2X8GA

Oxidized thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 193
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8gA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8gA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA03
4C77A 2GQMA 1P2HA 2XBQA 1PQNA 4KCAA 2V41A 2O85A 3LYPA 1H81A 4ULXA 2YPMA 3RHCA 3NYEA 2VUPA 1SENA 2B5YA 5ELGA 4PQ1A 3I69A 1ZMDA 2C1YA 3OR5A 1XFLA 1ZY8A 3H8LA 5C2TA 2BS2A 3ZRDA 5D9TA 2FHEA 3UOVA 4ZCDA 3GHAA 1OJCA 1ZK7A 3H4KA 2PUKC 3F3RA 3AE8A 5HR3A 3HJOA 2JADA 5AISA 2HYXA 3F8RA 3ZLPA 1NG4A 4MDCA 3FPZA 2PWJA 5BVAA 3DJEA 4H86A 3CMIA 1O95A 4WF4A 4K9ZA 2BK5A 1AQWA 4AOSA 2XFQA 1QMVA 1PS9A 1HYUA 3HZ4A 4K5RA 2YLSA 4HZ4A 1XZOA 3BI2A 2PVQA 2HFDA 2WHDA 4NPBA 5KOXA 6GSWA 1D4CA 3NRNA 1D4EA 5F06A 4KCEA 2MBTA 2H1DA 3TRPA 1S3DA 2H1GA 3SGLA 1NENA 3ALJA 2IFQB 1B4PA 2YWOA 1K0LA 3F8DA 3KMOA 3HZLA 4EQWA 2TIRA 3ICSA 4ZBDA 2BC0A 2R45A 3QCPA 2FCHA 2WBAA 5KXJA 4CW9A 1UVZA 4LU6A 2CZ3A 1T1VA 4MH3A 5DCGA 2YR6A 5AN1A 4H2RA 3J7Yb 4DSGA 4OCEA 2JSZA 1ZOYA 3AD7B 1TXXA 3M12A 2R3XA 2IVEA 4DSRA 2R46A 1T00A 2BTOT 3AE3A 1X0RA 3FW2A 3QDNA 1K0BA 4TXOA 4K7OA 5FHIA 2R0GA 5EOWA 3DXBA 5JCMA 1Z6NA 4NMUA 3ZREA 2VQ7A 4K7ZA 2HNLA 4H2PA 1DOEA 4JNAA 3GKXA 3CSHA 4EE0A 1GRAA 1UKVG 1TJDA 2E5VA 3L1RA 3UAPA 1BGJA 5CRWA 3GL5A 1D5TA 2GQLA 3WGDA 4H4UA 3O76A 1H82A 3LG6A 3BJ5A 1T4ZA 3UOZA 4QQ7A 3C4NA 5EBKA 3PO7A 3L8KA 4CNJA 3CTFA 1XWKA 4YQMA 4HOJA 3C71A 1UN2A 1XXUA 4OPUA 3AE1A 2YG5A 3EINA 4WBJA 1SD9A 4AF2A 2GAGB 2V6OA 1TRUA 2EIRA 4CHSA 4RG3A 4REKA 1KFYA 1VQWA 2FGXA 4PURA 4B65A 3IK9A 3L4NA 1GUMA 1FW1A 4ZILA 1XIYA 1JLVA 2X3NA 1GOSA 2VL2A 2V3BA 3P4QA 3F6FA 2LRNA 5GSTA 5ELAA 3AD8B 4YAPA 4IP1A 1BQ7A 1A2LA 4RG4A 2H75A 3U6VA 2QA2A 4C5OA 3HJMA 5FS8A 3EANA 2CVKA 2BACA 3GTUA 2BCPA 2XFUA 3KLJA 3EWLA 4CDOA 3NG7X 2YZHA 1M9AA 1THXA 2E2MA 3ZMKA 4KAEA 1KNRA 4NTDA 1OAZA 1BYEA 1DOBA 4YKGA 3DK9A 4U8OA 4DSSA 3RP8A 5J3RA 3GKNA 3KU9A 4A5LA 5KRQA 4TM3A 4PX1A 3UKFA 5DAKB 2CV4A 3HZ8A 2NPXA 4BV6A 3UARA 5LNKe 3CPIG 5COHA 2V1MA 1YEPA 3ITJA 3F8UA 5A5KA 