2WSY | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	268
structure length	237
Chain Sequence	MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLIEKLKEYHAAPALQGGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPMLAELRSFVSAMKAASRA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	TRYPTOPHAN SYNTHASE
publication title	Loop closure and intersubunit communication in tryptophan synthase. pubmed doi rcsb
total genus	79
structure length	237
sequence length	268
ec nomenclature	ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date	1998-02-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00290	Trp_syntA	Tryptophan synthase alpha chain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2wsyA00

5HULA 3BV4A 2PRLA 4YL2A 1DJQA 1R2SA 4OWGA 2VC6A 2QCEA 1OFQA 1W5OA 2WKJA 1AW5A 3GKFA 3O15A 4JICA 3ZFHA 4LS2A 5D38A 3P62A 4HPXA 2E1DA 3DFTA 1Y0EA 1PCKA 3GDLA 3IEBA 2F7FA 4Z0JA 2WOQA 3LERA 5HR7A 3P80A 2J88A 4WX2A 1DVJA 3N9SA 2HS6A 4JN6A 3PULA 4RZ4A 4JR5A 2QCNA 3PUDA 4HNNA 1F6PA 1F7BA 4JXCA 4Z1AA 3TSBA 1WAUA 1QOPA 1VZWA 4N2YA 2GJLA 3H53A 4DF1A 1GT8A 2QUVA 1MEHA 3E96A 2Y85A 1QCWA 4NJHA 1IIGA 2G5WA 1YXYA 3DFQA 5AHFA 5AHIA 4N4QA 3O16A 2C16A 2C0AA 3ATYA 4GUHA 3SSJA 3NM1A 5K9DA 1E51A 1FBAA 3BG5A 5CZ0A 5D03A 4XUGA 3DI0A 3LTYA 2VFHA 3LM7A 1X8FA 2FFCA 3KHJA 2VFGA 4AWUA 1PL9A 4QSHA 1ME8A 3RK8A 1W1ZA 4O57A 4RZ6A 2R8WA 3P84A 1P4CA 4N9BA 2CLEA 3QPYA 1FDZA 4X22A 5KMYA 1VYSX 1QR7A 1JCLA 3BW3A 5F1UA 2QAFA 3PUOA 3N34A 4UUIA 3DGRA 4IMDA 3O6YX 5D02A 2CLFA 4MJZA 2V8ZA 3DXIA 1O5KA 3GXNA 3ABSA 4MJMA 3S0CA 2AQWA 3DFOA 3PBUA 4UMAA 4O13A 3HGJA 5DLCA 5AHLA 3FEMA 3HG4A 3I65A 1OF8A 4AHOA 2O7QA 1TSIA 4X9SA 3PF3A 3CIWA 3Q94A 1H1YA 3QW4B 4JTFA 5U7SA 5CPOA 5KZMA 1JQVA 3B06A 1EB3A 1YDVA 3W2JA 2NX3A 5CG7A 1KM3A 3G18A 3SW6A 2G95A 2J6XA 4EF8A 1A53A 3F1QA 4K39A 5KINA 2FPYA 3NDOA 1WX0A 2YFNA 3LV5A 1QPQA 1LYXA 2YCEA 4ZQCA 3W1RA 1PHQA 2WSRA 1S5TA 3CTLA 4FNUA 1EPXA 1KBJA 4WQ6A 1NVMA 5DBUA 4OU1A 2R94A 1EP2A 5TQLA 4PODA 3SI9A 2GQ8A 3MP4A 3Q58A 5F4WA 3NPVA 4Z08A 4JX6A 1LRQA 