The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
116
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structure length |
116
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Chain Sequence |
DWSGPIEQPLWSLPAAPGLSRWLIVHNLSSAAADGLYHVEVLERRQGQQPWQFQRLAAHLALTEQALRASIVAPLKRGGVYPESYQFAYRQWQERQAAGQAPVCRRTVDECLRAPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics
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| molecule keywords |
PA1645
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| publication title |
The Aeropath Project Targeting Pseudomonas Aeruginosa: Crystallographic Studies for Assessment of Potential Targets in Early-Stage Drug Discovery
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Pseudomonas aeruginosa
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| total genus |
26
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2XU8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3I5R A; 2QA4 T; 1BI2 A; 3I56 Q; 4M7D E; 1YHQ A; 3OYM A; 5CIU A; 1KD1 C; 3VYG A; 1ZUY A; 2CS7 A; 1I1J A; 3Q1J A; 1W2B P; 2F1L A; 5GMK j; 1VQ5 T; 3CBM A; 4HCB A; 1YFN A; 1VQK Q; 1QVP A; 2JT4 A; 2QQB A; 4ZN1 A; 2YWW A; 3JB9 D; 2FEI A; 3OW2 S; 2G6F X; 3MP6 A; 1RAF B; 2L5Q A; 1KFZ A; 3A8G B; 2DL7 A; 2X3W D; 1PG5 B; 4HT8 A; 1G3S A; 1G2B A; 1HD3 A; 2P0K A; 5FWB A; 4OMF B; 2EQI A; 3J81 E; 2PTK A; 3SB2 A; 3MPU B; 1YJW T; 2C0O A; 4ZGE B; 2GBQ A; 2VB6 A; 3QHS A; 2D8J A; 2EGE A; 3MJX A; 1X2K A; 4ATO A; 2KY9 A; 2QI2 A; 4OMM A; 1NJI U; 1AZE A; 4Z88 A; 1ARK A; 1SSH A; 2MYS A; 1IXD A; 2DJQ A; 2LRQ A; 3JSC A; 5KCO A; 3G4S Q; 1K4U S; 1JQQ A; 1N5Z A; 3PNW C; 5KYX A; 3I35 A; 2CUD A; 2E6N A; 3CPW A; 3ER0 A; 5FRO A; 5GAO n; 2EPD A; 1KC8 C; 4XTW A; 3CCU A; 3G6E T; 2RQU A; 5I11 A; 3HFO A; 2K9G A; 2K3B A; 2RI5 A; 2XID A; 1AWX A; 3JCM Q; 3DKM A; 5HK0 A; 3SFM A; 3M9Q A; 1WHM A; 2BE9 B; 2LQK A; 4II1 A; 3TVT A; 4M7D G; 1UEB A; 1PSF A; 1IZ6 A; 4PLL A; 3CMA Q; 3TEE A; 4J8O A; 5LJ3 j; 2XDP A; 4IUR A; 1WHK A; 2GTO A; 1JEG A; 2RQV A; 3VUZ A; 3L2Q A; 2MK5 A; 3I55 A; 