2XG9A

Crystal structure of barley beta-amylase complexed with 4-o-alpha-d- glucopyranosylmoranoline
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
487
structure length
487
Chain Sequence
VNVKGNYVQVYVMLPLDAVSVNNRFEKGDELRAQLRKLVEAGVDGVMVDVWWGLVEGKGPKAYDWSAYKQLFELVQKAGLKLQAIMSFHQCGGNVGDAVNIPIPQWVRDVGTRDPDIFYTDGHGTRNIEYLTLGVDNQPLFHGRSAVQMYADYMTSFRENMKEFLDAGVIVDIEVGLGPAGEMRYPSYPQSHGWSFPGIGEFICYDKYLQADFKAAAAAVGHPEWEFPNDVGQYNDTPERTQFFRDNGTYLSEKGRFFLAWYSNNLIKHGDRILDEANKVFLGYKVQLAIKISGIHWWYKVPSHAAELTAGYYNLHDRDGYRTIARMLKRHRASINFTCAEMRDSEQSSQAMSAPEELVQQVLSAGWREGLNVACENALPRYDPTAYNTILRNARPHGINQSGPPEHKLFGFTYLRLSNQLVEGQNYANFKTFVDRMHANLPRDPYVDPMAPLPRSGPEISIEMILQAAQPKLQPFPFQEHTDLPVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-AMYLASE
publication title Chemical Genetics and Cereal Starch Metabolism: Structural Basis of the Non-Covalent and Covalent Inhibition of Barley Beta-Amylase.
pubmed doi rcsb
total genus 191
structure length 487
sequence length 487
ec nomenclature ec 3.2.1.2: Beta-amylase.
pdb deposition date 2010-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01373 Glyco_hydro_14 Glycosyl hydrolase family 14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xg9A00
1FH9A 2XIIA 1E73M 3B8SA 4F9JA 2W67A 1MW3A 4UQCA 1JZ2A 2CBIA 4PEEA 4W84A 4PUEA 1E3ZA 3WEMA 1WNOA 1B3ZA 1UHVA 3WEOA 3WN6A 1NP0A 1DWFM 3MV01 4UZSA 2WMHA 3EDFA 3VUPA 2O9OA 2J4GA 2VT0A 4PMUA 1E0VA 1E4MM 2VR4A 3FW6A 3LPPA 1JF6A 3VGHA 3UG3A 1MW2A 1B31A 2DSZA 2VVNA 2TAAA 4C7FA 3RJXA 2PWEA 2W61A 3VIJA 2CEQA 1EQPA 3W38A 1XD0A 4WKHA 2BXZA 7TAAA 3ZSSA 3EMQA 1J01A 4KMQA 1AVAA 3OZOA 1ISZA 1J0KA 4UCFA 4P7NA 1PPIA 1V3JA 3OLDA 4NZCA 1QW9A 3AMCA 4PRWA 4P7OA 3PBGA 2XUCA 4QP0A 2OYMA 1MYRA 5HPOA 1KXVA 3W37A 3L4WA 3VIMA 2XVGA 3BGAA 2PWFA 1ISYA 4LXFA 1ZU8A 3J7HA 2OSYA 5JBEA 2CESA 4JFVA 1XV8A 3VD4A 5A6LA 1CZ1A 5A8OA 2BFGA 1V08A 5LYRA 4JHOA 2AAAA 5JIPA 5I24A 4XV0A 3ZT6A 2FGLA 3WD1A 3ZIZA 