The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
MVYTVSYDVDGTVIKTKVEAGTRITAPKPPTKQGYVFKGWYTEKNGGHEWNFNTDYMSGNDFTLYAVFKAET
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
INTERNALIN B
|
| publication title |
Fold and Function of the Inlb B-Repeat.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Listeria monocytogenes egd
|
| total genus |
11
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| structure length |
72
|
| sequence length |
72
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2Y5P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W9N A; 4L23 A; 1PGX A; 2PE9 A; 1KM7 A; 3IHP C; 2IY0 B; 3BWU D; 2GMI C; 1GJZ A; 4C80 A; 1L0X B; 3AEA B; 3HRD D; 5JHB A; 2K3U A; 1KTK A; 4NJC A; 2I38 A; 2CJO A; 3DVG X; 1WJN A; 3Q8C A; 1FD6 A; 3N9Y C; 2DZI A; 4A55 A; 3A33 B; 1NYR A; 1F52 A; 4REZ A; 3KH0 A; 2IZV B; 1TY0 A; 4W9J A; 3ZYY X; 2JQR B; 1J7B A; 1TS4 A; 4W9C A; 3HM3 A; 1JRP A; 5AZH A; 1YJ1 A; 1ISN A; 3C0R B; 3A1Q B; 1J0G A; 1QZE A; 4II2 B; 4IUM B; 3OWE B; 1N62 A; 1V1P B; 4KVG B; 4OVZ A; 1D4B A; 1L7Y A; 2NBW B; 2IGG A; 2MP2 A; 4DK5 A; 1UWX A; 4TSS A; 2HJ8 A; 3BK1 A; 5H8Y E; 4XGA B; 1C4A A; 1J7C A; 4LTU A; 4MSQ B; 1A70 A; 1ZP0 B; 4GDK B; 2DYM A; 2C5L C; 3R7Q A; 4IWP A; 2DWQ A; 2J42 A; 3A9K B; 1CJE A; 5BYS A; 1ZE3 D; 4ICU A; 2G9H D; 2KWC A; 2MCN B; 3P2B A; 1AAR A; 4RGN A; 3ZXV A; 3AEG B; 3AE6 B; 2KN4 A; 3ZTC A; 4G50 A; 1FFV A; 1EU3 A; 2WU5 B; 1V6E A; 5LXH A; 1C79 A; 2BS3 B; 3QC8 B; 1WGR A; 3AE1 B; 1PGA A; 2BYE A; 5LLI A; 2LXA A; 1N61 A; 3T3N A; 3AED B; 2O6V B; 4G11 A; 1IUE A; 1OQR A; 1F2R I; 1KRH A; 1HEZ E; 2HTM E; 2DYB A; 4B9K A; 3GOE A; 3N1X C; 4A3P A; 4PS3 A; 5GMV A; 2AQ2 B; 2CHZ A; 3Q3O C; 4XC2 A; 2CKH B; 1KJT A; 3IAS 1; 2QEJ C; 1YIW A; 2KX3 A; 2AL6 A; 1NEN B; 3TEW A; 2WDV B; 3PGE A; 3N20 C; 3QX1 A; 1VZ7 A; 4WQM A; 2J52 A; 3UGB B; 4RGM A; 1ZOY B; 3JSV A; 3KQ4 A; 5E6J A; 1F2R C; 2NPT A; 3T8M A; 1UEL A; 4B0E A; 3QHT A; 3TEX A; 3BYY B; 4KIK B; 5MPO A; 2WXK A; 4F1S