2XM2A

Btgh84 in complex with lognac
Total Genus 239
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
239
sequence length
711
structure length
635
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLSGKMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVERNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMPHKMLPLQVKANRVLISPEIELDAIYPGENIQINSAGLQKAPVKFVRFFVLTIEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Inhibition of a Bacterial O-Glcnacase Homologue by Lactone and Lactam Derivatives: Structural, Kinetic and Thermodynamic Analyses.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 239
structure length 635
sequence length 711
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2010-07-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2xm2A03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xm2A02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2xm2A01
1CPUA 1RD6A 5A3HA 2DT0A 1XD1A 3W29A 3GDBA 1J01A 1V0MA 3ARUA 4F9JA 1WE5A 4U5IA 2YLLA 4A3HA 4C91A 4UFJA 4GI6A 3AHTA 4NZCA 5A95A 5IFPA 1UH3A 1CLVA 2JALA 3A4WA 4WIWA 1UUQA 4U2YA 1CGYA 1GOIA 4MNKA 3VGDA 1V6VA 3WH6A 1WO2A 4QFUA 1E0VA 3SIMA 1UR4A 4AZCB 4DWSA 2OSYA 3SUTA 1OGBA 1W3LA 4DM2A 4PMQA 4PBGA 3RIKA 4AD2A 1HX0A 2YIHA 2GVYA 5JBDA 2XJ7A 1FFQA 3MU7A 5DEZA 3BLPX 4BS0A 2WPGA 3WQ5A 1UD5A 1EXPA 4ACZA 4CD4A 4PCTA 5A6SA 4AC1X 4AYSA 2E9MA 3T2PA 3GZAA 3BAJA 4MNMA 1O7AA 1LWJA 1WDQA 1KWGA 3ZO9A 3EMZA 1LJYA 4GQRA 1EQPA 3TA9A 4H2CA 2J7HA 4MADA 2YBUA 1GCYA 2EPMX 4AZIA 1X6LA 1I1WA 5JBFA 3DC0A 3UR7A 3IAPA 1A47A 4UZUA 1XD0A 2VZOA 3NIYA 3RJYA 4J3XA 2E0PA 1QBBA 4GXPA 4JCMA 5CZKA 5GNYA 3AIUA 1E6ZA 2WW5A 1V3HA 4V27A 3ZR5A 3DYOA 4FLOA 1W9PA 4LX4A 1S46A 4YHGA 3WQ8A 3VDHA 2O9OA 4D6HA 3B8SA 1VFMA 4B9ZA 5BRPA 3I3DA 4JFUA 2QPUA 2WVSA 3BAWA 3WF3A 1ODUA 3JUGA 5I2UA 4EAMA 4UOJA 4NI3A 4WSJA 4CVUA 3A47A 1E71M 5A6BD 3FAXA 5CJ5A 3TP4A 5D8WA 2ZUVA 4MAZA 1C93A 3IJ8A 2XM2A 1VFFA 1E72M 3K8KA 3WELA 1CGUA 3BLKA 4XZWA 3WDHA 3CUFA 1PJ9A 4OKDA 3UCQA 1BFNA 1WZKA 1C8YA 5D9OA 2UY3A 1U2YA 1VAHA 4N0RA 4H7VA 1G1YA 2W4XA 1BF2A 4XX6A 