1CDGA 1CXEA 3ARXA 3WMCA 2W4XA 5DT5A 3CZEA 1E4NA 1J0IA 3G6LA 4JFUA 3L2LA 2GSJA 3AYSA 4JL2A 2VQUA 3AIQA 1GOOA 1UD8A 1CGWA 2PF0A 5A2CA 3WH9A 2BXYA 4K68A 1XGZA 3ARYA 1VBRA 2WZIA 4AD0A 3M07A 1W9VA 4D6DA 1ITCA 4PMXA 3T2PA 2C0HA 5CLTA 2RGLA 1JGIA 4TUFA 1C90A 2DDXA 1VEOA 1W3LA 2WCGA 2YA0A 3N13A 1JYVA 3FNDA 1CBGA 4AW7A 4AZ6A 1V0MA 4HU0A 6A3HA 1GQKA 3WELA 1BAGA 1CXLA 1BFNA 4DM2A 1G9HA 4ZE4A 2WBKA 4Z2JA 2XFFA 2J77A 3FAWA 2DH2A 3D3AA 4E8DA 2YDSA 4ACZB 1W1YA 2CBUA 1LJYA 2EBNA 3WQVA 4QAWA 2DEPA 1OD8A 3VTRA 2XSBA 4U33A 4Y7EA 1EH9A 1Q6EA 3AS0A 4DUWA 5A8QA 2VMFA 3CZ8A 2CHNA 3NDZA 2FHFA 3T2OA 2W66A 2XGBA 3CZKA 4H8VA 2J8GA 1MQQA 4PMNA 4WK9A 3AMLA 1KGUA 3MMWA 2V5DA 3NSXA 4W8LA 5HDRA 3TA9A 3WH6A 4UQ9A 3W4RA 4H8HA 3SUVA 2XSAA 3NDYA 2G3IA 2WPGA 1DEDA 4AZ5A 2ZUUA 1O6IA 1D2KA 3PZIA 2UY2A 5A2AA 3ZJ8A 3O2LA 4HPGA 2WCSA 4MJ4A 4HOXA 1JZ3A 2O9RA 1DHKA 2VL4A 1TA3A 2Y24A 1G0CA 2J62A 1HN1A 4URIA 2WW5A 1HKJA 3AISA 3VDBA 3AHXA 3RPMA 4MTVA 4J28A 3N9KA 1QHOA 3F4VA 2DSVA 2VI0A 1NH6A 3CHEA 4J3XA 2QMJA 4F66A 2VZOA 2C8NA 1VEPA 4W8AA 3A6OA 4HMDA 5D9MA 1JXKA 4NI3A 5FOOA 3CZJA 4LPCA 3WQ8A 2VZTA 4V27A 2JFEX 2CYGA 4PMQA 2MANA 3B9EA 3WH7A 3A4WA 1KQYA 1VAHA 4RE3A 5GNZA 4W89A 2ZICA 2VR5A 1BHGA 3WMSA 2ZUNA 3KZSA 3BAXA 2WVSA 2CETA 4EE9A 1XCXA 1MW0A 4AZIA 1LQ0A 1QBBA 3BSHA 4LYPA 1VB9A 2QV4A 3GXIA 4CU7A 2W62A 4XX6A 4JHZA 3ZJKA 4D6IA 4W8BA 1EOKA 4AMCA 4MNKA 2VX7A 5HBFA 2WKLA 3UR7A 1E5JA 1MFUA 1TFVA 2AMGA 4YHEA 1R87A 3MSGA 1UYQA 3WSUA 3EMZA 1JZ4A 4UNIA 2ZE0A 1B3VA 1KWGA 2ZWYA 1JYWA 3T08A 2GFTA 1UKSA 2V5CA 3PN8A 2Y4SA 4C7DA 2BHUA 5BXSA 2DT1A 1LLOA 1X6NA 1UWQA 3GXFA 3CBWA 4FK9A 1EHNA 1M03A 1AMYA 4P8VA 2V3GA 3AZSA 3VDAA 4LX4A 3LPOA 3MMUA 4CD6A 3MUAA 1E6NA 4QCFA 1WDPA 4J7RA 3DECA 3A4AA 1E0WA 2DPEA 4CGTA 2AOSA 3VIFA 2GJXB 4R27A 4BQ4A 3PZVA 1KR1A 2YIHA 4JKKA 5F7UA 1UKOA 1CLXA 3IAPA 1EO5A 5IDIA 4U3AA 1E40A 2VOTA 4Q7NA 1DWGM 2B31A 4U5IA 4YPJA 5CSUA 1BSIA 5I6SA 4S3KA 1BYBA 2V38A 2VTFA 4UQBA 1V6WA 