2XSA | Genus

Total Genus 166

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	166
sequence length	447
structure length	443
Chain Sequence	MLTGVIEGFYGRDWRRDERATVMDWIAAAGMNTYIYGPKDDVHVRARWRVPYDAAGLARLTELRDAAAARGMVFYVSLAPCLDVTYSDPQDRAALLARVDQLARAGLRNLVLLFDDIPSVLPEADRHRFDSFAEAQADLSNMVLRHLRGAGHVVFCPTEYCGRMAGGDPRGSAYLQRLGSTLDPAIDIFWTGPEIVSEEIVAAHLAAVGEVLRRRPVIWDNFHANDYDIRRVFAGPLGGRSRDILPLVAGWITNPNNEAEANFPAIHTTGAYLADPDYAPERAIAAAVAAWQPRFRLAFGDGAVPSDLVALLCDLFWQPFALGPETTRILSALRAALTVPRPDPSDPAWRAALEDLRDLKRRINKLFTLMTEIENRDLFHTFHNYLWEAQEEVGHLVAYCDWLDEAPPPGAVFPATNFYRRGFGVAVQDILQRDRQGRYHHGV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	HYALURONOGLUCOSAMINIDASE
publication title	Human Oga Binds Substrates in a Conserved Peptide Recognition Groove. pubmed doi rcsb
source organism	Oceanicola granulosus
total genus	166
structure length	443
sequence length	447
ec nomenclature	ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date	2010-09-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07555	NAGidase	beta-N-acetylglucosaminidase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.58.240	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1	STAT; domain 1	2xsaA02
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2xsaA01

5AYIA 4C7GA 4D6JA 3GYCA 4AD2A 2EQDA 4KWUA 2EEXA 4CN4A 2WM0A 3CZEA 1X1NA 3T09A 3U5YA 1W2PA 1JF6A 3BC9A 2WMHA 3ZJ7A 2ZUMA 3BLKA 1BFNA 3JUGA 2Z1KA 2O9PA 5I6SA 3VUPA 1QNOA 4EKJA 5I24A 3AZTA 4TVUA 3UERA 2BVDA 1W9BM 2J75A 2JF7A 4BQ5A 3ZOAA 1SMAA 2ZUWA 4CN1A 4W5ZA 3QOKA 4QCFA 1JI1A 4MNJA 4MJ2A 3RJYA 3PZIA 4P8WA 2EPKX 2ZIDA 3RM4A 2EJ1A 2WANA 3AXIA 2V3EA 3ZJ8A 6TAAA 2VR5A 3VIKA 2BY2A 1JZ4A 2JEQA 1OWQA 4PMVA 4ML4A 3KWXA 3VGEA 1JZ2A 5LA0A 3K46A 2YL5A 3WNKA 1R7AA 5M3WA 2XWEA 1JL8A 3EMCA 2WCSA 2XM1A 4MADA 1UH3A 2V38A 4D1IA 1J01A 1V3KA 2OWCA 1V3HA 5GNYA 1F4AA 3EDKA 1HKIA 4GZJA 3W0KA 1BPLB 3ARRA 2YL9A 1VFFA 2CHNA 2F61A 2WXDM 2ZUTA 1GOWA 