The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
78
|
structure length |
78
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Chain Sequence |
VKNYETAVQFCWNHYKDQMDPIEKDWCDWAMISRPYSTLRDCLEHFAELFDLGFPNPLAERIIFETHQIHFANCSLVQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
RECEPTOR ACTIVITY-MODIFYING PROTEIN 2
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| publication title |
Structure of the Extracellular Domain of Human Ramp2
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
28
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| structure length |
78
|
| sequence length |
78
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQE A; 3N7R C; 3AQF A; 2YX8 A; 2XVT A; 3N7S C; 3N7P D; #chains in the Genus database with same CATH topology 4PHA A; 1YT3 A; 4KX5 A; 1X6J A; 5J0X A; 2JV3 A; 1N61 A; 5KL1 B; 4TUQ A; 2HHV A; 3F5E A; 2K4H A; 2KP7 A; 1LKY A; 4Z6F A; 3UMG A; 4NM1 A; 1Z3E B; 4DS5 A; 5DB8 A; 3GQC A; 4YD1 A; 5KFK A; 2W7P A; 3VCB A; 2RQ5 A; 3C2M A; 4DOA A; 2HBK A; 8ICC A; 2KFN A; 2YB1 A; 2CXY A; 4OO1 J; 3GZF A; 4R8U B; 3GV5 B; 5ALW A; 4XA5 A; 3BQ0 A; 4XQ8 A; 5KG6 A; 2JRZ A; 4QIW F; 2KIC A; 1ED1 A; 3BS5 A; 1NZB A; 4UB6 U; 5KAF U; 3JPO A; 4KLG A; 4PHP A; 1ZD4 A; 4P4M A; 5DB9 A; 4MHV A; 5J2K A; 8ICW A; 3SMV A; 4GXJ A; 4KLJ A; 4DCC A; 2R8H A; 1LVH A; 2HDO A; 4DQP A; 1Q8K A; 2H3F A; 2YML A; 3UPQ A; 5AIA A; 2KSO B; 2BCU A; 1DGJ A; 4PH5 A; 5AKJ A; 3LDA A; 2BZF A; 4I2G A; 1MQ2 A; 3K4G A; 5AM0 A; 4TUS A; 5KFX A; 2NV3 A; 2BPF A; 2VKQ A; 1V38 A; 2ZXH A; 2ALZ A; 1J2M A; 1DXS A; 3C2K A; 1Z1B A; 1XSP A; 2QB0 B; 4BGD A; 4BXO B; 5J0O A; 3RB6 A; 2E1E A; 2CPR A; 4Q43 A; 2FJ6 A; 2P35 A; 3DDH A; 2IOH A; 2KSO A; 4KMU A; 3WK9 A; 2R18 A; 3MDC A; 2C2D A; 4QZG A; 3QZ8 A; 5AKK A; 1LB2 B; 4ELT A; 1QSL A; 5JTI A; 3CYM A; 1BNP A; 2M0N A; 2QB0 A; 4J9L A; 4BXO A; 3ZDA A; 2GO7 A; 5KFF A; 1PUZ A; 3KBB A; 4YXM A; 1T94 A; 1RQL A; 4QZ9 A; 4KMO B; 4QZI A; 5KTQ A; 9ICL A; 2MRL A; 2KIW A; 3ALR A; 1IIP A; 5DG8 A; 4F5N A; 2H5X