2X8CA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni with the reduced c-terminal end
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase/flavoprotein
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 173
structure length 588
sequence length 588
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8cA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8cA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8cA03
4KH7A 2B1KA 2YQUA 2VLTA 4RSLA 3EE2A 4HU9A 1S2YA 1GSYA 5KXJA 2GVCA 4WF5A 3IHQA 3IK9A 4ZL7A 1RQMA 2GMHA 2NDOA 4B68A 3G9BA 1PHHA 3OR5A 1IUSA 4LIIA 3R9UA 5G31A 4H4ZA 1OVNA 4YKGA 1L9DA 3AEDA 3KIJA 1IYIA 3CPIG 1XHCA 2OE3A 1O8WA 2BXRA 1G6YA 1PXAA 4IELA 4D73A 4I2UA 2E1MA 4OFTA 2CAIA 1GP1A 1SKRB 4EC0A 2ZCTA 3HD5A 7GSSA 2P0GA 1CJ3A 4L5OA 2JK6A 1T00A 1YKCA 1GRHA 1F3PA 5F8BA 1OKDA 2D2ZA 3ZITA 2L59A 1NAAA 4HDEA 3AD8B 3RBTA 4Z2RA 2ES7A 3APOA 5J3RA 2APGA 2XVEA 2H30A 4N0VA 2CULA 2XHFA 4CY6A 2L5OA 5KRQA 1MO9A 1R7HA 2VQBA 3BI5A 5G5EA 5INYA 4Z2UA 3QFBA 2YOIA 3K30A 1TW9A 3QFAA 4MJEA 3Q9TA 4OPUA 3L0HA 3I6AA 3IR4A 3I9V2 3TKSE 2HT9A 2K6VA 1A8LA 1NEKA 4I58A 2YWOA 3AE7A 3MDKA 1T4YA 1XCCA 3GTUA 1Z7PA 1F6MC 4NHWA 3QOUA 1GRTA 4JY3A 4U2SA 1JZWA 2JB3A 4ACSA 1ZOVA 5KEJA 4TRXA 2FNOA 3LEFA 2FBWA 3GRTA 2BK3A 4Z25A 2IN3A 3TJKA 3LYPA 2OA1A 5FS7A 2IMIA 2WDVA 2HZEA 3F8UA 1M9BA 2VZ2A 4HB9A 5DALB 2O7KA 4ECIA 1ZK7A 1R4WA 2F9SA 3QR6A 1U88A 2B9XA 1REOA 2BCGG 5C3JA 4RUVA 3IF9A 4OFMA 3F4SA 3LJRA 1D4CA 2H6XA 5DAKA 2VAFA 1VRSD 4I97A 1MDKA 4YKFA 4GSNA 1EL7A 2YG3A 4K8DA 3ZYXA 1L9EA 3IOSA 5CNWA 3BNUA 1PXCA 3APQA 5EL8A 3V1WA 3BI4A 3AYIA 1VRQB 2E7PA 3ZTLA 1H7XA 2BACA 2B5EA 1GLPA 5U63A 3EMXA 1T3BA 5IOXA 2FJBA 4JE1A 1EGOA 4KGIA 1KSUA 4EM3A 3GKMA 2VOCA 2C7GA 4QQ7A 5DQYA 2K8VA 2H8LA 1PJ7A 4U8JA 1Z3EA 1JNZA 1SL2B 