The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GPLGSPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Motor protein
|
| molecule keywords |
MYOSIN 1E SH3
|
| publication title |
Myosin 1E SH3
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
13
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DF6 A; 1NLP C; 2L2P A; 4E6R A; 2DLP A; 2LJ1 A; 1YNZ A; 1UHF A; 2A08 A; 2FO0 A; 3RBB B; 2EYX A; 3THK A; 1PRL C; 2A36 A; 2V1R A; 4D8K A; 2RPN A; 2RQV A; 2DNU A; 1ZBJ A; 1WFW A; 2K2M A; 1WIE A; 2E5K A; 4OMP A; 2L3Q A; 1UFF A; 1X6B A; 3REA B; 2IIM A; 1KFZ A; 1BB9 A; 1IO6 A; 1K4U S; 3QWX X; 1JXO A; 1SEM A; 2GGR A; 2J6K A; 2JMA A; 1RUW A; 2EVR A; 4LUD A; 2D8J A; 1HJD A; 2CDT A; 2CSI A; 2KR3 A; 2RNA A; 1S1N A; 1V1C A; 3NHN A; 2XMF A; 2BZX A; 4X1V A; 1BBZ A; 2CRE A; 2ED1 A; 3KFV A; 2DL3 A; 2MCN A; 2KYB A; 3JV3 A; 1PKS A; 5I22 A; 4AFS C; 1UDL A; 1UJY A; 2EQI A; 4GLM A; 2W0Z A; 4A63 B; 5IH2 A; 1H3H A; 2JT4 A; 5IHI A; 4ORZ A; 1GBR A; 1NG2 A; 1GCQ A; 2J7I A; 2DBM A; 3UF4 A; 3I5S A; 2KXD A; 2FRW A; 1ZLM A; 4Y92 A; 3M0R A; 2DL4 A; 2JMC A; 1H92 A; 1ZUY A; 2YUN A; 5ECA A; 1WYX A; 2FPF A; 4AG1 C; 2LJ0 A; 3EG0 A; 2LJ3 A; 1X2K A; 2DE0 X; 1Z9Q A; 5EC7 A; 1M30 A; 4LN2 A; 2H8H A; 2ROL A; 1BU1 A; 1AWW A; 5GJV B; 1W6X A; 2V1Q A; 2HDA A; 2JS2 A; 2ABL A; 3O5Z A; 2F2V A; 3VS4 A; 2YSQ A; 1JU5 C; 1OPL A; 4JPB W; 1X2Q A; 1SPK A; 1AVZ C; 2RQT A; 3VS3 A; 2M51 A; 2CUD A; 2OI3 A; 1I07 A; 1GCQ C; 1UE9 A; 5FWC A; 3PE0 A; 2FRY A; 1WXU A; 2F2X A; 1ABQ A; 1UGV A; 1AWO A; 2NUZ A; 2LX7 A; 2J06 A; 2L0A A; 1WA7 A; 3H0H A; 2JTE A; 1SRM A; 1ZSG A; 3EHR A; 2KYM A; 2OJ2 A; 1AWJ A; 1WXB A; 4J9D A; 2FPE A; 1U06 A; 4JJB A; 5FWB A; 3H0F A; 2AKL A; 2EGA A; 1KSW A; 4RTU A; 1MV0 B; 2DRM A; 4HVV A; 2C0T A; 4IIO A; 3U23 A; 4RTY A; 2DYB A; 2CH4 A; 2PZ1 A; 2AZS A; 4QT7 A; 1E6G A; 4J9B A; 2ESW A; 2OAW A; 2PTK A; 4Z88 A; 2KRO A; 4D8D A; 2O2O A; 2P4R A; 1ARK A; 5IXF A; 2DJQ A; 3EGU A; 1QWE A; 