1I81 A; 4BY6 B; 4PJO D; 2F69 A; 2EKH A; 2P4T A; 2K3Y A; 2O01 E; 4FT2 A; 2F5T X; 4LUE A; 2JMC A; 2PNI A; 2PU9 B; 3HSB A; 3L2W A; 3UDC A; 5LJ5 g; 2MMP A; 2L89 A; 4N4G A; 3GP8 A; 1AD5 A; 1N9R A; 4CRI A; 4DBH A; 1VQ4 A; 2HAX A; 1VQM Q; 3CC7 T; 5IAY A; 2R57 A; 4C5E A; 4BI3 A; 5LJ5 h; 1TU0 B; 1VQ7 A; 4M77 F; 1X01 A; 1JO8 A; 4IUQ A; 2O88 A; 1RI9 A; 1QVG A; 1Q86 R; 5GAM e; 1VQM A; 3RKX A; 4R56 A; 3CC2 Q; 1OPL A; 2CP5 A; 4M7D C; 4XTU A; 4HCZ A; 4EIK A; 4DBQ A; 2RF0 A; 2KE9 A; 5KYU A; 2OTJ Q; 2EYY A; 4QW2 A; 3AHU A; 2ECZ A; 3MKD A; 3CCV A; 1X2Q A; 3LGF A; 1GCP A; 2GQI A; 2XG8 D; 3QWY A; 4M7A E; 4IUP A; 2AKK A; 1BBZ A; 3TSZ A; 5GAN 2; 1PNJ A; 2K4Y A; 2RK2 A; 2KBT A; 2M51 A; 2RA2 A; 2RB6 A; 2NUZ A; 3OYJ A; 2DXU A; 4M75 G; 5CO7 A; 2MF2 A; 3ULR B; 1AHJ B; 3PIO A; 3VV0 A; 2MIO A; 2KI7 A; 1UG1 A; 1GFC A; 1NPR A; 5GAN 8; 2VV5 A; 4O6J A; 4L59 A; 4JZ3 A; 1M1K R; 3CCE A; 1O75 A; 4LD6 A; 2XD0 A; 4BUG A; 3QJ6 A; 4FYW B; 5CKD A; 1RAA B; 1WNL A; 2JM8 A; 3SWN C; 2NUP B; 2ZPE B; 1IHV A; 4B9W A; 4EDU A; 2O4X B; 2KYM A; 4AMC A; 3CD6 Q; 1WZO A; 6AT1 B; 1JU5 C; 1MV0 B; 1OQK A; 5CKH A; 2LQN A; 4QQ6 A; 1MMG A; 4C92 F; 1Q7Y C; 3CCJ T; 3MO8 A; 3G71 A; 2W0Z A; 1ZX6 A; 1IHW A; 3CCL Q; 2BZ8 A; 2H3J A; 1XOV A; 1N6A A; 1YWP A; 2G3R A; 2HNI A; 5J39 A; 4EMK A; 3CXC P; 4EPC A; 4J9C A; 2KEA A; 3M53 A; 5FU6 C; 4HVV A; 1WI7 A; 4X9C A; 1UGQ B; 2R58 A; 5DM7 R; 2ROL A; 2F5K A; 5DLO A; 2YDL A; 1M2O A; 4LDU A; 1WIE A; 3CC4 Q; 4C0G A; 1S72 T; 2YUO A; 4RG8 A; 3UPU A; 4F7U E; 2CDT A; 2K57 A; 1KHC A; 1K1Z A; 1PKT A; 5IH2 A; 3EHR A; 1UHC A; 2X51 A; 2QQA A; 4XU2 A; 1N8R C; 1RUW A; 2HMA A; 3V7S A; 4M7A G; 4Q5W A; 4C5G A; 5CKF A; 2CYZ B; 1TTH B; 3CCQ Q; 4E7S A; 4ORZ A; 4KGV B; 4OP0 A; 1QVF A; 2O9V A; 3C94 A; 1M1F A; 4QVC A; 1R77 A; 1D1B A; 1M8M A; 4BAC A; 4BE1 A; 1WX6 A; 5KYN A; 4WTO B; 2K3X A; 1WQW A; 5GJW B; 4BDZ A; 1RL2 A; 4OB0 B; 4C5H A; 5CAI A; 3A8O B; 1I5O B; 3M0Q A; 4M7D B; 2A37 A; 4X34 A; 4MDW A; 2JTF A; 5ECA A; 1Z9Q A; 4XTZ A; 3VS0 A; 2JN0 A; 3OW2 P; 4B9X A; 5GAN h; 1BB9 A; 4KH1 B; 2K2V A; 1WJS A; 