A; 3KUD B; 2X8X X; 2WXJ A; 2Z0D B; 1FM0 D; 4NNJ B; 3PTF C; 2K25 A; 4S17 A; 2IPK D; 1SE2 A; 5HFY A; 2MJE A; 3C8Y A; 4OZC A; 2L3Z A; 3I3T B; 2DZM A; 5IKC M; 3RNE C; 4E71 A; 1N5W A; 4YTP B; 1ZXH A; 3LDZ E; 3ZKJ C; 1NBF C; 4NQK E; 2L83 A; 3RFZ B; 4HDO A; 3TEZ A; 2BKF A; 4NAW A; 3VRA B; 2KYW A; 4WAF A; 1QIL A; 4DXG A; 3EUB 2; 1WMH A; 1UH6 A; 4P1B C; 2MBE A; 2PKO A; 1E90 A; 2K39 A; 2KJ6 A; 3V6C B; 5AEK B; 1NI2 A; 4FJY A; 1CK1 A; 4S0R A; 2KDE B; 2ZCC A; 2L7R A; 5D94 A; 1XLN A; 3CST A; 2J0M A; 1QT9 A; 4MGZ E; 1OEY A; 4LNO A; 3Q8E A; 4FN2 A; 5IOI A; 2FBW B; 2RGF A; 1XD3 B; 2KWU B; 2K6D B; 1YX5 B; 3GP7 A; 3AM9 A; 3M3J A; 3ZGZ A; 3RT3 B; 4ARI A; 1E10 A; 3ZNI D; 4RF1 A; 1VD2 A; 4MJS B; 3BZD B; 3H6N A; 4GIV A; 1I4X A; 1MHX A; 2DLB A; 4JIO U; 1HA5 A; 3BII D; 3VUY A; 3WAP A; 1FXI A; 1E7P B; 5EE1 A; 3DBL I; 3MJ5 A; 3RI7 C; 4CO7 A; 3UIO B; 1WXM A; 3VH3 B; 4J3O D; 3SFD B; 4ZRP A; 2JZ3 B; 1P7F A; 4ZDV A; 4AUQ C; 2RR9 A; 3NZ3 A; 4XE0 A; 1ZUD 2; 1UWM A; 3Q69 A; 3VQI A; 1NEK B; 1P9D U; 3L0W B; 1R4N I; 1SBB B; 1IGD A; 1MVK A; 4RMA A; 3LXF A; 4FXC A; 2SAK A; 2KD0 A; 2CHW A; 3U2S C; 2N4F A; 1JWU D; 4WUR A; 1YQ4 B; 3GZN I; 2AQ1 B; 3KUZ A; 3AH7 A; 2O2V A; 4KSK C; 2J7Q B; 4W9G A; 4A20 A; 4B95 A; 1WRI A; 4OW0 A; 2N1W A; 3HVD A; 3U8Z A; 4DDG D; 5DPR A; 4JE3 B; 2CJN A; 4IWO A; 4OZB A; 1T0S C; 3W1S C; 2MBO A; 3V62 A; 1VLB A; 3HK0 A; 3ZRF A; 2CR5 A; 5FK9 C; 2LJI A; 2KFK B; 1DOI A; 4JWU C; 1F0Z A; 2INC C; 2MX2 A; 2ZVN A; 1S1Q B; 2ZVO A; 4EZK A; 3ABV B; 3D32 A; 3NVY A; 2K0P A; 3OAW A; 5L95 C; 1E8Z A; 4BAX A; 2HTH A; 1GB1 A; 1TKE A; 1V2Y A; 4DHJ D; 2INN E; 5G5H A; 3DDC B; 2KOX A; 2KZR A; 4PK1 A; 4M02 A; 1E7V A; 4RNA A; 3RMK C; 2KLC A; 4W9L A; 2WS3 B; 3RNG C; 3I9V 1; 1TY2 A; 3M95 A; 3KLS X; 1Y8R C; 1OQQ A; 3LB8 C; 3WAO A; 3ZJU A; 3VTW A; 3U7D A; 1RLF A; 4LNK A; 1LFD A; 1OFF A; 1UZX B; 1E0Z A; 1I4Q A; 3GB1 A; 2A4Z A; 3IFW B; 2BS4 B; 3DBH I; 2C9W B; 4YT0 B; 3ZNZ B; 3T3O A; 2YEP F; 3FIL A; 1E8X A; 3PS6 A; 2HE7 A; 3APC