2X8HA

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with gsh
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 192
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8hA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8hA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8hA03
4XTSA 1V58A 3KTBA 2YJ7A 4TXOB 4KDYA 2IMIA 4GSTA 2V60A 1OJDA 1I5GA 5B6MA 2LTKA 4B68A 1Y56A 4EUYA 4KGIA 2LRNA 3FEUA 1IUUA 1FB0A 4KSOA 5B8AA 1T8EB 3ME8A 1GRTA 1SJIA 4MJBA 1BF3A 1SL1B 2HE3A 5F07A 1FVJA 3G5QA 5HR2A 4XWZA 2F5ZA 4RI6A 1EOGA 4KH7A 4RI7A 4CRTA 2WHDA 1IUTA 4LLRA 5FHIA 3K7QX 2XLTA 1GNWA 2B9YA 2C76A 5CNWA 2CX4A 2GR0A 5GSTA 2ACZA 4OFNA 1TRWA 1YEPA 3HD5A 4EXJA 3V1WA 1OAZA 2BC1A 3UJ1A 2C1YA 1COYA 2WDVA 1OC9B 5J7XA 3HVXA 5ECIB 2JU5A 3FZ4A 2LSTA 4Z25A 4YKGA 3VRBA 2VIMA 4B69A 3HJOA 2IJYA 2WOWA 4H50A 3C96A 1O73A 2B7KA 3LG6A 2NPXA 3HKRA 3TRQA 4RSLA 1MTCA 2H76A 3GTUB 1NHYA 4YQUA 3TKQA 2KP2A 3BCIA 2B5YA 1EGOA 3I3LA 2IMKA 4B65A 1KEBA 1SL0B 3ITJA 3M0OA 4ZL9A 3D4TA 1ST9A 4FYBA 4PQ1A 3CPIG 3C1SA 2DKHA 2BMXA 3W8SA 2Z5YA 3H8QA 3HHVA 2DJKA 2VL2A 1Z7PA 5J60A 2H01A 1S2YA 3GYIA 3EURA 6GSYA 5DALB 1B4VA 1XANA 3DJGX 1W4VA 3F4TA 1PBFA 1DE2A 3ALLA 5L46A 2L57A 3A2XA 2VRMA 1F6MC 5CP1A 4HJMA 2VVMA 2YZHA 1KNGA 2QKEA 1G7OA 6GSSA 1A24A 5D8IA 3F0IA 3VWXA 5C04A 1REOA 3CTGA 4AT2A 2KP1A 2XVIA 3TKPA 3IBHA 4LMVA 1HNCA 1D5TA 1UVZA 4C3XA 3ZFLA 3R9UA 4G2EA 1PBBA 1ZP0A 3VI5A 2P5QA 2AAWA 1LU4A 1M64A 2BXSA 1XOBA 3KXOA 4QL9A 3UARA 2BYBA 1BEDA 3SQPA 3AEFA 4CW9A 1XWAA 1B8XA 2FA4A 2YG4A 4YTPA 6GSVA 3TOUA 2R46A 4U2SA 3F6DA 4MF7A 2YVGA 5EY6A 4C74A 1ZZYA 1TDKA 2Q6UA 1P2HA 3D4MA 1ZOFA 1DNCA 4MDCA 3QFAA 2YN1A 3ERWA 1GRXA 3QFBA 2FJEA 1VGLA 5F0GA 1O94A 3RHAA 2JZSA 1EL5A 3ZIJA 3SFDA 7GSSA 2YM1A 4OCEA 2WGRA 3GKNA 4OO5A 4K22A 3EVIA 1PBEA 3L1RA 5KN1A 3NH3X 4BK2A 1FAAA 1Z5YE 1VG0A 1YQZA 3F8UA 4OWYA 