2X1UA

Crystallographic binding studies with an engineered monomeric variant of triosephosphate isomerase
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
238
structure length
232
Chain Sequence
SKPQPIAAANWSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRWYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLAGLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE, GLYCOSOMAL
publication title Crystallographic Binding Studies with an Engineered Monomeric Variant of Triosephosphate Isomerase
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 88
structure length 232
sequence length 238
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2010-01-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2x1uA00
1H7XA 3M47A 4KFNA 3L21A 1ICQA 2GJNA 5HINA 4NNCA 3HGJA 1LYXA 3LB0A 4I7VA 1KTBA 5HQEA 2QCFA 3MHFA 4ZMGA 1D3GA 1NF0A 1X1OA 3P5ZA 2PRHA 4HSNA 3C2VA 1AG1O 4MYAA 4K39A 1T96A 3LI0A 1WYIA 4N4QA 3W7IA 3IEBA 5HULA 3LLFA 2CFFA 5BMXA 4MUZA 2QUTA 4BWLC 5D2WA 3MP4A 1Y0EA 3IIZA 3A21A 1B4EA 5U4NA 5D38A 3Q94A 3V75A 4ADSA 4UFIA 3A23A 3L0NA 1F6KA 3I7RA 3NVTA 4HPXA 1SSGA 3R5EA 4U4MA 1PHQA 3BG5A 5KSWA 2V2HA 4O1BA 2QEZA 1SFJA 3S5NA 4CLMA 1V5XA 2G95A 1TPC1 2TPSA 1O5KA 4HNNA 3C61A 1GYNA 3NG3A 1XUZA 2WPBA 2ZDRA 2X2GA 3N2MA 2BXVA 3YPIA 3N9RA 2Y85A 4DF2A 3P74A 4NJGA 3W2NA 3OG3A 2H8ZA 1GZGA 1KA9F 3TAOA 1G7UA 2WV8A 2CLEA 2QR6A 1OF8A 3NYZA 1TV7A 4JTTA 4UNLA 3IIPA 4HN4A 3PUDA 2C14A 4CQAA 3W88A 4P61A 3UZJA 2WKJA 1OF6A 1A53A 2CLMA 3OIXA 3Q37A 4GC4A 4GBUA 3W1LA 3QQ0A 1R30A 3VCRA 4DXVA 2GVJA 3W1UA 1FDYA 3CU2A 3STCA 1FWRA 3LBCA 3L0GA 4EOUA 1H7WA 5AYXA 1K8XA 3E9AA 3QPZA 3LRLA 1S5TA 4WOZA 2IQTA 4JYEA 1B9BA 3M16A 1VGAA 3S0CA 3A5VA 3P5YA 1K7EA 2H3DA 2QCDA 4NZFA 2NUYA 3BGJA 4GXMA 5FEXA 1G7VA 1UBSA 2E5BA 3CM4A 2VEMA 5A8GA 5G2HA 3W7MA 3OVRA 1N55A 1D9EA 3QQ1A 4AMAA 3W71A 4RZ6A 1OG0A 4JYDA 4JX6A 2WSYA 5EYWA 1ME7A 2NX1A 3MI3A 3EWZA 4N9EA 4I7UA 3MO7A 4NUWA 2YW3A 4YMZA 4QM1A 1IGSA 1RVGA 1TPVA 1GVOA 3BARA 1JR1A 4YL2A 2NUXA 4IOTA 2O7SA 2YFNA 3TUUA 5FF4A 