A; 2KVZ A; 5C3J B; 3ECI A; 4IM3 A; 2BB5 A; 5EDS A; 1FEH A; 3H7P A; 2KQ7 A; 2ACZ B; 4HKZ E; 2Y5C A; 5D6J B; 1MPE A; 4OVU A; 1WH3 A; 4HCP B; 2WWZ A; 3ZNH B; 1T5X D; 2PW9 A; 1SEB D; 3ENE A; 1L6V A; 3EC8 A; 3PRP B; 3VAW A; 3IBE A; 1IBX A; 3Q14 C; 3EGR A; 3QJZ A; 1HTQ A; 2NMQ A; 2DAF A; 1GC7 A; 2N9L A; 2NR2 A; 3GZN B; 4TQ1 A; 1JWB D; 5CHV C; 2WXH A; 2DZK A; 2R2Q A; 4EUT A; 2MBB B; 4NY0 A; 3DHI C; 1HE8 A; 4BKS A; 1RWS A; 2IBI B; 2BGF A; 2PJH A; 3PRZ A; 1YQ3 B; 3BVZ A; 3PLV A; 3H7S A; 4ICV A; 1I35 A; 2MRP A; 2NS5 A; 3NS8 A; 3M63 B; 4P6V F; 1HZ5 A; 2D3A A; 4B0M A; 4LJP B; 5LNK 1; 2AEH A; 1FCC C; 1YJJ A; 4MSM B; 3Q3N C; 4FLH A; 5HKH A; 1R4M I; 1OGW A; 4W9D A; 5D3I B; 2LRW A; 1KFY B; 1XLP A; 3KWL A; 3DHG C; 2WXN A; 2E6X A; 1JAL A; 4L1B A; 1HZ6 A; 1YN4 A; 3DVG Y; 2LGI A; 1I4G A; 1WJ6 A; 4PS8 A; 2KO3 A; 2MP2 B; 1HTO A; 2R61 A; 2W54 A; 3TMP B; 1GB4 A; 2BT6 A; 4ZRJ A; 5FKA C; 1MJD A; 1NDD A; 3A4S C; 2WU2 B; 3IVF A; 4KKJ A; 2H88 B; 4AQ7 A; 4K7W A; 3MC0 B; 3AN1 A; 4W9E A; 4IOI E; 2IYD B; 4MAC A; 1FRR A; 4GGQ A; 5FR3 A; 3JYU A; 3RCZ A; 4FA6 A; 3ML8 A; 4IG7 B; 3M62 B; 2G4D B; 2JRI B; 3QWZ B; 3L4P A; 3I5J C; 5CHW A; 1UUP A; 3DBR B; 1WXV A; 3A9J A; 1V1O A; 4K7U A; 4I6L B; 1RAX A; 2VH2 A; 2K8C A; 5CX3 A; 3TCA A; 2BWE S; 3B2G A; 5BYQ A; 5D2M B; 2RDB C; 4BBN F; 5AZF A; 2KMA A; 3RN9 C; 3ZXR A; 3E9S A; 3B9J A; 2YVC A; 1TT5 B; 3N30 A; 5KHQ A; 3VUX A; 3ALB A; 1ROE A; 4ZRI A; 1JCK B; 4USA A; 5JZE B; 3UQA A; 3GE8 C; 3RPF C; 5C2T B; 4XDD A; 1SGH A; 4NJ6 A; 1N6Z A; 1L5P A; 3K9O B; 2L00 B; 4DQO C; 4P16 A; 2B3A A; 2RDG A; 3V3X A; 4UDU C; 4XYC A; 4MGI E; 1AN8 A; 4ARC A; 3U7Z A; 1I4P A; 3AB5 A; 4CYE A; 2Y5B B; 1FCL A; 3VVW B; 1TKG A; 3P4P B; 4A6Q A; 1PDX A; 2EKI A; 1IYF A; 4FAD A; 3GS2 A; 1QOB A; 3SHQ A; 3R3M A; 4EE2 A; 3RYT A; 1K50 A; 2W3R A; 1QOF A; 1P0R A; 2ON8 A; 2BF8 B; 2QMT A; 2QJL A; 2K8H A; 1ZDV A; 3VR8 B; 2ZNV B; 4NAW B; 1R4M B; 4Q2J A; 2C7N B; 1WMH B; 1SF0 A; 2PLP A; 3EFU A; 2BW2 A; 3Q2A C; 2KDB A; 3DOW A; 