2YANA 3FY7A 1F8WA 3ATRA 1LJRA 4I6XA 3RAZA 5JCIA 1EEMA 4M52A 5FT3A 2GEWA 3VI7A 1IUVA 4MJCA 3GH9A 3KJYA 2R0PA 3UAPA 4UDPA 3K7TA 5GSSA 4G10A 3CIRA 3P8WA 4DEJA 5C2TA 1OE8A 3NTAA 2JBVA 4TXVA 3VFIA 1ERTA 2PMTA 3J7Yb 2IMFA 4HI7A 1TRVA 5ECSA 1UVZA 2XLPA 3CNTA 2GQLA 4H4XA 3H4KA 4O5QA 4H4TA 3GUSA 4YXDA 3M0FA 4ZL8A 5G2ZA 4U8OA 1Y25A 2BTOT 3CNDA 1TK8B 2RABA 3FK8A 5JCLA 3TOUA 1U3IA 1BZLA 3Q6OA 1GRGA 2OA7A 3QJ4A 3GYKA 4X9MA 5DJMA 3HXSA 5CREA 3NIXA 4JEDA 4TW5A 3ALMA 1TK5B 2YM2A 3PS9A 2VRMA 2BK5A 2RGJA 1F3BA 3GKNA 4GSSA 4AGSA 4PGTA 2H66A 4IV9A 1G0TA 4EMIA 5JWRB 5B7CA 1ST9A 3RDWA 1B8XA 4OWYA 4K2XA 1M2BA 2GR2A 4BK2A 4DSHA 3KM6A 4PQIA 2FWGA 2O8VB 2BCPA 1DUGA 1HYUA 1LTXR 4TR1A 4XRAA 2E4GA 3GL3A 3KA7A 2DKHA 3F4TA 5DBQA 1VG0A 3TDGA 4TR0A 2YZHA 3DWVA 2DIYA 1TRBA 5JCUA 3TKQA 4P9SA 4OPIA 3GWDA 1GNDA 4A5LA 2IJYA 2KHPA 4ZCDA 2IIYA 2ON5A 2N5FA 4O92A 1XVWA 4F2IA 2DJKA 2YAUA 2C3NA 3FW2A 1TDNA 4PABA 1MD3A 3LZWA 1PBEA 4OPTA 5KVIA 2A2SA 3IA1A 2BS3A 3P90A 1GUHA 1QJDA 1YY7A 3NTDA 1SENA 3NHOX 4H4PA 1ZP0A 2C3QA 2CX4A 3QAGA 4FO5A 5EY6A 1FL2A 4CY8A 1TDIA 3UOMA 1QQ2A 3CRUA 3UMAA 1K0OA 1E1LA 4CCQA 3QSSA 3KTLA 1B4VA 2B76A 3HZLA 2N5BA 2WESA 1ERVA 4J2WA 4MF6A 5KN0A 2XDOA 3UVTA 2XVHA 4MH2A 3K7MX 4TM1A 1FO5A 2YR5A 1PJ5A 4MH3A 4Q5RA 3VQRA 3E1TA 4YTMA 2WQYA 3G7JA 2C0EA 1XW9A 5EVOA 1KDGA 1BYEA 3RNMA 2H6YA 5GAND 1WRYA 3FR6A 1K3YA 3VR9A 4H4SA 3US3A 1JZRA 3NYFA 3P1WA 2ZZCA 4EQWA 2DKIA 2FCHA 2H0GA 3NNEA 4CBQA 4OCGA 4B65A 4H4YA 3N9JA 1CJCA 4RI7A 3UEMA 3NT6A 4NTCA 1GOSA 2L5LA 3ICTA 1PX6A 5B8AA 5IMCA 4YT0A 3H79A 4J56E 4IN0A 3EYTA 5HFGA 3H8IA 2C1YA 4EIPA 2VCZA 3M3MA 1ZDLA 1TRUA 3BCIA 3DJJA 5F06A 4HUAA 4WR4A 4JN9A 4TR3A 3ZMKA 1GALA 1DODA 3BI2A 4D04A 3P9UA 2YCDA 2X64A 3TCOA 3UOZA 1EOHA 1VGLA 4NWYA 2VL2C 1BGNA 18GSA 3E3EA 5KVHA 1U87A 2H73A 2XPEA 