1NM7 A; 1BYM A; 1WQ7 A; 2D9T A; 3OYK A; 2E65 A; 2YUN A; 2LX7 A; 4C8Q A; 2R5M A; 2XKO C; 4OMN A; 3JB9 I; 1M30 A; 1VQN T; 2D1X A; 4D8K A; 2KT8 A; 4BD3 A; 1TH7 A; 2ZPF B; 4FYV B; 4KUL A; 4M7A C; 1GBQ A; 1BCM A; 4QVZ A; 5DLQ E; 3RKW A; 1BIA A; 5CKB A; 3JB9 J; 3WXM B; 2DAQ A; 3MEA A; 1VYV A; 1AEY A; 4Z02 A; 4M78 E; 3SWN B; 1MGQ A; 1YJ9 A; 1SRM A; 1M5Q 1; 3M55 A; 1UEC A; 5D7U A; 1SKU B; 2ENM A; 3CCS A; 3HFN A; 3OYL A; 4GY5 A; 5LJ5 j; 1OU8 A; 2DTH A; 2LZ6 B; 1NE8 A; 2DMO A; 2VKN A; 3BFM A; 4PJJ A; 3GLX A; 2DVE A; 1SG5 A; 1B7T A; 2GQV A; 3OS2 A; 3OYG A; 2CH4 W; 2FZC B; 1Q81 C; 2DM1 A; 1PHT A; 4E7J A; 3JCM e; 5FU6 B; 1I5L A; 2FRY A; 3S3N A; 1HYO A; 1QLY A; 1GXI E; 1M90 C; 1VQ9 Q; 4XAX B; 3DB3 A; 5LL6 S; 3PTA A; 2CSQ A; 1Y07 A; 2DE0 X; 1RI0 A; 4DEY A; 2K5F A; 1QCN A; 2GFA A; 5D6X A; 2RQR A; 1WHJ A; 1N9S A; 1R8O B; 3RBB B; 3L42 A; 2RHI A; 1B34 B; 2KRS A; 3KUF A; 1G3T A; 4ZNX A; 3C0C A; 3F70 A; 3H8Z A; 4QVD A; 5CVI A; 1VQ8 T; 1M3C A; 3PMT A; 2OTL A; 3QZ9 B; 2FVU A; 1SF9 A; 4LDV A; 3X24 B; 1VQO A; 2QGF B; 1HXD A; 1T0H A; 2IPO B; 2LJ1 A; 3A1P A; 1Y7X A; 4M7D D; 4QQD A; 1Y96 B; 3RNJ A; 4A4F A; 5L8R E; 1QWE A; 4M78 G; 4O5V A; 5KYY B; 4M77 G; 4E7K A; 1PM3 A; 5LJ5 f; 3RER A; 1YI2 Q; 2KQW A; 1Y57 A; 2RJF A; 2DK3 A; 3BE3 A; 3RIR A; 3FEO A; 2H3E B; 3GIB A; 4DQ2 A; 2JVV A; 2M16 A; 4M7A B; 4AT1 B; 1W4S A; 4FSS A; 1K9M U; 1QP2 A; 1WXB A; 2KAF A; 2L3R A; 3CPF A; 4RTT A; 3VS4 A; 1K8A U; 3GPL A; 3OB9 A; 3QBY A; 4OGE A; 2NLU A; 2L0A A; 2P0Q A; 3C4S A; 1NYF A; 2DEQ A; 3TQ7 P; 3UA6 A; 3T9N A; 2C06 A; 4PJN A; 1G3W A; 2IG0 A; 2J6F A; 1K73 R; 4FYY B; 4IUV A; 1M3A A; 2HD0 A; 2DXT A; 3QSU A; 4ELY C; 1YJN A; 3CCR T; 4AFZ C; 3AT1 B; 1BKB A; 2A3L A; 4L5G A; 3E19 A; 4M78 C; 1SHF A; 1VQ6 A; 1TS9 A; 1D0X A; 4LD9 K; 1B07 A; 3EFS A; 3VUB A; 5GAO p; 3O8V A; 1KQ1 A; 4F16 A; 1F1B B; 3UAT A; 4JDS A; 4C92 G; 5GAN j; 1FXX A; 1KQS P; 2M1H A; 2OX7 A; 1VQP Q; 1WJQ A; 3M4Y A; 4CI0 C; 2CSI A; 4OML A; 1Q86 C; 3V7R A; 1PD0 A; 3WVE B; 2HSE B; 2CP6 A; 1M90 U; 2HL5 C; 1WPY A; 4IKF A; 1ABQ A; 2QA4 A; 2EWN A; 2GFU