A; 4Q44 A; 3PSF A; 4OJL A; 4BDP A; 8ICK A; 1QQ7 A; 2Q4T A; 7ICN A; 4RQM A; 5ALV A; 2LM4 A; 1F44 A; 4DSF A; 3GDX A; 4DLG A; 3TQ1 A; 1UQV A; 2EAN A; 3Q8R B; 3BS7 A; 1ZQE A; 4B9T A; 2WFA A; 4YR2 A; 1V9P A; 2KE7 A; 1WG8 A; 1LV5 A; 1WWU A; 5IIO A; 3JPP A; 4I2C A; 1ZQU A; 2OEH A; 3A0H U; 1VJ5 A; 2FPL A; 3H4B A; 3EPG A; 1BGX T; 2AGO A; 3KHL A; 2G09 A; 2ZIX A; 5IIJ A; 5FP0 A; 1SV0 A; 5B66 U; 4C80 A; 4O5E A; 1ZQL A; 1OXJ A; 4M6W A; 3C1Z A; 4UBB A; 4F93 B; 2MAX A; 3T79 A; 5KG7 A; 5CB1 A; 4I2J A; 5A0L A; 4KLH A; 3UXP A; 3LVV A; 1IXR A; 4LVS A; 2HBM A; 1PK1 B; 2AHO B; 2W8L A; 4F2S A; 3M8R A; 5ALU A; 2KOB A; 7ICR A; 2HHU A; 4EEN A; 5KFW A; 1D9F A; 4DQR A; 1Q46 A; 4RQ3 A; 3PSI A; 4IR9 A; 3LK9 A; 1C20 A; 3OSP A; 5AI5 A; 1Z4N A; 2W7O A; 5G5H A; 1X9S A; 2WAQ C; 1NK4 A; 4P0Q A; 2Y9U A; 8ICT A; 1PK1 A; 2EDU A; 1PVQ A; 4K4H A; 1L8L A; 1L7M A; 3T5H A; 4UAV A; 4P4P A; 4HAI A; 2K89 A; 2J6T A; 2JGA A; 4MFC A; 2BDP A; 1L7P A; 3D2Q A; 4KLS A; 1GO3 F; 3PR4 A; 1JMS A; 5DB6 A; 3OJU A; 3UMC A; 2C2E A; 2KEY A; 4U7C A; 1Y88 A; 5F9L A; 3N4M B; 2E8O A; 1L5U A; 2WF9 A; 4C7Y A; 2RDJ A; 3RRH A; 1L3S A; 3PX4 A; 5AI8 A; 4KLQ A; 1N62 A; 3AM9 A; 2W9B A; 2HHT A; 2IHM A; 2KK0 A; 4JV2 A; 2W9C A; 1JRO A; 1ECW A; 4ZH4 A; 2FMS A; 3BZK A; 4B6J A; 3FM9 A; 4B9N A; 2F1I A; 2ZIV B; 3SR6 A; 5J2B A; 2J6S A; 3OTQ A; 4TQR A; 4DSJ A; 4RQ4 A; 2LYA A; 2XVT A; 4YR3 A; 4DLE A; 2DPI A; 2EZZ A; 2E3T A; 3LVW A; 4F5O A; 9ICS A; 2E1F A; 1NK7 A; 4I2D A; 1ZQG A; 1FEZ A; 1X9X A; 4MFA A; 1M6Y A; 1S77 D; 3WKD A; 2ZUD A; 1UT5 A; 4B9L A; 2ZIU B; 1MQ3 A; 1U48 A; 4USA A; 2HHW A; 8ICL A; 3MC1 A; 1IM4 A; 1KRP A; 1WUD A; 3PW2 A; 2YTU A; 4WJ3 B; 2FPM A; 1S0N A; 2EAM A; 1TKD A; 1X66 A; 4F4W A; 2KV2 A; 2B0C A; 1ZD2 P; 4NJ8 A; 1XU4 A; 2HOQ A; 1BPY A; 3WKC A; 2KFZ A; 3FDS A; 2RDI A; 3IHQ B; 2P6U A; 2HW3 A; 5ALP A; 2NRW A; 5AK6 A; 4ED7 A; 3MDA A; 2GH1 A; 4AYB C; 3JPQ A; 3NVZ A; 2NRT A; 4I2B A; 3T5K A; 9ICB A; 1TK0 A; 2Y0S F; 3N97 B; 1JIH A; 4JMU A; 3V7L A; 4AP9 A; 4C8M A; 5III A; 3H8S A; 2PFO