2XM1A

Btgh84 in complex with n-acetyl gluconolactam
Total Genus 244
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
244
sequence length
712
structure length
645
Chain Sequence
SLQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKQSSKKGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMLPLQVKANRVLISPEIELDAIYPGENIQINFLSAGLQKAPVKFVRFQFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Inhibition of a Bacterial O-Glcnacase Homologue by Lactone and Lactam Derivatives: Structural, Kinetic and Thermodynamic Analyses.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 244
structure length 645
sequence length 712
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2xm1A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xm1A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2xm1A01
2VR5A 3DHPA 2IUZA 1OBAA 1WZMA 2EPLX 4HZ8A 5C71A 2XYLA 1MW0A 1CWYA 3AROA 3TTYA 1QNPA 4CVWA 4PYSA 2YL5A 3VTRA 3M46A 1LLOA 2VVNA 3AHYA 5E0FA 1ZBWA 1UD6A 5HNNA 1D3CA 1TVNA 4GZIA 1QBAA 3WEMA 1J0HA 1E6NA 4JFTA 1G1YA 2JALA 5A6LA 1HJUA 1XSJA 1JDDA 1MXGA 1NP0A 3PZIA 3BAIA 1HP4A 1KCKA 2BVTA 3SEPA 1ISXA 3GDBA 4ML4A 1UR0A 1J0YA 1UH2A 3A3HA 5M17A 3SCOA 1OB0A 1CLXA 1UUQA 4X0VA 3ZR5A 6CGTA 3PZTA 1H11A 3T0BA 1UZ1A 1B0IA 1DWHM 3RO8A 4WK9A 1TUXA 1NOWA 2BFGA 4DUWA 1GOIA 2WVVA 2BY2A 4Z2GA 1W1TA 4GKLA 5I77A 2VZTA 1ISZA 2J7GA 3W4RA 1FH7A 2J7BA 4J3SA 2JE8A 1KCLA 3BAYA 5BXTA 3MANA 3ZT5A 2OYKA 3NSMA 1MYRA 2XIBA 4KGJA 3WNMA 1ISVA 1IT0A 3BLKA 1JNDA 4UNIA 2CKSA 3AMGA 2XG9A 1R8LA 2W91A 2QHAA 5E6ZA 2WCSA 1U33A 1VBRA 4H41A 1KR0A 1QW8A 3WBEA 1FP9A 1ZBVA 5BROA 1CGUA 1ITCA 4E4PA 1CLVA 2CHNA 3MV01 1B3XA 1GOQA 4UQAA 1SMDA 1NWRA 3ARQA 1AMYA 5ABFB 4M56A 2DQXA 5HPOA 1GQLA 3L4UA 4P7NA 3GZAA 1UWUA 1K9EA 4D6EA 4YHEA 3VILA 1DWFM 3EMQA 2CYGA 2ZX6A 1ODUA 1W3KA 4UFKA 1V03A 3ARRA 1B9ZA 1BGAA 1KGWA 2WMKA 