2VKZG 2VEKA 3W07A 4O12A 3HJZA 3GK0A 5AFDA 2FFCA 1I2PA 4O18A 3NQVA 2GVLA 4IMDA 3ZFHA 3UWQA 1OVDA 3P80A 3P67A 2Q8LA 5TBOA 3BVJA 1QAPA 3LTYA 3HGRA 5F4SA 1SO5A 2FIQA 5FESA 1DKWA 3RLVA 4EVZA 5HWMA 4LC6A 4UTWA 1JCMP 3C0JA 4U28A 4LOCA 4Q4KA 1TQJA 4GUJA 2C15A 1DJQA 3E0IA 4Y9AA 2FPVA 3NL5A 4HSOA 3RU6A 3LCFA 1OYBA 2DZVA 5BMWA 5D02A 3M6YA 5G5IA 3NQAA 4JN6A 3W7HA 2A7PA 4GFSA 5C5YA 1A50A 3DFQA 3KOFA 1R47A 3OHIA 3F4WA 1EP3A 3O15A 2QJHA 1VHCA 1K02A 3NQEA 4EF9A 2YSWA 2BLEA 3HB9A 4AXKA 5AHMA 4FXSA 5IBXA 4GWEA 1F73A 2HS8A 1XDLA 3MP5A 2A0NA 5I3FA 1KFEA 3DFPA 5I3GA 3DZ1A 4EIVA 3W75A 3PR2A 3W73A 5G4WA 1LBMA 3S5ZA 1FXPA 3U6WA 2E5CA 1JUKA 1VCFA 3DFNA 3L5LA 3EX6A 4TX9A 1GWJA 2R14A 3LHZA 3H54A 5KZMA 1J4EA 1W3NA 3KVMA 3PS7A 1TB3A 1DQWA 4KWVA 4R33A 3E49A 3UWZA 4MOZA 5LSMA 1Q6LA 4ADUA 1OX4A 4GRSA 1H60A 4NJJA 4O14A 4UTTC 2VFFA 3LTPA 1ZFJA 4R53A 3W7LA 1QOPA 3MUXA 3W2LA 4O15A 1I8JA 2G5WA 5H91A 4NXSA 4LRSA 5AYZA 1I2NA 3QSRA 1KLYA 4JTHA 1O4UA 1F05A 3RNDA 4RZ5A 3KAOA 2ZZ3A 1N7KA 1PVNA 1XKYA 1W37A 3VI2A 4IXXA 1HO4A 2C0AA 1EIXA 4LVAA 2A4AA 3G1AA 4CQ8A 1FWNA 2RDWA 3UY8A 4QNWA 4N9BA 1EUNA 1OFAA 4GUGA 4UTKA 1NFBA 5D05A 5HWJA 3NEVA 4UCGA 3TQKA 5K2ZA 3STEA 5E93A 1X7FA 2A5HA 3HF3A 4MZ8A 1YDNA 3SIZA 1C8VA 3V1PA 5K9XA 1EB3A 1I2OA 4OQVA 1IXNA 2JKEA 3DBPA 2A6NA 3ABSA 3G24A 4BWLA 1TMHA 4RX0A 3BGGA 2CLKA 4O0KA 2CU0A 5KTLA 1VQTA 4BI7A 1T8XA 2WSQA 1KFLA 5K7JA 2E6DA 4FX6M 4O52A 2LLEA 4TR9A 1IXOA 1OK4A 4WXYA 2YXGA 4O4WA 1WBHA 1DBTA 5LNUA 3M1ZA 1GG0A 4JTUA 1IXPA 2WQPA 4Z0JA 3GLCA 5HJLA 4AHPA 1ME8A 1X1ZA 2V30A 4AEOA 2GQ9A 1GVSA 3CT7A 4FNRA 3W76A 2X16A 3EWXA 1TV5A 3USBA 5AOUA 1SO6A 4RJEA 1P1XA 1ZAJA 3TSBA 3BG9A 2DORA 2ZQ0A 1CW2A 3JR2A 2V82A 3W2JA 1BWLA 1SW7A 1NAL1 1KW1A 2Q3RA 4M6QA 3UXDA 2ATSA 1BWKA 1DV7A 3CQ0A 3OVQA 2Y7FA 1EUAA 1UJPA 1Q3NA 4Z0SA 4RXGA 2AAMA 4UMBA 1GEQA 1TPUA 1SO3A 5ABTA 1TTQA 1WXJA 3B04A 2TYSA 3QEZA 3QM3A 1P4CA 2ABAA 2ZZ7A 2B0MA 4O16A 3O05A 2YYTA 3W74A 3MBDA 3STFA 1FCQA 2GUUA 3R12A 1XBVA 4MKNA 4UTUA 5MHBA 5A5WA 3NM3A 3W1AA 1G4PA 1LORA 3CB8A 3JS3A 3UWVA 