2XFWA

Structure of the e192n mutant of e. coli n-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate in crystal form iii
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
299
structure length
298
Chain Sequence
HHHATNLRGVMAALLTPFDQQQALDKASLRRLVQFNIQQGIDGLYVGGSTGEAFVQSLSEREQVLEIVAEEAKGKIKLIAHVGCVSTAESQQLAASAKRYGFDAVSAVTPFYYPFSFEEHCDHYRAIIDSADGLPMVVYNIPALSGVKLTLDQINTLVTLPGVGALQTSGDLYQMEQIRREHPDLVLYNGYDNIFASGLLAGADGGIGSTYNIMGWRYQGIVKALKEGDIQTAQKLQTECNKVIDLLIKTGVFRGLKTVLHYMDVVSVPLCRKPFGPVDEKYLPELKALAQQLMQERG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINIC ACID LYASE
publication title Structural Insights Into Substrate Specificity in Variants of N-Acetylneuraminic Acid Lyase Produced by Directed Evolution.
rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 298
sequence length 299
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2010-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2xfwA00
1BEUA 1GTEA 1KW1A 4ZVJA 3QEZA 5HR6A 5U4NA 3EWXA 4E2DA 3CB8A 4WQ6A 1VCVA 1DQXA 2Y88A 1P1XA 4CNOA 5DLCA 3TMQA 1UB3A 1OFEA 3W3OA 3B04A 2B7OA 3QSTA 4TX9A 1DV7A 4UTLA 1PCWA 3TJLA 4YCPA 4UMAA 1GG1A 1FX6A 3W1AA 3G1AA 5E1QA 1ZALA 3HG2A 3O8AA 3E12A 2ZZ6A 4Z1BA 3DHFA 2NUYA 4IMEA 2B7PA 4X9SA 4JNMA 5HR7A 3ABSA 4KFNA 3R2GA 4A2SA 1TPB1 4IUOA 1WA3A 5KTLA 3HMJG 5G5IA 3E49A 2DU2A 4O28A 1W54A 5D04C 3CPRA 4NQ1A 3MHUA 4M19A 2C1HA 5CSRA 5CKSA 2YGYA 1CW2A 5DXYA 4UTMA 1KM3A 1OFDA 3QSRA 3TROA 1XM3A 1DL3A 3NVTA 4RZ5A 2QJIA 1XDLA 4JEQA 1QWGA 4Z1DA 2V81A 4H3DA 1SPQA 5EPDA 4XWUA 1LOQA 1OFRA 3N2MA 2QCCA 3GYEA 3O16A 3I7RA 1QMLA 3O15A 1GVQA 2V82A 4BWLA 4X22A 3LERA 4RLIA 3NEVA 3PB2A 4N02A 1O5XA 3M7WA 3G22A 3ZWTA 2ZZ4A 1X8FA 3VE7A 3Q37A 3EXSA 3BPWA 3LOTA 3LBCA 3QJAA 1KTCA 1XBXA 4DELA 1SO3A 3W2JA 1JUEA 1YYAA 2QCDA 2H3DA 4UMBA 5E0KA 3CM4A 4MOZA 3QPYA 4HPXA 2D73A 1SR9A 3TQVA 1GVRA 3Q94A 4UTJA 1QR7A 3TH6A 2DZVA 2X16A 3MWAA 3S1XA 4MUZA 1TB3A 1W31A 3W74A 3B8DA 3OVQA 4UUIA 4LV9A 5HWMA 1JUKA 2Z2UA 3HJZA 3HB9A 4JS3A 3EB2A 2JBMA 4UMCA 2YZRA 4M6VA 4WOQA 3UZJA 2ALDA 4JY8A 4GBUA 2CWNA 3HPXA 3KAOA 4I7VA 