKWB 3V5PA 4EC8A 3HZTA 4EH9A 5IKWA 4JOAA 1U54A 3MN3A 4XV2A 3Q60A 3GENA 3T3VA 4AP7A 5IA4A 3ALOA 5DIAA 3HDMA 4CNHA 3S1HA 4G3GA 5L8LA 2A27A 3CD3A 2H34A 2VNWA 4RJ3A 5A9UA 3UYTA 5I0BA 4BCJA 4C2WA 4KRCA 3H9FA 2VWWA 4L45A 5EH0A 2PY3A 1PHKA 1OKWA 3RM6A 3RNYA 5DEYA 3UNZA 4ZEGA 1Q8ZA 2G2HA 4GJ2A 1YXTA 5AUUA 5L2IA 4EOIA 4F63A 3HP2A 3MIAA 5IMEA 4ZTNA 4AOJA 5JGAA 4OTGA 3WARA 4PTEA 2BRNA 4I23A 4IWQA 4IH8A 5JFSA 3GQLA 3NCZA 1XH6A 3GFEA 5ETFA 2XIZA 4ZTMA 3CKXA 3TV4A 4L52A 4OTDA 3FLNC 2X6DA 2GTMA 4RC2A 2QU5A 3C51A 3U4UA 3A7HA 4BDGA 5AV1A 4ZTLA 4NSTA 2ONLA 3R21A 2GTNA 2IO6A 4JDKA 4LUEA 4D28A 3P86A 4AW1A 3KF7A 4JJRA 3R9RA 5EG3A 3PXZA 4ALWA 1U54B 3QTUA 4NCTA 1PMVA 4XG6A 4LFIA 4RZVA 3UIXA 5I9ZA 3ODZX 3GCSA 4TYJA 4B9DA 4UB7A 4BICA 4ACCA 4F9BA 3PLAE 2JLDA 1GAGA 4FZDB 2W06A 4AFEA 2FVDA 1OUKA 2C6IA 2UZUE 1Y6BA 3NYXA 3DLZA 5BPYA 4FGRA 3HRBA 3IW7A 4MCVA 3VS4A 3I6WA 1R39A 4DAWA 5H8BA 3R9HA 4BN1A 4I5CA 3OXIA 3D94A 4LMUA 4YPSA 5EHOA 5AUWA 2QC6A 5AP0A 3A60A 3TDVA 1Q41A 3LFQA 3EQDA 3CLYA 4G3FA 3A7IA 2ITVA 1F0QA 3AT2A 4DITA 2ETRA 3KEXA 3BLQA 4DFNA 2PVFA 4KWPA 2NRUA 4FICA 2O5KA 3VJOA 3MW1A 4C4IA 2GFSA 4JXFA 4PNIA 1U59A 2I0EA 5J79A 3DK6A 3PY3A 2JDTA 5JSMA 1ZMWA 2O8YA 3Q53A 3D2KA 3Q4TA 3NYOA 4LL5A 4AX8A 1J1CA 1DI8A 2JBPA 2VRXA 3FXXA 3CQWA 4X6QC 2IVSA 3O7LD 3SRVA 3TG1A 5D11A 3P1AA 3ZONA 2YCSA 3OY1A 4U6RA 3WOWA 4E5WA 3BLHA 1SYKA 5C26A 4FNWA 3FLSA 4G6NA 1M17A 2VX0A 4FSYA 2G1TA 2J0KA 2OIBA 1L8TA 3BU3A 4H1MA 3G90X 2NNWB 4BKJA 2VGOA 4EQUA 3OW3A 5DGZA 3AOXA 4HVHA 5M56A 2W9FB 2PMIA 2BZHB 2FYSA 4UV0A 4ALVA 2F4JA 1V0BA 2W1GA 4DG2E 4RC4A 5JH6A 5I9VA 3FKNA 2BVAA 2C3JA 1ND4A 3E7VA 3QA0A 4CSVA 1ZMVA 1JWHA 4IVBA 4GVAA 1FVRA 3WF8A 2OIQA 4ZSEA 3DT1A 4M97A 4QMSA 4M13A 2WB8A 2BILB 5TR6A 4UXLA 4BCFA 4NUSA 3I79A 4H3QA 4EOOA 5J7HA 1JSTA 2XNNA 4G3DA 3MIYA 3R8VA 3W8QA 2O64A 1ZYJA 2H6DA 3DK7A 1YXSA 3GCQA 4ZJVA 4F08A 3IK3A 3QC9A 2XB7A 3KL8A 4PL4A 1TQPA 4KB8A 1CDKA 2W7XA 3SOAA 4X2KA 4QYYA 3ZSIA 4YBJA 5E1SA 1YI6A 4FKVA 4FOCA 1H1SA 4FTOA 2LGCA 2Q0BA 4G3CA 3Q5ZA 5HLPA 3PRIA 1H8FA 5FG8A 5IH4A 4RT7A 2PU8A 4MD9E 2B9IA 4RX7A 4XX9A 3SD0A 1WVWA 1GZNA 2ACXA 1GZ8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3T3U A;  4O0W A;  5ICP A;  4FR4 A;  3QLF A;  4J52 A;  5JMS A;  1BX6 A;  1SVE A;  4IAZ A;  1Q62 A;  1JKK A;  3LOK A;  1YQJ A;  5FXR A;  3HAV A;  3F2R A;  3O50 A;  3PG3 A;  4FMQ A;  4RVK A;  4BZD A;  4JI9 A;  3U9C A;  2BPM A;  2WTI A;  5J95 A;  4MF1 A;  5B2M A;  5HX8 A;  3TDW A;  1OGY A;  4O6L A;  3FLQ A;  3BHH A;  5CZH A;  4BCG A;  1W8C A;  4O21 A;  4EUU A;  3SXF A;  1OKV A;  3LFN A;  2CMW A;  3MVL A;  2QUR A;  3KFA A;  3MPT A;  4X3F C;  3SQQ A;  4RFM A;  3RM7 A;  1BI7 A;  3S2P A;  2ZV9 A;  4FV7 A;  4USD A;  3BL7 A;  4YJO A;  3UMW A;  3ZRL A;  3DV3 A;  2GFC A;  2UZL A;  3W32 A;  4E4X A;  2YZL A;  1R3C A;  2J50 A;  3KK8 A;  1R78 A;  3OVV A;  4IDT A;  5FLF A;  3U4W A;  4BC6 A;  5DT0 A;  4E4N A;  4DH7 A;  1APM E;  3W0P A;  2R3N A;  3PP1 A;  4FL3 A;  4L53 A;  4F6U A;  5DI1 A;  2YWV A;  2ZV7 A;  3AD4 A;  2IZR A;  4A06 A;  3LFA A;  3QQG A;  4P7E A;  3MGY A;  4MK0 A;  3PXR A;  3PSB A;  4FSZ A;  4AT4 A;  5LCK A;  4BBM A;  4DDG A;  2V62 A;  2J0J A;  4IXP A;  2YA9 A;  2ZM3 A;  3NNV A;  3FPQ A;  2WEV A; 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