2WQOA

Structure of nek2 bound to the aminopyridine cct241950
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
277
structure length
242
Chain Sequence
SRAEDYEVLYTIGTGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRLKPANVFLDGKQNVKLGDGTPYYMSPEQMNRNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLILEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2
publication title An Autoinhibitory Tyrosine Motif in the Cell-Cycle- Regulated Nek7 Kinase is Released Through Binding of Nek9.
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 242
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wqoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wqoA01
4IACA 1OB3A 5AMNA 1KE8A 2YJSA 4QYGA 5IPJA 4ZEGA 3CTJA 4CG8A 5M06A 2OBJA 3BE9A 2J4ZA 3DT1A 2YCQA 4HGEA 3BLQA 4II5A 3S2PA 5GJDA 4KS8A 4AZTA 5JFXA 2NNWB 4ZOGA 5EQEA 4DE4A 3I4BA 1WBWA 3MY0A 2YCRA 3IO7A 1ZZLA 2XIYA 4I20A 4WRGA 4YPDA 4CD0A 3F3WA 2OK1A 1FMKA 3NCZA 4W9XA 1XHAA 1H1WA 4WG3A 3LMHA 4TN6A 2QHNA 3GI3A 4CFVA 4BYJA 1WBSA 2BZIB 3R7EA 5AV3A 2WIPA 3MY5A 4DEEA 4IVAA 3LPBA 2OZAA 4OTIA 5LVOA 3BZ3A 3DTWA 3SV0A 4R3PA 5ETCA 1WFCA 2I0VA 4Y95A 5AP3A 3ZCLA 4EK4A 2GFCA 1BI7A 4XBUA 1Q97A 3GB2A 2XK4A 3KA0A 3KC3A 4C59A 3PTGA 3R9DA 5LMBA 3RPRA 2ZM4A 4LOPA 3D5VA 5F20A 2JKKA 4B9DA 1OI9A 2O63A 3UVQA 3DNDA 4O0XA 4IFCA 2EU9A 3NUSA 3PWDA 1FGKA 1FGIA 2BZKB 5E8UA 3W33A 5KZIA 3H0ZA 2V7AA 4OGRA 5IA5A 2ETRA 1J7UA 3NUUA 1KE7A 4RJ4A 3MPTA 4RSSA 1MRYA 1SM2A 2UZVA 3KB7A 4IX3A 4HPTE 3TCPA 3VW8A 3W2RA 1GZNA 2UW3A 3CP9A 3NSZA 4HCUA 5JZJA 3BYOA 5K3YA 2V62A 3O7LB 3I6UA 4GJ3A 4XLVA 5DR2A 3LFSA 3ORNA 2XM9A 4JT3A 5AUWA 5DMZA 2W99B 3FL4A 4XX9A 4BGQA 4BRXA 5M4IA 5I9XA 2RFEA 4CFXA 3F3UA 2C69A 3JPVA 4R7IA 5TR6A 4RX7A 4CFFA 2GHMA 4O0VA 4EK8A 4C4IA 3A61A 2ONLC 2PE0A 3W2QA 2WMXA 2WIHA 2B9IA 5EK7A 3RI1A 1OKVA 3ORIA 2X8EA 3PG3A 5I9YA 3HDMA 2WMBA 4C2VA 5CI7A 5LMKC 4HVIA 2OXDA 4ASZA 4BZNA 3QKMA 2X2LA 4J98A 5C8NA 4I5PA 4I5HA 5LCKA 5J5TA 5DVRA 5HG8A 1R1WA 3POOA 1O9UA 4TTHB 4JXFA 5AR3A 4I5MA 2YWVA 