3UEQA 5A8QA 1OWQA 2O9RA 4CN1A 3AJ7A 4HMCA 1JXKA 2EPKX 5E6YA 3WMBA 1GQJA 1BTCA 3A4AA 4NRSA 1LWHA 2PWFA 3KL3A 1CGXA 2BNJA 3PZGA 3VMOA 5A2BA 5BXSA 5GPRA 3L4UA 4HPHA 3ECQA 1CXHA 4CD5A 1H0IA 4D6IA 2CITA 1CDGA 2A3CA 3SCVA 3D5HA 2WHJA 1OGGA 3ZSTA 1TR1A 3KE0A 1G5AA 2CKSA 1MQRA 1KGUA 2WB5A 2V3DA 3WD4A 5CSYA 1OM0A 4W8LA 1MW3A 3ZM8A 3BMWA 1H2JA 2VMFA 1UWQA 1AMYA 4X9YA 3KEHA 2CXGA 2BVTA 4U33A 2VL4A 3VD4A 1W3KA 3ZJ8A 2WVVA 2X8RA 4QP0A 2O9TA 4NRRA 4Q22A 1ISVA 3OLEA 3OIHA 1HJUA 2WWDA 2PWDA 1C8QA 2UY2A 4KRUA 1IV8A 5A8NA 2GFTA 3L4ZA 1XCWA 1PIFA 2D0GA 2VC9A 4ZE5A 2CBJA 2A3AA 3WUBA 4TOQA 3OZOA 3POCA 4A4AA 1MQPA 2D1ZA 1O6IA 3K4DA 2VRQA 4MDOA 4S3JA 1FHLA 5HPOA 1H41A 4JKMA 5ABEA 2J7EA 3FHAA 1GW1A 2VJXA 2W63A 4FK9A 5HDRA 4UZSA 1V02E 2ZUNA 3VIPA 2DEPA 4PUDA 4W5ZA 3VMPA 1KBKA 3HJEA 1HKMA 1TA3A 4J3WA 1EQCA 2BY2A 2FHBA 4YN5A 5DO8A 5GNXA 1E1EA 4LYQA 1M01A 1RP8A 4P8UA 5ABHA 4H8VA 3WBAA 3CMGA 4J28A 4TXEA 1W9UA 3SUWA 2UY4A 4ZE4A 1QI3A 1GQLA 2DSKA 3FHQA 5ABFB 1W1YA 5EBAA 2PC8A 4IM4A 3TONA 5D9NA 1TCMA 3SCPA 1ITXA 1FP9A 1QNSA 2JF6A 4B9YA 3VGFA 3I3BA 4JHZA 4OZOA 2ZIDA 3T09A 4CVWA 3MSGA 3GNRA 1MVYA 5DF0A 1B2YA 3GXDA 4M56A 3PZIA 1EHAA 1R7AA 3N18A 2DH2A 2W67A 1ZU8A 4D6EA 4JL2A 2X05A 1PX3A 1BVNP 2Q8XA 5DT5A 2V5CA 1EOKA 1QVBA 1NQ6A 4M29A 1MFUA 2FGZA 2FGLA 4AZ6A 4JFWA 5EB8A 3N12A 3ZT7A 1PBGA 1XYFA 2YL6A 3AIRA 4P8WA 2J25A 4Q7NA 3LPGA 4U31A 3CHEA 3WQWA 5LA1A 4TX8A 5A6MA 2JIEA 3BCDA 3KL0A 3W38A 4F9DA 4CU8A 4JIEA 1HKJA 1BG4A 1KCKA 2Y24A 2NT0A 2ZXQA 3KZSA 3QHOA 4UQBA 5A6KA 3AIBA 5AC4A 1ZBKA 2ZXAA 4WK9A 3ARPA 3T2OA 1P6WA 4EKJA 1D2KA 2BXYA 4HP5A 1TFVA 4GZJA 2VO5A 5A6AA 1H5VA 3WDRA 1V3MA 5E09A 5LYRA 1E6NA 2RGLA 4CU7A 3VILA 2VUYA 1J0IA 3QR3A 1UG6A 5E6ZA 3ZT6A 5A8PA 2NW0A 3WL0A 3WH8A 3WEZA 3SUSA 3KL5A 1G0CA 1UHVA 3U5YA 5HNNA 1E6XM 3W82A 1NM9A 1XV8A 5FL1A 2WHMA 1U30A 2QV4A 1DWGM 3TTYA 5E0FA 2GJRA 3SCWA 5BCAA 5C71A 2EPLX 1Q6GA 4LPCA 4W8AA 4B16A 2NT1A 4R27A 4AEEA 5AC5A 1QW9A 1ZS2A 4DWSD 1EA9C 4D6CA 3QHMA 2EQDA 1HP5A 1XYZA 3CGTA 3VIFA 3CHFA 4JHOA 5CPTA 1HVQA 3D3AA 2D24A 1WZAA 3WNPA 1E73M 3AIWA 4QLJA 1C8XA 2JF7A 