A; 4JZ4 A; 3CXC S; 2JM9 A; 3RR6 A; 2QTX A; 1NZ9 A; 1KK7 A; 3I5S A; 4OMO A; 2MOX A; 4ZTF A; 1VQ5 A; 4F7U B; 1TG0 A; 4CC2 A; 1O9S A; 3LW5 E; 3BY7 A; 3GF5 A; 2DL8 A; 3CME A; 1PC0 A; 2HZY A; 2F2W A; 1U06 A; 1U3O A; 4RCC A; 2KYB A; 1YJW A; 4RTZ A; 3HHT B; 1M1K C; 4KUI A; 2DL5 A; 1YHQ Q; 2O9S A; 3NPF A; 2A36 A; 3S6W A; 3JCM b; 5GAO r; 3FJP A; 3JB9 F; 3CCM T; 1YNZ A; 1UGP B; 2DIL A; 1Q95 G; 2DXC A; 2LQ8 A; 3VJP A; 2HKQ B; 2PVO B; 3GBQ A; 2P84 A; 2NUT A; 3TRE A; 2QK0 A; 3A8M B; 4M7A D; 2LX9 A; 2FYK A; 2CZ7 B; 5GAN f; 2D0N A; 3BDU A; 2XDD A; 1VQP T; 3G6E A; 3VS7 A; 1AOJ A; 4OMP A; 1EFN A; 2D0Q B; 3NTH A; 3OW2 A; 1R0B G; 1JXO A; 1K0S A; 1H92 A; 4C0Z A; 5AYF A; 3J7A F; 5D6Y A; 1TUC A; 4HCC A; 2OAW A; 2ZPH B; 2WSC E; 4J6Y A; 1E6H A; 2ZZD A; 1Q82 C; 4M78 B; 1YIJ T; 1VQL T; 4M4Z A; 4FYX B; 4OF1 A; 2SRC A; 3JCM V; 1UTI A; 3CCU Q; 2X4Y A; 2LTO A; 4AFS C; 3GOX A; 2KXD A; 4OB3 B; 2D8H A; 4ELZ C; 4JLG A; 3NTK A; 2WSF E; 1LOJ A; 2VGN A; 2E12 A; 3HRU A; 4C0F A; 4WCI A; 4F17 A; 1V76 A; 2O2O A; 2O4X A; 2PUO B; 1ZSZ A; 4RMO A; 3C12 A; 1UGR B; 3CC7 A; 1PSE A; 5CCA A; 1M27 C; 2EYW A; 2K7A A; 4PJO F; 4JPB W; 3I55 Q; 4M75 E; 3I56 T; 2NYS A; 1UB4 A; 2P4R A; 2QYZ A; 2FZK B; 1D0Z A; 2JTM A; 1VQK T; 4ME7 A; 5GAN 6; 2DO3 A; 4FL6 A; 3EH2 A; 4X1V A; 1M3B A; 2L2P A; 5AT1 B; 5GAN 4; 3EFR A; 4EMG A; 1HSQ A; 4JRP A; 4OB1 B; 3KFV A; 2WSE E; 1X75 C; 4MZP A; 1VQ4 Q; 1UDL A; 4Y92 A; 2CUB A; 2AKL A; 2VC8 A; 2YLC A; 3EHQ A; 1NBE B; 2J05 A; 3FB9 A; 1MMN A; 2MWO A; 1C1A A; 1VQ7 Q; 3JCM h; 1TWB A; 1M8V A; 4DBR A; 3VKI A; 2X3X D; 1AZG B; 3URG A; 1NJI R; 1IO6 A; 2QGG A; 4CC3 A; 1NG2 A; 5HCK A; 5CKE A; 2DEU A; 1RAD B; 4FM4 B; 3CCV Q; 1KD1 U; 5LJ3 e; 3OYH A; 3G4S T; 2CT3 A; 2QTV A; 3ME9 A; 1UE9 A; 4QQG A; 1MMA A; 4WF2 A; 3M59 A; 3CCJ A; 4DOW A; 2AZS A; 1XTD A; 4PK4 A; 3G7Z A; 1VUB A; 3VS3 A; 4N0A A; 5HK3 A; 5LJ5 d; 1Z9Z A; 2QAZ A; 4C8Q E; 3I55 T; 2EQU A; 2RI3 A; 3CCE Q; 4JUV A; 1VYU A; 4M78 D; 4DA4 A; 2QAS A; 4FW1 A; 4QT7 A; 3N5B B; 4RG2 A; 2MCN A; 4A4K A; 3CMA T; 5J3B A; 4J9B A; 3X26 B; 4FU6 A; 4JS4 A; 