1GPFA 3AYSA 4FK9A 5DFAA 2WC3A 2E9LA 3VDCA 2BXZA 2VQUA 4M1RA 1CGYA 4D71A 4ZE5A 4CVWA 4TX8A 1GJWA 2QPUA 2XVNA 3WQ4A 4HA1A 1NM9A 1HJVA 1DHKA 1VFMA 1H49A 1XHGA 1XH0A 1ISWA 2E8ZA 3W25A 1HL8A 3D5HA 3ARXA 3VDAA 1CXLA 4M8UA 4LGXA 1J0YA 5M03A 1MFUA 3VX0A 5ABHA 3G6MA 1LF1A 4GI6A 1B2YA 8CGTA 4BA0A 5A8NA 4CD7A 4M82A 1GVYA 4XB3A 1GHSA 4YN5A 2NSXA 3SCQA 4CUCA 3EMZA 3T08A 1E0VA 3VIIA 3VOCA 4X0NA 4PMYA 2CHOA 3MO4A 2FGLA 2WVSA 1N82A 1UHVA 4Y7EA 1WPCA 3W28A 3U5UA 2VZSA 4BF7A 1UR2A 1E5JA 2VMFA 2XFFA 4D6GA 1C3FA 2WBKA 1MXGA 2YIHA 1NWSA 2EPLX 1H5VA 1J0JA 3EDJA 1V03A 3ARYA 2ZOXA 1E3XA 2CBIA 5IDIA 1I75A 3VM5A 3LPPA 2J8GA 2CCRA 1GQLA 3AIQA 5HPOA 2W5FA 2W92A 2E3ZA 3THCA 3L2LA 4W7WA 1UR4A 2ZXBA 5E9AA 3W4RA 2PWFA 1GZJA 3AS0A 3VD9A 1W9UA 5E70A 4MNMA 4CGTA 3OLGA 1UYQA 1BG9A 3U57A 3WUBA 1BYDA 2VZUA 4UFLA 4J3TA 4F66A 1E6ZA 3ZT5A 9CGTA 1C90A 4HOWA 3MMWA 1W9DM 2J78A 4H2CA 1UR9A 2OYMA 4CCDA 1U33A 3RM8A 4RE2A 2DDXA 3T2QA 3W26A 1BYCA 4JKKA 3I3DA 3CUJA 2XFYA 2ESCA 3IANA 1G94A 1I1WA 1TR1A 3WKZA 4DWSD 3J7HA 1UA7A 2O92A 1SFSA 1ZBCA 1UR1A 4LXFA 1R8LA 5A6JA 4B9YA 5CLTA 4LX4A 1OSEA 1B3XA 4Z2KA 5JIPA 1V0LA 4W89A 2VURA 4GQRA 2JIEA 1KXVA 1U2YA 4AZCA 3D3AA 2DSKA 1UKPA 2D0FA 1C7SA 3SURA 3UR7A 3ZR6A 3VIMA 3PZNA 1ISZA 3CHFA 1VJZA 3BLPX 2PWGA 4R27A 3AHTA 4J7RA 3EBVA 2J47A 3OZPA 5A3HA 1UURA 2ZX8A 2PWEA 2OSXA 2CXGA 1BYBA 2QF8A 4P7QA 2ZX5A 2VRJA 4PRWA 2ZUSA 4MB5A 2FHCA 3VNZA 5E0CA 3CUHA 1EDTA 2QHAA 3ECQA 1QHZA 2E9BA 1GJUA 2Y4SA 2XPKA 4HOZA 3SCWA 2FH8A 3RPMA 4AD4A 3W38A 1JIBA 2BVYA 2YBTA 2XHYA 2J62A 3FY1A 3GTNA 4WKAA 1UQYA 5I79A 1EDQA 1XH1A 2DT2A 2J7GA 5A6SA 1LL6A 1ODUA 2GDUA 3WFLA 5BXSA 3MUAA 1W9PA 5CXPA 4D6CA 3CMGA 3VMPA 2E40A 1E6PA 3W29A 3GM8A 1BHGA 4YHGA 2DSWA 1GHRA 1H09A 2XGBA 1ITXA 4EANA 3N13A 2ZXQA 2V3FA 1EH9A 1WKYA 2WLZA 1O7AA 2D3LA 3GBDA 2CERA 1QOXA 1CZ1A 4JFTA 5I23A 4HOXA 2CKRA 3CZLA 2E8YA 4Z2IA 1CXKA 4P7NA 2X1IA 3ZJ6A 4HP5A 2HISA 4PYSA 3ARUA 5HOSA 3L4TA 1FA2A 3DC0A 1V6VA 2FHFA 2E4TA 