2TYSA 3MP3A 1MSSA 2JKAA 1O60A 3NR0A 3HF3A 2Y7EA 4NNAA 3PSWA 3VFLA 3FLUA 2E68A 2YW3A 4X2RA 1TJPA 3INPA 1K7FA 5IBXC 3GVGA 3EKZA 4QITA 1TCDA 3UWUA 3EWUA 3W2KA 4G1KA 1Q6OA 1V5XA 4WXZA 2VFFA 3IVUA 3PS7A 1HO4A 1G69A 4QNEA 1NF7A 3A22A 1KLZA 1LORA 3DBPA 2JBMA 3W73A 2G97A 4GUJA 3MMTA 1I2PA 2QCGA 5F2LA 1ZHAA 3M6YA 5MHBA 4OQVA 2A2IA 3PB2A 1UUMA 4IWWA 5LGXA 2WNZA 1PHWA 4KFPA 1LLZA 5A8GA 3W84A 3W1LA 3KVKA 4Q4KA 1G4TA 1ZNNA 1YADA 2QEZA 3NEVA 3ABQA 3BLEA 3GZ3A 2OZ0A 4NU7A 4Y9AA 4K36A 3NG3A 2V9DA 3NQ6A 1Z41A 1TTJA 3GNDA 3SGZA 1WQ5A 2QCDB 4O0KA 3NPXA 1VCVA 3LI1A 1R30A 2E6DA 1S3HA 2C1HA 3NQMA 1SFLA 3NOEA 3W7KA 3GDKA 4IPJA 4LUIA 1FX6A 3H55A 2E5DA 2Q8ZA 4GJ1A 1N7KA 3TC6A 3NL3A 4GE8A 3MYPA 1SO5A 1KW1A 3PUEA 3M5ZA 3M43A 1TQXA 5AN7A 5G1YA 5L6UA 3MBFA 2ZRWA 2Y7GA 4R34A 4U28A 4JNMA 5CZSA 2HS8A 1SU5A 2PURA 1GYLA 4JTSA 3IGXA 1JULA 4XTIA 2EGZA 2CLOA 1BKSA 4M6VA 2QCMA 3UWWA 2Q8LA 1B4EA 5F2MA 3M1ZA 2C14A 1XXXA 2V2CA 2Y70A 4RK8A 1TPFA 3QFEA 3NQ8A 1G6CA 3NQVA 4FNSA 5D37A 1WV2A 1CW2A 1UASA 4UCGA 3TUUA 4O18A 4O1CA 1Q3NA 3LLFA 1PE1A 1W0MA 5F2IA 1GPWA 3UD6A 3VKJA 3LCFA 2DZWA 3FYPA 1LLWA 2DZSA 2FPTA 4UMCA 2C13A 2CLLA 1LDCA 1TYGA 1HO1A 3FJLA 1HG3A 3NXFA 2E6AA 5I3IA 3W1XA 5D2YA 2V30A 4ICNA 4MZ1A 1H7XA 3ANYA 3I7RA 4K8HA 1F6KA 3GKAA 1TTQA 3IIVA 3FS2A 3F4NA 3STFA 3TMLA 5HR6A 1RZMA 3OG3A 2V2DA 3S1UA 4DBEA 2VFIA 5G4EA 4IQLA 3GDMA 4UTWA 4BI7A 2B7NA 3ELFA 3F4WA 1F05A 1QPRA 4IMFA 5EKYA 3WJXA 3C0JA 3CEUA 2EPHA 2NUWA 3L5MA 4ADTA 2XN1A 4AB4A 2QCLA 4UFLA 3EX3A 4KWVA 2ZZ1A 2NLIA 1TTPA 3E12A 2J24A 1HFBA 5LGZA 4FO4A 4OE7A 3QW3A 1T0OA 4MYAA 4JIPA 4WUIA 2QCHA 2NXIA 3MBDA 3CWOX 1T96A 1YPFA 3M7WA 3A9IA 4O52A 3QMRA 3UXDA 1P5BA 4D2JA 3L0NA 1GQNA 4NNCA 3GAYA 1DKWA 2YZRA 5AC7A 2A1YA 3P5ZA 1EUNA 4JTUA 3TW7A 3B0PA 1KA9F 5A5WA 2Q3OA 4HSOA 2OJPA 1LBFA 2H6RA 5G2HA 3PBYA 5EPDA 1TRIA 5CZTA 4TR9A 4ZQRA 4AF0B 3TQKA 2BWGA 5AHEA 1H1ZA 2FJKA 2J9ZA 4N4PA 4B5NA 3B0UX 5I3FA 2DZTA 2AAMA 3CWNA 1FXPA 3NQAA 4IX0A 3TE9A 5C2XA 1G4EA 3L0KA 4QQ3A 2X1SA 2E6YA 3N3MA 2E09A 4Q33A 1LROA 2ZZ2A 3ABRA 2NV2A 4I9AA 3V75A 4GC4A 