3AE8 B; 2KC2 A; 2Z8L A; 1ZW7 A; 2IGD A; 3PZ7 A; 3SDL C; 1M94 A; 3U52 E; 3NRZ A; 2WXR A; 1BT0 A; 3P1M A; 1G6J A; 1WGD A; 2D3C A; 1XXG A; 2LMC A; 1WIA A; 1I4R A; 1WJ4 A; 3HVZ A; 2I2Y A; 3EEC A; 1C78 A; 1SE9 A; 4AOF A; 1YX6 B; 2FCS A; 1IPG A; 1T6B X; 4YSZ B; 5EE9 A; 3DWM A; 5L83 A; 2JWU A; 4IW0 A; 2FUG 1; 2EMT A; 1PYW D; 2G45 B; 2BQQ A; 3HHM A; 3H9D A; 2M0X A; 1EF1 A; 3APF A; 2K9X A; 1C9F A; 2LGY A; 4C4V A; 3HM6 X; 2ASQ A; 2WXP A; 1WX7 A; 3O13 A; 3L17 A; 1WI0 A; 4MEL A; 4E3C A; 3KUC B; 1QOG A; 1VJK A; 1GNU A; 2KTR B; 2MHJ A; 2LVQ A; 3Q8B A; 2V1Y A; 4NQL B; 3BVM A; 3ZUN A; 4BKG A; 2JY6 A; 2KFJ A; 1HQR D; 4TV3 A; 4KGS A; 2V3N A; 4OHJ A; 1J19 A; 2D3B A; 2M8S A; 1STE A; 4MGY E; 2WX0 A; 3VHT C; 2L0T A; 4MEM A; 4BKS D; 4ZRQ A; 2FE8 A; 4MH8 A; 2NBV B; 4PYU A; 1JRO A; 3TUO A; 1IP9 A; 1ACC A; 2A5U A; 5HHD G; 3O65 B; 4WJN A; 3Q6B A; 2JT4 B; 4LNF A; 2LWP A; 3SFE B; 2INP E; 4ANW A; 4RGT A; 4BOZ B; 4HCN B; 2PEA A; 5HI1 A; 2K22 A; 2KN5 A; 4HPM B; 2WXG A; 4M00 A; 2LUM A; 3AUL A; 3ZVV A; 3PT2 B; 2LAS A; 4PS7 A; 3RZW C; 2I1K A; 2PMV A; 4RFB A; 1A5R A; 3J9C A; 3A9K A; 3OG5 A; 4MGK E; 1SIJ A; 3PO0 A; 4MT5 A; 2WDT B; 1BML C; 2DAJ A; 3QQ8 B; 4G0N B; 1HXY D; 2GBJ A; 1SE4 A; 3VTV A; 1EWY C; 1T0Q C; 2K5P A; 1WYW B; 2IO0 B; 2JX5 A; 2LFI A; 1P98 A; 1ZDX A; 1N60 A; 4N59 A; 4WIP A; 4YSY B; 5CTR C; 3Q3J A; 2ZPY A; 3ZLZ A; 2WLB A; 2O6V A; 2PE6 B; 2C7M B; 1C4P A; 3AV8 A; 2V3S A; 3AE9 B; 4E74 A; 5DPT A; 2JXT A; 2IO2 B; 3S2A A; 3U30 A; 2L1A A; 5IA7 A; 5E6O A; 3ETR A; 4GOC A; 4C00 A; 3NG0 A; 1EM7 A; 1JRU A; 1V5O A; 2BYT A; 4GDL A; 4HJG E; 4LDT D; 2N9E B; 3N3K B; 3U4E G; 4KGT A; 2GBK A; 2FAZ A; 3IXS A; 1T0R C; 3MC8 A; 4WAA A; 3W5U B; 4ITK A; 1VZ6 A; 5G5G A; 1NVI D; 3FIL B; 4MDK E; 3Q3M C; 3TSS A; 3EFC A; 2XNA C; 2RDH A; 3QIJ A; 5IO9 A; 2QDF A; 3RNB C; 1EO6 A; 2KAN A; 3FAH A; 2KHW B; 4KIK A; 2KDM A; 2KAC A; 1JQ4 A; 1TS3 A; 2MA9 B; 2M17 A; 3IT4 B; 3OLM D; 4TMA B; 5FR6 A; 2AL3 A; 3VH4 B; 2QIE B; 3PZD A; 2PVG C; 3EHV A; 