1S72 A; 3PVQ A; 2HSP A; 2HL3 A; 3PFS A; 1M2V A; 1QKW A; 2CP0 A; 5CK9 A; 1OOT A; 2LT1 A; 3G71 Q; 4A4G A; 1OPK A; 2W10 A; 3OY9 A; 5GAO l; 2L8D A; 2EQK A; 2M9U A; 1KC8 U; 3MET A; 1N27 A; 3P8H A; 3MEW A; 1VQM T; 2DET A; 2MAM A; 4HVW A; 1TXQ A; 2ZCF B; 1NPP A; 2HDA A; 3QDR B; 4J83 A; 1KQS S; 1JJ2 S; 4XK8 E; 2COY A; 3EG9 B; 3X20 B; 3OQ5 A; 2CKK A; 4M75 C; 1IRE B; 1WFW A; 3J80 E; 3CC2 T; 4EMK C; 4BDY A; 3H6Z A; 5KYW A; 1HJD A; 1KG1 A; 3JRZ A; 3VRZ A; 2BZX A; 5GAO q; 2OTJ T; 2J7I A; 4J9I A; 9ATC B; 2VVK A; 4DEX A; 1WHH A; 2HQH A; 3OYD A; 2WAC A; 2X9H A; 2BTT A; 1ZA1 B; 1VIF A; 1YWO A; 4XU0 A; 3QJY A; 1VQN A; 3HP9 A; 4L6V 5; 3I9Q A; 4J9E A; 2LJ3 A; 4C8Q G; 3L2U A; 1WJR A; 1B34 A; 2XDB A; 2J6O A; 2JZ2 A; 3JV3 A; 5GAN g; 1LJO A; 2DD4 A; 2EJG A; 1J3T A; 4PLI A; 3H0I A; 3E9G A; 2FRW A; 2RK1 A; 4Z8A A; 3JB9 G; 4ESR A; 4MZT A; 3M4G A; 3G71 T; 3QO3 A; 2EIF A; 1Y96 A; 3OBW A; 5D6W A; 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1VQO Q; 4F7U A; 2KDS A; 1IGU A; 1G5V A; 5IHK A; 1CSK A; 3L2Z A; 2RH2 A; 4CC4 B; 4C92 E; 2YT6 A; 3QUI A; 8ATC B; 4PJO A; 2Y4X A; 2K5I A; 2QDL A; 2GGR A; 3GNF B; 2CZ1 B; 1YIT A; 3P8B B; 3BW1 A; 1A0N B; 3FRN A; 3JCM f; 4KH0 B; 3A98 A; 4IUU A; 3CCR A; 2CZ6 B; 2A28 A; 4P5N A; 4AG1 C; 1T0J A; 4F04 B; 1ZBJ A; 2ED1 A; 3THK A; 2RM4 A; 4RTW A; 2DTI A; 1VIE A; 2V8J A; 2YRD A; 3NTI A; 2I0N A; 3X28 B; 2RMO A; 3EFO B; 3OBY A; 2RHY A; 1OX8 A; 1K9A A; 2KXC A; 4AFU C; 4C8Q B; 2DBK A; 2JS2 A; 1VQ9 T; 1YJN Q; 4D6W A; 1LVK A; 2RPN A; 3TU4 K; 2LDM A; 5A0D A; 1VQ6 Q; 2NWM A; 4XTY A; 4J9D A; 5L23 A; 4HXJ A; 4LUD A; 2EJ9 A; 1H3Z A; 1OU9 A; 4K11 A; 5GAM h; 3H41 A; 5LJ3 h; 3IQL A; 1EZZ B; 2DNU A; 3FLG A; 4M77 C; 4F14 A; 1TUG B; 2LNV A; 4OVA A; 4XU3 A; 2OI3 A; 2M0O A; 1Q81 U; 2QA4 Q; 1NJI C; 3M58 A; 4ANJ A; 2RNA A; 3VS1 A; 2RJE A; 1JJ2 P; 4M75 D; 3PT9 A; 1RAG B; 7AT1 B; 2E10 A; 4E7Z A; 4A4H A; 1VQ5 Q; 3M56 A; 2LP5 A; 1WYX A; 1QCO A; 2F2X A; 5IXB A; 3CCM A; 4V2S A; 5KH6 A; 1YCS B; 1T3L A; 3CME Q; 1YI2 T; 4RUG A; 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