3NQFA 2ZRVA 3HGRA 2OMAA 3P8IA 2A5HA 4DF2A 3KRSA 2WQPA 2A7PA 2NUYA 2ZRYA 3F03K 4GUFA 4E38A 2TPSA 3DI1A 5G2WA 4A2SA 2UV8G 3HO8A 3NQCA 4JTJA 3QH2A 4LOCA 3G1YA 5AHMA 3TR2A 2JGYA 2FPVA 3S5NA 3P5YA 2YDAA 4CNOA 3W7DA 4UC5A 3O1NA 1L6YA 1PCWA 3QQ1A 4R7JA 4UIOA 2ZCGA 1JR1A 1RQEA 3M41A 3I7QA 4LS1A 4IPIA 1IXOA 1GEQA 5CZJA 3G0XA 1THFD 2Y61A 1SSDA 4OHQA 1JJKA 1LOQA 1GVQA 3BPWA 5LNWA 2Z6IA 3P8JA 3GXTA 3NL5A 4HIBA 2Z0IA 4JYFA 2BX7A 4NX5A 1FCUA 1RQBA 2H90A 4Y6GA 1GYNA 1RVGA 4NVTA 4TU1A 4POCA 1F2JA 5DXYA 2RHGA 4CQ9A 1EA0A 1XBXA 5U4NA 4O10A 5D2TA 3W1QA 3MI3A 4N9EA 5HQEA 3CEPA 4HNUA 3FIGA 4DO6A 3PB0A 3TU9A 3B4UA 3THAA 3C8FA 4YMZA 5AFDA 2GUUA 3G1XA 4MOZA 2VEIA 1H7RA 4P2VA 1SW3A 1VS1A 1JUBA 4O50A 1ZFJA 4Y96A 3L65A 4UTKA 2FTPA 2NWRA 4DXVA 5C55A 3DFSA 1NEYA 1SSGA 4ORIA 1K8XA 4UFIA 1FCBA 1QPNA 4OGZA 3TFCA 3W7OA 4UXDA 2NXHA 2FLIA 3LB0A 3TJLA 3TW6A 3C2OA 1VYRA 4MLRA 1XDLA 4EIVA 2Z2UA 2KZHA 4LVFA 5FEPA 3LCLA 2ISWA 2DJXA 1TRDA 4GUGA 3UYCA 4EVZA 3BARA 3NQ7A 1W31A 3W3OA 2QCDA 4TMCA 3DHFA 1G7VA 1EX5A 3SJ3A 4BFAA 3CQ0A 4GRSA 1BWLA 5K7JA 3W1UA 4JTEA 1EP1A 2EKCA 4YCOA 4M5PA 3WJZA 1YXCA 3NAVA 3QF0A 4A21A 1B4KA 4A29A 3KOFA 3WK2A 3G1HA 3UPWA 4YLWA 4FNPA 3L66A 4QNWA 4O53A 1ZALA 3UZJA 5EY5A 2R14A 3G8RA 2TSYA 3GLCA 3EX6A 1VH7A 1DHPA 2PCQA 1XC4A 1OYBA 1ONRA 2YXGA 1OK4A 1DL3A 3R8RA 3VE7A 3M44A 3ABOA 3CM4A 3QSTA 3MWAA 1A5BA 3EX2A 4LU0A 4UTTA 2DZXA 5D04C 2QCFA 1LOLA 4E2DA 2X2GA 3GX9A 5I3JA 1IGSA 3HQ1A 4Y90A 4N6EA 1ME7A 1XUZA 2ZZ6A 1KM4A 1K03A 3NNTA 3PVFA 1SO3A 3UWVA 2LLEA 4JTLA 4HT3A 1TV7A 1MEWA 3NL2A 3HIJA 3T44A 1KFLA 2QUTA 1CI1A 4LUJA 5KZDA 5DBTA 3RF9A 1W3NA 3T78A 1FWNA 1JVNA 3STEA 5SWUA 1GTHA 3BG3A 3V1PA 3R5EA 3UQNA 1FWRA 3KFTA 1AW1A 2WPBA 4AWSA 2ZQ0A 1B3OA 2GJNA 4UTWC 1VGAA 2F84A 3QPZA 2D73A 3HJZA 2WNNA 2CZDA 5FEZA 3S1XA 3KXQA 5E93A 1ICSA 1KV5A 3C6CA 2Y7FA 4JS3A 3P7YA 4XKYB 1X1OA 3TJXA 3C3NA 5HUPA 1GVSA 3TK7A 3T4CA 5EYWA 4FB7A 4LVGA 4JX4A 4PH6A 5C54A 2BLEA 1FWWA 1KTCA 2ZBTA 3LHUA 2VEPA 1W37A 3C2EA 5G2IA 3PWAA 1OHLA 5DELA 4YCPA 7TIMA 4IXXA 5AOUA 3W1MA 4LVDA 5HUOA 2I9EA 1LRNA 