2XKEA

Structure of nek2 bound to aminipyrazine compound 5
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
277
structure length
243
Chain Sequence
SRAEDYEVLYTIGTGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSDLKPANVFLDGKQNVKLGDFTPYYMSPEQMNNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLILEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2
publication title Aminopyrazine Inhibitors Binding to an Unusual Inactive Conformation of the Mitotic Kinase Nek2: Sar and Structural Characterization.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 243
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2xkeA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xkeA01
4RFMA 4FNXA 2BR1A 4BKJA 4NW5A 4NWMA 3LZBA 2B54A 3HRCA 3QHWA 4RJ7A 4O81A 3AD6A 4WUNA 4KSPA 2ZM1A 3PXRA 1VR2A 3R7GA 4FTUA 4YJNA 4BCIA 4FG7A 4EOPA 4D2RA 4JOAA 4ZZOA 3DU8A 4UWCA 3UIXA 3NYXA 1FMOE 2ERZE 4A06A 4FG9A 4HVDA 2ONLC 1Q99A 3LM0A 5LXMA 3OEZA 3PY3A 2F2UA 3A99A 4LL0A 5GZ8A 5E1SA 4ACHA 5KZIA 4IFCA 1A06A 2VTMA 3KL8A 3EB0A 2Y4IB 3EKKA 4GL9A 3VW6A 5A14A 4PF4A 1OUKA 1S9JA 3PFQA 4CFMA 5EM6A 1REJA 2Z60A 2Z7RA 4ITJA 3OCSA 5CXHA 3NUNA 4I23A 3THBA 4DG2E 2CMWA 2YIXA 4I5PA 5J9YA 2R3IA 3IS5A 2XMYA 2I0YA 4DTKA 2WOTA 5ACBC 2O0UA 2PUUA 3WIGA 4J99A 1PY5A 2J5EA 2XNMA 3LOKA 2RG5A 1YW2A 5DEWA 4BWKA 5AAEA 3F3ZA 4FTLA 4G3EA 4MWIA 4XV9A 3RALA 4YR8A 3R1NA 3R9NA 2RSVA 3GXLA 3TNQB 2J0IA 4TNDA 4YTHA 1YWRA 2OZAB 3LMGA 4PMSA 4FL1A 2XJ1A 4ANLA 2RL5A 4MXXA 4GT3A 3OVVA 4JT3A 3FPMA 4J53A 3PXKA 4TWPA 1EH4A 2VUWA 3FKOA 4NH1A 5AP6A 2W1IA 4X3JA 4ASEA 1OKYA 2PTKA 4WHZA 2SRCA 3EQIA 2W4KA 3UYTA 4IWQA 2VWXA 1FVVA 3ZUUA 3F66A 4CZYB 2XM9A 4YZ9A 3BI6A 3MBLA 3UIUA 1OIRA 5HCYA 3KXGA 3VBWA 3VUKA 4F9YA 4XJ0A 4W8DA 3R04A 5HNIX 2GQGA 4QP7A 4ALUA 4JX3A 3TM0A 2W96B 4M3QA 3HUBA 5C9CA 3TNPC 5JGBA 3QALE 4XP0A 3UO6A 4CTCA 2HWPA 4P4CA 2WFYA 4E8AA 2W5AA 2FO0A 3E92A 4FSTA 3KA0A 5AR5A 1ZOGA 1OIYA 2F9GA 3MW1A 4A4LA 3G15A 3R8LA 4M15A 3BU5A 4IEBA 4K6ZA 4L01A 1SNUA 4XP3A 3ZO2A 3ZLWA 1HCKA 