3PH9A 1TDOA 2C8UA 4A6NA 2HRNA 1XOBA 5H5SA 1YEXA 1RK4A 4NXIA 4FX9A 5HFGA 5IOWA 2GH5A 2DJ3A 1YQZA 3ZVJD 2CT6A 1IUVA 1B4VA 3FK8A 5J9BA 4BVYA 4NZHA 3L78A 4OPCA 2C7GA 1GRFA 1GP1A 4WR4A 1PDHA 1OC8A 3Q6JA 1PMTA 2B5EA 3C1RA 1Z7RA 1OJAA 1M2BA 3QFBC 1PX6A 4MLYA 2GVCA 1USBA 1TI1A 3TKSC 4CY8A 4G2EA 1M9BA 2IMKA 2GF3A 1ONFA 4V1Ap 2OACA 3AXBA 1FG4A 1CJ3A 3TJGA 3HKRA 2C73A 1EEMA 2HLSA 4YH2A 2Q0LA 5JWRB 5AIXA 3SFEA 2O7KA 5JCIA 1GTIA 1JHBA 2OKAA 3DVXA 1TRWA 2J9HA 1C72A 1BZLA 2YP6A 2YWMA 4HA6A 4B66A 2RLIA 1EWXA 4MF6A 1N4UA 3CNDA 1GRTA 1TK0B 4DGKA 1QLBA 4I97A 5GSSA 4WX1A 4BK3A 3IV4A 1JNRA 1W89A 4GRFA 2BYBA 3FZ5A 3ED3A 1FEBA 2VL3A 2GLRA 5HR1A 3ERWA 3P8WA 4TN8A 3RP6A 5GAND 1W4VA 1NW2A 3GYKA 2C4JA 1Q4JA 1N2AA 3RDWA 4PUAA 4F03A 1S3EA 2A89A 1F6MC 4O5RA 4J56A 4EMWA 1CC4A 1U3AA 2XFPA 3GSIA 4HS1A 4XWRA 3EU4A 3QFAC 3CXGA 2VCXA 3H8QA 3ZTLA 1BEDA 2GSQA 4OVIA 1E6BA 2F8AA 1T8EB 4PUFC 3RBTA 1K0CA 2L6DA 3BOAA 2WEUA 5A4WA 2V32A 3EU3A 4E8EA 1CJ4A 3F63A 1LU4A 1GESA 4GSSA 2CAIA 3CRUA 2P5RA 5ECSA 2B5XA 5IMZA 1QJDA 1QK8A 3QSMA 1ZYQB 3GMCA 1JZOA 1PBFA 3D5JA 4G10A 4LA1A 4J2WA 3NLCA 1AIUA 3UEMA 4MJCA 4MF7A 3V76A 1DXLA 4XHMA 3L9VA 3VRAA 3UVTA 4TM4A 1GEUA 1U87A 5FMHA 4Q5FA 2B7JA 1QO8A 1JEHA 4JZQA 1NHOA 3VWWA 3NIXA 4YAVA 1K0JA 3L9SA 4XRDA 3FR6A 3E3EA 1AXDA 2CVDA 3TKQA 3NYFA 4H7UA 2NVKX 2YAUA 3IPZA 4LMWA 1BX9A 4L0WA 5FT3A 1PJ6A 2DKIA 1K0OA 1EP7A 4HUAA 3DJDA 3P4PA 1GSDA 3KP9A 3UVHA 1XPQA 1AAZA 2BXSA 1OC3A 4ML6A 2I1UA 4D73B 4IA6A 4ZB9A 2WETA 2YVFA 3GRTA 1V40A 3L9UA 2ZNMA 2YLRA 1GTAA 3US3A 4HU9A 3ERFA 3AECA 2OAMA 2GZZA 1E1NA 3VPQA 1V57A 1TYTA 2JKCA 1OC9B 4N30A 2BS3A 2H6XA 2XLPA 5DALA 2N5FA 4EIQA 3H1NA 3UBKA 1R4WA 1Z5YE 3ALLA 4MMMA 2I81A 1OJDA 2C64A 3BHFA 3K8NA 2VO4A 2E2GA 4Y4MA 3ZDNA 1K0IA 3ZIJA 4EQRA 4OWYA 4USRA 2BK4A 2WPFA 1X5EA 3WGXA 4EUYA 3UTHA 1M2DA 3NK1X 2RGJA 1K0MA 2WB9A 3DRNA 2PHHA 5EB4A 2AUVA 1GUKA 3GN3A 1TTZA 3QMXA 4RSLA 3FZAA 3M0OA 4OPIA 4DNAA 2TRCP 4OPDA 2ES7A 1SL0B 3P1WA 11GSA 3AYLA 2R5GA 5INYA 1PA3A 2GMHA 4JBBA 1QUWA 1TYPA 1TRBA 2WP5A 