1AQMA 1WZKA 3VM7A 2VRKA 2VX7A 1L0PA 4UQBA 4WJXA 1CLXA 1TVNA 1H0GA 5HPCA 5TD4A 3ALGA 4DM1A 1JF5A 2EXOA 4ZXOA 2OYKA 1Q6DA 2O9OA 3AIBA 3QGVA 4LPCA 2HVMA 2ZE0A 2BFGA 4QLLA 4J27A 3GNPA 1E9LA 3MUIA 1C7TA 3VIHA 4PMRA 5A2BA 3MUZ1 4RL3A 2D3NA 3T0BA 5CQ1A 3WD2A 4WLCA 4OBRA 1NQ6A 1BTCA 1E4IA 3BAJA 1E73M 2WLYA 1AQ0A 1QW8A 1JAEA 3OLDA 2Q8XA 3VIJA 2FDMA 3WNOA 2GFTA 4EE9A 3T0DA 4PMUA 3ARQA 2RGMA 4AZCB 1QVBA 1CLVA 3ARVA 3SCNA 3WBAA 1WDPA 2WZHA 2B31A 1XV8A 1NARA 1UWTA 4CD8A 4PMZA 3CHCA 3S6TA 4J28A 2VZVA 1KBBA 2C0HA 1VENA 1JNEA 1R85A 3GNRA 1WCGA 5A2AA 3VTRA 4W87A 4AD0A 4EAMA 2VCAA 3A47A 3AI0A 3UCQA 2WAGA 3VMNA 2VT0A 2WNWA 4PMOA 3AHYA 3VGHA 3AS1A 3VD7A 3TTYA 3KZSA 1XC6A 4TOQA 1G1YA 1WDRA 2QMJA 4AISA 3NDYA 4BQ4A 4J3UA 3EDFA 4JKMA 1LG1A 1HX0A 2WKGA 1W1TA 1KQZA 4KRUA 1CGXA 2G4FA 2QLYA 4W88A 5EFDA 4NI3A 1FP8A 3RMEA 1PBGA 1WO2A 2J4GA 4MB1A 1JZ3A 1HJUA 3CBWA 4AD1A 1LWHA 1XCWA 1IV8A 1LL4A 5GQBA 5ABFA 2NT1A 1ZBVA 2XUCA 4W85A 4CCEA 4AZGA 4UFJA 3WD1A 1IZJA 1HIZA 5BXRA 3QR3A 3SIMA 2JEPA 1JYWA 1GNXA 3IK2A 3LMYA 4UQAA 3SUVA 1K9DA 2DT3A 3CUIA 3VGGA 1UQZA 3UG3A 4FLRA 1VRXA 1CBGA 5F7UA 2JIWA 1PPIA 3I3EA 1W3JA 3WNLA 1ODZA 1AMYA 1QHOA 1XD1A 3MV11 4E8CA 3ARTA 1HJSA 2ZUNA 1H1NA 1E43A 3WNPA 1UKSA 3GXIA 2Y8KA 2GJRA 4BCEA 4DUVA 3O9NA 4UOQA 2OSWA 3B9EA 3CO4A 4M29A 2J25A 4F9JA 1C8YA 4UOJA 3QHOA 5A6BA 2J7DA 4D6FA 3WL1A 1Z32X 3NJ3A 3ZJKA 1UZ4A 5FOOA 1E1FA 4W86A 3OG2A 3AMKA 4MB3A 3AICA 7A3HA 3NCOA 1MQPA 1JD7A 2WHLA 1V6YA 1UKTA 1UD8A 3II1A 1FP9A 1B90A 1SR0A 5A8PA 1E1EA 3SCVA 1WZLA 3WQWA 1V3MA 1YHTA 2X0HA 1A47A 1KCLA 1DP0A 1EHNA 4J3VA 4E8DA 1CTNA 3SCPA 1E4LA 1OT1A 3WQ5A 1VAHA 4AZ6A 2VX6A 4HZ6A 4TX6A 5DT7A 4HA4A 1NOFA 1E3ZA 1FFQA 1MFVA 2DSVA 4CD4A 4CVUA 2CIPA 2WVVA 2BY1A 1LLOA 5I3DA 3U7BA 3ZSTA 4GKLA 4GO8A 3UR8A 1UR8A 3KE0A 3OZOA 3ALFA 1JZ7A 4FLOA 4IPLA 1MW2A 1G9HA 3M46A 4GZIA 5I5RA 2CBJA 3WF3A 2UY4A 3KL5A 5A69A 1RPKA 3GDBA 1EHAA 1M04A 4CCCA 3BAYA 2A3AA 4QP0A 1KGWA 2W91A 4WSJA 1QI2A 4MB4A 