1E6SM 3VPLA 4W7WA 1EO7A 5HOSA 1E1FA 1FH9A 1SMAA 3ARYA 2E3ZA 3IAQA 4AEFA 4CCCA 3VIJA 3WQ6A 2DQXA 3SCSA 4M81A 1UZ4A 4PMOA 2D20A 4C90A 3DYPA 3N17A 1C91A 3UG3A 3VIGA 3AS0A 4MPKA 4QDMA 5CSUA 1H49A 1DTUA 2BFGA 3BAIA 3OLGA 1JZ4A 1VJSA 4PN2A 2V3EA 2XGBA 2MANA 3UR8A 3ZSSA 1ESWA 3VVGA 4KGJA 1K9EA 1NARA 2YOCA 4OOZA 1Q6EA 4BQ3A 1WDSA 3AMKA 3THDA 3MUAA 3SUVA 4CD6A 3NUKA 1CLXA 1EDGA 4J3SA 2XFRA 4AZCA 2PF0A 3EDKA 4DUWA 4LYRA 4AIEA 2XIBA 2BVDA 1TZ7A 1MW2A 5FOOA 1QI2A 2VX4A 1UWTA 2ZOXA 3G6LA 1J11A 3CZKA 3TTQA 4DM1A 5IXEA 1V3JA 4Z2GA 2CHNA 1E9LA 1JNDA 2TAAA 3AS1A 4J3VA 1Q6CA 1TVNA 3WUFA 4AD0A 3B9EA 5JIWA 1V3LA 2DIJA 4TVCA 4WKHA 2CBUA 3LPOA 2A3EA 4EK7A 4HOZA 1WZLA 3AHXA 2UY5A 1HJVA 4AWEA 5A2AA 2XG9A 1LG1A 2PWGA 1HVXA 2X2YA 2WWCA 3CBWA 5EFDA 1PPIA 3VGBA 2XFFA 1KB3A 3MS8A 4RE3A 2XSBA 3WY1A 1BYCA 1JF5A 4KGLA 4AXNA 4AZHA 1E6PA 4CD8A 3AOFA 4ZENA 3IK2A 5D4YA 1WKYA 3UERA 1CXKA 1PIGA 1UWSA 4GO8A 1J0KA 1DWJM 4Y7EA 3L4TA 3HN3A 4P7NA 3MMUA 1HN1A 3LMYA 4M8UA 4IPLA 9CGTA 2EPNA 1HXJA 2GUYA 1EDQA 1E15A 3CLWA 1DHKA 1VENA 3WFLA 3VGGA 4MAVA 3VDCA 2XWDA 2G41A 4PMVA 1UOKA 3BXWA 3AHYA 1V0LA 1BGAA 3ZT5A 1PX4A 1W3JA 2BV9A 3PZMA 4S3KA 2W66A 1BYAA 1XH0A 1KXVA 2IXVA 4HA4A 1EHNA 2PBGA 3M07A 1GHRA 3OGSA 3ZJ6A 2HISA 1M7XA 4OBRA 2QMJA 3CUHA 2RGMA 1M04A 2YL9A 2GDUA 1H0GA 3VINA 2FH6A 5BRQA 2BY1A 1UZ1A 2ZX9A 4AY1A 3WDPP 1CENA 1JG9A 1EO5A 2E8YA 8A3HA 1BYDA 1E6RA 2YBTA 1U33A 3AIVA 1XH1A 3M6DA 4L4OA 2C0HA 3NDYA 2E40A 2ZUMA 3UESA 2WBKA 1WPCA 4ATWA 3MV01 4L4PA 3PN8A 3PZVA 5BXPA 1I75A 1GOWA 1GHSA 5FD0A 3VD7A 4J7RA 2UWFA 8CGTA 3G6MA 1J0YA 4JCLA 2DSVA 2ZXDA 4Z2LA 4MTVA 5A94A 4XZBA 3VIMA 1E55A 1JI2A 2WZIA 2OYMA 3ALFA 3ARWA 4U3CA 1PEZA 2JFEX 4V2XA 3AZSA 4UQEA 4YHEA 1UD2A 2BS9A 3DHPA 3BCFA 1CXFA 2XUCA 2WLYA 1KQYA 1R87A 4C7FA 1CGWA 3WFZA 2WMHA 3AS2A 1QHOA 3U7BA 1JFXA 2IUZA 1HL9A 2J8GA 3PZOA 4HZ8A 4MDPA 4Z2JA 1OINA 3UG5A 4UOZA 5ECUA 2C8NA 1L8NA 2ZICA 1KGWA 3WIJA 2WMIB 2VQUA 3BSGA 4HU0A 1GNXA 4MB3A 1MW0A 5FIPA 2OYLA 1JZ3A 4D6GA 1UWUA 2XGIA 3S6TA 1H4PA 1HKIA 2DT3A 2WVUA 2DT1A 2OWXA 5DT7A 4GQQA 2XM1A 3AXHA 4IISA 1NH6A 3VM5A 