2VVLG 1GPEA 2H70A 3PINA 1FVJA 2C0GA 3DIEA 4G9HA 3S5WA 4AGSA 1PKWA 3VLNA 4TLZA 1JRXA 2Z9SA 3GURA 4E8HA 3UKAA 1GRHA 3RAZA 2FLSA 5J9CA 1LPFA 1G7OA 2GSSA 4ISDA 5J60A 5F07A 1I9DA 3V3NA 4MF5A 1YQ3A 2H74A 3DMEA 4H2QA 4XCSA 4U2SA 2WP6A 2YVGA 1FVKA 4HQZA 5ID2A 1E6EA 16GSA 2XCGA 4GUVA 3ICRA 3IHGA 4KH7A 2DMLA 4IQ1A 1B4QA 1XWBA 1TU7A 2KLXA 2HZFA 2OA7A 1DSBA 2HT9A 2LNSA 2PERA 4GDPA 3ATQA 1L9EA 3QAWA 3PVCA 4H4YA 1JZDA 1V2AA 3AY8A 3CPJG 4V2LA 5CKUA 5DBJA 3WT1A 3RHAA 4WF5A 3GDPA 2WOVA 5IPYA 2REMA 1NEKA 1GNEA 1ZYEA 3G7JA 1Z3EA 2QKEA 3KEBA 3LSZA 4KDUA 4EQXA 1CJCA 5D9VA 2F3MA 1BJXA 4GCMA 1SKRB 3P7XA 3CGDA 2JB3A 4TR1A 4OPLA 3AEFA 3WYWA 2AAQA 2I9HA 1RYIA 3BI5A 4B1BA 2YQUA 1MO9A 4GR1A 2JSYA 5ECQB 4XXGA 4RQRA 2KP1A 1HD2A 1JFUA 2GT6A 3LXDA 2LJKA 4XS4B 2JZSA 3M3MA 4P9SA 3UJ1A 4D03A 3CNJA 2HI7A 4NTEA 5JCGA 4IS0A 2WESA 5D73A 5HQPA 4TW5A 2G0FA 3KMNA 3KJYA 3FR9A 3F4TA 4FYCA 3ZFBA 3TCOA 2NBSA 2YLZA 5HR2A 1FAAA 3WE0A 1WP0A 4GQFA 4ECCA 1MOKA 2JB1A 4O92A 2RUEA 2BXRA 1PN9A 3H79A 1Q1RA 1GH2A 3QR6A 2PBJA 4OPGA 2GR3A 2IMEA 4ZIJA 2CFYA 4NV5A 1NG3A 2GQFA 4J34A 5CRGA 3AE7A 3C96A 2YLWA 3U5RE 3D8XA 3KGKA 5C04A 1RSGA 3NZNA 3G7IA 5CNWA 1A8LA 4PQIA 4U8LA 4H4VA 1Y25A 1I5GA 3GH6A 2GZYA 1VRQB 2H19A 4B64A 1Y56B 3BI4A 3M0FA 1NHSA 5D8IA 1E1KA 4H4RA 1JRZA 3QJ4A 1BKWA 1PBDA 5HY5A 2A87A 4KE3A 6GSSA 2VIMA 2C76A 1ZOVA 4F2IA 2WDUA 1AUCA 4OCGA 1GTHA 2OBIA 1CF3A 2PGTA 3C8EA 3D21A 5M10A 4V2MA 3DGQA 3E0UA 2IMIA 1PL1A 2CDUA 1NHPA 4J56E 4JNQA 2X8HA 3GFKA 4KDXA 5DQSA 4EVMA 4JRRA 5IPGA 2P5QA 3QSSA 4Z26A 2EIOA 3FR3A 2LSTA 1SKSB 3F8PA 2C75A 4ZBBA 1WJKA 4BK1A 5CYYA 2PVOC 2A2SA 2VM2A 2YZUA 3EMPA 3M9JA 4C74A 2KOKA 3URHA 1G0TA 2KHPA 2DMMA 4XIHA 2WZ9A 3KM6A 4H4TA 4HDEA 1AQVA 1NSWA 5G30A 4WBRD 4YSYA 2TMDA 1M0UA 4OD7A 4TR3A 5AIVA 3FBSA 4AT0A 1IUTA 3GIXA 3FY7A 4O32A 2LJRA 4OO5A 3Q9TA 1FL2A 1TDNA 1M2AA 2VD1A 2VM1A 4AJ7A 2H1AA 3A3TA 2LTKA 2B3SA 1G6YA 2C3DA 4GCIA 1KNGA 1DE1A 3TKRA 1OYJA 1S3AA 3V3OA 3GV1A 1SEZA 4Z25A 4TM0A 2B6MA 3OZ2A 2B7SA 2D2ZA 2EQ8A 1PKZA 1B9YC 4Q5RA 3RHBA 