3G1SA 2QDHA 3ZWTA 3SGUA 3CPRA 3QMTA 3UY8A 4AHPA 1Z48A 4Z1CA 3GB6A 3K30A 4MZ8A 4MY9A 3G0UA 4DO5A 3TDFA 3EXSA 3LCXA 3ZR4A 2C19A 4CLMA 4NT0A 4K6AA 3OVRA 1N55A 1I45A 5DY2A 3T40A 4O4VA 4IGHA 3IGUA 3TCEA 2X1RA 4MY1A 3HOJA 2ABBA 3IGSA 1SUXA 4OV4A 4FNRA 4N02A 1C8VA 4JTKA 5CPMA 1F74A 5E0KA 5DCBA 4NJJA 3R89A 4ZMGA 3C56A 3LHZA 5FEXA 4AF0A 4UFHA 1LCOA 1HTIA 4CNPA 2VXNA 2B0MA 1KFCA 4UTUA 4K7VA 1H61A 3UPBA 2A6LA 1YDOA 3QJAA 4PC8A 2BXVA 3TAKA 2QJGA 3UWQA 5HWJA 4MYXA 1GJPA 1TPB1 3W7MA 5HWMA 2Y7DA 5AYXA 3G22A 1HL2A 4IMGA 4K7YA 3PG9A 3S42A 2HTMA 3LRLA 1OX4B 3N9RA 4HNVA 3M5YA 3W07A 3TH6A 4EOUA 1JCXA 2QAPA 4XBSA 5D2WA 1TJRA 3VNDA 3DFNA 3BK0A 3W7HA 3CC1A 5BW6A 2R91A 5D05A 1SZNA 4UTHA 4PFMA 4QM1A 3QRHA 5G5IA 1FWSA 4NJIA 2ZA2A 3UNDA 3DHDA 2RDWA 1JCJA 1VCFA 1FDJA 4H4IA 4XBKA 4MVAA 3LHWA 3RNDA 4CNNA 3QYQA 2CU0A 1G7UA 2ISVA 3NA8A 3W7RA 2DP3A 3LGEA 4JDBA 4O0ZA 1X7FA 1FXQA 4IX2A 5HJLA 2EF9A 2OT0A 5LNVA 3FFSA 4K8EA 2BZNA 3N2XA 3BGJA 3GXPA 2G96A 3G1VA 3HPSA 2GVLA 2ALDA 1D3GA 1Q6QA 3JRKA 3TQ0A 5H2ZA 1EEPA 2YYUA 1ADOA 1GG0A 2H8ZA 1QOQA 3CT7A 2WV8A 1OF6A 1DQXA 4UTLA 3W1NA 3L9CA 3W83A 3KAOA 3VI2A 1D9EA 2YSWA 4N9DA 1PVNA 4E2BA 1H63A 4PL2A 1DJNA 3OIXA 4MFEA 5BMWA 4YXGA 5I3HA 5EL1A 3O8AA 3NM3A 1EWDA 2JKEA 1K7XA 1H5YA 4ZQPA 3W87A 2B7QA 4O17A 1W5NA 3C61A 3HMJG 3NPWA 4UMBA 2PC4A 5HMSA 3W7QA 3W2UA 3OA3A 1X6UA 1OFEA 1I2NA 4NX0A 5LNRA 3KVJA 5KTLA 1TO3A 3E0IA 3WFAA 4O4WA 4N6FA 3EX1A 3LLDA 2CLKA 3OVPA 5TIMA 2BTMA 4RJEA 3W74A 3QEZA 3W1AA 4RZ5A 3WJSA 1VQTA 4IUOA 5HWNA 1KFKA 4PL1A 3NQGA 1QO5A 2Y63A 3E02A 2NX1A 5AHNA 2FQIA 3S9YA 5TBOA 3WK1A 3DZ1A 2NZLA 1SFJA 3W70A 2JGQA 4JGDA 3GAKA 2ZDRA 2GQ9A 1VRDA 2VFEA 2H8XA 3LXAA 1LM1A 3FKRA 2X1TA 4HHPA 1QMLA 2ZZ4A 4AEOA 1H50A 4EWND 5BMXA 4UTJA 4NJKA 1FQ0A 3LRMA 4UTTC 3GDRA 4JTGA 4O8RA 4IJBA 3W2LA 2X30A 3P61A 4JDYA 2E77A 1OYAA 2J27A 3DU0A 1TMHA 1WDWA 4DEFA 2C18A 4LC8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2WSYA

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Chord Diagram

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