3BXWA 1WAWA 5C71A 5BRQA 5ABFB 2BHUA 1D3CA 2VO5A 1H11A 2D0HA 1PEZA 1J10A 5E0FA 5AYBA 2XSBA 5DO8A 2WK2A 5BROA 4U31A 1E56A 5ABEA 4KGLA 2WSKA 4CD6A 1UUQA 4GXPA 3WEZA 1CXIA 2OWWA 3MMDA 2CPUA 1LG2A 4AZ5A 5A6KA 5IHSA 4DUWA 1H0IA 3GXMA 2WPGA 2PBGA 3FW6A 3WDHA 5I78A 1ISYA 3N18A 3WEOA 4UQDA 2BXYA 3TTSA 1DWJM 1XSKA 5A8OA 1KR1A 1B1YA 4LYRA 4AEEA 4AW7A 4JCMA 3NIYA 4OIFA 1PJ9A 2J77A 4OOUA 1NWTA 3FNDA 4HMEA 2VL4A 2YBUA 2G3MA 1PX3A 5FKYA 3OGRA 3CIVA 5BYWA 2YDQA 3N04A 4MNKA 4HMCA 1TZ7A 4AZHA 5HDRA 3AQUA 4ACYA 2BVTA 3VIOA 1PIFA 1UWQA 4D6DA 1FOBA 1BSIA 2YA1A 3AIWA 4UTFA 4GINA 1AQHA 4HU0A 1EOMA 3SCUA 1FHLA 1H2JA 1OGBA 1W32A 2QMKA 2EPMX 4M56A 3SUSA 3AHVA 2VR4A 4QAWA 1RD6A 3VDBA 1CEOA 3BAKA 3B9AA 3PZMA 2V5CA 2ZWZA 1E4MM 4NF7A 3SUWA 3W6LA 4JFWA 1J0ZA 1NWRA 2XIBA 1UH4A 2WSPA 3T2PA 2WVVB 1HP5A 4AWEA 3ZR5A 3O2LA 6CGTA 5FL0A 2BHZA 1JXJA 3FAWA 1X6NA 1JZ5A 5JBEA 5I2UA 2XM2A 1GCYA 1ZJBA 1XSIA 2VUYA 1VFOA 2WMIA 3GXDA 1VJSA 1JXKA 3GXFA 1QI4A 2G3JA 4IUGA 5D9PA 4C7DA 3WF1A 2E9MA 2ZICA 1ISVA 2OYLA 4XX6A 3HMCA 4JHZA 2Y24A 3VPLA 3PTMA 3CUGA 5DT5A 2VOTA 3ZO9A 1K6AA 3OLEA 4AIEA 4PMQA 2Y8VA 3AIUA 4GI8A 1ITCA 5CZKA 1NOUA 3GH7A 2BY0A 3W82A 3TTQA 3GH5A 4QLKA 1B9ZA 1OCQA 5A2CA 4N0RA 1MVYA 2ZUVA 1JAKA 2MANA 1LWJA 1L8NA 2J7CA 2VRQA 4PTWA 2ZX6A 4PUDA 2PWHA 1M7XA 2FGZA 4V27A 5EFFA 1W3HA 1CPUA 1QI5A 3CMJA 1H41A 1BQCA 5GNZA 2WB5A 3WL0A 4M24A 2XGIA 1MQRA 3TP4A 4AC1X 1GOQA 4P7RA 1ZU8A 3VD4A 1G0CA 1DEDA 1S46A 1XYZA 4AMCA 1VB9A 4GIAA 4KRTA 2WMGA 2DSZA 2TAAA 4ATWA 1E55A 3CUFA 1EO7A 4AY1A 1MXDA 1KCKA 3NYDA 2XVLA 1C91A 4S3JA 1CIUA 3WDRA 4S3KA 2OLHA 3EMQA 3PTQA 1TVPA 3A4WA 3QHMA 4GPNA 5AY7A 1CXFA 2DT0A 4H41A 2IXVA 3WY1A 1WP6A 2PI6A 1MYRA 4WK9A 4WKFA 5A6MA 3KL3A 1E0XA 3UG5A 2VVNA 4JCLA 2J7BA 5I0DA 1B3YA 4WF7A 4ATDA 1EQCA 2C7FA 4Q22A 2YL8A 4ZXLA 3AIVA 3MV01 1EQPA 2D23A 4FF5A 2WMIB 5CSYA 4JFUA 1G01A 4P8UA 1FFRA 1FH8A 1P6WA 2DPEA 3AHZA 4ZE4A 2OWXA 3MKKA 1NP2A 2NT0A 1W3LA 1J0IA 3CTTA 4U5KA 1BF2A 4PTXA 4F79A 