4LL1B 3NKSA 2PPTA 1TRVA 1B37A 3CGCA 2XLSA 3VK9A 4GTUA 1TK5B 3DH9A 4EMIA 2PMTA 1GSEA 1J0FA 3KD9A 3GDNA 3AE6A 4J57A 1SD8A 4F0BA 4IV9A 10GSA 2KP2A 4ZN0A 4KPRA 1PL2A 3C4AA 4TXOB 3IWAA 3K7TA 1ZP0A 1QQ2A 3KXOA 5D96A 3ADAB 3HVVA 3AB1A 4OFNA 2DLXA 3DJGX 2APGA 2XVHA 2RGHA 4JDRA 4O5UA 3LYKA 4A99A 2WDVA 4NAXA 4EKZA 3TOUA 4TOPA 1O85A 2K8VA 5F05A 2C3TA 5LV9A 2XFOA 3KIJA 4TLXA 3ISOA 3CGEA 2L59A 1XBSA 2TRXA 2XHFA 2GMJA 3IXRA 5ECNB 17GSA 5JCWA 3Q74A 4OMVA 2N5AA 3TUEA 2X8CA 3NK2X 1PXBA 1HNCA 3JCML 2IIDA 4GRTA 2CAQA 1WE0A 3O3TA 2WGRA 3WD6A 3A2WA 1FOVA 1GALA 3PR8A 2B7RA 3DD3A 4IVOB 4USQA 2VCTA 1AOGA 2I4AA 2LKUA 3GKMA 1XW6A 3HYPA 3O6TA 3AEEA 4Z2TA 4BWSA 4K22A 2LQOA 3IC9A 3AEGA 4MJAA 1T4YA 2CVBA 3P9UA 2NDOA 4KB3A 1X5DA 5B7CA 3DYRA 3OC4A 3IRAA 19GSA 4AP1A 2MMOA 4U2LA 2FJAA 3K30A 5G5FA 1U88A 2WCIA 4EM3A 2WOWA 1FB0A 2NVLA 3GTUB 2QC7A 5ECIB 3ZMLA 1N4VA 3GYIA 3KH7A 2NTOA 5JCKA 5KEJA 4DSSB 2B76A 1XOAA 2XC2A 4A9WA 1MDKA 2ON7A 4EF0A 3IHMA 3G9BA 3AYIA 4UDQA 3NK0X 1X9WB 1F8RA 1PGTA 2LRTA 1ELIA 4AJ8A 3GRXA 4A6NB 1D4DA 3B3RA 2YM2A 4IVFA 1H6VA 4BA7A 3NT6A 5JWOB 2HSYA 4N0ZA 1S2QA 4E0VA 2W0HA 4H4XA 3F4RA 2HSHA 2OALA 3KVEA 4FK1A 5KN1A 4L0UA 1GSSA 3CGBA 5ECHB 1K3OA 1ILOA 4K5SA 3VI5A 1SKWB 2YJHA 3TDGA 3N5OA 2BK3A 5JCUA 2HXKA 4BL7A 1ZMCA 3GSSA 3D0ZA 3D4TA 4N11A 3TGZA 1F3PA 1ON4A 2H01A 3ZZXA 5BRTA 1LBKA 4M52A 1WRYA 1FHEA 2VAFA 4EMJA 2ZUPA 1ZKQA 1WWJA 3O0HA 1LTXR 1O81A 5TR3A 4MK3A 5CO3A 1XANA 1IUSA 4AJ6A 3ATRA 4ECHA 2DC5A 4HB9A 5ECLB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1M64 A;  3S61 A;  3ME8 A;  1MXT A;  4Z44 A;  4POB A;  1WOU A;  1CC6 A;  2MYG A;  2AHE A;  3H12 A;  4KX6 A;  3GWD A;  1JLW A;  5LD0 A;  1SJ6 A;  2V61 A;  3T31 A;  2OZ8 A;  4GLT A;  1CQG A;  3GMF A;  5IO0 A;  4FH8 A;  4OPT A;  3D47 A;  2VCV A;  4CY6 A;  5CRD A;  1Y56 A;  2P8B A;  2AB6 A;  3HVN A;  3MSY A;  3H93 A;  4RI7 A;  2CVJ A;  3TRQ A;  1LV0 A;  4K7I A;  1K4Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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