2XIYA

Protein kinase pim-1 in complex with fragment-2 from crystallographic fragment screen
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
274
structure length
273
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIRGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE PROTEIN KINASE PIM-1
publication title Crystallographic Fragment Screen Identifies Cinnamic Acid Derivatives as Starting Points for Potent Pim-1 Inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 273
sequence length 274
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2xiyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xiyA01
4OTDA 1UWJA 2UZEA 4YBJA 2C69A 3SAYA 1NT2A 2C3KA 1U46A 1JSUA 4E93A 2YISA 4O7YA 2PVRA 4JQEA 3QA8A 4EBVA 2UV2A 1R0PA 3D14A 4IHPA 4BN1A 4PPAA 3Q4CA 5BYLA 1U5QA 3GC8A 1LEZA 3DBDA 4HGTA 4DCAA 3HV3A 4NW5A 5F95A 3VBQA 5HNIX 1JOWB 4TZRA 4XJ0A 2JITA 2V0DA 3AGMA 3LFNA 1XH6A 4GMYA 4F6SA 4CTCA 4APCA 4JDHA 4DGGA 3D5UA 4V04A 1PXMA 3E64A 2F7ZE 4IAZA 2WTJA 3VS5A 1RQQA 1XQZA 3CBLA 3NAYA 3PZHA 3QU0A 3R1SA 4KABA 4EYMA 3VQHA 4RWLA 2F49A 1A06A 3QRTA 3NWWA 4UYAA 3RKBA 2WFYA 3V5LA 4UMTA 4EYJA 2R3FA 3JPVA 3KGAA 3EN9A 5KMOA 1UV5A 3HRFA 3P79A 4TWCA 4X6RA 3PTGA 3WZEA 1WVXA 4LRMA 5J95A 3I5ZA 4S31A 1ZYSA 4W9XA 5LOHA 4JS8A 4KBKA 4C34A 2YWVA 2VNYA 2HOGA 4O0WA 5FEEA 5M56A 4I94A 5J9YA 5BUIA 2C5NA 4GCJA 2R3GA 5E8SA 1APME 1MRYA 1M2RA 3NYVA 3HRBA 5M44A 1JVPP 4CV8A 1GIJA 4TWNA 4E8AA 4G9RA 4CV9A 4KIPA 3C51A 5DT3A 3DQXA 4ZTNA 2XIKA 3DBQA 2GMXA 5HU3A 2O65A 4TN6A 4IAAA 4JRNA 3UC4A 4QMYA 2I0VA 3RPYA 4KD1A 3DFAA 3QX2A 2VX1A 5AIKA 4DLJA 1P2AA 2VTLA 4BL1A 5HU9A 2E9VA 4EC8A 3MJ1A 5B0XA 3UDBA 4HVIA 5J7HA 5JQ8A 3OOMA 2P2IA 2X4FA 1PXPA 3MV5A 2BZJA 5CT7A 2OJIA 4RIXB 1VYWA 5HO8A 1J7IA 1NXKA 3KVWA 2LGCA 4FKPA 4WSYA 3G9NA 3N4VA 2JDVA 2ZB1A 5DEWA 4AAAA 3BLQA 3EN7A 2PZRA 3BLHA 2VTHA 3U8WA 4KB8A 2WPAA 4PP7A 3DK6A 3F9NA 3V5PA 3WF5A 5HG9A 4DTKA 4HW7A 4CMUA 4BDGA 2J0MB 2X8DA 2UVZA 5EW8A 5BVKA 2UZDA 4AGUA 4F99A 3PLSA 3MIYA 4DLIA 4EOOA 4L67A 