2BHYA 2CKSA 5CG0A 3MMUA 3T0AA 3DYMA 3WUGA 1HP4A 2J7EA 1V6WA 2ZXDA 3AMLA 4HZ8A 2VCBA 3PTKA 2WCAA 5CJ5A 1A3HA 2JALA 4UCFA 3LPFA 3TA9A 5FCZA 2GSJA 3VMOA 4AXNA 3THDA 3ZM8A 2WBGA 3IAPA 2XTKA 4QCEA 1GQJA 4HA3A 3CHDA 3VKKA 1E0WA 5DMYA 1BG4A 5FD0A 5D9NA 2VI0A 1JYXA 4PN2A 3BAIA 1KWGA 2Y2WA 3DYOA 2J74A 3VGDA 1BAGA 3VDHA 1UUSA 3OB8A 2GJXA 2WHMA 1V02E 4HMDA 1PZ2A 3QHNA 5D8ZA 2DH2A 5E09A 4AZIA 1E15A 1F4HA 4JHOA 2OSYA 4E4PA 1M01A 3WNNA 1QHPA 1HJQA 3NSMA 5BCAA 2ZUUA 8A3HA 1MW0A 3NDZA 5A1AA 4P7LA 2G3NA 1QW9A 4UOZA 3S2CA 1VIWA 4QLJA 5A94A 3K4AA 4JFSA 4L4OA 4MDPA 1OB0A 4PMDA 4DUXA 1GONA 1US3A 1GOIA 2CESA 1E6SM 4OBSA 1ZS2A 3PZVA 2JF6A 3VO0A 5GPRA 2GK1B 3NSXA 1W9XA 3MS8A 1XRVA 4AYSA 3WUEA 4XUYA 3POCA 3BCDA 4B9ZA 3WH9A 2X09A 3WD3A 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4Z2GA 4ZEPA 1UG6A 2D1ZA 2WWDA 3MSGA 4F9DA 1GOMA 1O6IA 4PUEA 4UNIA 2WZEA 3MSDA 2XWDA 4FMVA 3VNYA 3WDJA 4PSRA 1SYTA 1H4PA 4AD3A 1GOOA 1HKKA 4OOZA 1JGIA 5CPTA 3LPOA 4PEEA 5ABGA 2DGAA 3TOPA 3HN3A 3AFBA 4B3LA 1V3IA 3WF4A 2O9TA 4GO9A 2CNCA 3CH9A 4PCTA 4R5EA 3G6LA 2XFRA 2CYGA 1HL9A 3HU7A 1MW3A 1E40A 1NWUA 1IZKA 3SUTA 5LA1A 2VZTA 4HU8A 1XH2A 1JG9A 1Q6EA 1UWUA 1TE1A 4MAVA 7CGTA 4PCSA 3L2MA 4WSKA 1ISXA 2J7FA 1PZ3A 3VGBA 4CU6A 3UG4A 1FH7A 1E6RA 2XJ7A 3DECA 4V2XA 2D22A 2WHJA 3AHXA 1VBRA 3VILA 2DSUA 4MJ4A 3MU7A 2VC9A 4PSPA 1RP8A 5D8WA 1VEMA 1CGVA 1Q6GA 3AMCA 4IPNB 3WQ8A 1OGSA 3VD3A 1W91A 4U2YA 4B3KA 5I77A 4QFUA 4D1JA 1C8QA 1JNDA 3IJ8A 3ZT6A 2W62A 3ZQ9A 1LJYA 4U2ZA 5BRPA 2D2OA 1UD5A 3DHPA 1HT6A 4W7VA 3CPUA 2UY3A 1EXPA 1QBBA 3U7VA 5EBAA 4E2OA 1DWIM 3SCOA 4D72A 5IHRA 1EA9C 1HKMA 2AMGA 2JFEX 4BS0A 2XG9A 3T2OA 2V3DA 3I3BA 3OBAA 3WBEA 1U30A 4QDMA 1NH6A 3WDPP 2VJXA 1ZBKA 1HXJA 2W61A 2XYLA 1QI0A 1E72M 1JYNA 3VIPA 1UOKA 3BSHA 2UY2A 2VVSA 2YA0A 5IFTA 3AS2A 3UETA 1GUVA 3W27A 3WSUA 4P8XA 1VBUA 4D6HA 4PBGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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