3PC0A 2OMAA 3L0KA 2A2IA 3NPWA 2VENA 4O1BA 1JULA 1PV8A 3EX1A 2Y61A 2QKFA 1SSDA 4UFLA 4Y9AA 3W71A 1N7KA 4QAIA 4JTGA 3WJZA 3SZ8A 4JTIA 1GVFA 3HBLA 2YW3A 3INPA 2A7RA 3KFTA 1SZEA 3QPZA 5HWJA 1JCXA 3TXZA 3UYCA 2A21A 2EKCA 1LROA 2GVGA 4LVDA 1ZY9A 1LDCA 1TQXA 1EIXA 1VQTA 4G1KA 2V5LA 3W7PA 2I14A 2X1UA 4UFKA 2QJHA 2WJZA 1GZGA 2NWSA 3MMTA 5AYXA 1JCLA 2WSQA 5D2XA 1LRTA 4ADSA 3L65A 3M5YA 5D2TA 1KM0A 5HWNA 2NUXA 3ABRA 3A22A 3IIXA 4AEOA 3PSVA 4QQ3A 5BMXA 5LNRA 5G2IA 3DI0A 4WJEA 4Z08A 2O7SA 2QEZA 2A4AA 4O1DA 2V2DA 2CLLA 2B0MA 3TIMA 3DBPA 4YWIA 3STEA 3LHTA 3PBUA 3UY8A 5HULA 1TPFA 2EF9A 5AHIA 4JY9A 3JR2A 1K8XA 4NUWA 1OFAA 3O63A 3W1TA 4QITA 1BKSA 2GVLA 3LGEA 3GXNA 1FCUA 3V1PA 1F05A 1JJKA 2RH9A 4PL1A 3C2EA 3W7NA 1WV2A 5LKYA 4UFHA 1H1ZA 4NXKA 2DZXA 3PUDA 3IGXA 1ZAHA 3LTSA 5KSWA 4HNNA 1XBZA 3GNDA 3MP3A 4S2BA 1YLVA 3NDOA 2A7NA 2ZFAA 3ZFHA 4IPIA 1JQVA 1RQEA 3I7SA 2CZDA 3K30A 3W2NA 1FWSA 2WV8A 4ZZ9A 1A5CA 2C18A 1E51A 3PY2A 2EPHA 1XBVA 4IWWA 2BSLA 3OG3A 1W37A 3RLVA 2QF7A 3M6YA 4NJGA 4HSOA 1VPXA 3PSWA 5U7SA 4BI5A 1QDSA 2CZ5A 3TMLA 3DH7A 2C16A 4JTUA 5AC6A 1HFBA 3W73A 4M7TA 1I45A 5F2LA 5I3JA 1OFOA 2H8ZA 3EWZA 1T96A 4CLMA 2E1DA 3JS3A 2Q8ZA 1SW3A 1THFD 2E5CA 1WOAA 3L5AA 4I7UA 4WXZA 4ORMA 2A7PA 2ABBA 4X3ZA 2FFCA 4HIBA 3LCFA 4H4IA 4EIVA 1R2TA 4PL2A 3HGSA 3GDKA 3GXPA 2ATMA 5K2ZA 1MSSA 1ZJIA 2YXGA 4NZFA 1S3HA 2YYUA 3R12A 1DOSA 4UTHA 3CU2A 2QUUA 4NNCA 3N19B 1DJNA 3PG8A 1N8FA 4JXCA 4UIOA 3M16A 3N2XA 2W79A 1GTHA 1B9BA 2BTMA 4GXMA 1L6SA 4M6PA 1AW1A 1ME9A 4HPJA 4O4WA 2H6RA 5CZ0A 2QCMA 3G8RA 2QUVA 4W9TA 3NL5A 3HG3A 5D37A 3H54A 5TIMA 5DCDA 1YTEA 4AWSA 5TQLA 3EWWA 2G5WA 3WJSA 3NYZA 3W86A 1KM1A 1YDVA 2FJKA 1I2RA 4K36A 5K7JA 5CPLA 2W6RA 4UTUA 1PVNA 1A5AA 4AVFA 1OF8A 3LHVA 3P80A 4R7JA 5AHLA 3TNOA 2V30A 4CNPA 3A5FA 2DZSA 3P60A 1MZHA 4ICNA 4MYXA 1AMKA 3PUEA 3U2OA 2Z6IA 2CFFA 4JTKA 4E0CA 3RK8A 4JTSA 3HOJA 1J5TA 2A5HA 4RXFA 3TJXA 4K39A 3C2FA 2ZTJA 5L6UA 4DO5A 3BV4A 2CU0A 3L2IA 3NGJA 4OT7A 2Y7GA 2C3ZA 3RU6A 2TPSA 1OVDA 2C0AA 1EB3A 4IJBA 4O13A 3NO5A 1ICQA 3NQMA 5BOOA 3A23A 1M7PA 2EGZA 1PL9A 1X6UA 2DJXA 2ZYFA 3ZWSA 