2P31A 5ECIB 2H72A 2LSTA 2REMA 2LJKA 3HJMA 3A3TA 2JZRA 3ME8A 4KB3A 1KFYA 3GHAA 3ZFLA 5HR1A 5JCWA 2YVFA 2VRLA 3GH6A 1FVKA 1EZKA 4PX1A 2YJHA 5CAXA 3RPPA 5J9CA 4B1BA 1PBBA 4BVXA 4K0GA 4ZB6A 2YVJA 3DGHA 3VWVA 2MBTA 4B67A 3NOFA 4UP3A 3CGDA 4MK3A 3FZ9A 3RHBA 3AE9A 3CSJA 4TLXA 1ZX9A 5BVAA 1BWCA 4I8BA 5KN2A 2B9YA 1X0RA 3M1GA 1GSDA 1M2DA 4WBJA 4L0WA 3Q74A 3ZZXA 4UDQA 4H2QA 1K0JA 1ZGNA 3NIVA 1O85A 5E4WA 1L0VA 3VRDB 2Z5YA 3AE1A 1XWKA 3BOAA 4HOJA 4J56A 5HXIA 3LGCA 2XVJA 2H70A 1RW1A 1XANA 1OYJA 3AE2A 3I69A 5J7XA 1AW9A 5F07A 2LQOA 2M46A 2JB1A 3IRAA 4QL9A 1RYIA 3IK7A 1BF3A 4TR1B 4F0CA 3EANA 2K18A 4PUFC 3VLNA 4C74A 2C0GA 1VDCA 6GSVA 1TU8A 3L1RA 2LRTA 1TK0B 5ER0A 2H0HA 4JRRA 5C00A 1O7UA 3ED3A 4DSQA 3CPHG 1P2EA 2WGRA 1M2AA 2GSSA 1AQWA 2F8AA 2HNLA 2HRNA 2YV9A 2C70A 1MD4A 2XVFA 4G19A 1N4UA 2CFYA 3F8DA 2CZ3A 3E9JB 1DE1A 2F5ZA 3ERFA 4L8EA 4XIHA 1QMVA 3PVCA 3N5OA 3P4RA 3ZFBA 1HNCA 3HZ4A 2FHEA 1B5QA 1USBA 1T7PB 3EWLA 4NTDA 1K0NA 2LQQA 1PKZA 5AGYA 5DCHA 4EDZA 4BK3A 3AEFA 4IQAA 4V1Ag 3ICSA 1K0AA 2WPCA 3AE4A 2GVPA 4F82A 3F3QA 3UKPA 1W4VA 2E0QA 3UOXA 1PN9A 1S3DA 5ELAA 2I1UA 5CRWA 1IUTA 4YWOA 2IMDA 4EQXA 2ARDA 5CRDA 1OC3A 4GXZA 1YQZA 4H50A 1ERWA 2L4QA 2QKEA 2ZBWA 3KD0A 3E0UA 1DOBA 2CT6A 2TMDA 1GWCA 4DGKA 2PUKC 1S3AA 3KMNA 2MMNA 3FMWA 2YPMA 4X43A 5HFKA 2WJUA 1GLQA 2H88A 2FWEA 2AAQA 5E59A 3FYGA 1OC8A 1TXXA 3ICRA 2RLIA 1J08A 2VLUA 5LNKe 3QSEA 3D4TA 4POBA 3SBCA 3NYCA 2JZSA 4DSRA 2Q6UA 1KNGA 1A0FA 1JRXA 1EGRA 1A0RP 4TXOB 3P4PA 2FA8A 4LU6A 2X8CA 2MMAA 3U5RE 2VVLG 3UKKA 2WB9A 2GMJA 1GUMA 4RQRA 5DALA 3UTHA 5F05A 4K5SA 3M8NA 1OKTA 4I59A 4J31A 2C80A 3M0OA 2YLSA 1BKWA 3SFEA 1F3AA 2GQFA 3R2QA 4K7IA 3LXDA 4IKHA 3T37A 1VF4A 2C0DA 2IMKA 1ZOFA 4FK1A 3AWIA 4IP1A 2VO4A 4G9HA 3AD7B 4OMVA 4Z43A 5G30A 1GSFA 1N4WA 4A6NB 1O94A 4EL1A 