4XG9A 3E5AA 4L52A 4KA3A 3R7OA 4I94A 2F7ZE 4ZZNA 2QO9A 3VUGA 2B55A 1U5RA 3B8RA 3FZPA 3L8VA 5B7VA 4GKIA 2JKMA 2VO6A 3WF8A 5M4FA 3UC4A 5LARA 4F1MA 2CGXA 5IEXA 5IQCA 2GS6A 5K0KA 3I6WA 4W8EA 4LUDA 4AZWA 3QRKA 5E8WA 5HE0A 3SKCA 4CQGA 1ZRZA 4E8AA 3TUBA 1Z5MA 2QR8A 4M12A 4F6SA 2WMWA 3GP0A 4G34A 2WPAA 3HRFA 4JDJA 3COKA 4U3ZA 4D2SA 2W9FB 4RFMA 4BI2A 3T9TA 3UE4A 4F99A 1F0QA 2XIXA 3DK3A 2EWAA 2RKUA 2BZJA 3ORLA 3W10A 5HOAA 3R04A 3I7BA 3Q53A 2J9MA 4CTBA 3Q4UA 3PXRA 3UOJA 4C4EA 3TXOA 4G3EA 4ZJVA 1IAHA 3CKWA 1S9IA 3O23A 4YUQA 2IW6A 4BTKA 3DJ5A 4FZ6A 5DN3A 1KUTA 5IEYA 4ZMFA 5A54A 4EH7A 2WMRA 2X7FA 3PXFA 3EQGA 4NCTC 2XRUA 4YTFA 2R3FA 4BI1A 4UZHA 3QTUA 4ZP5A 4CFWA 4D4RA 4P4CA 4JDIA 2H96A 4BCKA 2W4OA 3GCPA 4FZ7A 3QQUA 2XVDA 3ZFXA 2R3QA 1Q8ZA 5IU2A 2RFDA 3IONA 5AAGA 1OUKA 3HA8A 4M8TA 3MB7A 4GMYA 1SYKA 4FG9A 3NYVA 5ACBC 4L01A 4R3RA 4YJOA 1KOAA 3VQHA 1MQBA 2YERA 3C50A 3EL7A 4O7RA 1PMUA 1G5SA 2WQNA 4C4HA 1M2QA 3QF9A 5DHJA 4OTFA 2YM7A 5DNRA 1H8FA 3VS2A 3FZSA 3DXPA 2H9VA 1PF8A 4IW0A 4EOJA 4O0YA 2GNLA 3FY2A 3C13A 3EZVA 5DGZA 2B53A 3FKOA 5JFWA 4QMUA 4Z9LA 4BIBA 3LXLA 5CLPA 5BYLA 2XIRA 4GEOA 3WF6A 2WNTA 4JBQA 3TZ8A 4CZYB 1JPAA 2PUNA 3KN6A 4BKZA 4ORKA 3R7GA 3EKKA 5ANIA 3FQEA 4KABA 3A8XA 4FUXA 2YDKA 5IUIA 3CIKA 3TUDA 2B0QA 2XBAA 3WZEA 2AC3A 3E3BX 3REPA 3ZS5A 3CXWA 2QG5A 3K3IA 4PF4A 5CT7A 5AR4A 5JGDA 3LIJA 5L4QA 4G3FA 5IQGA 3ORTA 2VU3A 3LFDA 3ZO2A 3DOGA 3TG1A 4ANNA 1OL1A 3FI8A 2C5VA 4J99A 3UIUA 3LCSA 3UJGA 3UMXA 3LKMA 3H3CA 4EK5A 3H4JA 4C7TA 3QUPA 2QODA 3QBNA 2WMQA 4A9SA 3ALNA 5EOLA 2XP2A 3RBWA 1SMHA 4H3PA 4IVBA 4JQ8A 3A62A 1URCA 4CRSA 5KO1A 4PPAA 5ANEA 3VBWA 4QQTA 4GW8A 4WT6A 3TZMA 3KCFA 1H1SA 5ANKA 1V0PA 2ZVAA 2XK6A 3DJ6A 5AUVA 1IAJA 4EC9A 2IJMA 3KQ7A 3G15A 2CPKE 4IE9A 2QOCA 2WMAA 2CN5A 1YOLA 4RRVA 5IZFA 2OJFE 4FEWA 2W1EA 5T6KA 3VC4A 4GYIA 3EQIA 2ETKA 4FTCA 4HGLA 3V01A 3FXZA 2XEYA 4QP2A 3G0FA 3QYZA 4FT5A 4RWIA 5EM6A 4IJ9A 3EQPA 3AC3A 3P79A 3EQHA 4CFMA 4IWDA 3BKBA 2WXVA 5E7RA 2WD1A 4NEUA 2YIYA 2F7EE 4O2PA 2XEZA 5CANA 3GCVA 4PTEA 4B6LA 