2VAGA 4FZ7A 3RK9A 3WE4A 3NRMA 4CT1A 4USEA 2QR8A 4JG7A 5CQUA 3SVVA 3E92A 4BHZA 1WBOA 4IANA 2YCFA 4TNBA 3EN4A 5EW9A 4F6WA 4G3FA 3ALNA 4G3GA 2UW9A 3JXWA 1VEBA 3OCTA 5L6OA 5AFVA 2RG5A 4GK3A 5AAEA 5HCZA 1CMKE 2VTTA 5AUZA 5LMBA 4QQCA 4EOKA 2QOBA 2W1FA 4EZ7A 2SRCA 3FHRA 2X6DA 3LMHA 4NM7A 3QQUA 3HA6A 3PZEA 3R9HA 3PJ8A 4MTAA 5D7AA 4L6QA 2QLQA 4A4XA 4GV1A 3R7OA 5IQHA 3UQCA 4NZWB 4AZFA 3HMPA 3ZSHA 5ETIA 2EXMA 3OVVA 2QU6A 5FXQA 1YWVA 3DK7A 3HLLA 4WOVA 3WF7A 4C7TA 4NL0A 5CTPA 4XHKB 3R8VA 2VTOA 3GFWA 4WA9A 5AJQA 2BKKA 2PVHA 4ZSGA 4YHTA 5J1WA 2PUNA 4QMOA 2UW5A 4BIEA 3NW5A 4EH4A 4MCVA 3MFSA 4IZYA 3CKWA 1P4OA 4JBPA 5AR2A 5I9WA 2PMIA 1OBGA 4O84A 3P5KA 4R77A 3THBA 5M08A 4E4LA 3WF9A 3EFWA 4NKAA 4N6YA 5DMZA 4MNEA 4FT7A 3C4FA 3AGLA 4XCUA 4FT9A 4X2JA 3GXLA 3PSCA 4E1ZA 4BCQA 2ETKA 2JKOA 2WMUA 4XG7A 2WMWA 3HMMA 3LE6A 1XH5A 4M67A 4GRBA 4D28A 3QUDA 2WGJA 4R78A 3Q4TA 4UMPA 4PV0A 3D83A 5LJJA 2C68A 2OZAB 4BICA 2J50A 3ORPA 4D5HA 5DHJA 3BE9A 4GEOA 3DY7A 4O21A 2I0EA 4D2SA 4H36A 3IQ7A 3KN6A 4DG2E 4BF2A 2W1ZA 3ZFYA 4OBOA 4IADA 4MAOA 4FGRA 3TNWA 2BRNA 4M66A 1I44A 2AC3A 2CCIA 2FH9A 4FTLA 4EC9A 3OFMA 4RLKA 1VJYA 2X8IA 3CD3A 1CDKA 1YW2A 3OWPA 4FSQA 3VS0A 1FMKA 5DEYA 3U6JA 3TV4A 4FKLA 1Q97A 2C6LA 2AUHA 3HA8A 3PPJA 4AGDA 4JT3A 4MXOA 5HTIA 3IOPA 5HLNA 4IJPA 4I5MA 4EWHA 3I60A 3NPCA 2YLFA 4IAFA 2E9UA 1IAJA 4BDCA 2ITNA 3CIKA 4EL9A 1G8AA 3RAHA 4K77A 5KBQA 4IMYA 5E8TA 3UOLA 3PWDA 3VULA 1R3CA 4C4EA 3RTPA 4WUNA 4EORA 3NUXA 1K9AA 4YJOA 2EU9A 3TV6A 1QMZA 4F70A 5CEMA 1RDQE 5E8WA 2WXVA 3D5VA 4MQ2A 3LQ3A 5IKWA 1W84A 4XP3A 4UBAA 3BHVA 2YA9A 4PP9A 5L2QA 3KRXA 1YXTA 2AC5A 4BDAA 5IUGA 3MS9A 4BCJA 3HV5A 4E3CA 3QYZA 3TIZA 5BUEA 3K54A 4YC3A 2X8EA 4EWQA 2G2FA 3FMJA 4FEXA 4JLCA 5HE3A 4IB0A 3HV4A 5ANOA 4C36A 2DS1A 2JGZA 3UIBA 4Q2AA 3RPVA 4BIBA 4OAVB 4O0XA 4CRSA 4JNWA 3LOKA 4KUJA 4XLVA 3O71A 4L52A 4R6VA 3O7LB 4P90A 3VIDA 4FKQA 1FPUA 3OXTA 3B8RA 1OUKA 4IW0A 4R1YA 2HK5A 4BRXA 1GIIA 4EOSA 4CLJA 5HTCA 3R6XA 5IPJA 3GI3A 5J7BA 4PPBA 3QQKA 4HZRA 4X2NA 4ANMA 2Z7LA 