3MPTA 4ZEGA 3RAIA 4LGHA 4PL5A 2EXEA 4V04A 4FTMA 3ZXZA 3NDMA 3ORXA 4JBQA 1ZY4A 5FXRA 3A7IA 4C3PA 1KE9A 2YIWA 1OKWA 2RFSA 5EDRA 2J6MA 4FVRA 5KHWA 1GOLA 2G9XA 2I0HA 3LE6A 5EYDA 1UNHA 4C61A 2AYPA 4EK4A 2XKFA 3F3UA 3FXWA 5BVFA 3PG1A 2BROA 3ENHA 5IH5A 3CQUA 2W1FA 3F3VA 3OOGA 4U7ZA 4ZTQA 1KWPA 1MQBA 1GIJA 1B39A 5E8XA 5AWMA 5IKWA 3R7EA 2R3RA 4UYAA 2VO3A 2A4LA 4BDFA 4ZSLA 4XG7A 2XBAA 3UC3A 5BUJA 5A4EA 1S9IA 5A54A 1KV1A 3FY2A 4RFYA 4HGLA 2PVKA 3NCGA 4EEVA 2NRYA 4C59A 1ZYLA 3AMAA 2XKEA 3NLBA 3MH2A 1T45A 4I4EA 1CM8A 1CKJA 4XG3A 5M56A 1BX6A 3DAJA 3LFEA 3QX2A 2XK8A 4RG0A 3VBVA 3MY5A 4QTDA 5CEOA 1P2AA 2R7BA 2VTAA 3NCZA 4O6EA 4FV5A 2Q0NA 3LQ8A 4Y72A 2HYYA 4WG5A 3V5TA 4CYJA 3B2TA 2I6LA 5F20A 1XBBA 4JIKA 5DGZA 2PU8A 3CGFA 1IA9A 3LAUA 1PJKA 2VTQA 3DT1A 4FZ6A 5K3YA 3OC1A 5IQDA 4Z7HA 3C4WA 4EOJA 3HA6A 5DEYA 3EJ1A 4FYNA 2VNWA 3E7VA 4WT6A 5GIOE 4KKEA 4EH5A 4C2WA 1Y8GA 2WEIA 4ITHA 5DHJA 2GS6A 2IVTA 5GZ9A 3KF7A 3GGFA 4TYJA 3P5KA 3DKOA 5C8MA 3R0TA 5LVOA 2CNVA 5E91A 4CRSA 3C5IA 5T6KA 1W84A 3TN8A 1DAYA 3E64A 3VN9A 2YACA 3Q3BA 4RJ4A 4C37A 2FSTX 3V5JA 3MPMA 2KTYA 5EI6A 4LOQA 4OT5A 2UW6A 3DFCB 4Y85A 3VIDA 5AFVA 3IGGA 4O22A 4W4VA 2WMVA 2W06A 5AIRA 4E4LA 3JYAA 4OTDA 4GYIA 4GIIA 4EOSA 4RIYA 2XCHA 4U8ZA 5CWZA 3EFLA 3UVPA 4WUAA 5B0XA 4FKPA 2Y6MA 4D5KA 5KMKA 3MV5A 3QD0A 1NXKA 5FD2A 3QQKA 5HCZA 2IVVA 3R9RA 4BGQA 3AT4A 4EOKA 2VZ6A 3WF5A 3QA8A 2GU8A 3CQWA 4FK3A 2QURA 3CKWA 2UZOA 3QU0A 4PNIA 4K11A 3ZSIA 4F1OA 2YZLA 3U54A 5EYMA 3DS6A 4QRCA 4AGDA 4IIRA 4F99A 4FT0A 3HLLA 3LCOA 3IKAA 4RPVA 4U79A 4M8TA 4H58A 5HBHA 2V7OA 1KOAA 1H1WA 1OZ1A 2FGIA 3RJCA 3C4FA 4J95A 4K1BA 4OTGA 3OCTA 5DE2A 4BDGA 4B0GA 3OG7A 2WTIA 4FV8A 2XYNA 3HMNA 4YSMA 2JITA 5C27A 2PVNA 5KX8A 2PVRA 3LCTA 5L2IA 3VS6A 1L3RE 3FMJA 1MRUA 2EB3A 2YM6A 4O0RA 1RE8A 3FWQA 3KRLA 5HQ0A 4JR7A 4C3FA 3GCQA 3FZTA 4EJ7A 3QXOA 4FV9A 1XH5A 3KN6A 3OWJA 1SZMA 1Q8ZA 5ETCA 3KMUA 5HE0A 4HVIA 2EU9A 4X7QA 2H96A 1APME 3NMUF 4LQMA 5KBRA 2BTSA 4APCA 3V5QA 3ZYAA 5F94A 2YITA 3SDJA 5A46A 5EM7A 5C8NA 4A7CA 3S0OA 4YO6A 4BBEA 