1OYBA 4JIPA 3NOEA 5TBOA 5HUOA 2ISWA 4UC5A 3VKJA 3LCIA 3CEUA 4FX8A 4O50A 2RHGA 1LYXA 3QRHA 3GX9A 4UFMA 3VE9A 4NX0A 1IIGA 4QNEA 4JTHA 4K37A 1BWKA 4TIMA 4O0ZA 2J88A 2Y7DA 3R89A 1SW0A 3ANYA 2KZHA 3G1YA 1VZWA 3WJWA 5KZEA 1AW2A 1XUUA 2G95A 3EX4A 3NQAA 1QFEA 4RX0A 1RD5A 4AAJA 2CW6A 4QNWA 4QSHA 1F76A 4WOZA 4O16A 1SZGA 1ZAIA 3TX9A 3C3NA 1LBFA 1YPFA 1DQWA 1OK6A 3W1PA 3TW6A 3N9SA 2E6YA 4L4MA 1W3NA 1H61A 5FF2A 5F2GA 1I2NA 1O60A 3DKJA 2JK2A 3NQGA 1BTMA 1GYNA 2FIQA 2QAPA 3TUUA 5AC8A 2VEPA 3EWUA 3IVUA 1VCGA 1H62A 5DCEA 3OBKA 2JGYA 3B4UA 4NJHA 3W1LA 1A5SA 3S1UA 2G97A 5SWUA 4O19A 3P81A 5K4ZA 4CQAA 1R46A 4ADUA 2R91A 3HF3A 3JRKA 1OFQA 1PCKA 2VFDA 4K8HA 2G96A 1FWWA 3UWQA 3HPZA 1W5MA 3P74A 1VJIA 5CZTA 3G8EA 1Q6OA 4AB4A 1UUMA 4JYDA 1NSJA 4GJ1A 3GR8A 6TIMA 4OQVA 2X2GA 3PVFA 1WAUA 1KV8A 3B0UX 1K02A 3ABQA 2YPIA 1TCDA 2C13A 1Q45A 2HS6A 2R8WA 3F4WA 1B4KA 2DZWA 3THAA 1EP3A 3M5ZA 1PIIA 3LRKA 1T8XA 3TFXA 4N4PA 3CTLA 1GJPA 4FNSA 1ZENA 3TCEA 4UR8A 1F5ZA 1HO1A 1MEHA 1PS9A 1WBHA 2YR1A 1KFJA 3P61A 5C6MA 1F74A 4MY8A 4N9CA 3NQ7A 4GUIA 4RZ6A 1WDWA 4PA8A 3EXTA 1C29A 5EY5A 5MHBA 2VEKA 5E93A 3T7VA 4K7YA 3W7JA 4IMGA 1I2QA 2E6AA 1UUOA 4OU1A 3UWZA 5BNKA 3PG9A 1K7XA 5LHFA 1LOSA 2E5DA 4GRSA 5C2XA 6ALDA 3W1QA 2PURA 1PHQA 3GR7A 3LTYA 3CHVA 2GPTA 2FPVA 2F7FA 4YCOA 4FO4A 2JKEA 2Z6JA 1TJRA 3MYOA 3UNDA 3HGRA 3EKZA 3UY7A 2E6FA 3BLFA 1XUZA 4FIQA 3LXCA 3DFPA 3LBMA 4MJZA 5LZLA 4O17A 3I6RA 4UTTA 5F4SA 2GJLA 3GLCA 4LVAA 4Q32A 3M5XA 4UTWA 2E77A 3HQ1A 1NFBA 2E09A 2J9XA 2QUTA 2BZNA 1Q6RA 5FF4A 5AYYA 5J5RA 5I3IA 1OG0A 3LRLA 4GUJA 3IEBA 1FCVA 1LOLA 5EKYA 3N73A 3CT7A 2DZTA 1KFKA 3DZ1A 1TV7A 3BLIA 3LI0A 2A1YA 4A29A 4XBSA 3GIYA 5D33A 2OCZA 3EXRA 1VYPX 1SQ7A 2A85A 4IOTA 2X1RA 1VLWA 5IBXC 5HINA 1R2RA 2V5BA 1C9DA 4LS1A 1WBJA 4NNBA 2WO5A 1EEPA 1H63A 3LDVA 3UWVA 4EVZA 1O4UA 1OX4B 2BLEA 5G4WA 1RVGA 1OYAA 1IF2A 2FQIA 2VXNA 4BF9A 1S5TA 1WQ5A 2RDWA 4FNRA 1Y0EA 1EWDA 2A0NA 5I3FA 5FF7A 3SW6A 3FJLA 4IMFA 3TSBA 1FDZA 2NLIA 1TMHA 3NNTA 3GB6A 4DO4A 3PAJA 1LLZA 4O53A 4EWND 5FESA 2ISSA 4JYFA 3RMJA 5BRBA 2RKXA 1X1ZA 5F2MA 1O5KA 4HN4A 3IVTA 3NM1A 4FIRA 