4RE4A 1L8NA 1CGTA 1KGWA 1NOUA 3SUWA 3ZMRA 3AQUA 5CG0A 1UH2A 1US2A 3FXYA 1M53A 5E9AA 4H7VA 2WNWA 3EMCA 1B30A 2WMFA 2DSKA 4CVUA 3AHYA 1HKMA 3BXWA 5GNYA 2WVVB 4MB1A 4U5KA 1A47A 1U33A 1E72M 3VD9A 4HP5A 1E15A 4BZYA 1E56A 3ARZA 2E9MA 2F8QA 3FHAA 1ZBKA 3WNKA 3VDHA 5EBAA 1C7TA 2NT0A 3PZOA 1GPFA 4B15A 2XM1A 1D3CA 2YL8A 4U3CA 3WDQA 1UD6A 1E70M 2WMJA 3CZGA 5GQBA 2O9TA 1KCKA 3ZQ9A 3AXIA 4TVDA 3WNLA 3CH9A 4AD4A 1C8YA 4AZHA 1B90A 3WQ4A 1F4HA 4Q22A 2E8ZA 2OWWA 5BWFA 1WCGA 1QI3A 2J79A 4E4PA 4PBGA 5AC5A 1EQCA 4OIFA 3K46A 5CQ1A 5D8WA 3E1F1 1CNVA 1Q6GA 5A6SA 2A3BA 3DYPA 3ZT5A 3CMJA 1UOKA 4W87A 5GNXA 2WM0A 2FHCA 4M1RA 2FH6A 1W32A 1M04A 2PWDA 1GZJA 1K9FA 1M7XA 4WSKA 2VX6A 1W2VA 3OLGA 3SCVA 3K4DA 1I1WA 1TVPA 2BS9A 3UEQA 5A8NA 4PN2A 1VBUA 2XIBA 4NRSA 1ESWA 4NSBA 1ZS2A 1RD6A 1IT0A 1VEMA 1QI4A 3PZ9A 3MV11 4M29A 1BGAA 3AIVA 3SCWA 4UOZA 5DEZA 1L0PA 2GDUA 4J27A 1G01A 4MADA 1H41A 1RP8A 1LF1A 3L4TA 1V3MA 5IFPA 4L4PA 4D6FA 3KEHA 1RP9A 1HXJA 1UR2A 3W81A 1CWYA 4H2CA 4UZUA 1H4PA 1B3YA 2NW0A 3W82A 4XZWA 3BAIA 1NM9A 1P6WA 1HJSA 3S2CA 2D1ZA 3A3HA 1JL8A 3OB8A 2EPMX 2ZWZA 1V02A 3GH4A 2VC9A 3PZTA 2WLZA 3MUIA 5I5RA 1AQHA 5EB8A 1WO2A 3I3BA 1WAWA 3WUGA 2ZXBA 3N12A 1KWKA 1XC6A 3FY1A 3U7BA 1V3HA 1QNRA 4X0VA 2V3FA 1UG6A 3OLIA 1S46A 3W6MA 4N42A 4Z2LA 2GJXA 4UFHA 2Y8VA 3UG4A 1I1XA 4PMDA 1OD0A 1KR0A 2XVNA 4GPNA 4M80A 3UETA 1PX3A 2CBJA 5M5DA 2WMIA 3VPLA 1C91A 3MANA 1TA3B 4FLSA 1GW1A 4OUEA 1FHLA 1Q4NX 2D24A 3OGVA 4IPNB 1CLVA 4P7LA 1SR0A 5AYBA 2A3AA 4A4AA 1PZ3A 1HJXA 1I75A 3GNRA 8CGTA 4UTFA 2V3DA 3VGBA 1QNPA 4V28A 1R7OA 3N17A 1J18A 1K9DA 3BAJA 1SMDA 1HJVA 1PX4A 4WLCA 5JBDA 5D9OA 5ABGA 2WVVA 4JCMA 4CU6A 1ODZA 2Y5EA 3EYPA 2YL6A 3GH5A 1H2JA 3MU7A 1W9PA 5ECUA 1EXPA 2JEQA 2IUZA 1W1VA 3WH8A 1UKQA 1TMQA 3BSGA 3PTMA 2E3ZA 1VFOA 3ZOAA 2JF7A 1OT2A 1NWSA 5FKYA 2X2YA 4MPKA 3WDPP 4OKDA 3SURA 5A6KA 1UWUA 4HOWA 1Z32X 3OA5A 3T2QA 3VX1A 5ABEA 1E71M 1BYDA 1ITXA 1FP9A 1TUXA 2YOCA 1BVNP 3ARQA 1UQYA 