2KBT A; 2AKK A; 3NGP A; 1WX6 A; 1YWP A; 4J9C A; 1TUD A; 2F2W A; 1KIK A; 1HSQ A; 1YCS B; 2EGC A; 1CSK A; 2D8H A; 2JM8 A; 5HCK A; 4KRT A; 1M3C A; 3EHQ A; 4RTZ A; 4HXJ A; 2CT3 A; 2D0N A; 1I1J A; 3UA6 A; 2G6F X; 2DMO A; 5IHK A; 4EIK A; 4CC7 A; 2HCK A; 2B86 A; 1K9A A; 1PKT A; 2X3W D; 1HD3 A; 2YDL A; 2LMJ A; 4K11 A; 2EGE A; 4CC3 A; 1N5Z A; 3IQL A; 2AK5 A; 2EYY A; 2L3P A; 4AFU C; 3C0C A; 1GCP A; 4J9H A; 1YN8 A; 4LUE A; 4J9G A; 4AFQ C; 2C0O A; 2DBK A; 3VRY A; 1LCK A; 4OMM A; 1U3O A; 4AG2 C; 2KEA A; 2K9G A; 1YP5 A; 3H0I A; 1K0X A; 1NEG A; 2LNH B; 1WLP B; 3SHW A; 1QKX A; 2K3B A; 1UTI A; 2DL5 A; 2CT4 A; 1Y0M A; 5I11 A; 4J9I A; 1A0N B; 1QWF A; 1GRI A; 1CKB A; 2KNB B; 2RQR A; 2DL7 A; 4JZ4 A; 3EG2 A; 4CC2 A; 2O9V A; 3M0P A; 1UHC A; 1JQQ A; 3M0U A; 2CH4 W; 2X3X D; 1SSH A; 2A28 A; 2YUO A; 1GL5 A; 2QDL A; 1AZE A; 1AWX A; 1E6H A; 2J6F A; 4JZ3 A; 1NM7 A; 1SHF A; 1PWT A; 4OMO A; 3ULR B; 1B07 A; 1QKW A; 1CKA A; 2DM1 A; 2DIL A; 4IIM A; 2EKH A; 4DEY A; 2YUP A; 2AZV A; 4M4Z A; 1G2B A; 1OOT A; 2DA9 A; 1JO8 A; 2EYZ A; 2O31 A; 3EG3 A; 1M3B A; 2JM9 A; 2KT8 A; 2J05 A; 1XOV A; 1UG1 A; 1ZX6 A; 1SHG A; 2KE9 A; 1RI9 A; 2DVJ A; 2BTT A; 4CC4 B; 2EYW A; 2FPD A; 4RUG A; 1FYN A; 3REB B; 2LP5 A; 2ED0 A; 4J9E A; 1OPK A; 2JS0 A; 3PVQ A; 2RN8 A; 3FJ5 A; 3TVT A; 1OEB A; 2DX1 A; 1UEC A; 1NYG A; 3M0S A; 5IXB A; 2MIO A; 3I9Q A; 1VYU A; 1U5S A; 1UUE A; 2GQI A; 5IHN A; 3I5R A; 2K6D A; 2HBW A; 4ZNX A; 3UAT A; 2CUB A; 2VKN A; 2NWM A; 1WI7 A; 2K7A A; 2A37 A; 4GBQ A; 2HEQ A; 2LCS A; 3R6N A; 2GNC A; 2EPD A; 1M3A A; 2GBQ A; 3VS0 A; 4F16 A; 4LNP A; 1KJW A; 1X43 A; 1X6G A; 2ECZ A; 4ESR A; 1W1F A; 2VWF A; 2BZY A; 2RQW A; 2KRM A; 1AD5 A; 2C0I A; 1VYV A; 1K1Z A; 2KT1 A; 3GBQ A; 4DEX A; 4JJC A; 1K0S A; 2BZ8 A; 2DRK A; 4F17 A; 4AFZ C; 2LZ6 B; 3NMZ C; 2VVK A; 2L3S A; 1I0C A; 2KRN A; 4RTV A; 1PNJ A; 2HSP A; 1GBQ A; 1UJ0 A; 1PHT A; 2I0N A; 2J6O A; 2SRC A; 4Z89 A; 1MV3 A; 3QWY A; 2RQU A; 2YT6 A; 1TUC A; 