3FJLA 2QCGA 4PTNA 1EWDA 4TMCA 1AMKA 3BLIA 4O50A 2E5DA 3UWWA 4E2DA 4A3UA 4A29A 5EMUA 1HTIA 4O4VA 3P60A 4NNAA 2TSYA 1QO2A 3ANYA 1OFBA 3W23A 2TMDA 2YZRA 4UFHA 2YPIA 1JCNA 4X3ZA 1QR7A 3L2IA 1K8ZA 4FHAA 1PL9A 1AW1A 1F2JA 3L67A 4PA8A 3SI9A 1AL8A 3P61A 2QUUA 2Y70A 1FWWA 4OE7A 4JICA 2R94A 3TIMA 4B5NA 5CGQA 3F4NA 3GAYA 4PL2A 1TREA 3MI2A 2HMCA 1XL9A 4FIQA 1TPH1 4L4LA 1XBXA 3R8RA 1IIHA 1OYCA 2GPTA 5CSRA 2NV2A 3B0PA 3L66A 2WNNA 2RH9A 4Z1BA 3SR7A 5D2XA 3GIYA 1ZCOA 3SY5A 4KWWA 3ATYA 1X8FA 3PAJA 4RLIA 3G22A 3VE7A 1PCWA 2DZXA 2E6FA 4PCFA 2DP3A 5DBTA 1FCUA 3KRSA 3F1QA 3LRKA 3BV4A 4CCEA 3S42A 3FS2A 3C3NA 1EWEA 1ZAHA 3BO9A 4FO4A 2NZLA 1I2QA 4JTIA 1CX9A 3LLDA 1J5TA 5J5RA 1TJPA 5FEWA 5C54A 1H7NA 1S5WA 4C1KA 4M19A 4JDYA 5KITA 1B57A 1VYPX 1VLIA 3N9SA 4NXKA 4ZQPA 3O63A 3TFXA 2VOMA 4I7WA 4TIMA 2W79A 1QFEA 1DORA 4QSHA 3NPXA 1DOSA 4DQWA 3LCXA 1O94A 5FF2A 4JTEA 1KFKA 2E68A 1M7PA 5EA9A 2X1SA 4D2JA 3CEPA 3MYOA 2E1DA 3O6YX 4Y96A 3E12A 4Y8FA 1Q6QA 2I9EA 1LLWA 2ZYFA 2HS6A 2FTPA 2VELA 4W9TA 3LX9A 1T0OA 4FIRA 1J2WA 3FJ6A 2W0UA 4M6VA 1TPB1 3MBFA 1THFD 4NX0A 1YPFA 2Y62A 3EWUA 4LVDA 2EPHA 1VZWA 1VHNA 5DCEA 2QJIA 5D09A 3B0VC 4MZ1A 3W7DA 2PURA 1SFLA 4HT3A 4IJBA 3W6YA 1SW0A 2WNQA 4S2CA 4UTIA 5I3JA 1VR6A 4Z1CA 3MJYA 3NQDA 2ISVA 2Y6ZA 5K9CA 3O6DA 3UPWA 2BX7A 1EX5A 4WQ6A 1JJKA 5KINA 2P1FA 3FKKA 3PSWA 5DELA 5DBUA 1DL3A 4RV8A 1Q6OA 5LNRA 3I6RA 3MYPA 1MZHA 3B03A 1ZALA 4UNKA 2H8XA 4WUIA 1OJXA 1L6SA 1UUMA 3IRDA 4WOQA 3DXIA 5HMSA 5FF0A 3M7WA 1YYAA 1SUXA 2JKPA 2VENA 3LGEA 1YXYA 3SFKA 1OX6A 3A22A 1H1YA 2DU2A 2CLIA 1T99A 1ICSA 3EXSA 3TROA 5DY2A 1C9DA 3O07A 2ABBA 2Q3OA 3W1RA 5LNVA 3H55A 3LCIA 3N3MA 2PC4A 1G69A 3BW4A 2Z0IA 5I3HA 4N6EA 3L68A 2OX1A 3GX9A 3HPXA 4FNQA 3DENA 3IGUA 4PC8A 2QCDB 4LW7A 4WX2A 4LT9A 3PBUA 3GR7A 4JIQA 5F1UA 1JQXA 1X6UA 2Z6IA 4K38A 3EWBX 4MJMA 3GDKA 2V5BA 2GOUA 5CZJA 2C6QA 1TPWA 4QIUA 3B4UA 3WK2A 3LHWA 3CLMA 1H51A 3W2UA 4A2RA 3NQ6A 1K8YA 4JD4A 2PRMA 3TC7A 5LNWA 1GQNA 4GE8A 4AF0B 2A7RA 3CWOX 1G4TA 4N6FA 1LRTA 4ALDA 4DEFA 3PWAA 1SW3A 4ZQCA 1TRIA 1H62A 