3ORXA 4KNBA 3W16A 3PSBA 1XWSA 3A7FA 4FIHA 4BWKA 5CF4A 4EH3A 5JH6A 5IH4A 4CCBA 2YCSA 3TN8A 5A6OA 5C4LA 3PSDA 3F5XA 4QPMA 3QTXA 2OGVA 2XK3A 3UO6A 5LOHA 5LXMA 1CM8A 2C6TA 4I1ZA 1OIRA 1P5EA 2VTMA 4GT5A 3BGPA 4O7TA 4RG0A 4JOAA 3AD4A 3RM6A 4BR3A 3EN4A 3COMA 3EWHA 3ENHA 5DA3A 4FTKA 3F66A 5L6WL 1Y8GA 5DRBA 2HYYA 2Y4IC 3VHKA 3IDCA 4ZTNA 5D1JA 2Z2WA 1Y8YA 2BRGA 4ID7A 4O21A 5C27A 3V6SA 3VF9A 5CS6A 4MNEB 3LFNA 4NIFB 4X3JA 4C35A 4ANQA 4XJ0A 3VULA 4UMUA 1I09A 2X1NA 2ZDTA 2VTOA 1WVYA 3EQDA 5TKDA 1XJDA 3QD4A 4AQCA 2WQMA 4HPUE 4G6LA 4IFGA 5IUGA 3UGCA 2GNHA 2YDIA 2ZMDA 1V0BA 2R3OA 2VTRA 3KL8A 3QA8A 4NFNA 3BHHA 1XO2B 2GHGA 3TM0A 2OJGA 4IXPA 3UO4A 4WRSA 3VIDA 1IG1A 2Y8OA 1XKKA 5FRIA 3UPZA 1ZY5A 5ANDA 1Q5KA 3ATTA 5HTBA 2X9EA 2A19B 4WUAA 2A27A 4HVDA 5L3AA 4HW7A 2YIRA 5GIPE 4FKTA 1OVEA 1YHVA 3W2CA 3PIYA 4QT1A 4RGJA 4S33A 1M17A 4X0MA 5G1XA 3IW6A 3VS5A 5HTCA 3PP1A 2BR1A 4AA5A 2ZYBA 3UO5A 4MYGA 5BPYA 5EM7A 3GCUA 2C3IB 1J7LA 2C47A 3TZ9A 2YN8A 4FV5A 3FMHA 4YBKA 2WTCA 1ND4A 1P2AA 4PMMA 1DS5A 2YZLA 2JIVA 3MVLA 4IB1A 4ITIA 4IX4A 3RNIA 4MKCA 3LLTA 4U81A 4IQ6A 3FY0A 1YXTA 1OIUA 3VNTA 4DH3A 2CCHA 2OKRA 5EYMA 3AC8A 4MXOA 3DDQA 2F49A 4L43A 3DB6A 2O3PA 3SD0A 4KBCA 3KXMA 4IM3A 3OTUA 4FL2A 3K5UA 3PRIA 3TDWA 1H07A 1YXSA 4CVAA 5BX0A 4CRLA 5L2SA 3AOXA 1G8SA 4C4FA 3FKNA 3IKAA 2F9GA 4CKRA 2X7OA 2CKQA 3GCQA 3FPMA 2IZSA 1CMKE 4FG7A 4IHPA 4YZBA 4I4EA 1F5QA 4LL5A 3IGOA 4D9UA 4QMZA 4DFBA 4QMOA 2HWOA 1W98A 4EKLA 3HMMA 4PQNA 3C9WA 4E20A 2VZ6A 2W1FA 4GFGA 4RIOA 4TW9A 2F57A 1SZMA 4ZJIA 3L9NA 3QZFA 4H36A 1G8AA 2QOIA 4FKWA 4U80A 1UU8A 3ZONA 2FSMX 4E26A 4UMRA 2OICA 5H8GA 5IUHA 4FV0A 3S0OA 3QC4A 3F88A 2VGPA 4MNEA 1IA8A 2W5HA 3MPAA 4NIFA 5FBOA 3R8VA 4YJTA 5A4QA 3SW7A 1BL7A 5CU6A 4CEGA 3U55A 2B1PA 3GT8A 3VUDA 1BLXA 5A4CA 5JT2A 4UY9A 3QQJA 4WNOA 4Z3VA 2VRXA 1YDSE 2LGCA 3IW5A 4BHNA 2QG7A 3ZSGA 3LM0A 5KUPA 2QLQA 3QXPA 4N57A 3HMNA 1OPKA 4EBWA 5A9UA 1YWNA 4DH5A 4CLJA 3VN9A 1Q62A 4FNZA 4QOXA 3SAYA 3W8QA 2WOTA 2YCFA 5C9CA 1UU3A 2PZ5A 2XCHA 3PYYA 5EW3A 4FSZA 3WI6A 