5M53A 4ZSAA 4UMRA 2V7AA 3EZRA 4QPAA 4YURA 4XBUA 2YERA 4W9WA 3DXPA 4H05A 2PUNA 3U55A 1SVGA 5HTCA 5K0XA 4YTIA 5FXSA 1CTPE 4XRLA 4YC8A 2YCQA 3DBQA 3ORNA 4F9AA 3F6XA 4FIEA 4LGDA 5AP3A 4BDKA 4L45A 5CEMA 4CZUA 4MYGA 2GTNA 1F0QA 4BBFA 4EONA 3ZH8A 4ZMEA 4O0UA 3BGQA 1H26A 3BLHA 3PRFA 4ZS0A 1YHWA 2YCRA 5HLPA 4HGTA 4C3RA 4EC8A 5BYLA 3KULB 3ZBXA 3LLTA 4W8EA 3BYMA 2OIBA 2QOFA 4IDVA 4DH1A 3KY2A 4J7BA 2HK5A 5HESA 2J0MB 4GKHA 2ZM4A 3C4EA 3FKNA 4BIEA 3WI6A 4C35A 2YDIA 4DH3A 5CF5A 1ZZLA 4M0ZA 5CS6A 3W2PA 4K33A 3BYOA 3P9JA 4HJOA 4EOQA 5AEPA 3WIKA 4AA4A 3RBWA 1OBGA 3R71A 4HYIA 4L68A 4EZ5A 4AAAA 1OPLA 3ATSA 4MTAA 4H3PA 3QFVA 2XB7A 1IASA 3ZU7A 4BCNA 4ANSA 4UX9A 3DOGA 4MXOA 2WTKB 3VUMA 3LLAA 3FJQE 3DBCA 5EDPA 4P2KA 4TYGA 3D4QA 3ZDUA 2QI8A 5KMLA 3H9OA 4FNWA 2HY0A 1KE8A 4UWYA 5AV2A 5FXQA 3Q96A 4CKRA 1U59A 3M1SA 2C3IB 5CU3A 5BYZA 2J0JA 1OMWA 5M4CA 4FTIA 3JVRA 3NVMB 2XA4A 4YBKA 2J4ZA 1SNXA 1Q41A 4GFMA 4IBMA 3TZ9A 2CLQA 3NYVA 4XRJA 1B6CB 1KE7A 3MFRA 4ITIA 4P7EA 1AGWA 3GEQA 2ZV8A 3F88A 3FYJX 5FDPA 5HIBA 1FVTA 3ZZEA 2O65A 3EH9A 4RC4A 4TWCA 1Y57A 5LWNA 2X2MA 5GIPE 5LMBA 3DTWA 4OR5A 2A0CX 4QMSA 3LKMA 4O7TA 3MESA 4BI0A 4O0VA 3A62A 4H36A 3HAVA 1OM1A 1I09A 2FVDA 3UIMA 4FUYA 4PDPA 3E93A 1GNGA 5D11A 1J7UA 2GNLA 1ZYDA 4GH2A 5I3OA 4X3FB 5JEBA 2HAKA 2HZNA 5EQEA 4IM3A 1G5SA 1VJYA 3V6RA 3BU3A 3OCBA 4GSBA 3VWAA 1PXJA 1Q5KA 2ITPA 3QGYA 4C4IA 4DH7A 4TRLA 1XQZA 4FIIA 3QKKA 2PUIA 3UP2A 1UNLA 2ITNA 3UP7A 4YPDA 3N4UA 3ORMA 5AP2A 3UOHA 5CAVA 4L46A 1MP8A 3VF9A 4F1MA 5HD4A 4Y73A 2X8IA 2ZAZA 4Q2AA 5AV4A 2BZHB 4IZYA 3DAEA 3O2MA 3A60A 3DY7A 3OMVA 5FBNC 2ONLA 1GZ8A 4IZ7A 5DN3A 4B6LA 1IAJA 2ZOQA 4U40A 4KIKB 4FE2A 4BYJA 5GZAA 3G6GA 4MF0A 1W98A 5CEPA 3U9CA 3F3WA 5CVFA 2IW9A 3O50A 5BVNA 4U3YA 2G01A 5IA3A 4MD8E 4MNEB 4F6WA 5HEZA 3V5WA 4FSWA 4BDJA 4IXPA 5M57A 4OAVB 1PXOA 2HCKA 3FMMA 3EFWA 3HV4A 3O96A 2J2IB 4BIBA 1YOLA 3MFSA 3FSKA 3GUBA 3PVWA 4S30A 4UZDA 3UG2A 1H27A 3EWHA 4EHEA 4OBOA 1DI9A 4XG6A 3PJ2A 3DTCA 1QMZA 1NVSA 2ERKA 2J5FA 5I9YA 3VF8A 3Q9YA 4FF8A 2XVDA 2XK6A 5TO8A 