5DMYA 2WMFA 3BSGA 2VZUA 4WKFA 4H2CA 5A8MA 3UERA 1BG4A 1LG1A 3VGDA 2VQUA 1CGXA 1W3LA 5I6SA 1MFVA 4B15A 2W61A 4AXNA 4ACZA 1TCMA 3SCTA 1TA3A 2J7EA 4DM1A 1E55A 3HMCA 1BF2A 1M7XA 3UEQA 1K6AA 1S46A 4UOZA 1HL9A 3T2QA 3UG4A 3AHVA 4EK7A 1JGIA 4B3KA 4BQ2A 1OWQA 1K9DA 4W87A 2EXOA 3WQVA 3FN9A 1H41A 2XVGA 2PI6A 3VIPA 4KRTA 3VINA 3VIOA 5CJ5A 3CGTA 2X0HA 2G3JA 1C93A 4QLKA 4ZFMA 5D4YA 5JIPA 4TX6A 3BAJA 1J0JA 4W86A 4OBRA 4JZ5A 3VUPA 2VZVA 5BWFA 1Y7VA 1E0XA 1CXIA 1J0KA 5TD4A 4JCLA 3WEOA 1W9XA 1V02A 1W91A 3PN8A 1WZLA 4W84A 1UWSA 3N04A 1HF6A 4AISA 1BYCA 4LQ1A 2X05A 3NCOA 4XB3A 3E1F1 1GOKA 4U5IA 3AXXA 5FOOA 1VFOA 1E3XA 3DYOA 3M7SA 1A3HA 2FGLA 2YLLA 2WVSA 3A4AA 1QPKA 1XSIA 4R5EA 5DO8A 4W7WA 2PBGA 3W29A 6A3HA 1KWKA 3F5KA 1JXKA 1V02E 5E0CA 1HKKA 2VTFA 4AZ7A 1HP5A 4DWSD 5A95A 2XTKA 1FOBA 1VFUA 3PTKA 3BGAA 4U2ZA 3CZGA 1LF1A 2ZXDA 1V6UA 1QHOA 3KL5A 2WXDM 3O2LA 4UQDA 2EQDA 2GJRA 4MDPA 3ZO9A 1Z32X 4YN5A 3RJYA 3ZJ7A 5GNYA 4E2OA 3ALGA 1GOWA 4OUEA 3OZOA 3II1A 3RDKA 3IK2A 4LYPA 4MB4A 4P7RA 1TA3B 1XH0A 1XYFA 2OYLA 1EO5A 2V38A 3ZQ9A 1WZKA 3GTNA 1QI5A 2ZXBA 3GNPA 3EDEA 1P6WA 3IAQA 3N18A 4KH2A 4ATWA 1NWUA 1BHGA 1F4HA 2XHYA 1H0IA 2GSJA 2WBKA 3WQ6A 4U5KA 2E8YA 1FH8A 3B9EA 5A2CA 1G94A 4BZYA 3K4DA 1VJZA 4AZHA 3EMCA 4M1RA 3F4VA 1GJUA 1UKOA 3B9DA 4DWSA 1R86A 3ZMRA 1PBGA 1VJSA 4HP5A 2WVUA 4UTFA 2VZSA 3KE0A 2V3FA 3ARXA 1UD8A 1E4LA 1W2VA 1BAGA 1J0ZA 2JF7A 1GUVA 3VD5A 2CESA 1HJXA 3SUUA 4ZXOA 1OGBA 4N0RA 3WY1A 4FK9A 1WKYA 2CXGA 4A4AA 3SUWA 3VKKA 5LYRA 3U5YA 1CENA 3NJ3A 1LL4A 2D0GA 1ESWA 2PWDA 3MMDA 4M8UA 2ZX5A 1WB0A 2E8ZA 1E72M 2ZX7A 3CUJA 1FHDA 4D6GA 2VUYA 2ESCA 3OGRA 1JZ6A 1MW1A 3ZM8A 1E40A 2WANA 3EDFA 4AZCA 5I5RA 3PHAA 2BVDA 1HVQA 2BHUA 2WHJA 1KXQA 3VDCA 1CIUA 3K4AA 1QBBA 2W62A 4AZGA 1LWJA 3FHQA 1H3GA 1L8NA 4J3TA 1UR1A 4A3YA 4M29A 3FXYA 4P8VA 2NW0A 3W25A 3HN3A 2UY4A 1CXKA 5E6YA 1BVZA 1EQCA 