4MABA 3TCOA 1YKJA 4TR1B 3KJYA 3KP9A 3HJMA 1NEKA 4MZWA 2VLVA 4U8LA 1ZMAA 3UP4A 4FIWA 1XXUA 3HVSA 1URMA 2C0GA 2HXKA 2JSZA 5DJMA 3LFLA 3NZNA 2B76A 3AYJA 5KWFA 1TYTA 1YY5A 1KNRA 4K0GA 2J9HA 4PQIA 2HSHA 2DIYA 3GKMA 3EC3A 4V2LA 3HZLA 1Q1WA 3VLNA 4C77A 2H72A 3LGCA 3CPJG 2QGVA 3RAZA 3RPNA 3ZVJD 2B7SA 2PVQA 3UKHA 1H84A 3FRCA 2JACA 3ABVA 1GSFA 1Y25A 1PJ7A 5CRHA 1FECA 3L9SA 4OPUA 1F2EA 3UKKA 2DMMA 2B7JA 1TRVA 1WPIA 2VOCA 3U6VA 3CGEA 1GSQA 3NHOX 4EQXA 3ISHA 2CZ2A 1WWJA 4WX1A 2GQKA 2OA1A 2V32A 2XFNA 2YCDA 1HNAA 4GDPA 3ERGA 5KEJA 1NHOA 2X3NA 3C1RA 2VCQA 4HQSA 2PYXA 2V6KA 5G2ZA 1QXHA 5EB5A 4MZBA 4U2LA 3P7XA 3PO7A 3FKFA 3O76A 2HYXA 3IAM2 4H2RA 3RDWA 4OCGA 2OA7A 1J0FA 1XWBA 4K7NA 1N4WA 2AQJA 3VQRA 1O8XA 1PL2A 1N1PA 5JCKA 2C67A 4J57A 2I3YA 1NPXA 2C72A 3IK9A 2YP6A 4H4RA 1TU7A 4KCEA 1O81A 4IJ3A 1TTZA 4JZQA 2PBJA 1ILOA 3G5SA 2CAIA 2OE3A 3J7Yb 4I97A 5ABRA 3I69A 2C0FA 1X5DA 4ML6A 2IFQA 3NOFA 1TW9A 4TM0A 1PMTA 1X5CA 1TOFA 4NMUA 1PGTA 1M2AA 3Q6OA 1TK0B 1Y0PA 2EIQA 2XVFA 3LB8A 1GRGA 2EQ6A 3KMOA 4YQMA 2WDQA 1BWCA 4DEJA 2WCIA 4D04A 2YLWA 3UBKA 1AQVA 4MF5A 4IVMB 18GSA 1PXAA 3DMEA 1B8SA 2DC5A 4Y4MA 3ERFA 1SD9A 1Q9IA 1H7WA 3RNMA 3F4RA 4EM4A 4ECJA 1PSQA 3KM6A 2GV8A 4JR6A 3TOTA 3F9UA 1UKVG 2FJBA 2A8XA 3GFKA 3GX0A 2H0IA 3GURA 3VWVA 5GRTA 4NEVA 2WESA 2GB0A 2CZ3A 1CBOA 4EMJA 1P2EA 5DCGA 1TI1A 5IQ4A 1XPVA 4O5QA 1D4CA 2IVDA 2FCHA 1OC9A 3VURA 2DJ2A 2MYGA 3GDPA 4NTEA 4PNGA 2XPEA 3F8RA 2BA9A 2F9SA 2K9FA 3ZYXA 4AT0A 3GUSA 3SGLA 4IA5A 2C80A 4KSMA 3CNDA 2VUPA 3NRNA 3DJEA 1S3EA 1Y6EA 4O5UA 3EAOA 1EOHA 1NHSA 3GTUA 2GQWA 3TJKA 3UVTA 2YNXA 3Q9TA 3C71A 4D73B 2L59A 4F0BA 3ED3A 1PKZA 1FEBA 5M0ZA 1EL8A 2GT6A 2LUSA 2E2MA 4BURA 3SWLA 1VF1A 2C8UA 5KOXA 4WBRD 5IMCA 4PNFA 2C0EA 3DEXA 4U8MA 2E5VA 4B66A 2H66A 3ZVJA 1DODA 4CCRA 3CTYA 1OYJA 3EE2A 3WGEA 2R0GA 5DALA 5LNKe 3LXTA 2VOUA 1QUWA 3DK8A 3QPMA 