2BFXA 5DN3A 5EHOA 4ANOA 3AMYA 4R3PA 4DGNA 2QCSA 4CG8A 3QA0A 3S95A 2OG8A 5HNGA 2DYLA 4BGQA 4G16A 1PXNA 1YI6A 3NAXA 3RCJA 1P5EA 3MH1A 4U7ZA 3VO3A 2WMQA 3TEIA 3WI6A 3KCFA 4CCUA 1QPJA 4QMMA 3PPZA 1NVSA 4CYJA 2IO6A 3LQ8A 1H00A 2F7XE 3B2TA 4D5KA 3E3PA 5D12A 5E8ZA 1KE5A 2HZ4A 5EI8A 1Q8TA 2J6MA 3VS2A 4UMQA 4IM3A 3H0ZA 4OAUC 3O51A 3E8EA 2WTVA 3U55A 1PYXA 4MBLA 1TKIA 3FY2A 3ZC6A 3GCQA 4PPCA 3TTIA 4LGHA 5GZAA 4RWJA 3NUNA 5KO1A 1XBCA 3FI4A 4FNZA 5H9BA 4H1MA 4UX9A 2YHVA 4K2RA 3R2BA 2GQRA 4W9WA 2JBOA 3MPTA 3F2AA 3ZO1A 1PXKA 4YTCA 1XR1A 2X7FA 4DGLC 4ZLOA 5J9LA 3COMA 1J91A 4USDA 3DJ6A 2VX3A 3QXOA 4G2FA 2VGOA 3OS3A 2PWLA 3UNJA 4DEBA 2BALA 4UALA 4BCFA 5FTGA 4O7NA 4IXPA 5FTQA 3DXQA 2UZLA 2XNOA 4M7IA 2XKDA 1ZMWA 2GS7A 3EQGA 4FICA 4ONAA 5AX9A 4ORKA 4PTEA 3FZPA 5HD7A 4JJRA 3UPXA 3FY0A 5I4NA 2UUEA 3VUGA 4Y46A 1G5SA 4O82A 4RX8A 4QP1A 4Q5EA 4FTQA 2PMOX 2C3LA 5D10A 2Z2WA 2VTAA 4M84A 4QP3A 3RK5A 4AUAA 1B39A 2Y6MA 3O7LD 1OL7A 2ETRA 3HZTA 3IDCA 4IWPA 4C3PA 4UMUA 4C4IA 5CLPA 3ZLWA 5EYCA 3V51A 3F69A 3JVRA 5GIOE 3O96A 3OXZA 2VTIA 4FTNA 3MTFA 5F94A 4DC2A 2BROA 5CEKA 2BIYA 3KXZA 5CI7A 3U9NA 5DT0A 2E9NA 4ZTHA 4YBKA 4C3RA 4XBUA 2VTJA 5LVLA 2XYNA 4D1SA 4NH1A 4XV3A 3BYMA 3QALE 4KBCA 2UW6A 2ZV2A 2J7TA 1Q61A 2VV9A 3OC1A 3W18A 4O7ZA 2XJ1A 2YDIA 3R8LA 4ZY5A 3G15A 1UKIA 5C4KA 4USFA 4B6LA 2E2BA 5LCKA 5I9UA 4F1OA 4N57A 3LAUA 4ZSEA 3TUCA 4GVJA 4ZY4A 4EKKA 4AZEA 3GCSA 4K6ZA 5CSHA 5AUUA 4CFMA 3VUKA 1ZYCA 3R1YA 4E6DA 5ANGA 2ERZE 4I6QA 4WNOA 3QZIA 1WVYA 4RIWA 4IX3A 4KIOA 5IA2A 2CNVA 4O7LA 1O9UA 4KA3A 3Q4UA 1U54A 2O64A 3V04A 5KBRA 4UYNA 3A2CA 4CQEA 1WCCA 4IVBA 4OTPA 3GVUA 3LFSA 5KNJA 4CGAA 2Y8OA 2PVLA 3RVGA 2CPKE 2JKMA 5FXSA 2HZNA 3MPMA 3UIUA 2EB2A 3GNIB 4FV1A 2VO7A 4MWIA 3IK3A 2YIRA 4KIKB 4RZVA 5K5XA 4RX5A 4MF1A 3FMKA 4AW1A 4O81A 3Q52A 2ZOQA 4DH1A 1CSNA 4UZHA 1OPJA 3Q96A 3RPRA 2CKEA 3O0GA 3NUYA 3MESA 3NCGA 2OU7A 2RFSA 4I0SA 1JKLA 3ZOSA 4OW8A 3ENHA 3E62A 5A4LA 1BUHA 4LGDA 4W8EA 5HHWA 3HL7A 4Z16A 2DQ7X 3D7TB 2WQBA 3PIYA 3GU7A 4FL3A 4M69B 