2GK1A 2NT0A 2WMGA 4UZSA 1QNOA 4W88A 1QHPA 3AHZA 1I1WA 4W8BA 1B90A 1GOOA 2XFYA 4AIOA 4QLLA 4DWSB 2BHYA 4HOZA 3AMLA 1C92A 3WF2A 1ZJBA 3RPMA 1F4AA 2XWEA 4CD8A 2ZXQA 2VC9A 1B1YA 2YOCA 2DSKA 4BQ4A 1GQJA 4AD4A 4DUVA 2O9RA 5FL0A 3VDBA 1E5NA 3HU7A 1ISYA 1H5VA 3BMVA 1XH1A 1C91A 5A8PA 3RIKA 1CXEA 1SR0A 1E71M 4AZ5A 2UY5A 3GBDA 2VX7A 1FP8A 1Q6DA 1SMAA 2V3GA 3W26A 3UG5A 2WHKA 1NWTA 4EE9A 2YBUA 1JI2A 4AZCB 3WD1A 1CDGA 3WNNA 5C70A 4P8UA 2J25A 4PMDA 3OB8A 4MJ2A 5BXPA 1HXJA 2VL4A 2W92A 4HMDA 3K1DA 3U57A 2WNWA 3U5UA 2XGIA 1J10A 2ZICA 1OD8A 3AIBA 4L4OA 4F79A 1KGXA 3N11A 2UY2A 4X0NA 2D3NA 3OA5A 1UWIA 1LL6A 1R87A 3BCFA 3FAWA 4PMZA 3THCA 1B3YA 3AIUA 5GNZA 1CGWA 3VOCA 1OINA 1GCYA 3L4ZA 5I24A 4U3AA 1XYZA 5BRPA 5JBFA 1PJ9A 4Z2HA 2UWFA 2VCCA 5AC5A 3UR7A 1X1NA 2CBJA 1JI1A 3ARZA 7TAAA 3J7HA 4J3UA 1WCGA 4IPLA 4F9DA 2DT1A 2C8NA 3QHNA 1MFUA 4D6JA 5BCAA 3KL3A 2DT3A 1FFRA 5E09A 4J3XA 2VRJA 3A6OA 2EPKX 3WFZA 3AS1A 1CZ1A 1XHGA 3ARSA 2BY3A 2WM0A 2QPSA 1UKTA 5DT5A 4AZIA 1WDRA 3I3DA 4HA3A 2RGMA 3N9KA 3T2PA 1BLIA 2YA2A 5D9NA 1RH9A 1V6VA 4UFLA 1JZ8A 1JDCA 4CD4A 1E6QM 3AMCA 4OBSA 4LXFA 2ZUVA 3VMNA 1M53A 1M01A 2PF0A 4WSJA 3AYSA 3WDIA 5E70A 4JHOA 2XVLA 2DSZA 3KWXA 3G6MA 1CNVA 1G01A 2WZHA 3GXIA 3TTOA 4MJ4A 4D1IA 3VGHA 3CZLA 2VRQA 5BXSA 3AISA 4QAWA 3LPOA 1ZJAA 4GQRA 4CD7A 1LL7A 1V08A 2OWXA 2Z1KA 4D6CA 2ZXAA 2CERA 4D1JA 1JD7A 3CTTA 3AIRA 1TZ7A 2VR4A 3VIIA 3WFLA 2CBIA 1PIGA 3POHA 3W38A 2FDMA 2ZUSA 4EANA 3AMKA 1DTUA 4CGTA 1US2A 4PMOA 1LWHA 3L2MA 7CGTA 2BY1A 3L4WA 2O92A 1EO7A 4CN1A 4TTGA 1I75A 2DSVA 2HVMA 1AQHA 2G4FA 3LPFA 3UCQA 5D9PA 4U33A 1PZ3A 5EFDA 1E3ZA 5AY7A 1DHKA 1XGZA 4PN2A 1J9YA 3WH5A 2FHCA 4TOQA 4BQ5A 2O9PA 2ZUWA 1VIWA 1V0LA 3WENA 4AD0A 4XZWA 2W67A 2OWCA 3ZSTA 1GONA 1DWIM 4WKAA 4P8XA 5LA0A 4ZENA 4D6FA 3AS0A 3N1AA 4GI8A 5A69A 1LQ0A 2FH6A 3ZT6A 4TX8A 1QNQA 3FHAA 3S2CA 3A47A 2G41A 4OKDA 2IXVA 