A; 1ZQA A; 5AK5 A; 4JWN A; 4C4S A; 4F2R A; 5ALE A; 1ZQM A; 5BOL A; 1ZQJ A; 8ICQ A; 2W9M A; 3QNM A; 1JXL A; 4J9R A; 3AL0 B; 4KLM A; 1A6S A; 1KFD A; 2ZTD A; 4QWE A; 4B9U A; 4UAW A; 3PZP A; 2AQ0 A; 1NK6 A; 5KT2 A; 4P2H A; 4JWM A; 1ZQD A; 1TFR A; 4LZG A; 1ZQI A; 1QLN A; 4QZD A; 4RQ8 A; 8ICM A; 4O3S A; 1N5X A; 3V72 A; 9ICR A; 7ICF A; 1RXW A; 2F1H A; 1Z4O A; 1SXE A; 3G6X A; 2F2A B; 3HKZ F; 3QUT A; 3C21 A; 1K1Q A; 2KZZ A; 1SB3 C; 4IQV A; 2HOI A; 1KFS A; 2F1J A; 5DQH A; 3B9J A; 4B9V A; 3ZI4 A; 9ICW A; 1NK0 A; 3SV3 A; 3EPI A; 4NXZ A; 3KKA A; 2H3Q A; 1WYG A; 3NVW A; 3MR3 A; 4QZE A; 2I1Q A; 1L7O A; 1JAL A; 1B43 A; 3V6K A; 4C4T A; 3PSP A; 7ICK A; 1S0O A; 2D6F C; 1KW4 A; 1Z19 A; 7ICU A; 9ICE A; 2XO7 A; 1KFT A; 1KKX A; 3RBE A; 4LZD A; 1PVP A; 4QZC A; 3I28 A; 5DLF A; 3HX0 A; 1S8O A; 5JUM A; 3AEV A; 3TAR A; 7ICG A; 1TK5 A; 2JH1 A; 5DQG A; 2IMW P; 2G07 A; 4M04 A; 3RJE A; 2ZJ8 A; 4ECQ A; 2PKE A; 2ISP A; 3PX6 A; 2BQ3 A; 1ZQV A; 4YCX A; 4KN7 A; 4EBE A; 4EYH B; 4DF4 A; 1Z00 A; 4UAZ A; 1QQ6 A; 4ELU A; 3PV8 A; 1BVS A; 3B0Y A; 5AM3 A; 4OD0 A; 2KD1 A; 2VA3 A; 5ALO A; 2WHE A; 2W3S A; 3UXN A; 4JB3 A; 3PY8 A; 2PFQ A; 5DDM A; 1S10 A; 1YZ6 A; 4KLO A; 2QAR B; 7ICL A; 9ICI A; 4P0P B; 4Y2T A; 4MEY A; 3H8J A; 1N63 A; 4KLI A; 3M8S A; 1NK8 A; 3HIL A; 1T4G A; 2KJ8 A; 2JZB B; 4O5C A; 1JI7 A; 2WF7 A; 4GFJ A; 5J0T A; 8ICO A; 1SKR A; 2HBJ A; 3IP4 B; 5EE9 A; 4M47 A; 3G6Y A; 2XY7 A; 2G5H B; 8ICS A; 3PW4 A; 1V85 A; 2JR5 A; 4Z6D A; 2KTQ A; 2KMD A; 4Q8F A; 4C8L A; 1JX4 A; 3QE9 Y; 3L5K A; 2W54 A; 1N56 A; 3IRU A; 4NL9 A; 5AKI A; 3C28 A; 8ICE A; 4YG2 A; 3S6J A; 4ED2 A; 4J9M A; 2BGW A; 1KN5 A; 2E8N A; 1DRG A; 4IS7 A; 4ED6 A; 2G0A A; 1LKY B; 4M9N A; 5IIL A; 5DG9 A; 5J0W A; 4RNM A; 4KLT A; 2JEF A; 2GLE A; 5AM1 A; 1H38 A; 4O3N A; 3PMN A; 3C29 A; 4EX6 A; 5KFQ A; 3ISB A; 2PFP A; 5KG5 A; 3PW0 A; 4F8R A; 2ZTE A; 2G08 A; 5ALQ A; 1VLB A; 4DFK A; 2XCP A; 8ICZ A; 2EZY A; 3MFH A; 1T3N A; 3BS5 B; 3M9N B; 5CHG A; 4BX9 C; 3MR6 A; 4JV0 A; 5ALT A; 3RH4 A; 2KN7 A; 4R63 A; 4RZR