1G83 A; 2K79 A; 1FMK A; 2DL8 A; 3M0T A; 2YUQ A; 3TSZ A; 2FG0 A; 2ROT A; 2O88 A; 2KRS A; 2PNI A; 1NYF A; 1AZG B; 5FW9 A; 1NLO C; 3TSW A; 3VS7 A; 4J9F A; 3SEM A; 3CQT A; 1X69 A; 2W10 A; 2KGT A; 1VYT A; 4WCI A; 3A98 A; 1VA7 A; 2M0Y A; 2SEM A; 4FSS A; 4OMQ A; 1H8K A; 1J3T A; 2JXB A; 1BK2 A; 1RLP C; 4R0K A; 2LQW A; 5L23 A; 1PRM C; 3LH5 A; 3H41 A; 1JXM A; 1ABO A; 2D1X A; 2EBP A; 3NPF A; 5GJW B; 2GTO A; 4HVU A; 1K76 A; 2MOX A; 4F14 A; 2O9S A; 3EG1 A; 3VS5 A; 3UA7 A; 3VRZ A; 1T3S A; 2EW3 A; 1YWO A; 3VS1 A; 1NEB A; 3VS6 A; 1E7O A; 1T0J A; 2JW4 A; 1EFN A; 2GTJ A; 1WDX A; 2KXC A; 2ENM A; 3RNJ A; 3ZL7 C; 4RTX A; 1JEG A; 1MUZ A; 1Y57 A; 4OML A; 2RF0 A; 1QLY A; 4LE9 A; 3I35 A; 1SRL A; 3VS2 A; 2RMO A; 4HVW A; 2CSQ A; 4RTW A; 4RTT A; 1AEY A; 1T0H A; 1M27 C; 1QCF A; 1RLQ C; 1ZUU A; 1GFD A; 1WXT A; 1OV3 A; 4OMN A; 3PVL A; 1Z9Z A; 1GFC A; 1X27 A; 1W70 A; 1B3Q A; 1TG0 A; 1ZUK A; 1AOJ A; 2FEI A; 4Z8A A; 1M8M A; 2LQN A; 3M0Q A; 1T3L A; 4JJD A; 4HCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DF6 A; 3OMG A; 4LDX A; 2HQH A; 2XDB A; 2LJ1 A; 1YNZ A; 2HZY A; 2FO0 A; 4ME7 A; 4HT9 A; 2WSE E; 3CME A; 4XTX A; 5FU6 C; 4D8K A; 2EIF A; 2FZK B; 3MCA B; 1ZBX A; 3GP8 A; 1WFW A; 1EX4 A; 3VU3 C; 2E5K A; 2L3Q A; 3REA B; 1KHC A; 3QWX X; 5KYU B; 4X9C A; 2GGR A; 2JMA A; 2MF2 A; 3CBM A; 4LUD A; 2D8J A; 3MPU B; 3CME T; 2CDT A; 2KR3 A; 3HRU A; 2BZX A; 4HCZ A; 4BY6 C; 2CRE A; 1VQ5 T; 1YIT Q; 3SDZ A; 3JV3 A; 2F1L A; 3RKX A; 2QQA A; 2V26 A; 3EGD A; 1KQ2 A; 2KQW A; 1ZA2 B; 1UDL A; 1UJY A; 1QVG A; 4GLM A; 2QAZ A; 4ORZ A; 2P84 A; 1GBR A; 1GCQ A; 2J7I A; 3O8V A; 5LJ3 e; 3UF4 A; 5KYX B; 1JB0 E; 1K73 U; 2XI9 A; 1ZLM A; 3JCM b; 3CCS Q; 3M0R A; 2DL4 A; 1H92 A; 1XTD A; 2WSC E; 4KGZ B; 1Q86 C; 2YUN A; 3HKS A; 1WYX A; 2JTM A; 1YJW Q; 2LJ0 A; 2LJ3 A; 1NBE B; 2QGF B; 2MYS A; 2XIC A; 2JUF A; 1M30 A; 1RAI B; 5HK0 A; 2YHT A; 1P92 A; 1DJ7 B; 1W6X A; 4UC4 A; 9ATC B; 3X24 B; 1I5O B; 3FRN A; 2JS2 A; 