4BQ2A 3I3EA 2J7FA 4XB3A 1AQMA 1ECEA 2D0FA 1B3XA 4OOUA 3ZIZA 3WEMA 3BMVA 3U5UA 4YPJA 1NWTA 4GI8A 4PMNA 3FNDA 2F61A 1FH8A 4BA0A 3PTMA 6A3HA 4PMDA 1M53A 4CUCA 1GJUA 4P8VA 4CKQA 3WF0A 3OGVA 1TE1A 3WDIA 1HL8A 4DUXA 5A6LA 4UQ9A 2OSXA 3RMEA 1QBAA 3AZTA 1KFWA 4BF7A 1J18A 3AHVA 1ODZA 3RJXA 4JFTA 4LXFA 2DH3A 1FH7A 1NWUA 1HIZA 1WP6A 3L2LA 3F4VA 4EE9A 2BHYA 2YA2A 1OCQA 1OT1A 1ZJAA 2J77A 1JAEA 1GOQA 3SEPA 2OYKA 5ABFA 4Z2HA 1EOMA 2W91A 2J47A 3SCUA 1TMQA 7TAAA 2PWEA 1BPLB 1BAGA 2YL8A 6TAAA 4BCEA 3T0DA 4JAWA 5I3DA 2VVSA 2YA1A 3VGHA 4F8XA 1KXTA 2FHCA 3AIQA 1C3FA 5EMYA 3WD1A 1JYWA 3WD0A 4M24A 3AXXA 3IJ7A 4D1IA 4D6DA 5I23A 3RM9A 2CIPA 3WMCA 1UD6A 4C7GA 4GKLA 4PSPA 3WF2A 1E40A 4OIFA 4H04A 4D72A 1PZ3A 3W27A 1C7TA 1UKSA 2WANA 1CYGA 1VIWA 3ZR6A 1ISYA 1QI4A 1VJZA 4FLSA 4JKLA 3N04A 3IANA 4TTUA 1V02A 2Y4SA 1R86A 1JD9A 2CKRA 2WMJA 4WF7A 2X1IA 4W89A 1XSJA 5I77A 2YKKA 2F2HA 3AI0A 1UR0A 1RPKA 1KCLA 3QOMA 3GM8A 1TG7A 4FF5A 1UKOA 2ZX8A 3CHCA 1C90A 4E8CA 3MUZ1 1NP0A 1NOFA 1J10A 4KWUA 4U5KA 1RH9A 1MFVA 2QPSA 1GZJA 2Y2WA 1JL8A 4UFLA 4TVUA 5A8OA 4FMVA 3VIKA 1KWKA 3EYPA 5DFAA 2WNWA 2WC4A 1LF1A 3F5KA 2WMFA 2WCAA 5A1AA 1JGIA 1D3CA 4F66A 4D71A 2WHKA 1CEOA 2VCBA 5CG0A 4D6FA 4M1RA 4PUEA 2E4TA 1VF8A 4JFVA 1XSIA 1BGGA 4HMEA 2DDXA 4P7RA 3QOKA 2EPOA 1D7FA 4GIAA 4AISA 3VIHA 4CN4A 3SUUA 3GXMA 3CUGA 3PTKA 1B0IA 1VEOA 4UTFA 1LG2A 3NYDA 1K9DA 2WSPA 4BQ5A 1FA2A 3CZEA 3PZTA 4UFMA 2JIWA 2J74A 1UH4A 4TTGA 1JD7A 1PX8A 5E0CA 1ZBCA 1BG9A 3AIEA 3NDZA 3OZPA 2VOTA 3CO4A 1K9TA 2VT0A 2VZUA 2ZX6A 2BY3A 5E70A 2ZX5A 1GVYA 1QOXA 3ZJKA 3AMCA 1IZKA 1XCXA 1UKPA 1B90A 3GBEA 1MYRA 3GH7A 2X0HA 1J0JA 5HPCA 4IUGA 1B3WA 2YDRA 2QMKA 3QGVA 2G3JA 1HJXA 3GXIA 3TTSA 4X0VA 3AS3A 2XHYA 3FY1A 2J75A 4MJ2A 4PMXA 3SURA 2JE8A 3AXIA 4AIUA 4D6JA 1WDPA 2VVNA 4HTYA 4AZBA 3GH5A 1CECA 3CMJA 2WK2A 3CZ8A 5JIPA 4QCEA 3AMGA 1V3IA 1JDDA 5A6JA 1DWFM 5CQ1A 2QHAA 5KZ6A 1LLOA 5GQBA 4B3LA 1W1VA 1W1TA 3VU2A 3AROA 1J9YA 2ESCA 3EMQA 1NWRA 4UNIA 2YA0A 4PSRA 3LPFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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