2EPMX 3AICA 3CZJA 4BCEA 2J62A 4OOUA 1HJWA 4PMNA 3VD9A 3L4XA 4LPCA 2WPGA 3QGVA 1BYAA 1E70M 1VEMA 4MNLA 2JIEA 5IFPA 2X1IA 1W3HA 1EGZA 2ZIDA 4HPHA 1E5JA 4M80A 1Q4NX 4JL2A 2J7CA 1CBGA 4UOJA 1AVAA 5A6SA 2CBUA 4AEEA 1QNRA 3CBWA 4UOQA 1US3A 2Y2WA 1C7SA 3DYPA 4PSPA 3ZT7A 1ECEA 4TVUA 3CUIA 8A3HA 1O6IA 4GXPA 5BYWA 1QI3A 3CZEA 1IZKA 4PMYA 3AFBA 2FHBA 5CPTA 1FFQA 3ARUA 4ZE4A 1V6YA 1B3WA 1XRVA 3PTQA 1ZL1A 2NSXA 2XJ7A 3EYPA 1Q6FA 3FNDA 5IDIA 1CGTA 2VCAA 5CGMA 2ZX9A 3WUEA 1J0IA 2DEPA 3UESA 2OLHA 1H4PA 4MPKA 3W37A 3WDPP 3AYRA 5HOSA 1WP6A 1ISWA 2WVVB 3QHOA 4UQBA 1EOMA 2BXYA 1PPIA 4HTYA 5D9OA 3B8SA 4UR9A 2UY3A 2A3AA 2F61A 4GI9A 1EQPA 2B31A 1R7AA 1NP2A 4DUXA 4IISA 1GW1A 3SCSA 1PEZA 4Z2KA 2A3BA 5IXEA 3SCVA 4TTUA 5CPQA 1HKIA 3WEZA 1JF5A 4AYSA 3G6LA 3K8LA 2PBOA 4J3WA 4W93A 1WPCA 4KMQA 1E1EA 3W28A 2PWGA 2QF8A 5FKYA 4P7QA 5CLTA 2W63A 4QDMA 3L4VA 4L4PA 4ATDA 1UOKA 1V3IA 4U3CA 4ZXLA 4JCMA 3NUKA 1GHSA 1QHZA 1QOXA 3QOMA 4DWSC 2GDUA 3UR8A 2J7DA 4MNMA 2VI0A 3ECQA 3DC0A 3GXFA 1ZU8A 4W85A 4PMRA 1HJVA 4F66A 5EMYA 2AOSA 4W5UA 1UKSA 1HKJA 4LGXA 4OOZA 3N17A 3RMEA 2V3DA 1WDQA 4PMUA 2GUYA 1VB9A 3VPLA 2ZWZA 2EBNA 3L2LA 3CZKA 1V3JA 1UQZA 3VGFA 1HX0A 3GH7A 4UQEA 1OM0A 3W24A 4HZ6A 1C8YA 5KZ6A 4ACZB 1OIMA 2D22A 2FGZA 1D2KA 1W9UA 2W5FA 4LYQA 3ZJ6A 4C7FA 3VM7A 3VGBA 1JFHA 4XX6A 3GH4A 4WKHA 3HJEA 3SCWA 1FH9A 4C7DA 1W1PA 3WH8A 4WSKA 4PCSA 3MUZ1 1V3KA 3PZNA 1ZBKA 4XUYA 2F8QA 4GO9A 7A3HA 2J78A 3BLPX 5IHRA 2WB5A 1UH4A 5JIWA 1UD3A 1KWGA 3PZUA 2WSPA 2YIHA 4V28A 2AMGA 1V0MA 2CITA 5I0DA 2X2YA 5M3WA 3N13A 1C8QA 3VMOA 3N12A 1C3FA 3OBAA 1JYWA 1EHAA 2XWDA 1HJSA 2VX5A 2WHLA 1A47A 4AWEA 1ZS2A 2WMJA 5D9MA 1OT2A 3VO0A 3AJ7A 3L4TA 5GPRA 2WLYA 1YHTA 2D1ZA 5A6JA 1XD0A 5CZKA 1L0PA 3IJ8A 4WIWA 3PZMA 3SUTA 6TAAA 4CD6A 3CMGA 2A3CA 3GM8A 5KEZA 2OSWA 3W81A 1JDAA 1HNYA 2VT0A 1V0KA 3GNOA 2E9MA 4FLQA 1HKMA 1PIFA 2Y24A 