4LDY A; 2DK3 A; 1R8O B; 3MP1 A; 1QVG S; 4DBH A; 2F2V A; 2YSQ A; 4JPB W; 1X2Q A; 5GAO r; 1QVF A; 1SPK A; 3VS3 A; 2ZCF B; 5FWC A; 1X75 C; 3PE0 A; 3M53 A; 3CCL Q; 3T9N A; 1ABQ A; 1IGU A; 5KYW B; 4FIB A; 2J06 A; 4GY5 A; 2VGN A; 2JTE A; 1QVG P; 2OJ2 A; 4J9D A; 1VIE A; 2LC4 A; 4TVR A; 4M77 C; 2XID A; 3M9Q A; 1M1K C; 1MV0 B; 5FU6 B; 4IIO A; 2FVU A; 2KY9 A; 2DTH A; 2VGM A; 1VQ6 Q; 3DB3 A; 3DLL A; 4M78 C; 2PZ1 A; 2AZS A; 1HYO A; 4BAC A; 3CCE Q; 1R0B G; 1BIA A; 1QVF S; 1RAB B; 1N8R C; 3TEE A; 2G3R A; 5J3B A; 5GAM g; 2KBT A; 4JRI A; 4BY6 B; 1YJ9 A; 1I81 A; 1WX6 A; 2RJC A; 5LJ3 d; 1VQL A; 2E64 A; 2XHC A; 4XU3 A; 5HCK A; 2D0N A; 1QVF P; 3UA6 A; 4A4H A; 5IHK A; 4CC7 A; 4PJO C; 3JB9 F; 1K9A A; 1HD3 A; 3QBY A; 4K11 A; 3IQL A; 4JDS A; 5LJ3 h; 2AK5 A; 3HTR A; 4AFU C; 5CQY A; 3MP8 A; 5CCA A; 1M1G A; 1OZ3 A; 2DO3 A; 1KD1 C; 1JBM A; 1YN8 A; 4II1 A; 3UDC A; 2CZ7 B; 5AT1 B; 4AFQ C; 1SF9 A; 2DBK A; 3VRY A; 5KYY A; 1LCK A; 1KC8 U; 1WHG A; 1G5V A; 2KEA A; 1ZA1 B; 1YP5 A; 5FU7 C; 2XDD A; 2LNH B; 2YRV A; 2XDP A; 2LDM A; 3FIF A; 3C4S A; 2K3B A; 2L3R A; 1A0N B; 1IHW A; 2DIG A; 2QK0 A; 4FT2 A; 1D1C A; 3OYA A; 4J7F A; 2DL7 A; 4JZ4 A; 1IHV A; 4CC2 A; 2O9V A; 4HCC A; 3M0U A; 3D7S B; 2HSE B; 4M7D C; 1G3Y A; 2KI7 A; 1O75 A; 3P8H A; 1GL5 A; 4R56 A; 2DTI A; 2HAX A; 1AWX A; 4C0F A; 4BDY A; 4M7A C; 3L2Q A; 3ULR B; 1WHL A; 3JCM J; 1B07 A; 3JSC A; 2DIL A; 3JCM f; 4PLI A; 1K8A U; 1ACM B; 5IN1 A; 4Q5W A; 2ZAE A; 1OOT A; 4JLG A; 4M77 B; 1OYX A; 2LRQ A; 2O31 A; 3CCU A; 5CKD A; 3PMI A; 4C0Z A; 2DVJ A; 2K5F A; 3L1A A; 4C5G A; 2FPD A; 2QQ9 A; 1MMD A; 2GFA A; 1R0C B; 4M78 B; 5CK9 A; 1FYN A; 4JJN K; 5GAN e; 4KUD K; 2ED0 A; 3HL8 A; 3CC2 T; 1OPK A; 2JS0 A; 2DIQ A; 3PVQ A; 2RN8 A; 5I21 A; 1S72 A; 4C8Q F; 3OSS C; 1NZ9 A; 1QMC A; 3RES A; 2BIV A; 1UGS B; 1U5S A; 4A4E A; 2JN0 A; 3QYH B; 4PFZ A; 3E1S A; 3JB9 G; 2CUB A; 3CCV A; 2OTL Q; 1C1A A; 2EJG A; 2VKN A; 1WI7 A; 2E6N A; 2K7A A; 2VXE A; 3L2V A; 