1ZY8A 3M8NA 2CAQA 4ZCDA 2TRXA 1K0DA 3UOXA 1OKDA 2IIYA 4TM1A 1PD21 3LWAA 2X99A 1DJQA 4ULXA 2YPMA 2B9WA 3AEAA 3EWLA 2E2GA 1K0OA 3AD8B 4MLYA 4O92A 4Y4LA 1ERVA 1EV9A 4ZXGA 4EDZA 2B5XA 1Z3EA 4U8KA 3A3TA 2TIRA 3TB2A 1DOCA 3JSKA 5JCGA 4Q5FA 1E1MA 3AE3A 1XZOA 4OO4A 1VF3A 2VD1A 4HUAA 4WF5A 1SJZA 2RGHA 4EE0A 3NYEA 1E6EA 3UIWA 2GSSA 4APNA 5DBJA 3EPTA 2O87A 4HZ2A 2L5LA 4HB9A 3D21A 2DIZA 3M3MA 2E4GA 4K2XA 2FWFA 2CVJA 3NTAA 2MMOA 2BJXA 1EP8A 3ZTLA 2XDOA 5C3JA 2XLSA 3GNJA 3C4AA 3KD0A 4EF0A 3C4NA 2WS2A 3IOSA 3G5RA 3CGDA 1K3YA 3LZXA 4ECBA 4TM3A 4YT0A 4K6XA 4GR1A 4PUAA 3DJDA 2GVPA 1KNPA 3FMWA 3F8PA 4POMA 2N5AA 3CMIA 4H4PA 3I43A 3KEBA 3GA4A 4JNAA 2C3DA 4TRXA 3HA9A 4MCUA 2JK6A 1MDKA 4CBQA 2YAUA 2VCTA 4A99A 3A5WA 2GT5A 2B9XA 2C3NA 2B1KA 5J4UA 3QSMA 4ISDA 4BVYA 3L8KA 2FWEA 2JBVA 2XYOA 4PGTA 1MO9A 3EF6A 2QAEA 5AN1A 4EDYA 1SYXA 3NLCA 3V76A 2C3TA 3WGXA 3LYPA 1D4EA 1FOVA 3V3OA 4USRA 3RP7A 2AJQB 3VRAA 4ZCCA 4O7HA 2GF3A 1GUHA 4JU5A 1M0UA 2JB2A 2WBAA 4D03A 2L6DA 4EIPA 2YV9A 2VL3A 1E1KA 4MZCA 2E7PA 1R4WA 4I8BA 5D9VA 1XHCA 2APGA 4HOJA 4LL4B 1YQ4A 2DMLA 2P5RA 3OR5A 5G5EA 4KUNA 4NAXA 2WQYA 2BK4A 5U1OA 4NWYA 1YKAA 1N2AA 3QDNA 2Y6RA 3KLJA 4N10A 2DJJA 3CRUA 1PN9A 3CNTA 3EMPA 1HD2A 5H5QA 2P0GA 1KDGA 4A65A 4XCSA 1CF3A 1F8RA 1JEHA 5FS6A 2PERA 4ZB6A 1X9SB 1GNDA 4FH8A 2WB9A 5F8BA 3UOYA 4Y4NA 4AJ8A 1XWCA 2WP9A 1LBKA 2K6VA 2B7RA 2H71A 3IA1A 4I59A 1FHEA 2FA8A 2N5BA 1H83A 1OVNA 4OFMA 2ARDA 4M52A 4XHMA 3LORA 1JLWA 3CYNA 1YDKA 2OAMA 4ID0A 1XOAA 4TR0A 1L9CA 5ID2B 14GSA 1YF0A 4BWQA 1L9EA 1OC8A 4YXDA 1CC4A 1Z7RA 1JRXA 2HZEB 4EQWA 1GH2A 4N0VA 5BRTA 3IXRA 4H2QA 3KCMA 3URHA 3BOAA 5J5NA 2V3BA 4QL7A 1CQHA 1E2YA 3KPFA 3M12A 4F82A 1AOGA 3CRTA 3IV4A 1BQ7A 5BVAA 2HI7A 5ECLB 4K7ZA 4GRFA 2FJDA 4Z2TA 5HYMA 1XBSA 3O6TA 3C73A 2L4CA 3M1GA 2H30A 2C65A 4UDRA 2VM1A 3PS9A 2BCPA 4WBJA 2YG5A 4Z44A 1WE0A 5ECNB 