2R6KA 5GZZB 5EB4A 2QA2A 3KTBA 1TYTA 1H81A 3HYPA 1P2HA 2AQJA 5L46A 2DJ3A 2C65A 4Z44A 4WKWA 1PX7A 2LJAA 1JU2A 3UKHA 1Z9HA 1JOAA 3MNGA 1LBKA 3HJOA 2DLXA 1GTEA 3LWAA 2JB2A 5D93A 4H2NA 1GTUA 1PN0A 4MMMA 5ECOB 1MTCA 2R3XA 3P2AA 4AT2A 4NEWA 4H4WA 4AOXA 4KDYA 1LU4A 3CGEA 3DYRA 4EMJA 1TI3A 2CQ9A 3F6FA 2QA1A 1K0LA 1YQ3A 3NK2X 2AHEA 4GRFA 2G2QA 1SD9A 1UA5A 3Q18A 1N1PA 1PSQA 1DJNA 2WOIA 2VD1A 2C64A 4IGJA 5H5SA 2OLNA 4OFNA 4TM4A 5CYYA 3RHCA 3CSIA 4EXJA 3C4AA 3NKSA 4J34A 5M0ZA 1XWAA 2LTKA 2UZZA 1THXA 2HYXA 2X8HA 2OJLA 5L71A 3ABVA 3EINA 2GT6A 1MDIA 1GRBA 5GSNA 4AP1A 4O7HA 3NK0X 2PPTA 4PURA 3D6IA 4H86A 3PO7A 3A2WA 4E8HA 3CNSA 1TP9A 2C72A 4Z2TA 3LYKA 1JNRA 4K5RA 3NZNA 1M64A 4N10A 1ML6A 4AJ7A 2CX3A 1JFUA 4J2FA 2VLVA 3HHVA 3QSMA 1ACVA 2GV8A 1FW1A 2HSYA 4HZ4A 2NPBA 1QFNA 2X3NA 3DGQA 4ZBBA 4ULXA 1GH2A 2K9FA 1TDEA 2H1DA 5ECMB 4KCEA 1FEAA 3ERGA 5AIVA 4ZILA 5LD0A 2QSIA 4MJWA 2YN1A 2NVKX 1X5DA 4EQSA 2ON7A 5ECNB 1UKVG 4J33A 1NPXA 2FWFA 3HA9A 1ZY8A 3UJ1A 3UKQA 1I9DA 5HHFA 1JZDA 3P4SA 4JQ9A 4IVMB 1N4VA 3PH9A 1XDIA 1SK2A 1CC2A 4XHMA 2WS2A 3B6DA 4Y4MA 1V57A 2R0GA 3ZYWA 1XFLA 3OZ2A 4AF2A 4RG3A 5D9WA 3RPNA 1VF3A 2H6ZA 3DA1A 3MAKA 2H0IA 2C76A 2A2RA 4KA0A 2JZTA 1SK1A 4B64A 4N30A 1AOGA 2GZPA 2YJ7A 1NG3A 1B4QA 3O6TA 2R5GA 3AY8A 1ZL9A 6GSSA 3TJGA 1G7EA 1GSEA 1S3BA 2AB6A 1COYA 2PBJA 4DSSB 2C66A 1X31B 2ZZ0A 3FHKA 1NHSA 1TI1A 3WT1A 5ID2B 1XW5A 1K4QA 1KSSA 4YQVA 2GQMA 4ZBAA 3L9UA 4XS6A 1X5CA 2HE3A 1SJ6A 1TDKA 4J57E 4MDCA 1EWXA 1O8XA 5D96A 2KOKA 4KSMA 5CRGA 4EF0A 4OPDA 3C1RA 3ZVJD 3AE3A 1AQXA 4GF7A 1JLWA 1J9BA 4GRTA 3IE3A 5F0GA 1CC4A 2FJEA 2MBSA 4AP3A 2GGTA 3AYJA 1H82A 4ZCCA 1U3AA 5ECQB 1DSBA 1JZOA 5IQYA 2BYBA 5DBJA 3BNMA 2Y6RA 1GV4A 4AJ8A 2Q0KA 1V2AA 5HR2A 4JBBA 5IO2A 1F6MA 1I5GA 2FWHA 1O5WA 1GPEA 5U1OA 2FY6A 3VPTA 1GUKA 1K0MA 