4WY0B 1F2JA 2YW4A 4NJKA 4FNPA 1AW5A 5DN1A 4M5PA 3L0NA 3LCWA 4DXVA 1QOQA 3EKLA 4O8RA 2TSYA 3LXAA 1TIMA 1ML1A 3UPBA 1G6CA 2GQ9A 4ALDA 4UTKA 3RNDA 4ONVA 4XBKA 2AQWA 1FY6A 1KFBA 3NQCA 3L68A 1KTBA 1GG0A 1EUAA 1NVMA 3FKKA 5G1YA 3W75A 3NQVA 2BXVA 5AB3A 3QQ0A 3IGSA 3GKAA 1Q6LA 3DAQA 4IQLA 1RQHA 4X2RA 3S6DA 1H7OA 3P62A 3W6YA 3M43A 1G7UA 4RJEA 1HG3A 1ME7A 1HL2A 4UFIA 2O7QA 3LLFA 2WNNA 1Z41A 5K9CA 1L9WA 3FJ6A 1UCWA 4O10A 5AYZA 1YXYA 4Y8FA 2C19A 4DF0A 4XKYB 2ZRYA 2ZRUA 3QQ1A 1FWRA 4IGHA 3G1FA 1CX9A 2GVJA 1D3GA 3MO7A 5CZJA 3P7YA 3BW2A 4TU1A 3E0IA 2NXGA 3A21A 3OIXA 3TSDA 3BGGA 4DQWA 1GWJA 2NX9A 4WXYA 5LGZA 4N9DA 4M7SA 1W56A 3C0JA 1OFBA 3L66A 1IXOA 1G4PA 3GKFA 3M0ZA 5LNWA 5D2WA 2B7QA 4WY0F 3W7HA 1TTIA 2ABAA 1C8VA 4LC6A 4S2CA 1R47A 2I1OA 1Z42A 3MI2A 3EX3A 4JN6A 4ORIA 3S42A 1WYIA 2RDUA 4O11A 4J9JA 2JGQA 3Q58A 2W0UA 3NG3A 4HNTA 4O4VA 2LLEA 2PRLA 3C52A 3WJXA 4CNNA 3MHGA 1ICPA 1BWLA 5BMWA 4QJ1A 4TO8A 4ML9A 3TFCA 4OGZA 2WSYA 3W9ZA 5CG7A 1FWNA 3R13A 3E02A 1QPOA 3EX2A 4RZ4A 3GVGA 1W3TA 1TTPA 3NPUA 3YPIA 2B4GA 4AH7A 2CLMA 2WQPA 5FEXA 1VGAA 3M5VA 4Z1AA 2TRSA 2QCFA 3GNNA 3KXQA 4Y96A 3H53A 4N4QA 2TMDA 1QPNA 1PHWA 1QO2A 2OZ0A 1VHCA 1WOBA 3MP5A 4LY8A 4OWGA 5DXXA 4KWWA 3V75A 3O05A 2CLOA 1TYGA 4XZ9A 2FTPA 2OT0A 4O14A 4FX6M 4WUIA 4B5NA 1TREA 1OHLA 3HO8A 3BK0A 3FFSA 3KOFA 1FXQA 4MZYA 4LVBA 1DKWA 1AG1O 4OV9A 2WPBA 5EMUA 1KM2A 1XI3A 3MBFA 3HG4A 2QCDB 4Q4KA 2QDHA 2I9EA 5IM51 2VEMA 1A50A 3UQNA 3TC7A 5CZSA 2QCNA 4C1LA 3TU9A 2V0TA 4BI6A 1J4EA 2ZA3A 4UFJA 3ELFA 1JCNA 1Z44A 4O0KA 4AF0B 3LHWA 2CZFA 3HGOA 1AL7A 5AHEA 1R2SA 1H60A 5G1TA 4NT0A 4AHPA 3P84A 4O54A 1HTIA 3EWYA 1VHNA 3SY5A 3RF9A 4PH6A 1M6JA 5G2WA 2EAWA 4LT9A 1W3IA 1K7FA 3THQA 3P5YA 4EF9A 1KM5A 1L6YA 1LLWA 5D30A 3NL6A 3GDTA 3UWUA 1GPWA 4LRSA 1W5NA 4IMCA 1KBJA 3VNDA 3PULA 5CPNA 5GVJA 3S1WA 1LTDA 1VC4A 1O95A 1W5OA 2BWGA 3LXBA 2P1FA 4E2BA 4MFEA 3G0UA 5DY3A 3O06A 4MJMA 2V2HA 3U6WA 2VFEA 4QISA 4BR1A 4LV4A 3EX6A 2OT1A 3SECA 3I7QA 2NXHA 3PM6A 2Y70A 5FEZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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