3AB1A 3IR4A 3GRSA 3KP8A 2X8HA 3PINA 5IM9A 4J36A 4C3YA 2YVFA 3REDA 3US3A 1GULA 3KH9A 4AF2A 2TMDA 2WDUA 3FHKA 4OPGA 4OFTA 1GREA 2F3MA 1JZWA 3CXGA 4F0CA 5CAXA 4GF0A 1NG3A 3ICSA 4IVOB 1K0MA 4BJYA 2H1DA 4V1Ag 1M6IA 1ZYEA 2LJAA 2YLSA 2EQ7A 3OC4A 2VCWA 1VF4A 1E7PA 5DCHA 3EU3A 3AXBA 4A7AA 1L9DA 4X0XA 5E59A 3WE0A 4F9ZA 1UA5A 4IJIA 4ECCA 4FYCA 3DYRA 3TKSE 5J9CA 5IQYA 3IPZA 4K1FA 5HFIA 3TKRA 4LA1A 3LYKA 4FK1A 3QVRA 1KTEA 2FY6A 1LV0A 5FS8A 1PBDA 3KVEA 1WMJA 2H73A 1DOBA 3QD9A 4TLXA 4XRDA 2BK3A 5CKUA 1U6TA 2RIIA 1VRSD 4TR4A 5DJLA 1GTUA 4MJAA 1S3DA 1PA3A 4JY2A 4MPFA 2GTUA 3R2QA 3GHAA 1AAZA 1ML6A 2PPTA 3KU9A 2RUEA 3DIEA 3TKSC 3ZITA 5BUKA 3ISOA 4JY3A 1TRBA 3GH9A 1GUKA 2I1UA 2BK5A 4EQSA 1IUXA 4B67A 2OE1A 3PH9A 5CREA 1V59A 3D0ZA 2VQBA 1EBDA 4EVMA 3D8XA 4MH2A 4KDUA 4AJ7A 3GYJA 3P8WA 5ER0A 2OBIA 3UKQA 1M99A 5ELAA 1BG5A 4RG4A 4H4SA 3LOVA 2PN8A 1H82A 4NZHA 3LZWA 1WIKA 1BKWA 1GSYA 3QOUA 4X1UA 1K4QA 2C66A 3SBCA 1HYUA 4IA6A 2EIOA 1LJRA 2H8LA 5DQSA 2CVDA 1BYEA 1CQGA 2VL9A 3CIRA 3T37A 4PUFC 3H93A 4Z2RA 4I5QA 2Z5XA 4DSHA 4I2UA 1USBA 3BNUA 1QFNA 5HFGA 3KD9A 4P9SA 1YZXA 4BVXA 1A2JA 3ALJA 2L4QA 3GSSA 4PQHA 2JSYA 5AISA 3SFEA 2HLSA 1PXCA 1O5WA 4Q5QA 4V2NA 2JKCA 1X9WB 1PS9A 4OCFA 2WPEA 2M72A 4TR3A 3TGZA 4TVEA 2PU9C 5JCNA 3ADAB 3AE4A 2XLRA 1CHUA 1K0NA 3DK4A 1T00A 1H4OA 2V1MA 1PKWA 2YOIA 1B4QA 2JAEA 2GZYA 1D4DA 4H4UA 3RBTA 3FZ5A 3IHGA 4L0WA 4O32A 3VPQA 3FY7A 3B6DA 4BWSA 5EPFA 1SK0A 5IO2A 1PJ5A 4TN8A 3GMCA 1WRYA 1C72A 3CSIA 5D96A 3AE5A 4Z2UA 4OMVA 3NK0X 1GXFA 5EVOA 4H4VA 5IMDA 4Z24A 2QSIA 2VZ2A 2YLRA 2XLPA 2GH5A 5DVBA 4XS4A 2YWLA 2WS3A 4Z7XA 2XBIA 1R5PA 3IC9A 1V40A 4KPRA 3F3RA 4UDQA 1WP0A 1Z9HA 4QQ7A 3HYPA 1EZKA 4YSXA 4JRRA 5D9XA 3QAVA 4RQRA 4Q5RA 3A2VA 3FR9A 2MMAA 3L4NA 2VD0A 1NDAA 2B5EA 3P4SA 3NN0X 2GDRA 4HQZA 1IJHA 4IKHA 4X9NA 2V3AA 5U63A 5KN2A 4ECIA 3GWDA 2F8FA 2TPRA 1CJ2A 