3II4A 4EUYA 4K7NA 1JEHA 4QL7A 2O89A 2JADA 1O73A 1PD21 1IUUA 22GSA 4TKYA 1SU9A 5HFIA 4JU5A 1H86A 3J7Yk 2FD3A 2KP1A 1V9WA 3AE8A 2JAEA 4MZWA 2AUVA 2C0FA 4RG4A 1KTEA 3ISOA 4J57A 4XS1A 4WX1A 2IWTA 5HQPA 2C3TA 2R46A 4YSXA 3IDVA 1F8SA 4H4RA 5D9TA 3Q19A 4LLRA 4OPGA 2AV4A 3CNPA 4REKA 3TJFA 4YTNA 1BX9A 4U8NA 2XC2A 2HLSA 3C7MA 3HDCA 4K7ZA 2YZUA 4EQRA 2PWJA 4N11A 2WDQA 1F37A 2LRCA 2V3BA 4OVIA 1WOUA 3HCZA 4H4QA 1X9WB 4Z24A 1EP8A 1WMJA 1HD2A 2PN8A 4V2NA 2PU9C 3GA4A 5ENUA 2W0HA 2IMEA 2C3DA 2OBIA 3KXOA 2IPAA 4JY2A 1V58A 2CA8A 5KOWA 1S2QA 1PL1A 4PNFA 1J0FA 2YLWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KH7 A;  2B1K A;  2POD A;  2YQU A;  2VLT A;  4RSL A;  3EE2 A;  4HU9 A;  4IHC A;  1S2Y A;  1GSY A;  5KXJ A;  2GVC A;  3HYX A;  1JCT A;  4WF5 A;  3IHQ A;  2AL2 B;  3IK9 A;  3DEQ A;  4ZL7 A;  2QVH A;  1RQM A;  2GMH A;  2NDO A;  4B68 A;  3G9B A;  1PHH A;  3OR5 A;  4GIS A;  1IUS A;  4LII A;  3IJQ A;  4FP1 A;  5G31 A;  3R9U A;  4H4Z A;  1OVN A;  4YKG A;  1L9D A;  3AED A;  3KIJ A;  1IYI A;  3T2Y A;  3CPI G;  1XHC A;  2OE3 A;  1O8W A;  2BXR A;  1G6Y A;  2OZT A;  1PXA A;  4IEL A;  3SY4 A;  4D73 A;  4I2U A;  5KMP A;  2E1M A;  4OFT A;  2CAI A;  1GP1 A;  1SKR B;  4EC0 A;  2ZCT A;  3HD5 A;  7GSS A;  2P0G A;  3T6C A;  1CJ3 A;  4L5O A;  2PTY A;  2JK6 A;  1T00 A;  1YKC A;  1GRH A;  1F3P A;  5F8B A;  1OKD A;  2D2Z A;  3ZIT A;  2L59 A;  1NAA A;  5G5G B;  4HDE A;  3AD8 B;  3RBT A;  4Z2R A;  2ES7 A;  3APO A;  5J3R A;  2APG A;  2XVE A;  3SQS A;  3AM9 A;  2H30 A;  4N0V A;  2CUL A;  2XHF A;  4CY6 A;  2L5O A;  5KRQ A;  1MO9 A;  1R7H A;  3OZM A;  2VQB A;  1N60 C;  3BI5 A;  5G5E A;  4Z2U A;  5INY A;  3QFB A;  2YOI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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