A; 1S76 D; 2QB1 A; 1SL0 A; 3MFI A; 5AKY A; 5J8Y C; 2ZXI A; 1MSW D; 2YY6 A; 1KTQ A; 8ICN A; 2K4I A; 1NOM A; 4NL9 C; 8ICV A; 9ICM A; 1DOQ A; 3HP6 A; 2FI1 A; 1A76 A; 3KHG A; 4Y2Y A; 1CI4 A; 4RPZ A; 1ARO P; 2PI5 A; 3ZDC A; 4Q45 A; 4US8 A; 4QWC A; 1ZOL A; 3SAF A; 2XY6 A; 2Y1J A; 5AKG A; 1L3V A; 3ZDE A; 5KFR A; 3ISC A; 5AK4 A; 5CA7 A; 1X9M A; 5AKH A; 5ALF A; 4QZA A; 4FZM A; 4M2Y A; 1KDH A; 5KFY A; 4I2I A; 8ICP A; 3CRX A; 5AK3 A; 2IOF A; 1XNS A; 1XO1 A; 2AQ4 A; 2ZG6 A; 8ICU A; 4BWJ A; 1ZRN A; 5F9N A; 2JMG A; 4ELV A; 5BOM A; 4ACO A; 3PO4 A; 4F5Q A; 4QWD A; 4C7Z A; 4DL7 A; 1NJZ A; 7ICE A; 1RYU A; 1BPX A; 4NV0 A; 2R8J A; 5KT7 A; 4RQ1 A; 4O0I A; 5HR6 A; 3CW2 C; 4ECS A; 2F8L A; 9ICQ A; 2FLL A; 1MC8 A; 5TZV A; 3CNH A; 3QU7 A; 3GIM A; 4F50 A; 2YMM A; 1K1S A; 2H3I A; 8ICA A; 1EXN A; 3L3F X; 5J0P A; 3HJE A; 4QZH A; 5AI9 A; 1ZQX A; 2DKZ A; 3ED5 A; 4DSE A; 3T5L A; 5CP2 A; 3ZDD A; 2V4R A; 3TAP A; 5KFH A; 2W9A A; 3TAQ A; 2WAQ F; 1CRX A; 1X9W A; 2VJ4 A; 5TIS U; 1ZQZ A; 3T5J A; 1L6N A; 1OUQ A; 2K60 A; 2OM6 A; 3VC8 A; 3QUB A; 1YZ7 A; 3I76 A; 4F4X A; 1RQN A; 4YMO A; 3GV7 B; 4Y2U A; 2EH9 A; 4LJX A; 3L4P A; 4B9M A; 2YQE A; 3U26 A; 2ZIX B; 9ICO A; 4FZN A; 2HHQ A; 4FS1 A; 2K4E A; 4US9 A; 3Q8M A; 4QNL A; 2MU2 A; 4M6W B; 4CDG A; 1KSP A; 1HIW A; 4UB5 A; 4O3O A; 5KFL A; 4DWI A; 2FMP A; 4FZL A; 1DGS A; 2RLT A; 3E2E A; 5ALS A; 3Q8S B; 2BKE A; 3OGU A; 4PPX A; 1IG6 A; 1X40 A; 4ED1 A; 3PW5 A; 3C5F A; 5AM5 A; 9ICH A; 4GLX A; 3JPR A; 5H2F U; 2YB4 A; 3GV8 B; 2GWS A; 4DL3 A; 1TK8 A; 4OJO A; 4Y2P A; 1T3Q A; 2EZX A; 7ICV A; 4IQU A; 2FLP A; 5ALJ A; 3R9K A; 2A1A A; 5EE3 A; 2G5I B; 1XS9 D; 4UAU A; 5DGA A; 5HMM A; 5DBC A; 4P0Q B; 2D3D A; 4YP3 A; 9ICF A; 4UQG A; 3RJI A; 1K5O A; 3PR5 B; 1V97 A; 4O3R A; 2R8I A; 4IL6 U; 4Q8E A; 4YMM A; 3UQ2 A; 5J2I A; 1IV8 A; 5HNK A; 3M9O B; 3TAD C; 1D9D A; 1O03 A; 3H8W A; 1F5S A; 4XUS A; 2PI4 A; 2XIC A; 3C5G A; 4CF4 A; 4O9M A; 3V6J A; 3DV9 A; 2LHT A; 3SEI A; 5JRT A; 4EBD A; 1CUK A; 3Q8P B; 1OW5 A; 2KHQ A; 5AM2 A; 2W9B B; 