2XFRA 2JALA 3RM9A 4MB3A 5M17A 3CGTA 1NOWA 3RIKA 4D6GA 4J3VA 4D6HA 4CU8A 3ZM8A 1C93A 4J3SA 3BC9A 3RO8A 1KCLA 3GBDA 2CKRA 2GDVA 4WKAA 4P8UA 4J3WA 1E6ZA 4W85A 3ARPA 3BCDA 2VZVA 1HL9A 2X1IA 2YJQA 4MDPA 2VRJA 3KL0A 2O92A 3CUHA 4AD3A 2OLHA 3ZR6A 2GK1A 2CPUA 1UA7A 2VZUA 4IUGA 1QI0A 4EK7A 1OGSA 4Z2GA 5A6MA 1UH4A 1C7SA 3VMNA 1GCYA 3PZNA 4QLJA 3NIYA 1FP8A 2O9PA 4PCSA 4HPHA 2NSXA 4B3KA 1HNYA 1WP6A 2D22A 1UKPA 4MDOA 4IM4A 4B9YA 4HZ6A 4PYSA 5M03A 3PTKA 4LYQA 1GQIA 1KXQA 2E40A 3VM5A 5FD0A 4AZ7A 2PB1A 2WZEA 4GZJA 2WC4A 5KZ6A 2XWDA 3FN9A 3DYOA 2X0HA 4KGJA 3WY1A 5CLWA 4GZIA 4WF7A 5BROA 4V2XA 4U2YA 1JDCA 3WF2A 3F5LA 4YHGA 3ARUA 4M82A 1JZ8A 3PZGA 1OB0A 4JZ5A 3KWXA 2YA1A 2YDQA 2CHOA 3GDBA 4PSPA 1V0NA 1WZMA 5A8PA 1WZLA 2BY3A 2EPLX 2DT0A 2J7EA 3NSMA 2XFYA 3LPFA 2BV9A 1E43A 5E6YA 2VCAA 2QPSA 1LG1A 2YBUA 1EO7A 1MVYA 2YL9A 1LL6A 3CUIA 3IJ7A 1NWRA 5I77A 1EHAA 1XD1A 3WQ6A 4XUYA 1E6XM 2WB5A 1C92A 3MUY1 4BS0A 1JDAA 3I3DA 4JKLA 2CBVA 3L4ZA 2J7FA 1WDSA 4ZXOA 5CPQA 3WUBA 3EDKA 2V3EA 1H5VA 1GVIA 1NOFA 1UZ4A 4YN5A 2DIEA 3ARWA 4TX6A 4FLRA 1WZKA 1A3HA 3NUKA 5JIWA 1B0IA 1W2PA 1SFSA 4UFMA 4FF5A 4F79A 4ATDA 9CGTA 4DM1A 1WKYA 5CPSA 2BY2A 3QHMA 3NJ3A 5EMYA 1CIUA 2BVTA 2XJ7A 4UR9A 4DWSA 2OWXA 4AD1A 4TXEA 3PHAA 2J7CA 1WB0A 1XYZA 1IZJA 2JIEA 3B9DA 4OOZA 4JAWA 2WMKA 3AICA 2CCRA 1E1FA 1TG7A 1ZBWA 3VNZA 4W5UA 1V6XA 1VIWA 4D71A 1QHZA 4ATLA 3VMOA 1J0HA 4JIEA 4AIOA 5HXMA 1JYXA 3T0AA 1XRVA 4EANA 1W1TA 4WKFA 3ZSTA 4AWEA 2ZX9A 4UQEA 3UR8A 3HMCA 1FOBA 2WVUA 1W91A 3QR3A 4IISA 3WD2A 3JUGA 3ZJ7A 5FL1A 2BVDA 4JFWA 3VGEA 2UY4A 2EXOA 1JI1A 1PZ2A 1OCQA 3W28A 2X8RA 3K4AA 1CXFA 3AROA 3WDIA 4TTUA 3WH5A 4H41A 2D23A 4KRTA 3NCOA 3G6MA 2EJ1A 2WYSA 1TZ7A 1FHDA 2W5FA 4GO8A 1E4IA 4PMOA 3I3EA 3FHQA 4HMEA 3L4XA 3WF4A 1GONA 2VURA 1UQZA 1RPKA 1UZ1A 2DIJA 1XH0A 4BA0A 2J8FA 3QGVA 2C7FA 1HT6A 3AIBA 3APGA 5BCAA 1MW1A 5AY7A 1DP0A 3MO4A 2D3NA 1V02E 1JF5A 1BPLB 2D2OA 3T0BA 2E9LA 2VO5A 3BAWA 2XGIA 5LA2A 3K8KA 2J78A 