1ERWA 1ELIA 1T4YA 4H2PA 1ZK7A 3NTDA 2OACA 2PUKC 2VCXA 1K0JA 3B3RA 5GAND 4NEWA 3N9JA 4E8EA 2ZBWA 2R4EA 3RPPA 3CNSA 2LNTA 1GALA 3K8NA 2CV4A 4OPDA 4XRAA 5ECOB 5JWOB 3TJGA 2ON5A 3E3EA 3UOMA 4K2DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E5T A;  4XTS A;  1V58 A;  3KTB A;  3NZG A;  2YJ7 A;  4TXO B;  4KDY A;  2IMI A;  4GST A;  2V60 A;  3RGT A;  1OJD A;  4KPL A;  2PGE A;  1I5G A;  5B6M A;  2LTK A;  3B9J B;  4B68 A;  1Y56 A;  4EUY A;  3DGB A;  4KGI A;  2LRN A;  3FEU A;  5FJP A;  1IUU A;  1FB0 A;  4KSO A;  5B8A A;  1T8E B;  3ME8 A;  1GRT A;  1SJI A;  4MJB A;  1BF3 A;  1SL1 B;  2HE3 A;  5F07 A;  1FVJ A;  3G5Q A;  5HR2 A;  4XWZ A;  2F5Z A;  4RI6 A;  1EOG A;  4KH7 A;  4RI7 A;  4CRT A;  2WHD A;  1IUT A;  4LLR A;  5FHI A;  3K7Q X;  2XLT A;  1GNW A;  2B9Y A;  2C76 A;  3N6H A;  5CNW A;  4G74 A;  2CX4 A;  2GR0 A;  3VFC A;  5GST A;  2ACZ A;  4OFN A;  1TRW A;  1YEP A;  3HD5 A;  4EXJ A;  3V1W A;  1OAZ A;  4MNN A;  2BC1 A;  3UJ1 A;  2PU0 A;  2C1Y A;  1COY A;  2WDV A;  1OC9 B;  5J7X A;  3HVX A;  2RDX A;  5ECI B;  2JU5 A;  3FZ4 A;  1P43 A;  4GME A;  2LST A;  4Z25 A;  4YKG A;  3T6C A;  3VRB A;  2VIM A;  3GD6 A;  4B69 A;  2QQ6 A;  3HJO A;  2IJY A;  2WOW A;  4H50 A;  3C96 A;  1O73 A;  2B7K A;  3LG6 A;  4BL7 B;  2NPX A;  3HKR A;  3TRQ A;  4RSL A; 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 4Z17 A;  5CRW A;  1JRY A;  3H8I A;  19GS A;  3LJR A;  4IL0 A;  2OLN A;  3UP5 A;  2O7K A;  4ICY A;  4NXI A;  1PL1 A;  3PPU A;  1E1L A;  3UJF A;  4GXZ A;  1ACV A;  2KLX A;  2ZUP A;  3DFH A;  3UKF A;  3IJI A;  2HZG A;  2HQM A;  3SQS A;  1ERT A;  2H1B A;  3R1Z A;  2R4V A;  2RAB A;  3EMX A;  2WP6 A;  4U8P A;  2EQ8 A;  1XW6 A;  5CRG A;  1CJ4 A;  3ICT A;  4J56 A;  1YQ1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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