5HI2A 4PL3A 4A7CA 3CY2A 4R77A 1IASA 3CLYA 3P7CA 4RA5A 2R3JA 2XCKA 2YABA 3FMLA 3O8TA 4FTIA 3O50A 5E8ZA 2HENA 5BUJA 5BMSA 5AP1A 4R1YA 4K6ZA 3LVPA 5HBJA 4FYOA 4GYGA 2F7XE 2IZUA 3HP5A 4DTKA 4FKSA 5HVYA 3TWJA 3L8XA 2XUUA 5FLFA 3BV3A 1SVEA 1DI9A 3EJ1A 2PVYA 4DH1A 2HZNA 2YISA 4NYEA 4XYFA 3KXGA 1MUOA 3CGFA 3UP7A 3HYHA 3FBVA 3FMJA 2I7QA 4GT3A 1PXOA 4FMQA 4P2KA 3P7BA 1NW1A 2JITA 3OWLA 4UYAA 2W1CA 3FLZA 1PXIA 3BQRA 3VS7A 3ORPA 2XM8A 4PTGA 3NUYA 3DQWA 3I7CA 4BGHA 3I5ZA 4KIOA 4EYJA 5ICPA 4H05A 3UZPA 4DGLC 1ZY4A 2VWWA 3QCQA 4JDKA 3OUKA 5BVDA 5LVLA 3OXIA 3QX4A 4KSQA 3G90X 3ZEWA 4JJRA 4MCVA 4BWPA 4L9IA 4Y85A 3AQVA 4F0GA 1X8BA 3OHTA 4U43A 4PL4A 4WNKA 4DYMA 4LGHA 3WIGA 3DAEA 2EB3A 3ATSA 2VN9A 1GIJA 3TKHA 2ITVA 4P5QA 4RFZA 4W8DA 1FMOE 3C0GA 2VD5A 5AM6A 2Z8CA 3UQGA 4DGMA 5CEKA 4L68A 1CSNA 4QP8A 4M68A 2ESMA 4YJSA 3F3TA 5HIEA 2X39A 2PVHA 5IEVA 4GG5A 3KREA 4EOOA 4RZVA 1PMVA 2CKOA 3W2SA 2KULA 4KINA 1J1BA 3FI2A 3PVGA 4F9CA 2X4ZA 3PPKA 3PZEA 5BQ0A 2VTHA 3KXNA 4F7LA 1YKRA 2O64A 1P4OA 3IDPA 2IPXA 2UW6A 3FHIA 3DS6A 3LW0A 3A60A 4UYNA 4QYEA 1PHKA 3CTQA 4ANBA 4Y5HA 4MWHA 3UQFA 1W84A 3G2FA 3FHRA 2GHLA 4G9CA 4YJVA 3IECA 4MD9E 3ELJA 1W7HA 1R78A 3P7AA 3ZM4A 4ZSJA 2O2UA 2CDZA 2XJ2A 2WQEA 5AX3A 4I3ZA 5AR5A 4FT3A 4TKSA 2W1DA 4OAVB 1A48A 3DU8A 2FGIA 3C51A 3IOPA 3PE1A 2W06A 3POZA 2XH5A 4PX6A 5B2KA 4BDAA 2DWBA 2WFYA 4J96A 1CKPA 1UVRA 3NIEA 4DEAA 3Q6UA 3UG2A 3M42A 4TPTA 3BLHA 3QTWA 4ASDA 1W0XC 4KB8A 3RCDA 3D2IA 2FB8A 5H8BA 3NMUF 2R3LA 3EHAA 4EH9A 5L2TA 2LAVA 3ZXTA 4FTAA 2X8DA 1M14A 2NP8A 1NVQA 4O0SA 5HQ0A 4MEDA 3BPRA 4RJ5A 1ZMUA 3GFWA 3FC2A 2IZRA 4KKEA 3V51A 3WE4A 2PVFA 2J7TA 2PVMA 3KEXA 4JAIA 3E7OA 4TY1A 3VBTA 4BGGA 5HO6A 3DY7A 1WBNA 4U9AA 3QD0A 4EHGA 1LEWA 3DZOA 4FKQA 4C3RA 4YMJA 3ALOA 5CALA 3G6HA 4R5YA 1ZWSA 4NSTA 4IEBA 4LV5A 3O17A 2FO0A 2RFNA 4PDPA 4GK4A 3RTPA 3MH1A 4DINA 4K33A 2W5BA 3U4UA 2IVTA 2WZJA 4B7TA 1LR4A 4CKJA 2WTVA 4I93A 4DFXE 3OTVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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