4IE9A 2R0IA 1CKPA 2VTSA 4PMTA 3RHKA 1WVWA 2C6TA 3BGZA 4FSNA 4YGAA 1YKRA 3VN9A 4BCMA 4ZAUA 4FSYA 5CANA 5ANKA 3QTRA 3DBFA 4XUFA 1OL5A 1RW8A 1YQJA 2NRUA 3L9MA 4X3FB 2IZRA 4ARKA 4DBNA 5GIPE 3FEGA 4NM0A 4IDTA 2BDWA 4L53A 5CAUA 2WQOA 3IGGA 4B99A 3F3UA 3HV6A 4YC6A 4OTWA 3DTWA 4BDHA 3OBGA 5CXHA 1K2PA 1E9HA 2O63A 5HE1A 1YHSA 2WO6A 5HD4A 2OJGA 3QC4A 4LRKA 2WQEA 3R01A 3A7HA 2P33A 5BQ0A 3QHRA 5J79A 2IN6A 4ASXA 3GCPA 5HO6A 3IS5A 2C5VA 4O0RA 3KXNA 2VWBA 2OFVA 2P0CA 1KSWA 2XIYA 3FZSA 3LFAA 4FYNA 4GT4A 4PUZA 2PYWA 2BIKB 1O6KA 3ZRLA 3TZMA 1G8SA 5HVJA 2C6MA 5HX6A 4FV9A 3RK7A 5CF8A 2X2KA 2BKZA 3S2PA 5LXMA 4A9SA 4AXAA 3P4KA 2I40A 3M42A 1V1KA 3ACKA 3QTQA 1YDRE 4WG4A 2BRGA 3R1QA 4WRGA 2UZUE 5TO8A 5AMNA 5F20A 4F08A 4GG5A 3QKKA 4JG6A 5EDRA 2DUVA 4FMQA 2WU7A 5HG8A 4ANSA 3P23A 3RWQA 3W2PA 4C02A 3GFEA 4CFNA 3NMUF 5HCXA 4M97A 5JFSA 4DF3A 3KULB 2R3PA 2OZOA 1U59A 3UQFA 1KE7A 5AEPA 4AW2A 3GT8A 4I22A 4IX4A 3WBLA 4ZSAA 5HIDA 3HGKA 3C13A 2XMYA 3OZ6A 3L9LA 3DGKA 4RQVA 3L9PA 2B9JA 4R7HA 2C5YA 1ZOGA 5I0BA 2HAKA 2GFCA 3FYJX 4QMSA 5M06A 5J5TA 4Y72A 4KIQA 5LCJA 4RVTA 3MJ2A 4JIKA 3SHEA 3ZLYA 5FD2A 4HGSA 2YM6A 4O1PA 2W06A 5HLWA 2X0GA 2PZ5A 5EHLA 2CGUA 5M09A 3U51A 3UO4A 5KKRB 5T6KA 4YC8A 4BTKA 3BYSA 4LM5A 4KKEA 4E6AA 4J52A 4AOIA 2YZLA 4FEUA 3UPZA 4MHAA 5ICPA 4FTAA 4FK6A 4YZBA 4WUAA 4IZ5A 1CM8A 1OITA 2GFSA 4CSVA 3A7FA 3BYUA 5H3QA 4WT6A 4I5HA 3VBWA 4NJ3A 5IEVA 3NCZA 4FNWA 5IQDA 1M14A 5IA1A 2ESMA 2XM9A 3BEGA 2V7OA 4N6ZA 3WYXA 4YTHA 5ITAA 5M4UA 2QOKA 5JMSA 2XCHA 3FJQE 4MK0A 3E8NA 4I3ZA 4RVLA 4CZUA 3UOHA 1YDSE 4NM5A 2ZM4A 4EHZA 3CS9A 3WE8A 5ETAA 3JY9A 5FDPA 5FXRA 1DAYA 3CE3A 4X6QC 4C62A 2ITXA 5AR3A 3NIEA 5T68A 4I20A 2IZSA 3C4XA 3KMMA 3SW4A 4BCGA 2GHLA 1Y91A 2GQSA 4BCOA 4NUSA 2IVSA 2BRBA 3DAKA 3W8QA 1YDTE 4ALWA 4OTHA 3EOCA 4IZ7A 3LXPA 3TDVA 4YO6A 4ZP5A 5IEXA 5AUYA 4AN3A 3A4OX 4LG4A 4IAKA 3O8PA 4QNYA 3WZJA 5H8EA 2QO7A 2B4SB 5TT7A 4K33A 1Y8YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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