1JXJA 4HMEA 4UFHA 1TR1A 1E6XM 3PTMA 3VNYA 4D72A 2DDXA 2D20A 1QVBA 1OGGA 1NOFA 4QP0A 4HA4A 1UG6A 1VEOA 2YJQA 3T09A 3VGEA 1GVYA 4WLCA 1RPKA 4OJYA 1BGGA 1GQKA 3VU2A 2JEQA 3CHFA 3MO4A 2JF6A 5D8WA 3ZOAA 1MXDA 1VFFA 1CPUA 3AOFA 4CN6A 1BPLB 3FAXA 3CIVA 2J4GA 1KXHA 4AD5A 2VRKA 4CU7A 2J8FA 1TG7A 3KL0A 4GO8A 2OWWA 2WAGA 2Z1SA 5CSUA 1H2JA 2WYSA 2A3EA 1V6XA 1G0CA 4GPNA 5A6AA 4CUCA 4ZE5A 4TVDA 1R7OA 1G5AA 4AY1A 2J75A 4JL1A 3OLDA 2OSYA 3VD4A 3D5HA 3EDJA 1N82A 1H49A 1EIBA 1VENA 3LPPA 4MAVA 4QFUA 4P7OA 3CMJA 2PWFA 1BVNP 3ZR6A 2DT0A 1JYNA 5I3DA 4U2YA 2J77A 1XSKA 1C7TA 2VO5A 2J74A 2EJ1A 3WQ4A 5HPCA 4DM2A 3WF4A 1UKPA 4JHZA 4AIEA 5EB8A 1QNSA 1UKQA 4AW7A 2G8ZA 5BRQA 1CGVA 1ITXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2VR5 A;  3DHP A;  2IUZ A;  1OBA A;  1WZM A;  2EPL X;  4HZ8 A;  5C71 A;  2XYL A;  1MW0 A;  1CWY A;  3ARO A;  3TTY A;  1QNP A;  4CVW A;  4PYS A;  2YL5 A;  3VTR A;  3M46 A;  1LLO A;  2VVN A;  3AHY A;  5E0F A;  1ZBW A;  1UD6 A;  5HNN A;  1D3C A;  1TVN A;  4GZI A;  1QBA A;  3WEM A;  1J0H A;  1E6N A;  4JFT A;  1G1Y A;  2JAL A;  5A6L A;  1HJU A;  1XSJ A;  1JDD A;  1MXG A;  1NP0 A;  3PZI A;  3BAI A;  1HP4 A;  1KCK A;  2BVT A;  3SEP A;  1ISX A;  3GDB A;  4ML4 A;  1UR0 A;  1J0Y A;  1UH2 A;  3A3H A;  5M17 A;  3SCO A;  1OB0 A;  1CLX A;  1UUQ A;  4X0V A;  3ZR5 A;  6CGT A;  3PZT A;  1H11 A;  3T0B A;  1UZ1 A;  1B0I A;  1DWH M;  3RO8 A;  4WK9 A;  1TUX A;  1NOW A;  2BFG A;  4DUW A;  1GOI A;  2WVV A;  2BY2 A;  4Z2G A;  1W1T A;  4GKL A;  5I77 A;  2VZT A;  1ISZ A;  2J7G A;  3W4R A;  1FH7 A;  2J7B A;  4J3S A;  2JE8 A;  1KCL A;  3BAY A;  5BXT A;  3MAN A;  3ZT5 A;  2OYK A;  3NSM A;  1MYR A;  2XIB A;  4KGJ A;  3WNM A;  1ISV A;  1IT0 A;  3BLK A;  1JND A;  4UNI A;  2CKS A;  3AMG A;  2XG9 A;  1R8L A;  2W91 A;  2QHA A; 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