1YJN Q; 4C92 F; 3CCR A; 5C6S A; 4PJO B; 4PFO A; 1VQK Q; 1B34 B; 1KJW A; 1Q7Y U; 4ESR A; 4JLI A; 2VWF A; 2BZY A; 3OYD A; 5KYX A; 2KRM A; 3CCV T; 1K1Z A; 2MPX C; 2KT1 A; 3L2U A; 3CCR T; 4DEX A; 4PNO A; 4J7I A; 1MND A; 2JJ9 A; 5FU7 B; 1WJR A; 2J6O A; 2AIR B; 4RCB A; 1PHT A; 3RKY A; 2SRC A; 1MV3 A; 3QWY A; 2RQU A; 2HBP A; 1TUC A; 3QO3 A; 1G83 A; 3BFM A; 1NJI R; 1D3B B; 1VQ6 T; 3JAM E; 3M0T A; 3EFS A; 2YUQ A; 3TSZ A; 2FG0 A; 1AZG B; 3URG A; 3QII A; 4M7D B; 4J9F A; 1X69 A; 1TH7 A; 4RG2 A; 2KGT A; 3R6O A; 5GAN 6; 4M7A B; 3A98 A; 2NYS A; 2OTJ A; 1OU8 A; 4Y28 E; 2YRC A; 2JXB A; 3CPF A; 1JXM A; 1ABO A; 2QEX A; 2QGG A; 1WNL A; 3PNW C; 2EBP A; 2HNI A; 4DBF A; 3UPU A; 3I55 Q; 1G3W A; 4HVU A; 4BE1 A; 5KYW A; 3OYN A; 3CD6 Q; 2L89 A; 1PCX A; 1YFN A; 1MGQ A; 3QYG B; 5LJ5 f; 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2RJE A; 1QCO A; 2CZ6 B; 3M56 A; 5ECA A; 4KGX B; 3QDR B; 2FPF A; 1VQK T; 4M77 A; 1LVK A; 4Z02 A; 2X9H A; 5EC7 A; 4KUI A; 2ROL A; 4QW2 A; 1AWW A; 4M78 A; 4E47 A; 4PJO E; 3C94 A; 2V1Q A; 4F7U E; 2ABL A; 3BDL A; 1UGQ B; 2RQT A; 4JS4 A; 4LDU A; 4ELZ C; 2HKQ B; 1I07 A; 5GAM e; 5LJ5 g; 1VQ7 Q; 2X51 A; 4XAX B; 5CVI A; 3CCJ A; 1PSF A; 1AWO A; 5AYF A; 5CO7 A; 2L0A A; 2RHY A; 2A0F B; 1WA7 A; 4KBM B; 3MEU A; 3H0H A; 4PJJ A; 1BCO A; 2YXY A; 2FPE A; 1U06 A; 2FL7 A; 4JJB A; 4PJO A; 3SB2 A; 1B34 A; 2QQB A; 2AKL A; 1KSW A; 1KC8 C; 3CCJ T; 3U23 A; 4HT8 A; 4M7D E; 2DYB A; 1NJI C; 3OBW A; 2QTX A; 4J9B A; 1Q81 U; 3CC4 Q; 3VKI A; 4M7A E; 1NPP A; 3OYH A; 2KRO A; 4D8D A; 2O2O A; 1VQ5 A; 5IXF A; 3EGU A; 4IUQ A; 2KMT A; 3G4S A; 1YWP A; 3OYI A; 2F2W A; 3HRS A; 1KIK A; 5GAO l; 1EIF A; 3FJP A; 1G8X A; 1YCS B; 1D3B A; 1U8R A; 2CP6 A; 3FLG A; 3EHQ A; 1RAD B; 1WPY A; 2DER A; 5GAN 2; 1K9M U; 2E1H A; 2CT3 A; 2F69 A; 2B8A A; 3MEV A; 5I2M A; 2DMO A; 4M7D A; 3AT1 B; 2RJF A; 4BI3 A; 2PUK B; 1XQH A; 2DPP B; 1PKT A; 3PIP A; 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