1D7FA 5A6AA 2W63A 2ZUMA 3WBAA 4CCDA 4ML4A 3O6AA 4Z2HA 3SUSA 2DSUA 1QOXA 5JBFA 4AD2A 1HP5A 5A6JA 2QHAA 4AC1X 1NWUA 3BAKA 5IXEA 3ARRA 3VNYA 1M01A 4HA3A 1CGYA 2J25A 2WMIB 3OGSA 1GOQA 4X9YA 4J3UA 4AEEA 2ZIDA 4ZFMA 1ISVA 1UR4A 3WDJA 1UD5A 4GKLA 4PMRA 2WWCA 2IXUA 3UESA 4JKMA 4DUVA 3BMWA 4MB5A 1ZJBA 4CD4A 4MAVA 3RM8A 4PCTA 2X09A 1HVQA 4B3LA 3CIVA 3WF1A 5A6BA 1NQ6A 1OWQA 1BG4A 1YHTA 4H8UA 1R86A 1ZBCA 4ZEPA 4AZCB 2EQDA 3L4YA 3RMEA 2J75A 1V6UA 1KBBA 3EDEA 1N82A 4QLKA 1ISXA 2DH3A 1BVZA 2E4TA 3VO0A 3GZAA 2CERA 4GIAA 3AIRA 4U31A 1GQJA 5E0CA 4ZENA 1W1PA 2CNCA 3N1AA 4J3TA 4KGLA 1X6LA 5KEZA 2XWEA 3TONA 3TP4A 3AXHA 1UWRA 4P7QA 1QHPA 3WNMA 4LGXA 1JD9A 2DQXA 3NSNA 4DWSD 3POHA 4BQ5A 1BG9A 3K8MA 1JDDA 3W29A 1IV8A 1U30A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FH9 A;  2XII A;  1E73 M;  3B8S A;  4F9J A;  2W67 A;  1MW3 A;  4UQC A;  1JZ2 A;  2CBI A;  4PEE A;  4W84 A;  4PUE A;  1E3Z A;  3WEM A;  1WNO A;  1B3Z A;  1UHV A;  3WEO A;  3WN6 A;  1NP0 A;  1DWF M;  3MV0 1;  4UZS A;  2WMH A;  3EDF A;  3VUP A;  2O9O A;  2J4G A;  2VT0 A;  4PMU A;  1E0V A;  1E4M M;  2VR4 A;  3FW6 A;  3LPP A;  1JF6 A;  3VGH A;  3UG3 A;  1MW2 A;  1B31 A;  2DSZ A;  2VVN A;  2TAA A;  4C7F A;  3RJX A;  2PWE A;  2W61 A;  3VIJ A;  2CEQ A;  1EQP A;  3W38 A;  1XD0 A;  4WKH A;  2BXZ A;  7TAA A;  3ZSS A;  3EMQ A;  1J01 A;  4KMQ A;  1AVA A;  3OZO A;  1ISZ A;  1J0K A;  4UCF A;  4P7N A;  1PPI A;  1V3J A;  3OLD A;  4NZC A;  1QW9 A;  3AMC A;  4PRW A;  4P7O A;  3PBG A;  2XUC A;  4QP0 A;  2OYM A;  1MYR A;  5HPO A;  1KXV A;  3W37 A;  3L4W A;  3VIM A;  2XVG A;  3BGA A;  2PWF A;  1ISY A;  4LXF A;  1ZU8 A;  3J7H A;  2OSY A;  5JBE A;  2CES A;  4JFV A;  1XV8 A;  3VD4 A;  5A6L A;  1CZ1 A;  5A8O A;  2BFG A;  1V08 A;  5LYR A;  4JHO A;  2AAA A;  5JIP A;  5I24 A;  4XV0 A;  3ZT6 A;  2FGL A;  3WD1 A;  3ZIZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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