4DLJA 1SVHA 3R00A 2O5KA 3UVQA 1GZOA 5KKRB 3AXWA 5FRIA 2XK7A 4R3PA 5K4JA 3ZLXA 2WAJA 4FYOA 4TL0A 1SMHA 1WBTA 3ZLYA 2C3KA 2JBPA 2VWUA 4QT1A 5JGAA 4DFBA 1J1CA 4FV2A 3FQSA 3ID6C 3MYGA 2VN9A 2QKWB 5J9LA 4K18A 3HAMA 2X4ZA 3PPJA 5CQWA 5FWKK 4UZHA 4AT5A 3FUPA 4WSYA 4O7ZA 4BB4A 1PW2A 3R8MA 2UZNA 3P7CA 1YHSA 3L8PA 5M51A 3JPVA 2W05A 2X6EA 2HOGA 5KCVA 1PMUA 2B9IA 4AW1A 3ATTA 4UMPA 2CCIA 2GHMA 5I0BA 2PSQA 4X2KA 3V8WA 4CMOA 1OL7A 1P5EA 1V0OA 3DKGA 3T3VA 3VS4A 4BZDA 4FL2A 3VJNA 2OICA 4U81A 3OWPA 4KKGA 2QNJA 3O7LB 4KIOA 2G15A 3DZQA 4OBQA 5HO6A 3V6SA 3ZMMA 2WD1A 5A9UA 5ITAA 2YZAA 4U6RA 4IAKA 4WRSA 4CV9A 4EZ3A 5E4HA 3A61A 3W8QA 2C6KA 2ZV9A 5IA2A 2IZRA 4YC3A 4FIFA 4RGJA 3ZUTA 3A7GA 4LG4A 5GJGA 2R3NA 3IW4A 4IWPA 4RRVA 5CF8A 2BZJA 4FTAA 4MQ2A 4NKAA 4RWIA 4BZOA 4Z3VA 1I44A 3COIA 4KAOA 3HVCA 4XHKB 4XG4A 4ZY6A 5DG5A 2BFXA 3PXQA 3QQFA 4AOTA 1TKIA 4H3QA 3EN4A 3A2CA 3O0GA 5J5SA 4RC2A 4FZ7A 3OD6X 4DG3E 3FC1X 4TYEA 4CZTA 1TVOA 4QMWA 4L52A 2IW8A 4EHGA 3NVKI 5ANOA 4ANNA 5CSPA 4GK3A 5EKOA 3UIBA 3SAYA 3ZUVA 3M42A 3NRMA 3EYHA 3CC6A 2XIYA 4DEIA 5KMIA 3D0EA 4OGRA 3NEWA 1TQIA 1U46A 3SVVA 4QQCA 4YJVA 2I0VA 3QTRA 1IEPA 4BTJA 5DR6A 3QLGA 3UQGA 1YXUA 4CG8A 3K3IA 3Q4TA 1WBWA 3CTJA 4ALVA 2C6TA 3G90X 2V22A 3QL8A 5LVPA 1QPDA 5ETAA 5F95A 5CAQA 3ZO1A 3QA0A 2PE1A 3IOPA 4M7IA 4C62A 4YJRA 1Q8YA 3H0YA 3QTQA 4XOZA 3VAPA 2BMCA 1MRVA 1JBPE 4JQ7A 3SX9A 3QD4A 3MH3A 5GINE 1Y6AA 1UNGA 3E88A 3C0GA 2VWVA 4IC8A 4TNBA 1Z5MA 4C4JA 2I1MA 3EOCA 3OWLA 4OTPA 3SQQA 3UG1A 3U6HA 5M44A 2A2AA 4LRJA 4DFXE 2ZB1A 3NZ0A 2FUMA 4FT3A 5CENA 4UEUA 4J1RA 3D7ZA 3L1SA 5JZNA 3LFDA 4QD6A 4F08A 5IDNA 3U6IA 1K3AA 2FYSA 2X8EA 4USDA 4IAYA 3W18A 4BDDA 4FNYA 3ELJA 3FPQA 3HV5A 4RIWB 4IM0A 3EL7A 4DEEA 2XCKA 2C5YA 2CGXA 1JAMA 2WQMA 5JK3A 1ZOEA 1ZYSA 2W1GA 3KN5A 4K8AA 4FSMA 4BCHA 3FL4A 4H3BA 4I6BA 1XKKA 4UB7A 3UC4A 2YM5A 4X0MA 1J1BA 4G5JA 2PVMA 5E7RA 2CLXA 4GVAA 3ZRLA 3PE1A 4G3GA 1PF8A 3UZTA 3SOAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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