4ECU A; 2F44 A; 2W9C B; 4AYB F; 2C2R A; 2JEI A; 4DL5 A; 4I2E A; 4Y2X A; 4R66 A; 4F4Y A; 5CEH A; 1SWV A; 1S9F A; 3NAS A; 5KFZ A; 2NO4 A; 2DF4 B; 3D2S A; 4EEY A; 3QXG A; 2UVR A; 3E58 A; 1XO0 A; 4KLF A; 4FO6 A; 5DDY A; 3QUQ A; 4C0Z A; 4Y2Q A; 1KLN A; 4UB1 A; 4DSK A; 3WKE A; 1Q3U A; 2OCE A; 1DK3 A; 4ECT A; 4IC9 A; 3AUO A; 3E0F A; 8ICY A; 2KKV A; 1D8L A; 5KFV A; 3GIJ A; 3BQ2 A; 3WU2 U; 5L9X A; 3D2N A; 3IG8 A; 4C4R A; 3ZDB A; 4PL1 A; 7ICI A; 2LI6 A; 3LWM A; 1Q3V A; 2I5H A; 2HHX A; 2BCV A; 2Q0Z X; 3RJF A; 5ALY A; 4UAT A; 3PNC A; 2A3V A; 2AXT U; 1A77 A; 3NGD A; 5EE0 A; 2ZJA A; 4ECZ A; 1ZQB A; 4BUG A; 2C22 A; 4ECY A; 1SWW A; 5KFG A; 2ZTC A; 4NLB A; 3EZ5 A; 3AMZ A; 1NZP A; 4IRC A; 1ZD3 A; 4F4Z A; 4IR1 A; 4PGQ A; 9ICG A; 3K1R B; 5CRX A; 4NM2 A; 1U47 A; 3RAX A; 1QTM A; 3QU4 A; 4O3Q A; 4OJP A; 2XY5 A; 3AN1 A; 2F77 X; 4DQQ A; 1RDF A; 5C0Y A; 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1J97 A; 4ED3 A; 1X6I A; 2LPE A; 2YX8 A; 3WK6 A; 3F5A A; 1NJX A; 1Z00 B; 3Q8L A; 1L3T A; 1KEJ A; 3LYS A; 3ONN A; 2A1J A; 4RQ6 A; 4EZ6 A; 5KFD A; 1D8B A; 4HYK A; 3SAG A; 1NKC A; 2P6R A; 3F2D A; 2XGP A; 1QCK A; 3OHB A; 3GIL A; 3F53 A; 1L8O A; 5JU5 A; 5DBA A; 5HP4 A; 1WCN A; 4GIB A; 2K8B B; 4DFM A; 3PVX A; 1F0M A; 3C23 A; 3HWT A; 3ISD A; 2Y0S C; 1S0M A; 4C8N A; 8ICB A; 4KLU A; 3NUQ A; 1SL1 A; 4DFD A; 1COK A; 4ED8 A; 1ZQ1 C; 5KFN A; 2ZIW A; 2D8C A; 3SYZ A; 5AHX A; 4R65 A; 4EEL A; 3PST A; 1HUZ A; 5J2G A; 1ZQT A; 1B22 A; 3N7S C; 5C5J A; 3KHR A; 3MGV A; 5KFJ A; 2P66 A; 4RU9 A; 3FAH A; 3TFR A; 1KBU A; 3BJY A; 3JPT A; 5L1K A; 3NVV A; 7ICP A; 4YN4 A; 3TKA A; 4OJ5 A; 5J2C A; 5CWR A; 3QEA Z; 1HEK A; 8ICR A; 2KJ5 A; 5DG7 A; 9ICV A; 3F2B A; 3N7R C; 2ASJ A; 4QWB A; 2OWO A; 8ICF A; 4RQ7 A; 2WB1 C; 4G3I A; 8ICH A; 4J03 A; 3IN5 A; 2RHF A; 5K4L A; 5KG4 A; 9ICJ A; 5J8Y A; 2KHV A; 1SV4 A; 1BPZ A; 5CR0 A; 1SKS A; 4ICA A; 3H0L B; 9ICP A; 2ZUC A; 5B5E U; 4DF8 A; 1UHU A; 4RPX A; 1RYS A; 2VIX A; 1RXV A; 2BCQ A; 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