2VFDA 3LXCA 3ELFA 1SPQA 3W70A 2C13A 3P81A 2QCMA 2DZSA 4IX2A 3DFSA 1WBJA 3MP3A 1ML1A 4H6KA 1VS1A 1GG1A 4O8RA 3TXZA 4FNUA 2EKCA 1JVNA 4WY0B 4EF8A 4HNTA 3NQFA 4HNVA 1FCBA 1TQXA 2DZPA 2ZZ2A 3C2FA 3IIXA 4YCPA 1OFRA 3LHTA 4JR5A 3UZ5A 3UNDA 3KRUA 2XN2A 5AHNA 1I2RA 1KFCA 2ZZ5A 3T40A 3IIVA 4ZVJA 3WJXA 2A21A 1GTEA 4LVGA 1YDVA 1BTMA 4PL1A 3WJYA 1QPOA 1XUUA 1GJPA 5AC7A 3WJWA 3KFTA 3NL3A 1TTIA 3P82A 3O8AA 5I3KA 3G1YA 1FCVA 4K6AA 3DU0A 3GDMA 3BW3A 4NVTA 3EXTA 4UR7A 3W2KA 3QMTA 5DXXA 1W5OA 2OMAA 3TV8A 3FYOA 3LV5A 2X1TA 1NVMA 1ZY9A 4GUIA 2TRSA 3NZRA 3NQ2A 3PBWA 2FLIA 4ORIA 2J24A 7TIMA 2ZRXA 2QKFA 1FWSA 4Z1DA 3G0UA 3HPZA 2GJLA 4UFKA 4FNTA 2DZTA 4OBTA 2FJKA 1ICPA 4A21A 1WOBA 2H6RA 3QC3A 3UWYA 2NLIA 2V81A 4IMCA 1TYGA 3DKJA 1H5YA 3IV3A 2QCCA 3W1TA 2FDSA 3EX4A 4DPQA 1LRNA 3G1SA 5D03A 3C56A 2BSLA 2QAFA 3A24A 3L65A 4OWGA 2JBMA 1H7RA 4UFJA 1KBJA 3QJAA 1SO4A 4NT0A 1P0KA 2DJXA 3EEGA 5HWNA 2ALDA 5CZSA 2ZFAA 4QJ1A 4MLJA 2E6YA 1KM0A 4IMGA 3IGXA 1XDMA 3UQNA 1H50A 3ZWSA 3M5XA 1LZOA 1OABA 3G8RA 5EKYA 1M6JA 3S1XA 1TIMA 4JX4A 1LP6A 4MLRA 1MO0A 4AHOA 2CLHA 3S8HA 5KZEA 2V8ZA 2C1HA 3NO5A 4O28A 1TRDA 1ZHAA 5D04C 5AYYA 1KV8A 5AHEA 4P2VA 4IMEA 3UPBA 3ZR4A 2V2CA 3MWAA 1WX0A 4XTDA 1W54A 3VE9A 1JULA 4NU7A 1TTPA 2UV8G 4MY8A 2BZNA 3LERA 3MHGA 2GQ8A 4UFLA 3FIGA 1JUEA 4LTSA 5DCDA 4O17A 6ALDA 3GNDA 4YCOA 3WK1A 4ADTA 2Y61A 3G3MA 4NQ1A 4R7JA 3NA8A 5CPMA 2EF9A 1GVFA 3K30A 1TCDA 1I4NA 4EWND 2CW6A 1L6YA 3SECA 2DZWA 1LBLA 3GZ3A 1TTJA 4AHQA 1LLZA 3IVTA 3LDVA 3FFSA 3HIJA 2R8WA 1PHWA 5EY5A 1GOXA 1K7FA 1PS9A 5L9FA 4YLWA 3IGSA 4QAIA 1KM1A 3NDOA 1O60A 4JTFA 2NXGA 3W7JA 4M7SA 1LTDA 1RR2A 5DLCA 2JKAA 2FB2A 3C4UA 1FXQA 5F2GA 4UTLA 1AL7A 1OFQA 2J9YA 3L5AA 4JYFA 1TJRA 1OFDA 3LRMA 1A5AA 1QNVA 2I14A 5F2LA 1JQVA 2ATMA 4Q32A 3TC6A 4YXGA 4OV9A 2ZTJA 3PC0A 1QCWA 3KHJA 4O10A 1TV8A 4M7TA 1I45A 3AJXA 4MZYA 3LM7A 3HG3A 5CSSA 3I65A 1QPQA 5FF3A 2D73A 3VFLA 2VFHA 1XCFA 3G1XA 2B7OA 1JCLA 4RK8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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