2BS2 B; 2CHX A; 2J0K A; 4F7Z A; 1KF6 B; 1UBI A; 3DQV A; 1TZO A; 4XDC A; 4JGH B; 1XF5 L; 1KLG D; 2FNJ B; 3DPD A; 2BYV E; 3QK0 A; 3AE2 B; 4US8 A; 2RD0 A; 3ZIM A; 4IM2 A; 1GPX A; 1IBX B; 1OQY A; 5D7G A; 4KZ0 A; 3MC9 A; 2ZW0 A; 2DEN B; 2FCQ A; 1Z5S B; 4M0W B; 1YOV B; 2MJD A; 3RUI B; 4A3O A; 3VRB B; 4JWS C; 1CQV A; 4G3X B; 1L0V B; 3AE4 B; 2J0J A; 4EZJ A; 2DHZ A; 5IN7 A; 4C7Z A; 2JF5 A; 1DGJ A; 2JUO A; 5HG2 A; 2MBQ A; 4AJW A; 3W2D A; 3V6E B; 1UGM A; 1T0Y A; 2MBH A; 2IGH A; 4KGR A; 3JVZ X; 2UU7 A; 4MJS A; 3EA6 A; 2E3T A; 5BYR A; 3P42 A; 2N7D A; 2V4L A; 1YQB A; 5E6P A; 3PRM B; 4I6P A; 5BMH A; 2AQ3 B; 2LD9 A; 1GOZ A; 2EMS A; 3KW5 B; 4LCD E; 1LM8 B; 4BBN C; 2ZCB A; 2FUH B; 1WF9 A; 2GBN A; 2LI5 A; 4WWM A; 4N58 A; 2OED A; 3RUL A; 3DBL B; 4TQ0 A; 3N1Y C; 2D3G A; 4K3C A; 1WXS A; 1VDV A; 3P4S B; 4C7Y A; 5DPW A; 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2MQJ A; 3ZJV A; 1XLQ A; 2N0S B; 1AW7 A; 3PVL A; 2D5G A; 2NTS A; 2JPH A; 1XCT L; 1FXA A; 4URK A; 4MM3 A; 2KKC A; 2ZEQ A; 1ET9 A; 3B0A A; 1Q0W B; 2LHD A; 4LNI A; 4MH0 E; 2REX A; 3VDZ A; 2XK5 A; 1OTR B; 3TIX A; 3PPA A; 2JXX A; 5EE0 A; 2FID A; 4WQO B; 2XBB C; 3AMZ A; 4CHK A; 2KWV B; 1WZ3 A; 2L76 A; 1UBQ A; 2K1F A; 1WM2 A; 3AEE B; 3R2I A; 5AUK A; 2W55 A; 4AJY B; 4ZHP A; 2KC1 A; 2UYZ B; 3B2F A; 4C4V B; 3ZDT A; 3A4R A; 3LJ3 A; 1WX9 A; 3RZF A; 4EEW A; 2MW5 A; 3JSV B; 1B9R A; 3OJ3 A; 2NPT B; 1JML A; 3R7R A; 2Y5P A; 2KT7 A; 4OZA A; 1SJE D; 3I57 A; 1V86 A; 1J7A A; 2ZJD A; 4F8C B; 2V9H A; 2IJ0 A; 3KYD D; 1WY8 A; 2GOW A; 3X23 A; 3PZ8 A; 1GUA B; 1MFW A; 3ZDM C; 2QHO A; 2BBC A; 4XZ4 A; 3IG3 A; 3UIN B; 2G3Q B; 3VXW A; 5H92 C; 1K8R B; 4I6N B; 3SR6 A; 4HKQ A; 1WGH A; 3TEY A; 2WXF A; 3URY A; 2SEB D; 4BFR A; 2PIA A; 4HRS A; 1YJI A; 1QF6 A; 2EKE C; 2N9K A; 3BIN A; 2MEK A; 2CS4 A; 1YNT E; 1E6E B; 1KOT A; 1TZ1 A; 3BK2 A; 2HDE A; 2DNF A; 2YLM A; 4YSX B; 4HRO A; 3B1L X; 1H4R A; 4DHZ B; 1GAQ B; 4WJO A; 4N9F 4; 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